荊偉龍
基因檢測,很多人都聽說過,大部分人對基因檢測的理解都是,可以預(yù)測疾病,是比較高大上的醫(yī)療檢測。高齡產(chǎn)婦對基因檢測的認(rèn)識可能更為直觀,因?yàn)橄喈?dāng)數(shù)量的高齡產(chǎn)婦為了避免羊水穿刺引起的流產(chǎn),會選擇無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測。2017年6月,中國卒中學(xué)會學(xué)術(shù)年會即天壇國際腦血管病會議上,北京天壇醫(yī)院宣布已擁有單基因腦血管病基因診斷技術(shù)。
目前,基因檢測、基因編輯等技術(shù)已進(jìn)入成熟期,并開始逐漸應(yīng)用于疾病篩查、癌癥治療、慢性病治療等領(lǐng)域。今年年內(nèi),我國將正式啟動國家基因庫二期工程建設(shè),預(yù)計5年內(nèi)基因數(shù)據(jù)總量超過美歐日三大基因庫總和。同時,我國將加速建立從基因檢測到個體化精準(zhǔn)免疫的基因技術(shù)體系和基礎(chǔ)設(shè)施。此外,我國將出臺相關(guān)政策,對經(jīng)確定為創(chuàng)新醫(yī)療器械的基因檢測產(chǎn)品等,按照創(chuàng)新醫(yī)療器械審批程序優(yōu)先審查,加快創(chuàng)新醫(yī)療服務(wù)項目進(jìn)入醫(yī)療體系,促進(jìn)新技術(shù)進(jìn)入臨床使用。
發(fā)展這么快的基因檢測到底跟普通百姓有什么關(guān)系?我們聽聽元碼基因創(chuàng)始人、原清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院基因組測序中心主任、全國衛(wèi)生協(xié)會檢驗(yàn)師分會青年分會理事田埂博士怎么說。
基因檢測——解讀人類的遺傳密碼
基因檢測一般是指做DNA檢測,屬于遺傳檢測,通俗來講就是檢測父母遺傳給孩子的遺傳密碼。DNA,即去氧核糖核酸,是一種生物大分子,可組成遺傳指令,引導(dǎo)生物發(fā)育與生命機(jī)能運(yùn)作。而帶有蛋白質(zhì)編碼的DNA片段稱為基因。目前基因檢測主要有兩種技術(shù),一種是基于基因芯片的技術(shù),另一種是基于DNA測序的技術(shù)。
基因芯片技術(shù)是通過檢測DNA已知位點(diǎn)的突變,如某個基因某個位置的突變,或是其有多態(tài)性。
基因測序技術(shù)是發(fā)現(xiàn)一些新的突變,如之前沒有發(fā)現(xiàn)、報道過的基因突變。當(dāng)前,基因檢測主要朝著DNA測序的方向發(fā)展,因?yàn)槊總€人都可能擁有約300萬個與眾不同的堿基變化。
采樣、標(biāo)記、讀取——基因檢測三部曲
兩種基因檢測技術(shù)流程稍有差異,但大多數(shù)流程是相同的。
首先是取材或叫采樣。從理論上說,身體的任何一種細(xì)胞只要其具有細(xì)胞核,都可以提取出DNA,如頭發(fā)中含有毛囊細(xì)胞,口水中有脫落的上皮細(xì)胞,所以在組織或血液中取材均可。目前市場上的基因檢測項目主要是取唾液或直接刮取上顎脫落細(xì)胞。
第二,如果是通過生物芯片技術(shù)的話,需要對DNA進(jìn)行標(biāo)記,即將想要得到信息的位點(diǎn)標(biāo)記出來。
第三,雜交芯片、芯片數(shù)據(jù)的讀取。數(shù)據(jù)信息讀取后,將信息從模擬的熒光信號變成數(shù)字信號,轉(zhuǎn)變成一個個可識別的變異信息,就可以進(jìn)行數(shù)據(jù)解讀了。
如果采用DNA測序技術(shù)的話,從DNA開始還要進(jìn)行樣本制備的過程。當(dāng)然,最好的測序方式是從DNA的第一個堿基開始直到讀完所有的堿基,但事實(shí)上基因檢測是對每一個片段進(jìn)行讀取的,所以先要把DNA制作成一個個可讀取的片段,再利用DNA測序儀進(jìn)行測序,測序后再進(jìn)行數(shù)據(jù)解讀分析,形成基因檢測報告。
基因檢測有啥用——哪些靠譜,哪些是炒作
第一是診斷。尤其是遺傳性疾病的診斷,也是以往基因檢測最主要的應(yīng)用,如遺傳性耳聾的檢測。遺傳性耳聾指的是由于基因和染色體異常所致的耳聾。這種疾病是由父母的遺傳物質(zhì)(包括染色體及位于其中的基因)發(fā)生了改變傳給后代而引起的耳聾。在每1000個新生兒中就有一位患有先天性耳聾,其中60%以上是由遺傳因素引起的。
第二是與用藥相關(guān)的檢測,看某種藥物在體內(nèi)能否進(jìn)行有效代謝。比如波立維,它是一種前體物質(zhì),需要在體內(nèi)將其前體代謝才能起到抗凝作用,如果前體代謝不掉,則起不了治療作用。在太平洋島國以及亞洲人群中有相當(dāng)部分人不能進(jìn)行很好的前體代謝。這種應(yīng)用就屬于藥物基因組學(xué),判斷某些人能否服用某種特定藥物。
在美國,有18%的藥物受到遺傳基因影響,有些是要強(qiáng)制要求,有些是建議基因檢測后才可開具處方。但中國目前華法林、波立維還沒有強(qiáng)制基因檢測的要求,阜外心血管病醫(yī)院、北京安貞醫(yī)院等建議做這項檢測后再服藥。
第三是靶向藥物相關(guān)檢測。如果腫瘤組織具有某種基因突變,服用某些特定的抗腫瘤藥物就可能達(dá)到治療作用。如果沒有這種基因突變,抗腫瘤藥物就沒辦法起到治療效果。
第四是藥效、藥代動力學(xué)相關(guān)檢測。某種藥物雖然可以達(dá)到治療效果,但是某些人對其代謝時間可能會比其他人長或短。知道這個也很重要,因?yàn)樗幬锶绻x時間長,每天就不需要過于“密集”地服用。通常服藥的頻次是通過大量人群實(shí)驗(yàn)得出的平均數(shù),這個數(shù)并不是每個人都適用的。這就需要用到基因檢測,判斷用藥使用情況。
第五是以健康為目的的相關(guān)檢測。比如酒精代謝、咖啡代謝的能力。通過基因檢測會對個人的生活、健康提供幫助。如果對某種物質(zhì)沒有很好的代謝能力,就少用一些,代謝能力強(qiáng)可以適度多用一些。
第六是天賦基因的檢測。這和酒精代謝能力的基因檢測相似,但現(xiàn)在家長過分沉迷于測天賦基因,包括音樂、體育、數(shù)學(xué)、社交能力等,其實(shí)這些是屬于非常復(fù)雜的性狀特征,不是一或兩個基因可以解釋清楚的。目前這方面還屬于炒概念的過程,結(jié)果還需要進(jìn)一步研究明確。
第七是和藥物相關(guān)的如抗生素耐藥性檢測。通過基因檢測判斷細(xì)菌對抗生素的耐藥性,指導(dǎo)臨床抗生素的使用。
基因檢測費(fèi)用——從99元到10萬
根據(jù)檢測服務(wù)項目和內(nèi)容等,具體的費(fèi)用標(biāo)準(zhǔn)也不相同。比如某些基因檢測公司開展的酒精基因檢測費(fèi)用大概是99元或199元,還有一些基因公司開展的全基因組檢測費(fèi)用是5萬元~10萬元。
基因檢測中,數(shù)據(jù)的解讀是比較昂貴的,雖然計算機(jī)能完成部分工作,但報告還是需要人工審核和解讀。
撥開云霧——如何選擇基因檢測機(jī)構(gòu)
可以考慮選擇市場份額較大,較為成熟的基因檢測公司,通常來說其會考慮自己的名聲,不會因小失大。
另外,可以考慮具有基因檢測臨床資質(zhì)的機(jī)構(gòu)。一般而言,這樣的機(jī)構(gòu)檢測結(jié)果會相對科學(xué)、靠譜。建議如果有條件,可以考慮去大型醫(yī)院,找靠譜的醫(yī)生給出基因檢測的合理化建議。
未來每個人都可能有“基因組之書”
在未來,每個人出生時,可能就會擁有自己的基因組(一個細(xì)胞或者生物體所攜帶的一套完整的單倍體序列,包括全套基因和間隔序列)。這樣的愿景需要10年~20年的時間才有可能實(shí)現(xiàn)。但隨著基因檢測技術(shù)發(fā)展速度越來越快,價格也越來越合理,很有可能某一天每個人都會擁有自己的“基因組之書”。
人類對DNA的了解還很有限,科學(xué)家通過約100年的研究,真正能解密的基因不到基因總數(shù)的1%,能夠明確與某種疾病有必然聯(lián)系的基因數(shù)量可能還不到300個?;蛑羞€包括相當(dāng)復(fù)雜且龐大的基因家族間的關(guān)系,所以即便測序解讀能力提高了,真正能應(yīng)用的還是很少。
美國對此提出了精準(zhǔn)治療計劃,其中包括測試100萬人的基因組,分享其信息,包括生活習(xí)慣、眼睛、膚色等所謂的表型信息,同時對測試人群進(jìn)行多年跟蹤,將這些基因信息和表型信息結(jié)合起來成為精準(zhǔn)治療計劃中最核心的部分。
此外,除美國政府外,很多基因檢測公司也參與基因組計劃。所以,隨著基因檢測得到數(shù)據(jù)的不斷增加,相信不久的將來能夠解釋的表型信息也會越來越多。