閘雯俊++李三和++周雷++劉+凱++徐華山++陳志軍++楊國才++劉凱++李培德++游艾青
摘要 RNAi能夠抑制基因特異序列的表達(dá),為昆蟲學(xué)研究提供了新方法,尤其是可以分析基因的功能,控制害蟲種群以及減少疾病病原體的感染。不同種群、RNAi攝入方式、靶標(biāo)基因都會影響RNAi的效率,是轉(zhuǎn)錄本抑制程度存在差異的原因所在。對于不能穩(wěn)定轉(zhuǎn)基因的物種,如昆蟲,利用dsRNA介導(dǎo)的 RNAi技術(shù)便成為快速分析基因功能的重要手段。介紹了RNAi技術(shù)的作用機(jī)制,并從控制害蟲和保護(hù)益蟲方面總結(jié)了RNAi技術(shù)的應(yīng)用。
關(guān)鍵詞 RNAi;害蟲控制;dsRNA;機(jī)制;應(yīng)用
中圖分類號 S433;Q789 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A 文章編號 1007-5739(2017)07-0144-02
RNA干擾已經(jīng)徹底改變了昆蟲學(xué)的研究范圍,使研究者能夠通過抑制目的基因的表達(dá),將改變的表型和基因功能聯(lián)系起來。對于基礎(chǔ)研究而言,RNAi(又稱基因沉默)為所有的昆蟲基因組學(xué)研究提供了一條路徑,同時(shí)對應(yīng)用昆蟲學(xué)也有巨大的潛在作用。例如,RNAi能夠通過抑制關(guān)鍵基因提高死亡率控制害蟲。此外,利用無害的病毒序列啟動(dòng)抗病毒RNAi反應(yīng),能夠有效防止益蟲(如蜜蜂和家蠶) 感染高致病性病毒。
1 RNAi的機(jī)制
RNAi是利用非編碼小RNA分子切割靶標(biāo)mRNA抑制基因表達(dá)。主要分為以下3個(gè)階段。
1.1 起始階段
核糖核酸酶Ⅲ型家族的核酸酶Dicer,以 ATP 依賴的方式逐步切割加工導(dǎo)入生物體的外源或內(nèi)源性轉(zhuǎn)錄生成的dsRNA,生成21~23nt的siRNA(small interfering RNA),其與靶標(biāo)mRNA具有高度特異性,為成功降解提供保證。
1.2 效應(yīng)階段
siRNA 雙鏈結(jié)合其他蛋白復(fù)合物形成RNA 誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RNA-induced silencing complex RISC),雙鏈siRNA解鏈,RISC介導(dǎo)單鏈反義siRNA通過堿基配對原則從siRNA引導(dǎo)鏈中心所對應(yīng)的靶基因位置切割靶mRNA,進(jìn)一步降解mRNA,同時(shí)還可以引發(fā)宿主細(xì)胞的一系列反應(yīng)。
1.3 放大效應(yīng)階段
siRNA在引導(dǎo)RISC切割靶RNA的同時(shí),也在RNA聚合酶(RdRP)的作用下以mRNA為模板合成新的dsRNA。緊接著進(jìn)入第一步循環(huán)過程,生成大量次級siRNA,經(jīng)過逐級放大效應(yīng),使mRNA徹底降解。
2 RNAi技術(shù)的應(yīng)用
利用RNAi技術(shù)控制害蟲和保護(hù)馴化益蟲(例如蜜蜂)已經(jīng)得到廣泛應(yīng)用。一般情況下,RNAi序列適用于任何形式,從單個(gè)基因型到家系,甚至昆蟲所屬的目;因?yàn)槟繕?biāo)序列可以隨意操控。
2.1 利用RNAi控制害蟲
利用RNAi控制害蟲最早是應(yīng)用于玉米根蟲和棉鈴蟲。研究者喂養(yǎng)玉米根蟲含有290條dsRNAs的人工飼料,發(fā)現(xiàn)14個(gè)基因會使成蟲的生理活動(dòng)下降,并且對液泡ATP酶亞基A基因(V-ATPase)進(jìn)行了詳細(xì)的分析。人工飼料中只含有低濃度V-ATPase的dsRNAs,經(jīng)玉米根蟲取食后,相應(yīng)的mRNA受到抑制。更重要的是,研究者將玉米根蟲喂養(yǎng)在表達(dá)V-ATPase dsRNAs的轉(zhuǎn)基因玉米上后,發(fā)現(xiàn)根蟲的V-ATPase基因表達(dá)量下降,玉米根部受損程度降低[1]。研究者發(fā)現(xiàn)棉鈴蟲有1個(gè)靶標(biāo)基因細(xì)胞色素P450(CYP6AE1),該基因在幼蟲中腸中表達(dá),對棉花的二級次生代謝產(chǎn)物棉子酚具有解毒功能[2]。當(dāng)將棉鈴蟲喂養(yǎng)在表達(dá)CYP6AE14 dsR-NA的轉(zhuǎn)基因擬南芥和煙草上時(shí),該基因在蟲體中腸里的表達(dá)量下降,幼蟲生長發(fā)育減速[3]。同時(shí)在玉米根蟲和棉鈴蟲上也都有了新發(fā)現(xiàn)[4]。其中Snf7基因主要參與膜受體的運(yùn)輸,在玉米根蟲中的效果非常顯著。同時(shí)在棉花中表達(dá)半胱氨酸蛋白酶,棉鈴蟲取食后,蟲體圍食膜功能減弱,變得更容易吸收dsRNA。更重要的是,棉花同時(shí)表達(dá)dsCYP6AE14和半胱氨酸蛋白酶比單一表達(dá)其中一個(gè)基因的抗性強(qiáng)[5]。
上述研究闡明利用RNAi控制害蟲有2個(gè)關(guān)鍵因素:①用于RNAi靶標(biāo)基因序列的選擇;②傳遞dsRNA的方式。其中靶標(biāo)基因必須是昆蟲的關(guān)鍵基因,同時(shí)在昆蟲的整個(gè)生活史中要持續(xù)表達(dá)。隨著技術(shù)從理論證明到應(yīng)用的轉(zhuǎn)變,嚴(yán)苛設(shè)計(jì)靶標(biāo)序列是必須的。先決條件就是從dsRNA中獲得的21~25 bp siRNAs必須與序列保證完全的一致性,同時(shí)與昆蟲的mRNA具有同源性,與非靶標(biāo)物種的所有siRNAs和編碼蛋白基因具有序列差異性。在網(wǎng)上將候選dsRNA同時(shí)與靶標(biāo)物種的目的基因及所有公共基因組中預(yù)測的編碼蛋白的基因進(jìn)行比對,杜絕不能與靶標(biāo)序列完全匹配以及與非靶標(biāo)物種序列匹配的siRNAs。
RNAi成功的第2個(gè)關(guān)鍵就是在有效劑量下傳遞放大RNAi信號。目前dsRNA合成方法已有重大突破,一次能夠合成1 kg左右,合成成本的持續(xù)下降將有利于dsRNA產(chǎn)品應(yīng)用于魚餌、生物農(nóng)藥噴霧以及灌溉系統(tǒng)中。利用植物介導(dǎo)的RNAi已經(jīng)廣泛應(yīng)用于控制咀嚼式昆蟲(例如玉米根蟲和棉鈴蟲)和刺吸式昆蟲。Bt抗蟲轉(zhuǎn)基因作物控制刺吸式昆蟲的作用甚微,因?yàn)锽t類毒素尚未對這些昆蟲產(chǎn)生作用。由于生態(tài)釋放導(dǎo)致廣譜殺蟲劑的使用逐漸減少,Bt作物上的害蟲卻逐年增加。因此,利用植物介導(dǎo)的RNAi解決了這個(gè)難題,在褐飛虱和蚜蟲中都得到了應(yīng)用。此方法可以代替?zhèn)鹘y(tǒng)殺蟲劑,例如可以作為城市害蟲(螞蟻、蟑螂、白蟻)的殺蟲餌劑;其商業(yè)潛力主要取決于dsRNA傳遞給靶標(biāo)昆蟲的效率、dsRNA是否在昆蟲體內(nèi)能穩(wěn)定存在、作為殺蟲餌劑的濃度。上述因素均影響dsRNA的生產(chǎn)成本。因此,加強(qiáng)昆蟲細(xì)胞吸收dsRNA和保證dsRNA在昆蟲體內(nèi)不被dsRNases降解至關(guān)重要。
2.2 利用RNAi保護(hù)益蟲
許多真核寄生蟲對RNAi敏感,可以利用這一特點(diǎn)增強(qiáng)益蟲的健康。當(dāng)然,這個(gè)策略不適用于細(xì)菌性病原體或某些真核生物(如錐和瘧原蟲物種),因?yàn)槠淙狈NAi的能力。最經(jīng)典的例子就是蜜蜂的寄生蟲疾病,此疾病會導(dǎo)致蜜蜂高發(fā)病率和高死亡率。蜜蜂的寄生蟲具備應(yīng)用RNAi的2個(gè)要點(diǎn):首先,其具有RNAi的分子機(jī)制;其次,中腸作為攝取dsRNA的場所,寄生蟲能夠在蜜蜂中腸上繁殖。蜜蜂寄生蟲的ADP/ATP轉(zhuǎn)運(yùn)子對于能量代謝是至關(guān)重要的,當(dāng)感染疾病的蜜蜂取食了含有寄生蟲的ADP/ATP轉(zhuǎn)運(yùn)子的dsRNA后,寄生蟲的靶標(biāo)基因表達(dá)量下降,蜜蜂的死亡率會隨之下降。
真核寄生蟲除了能夠利用腸道作為傳遞RANi的場所,還可以利用昆蟲器官傳遞系統(tǒng)性RNAi信號,已經(jīng)在以蜜蜂血液為食的寄生蟲瓦螨中得到證實(shí)。當(dāng)蜜蜂取食了瓦螨特定基因的dsRNA之后,寄居在蜜蜂上的螨蟲群體明顯減少,同時(shí)對蜜蜂沒有明顯的有害影響。隨后,研究者利用熒光蛋白的dsRNA(dsRNA-GFP)檢測蜜蜂體內(nèi)是否能夠進(jìn)行系統(tǒng)性RNAi。蜜蜂和寄生蟲體內(nèi)均沒有綠色熒光蛋白基因,故可以利用GFP-RNA檢測干擾效果。當(dāng)感染寄生蟲的蜜蜂取食含有dsRNA-GFP的蔗糖溶液后,寄生蟲全身覆蓋GFP-RNA。除此而外,將這些寄生蟲轉(zhuǎn)移到?jīng)]有取食dsR-NA-GFP的蜜蜂上,蜜蜂體內(nèi)會含有GFP-RNA。說明RNAi信號不僅可以在昆蟲個(gè)體水平進(jìn)行傳播和放大,同時(shí)還可以在蜜蜂繁殖群體水平進(jìn)行傳播。下一步需要研究如何使RNAi的效率和劑量持續(xù)保護(hù)益蟲群體,同時(shí)控制寄生蟲的成本是否合理,以及對蜜蜂群體的健康是否有害都需要加以考慮。
可以利用RNAi抗病毒保護(hù)昆蟲,同時(shí)也可以利用RNAi進(jìn)行抗病毒治療。利用RNAi介導(dǎo)來抑制昆蟲感染病毒,同時(shí)還可以預(yù)防一些人類、牲畜和農(nóng)作物嚴(yán)重病毒性疾病。外源提供和攝取的dsRNA可以提高宿主本身RNAi運(yùn)轉(zhuǎn)效率,保護(hù)宿主包括預(yù)防和直接治療。RNAi介導(dǎo)的抗病毒免疫有利于抑制蚊子的登革熱病毒、辛德畢斯病毒和西尼羅河病毒等。此外,加強(qiáng)RNAi通路能夠促進(jìn)病毒抑制,例如通過基因工程使昆蟲體內(nèi)表達(dá)特定病毒序列的反向重復(fù)RNA,從而促發(fā)dsRNA生成。
蜜蜂是另一個(gè)遭病毒侵襲亟須被保護(hù)的昆蟲,其中以色列急性麻痹病毒(IAPV)可能導(dǎo)致蜜蜂種群持續(xù)下降和群落消失的危險(xiǎn)??茖W(xué)家通過體外合成IAPV基因組的dsRNA,感染IAPV的蜜蜂取食后,體內(nèi)的RNAi工廠機(jī)制可以消除IAPV。實(shí)驗(yàn)室和蜂場試驗(yàn)表明,在接種IAPV以前飼喂特異RNA的IAPV,與只接種IAPV比較,其幼蟲孵化率和產(chǎn)蜜量均明顯較高。此結(jié)果在美國已經(jīng)進(jìn)行了大量的田間試驗(yàn)。2007年Beeologics公司成立了一個(gè)研究小組,開始研制一種治療此病毒的制劑,研發(fā)出殺死IAPV的藥物Remebee,是利用核糖核酸干擾機(jī)制,阻止目的基因表達(dá)。Remebee是以RANi為基礎(chǔ),理論上RANi生物制劑能促使RANi發(fā)生。
3 展望
近年對昆蟲RNAi的研究展示了科學(xué)發(fā)現(xiàn)的偉大力量和其控制昆蟲種群的潛力。隨著科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,RNAi已經(jīng)不再是靈丹妙藥,但卻提出了一系列的新概念,給昆蟲學(xué)家提出了新的技術(shù)挑戰(zhàn),沒有一種技術(shù)是適用于所有物種的。同時(shí),RNAi信號是如何在單個(gè)細(xì)胞里放大和在昆蟲細(xì)胞間傳播的也始終困擾著科學(xué)家。因此,昆蟲RNAi如何運(yùn)轉(zhuǎn)的問題仍需堅(jiān)持不懈的研究探索。
4 參考文獻(xiàn)
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