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    分泌蛋白質(zhì)組學在腫瘤標志物中的研究進展

    2017-04-06 05:46:08余樂正柳鳳娟吳正雨冉小強
    生物技術(shù)通報 2017年3期
    關鍵詞:前列腺癌胃癌肺癌

    余樂正 柳鳳娟 吳正雨 冉小強

    (貴州師范學院化學與生命科學學院,貴陽 550018)

    分泌蛋白質(zhì)組學在腫瘤標志物中的研究進展

    余樂正 柳鳳娟 吳正雨 冉小強

    (貴州師范學院化學與生命科學學院,貴陽 550018)

    在腫瘤發(fā)生、發(fā)展過程中,腫瘤細胞會分泌出大量蛋白質(zhì),而一些分泌蛋白已作為腫瘤標志物被用于腫瘤的臨床檢測與預后判斷。隨著蛋白質(zhì)組學技術(shù)的快速發(fā)展,分泌蛋白質(zhì)組學應運而生,并為腫瘤研究提供了新的思路與方法?,F(xiàn)就分泌蛋白質(zhì)組學在腫瘤標志物研究中的策略及進展做一綜述,旨在為研究人員在腫瘤標志物發(fā)現(xiàn)及篩選方面提供借鑒。

    分泌蛋白;分泌蛋白質(zhì)組;分泌蛋白質(zhì)組學;腫瘤標志物

    惡性腫瘤是當今人類生活中最危險的疾病之一,其致死率在發(fā)達國家中位居第一,在發(fā)展中國家也位居第二[1]。隨著世界人口數(shù)量的不斷增加,人口老齡化的不斷加劇及工業(yè)化引起的人類生活環(huán)境質(zhì)量的不斷下降,許多惡性腫瘤的患病率仍將繼續(xù)上升。由于惡性腫瘤大都具有高發(fā)病率和高致死率的特點,越早發(fā)現(xiàn),其治愈的幾率就越大,因此惡性腫瘤的早期診斷已成為腫瘤治療及延長患者生命的關鍵[2]。作為一種強有力的系統(tǒng)生物學工具,蛋白質(zhì)組學(proteomics)技術(shù)的快速發(fā)展在深度和廣度上不斷推進惡性腫瘤的研究進程。利用蛋白質(zhì)組學技術(shù)對惡性腫瘤分泌蛋白質(zhì)組進行系統(tǒng)研究,找到特異性強、靈敏度高的腫瘤標志物,進而揭示其表達水平的變化與惡性腫瘤發(fā)生發(fā)展不同階段的相互關系與規(guī)律,已逐漸成為惡性腫瘤早期診斷的最有效途徑,本文對分泌蛋白質(zhì)組學技術(shù)在腫瘤標志物研究中的進展進行了分析,以期為新的腫瘤標志物的發(fā)現(xiàn)及篩選提供借鑒。

    1 分泌蛋白、分泌蛋白質(zhì)組及分泌蛋白質(zhì)組學

    分泌蛋白(secreted proteins/secretory proteins)是對所有在細胞內(nèi)合成,再被分泌到其它細胞器、細胞外環(huán)境及其它細胞內(nèi)起作用的蛋白質(zhì)的統(tǒng)稱,主要包括細胞因子、生長因子、補體、降解酶類、抗體、肽類激素及免疫球蛋白等具有重要生理功能的蛋白質(zhì)。根據(jù)蛋白質(zhì)分泌過程中是否有N端信號肽的參與,分泌蛋白可簡單分為經(jīng)典分泌蛋白和非經(jīng)典分泌蛋白兩大類[3,4]。1994年,澳大利亞Macquarie大學的Wilkins和Williams[5]首次提出了蛋白質(zhì)組(proteome)的概念,以表征一個基因組、細胞或組織在一定時期內(nèi)所表達出的所有蛋白質(zhì)。2000年,Tjalsma等[6]在研究枯草桿菌分泌蛋白時,在蛋白質(zhì)組的基礎上又提出了“分泌蛋白質(zhì)組”(secretome)的概念。分泌蛋白質(zhì)組是指一個基因組、細胞或組織所表達的全部分泌蛋白,其數(shù)量約為整個蛋白質(zhì)組的30%[7]。分泌蛋白質(zhì)組學(secretomics)則是以分泌蛋白質(zhì)組為研究對象,利用蛋白質(zhì)組學技術(shù)從整體水平上對分泌蛋白組成及其活動規(guī)律進行的研究[8]。

    2 腫瘤標志物與分泌蛋白質(zhì)組學

    腫瘤是由遺傳和環(huán)境等多種因素協(xié)同作用所致的疾病,其細胞具有無限增殖的特點。腫瘤標志物(tumor markers,TMs)是指在惡性腫瘤發(fā)生和增殖過程中,由腫瘤細胞合成分泌的或因機體對腫瘤反應而異常產(chǎn)生或升高的,反映腫瘤存在與生長的一類物質(zhì)[9]。腫瘤標志物包括DNA、RNA、蛋白質(zhì)和代謝物等活性分子[10]。通過對血液、尿液、脊髓液等體液和細胞中該類物質(zhì)的定性定量檢測,可為判斷是否存在腫瘤、腫瘤的類型、腫瘤發(fā)展階段、療效及預后評估等提供實驗依據(jù)[11]。理想的腫瘤標志物應具有靈敏度高、特異性強、易于檢測、經(jīng)濟性好、可定位腫瘤等特點。

    在惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中,腫瘤細胞會分泌出諸如細胞因子、蛋白水解酶等多種蛋白質(zhì),而不同類型、不同發(fā)展階段的腫瘤細胞釋放出的分泌蛋白的種類與表達水平也各不相同,分泌蛋白已成為潛在腫瘤標志物的主要來源[12-18]。因此,利用分泌蛋白質(zhì)組學技術(shù)對惡性腫瘤細胞分泌物進行系統(tǒng)深入的研究,不僅有助于全面理解、認識、分析與解釋惡性腫瘤發(fā)生和發(fā)展的分子機制,對于腫瘤標志物的篩選,腫瘤的早期診斷、監(jiān)測、治療及抗腫瘤藥物的研發(fā)等也具有重要指導意義。近期的研究還證實,非經(jīng)典分泌也是惡性腫瘤細胞轉(zhuǎn)運蛋白質(zhì)的主要途徑之一,而一些非經(jīng)典分泌蛋白則成為被忽略的潛在腫瘤標志物和藥物靶點[19,20]。

    3 腫瘤分泌蛋白質(zhì)組的研究策略

    腫瘤分泌蛋白質(zhì)組的研究策略可分為兩大類,即基于基因組學技術(shù)和基于蛋白質(zhì)組學技術(shù)的研究[21,22]?;诨蚪M學技術(shù)的研究策略:首先利用基因芯片對實驗樣品進行檢測,以獲取腫瘤相關的基因序列特征信息;再采用生物信息學方法進行分析,篩選出可能編碼分泌蛋白的基因;最后通過實驗手段對篩選出的基因組進行相關驗證?;诘鞍踪|(zhì)組學技術(shù)的研究策略大致可分為5步,即分泌蛋白的收集或制備、分泌蛋白的分離與鑒定、差異蛋白質(zhì)的定量檢測、生物信息學軟件預測及目標蛋白質(zhì)的驗證。前者雖然具有簡單、快捷、高效等特點,但由于基因組水平的研究不能完全準確地反映細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的真實情況[23],使得該策略的實用價值大大降低。而后者雖然起步較晚,但由于蛋白質(zhì)較DNA和mRNA能更準確地反映腫瘤的病理學變化[24],伴隨著實驗技術(shù)、蛋白質(zhì)組學技術(shù)及生物信息學的快速發(fā)展,該策略已逐漸成為腫瘤分泌蛋白質(zhì)組研究的主要策略。

    4 腫瘤標志物研究中的蛋白質(zhì)組學技術(shù)

    目前,已有多種蛋白質(zhì)生物標志物被用于腫瘤的臨床診斷與治療,其檢測與評估主要通過各種蛋白質(zhì)組學技術(shù)。這些蛋白質(zhì)組學技術(shù)可簡單分為基于質(zhì)譜(MS-based)和不依賴于質(zhì)譜(non-MS-based)兩大類[25]。其中,不依賴于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學技術(shù)主要包括蛋白質(zhì)微陣列、血清蛋白質(zhì)電泳、蛋白質(zhì)印跡法(Western blot)、 酶聯(lián)免疫吸附測定法(ELISA)等[26]。

    作為一種高通量、低消耗、小型化的類似于基因芯片的分析技術(shù),蛋白質(zhì)微陣列在過去10年中得到了快速發(fā)展。通過該技術(shù),研究人員可同時對數(shù)以萬計的蛋白質(zhì)進行分析,從而為生物標志物識別、蛋白質(zhì)相互作用研究等提供了更多選擇[27]。而經(jīng)過數(shù)十年的改進提升,蛋白質(zhì)電泳、Western blot、ELISA等蛋白質(zhì)檢測技術(shù)現(xiàn)已較為成熟。

    近年來,實際用于腫瘤標志物、藥物靶標等篩選的蛋白質(zhì)組學技術(shù)多以質(zhì)譜為核心。根據(jù)蛋白質(zhì)分離方法的不同,基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學技術(shù)可分為基于凝膠的方法和不依賴于凝膠的方法[10,25,26,28]。前者包括二維凝膠電泳(2-DE)和差異凝膠電泳(DIGE);后者主要包括細胞培養(yǎng)穩(wěn)定同位素標記(SILAC)、同位素標記相對和絕對定量(iTRAQ)、同位素標記的親和標簽(ICAT)、串聯(lián)質(zhì)譜標簽(TMT)等方法。由于具有高通量、高靈敏度等特點[29],這些基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學技術(shù)也能同時處理數(shù)以萬計的蛋白質(zhì),雖然樣品中蛋白質(zhì)的含量很低。因此,許多研究小組利用這些技術(shù)以快速準確地識別惡性腫瘤診斷與治療中的潛在蛋白標志物[10]。

    5 分泌蛋白質(zhì)組學技術(shù)在惡性腫瘤標志物研究中的應用

    在惡性腫瘤的研究中,分泌蛋白質(zhì)組學技術(shù)主要應用于篩選腫瘤標志物,探索腫瘤發(fā)生發(fā)展機制,尋找潛在的腫瘤藥物靶點等方面[7,12]。由于腫瘤標志物的檢測不僅在腫瘤診斷、腫瘤發(fā)生發(fā)展機制研究中具有重要作用,還可為腫瘤的臨床治療提供依據(jù),進而以其為靶點實現(xiàn)腫瘤的靶向及免疫治療。因此,腫瘤標志物在腫瘤研究中占有十分重要的地位,而腫瘤標志學也發(fā)展成為腫瘤學中一個重要的新學科、新領域。分泌蛋白質(zhì)組學研究最主要的目的就是找到準確、可靠、專一的腫瘤標志物,從而為惡性腫瘤的早期診斷與治療提供實驗依據(jù)。通過分泌蛋白質(zhì)組學技術(shù),近年來已發(fā)現(xiàn)了不少可成為腫瘤標志物的分泌蛋白[30-33]。根據(jù)CA期刊在線發(fā)布的《2012全球癌癥統(tǒng)計》報告[34]及全國腫瘤登記中心出版的《2014年中國腫瘤登記年報》[35],本文將10種最常見的惡性腫瘤潛在分泌性蛋白標志物匯總于表1中,并對其中5種進行了重點介紹。

    表1 分泌蛋白質(zhì)組學技術(shù)發(fā)現(xiàn)的潛在惡性腫瘤蛋白標志物

    5.1 肝癌

    肝癌是臨床上最常見的惡性腫瘤之一,因其惡性程度極高,預后極差,被稱為“癌中之王”。我國是肝癌最主要的高發(fā)區(qū),2012年新增肝癌病例數(shù)和死亡病例數(shù)約占全球總數(shù)的一半[34,108]。甲胎蛋白(AFP)是肝癌診斷中最主要的指標之一,但臨床上約30%肝癌患者的AFP檢測結(jié)果為陰性,且AFP檢測不能準確地區(qū)分早期肝癌與慢性肝炎和肝硬化[109,110],故尋找靈敏度更高、特異性更強的肝癌標志物已成為肝癌研究的重要課題。Yamashita等[36]運用2D LC-MS/MS技術(shù)從HepG2細胞中發(fā)現(xiàn)86個分泌蛋白,其中10個含信號肽的分泌蛋白為最新發(fā)現(xiàn)。Zinkin等[37]采用SELDI-TOF MS技術(shù),通過對41例肝癌患者和51例肝硬化患者間分泌蛋白質(zhì)組進行比較研究發(fā)現(xiàn),胱抑素C等11個蛋白質(zhì)表達水平變化明顯。以這些蛋白質(zhì)為標志物組合對肝癌進行聯(lián)合檢測,其診斷的靈敏度和特異性分別高達79%和86%。Wu等[39]利用1D SDS-PAGE和nano-LC-MS/MS技術(shù)對23種癌細胞系進行系統(tǒng)分析后,共識別出4 584個非冗余的蛋白質(zhì),其中196個是肝癌細胞獨有的。通過對44例肝癌患者和45例健康人蛋白質(zhì)組進行比較分析發(fā)現(xiàn),肝癌患者血漿中單核細胞分化抗原CD14表達水平明顯高于健康人的。此外,根據(jù)人類蛋白質(zhì)圖譜(Human Protein Atlas)數(shù)據(jù)庫中得到的數(shù)據(jù),CD14在肝癌組織樣本中陽性著色率遠遠高于在其它19種癌癥,故推測CD14可能是一種特異性的肝癌標志物。為了識別出有效的肝癌循環(huán)生物標志物,Awan等[45]從7個開放的基因和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中提取出731個肝特異性的蛋白質(zhì)。對這些蛋白質(zhì)的表達譜進行驗證分析后,共篩選出20個可作為肝癌標志物的蛋白質(zhì),其中6個已被證實為肝細胞癌循環(huán)生物標志物。

    5.2 肺癌

    肺癌是全球最常見,也是導致死亡人數(shù)最多的惡性腫瘤[34,111]。由于其早期癥狀輕微,且缺乏特異性的生物標志物及早期篩查方法,大多數(shù)肺癌患者就診時已處于晚期,失去了手術(shù)機會。因此,找到高靈敏度、高特異性的肺癌標志物,已成為肺癌早期診斷與治療的關鍵。Chen等[46]運用2D-PAGE聯(lián)合MS技術(shù),通過對93份肺癌組織樣本和10份正常組織樣本進行比對研究發(fā)現(xiàn),抗氧化酶AOE372、ATP合酶亞基d(ATP5D)等9種蛋白質(zhì)在肺癌組織樣本中顯著過表達,表明它們可能是潛在的肺癌標志物。Luo等[52]運用1DE聯(lián)合LC-MS/ MS技術(shù)對A549細胞蛋白質(zhì)組進行研究后,構(gòu)建了一個包含382個蛋白質(zhì)的分泌蛋白數(shù)據(jù)集。ELISA證實C4b結(jié)合蛋白(C4BP)在非小細胞肺癌血清中上調(diào)表達。進一步的研究表明,C4BP血清表達水平與非小細胞肺癌的臨床分期緊密相關。Yu等[53]利用1D-SDS-PAGE聯(lián)合 nano-LC-MS/MS技術(shù)對肺癌胸腔積液蛋白質(zhì)組進行研究后,構(gòu)建了一個包含482個非冗余蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)集。為了識別出源自胸腔積液的潛在肺癌標志物,將該數(shù)據(jù)集與3個肺癌細胞系蛋白質(zhì)組進行比對分析后,共發(fā)現(xiàn)了107個胸腔積液中特有的蛋白質(zhì)。通過對68例肺癌患者和119例非致命性肺病患者胸腔積液中分泌蛋白質(zhì)組進行比對研究發(fā)現(xiàn),α2 HS糖蛋白(AHSG)和胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白2(IGFBP2)在肺癌患者胸腔積液中水平升高。Na等[54]利用蛋白質(zhì)組學技術(shù)對肺癌細胞分泌蛋白質(zhì)組進行分析后發(fā)現(xiàn),斯鈣素2(STC2)的表達水平高于鄰近正常細胞中的。RTPCR和Western blot進一步證實肺癌組織中STC2的mRNA和蛋白質(zhì)表達水平也高于鄰近正常組織,表明STC2可能是一種潛在的肺癌標志物,并在肺癌的轉(zhuǎn)移和發(fā)展中發(fā)揮了重要作用。

    5.3 乳腺癌

    乳腺癌是女性中最常被檢出,也是導致女性死亡人數(shù)最多的惡性腫瘤[34]。目前有關乳腺癌標志物的研究已有很多,而一些標志物也被應用于乳腺癌的臨床診斷與治療,但其靈敏度和特異性仍有待進一步提高。Zhao等[55]運用2-DE聯(lián)合MALDIMS技術(shù)對54例正常女性和76例乳腺癌患者血清蛋白質(zhì)組進行對比研究后發(fā)現(xiàn),乳腺癌患者血清中既有HSP27的上調(diào)表達,也有14-3-3 σ的下調(diào)表達。以這兩個蛋白質(zhì)為腫瘤標志物組合對104份未知血清樣本進行分類,其靈敏度和特異度分別高達100%和97%。Kulasingam等[59]通過對100例健康女性,50例健康男性及150例乳腺癌患者血清樣本進行檢測發(fā)現(xiàn),ALCAM的檢出率(0.78)高于經(jīng)典的乳腺癌標志物CA15-3(0.70)和CEA(0.63)的檢出率。此外,ROC曲線結(jié)果表明,聯(lián)合檢測血清中ALCAM和CA15-3,可進一步提高對乳腺癌的診斷靈敏度。Lai等[60]利用2D-DIGE聯(lián)合MALDI-TOF MS技術(shù),從MCF-7,MB-MDA-231和MCF-10A三個細胞系的蛋白質(zhì)組中發(fā)現(xiàn)了50個差異性表達的分泌蛋白,其中IFIT3和MMP2被證實是乳腺癌發(fā)展階段的潛在標志物。Tan等[64]運用2DE聯(lián)合圖像分析技術(shù)從MCF-7乳腺癌細胞系培養(yǎng)基中發(fā)現(xiàn)了CPA4、AAT、HSP70和HP 4個糖蛋白,而在正常乳腺上皮細胞(HMEpC)的培養(yǎng)基中則只發(fā)現(xiàn)了CPA4和ON 2個糖蛋白。凝集素印跡法分析進一步證實CPA4、AAT、HSP70、HP都是作為N端多糖而被分泌到MCF-7培養(yǎng)基中的,而只有CPA4是作為N端多糖被分泌到HMEpC培養(yǎng)基中,表明糖蛋白可作為糖基生物標志物用于乳腺癌的預后判斷。

    5.4 前列腺癌

    前列腺癌的檢出率在男性惡性腫瘤中排第二,其致死率在歐美發(fā)達國家惡性腫瘤中位居第三[34]。我國雖然不是前列腺癌的高發(fā)區(qū),但近年來隨著我國人口老齡化、飲食結(jié)構(gòu)改變等因素,前列腺癌的發(fā)病率和致死率也逐年升高。前列腺癌特異性抗原(prostate-specific antigen,PSA)是目前臨床上前列腺癌診斷最有價值的腫瘤標志物,但由于PSA是一個組織特異性而非腫瘤特異性的標志物,其檢測結(jié)果會受到諸多因素的影響,在改善患者預后方面也存在較大爭議[112]。因此尋找到專一性更強的腫瘤標志物,對于前列腺癌的早期診斷具有重要的臨床價值。Zheng等[65]利用SELDI技術(shù)對22例前列腺癌根治術(shù)切除標本進行分析后發(fā)現(xiàn),了一個特殊蛋白Pca-24。通過激光捕獲顯微切割技術(shù)(LCM),進一步證實Pca-24的確來自于前列腺癌細胞,表明Pca-24可能是一個有效的前列腺癌標志物。Pan等[113]采用SELDI-TOF MS對83例前列腺癌患者和95例健康男性血清樣本進行比對分析后,發(fā)現(xiàn)了18個血清差異性蛋白,其中4個表達水平升高,另外14個表達水平降低。Chen等[114]運用2DE聯(lián)合MALDITOF MS技術(shù)對BPH-1和LNCaP細胞條件培養(yǎng)液中蛋白質(zhì)組進行分析后,共發(fā)現(xiàn)了11個差異性表達蛋白,其中6個上調(diào),5個下調(diào)。以這些蛋白質(zhì)為前列腺癌標志物組合,可有效地區(qū)分前列腺癌和良性前列腺增生。Liu等[71]利用SWATH質(zhì)譜對10例正常前列腺組織樣本,24例非侵略性前列腺癌,16例侵略性前列腺癌,25例轉(zhuǎn)移性前列腺癌組織樣本進行比對分析后發(fā)現(xiàn),包括NAAA和PTK7等在內(nèi)的220個糖蛋白與前列腺癌的侵襲、轉(zhuǎn)移等多種生理過程緊密相關。通過蛋白質(zhì)微陣列技術(shù)對獨立樣本集進行分析,進一步證實這兩個糖蛋白與侵略性前列腺癌存在顯著關聯(lián),表明NAAA和PTK7可作為潛在的前列腺癌標志物。

    5.5 胃癌

    在我國惡性腫瘤中,胃癌的發(fā)病率位居第二,死亡率位居第三,每年約35萬人死于胃癌。目前臨床上能用于胃癌診斷與治療的腫瘤標志物還很少,而專門針對胃癌細胞系條件培養(yǎng)液蛋白質(zhì)組的研究也不多[108]。Chong等[73]運用MS技術(shù)結(jié)合iTRAQ標記對胃癌動物模型蛋白質(zhì)組進行研究后發(fā)現(xiàn),α胰蛋白酶抑制因子H3(ITIH3)在胃癌小鼠模型血漿中的表達水平顯著高于正常小鼠血漿中的。通過對83例正常人和84例胃癌患者血漿樣本進行分析,實驗結(jié)果表明ITIH3在胃癌患者血漿中的表達水平更高。以ITIH3為胃癌診斷標志物,ROC曲線得到的最佳靈敏度和特異性分別為96%、66%。Loei等[75]應用2D-LC-MS/MS技術(shù)結(jié)合iTRAQ標記對胃癌細胞系AGS和MKN7分泌蛋白組進行研究后,共發(fā)現(xiàn)了90個在條件培養(yǎng)液中表達水平升高的蛋白質(zhì)。免疫組化實驗表明顆粒體蛋白(GRN)在胃癌組織中頻繁表達,而在正常胃黏膜上皮細胞中不表達。ELISA分析進一步證實GRN在胃癌患者血清中的表達水平高于正常人群的,尤其是早期胃癌患者,表明GRN可能是早期胃癌診斷的潛在標志物。Penno等[76]利用2D-DIGE聯(lián)合LC-MS/MS技術(shù)對胃癌小鼠模型中正常型和腫瘤型分泌蛋白組進行比對分析后發(fā)現(xiàn),28個人類同源蛋白質(zhì)。以其中8個蛋白質(zhì)為胃癌診斷的標志物組合,ELISA分析證實載脂蛋白E和結(jié)合珠蛋白在胃癌患者血清中表達水平顯著升高,而afamin和叢生蛋白則明顯降低。ROC分析結(jié)果進一步表明這4個蛋白質(zhì)對于胃癌診斷的靈敏度和特異性可能要優(yōu)于現(xiàn)有的胃癌檢測標志物CA72-4。Wu等[78]利用2D-DIGE聯(lián)合Western blot、免疫組化技術(shù)對胃癌組織樣本及其鄰近正常組織樣本進行比對分析后發(fā)現(xiàn),GRP78、GSTpi、ApoAI、A1AT和GKN-1等5個蛋白質(zhì)可作為有效的胃癌標志物組合。實驗結(jié)果表明,GRP78、GSTpi在胃癌組織中顯著上調(diào)表達,A1AT顯著下調(diào)表達。此外,GRP78和ApoAI的表達水平與A1AT緊密相關。

    6 展望

    分泌蛋白是潛在的腫瘤標志物及藥物靶標等的主要來源,已成為腫瘤研究中的熱點和難點問題。由于具有靈敏度高、特異性強、復現(xiàn)性好、高通量、簡單、快捷等特點,基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學技術(shù)在過去十年中發(fā)展迅速,并在腫瘤標志物的篩選與鑒定、腫瘤分類與發(fā)生發(fā)展機制、治療與預后評估等方面承擔起越來越重要的角色。近期的研究還表明,多種腫瘤標志物聯(lián)合檢測的靈敏度和準確度較單一標志物檢測更高[83,115]。盡管蛋白質(zhì)組學方法在腫瘤研究的各個領域都取得了顯著成效,但目前仍存在諸多困難與問題。蛋白質(zhì)組學方法雖然能同時識別成千上萬的蛋白質(zhì),但檢測結(jié)果往往偏向于可溶性和高豐度的蛋白質(zhì),而容易錯過許多低豐度的具有重要生理功能的蛋白質(zhì)。腫瘤的異質(zhì)性是惡性腫瘤的特征之一[116],故即使在同一類型的惡性腫瘤中,也很難找到通用的蛋白標志物。此外,藥物研發(fā)的速度遠遠滯后于新的藥物靶標的發(fā)現(xiàn)速率,而藥物靶標的發(fā)現(xiàn)同樣來自于大量的蛋白質(zhì)組學研究。因此,雖然蛋白質(zhì)組學技術(shù)目前已篩選出大量腫瘤診斷、治療及預后的蛋白標志物,但其中只有很少一部分能應用于臨床。今后對于腫瘤標志物的研究應更注重其功能性研究和臨床試驗,以期獲得更快的檢出速度和更高的檢測成功率。在惡性腫瘤靶向和組合療法的臨床前與臨床研究中,蛋白質(zhì)組學技術(shù)有望發(fā)揮越來越重要的作用[25]。

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    (責任編輯 狄艷紅)

    Research Progress on Tumor Markers by Secretomics

    YU Le-zheng LIU Feng-juan WU Zheng-yu RAN Xiao-qiang
    (School of Chemistry and Life Science,Guizhou Normal College,Guiyang 550018)

    In the occurrence and development processes of tumor,a large number of proteins are secreted by tumor cells,and some of them are considered as tumor markers and used for clinical detection and prognosis. With the rapid development of proteomics techniques,secretomics is born at the right moment and provides new ideas and methods for tumor research. Now the strategy and the advance in the study of tumor markers by secretomics are reviewed,which may provide reference for the researchers in the discovery and screening of tumor markers.

    secreted proteins;secretome;secretomics;tumor markers

    10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.03.003

    2016-07-02

    貴州省科學技術(shù)基金計劃項目(黔科合J字[2014]2134號),貴州省普通本科高等學校青年科技人才成長項目(黔教合KY字[2016]219),貴州師范學院校級博士項目(12BS024),貴州師范學院校級大學生科研項目(2015DXS136)

    余樂正,男,博士,副教授,研究方向:生物信息學;E-mail:xinyan_scu@126.com

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