蔡立英/編譯
冰下危機(jī):潛伏于凍土中的遠(yuǎn)古病菌復(fù)蘇
蔡立英/編譯
遷徙的馴鹿
● 隨著全球氣候變暖,冰封于冰層和永久凍土之下長(zhǎng)達(dá)數(shù)世紀(jì)的長(zhǎng)期蟄伏的細(xì)菌和病毒開始復(fù)蘇。
縱觀歷史,人類與細(xì)菌和病毒一直并存。從瘟疫到天花,為了抵御它們,我們一直在進(jìn)化,而它們也相應(yīng)地演化出感染我們的新方法。
自從亞歷山大·弗萊明發(fā)現(xiàn)青霉素以來(lái),我們擁有抗生素已有近100年的時(shí)間。作為回應(yīng),細(xì)菌也不斷產(chǎn)生抗生素的耐藥性。這場(chǎng)戰(zhàn)役永無(wú)止境:因?yàn)槲覀兣c病原體共同生存的時(shí)間太長(zhǎng),有時(shí)會(huì)形成一種自然的僵局。
然而,如果我們突然暴露于已消失成千上萬(wàn)年或是我們從未遇到過(guò)的致命細(xì)菌和病毒前,將會(huì)發(fā)生什么情況呢?
我們可能很快就會(huì)看到這個(gè)假設(shè)變成現(xiàn)實(shí)。氣候變化正在融化已冰凍成千上萬(wàn)年的永久凍土,隨著土壤的融化,它們將會(huì)釋放出蟄伏多年的古老病毒和細(xì)菌,這些病毒和細(xì)菌正在恢復(fù)生命力。
2016年8月,在西伯利亞凍原的偏遠(yuǎn)一隅——北極圈內(nèi)的亞馬爾半島上,1名12歲的男孩因感染炭疽死亡,至少有20人也因此住院治療。
此次炭疽疫情暴發(fā)的前因后果是,大約75年前,一頭馴鹿死于炭疽感染,其冰凍的尸體封存在被稱為“永久凍土”的一層凍土之下。此后,馴鹿的尸體一直封凍在那里,直到2016年夏天的一波熱浪襲擊了這里,最終導(dǎo)致永久凍土的解凍。
永久凍土的解凍導(dǎo)致馴鹿的尸體暴露出來(lái),并將具有感染性的炭疽菌釋放到附近的水體和土壤中,然后進(jìn)入食物供應(yīng)鏈。附近放牧的2 000多頭馴鹿被感染,然后引發(fā)了小部分人類的感染。
科學(xué)家擔(dān)心,這不會(huì)是一個(gè)孤立的個(gè)案。隨著地球變暖,更多的永久凍土將融化。正常情況下,表層深度在50厘米以下的永久凍土層每年夏季都會(huì)融化。但是現(xiàn)在,全球變暖逐漸使更深的永久凍土層暴露出來(lái)。
處于冰凍狀態(tài)的永久凍土是細(xì)菌長(zhǎng)期保持活性的完美溫床,細(xì)菌有可能存活長(zhǎng)達(dá)100萬(wàn)年。這意味著永久凍土中冰層的融化可能會(huì)打開疾病的潘多拉魔盒。
北極圈的氣溫正在快速上升,其升溫速度比世界上其他地方大約快3倍。隨著冰層和永久凍土的融化,其他感染性病原體可能會(huì)被釋放出來(lái)。
“永久凍土是微生物和病毒非常好的保護(hù)者,因?yàn)樗鼫囟群艿?,沒(méi)有氧氣,而且處于黑暗中,”法國(guó)艾克斯-馬賽大學(xué)的進(jìn)化生物學(xué)家讓-米歇爾·克拉弗里(Jean-Michel Claverie)指出,“能感染人類或動(dòng)物的致病性病毒可能保存于古老的永久凍土層中,甚至包括過(guò)去曾導(dǎo)致全球性傳染病的惡性病菌?!?/p>
在南極的冰層中發(fā)現(xiàn)了蟄伏的細(xì)菌
僅在20世紀(jì)初,超過(guò)100萬(wàn)頭馴鹿死于炭疽病。當(dāng)時(shí)挖深坑埋尸體并不是一件容易的事,所以這些馴鹿的尸體大部分就掩埋在地表附近,分散于俄羅斯北部的7 000個(gè)埋葬地中。
但是,最大的恐懼是凍土之下潛伏著什么。
幾個(gè)世紀(jì)以來(lái),不斷有人類和動(dòng)物的尸體埋藏在永久凍土中,所以可以想象永久凍土可能釋放出其他傳染性病原體。例如,科學(xué)家在阿拉斯加苔原的大型墓地挖掘出的幾具尸體上,發(fā)現(xiàn)了完好無(wú)損的、曾經(jīng)橫掃歐洲的1918年西班牙流感病毒。天花和黑死病的病原體也有可能埋藏于西伯利亞的永久凍土中。
在2011年的一項(xiàng)研究中,鮑里斯·雷維奇(Boris Revich)和瑪麗娜·波多納亞(Marina Podolnaya)預(yù)測(cè):永久凍土融化的一個(gè)后果是,18世紀(jì)和19世紀(jì)致命的感染性媒介可能會(huì)卷土重來(lái),尤其是在埋葬了這些傳染病受害者的墓地附近。
例如,在19世紀(jì)90年代,西伯利亞曾爆發(fā)過(guò)一次嚴(yán)重的天花疫情,一個(gè)小鎮(zhèn)因此失去了40%的人口,他們的尸體埋葬于科雷馬河河畔永久凍土的表層之下。120年后,科雷馬河的洪水開始侵蝕河岸,而永久凍土的融化加速了這個(gè)侵蝕過(guò)程。
在20世紀(jì)90年代啟動(dòng)的一個(gè)研究項(xiàng)目中,來(lái)自俄羅斯新西伯利亞的病毒學(xué)和生物技術(shù)國(guó)家研究中心的科學(xué)家化驗(yàn)了石器時(shí)代的古人類遺骸,它們是在西伯利亞南部的阿爾泰山地區(qū)發(fā)現(xiàn)的。他們還化驗(yàn)了19世紀(jì)病毒流行期間死亡的男子尸體樣本,這些尸體是從俄羅斯永久凍土中挖掘出來(lái)的。研究人員稱,他們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)這些尸體具有患天花后留下的癥狀。雖然他們沒(méi)有找到天花病毒本身,但他們已經(jīng)檢測(cè)到天花病毒的DNA片段。
在2005年的一項(xiàng)研究中,美國(guó)宇航局(NASA)的科學(xué)家們成功復(fù)活了封存在阿拉斯加一個(gè)冰凍池塘中長(zhǎng)達(dá)3.2萬(wàn)年的細(xì)菌。這種叫作 “肉芽孢桿菌”(Carnobacterium pleistocenium)的微生物自更新世以來(lái)就一直被封凍,當(dāng)時(shí)毛茸茸的猛犸象仍然在地球上漫游。一旦冰層融化,肉芽孢桿菌就開始四處游動(dòng),似乎未受冰凍的影響。而一旦它們復(fù)活,病毒就迅速開始具有傳染性。兩年后,科學(xué)家們成功復(fù)活了在冰下蟄伏長(zhǎng)達(dá)800萬(wàn)年的細(xì)菌,這些細(xì)菌休眠于南極一處冰川下面的冰層中。在同一項(xiàng)研究中,科學(xué)家還復(fù)活了從已存在 10萬(wàn)年的冰層中采集到的細(xì)菌。
但是,并不是所有冰凍在永久凍土之下的細(xì)菌都可以復(fù)活。炭疽桿菌之所以能做到,是因?yàn)樗鼈兡墚a(chǎn)生孢子,孢子生命力頑強(qiáng),可以在冰凍狀態(tài)下存活超過(guò)一個(gè)世紀(jì)以上。
可以產(chǎn)生孢子的其他細(xì)菌也因此能在永久凍土中存活,包括破傷風(fēng)菌和肉毒桿菌。肉毒是一種能導(dǎo)致癱瘓甚至致命的罕見病,肉毒桿菌是產(chǎn)生肉毒的病原體。此外,一些真菌和病毒也能在永久凍土中長(zhǎng)期生存。
在2014年的一項(xiàng)研究中,克拉弗里領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)復(fù)活了被封存在西伯利亞永久凍土中長(zhǎng)達(dá)3萬(wàn)年的兩種病毒——西伯利亞闊口罐病毒和西伯利亞軟體病毒,它們都是“巨型病毒”,因?yàn)椴幌翊蠖鄶?shù)的普通病毒,它們的體型相對(duì)“巨大”,利用常規(guī)顯微鏡就能觀察到。它們是在西伯利亞沿海的苔原帶凍原地下100英尺(約30.48米)處被發(fā)現(xiàn)的。
一旦它們復(fù)活,這些病毒就迅速變得具有傳染性。幸運(yùn)的是,這些特殊的病毒只感染單細(xì)胞的變形蟲。不過(guò),該研究仍然表明,真正可以感染人類的其他古老病毒可能會(huì)以同樣的方式復(fù)活。
更重要的是,全球變暖并不一定直接通過(guò)融化永久凍土對(duì)人類構(gòu)成威脅。因?yàn)楸睒O的海冰正在融化,西伯利亞北海岸已變得更容易從海路抵達(dá)。因此,包括采礦和石油天然氣鉆探等在內(nèi)的工業(yè)開發(fā)正從中獲利。
“目前,這些地區(qū)是荒蕪的,深層的永久凍土層還未受干擾,”克拉弗里指出,“但是,這些古老的凍土層可能因人類采礦和鉆井作業(yè)所需要的挖掘而暴露出來(lái)。如果能成活的病毒粒子還潛藏在凍土層中,可能會(huì)給人類帶來(lái)災(zāi)難?!?/p>
關(guān)于碰撞檢測(cè)時(shí)間的計(jì)算,考慮[t0,t1]∈[t0,t0+1]在小范圍內(nèi)處理。被測(cè)物體A和B間做連續(xù)時(shí)間的接近運(yùn)動(dòng)(此時(shí)兩者均已分割成三角形元素),在[t0,t0+Δt]∈[t0,t0+1],在 Δt運(yùn)動(dòng)過(guò)程中,物體 A 正在以某一方向向B靠近,具有線性運(yùn)動(dòng)規(guī)律,可考慮運(yùn)動(dòng)方程有 μtΔt≤d(A(t),B)的關(guān)系,d(A(t),B)為物體A與B之間的距離,μt為閾值。因考慮時(shí)空相關(guān)性理論,前提考慮兩物體已經(jīng)發(fā)生碰撞,標(biāo)記節(jié)點(diǎn)并記錄時(shí)間,可以減少部分時(shí)間計(jì)算,考慮回退技術(shù)的應(yīng)用[9],在時(shí)間段[t0,t1]∈[t0,t0+1]中,通過(guò)時(shí)間Δt進(jìn)行時(shí)間區(qū)間分段:
倘若任何此類病毒真的爆發(fā),那么最有可能的罪魁禍?zhǔn)资蔷扌筒《尽?/p>
“因?yàn)楣庹?、脫水或自發(fā)的生化降解,大多數(shù)病毒在宿主細(xì)胞外就迅速失去活力,”克拉弗里說(shuō)道,“例如,如果它們的DNA受損至無(wú)法修復(fù),其病毒粒子將不再具有傳染性。但在已知的病毒中,巨型病毒往往生命力非常頑強(qiáng),幾乎不可能被破壞?!?/p>
克拉弗里指出,曾出現(xiàn)于最早居住在北極的古人類的病毒可能會(huì)再次出現(xiàn)。我們甚至能看到那些來(lái)自早已滅絕的古人類種群的病毒,比如尼安德特人和丹尼索瓦人,他們都曾在西伯利亞定居過(guò),并飽受各種病毒性疾病的困擾。科學(xué)家已在俄羅斯陸續(xù)發(fā)現(xiàn)距今3萬(wàn)~4萬(wàn)年前的尼安德特人的遺骸,數(shù)千年前,人類曾在那里居住,生老病死。
克拉弗里說(shuō):“我們能從早已滅絕的尼安德特人的遺骸中采集到病毒,這種可能性表明,一種病毒能從地球上‘根除’的想法是錯(cuò)誤的,這種想法給我們一種虛假的安全感。這就是我們要維持疫苗庫(kù)存的原因,僅僅是以防萬(wàn)一?!?/p>
自2014年以來(lái),克拉弗里一直在分析永久凍土層的DNA含量,尋找可能感染人類的病毒和細(xì)菌的遺傳特征。他已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多種細(xì)菌很可能對(duì)人類產(chǎn)生威脅的證據(jù)。這些細(xì)菌擁有的DNA能對(duì)毒性因子進(jìn)行編碼,毒性因子是致病細(xì)菌和病毒產(chǎn)生的分子,能增強(qiáng)其感染宿主的能力。
尼安德特人曾在西伯利亞生活過(guò)
克拉弗里的研究團(tuán)隊(duì)還從永久凍土中發(fā)現(xiàn)了一些似乎來(lái)自病毒的DNA序列,其中包括皰疹病毒。但是,他們尚未發(fā)現(xiàn)任何天花病毒的蹤跡。由于顯而易見的原因,他們沒(méi)有嘗試去復(fù)活任何一種病原體。
現(xiàn)在看來(lái),似乎從人類身上斷絕的病原體也將從其他地方出現(xiàn),而不只是從冰層或永久凍土中。
2017年2月,NASA的科學(xué)家宣布,他們?cè)谀鞲缫粋€(gè)礦井的水晶中發(fā)現(xiàn)了存活1萬(wàn)~5萬(wàn)年的微生物。
這些細(xì)菌存在于奈卡水晶洞中,它是墨西哥北部小鎮(zhèn)奈卡一座礦山的一部分。這個(gè)水晶洞中蘊(yùn)藏大量的乳白色晶體——透明石膏(亞硒酸鹽晶體礦物),是歷經(jīng)數(shù)十萬(wàn)年而逐漸形成的。
這些細(xì)菌被困在晶體內(nèi)微小的液泡中,但一旦被提取出來(lái),它們就會(huì)復(fù)活并開始繁殖。這些微生物在遺傳上是獨(dú)一無(wú)二的,它們可能是新物種,但是研究人員尚未發(fā)布其研究成果。
科學(xué)家在美國(guó)新墨西哥州地下1 000英尺(約304.8米)的龍舌蘭洞穴中發(fā)現(xiàn)了更古老的細(xì)菌。這些微生物在不見天日的地下存活了400萬(wàn)年之久。
龍舌蘭洞穴從來(lái)不見天日,與世隔絕,地表上的水滲入洞穴內(nèi)需要大約1萬(wàn)年的時(shí)間。
盡管如此,龍舌蘭洞穴中的細(xì)菌不知如何竟然已對(duì)18種抗生素產(chǎn)生耐藥性,包括被認(rèn)為是抗擊感染“最后一招”的藥物。在2016年12月發(fā)表的一項(xiàng)研究報(bào)告中,研究人員發(fā)現(xiàn),這種被稱為“類芽孢桿菌LC231”的細(xì)菌,對(duì)70%的抗生素具有耐藥性,而且能讓其中很多抗生素完全失去活性。
由于這些細(xì)菌在洞穴中與世隔絕的時(shí)間長(zhǎng)達(dá)400萬(wàn)年,所以它們從未與人類或是用于治療人類感染的抗生素藥物接觸過(guò),這意味著其抗生素耐藥性必定是通過(guò)其他途徑產(chǎn)生的。
左上:墨西哥奈卡水晶洞中的水晶;左下:龍舌蘭洞穴中的透明石膏晶體;右上:青藏高原的永久凍土;右下:西伯利亞的永久凍土
參與該項(xiàng)研究的科學(xué)家認(rèn)為,這些細(xì)菌對(duì)人類沒(méi)有危害,是那些自然進(jìn)化出抗生素耐藥性的很多種細(xì)菌中的一種。這表明,細(xì)菌的抗生素耐藥性存在的時(shí)間已長(zhǎng)達(dá)數(shù)百萬(wàn)年乃至數(shù)十億年之久。
顯然,如此古老的抗生素耐藥性不可能是因?yàn)樵谂R床上使用抗生素而形成的。
原因是很多種類的真菌,甚至其他細(xì)菌,會(huì)自然產(chǎn)生對(duì)抗生素的抵抗力,從而獲得勝過(guò)其他微生物的競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì)。弗萊明最早就是這樣發(fā)現(xiàn)青霉素的:當(dāng)培養(yǎng)皿中的細(xì)菌被一種能分泌抗生素的霉菌污染后,培養(yǎng)皿中的細(xì)菌都死了。
在那些缺乏食物的洞穴中,生物要想生存下去,就必須殘忍無(wú)情。像“類芽孢桿菌LC231”這樣的細(xì)菌,可能不得不進(jìn)化出抗生素耐藥性,以避免被對(duì)手生物殺死。
這可能解釋為什么這些細(xì)菌只對(duì)來(lái)自細(xì)菌和真菌的天然抗生素產(chǎn)生耐藥性,這種抗生素在我們?nèi)粘J褂玫乃锌股刂姓紦?jù)大約99.9%的比例。這些細(xì)菌從未遇到過(guò)人造抗生素,所以對(duì)人造抗生素并沒(méi)有產(chǎn)生耐藥性。負(fù)責(zé)這項(xiàng)研究的美國(guó)俄亥俄州阿克倫大學(xué)微生物學(xué)家黑澤爾·巴頓(Hazel Barton)指出:“我們的研究工作和其他人的研究工作表明,抗生素耐藥性并非一個(gè)新概念,我們發(fā)現(xiàn)的生物與地表生物隔絕了400萬(wàn)~700萬(wàn)年,但它們的抗生素耐藥性在遺傳學(xué)上是相似的。這意味著這些抗生素耐藥性的基因至少存在了400萬(wàn)~700萬(wàn)年,而不是人類用抗生素治療疾病才產(chǎn)生的。”盡管“類芽孢桿菌 LC231”本身對(duì)人類無(wú)害,但理論上它能把其抗生素耐藥性傳給其他病原體。然而,由于它被隔絕在地下400米深的洞穴中,這種事情似乎是不太可能發(fā)生的。
不過(guò),天然的抗生素耐藥性在微生物中很可能非常普遍,從融化的永久凍土中出現(xiàn)的很多細(xì)菌可能已經(jīng)具有抗生素耐藥性。與此推斷一致的是,在2011年的一項(xiàng)研究中,科學(xué)家在俄羅斯與加拿大之間的白令海地區(qū)發(fā)現(xiàn)了在永久凍土中潛伏了3萬(wàn)年的細(xì)菌,并提取了其DNA。他們發(fā)現(xiàn)其基因編碼了對(duì)β-內(nèi)酰胺、四環(huán)素和糖肽抗生素具有耐藥性。
對(duì)于這一切,我們應(yīng)該感到幾分擔(dān)憂?
有一種論點(diǎn)認(rèn)為,永久凍土中的病原體造成的危險(xiǎn)本質(zhì)上是不可知的,所以我們不應(yīng)該刻意為此擔(dān)憂。相反,我們應(yīng)該專注于氣候變化方面更為明確的威脅。例如,隨著地球變暖,北半球國(guó)家將變得更容易發(fā)生通常在南半球國(guó)家才出現(xiàn)的疾病,比如瘧疾、霍亂和登革熱,因?yàn)檫@些病原體在更高的氣溫下會(huì)茁壯成長(zhǎng)。
另一種觀點(diǎn)認(rèn)為,我們不應(yīng)該忽視永久凍土中的病原體帶來(lái)的風(fēng)險(xiǎn),因?yàn)槲覀儫o(wú)法對(duì)這些風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行量化。
“根據(jù)我們以及其他人的研究結(jié)果可以發(fā)現(xiàn),永久凍土中的致病性微生物復(fù)活并感染人類的可能性并非為零,”克拉弗里指出,“這種可能性具體有多大還不知道,但確實(shí)有這種可能。它們有可能是用抗生素能醫(yī)治的細(xì)菌,也可能是具有抗生素耐藥性的細(xì)菌或病毒。如果病原體與人類已經(jīng)很長(zhǎng)時(shí)間未接觸,那么,我們的免疫系統(tǒng)還沒(méi)有做好抵御這種病原體的準(zhǔn)備。所以,這就可能存在危險(xiǎn)。”
[資料來(lái)源:BBC][責(zé)任編輯:松 石]
本文作者賈斯明·??怂?斯凱利(Jasmin Fox-Skelly)是英國(guó)著名的自由科學(xué)作家,擁有神經(jīng)科學(xué)學(xué)士學(xué)位和科學(xué)傳播碩士學(xué)位,主要關(guān)注新科學(xué)和天文學(xué)。