AGCU-Y24-STR和YfilerTM-STR試劑盒的比較研究

馬沁雅申君毅

（1 長治市公安局刑事技術(shù)支隊 山西 長治 046000；2 山西省公安廳科技處 山西 太原 030000）

AGCU-Y24-STR和YfilerTM-STR試劑盒的比較研究

馬沁雅1申君毅2

（1 長治市公安局刑事技術(shù)支隊 山西 長治 046000；2 山西省公安廳科技處 山西 太原 030000）

比較AGCU-Y24-STR和YfilerTM-STR試劑盒的法醫(yī)學應用價值。采用這兩種試劑盒分別進行平行擴增，研究在遺傳多態(tài)性、各種檢材、親子鑒定中的應用。AGCU-Y24-STR試劑盒基因座可單次檢測24個Y-STR基因座，可大幅度提高多態(tài)性信息含量，其單倍型多樣性和非父排除能力高于YfilerTM-STR試劑盒。兩種試劑盒在各種檢材檢驗中17個共有-Y-STR分型結(jié)果一致，AGCUY24-STR新增的7個基因座GD均大于0.5，適于山西漢族人群，在親子鑒定中尤其是基因突變的樣本檢驗有更高的應用價值。AGCU-Y24-STR大幅提高了多態(tài)性信息含量和個體識別能力，選擇了在中國人群中突變率低的基因座，更適于男性家系調(diào)查及Y-STR數(shù)據(jù)庫建設。

Y-STR AGCU-Y24-STR試劑盒 YfilerTM-STR試劑盒 遺傳多態(tài)性

1 引 言

近年來，隨著DNA數(shù)據(jù)庫的建立及全國聯(lián)網(wǎng)，大量的現(xiàn)場生物物證和人員樣本的DNA分型入庫，實現(xiàn)了全國范圍內(nèi)的資源共享，為揭露犯罪、證實犯罪、打擊犯罪和重特大災害事故處置提供了強有力的技術(shù)支撐，發(fā)揮了其他技術(shù)無法替代的特殊作用。目前，美國AB公司研發(fā)的YfilerTM-STR試劑盒因結(jié)果可靠、穩(wěn)定在日常檢案中被廣泛應用，但檢驗成本高，在Y-STR家系的大量排查中受到了限制[1]。國產(chǎn)試劑盒的AGCU-Y24-STR是無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司研發(fā)的新一代Y-STR復合擴增試劑盒，比YfilerTM-STR試劑盒新增了DYS447、DYS392、DYS522、DYS388、DYS444、DYS527a/b共7個高多態(tài)性Y-STR基因座，更適于中國人群，提高了Y-STR數(shù)據(jù)庫的兼容性，因經(jīng)濟、高效在日常檢案中具有更為廣泛的應用價值。

2 材料和方法

2.1 樣本來源

1500例血樣均采自于隨機抽取的，籍貫為山西，漢族，無親緣關(guān)系的志愿捐血者。

2.2 PCR擴增

AGCU-Y24-STR熒光檢測試劑盒 (無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司)、YfilerTM-STR試劑盒（美國AB公司)在兩臺9700型擴增儀對樣本進行平行直擴。PCR擴增體系及擴增條件分別參照這兩種試劑盒說明書。

2.3 Y-STR分型

在96孔電泳板取中每孔分別加入1μL擴增產(chǎn)物，10μL甲酰胺，0.5μL內(nèi)標，放入3130XL遺傳分析儀收集分析Y-STR分型數(shù)據(jù)。

2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析

兩種試劑盒的等位基因頻率采用直接計數(shù)法統(tǒng)計，基因多樣性 (GD)按公式 GD = n (1-∑Pi2) / (n-1) (Pi為等位基因，n為樣本數(shù)) 分析。

3 結(jié)果

3.1 遺傳多態(tài)性應用

Y-STR檢測結(jié)果顯示，在1500例無關(guān)男性個體樣本中，AGCU-Y24-STR和YfilerTM-STR試劑盒等位基因頻率分布均在0.0084～0.7719，基因多樣性值均為0.3748 (DYS391)～0.9705 (DYS385a/b) （詳見下表）。在共有的17個Y-STR基因座中，DYS391、DYS437、DYS438的GD值均小于0.5，在山西漢族群體中遺傳多態(tài)性較低。而AGCU-Y24-STR新增的7個Y-STR基因座DYS392、DYS388 、DYS447、DYS444、DYS527a/b 、DYS522在山西漢族群體中GD值均大于0.5，分別為0.7653、0.5022、0.8228、0.6858、0.9418、0.6863，其基因型具有更好的家系代表性，更加適合于Y-STR數(shù)據(jù)庫建設。我們還發(fā)現(xiàn)，DYS392基因座出現(xiàn)稀有基因10.2，說明該基因座在山西漢族群體中有豐富的遺傳多態(tài)性。且該試劑盒單次檢測可同時擴增24個基因座，HD值為0.9999932，DC值為0.9980677，具有較高的單倍型多樣性和非父排除能力。

表 山西漢族無關(guān)男性7個Y-STR基因座等位基因頻率(n=1500)

DYS527a/b GD=0.9416等位基因 (A) 頻數(shù) 頻率 (F) 等位基因 (A) 頻數(shù) 頻率 (F) 17/20 2 0.00133 21/22 154 0.10267 17/23 1 0.00067 21/23 127 0.085499 18 1 0.00067 21/23.2 1 0.00067 18/19 12 0.00800 21/24 68 0.04610 18/20 8 0.00533 21/25 11 0.00733 18/22 1 0.00067 21/26 4 0.00267 18/23 5 0.00333 21/28 1 0.00067 18/24 4 0.00267 22 125 0.08466 18/25 1 0.00067 22/23 108 0.07292 19 14 0.00933 22/24 35 0.0235 19/20 88 0.05867 22/25 6 0.00419 19/21 30 0.02000 22/26 6 0.00419 19/22 11 0.00733 23 90 0.0614 19/23 11 0.00733 23/24 29 0.01928 19/24 5 0.00333 23/25 11 0.00754 19/25 6 0.00400 23/26 2 0.00133 19/26 1 0.00067 23/27 1 0.00067 20 40 0.02667 24 10 0.00670 20/21 57 0.03800 24/25 2 0.00133 20/22 45 0.03000 25 5 0.00335 20/23 104 0.06933 19/20/21 1 0.00067 20/24 72 0.04800 19/20/22 1 0.00067 20/25 26 0.01760 19/20/21 1 0.00067 20/26 5 0.00333 19/21/23 1 0.00067 20/27 1 0.00067 20/22/25 1 0.00067 20.1 1 0.00067 21/22/23 1 0.00067 21 136 0.09066 21/23/24 1 0.00067 DYS522 GD=0.6863等位基因 (A) 頻數(shù) 頻率 (F) 8 1 0.00067 9 10 0.00672 10 161 0.10915 11 566 0.37448 12 587 0.39043 13 143 0.09656 14 31 0.02099 15 1 0.00067

3.2 在常規(guī)檢案中的應用

本文采用AGCU-Y24-STR和YfilerTM-STR試劑盒對日常檢案積累的血卡、口腔拭子、口香糖、泥土和色素污染的血痕、精斑等進行平行檢測，在共有的17個Y-STRA基因座分型結(jié)果一致。值得注意的是，DYS527a/b基因座出現(xiàn)多個擴增條帶，為多拷貝Y-STR基因座，共檢出54種單倍型，其中有6個(19/20/21；19/20/22；19/21/23；20/22/25；21/22/23；21/23/24)三拷貝單倍型，在多個男性的混合樣本判斷時，應注意結(jié)合其他基因座或Y-STR檢測系統(tǒng)綜合分析判斷，

3.3 在親子鑒定中的應用

本文通過對日常檢案中不排除親緣關(guān)系的50例雙親和50例單親檢材進行RCP的比較，AGCU-Y24-STR和YfilerTM-STR試劑盒RCP≥99.999%的分別為97例、92例，占97%和92%，而RCP≤99.95%分別為6例、12例，占6%和11%。這是由于AGCU-Y24-STR試劑盒有DYS392等7個高度多態(tài)性基因座的加入，使得多態(tài)性信息含量和個體識別能力增高。

4 討論

近年來，隨著社會的不斷發(fā)展變化，企業(yè)招工、農(nóng)村耕地占用、城中村改造等工作中涉及到的費用補償問題，已逐步成為治安管理部門不容忽視的社會矛盾之一，其中戶籍管理過程中親緣關(guān)系鑒定便越來越成為化解矛盾的有效手段，Y-STR檢驗技術(shù)不僅在認定犯罪方面發(fā)揮了其他證據(jù)手段不可替代的作用，在打拐、尸源認定、親子鑒定、Y染色體家系排查等方面也越來越顯示出其獨特的功能優(yōu)勢[2]。應用更適合的試劑盒進行檢驗，可以及時準確地獲取DNA分型數(shù)據(jù)，國產(chǎn)試劑盒AGCUY24-STR選擇了更適合我國人群的高度多態(tài)性STR基因座，以其經(jīng)濟、高效的特點極大地節(jié)約辦案經(jīng)費并提升案件偵查效率，適于案件排查和家系親緣搜索，對多人性侵案中犯罪嫌疑人數(shù)目判斷具有極高的應用價值[3]。

綜上，這兩種試劑盒檢測的1500名無關(guān)男性個體在17個共有Y-STR基因座分型結(jié)果一致，均能滿足法醫(yī)學實際應用需要[4]。尤其是國產(chǎn)化試劑盒AGCU-Y24-STR，新增的高多態(tài)性基因座DYS392、DYS388 、DYS447、DYS444、DYS527a/ b 、DYS522在山西漢族人群中GD值均大于0.5，分別為0.7653、0.5022、0.8228、0.6858、0.9418、0.6863，HD值為0.9999932，DC值為0.9980677，說明該AGCU-Y24-STR系統(tǒng)其單倍型具有更好的家系代表性，在親緣關(guān)系鑒定中基因突變、近親鑒定的疑難案例中比YfilerTM-STR試劑盒具有顯著優(yōu)勢，尤其適于山西漢族人群的家系排查認定，適用于實際案件犯罪嫌疑人的身份排查，適用于性犯罪等男女混合斑的男性犯罪個體識別[5]。且該試劑盒單次檢測可同時擴增24個基因座，包含17個YfilerTM-STR試劑盒基因座，7個新增的高度多態(tài)性基因座，為快速反應試劑盒，單次擴增可獲得更充分的多態(tài)性信息，兼容現(xiàn)有的法醫(yī)檢測系統(tǒng)，完全符合國際標準和法庭科學DNA數(shù)據(jù)庫建設，更適合Y-STR數(shù)據(jù)庫建設、家系排查和父系親緣關(guān)系鑒定，從而更好地規(guī)范親緣關(guān)系鑒定工作，做到公正、公平、公開，為群眾辦實事、解難題，充分發(fā)揮DNA技術(shù)的社會效益。

[1]吳微微,鄭小婷,潘立鵬,等.浙江漢族人群16個Y-STR基因座遺傳多態(tài)性調(diào)查[J].刑事技術(shù),2005(5):422-426．

[2]李斌,呂政,王澍,等.福建漢族人群17個Y-STR基因座遺傳多態(tài)性調(diào)查[J].刑事技術(shù),2008(2):246-249.

[3]焦偉,劉斐,黎海瀾,等.16個Y-STR基因座在廣西苗族、瑤族、侗族人群中的遺傳多態(tài)性[J].法醫(yī)學雜志,2012(5):355-358.

[4]Y.P. Hou,J. Zhang,Y.B. Li,et al.Allele sequences of six new Y-STR loci and haplotypes in the Chinese Han population[J]. Forensic Science International,2001(2):5-8.

[5]Myung Jin Park,Hwan Young Lee,Ji-Eun Yoo,et al.Forensic evaluation and haplotypes of 19 Y-chromosomal STR loci in Koreans[J]. Forensic Science International,2004 (2):68-70.

（責任編輯：孟凡騫）

DF795.2

A

2095-7939（2017）01-0105-03

10.14060/j.issn.2095-7939.2017.01.017

2016-11-06

馬沁雅（1982-），女，山西長治人，山西省長治市公安局刑事技術(shù)支隊主檢法醫(yī)師，主要從事法醫(yī)物證研究。