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    12個油茶良種的SCAR分子標(biāo)記鑒別

    2017-08-07 10:24:00李海波王燕飛
    浙江林業(yè)科技 2017年2期
    關(guān)鍵詞:長林油茶多態(tài)性

    李海波,劉 勇,趙 佳,王燕飛,徐 梁,楊 明

    (1. 浙江省林業(yè)科學(xué)研究院,浙江 杭州 310023;2. 浙江省安吉縣林業(yè)局,浙江 安吉 313300;3. 浙江省龍泉市林場,浙江 龍泉 323700;4. 浙江省安吉縣梅溪鎮(zhèn)林業(yè)站,浙江 安吉 313300)

    12個油茶良種的SCAR分子標(biāo)記鑒別

    李海波1,劉 勇2,趙 佳1,王燕飛3,徐 梁1,楊 明4

    (1. 浙江省林業(yè)科學(xué)研究院,浙江 杭州 310023;2. 浙江省安吉縣林業(yè)局,浙江 安吉 313300;3. 浙江省龍泉市林場,浙江 龍泉 323700;4. 浙江省安吉縣梅溪鎮(zhèn)林業(yè)站,浙江 安吉 313300)

    以12個長林系列油茶Camellia oleifera良種為試材,基于特異性SCAR分子標(biāo)記的開發(fā)來鑒別油茶品種。結(jié)果表明:基于4條SAPD引物、24對SRAP引物和15個ISSR引物分別對12個油茶品種進(jìn)行擴增,得到了21條多態(tài)性片段,包括7條nSAPD,10條SRAP和4條ISSR片段。2條nSAPD,7條SRAP和2條ISSR多態(tài)性片段被成功轉(zhuǎn)化為了11個穩(wěn)定可靠的SCAR標(biāo)記。長林油茶23號、長林26號、長林53號、長林56號和長林166號有1個SCAR標(biāo)記,長林3號和長林55號各有2個SCAR標(biāo)記,長林21號有4個SCAR標(biāo)記,長林18號有6個SCAR標(biāo)記,長林4號、長林27號和長林40號沒有SCAR標(biāo)記。這些SCAR標(biāo)記可作為品種特異性的DNA指紋,輔助用于12個長林系列油茶良種的鑒別。

    油茶;良種;品種鑒別;分子標(biāo)記;SCAR;DNA指紋

    油茶Camellia oleifera是我國南方重要的木本油料樹種,栽培歷史悠久,具有分布區(qū)域廣、栽培面積大、用途多等特點,并集經(jīng)濟價值于一身[1],在生態(tài)經(jīng)濟建設(shè)中占有重要地位。早在上個世紀(jì)60年代,我國林業(yè)工作者就開展了油茶良種的選育工作,并取得了重大突破。先后選育出了一批優(yōu)良的單株、無性系和家系[2],其中,具有早實、豐產(chǎn)和穩(wěn)產(chǎn)特點的油茶優(yōu)良無性系已作為最重要的良種資源推廣應(yīng)用[3]。每公頃產(chǎn)油量達(dá)到750 kg以上的新品系,成為油茶主栽品種[4]。近年來,油茶產(chǎn)業(yè)迅速發(fā)展,油茶良種苗木市場供不應(yīng)求,出現(xiàn)了品系混雜、以假亂真、以次充好的現(xiàn)象。油茶無性系品種的真實性問題一直困擾油茶產(chǎn)業(yè)化的發(fā)展。

    油茶各無性系的識別主要依賴其表觀特征,但是許多形態(tài)性狀的鑒定周期長、受環(huán)境影響大,而且隨著無性系數(shù)量的不斷增多,鑒別也愈加困難。況且,用于大面積推廣的油茶芽砧苗尚不具備可用于識別的形態(tài)、生物學(xué)特征以及經(jīng)濟性狀[2]。二十一世紀(jì)以來,分子標(biāo)記技術(shù)包括隨機擴增多態(tài)性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA, RAPD)[5]、簡單重復(fù)序列間區(qū)擴增多態(tài)性(Inter Simple Sequence Repeat, ISSR)[6]、相關(guān)序列擴增多態(tài)性(Sequence-Related Amplified Polymorphism, SRAP)[7]和簡單序列重復(fù)(Simple Sequence Repeats,SSR)或微衛(wèi)星(Microsatellite)標(biāo)記[8]陸續(xù)應(yīng)用于油茶的生產(chǎn)技術(shù)研究,為油茶優(yōu)良無性系的品種鑒別與優(yōu)良品系的分子選育提供一種新的技術(shù)手段[2,4,9-12]。這些分子標(biāo)記中,RAPD的穩(wěn)定性和可重復(fù)性較低。SSR具有多態(tài)性豐富、操作簡單、結(jié)果可靠、重復(fù)性好等優(yōu)點,但SSR標(biāo)記的開發(fā)需要構(gòu)建cDNA文庫、利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),還需要對SSR標(biāo)記的有效性做大量篩選工作,工作量很大、成本高。而且SSR標(biāo)記用于油茶品種鑒定,不僅要篩選出一組多態(tài)性良好、擴增穩(wěn)定且均勻分布于染色體上的核心引物組合,并采用一個標(biāo)準(zhǔn)化的等位基因檢測方法[13],還需要建立油茶已知品種的DNA數(shù)據(jù)庫。

    SCAR(特征性片段擴增區(qū)域,Sequence Characterized Amplified Region)標(biāo)記是RAPD標(biāo)記的進(jìn)一步發(fā)展,它是基于對特異RAPD片段的測序,根據(jù)兩端序列設(shè)計一對18 ~ 24堿基的引物,在較高的退火溫度下進(jìn)行特異擴增實現(xiàn)的[14]。隨著分子標(biāo)記技術(shù)的不斷發(fā)展,SCAR標(biāo)記的開發(fā)已不僅僅限于從RAPD發(fā)展而來。幾種分子標(biāo)記SRAP、ISSR)、特異擴增多態(tài)性DNA(Specifically Amplified Polymorphic DNA, SAPD)也被相繼用于轉(zhuǎn)化為SCAR標(biāo)記。無論RAPD,還是SRAP,ISSR,SAPD都是基于通用性引物的PCR擴增,而轉(zhuǎn)化為SCAR標(biāo)記是特異性引物的擴增,具有穩(wěn)定、簡便、快速的優(yōu)點,因而被廣泛用于眾多物種在種間或種內(nèi)的高效鑒別[15-23]。

    長林系列油茶品種具有早實豐產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)、出籽率高、含油量高、抗性強、適應(yīng)性廣等特性的優(yōu)良無性系。選用長林系列的12個良種作為材料,首先基于SAPD,SRAP和ISSR三種引物通用型的DNA分子標(biāo)記技術(shù)對12個油茶品種的基因組DNA進(jìn)行大規(guī)模篩選,并進(jìn)一步通過分子克隆技術(shù)開發(fā)獲得油茶品種特異性的SCAR分子標(biāo)記,進(jìn)而達(dá)到對12個油茶品種快速鑒別的目的。該研究旨在為油茶優(yōu)良無性系的準(zhǔn)確鑒別開發(fā)一種新的分子識別方法,為油茶優(yōu)良品種資源的保護(hù)提供技術(shù)支持。

    1 材料與方法

    1.1 實驗材料

    1.1.1 植物材料 12個長林系列油茶優(yōu)良無性系來自浙江省林業(yè)科學(xué)研究院在浙江省武義縣俞源鎮(zhèn)鐘蓬村建立的百靈谷油茶幼林基地,分別為:長林3號(CL3)、長林4號(CL4)、長林18號(CL18)、長林21號(CL21)、長林23號(CL23)、長林26號(CL26)、長林27號(CL27)、長林40號(CL40)、長林53號(CL53)、長林55號(CL55)、長林56號(CL56)、長林166號(CL166)。主要經(jīng)濟性狀參見林萍等[4]的報道。2015年4 ~ 5月進(jìn)行采樣,每個油茶品種均采集3株,每株取3 ~ 5個幼嫩葉片,置于裝有硅膠的密封袋干燥保存,至完全失水后作為提取基因組DNA的供試材料。

    1.1.2 主要試劑及引物 研究所用主要分子生物學(xué)試劑包括新型快速植物基因組DNA提取試劑(BioTeke,北京)、普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(TIANGEN,北京)、PCR擴增試劑2′Power Taq PCR MasterMix(BioTeke,北京),基因克隆所用載體pGEM-Teasy、感受態(tài)細(xì)胞DH5a(TaKaRa,大連)。ISSR引物選用加拿大哥倫比亞大學(xué)(UBC)開發(fā)的通用引物。ISSR,SRAP,SAPD,nSAPD和SCAR引物由北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司(TSINGKE,北京)合成。

    1.2 實驗方法

    1.2.1 基因組DNA的提取及濃度測定 將每個油茶品種3株經(jīng)干燥后的幼嫩葉片粉碎,取等量混合后作為基因組DNA的提取樣品。DNA提取方法參照新型快速植物基因組DNA提取試劑盒的操作說明,提取后的DNA測定濃度,并經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.2 nSAPD,SRAP和ISSR多態(tài)性擴增 SAPD-PCR的擴增體系為:2×Power Taq PCR Master Mix 10 ml,SAPD(A-NotT-NotG-NotC-Not)引物(10 uM)1 ml,DNA模板(20 ng/ml)3 ml,加ddH2O補齊到20 ml。nSAPD-PCR的擴增體系為:2×Power Taq PCR Master Mix 10 ml,nSAPD(A-Not-A,A-Not-T,A-Not-G,A-Not-C;T-Not-A、T-Not-T,T-Not-G,T-Not-C;G-Not-A,G-Not-T G-Not-G,G-Not-C;C-Not-A,C-Not-T,C-Not-G,C-Not-C)引物(10 uM)1 ml,DNA模板(SAPD-PCR的產(chǎn)物)1 ml,加ddH2O補齊到20 ml。SRAP和ISSR-PCR的擴增體系為:2×Power Taq PCR Master Mix 10 ml,SRAP上下游引物(10 uM)各1 ml(或ISSR引物2 ml),DNA模板(20 ng/ml)3 ml,加ddH2O補齊到20 ml。

    nSAPD、SRAP和ISSR的擴增反應(yīng)均在Life ECO型PCR儀(Bioer,杭州)上進(jìn)行。nSAPD的反應(yīng)條件為95℃預(yù)變性5 min后,94℃變性1 min、39℃退火1 min (A-Not-A,A-Not-T,A-Not-G,A-Not-C;T-Not-A,T-Not-T,T-Not-G,T-Not-C)或41℃退火1 min(G-Not-A,G-Not-T,G-Not-G,G-Not-C;C-Not-A,C-Not-T,C-Not-G,C-Not-C),72℃延伸5 min,共30個循環(huán);最后于72℃補平10 min,終止溫度為4℃。SRAP的反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性5 min后,94℃變性1 min、35℃退火1 min、共5個循環(huán);之后72℃延伸1 min;繼續(xù)94℃變性1 min、52℃退火1 min、72℃延伸1 min,共30個循環(huán);最后于72℃補平10 min,終止溫度為4℃。ISSR的反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性5 min后;94℃變性45 s,退火時間45 s(不同ISSR引物的最佳退火溫度不同),72℃延伸2 min,共30個循環(huán);最后于72℃補平7 min,終止溫度為4℃。

    PCR擴增后的產(chǎn)物用1.5%的瓊脂糖凝膠(EB染色)電泳,擴增圖譜的攝取采用美國伯樂自動凝膠圖像分析儀(Chemi Doc XRS imaging system,Bio-Rad,Hercules, CA, USA)。

    1.2.3 nSAPD,SRAP和ISSR特異片段回收、克隆及測序 采用普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒從1.5%的瓊脂糖凝膠中回收nSAPD、SRAP和ISSR的特異片段。特異片段與pGEM-Teasy載體連接,4℃過夜。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化于E. coli 感受態(tài)細(xì)胞DH5a中,經(jīng)藍(lán)白斑篩選后,每個樣品均隨機挑選5個陽性克隆交付杭州擎科生物技術(shù)公司完成測序。

    1.2.4 SCAR引物設(shè)計 根據(jù)nSAPD,SRAP和ISSR特異片段的測序數(shù)據(jù),利用Oligo 6.54(MBI,USA)軟件設(shè)計SCAR引物。引物設(shè)計的主要參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)為:Stringency:moderate;Prime Tm Range:60.0±5.0;其余參數(shù)選擇Defaults。用軟件的“Analyse”菜單對設(shè)計出的SCAR引物進(jìn)行分析評價,包括引物二聚體(3’端不形成二聚體)、發(fā)夾結(jié)構(gòu)(DG<4.5 kcal/mol)、GC含量(45% ~ 55%)、Tm值(上下游引物接近)等,最終設(shè)計出一對18~24 bp的特異PCR引物,交由北京擎科合成。

    1.2.5 SCAR-PCR擴增 20 ml SCAR-PCR的擴增體系為:2×Power Taq PCR Master Mix 10 ml,SCAR上下游引物(10 mM)各1 ml,DNA模板(20 ng/ml)3 ml,加ddH2O補齊到20 ml。擴增反應(yīng)在TC-XP型(Bioer,杭州)擴增儀上進(jìn)行。反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性6 min后;94℃變性40 s,退火時間40 s(不同SCAR引物的最佳退火溫度不同),72℃延伸2 min,共30個循環(huán);最后于72℃補平7 min,終止溫度為4℃。最適退火溫度的取得是通過在SCAR-PCR擴增中逐步提高退火溫度。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 nSAPD,SRAP和ISSR多態(tài)性分析、特異片段的克隆及測序

    利用nSAPD、SRAP和ISSR分子標(biāo)記對12個油茶品種的基因組DNA進(jìn)行PCR擴增,檢測品種間的多態(tài)性差異(圖1)。利用4條SAPD(A-Not,T-Not,G-Not,C-Not)引物分別對12個油茶品種的基因組DNA進(jìn)行PCR擴增之后,繼續(xù)用16條nSAPD (A-Not-A,A-Not-T,A-Not-G,A-Not-C;T-Not-A,A-Not-T,A-Not-G,A-Not-C;G-Not-A,G-Not-T,G-Not-G,G-Not-C;C-Not-A,C-Not-T,C-Not-G,C-Not-C)引物分別對SAPD-PCR產(chǎn)物進(jìn)一步進(jìn)行巢式PCR擴增。nSAPD的擴增圖譜顯示,A-Not-A,A-Not-C,G-Not-T,C-Not-G,C-Not-C這5條引物在12個油茶品種間共檢測到了7條清晰、穩(wěn)定的多態(tài)性片段;選用24個Me/em系列的SRAP引物對對12個油茶品種的基因組DNA進(jìn)行PCR擴增,SRAP擴增圖譜顯示,7個SRAP引物(Me1/em9,Me1/em12,Me2/em7,Me6/em4,Me7/em12,Me7/em4,Me8/em8)在12個油茶品種間擴增出了10條帶清晰、穩(wěn)定的多態(tài)性片段;選用15個UBC系列的ISSR引物對12個油茶品種進(jìn)行PCR擴增,其中3個ISSR引物共檢測到了4條清晰、穩(wěn)定的多態(tài)性片段。這7條nSAPD,10條SRAP和4條ISSR多態(tài)性片段被進(jìn)一步回收、克隆測序,待轉(zhuǎn)化為SCAR標(biāo)記。

    圖1 12個油茶品種的nSAPD,SRAP和ISSR-PCR擴增圖譜Figure 1 Electrophoretic prof i le of 12 cultivars of C. oleifera amplified with nSAPD, SRAP and ISSR primers

    2.2 SCAR標(biāo)記的建立及可鑒別的油茶品種

    對21條多態(tài)性片段的測序數(shù)據(jù)設(shè)計出21對SCAR特異引物,分別對12個油茶品種的基因組DNA進(jìn)行擴增,結(jié)果顯示,21對SCAR引物中的10對引物并沒有再現(xiàn)起初nSAPD,SRAP和ISSR標(biāo)記的多態(tài)性,表明這些多態(tài)性的分子標(biāo)記未能轉(zhuǎn)化為特異性的SCAR標(biāo)記;其余的11對引物(從Co_1R/Co_1F到Co_11R/Co_11F)在各自最適的退火溫度下,從1個或幾個油茶品種中擴增出了預(yù)期的特異性條帶(圖2),這表明基于三種分子標(biāo)記對12個油茶品種的多態(tài)性篩選,2個nSAPD,7個SRAP和2個ISSR多態(tài)性標(biāo)記已成功轉(zhuǎn)化為了11個穩(wěn)定特異的SCAR標(biāo)記CoSC1 ~ CoSC11。表1所示為11對油茶SCAR標(biāo)記特異引物的名稱、核苷酸序列、最適退火溫度、bp數(shù),以及這些SCAR標(biāo)記可用于鑒別的油茶品種。11個SCAR標(biāo)記對油茶品種的鑒別能力顯著不同,CoSC1可鑒別5個油茶品種,CoSC10可鑒別3個油茶品種,CoSC6和CoSC7均可鑒別2個油茶品種,其余7個SCAR標(biāo)記可各自鑒別1個油茶品種。從表2所示的11個SCAR標(biāo)記在12個油茶品種間的分布來看,12個油茶品種所擁有的SCAR標(biāo)記數(shù)量亦明顯不同,長林23號、長林26號、長林53號、長林56號和長林166號只有1個SCAR標(biāo)記,長林3號和長林55號各有2個SCAR標(biāo)記,長林21號有4個SCAR標(biāo)記,長林18號有6個SCAR標(biāo)記,而長林4號、長林27號和長林40號則沒有SCAR標(biāo)記。從SCAR標(biāo)記的品種特異性來看,11個SCAR標(biāo)記中的CoSC2,CoSC3,CoSC8為長林18號所特有,CoSC4,CoSC5,CoSC9為長林21號所特有,CoSC11為長林55號所特有,其余的CoSC1,CoSC6,CoSC7和CoSC10均為幾個品種所共有。因此,這11個SCAR標(biāo)記尚不能鑒別長林4號、長林27號和長林40號,另外9個油茶品種的鑒別則需要11個SCAR標(biāo)記的聯(lián)合使用。

    圖 2 12個油茶品種的SCAR-PCR擴增圖譜Figure 2 Electrophoretic prof i le of 12 cultivars of C. oleifera amplified with SCAR primers

    表1 用于12個油茶品種鑒別的特異SCAR標(biāo)記Table 1 SCAR markers for identification of 12 cultivars of C. oleifera

    表212個油茶品種的SCAR標(biāo)記分布Table 2 Distribution of SCAR markers among 12 cultivars of C. oleifera

    3 討論與結(jié)論

    根據(jù)21條多態(tài)性片段的測序數(shù)據(jù)設(shè)計的21對SCAR引物中,11對成功轉(zhuǎn)化為了SCAR標(biāo)記CoSC1 ~ CoSC11,可用于9個油茶品種的鑒別。剩下的10對中,5對nSAPD引物和3對SRAP引物在12個油茶品種間的SCAR-PCR擴增出現(xiàn)完全一致的結(jié)果,沒有再現(xiàn)起初nSAPD和SRAP的多態(tài)性;2對ISSR引物雖出現(xiàn)多態(tài)性,但重復(fù)性很差。這可能是由于起初nSAPD和SRAP檢測到的多態(tài)性來自于引物錯配位點?;蛘哂捎谠O(shè)計的SCAR引物不在變異位點,而導(dǎo)致原有的多態(tài)性消失。因此從引物通用性標(biāo)記轉(zhuǎn)化為品種特異性的SCAR標(biāo)記需要做大量的篩選工作和重復(fù)性測試,才能最終確定SCAR標(biāo)記的穩(wěn)定可靠性。1對SCAR引物的擴增產(chǎn)生了2個SCAR條帶的情況,但由于其中1個條帶的擴增效率很低且重復(fù)性差,在逐步提高退火溫度后,只有1個SCAR標(biāo)記穩(wěn)定存在。

    針對12個長林系列的油茶優(yōu)良品種,開發(fā)出了11個SCAR標(biāo)記,可作為品種特異性的DNA指紋,從分子水平上輔助油茶良種的有效鑒別。為了提高品種間分子鑒別的可靠性與便捷性,挖掘品種的多個SCAR標(biāo)記(多位點SCAR表型)具有重要價值[19]。本研究中,長林3號和長林55號各有2個SCAR標(biāo)記,長林21號有4個SCAR標(biāo)記,長林18號有6個SCAR標(biāo)記。因此在后續(xù)研究中,進(jìn)一步擴大SRAP,ISSR等通用性引物的多態(tài)性篩選,不僅開發(fā)出可用于鑒別長林4號、長林27號和長林40號品種的SCAR標(biāo)記,特別是開發(fā)出單個品種的多位點SCAR表型對于這些油茶良種的準(zhǔn)確鑒別更有意義。

    多重PCR是一種可以在一個PCR反應(yīng)里同時檢測多位點表型的分子技術(shù)手段。利用多重PCR技術(shù)將特異性的SCAR標(biāo)記整合已成功用于了香菇菌株和乳酸菌種間等物種的高效鑒別[19-20,22-24]。因此在后續(xù)研究中,技術(shù)層面上進(jìn)一步優(yōu)化建立油茶品種的多重PCR體系,即將某些品種,例如長林3號和長林55號的2個SCAR標(biāo)記、長林21號品種的4個SCAR標(biāo)記、長林18號的6個SCAR標(biāo)記的引物進(jìn)行整合,實現(xiàn)在一個PCR反應(yīng)里同時檢測一個品種的多個SCAR指紋條帶,這樣不僅可以實現(xiàn)油茶品種的高效鑒別,也更有利于油茶品種鑒別的準(zhǔn)確性。

    SAPD分子標(biāo)記揭示基因組DNA在限制性內(nèi)切酶Not I識別位點序列(GCGGCCGC)上的多態(tài)性,其開發(fā)初衷是為了增強原RAPD標(biāo)記的分辨率并克服其不穩(wěn)定性[25-26]。高分辨率的SAPD標(biāo)記已成功用于了細(xì)菌、酵母、真菌、植物、水稻以及人類的基因組研究[22],還有最近報道的用于櫻花品種鑒別的研究[27],但由SAPD轉(zhuǎn)化為特異性的SCAR標(biāo)記用于優(yōu)良經(jīng)濟林品種的鑒別迄今尚未有報道。本研究基于4個SAPD引物和15個ISSR引物的篩選,從12個油茶品種中各獲得了2個穩(wěn)定的SCAR標(biāo)記,而基于24對SRAP引物的篩選則獲得了7個穩(wěn)定的SCAR標(biāo)記,顯然SRAP顯示了比SAPD和ISSR標(biāo)記更高的分辨率、更低的工作量。因此,對于油茶品種的鑒別,SAPD和ISSR不是最佳的分子標(biāo)記,基于SRAP標(biāo)記篩選并進(jìn)一步轉(zhuǎn)化為特異性SCAR標(biāo)記更適合于油茶品種高效鑒別。

    SCAR分子標(biāo)記的一個顯著特點是可以由顯性標(biāo)記發(fā)展為更加有用的共顯性標(biāo)記[13]。因而本研究中獲得的油茶顯性SCAR分子標(biāo)記可進(jìn)一步發(fā)展為共顯性的SCAR標(biāo)記,用于今后油茶分子標(biāo)記輔助育種(Marker Assisted Selection)中雜合子的高效鑒定,對于提高油茶育種目的性、精確性及其遺傳改良效率具有重要意義。

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    Identification of 12 Superior Cultivars of Camellia oleifera by Sequence Characterized Amplified Region Markers

    LI Hai-bo1,LIU Yong2,ZHAO Jia1,WANG Yan-fei3,XU Liang1,YANG Ming4
    (1. Zhejiang Academy of Forestry, Hangzhou 310023, China; 2. Anji Forestry Bureau of Zhejiang, Anji 313300, China; 3. Longquan Forest Farm of Zhejiang, Longquan 323700, China; 4. Anji Meixi Forestry Station of Zhejiang, Anji 313300, China)

    Experiments were conducted on sequence characterized amplified region markers (SCAR) from amplified polymorphic DNA (SAPD), sequence-related amplified polymorphism and inter simple sequence repeat (ISSR) molecular techniques for identification of 12 cultivars (Changlin series)of Camellia oleifera. The result demonstrated that twenty-one polymorphic bands (7 from nSAPD, 10 from SRAP and 4 from ISSR) were obtained from the tested cultivars by using 43 primers (4 SAPD, 24 SRAP and 15 ISSR). Eleven (2 from nSAPD, 7 from SRAP and 2 from ISSR) of 21 polymorphic bands were converted into 11 stable and reproducible SCAR markers by designing specific SCAR primers from the 11 sequenced polymorphic bands and by verifying PCR amplification with SCAR primers. Changlin 23, 26, 53, 56 and 166 had only one SCAR marker, Changlin 3 and 55 had two ones, Changlin 21 had four ones, Changlin 18 had six ones, and Changlin 4, 27 and 40 have no SCAR markers. These SCAR markers can be used as cultivar-specific DNA fingerprints for better identification of cultivars.

    Camellia oleifera; superior cultivars; identification; molecular markers; SCAR; DNA fingerprints

    S794.4

    A

    1001-3776(2017)02-0017-07

    10.3969/j.issn.1001-3776.2017.02.003

    2016-12-25;

    2017-02-12

    浙江省科研院所扶持專項(No. 2014F30002;2013F50012);浙江省重大科技專項(No. 2010C02005-1)

    李海波,研究員,從事林木遺傳育種研究;E-mail:1178646251@qq.com。通信作者:楊明,助理工程師,從事森林培育研究;E-mail:1178646251@qq.com。

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