王延麗,楊 震
(赤峰學(xué)院 農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,內(nèi)蒙古 赤峰 024000)
蛋白組學(xué)及其在食品科學(xué)研究中的應(yīng)用
王延麗,楊 震
(赤峰學(xué)院 農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,內(nèi)蒙古 赤峰 024000)
隨著現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,在我國(guó)的人們生活當(dāng)中,出現(xiàn)了很多蛋白組學(xué).并且隨著人們物質(zhì)生活的不斷豐富,對(duì)于食品安全科學(xué)的問(wèn)題也變得越來(lái)越重視,因此在現(xiàn)階段的研究過(guò)程當(dāng)中,出現(xiàn)了蛋白組學(xué)來(lái)為有效的解決生命科學(xué)領(lǐng)域當(dāng)中的很多問(wèn)題,集中體現(xiàn)在了食品品質(zhì)與安全食品問(wèn)題等方面當(dāng)中,成為了其檢測(cè)食品科學(xué)問(wèn)題的有力工具.在本文當(dāng)中首先對(duì)蛋白組學(xué)進(jìn)行了概述;其次對(duì)蛋白組學(xué)在研究過(guò)程當(dāng)中的主要研究技術(shù)進(jìn)行了分析;最后針對(duì)其蛋白組學(xué)在食品科學(xué)研究中應(yīng)用進(jìn)行了分析.
蛋白組學(xué);食品科學(xué);應(yīng)用
在我國(guó)現(xiàn)階段的民生問(wèn)題當(dāng)中,食品安全問(wèn)題是一個(gè)相當(dāng)重要的問(wèn)題,對(duì)于我國(guó)的食品科學(xué)知識(shí)的教育有著很重要的作用.因此在此種情況下,蛋白組學(xué)的研究便應(yīng)用而生,已經(jīng)成為了一種先進(jìn)的生物技術(shù).在現(xiàn)代科技的發(fā)展過(guò)程當(dāng)中,基因組的研究也得到了全面的研究,并且逐漸的轉(zhuǎn)向了生命科學(xué)的分子方向研究,來(lái)自對(duì)生物體當(dāng)中的日常工作的新陳代謝進(jìn)行探究,最終保證人民的食品安全問(wèn)題得到最大限度的保障.
蛋白質(zhì)組(proteome),即為對(duì)基因組所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)進(jìn)行科學(xué)的表示,其中可實(shí)現(xiàn)對(duì)各種蛋白質(zhì)的良好修飾.在對(duì)蛋白質(zhì)組的研究過(guò)程當(dāng)中,可以進(jìn)行兩個(gè)方面的內(nèi)容進(jìn)行研究,其一為對(duì)蛋白質(zhì)的表達(dá)模式所進(jìn)行的研究,其二為對(duì)蛋白質(zhì)組當(dāng)中所呈現(xiàn)出的功能模式所進(jìn)行的研究.在現(xiàn)階段當(dāng)中,需要對(duì)其蛋白組學(xué)當(dāng)中所呈現(xiàn)出的相互內(nèi)容進(jìn)行研究,其中包括蛋白質(zhì)的發(fā)現(xiàn)與功能的明確、蛋白質(zhì)翻譯后的修飾特征、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析、蛋白質(zhì)活性的調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)的相互作用及其構(gòu)象研究、蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)分析以及亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中的蛋白質(zhì)分離、蛋白質(zhì)的表達(dá)分析以及生物信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與代謝途徑分析等多種內(nèi)容.
在我國(guó)現(xiàn)階段的研究技術(shù)當(dāng)中,可以利用多種方式來(lái)對(duì)其進(jìn)行研究,其中分別是蛋白質(zhì)組分分離技術(shù)、蛋白質(zhì)組分的鑒定技術(shù)、利用蛋白質(zhì)信息學(xué)進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能分析及預(yù)測(cè).在本文中,主要對(duì)雙向電泳質(zhì)譜(2-DE-MS)技術(shù)、多維色譜–質(zhì)譜聯(lián)用(MudPIT)技術(shù)以及SELDI-TOF-MS技術(shù)和蛋白質(zhì)信息學(xué)來(lái)進(jìn)行分析和研究.
在雙向電泳技術(shù)當(dāng)中,主要是利用一種對(duì)復(fù)雜蛋白質(zhì)的分離方式來(lái)實(shí)現(xiàn)的,在此種方式的應(yīng)用過(guò)程當(dāng)中,首先需要在蛋白質(zhì)自身的電點(diǎn)不同的情況下來(lái)對(duì)蛋白質(zhì)做出有效的分離,可以被稱(chēng)之為電聚焦,通過(guò)固定pH梯度技術(shù)(IPG)可以實(shí)現(xiàn)非常精確的蛋白質(zhì)分離并具有高度的可重復(fù)性.其次就需要根據(jù)蛋白質(zhì)自身當(dāng)中的分子質(zhì)量的大小來(lái)對(duì)其進(jìn)行蛋白質(zhì)的分離,形成一個(gè)蛋白質(zhì)的點(diǎn)圖譜,從而對(duì)其蛋白質(zhì)點(diǎn)的飽和度做出充分的顯示.
在多維色譜–質(zhì)譜聯(lián)用(MudPIT)技術(shù)的應(yīng)用過(guò)程當(dāng)中,主要是根據(jù)其中的胰蛋白酶消化的情況來(lái)對(duì)其中的特性做出分析的,其中多產(chǎn)生多肽在一定程度上會(huì)不斷的進(jìn)行強(qiáng)陽(yáng)離子的交換.在此種情況下,可以對(duì)實(shí)驗(yàn)當(dāng)中樣品進(jìn)行標(biāo)記對(duì)照,利用大量的對(duì)比和分析來(lái)對(duì)其中存在的蛋白組的定量信息做出搜集和分析.之后就可以對(duì)標(biāo)記過(guò)的多肽進(jìn)行添加到蛋白質(zhì)的消化混合物當(dāng)中,從而可以實(shí)現(xiàn)對(duì)多肽回收率的有效測(cè)定.在此種方式的應(yīng)用過(guò)程當(dāng)中,其中的速度是相對(duì)較高的,并且其靈敏度也是相對(duì)較快,并且在方法的通用性方面也是相當(dāng)高的.
在SELDI技術(shù)當(dāng)中,主要是利用離子交換柱或LC的介質(zhì)來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)的有效分離,并且在對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行分離之后,其中所具有的芯片就會(huì)對(duì)蛋白質(zhì)當(dāng)中所具有的抗體以及底物等多種物質(zhì)進(jìn)行單個(gè)或者多個(gè)目標(biāo)蛋白的信息提取.因此在利用此種方式進(jìn)行提取的過(guò)程當(dāng)中,可以最大限度的實(shí)現(xiàn)對(duì)復(fù)雜蛋白質(zhì)樣品的有效提取和分離,從而獲得富集蛋白質(zhì)的亞群信息,最終對(duì)蛋白質(zhì)當(dāng)中的圖譜信息作出有效的研究.在此種方式和方法當(dāng)中,其中應(yīng)用到的設(shè)備是相當(dāng)簡(jiǎn)單的,并且在對(duì)樣品的復(fù)雜性方面的要求也有了一定程度的減少,從而實(shí)現(xiàn)了對(duì)蛋白質(zhì)表面特征的快速提取.
在生物信息學(xué)(Bioinformatics)的研究當(dāng)中,主要是利用對(duì)生物學(xué)的一系列研究,來(lái)自實(shí)現(xiàn)對(duì)生物數(shù)據(jù)的有效獲取,其中包括對(duì)數(shù)據(jù)的獲取、加工、存儲(chǔ)、檢索以及分析等.在對(duì)蛋白質(zhì)的編碼序列進(jìn)行獲取的過(guò)程當(dāng)中,可以最大限度的實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白功能數(shù)據(jù)的有效搜集.在蛋白質(zhì)的信息學(xué)研究過(guò)程當(dāng)中,可以對(duì)蛋白質(zhì)組的分析起到一個(gè)良好的推動(dòng)作用,一方面可以將獲取到的數(shù)據(jù)信息和數(shù)據(jù)庫(kù)當(dāng)中存在的數(shù)據(jù)庫(kù)信息作出對(duì)比,從而對(duì)蛋白質(zhì)當(dāng)中的未知的功能進(jìn)行發(fā)現(xiàn).另外一方面,也可以通過(guò)對(duì)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)的分析,來(lái)對(duì)其功能作出預(yù)測(cè).一般情況下,在蛋白質(zhì)的組學(xué)當(dāng)中,會(huì)出現(xiàn)大量的復(fù)雜數(shù)據(jù),因此需要根據(jù)其大量的復(fù)雜的數(shù)據(jù)來(lái)對(duì)其蛋白質(zhì)當(dāng)中所具有的功能作出分析,其中包括表型以及結(jié)構(gòu)基因組和功能基因組數(shù)據(jù)等.由此可見(jiàn),在對(duì)蛋白質(zhì)組的分析過(guò)程當(dāng)中,其數(shù)據(jù)搜集和合并是一個(gè)主要的任務(wù),根據(jù)相關(guān)的數(shù)據(jù)來(lái)對(duì)蛋白質(zhì)的信息作出分析,比如蛋白質(zhì)的順序、核苷酸順序、雙向凝膠電泳、三維結(jié)構(gòu)、翻譯后的修飾、基因組及代謝數(shù)據(jù)庫(kù)等.
在蛋白組學(xué)的應(yīng)用過(guò)程當(dāng)中,得到了相當(dāng)廣泛的應(yīng)用和研究,在本文當(dāng)中分為以下幾個(gè)方面進(jìn)行了分析:
首先在糧油食品的應(yīng)用過(guò)程當(dāng)中,主要可以對(duì)糧食的作物產(chǎn)量以及其糧食的品質(zhì)做出充分的研究,集中體現(xiàn)在糧油食品的的農(nóng)作物性狀方面當(dāng)中.通過(guò)其蛋白質(zhì)組的研究,可以對(duì)現(xiàn)有的農(nóng)作物性狀做出一定程度的改變,在其產(chǎn)量、抗倒伏以及對(duì)病蟲(chóng)害的抵抗方面都有著相當(dāng)重要的影響.在實(shí)際的應(yīng)用過(guò)程當(dāng)中,如果對(duì)大豆種子進(jìn)行蛋白組的分析和干預(yù),可以充分的發(fā)現(xiàn)其中的所含有硫的氨基酸的濃度是相對(duì)較高的,從而度大豆蛋白的產(chǎn)量有一個(gè)全面的提高.比如在對(duì)小麥的生長(zhǎng)過(guò)程當(dāng)中在所含有的蛋白質(zhì)組進(jìn)行分析的話,在含有氮肥相對(duì)較多的小麥的產(chǎn)量是相對(duì)較多的,并且其中的籽粒的數(shù)量和飽滿程度均要明顯增加.
其次在肉類(lèi)食品當(dāng)中的應(yīng)用當(dāng)中,主要體現(xiàn)在了生物肌肉的生長(zhǎng)過(guò)程當(dāng)中,其中對(duì)于紅肌和白肌纖維所起到的作用差異較大.在肌肉纖維的生長(zhǎng)過(guò)程當(dāng)中,纖維自身當(dāng)中所具有的性狀對(duì)于肉類(lèi)食品來(lái)說(shuō),其影響是相當(dāng)大的.因此,在分析研究的過(guò)程當(dāng)中,可以對(duì)肌肉的生長(zhǎng)模型進(jìn)行描述,從而對(duì)其肌肉纖維的生長(zhǎng)情況以及肉質(zhì)之間所存在的關(guān)系作出分析和掌握了解.比如對(duì)雞胸脯纖維的蛋白質(zhì)組進(jìn)行研究的時(shí)候,需要對(duì)雞在各生長(zhǎng)時(shí)期當(dāng)中會(huì)呈現(xiàn)不同的變化規(guī)律進(jìn)行研究;對(duì)牛骨骼肌進(jìn)行研究的過(guò)程當(dāng)中,如果出現(xiàn)了過(guò)渡生長(zhǎng)的情況,則充分說(shuō)明了其中的肌肉蛋白質(zhì)的基因生長(zhǎng)情況發(fā)生了變化.與此同時(shí),還要注意的是,在動(dòng)物屠宰之后,其中自身的肌肉纖維也會(huì)對(duì)其品質(zhì)產(chǎn)生一定程度的影響,因此在研究的過(guò)程當(dāng)中,需要對(duì)不同的時(shí)期肌肉纖維當(dāng)中的新陳代謝做出研究,從而最大限度的保證其肉質(zhì)品質(zhì)的提升.
另外,在水產(chǎn)食品儲(chǔ)藏中的應(yīng)用當(dāng)中,一般情況下,在人們常見(jiàn)的水產(chǎn)食品種類(lèi)當(dāng)中,魚(yú)類(lèi)、貝殼類(lèi)、無(wú)脊椎動(dòng)物類(lèi)等水產(chǎn)食品的食品安全是相當(dāng)重要的,在研究的過(guò)程當(dāng)中需要對(duì)現(xiàn)代蛋白質(zhì)組學(xué)當(dāng)中的方式進(jìn)行全面的利用,來(lái)對(duì)其水產(chǎn)食品的存儲(chǔ)以及加工的過(guò)程當(dāng)中所呈現(xiàn)出來(lái)的品質(zhì)變化狀態(tài)做出分析和研究.比如在對(duì)鱈魚(yú)的肌肉當(dāng)中的蛋白質(zhì)圖譜進(jìn)行繪制的過(guò)程當(dāng)中,需要對(duì)不同冷藏狀態(tài)下的肌肉做出分析,在不同的存儲(chǔ)時(shí)間的影響下,對(duì)鱈魚(yú)肌肉纖維當(dāng)中所具有的肌漿球蛋白、激動(dòng)蛋白、醛縮酶A等物質(zhì)來(lái)進(jìn)行觀察.
最后還要對(duì)在乳品食品當(dāng)中的應(yīng)用進(jìn)行研究,在乳品食品當(dāng)中,所含有的蛋白質(zhì)的含量是相對(duì)較多的,因此在蛋白質(zhì)自身的水解變性程度方面也會(huì)對(duì)乳品的品質(zhì)產(chǎn)生重要的影響.在對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行水解之后,其中所含有的肽類(lèi)物質(zhì)就成為了乳品自身味道的關(guān)鍵部分,其中所具備的獨(dú)特的蛋白質(zhì)組學(xué)特性都起到了相當(dāng)重要的作用.如果將蛋白質(zhì)編碼中的幾個(gè)關(guān)鍵基因刪除,對(duì)于其中的所存在的β-酪氨酸末端就會(huì)在很大程度上出現(xiàn)10個(gè)殘基的轉(zhuǎn)移系統(tǒng)的現(xiàn)象,因此對(duì)于細(xì)胞內(nèi)部的物質(zhì)的運(yùn)轉(zhuǎn)能力會(huì)產(chǎn)生下降的現(xiàn)象.與此同時(shí),在對(duì)乳品食品的研究過(guò)程當(dāng)中,可以發(fā)現(xiàn)其中的幾種嗜熱乳酸類(lèi)細(xì)菌的蛋白質(zhì)在發(fā)酵之后進(jìn)行水解之后的提取蛋白質(zhì),也會(huì)產(chǎn)生相當(dāng)大的影響,其中所具備的水解能力是相當(dāng)強(qiáng)烈的,并且物質(zhì)當(dāng)中所含有的磷酸肽的蛋白質(zhì)則無(wú)法被水解.比如對(duì)酸奶進(jìn)行研究的過(guò)程當(dāng)中,其中所具備的乳酸菌以及益生菌也是相當(dāng)多的,需要對(duì)不同的菌株在不同的情況下所出現(xiàn)的蛋白質(zhì)數(shù)量以及種類(lèi)進(jìn)行研究.
綜上所述,在現(xiàn)代化的食品安全研究的過(guò)程當(dāng)中,蛋白組學(xué)的出現(xiàn)為食品科學(xué)的研究指明了很大程度的方向,同時(shí)也為食品科學(xué)的研究奠定了相當(dāng)良好的發(fā)展平臺(tái).蛋白組學(xué)的出現(xiàn)為蛋白質(zhì)功能的出現(xiàn)提供了重要的突破口,利用對(duì)蛋白組學(xué)的研究,可以充分的實(shí)現(xiàn)對(duì)食品種類(lèi)、品質(zhì)、功能以及安全等多個(gè)方面的蛋白質(zhì)生理機(jī)制以及結(jié)構(gòu)功能的全面保障.在未來(lái)的研究過(guò)程當(dāng)中,對(duì)于基因以及蛋白質(zhì)組的功能需要不斷的發(fā)揮其作用,充分的利用其蛋白組學(xué)的研究提高食品安全,在改善食品制作以及儲(chǔ)存條件的同時(shí),還可以對(duì)食品的口感以及營(yíng)養(yǎng)程度進(jìn)行不斷的提高.
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Q51
A
1673-260X(2017)09-0012-02
2017-06-02
赤峰學(xué)院學(xué)報(bào)·自然科學(xué)版2017年17期