胡 騎 , 王靜林 , 何于雯 , 孫 強(qiáng) , 吳 晶
(云南省熱帶亞熱帶動(dòng)物病毒病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院, 云南昆明650224)
云南師宗和江蘇盱眙中華按蚊的分子鑒定及COII基因序列分析
胡 騎 , 王靜林 , 何于雯 , 孫 強(qiáng) , 吳 晶
(云南省熱帶亞熱帶動(dòng)物病毒病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院, 云南昆明650224)
為了了解云南省師宗縣和江蘇省盱眙縣中華按蚊的分子鑒定及COII基因序列特征, 2014年7月在云南省師宗縣和江蘇省盱眙縣采集蚊蟲(chóng)標(biāo)本, 通過(guò)形態(tài)學(xué)鑒定出中華按蚊, 再提取蚊蟲(chóng)基因組DNA, 用COII基因特異引物和序列測(cè)定, 然后采用生物信息學(xué)軟件進(jìn)行核苷酸序列同源性和遺傳進(jìn)化分析。 結(jié)果在云南省師宗縣縣城周圍采集蚊蟲(chóng)標(biāo)本314只, 其中按蚊234只(74.52%);在江蘇省盱眙縣桂五鎮(zhèn)采集蚊蟲(chóng)標(biāo)本212只, 其中按蚊143只(67.45%)。 經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定, 每個(gè)地方挑選了8只疑似中華按蚊進(jìn)行序列分析, 結(jié)果顯示,16只蚊蟲(chóng)COII核苷酸序列同源性在98%-100%之間, 遺傳進(jìn)化分析顯示,16只蚊蟲(chóng)全部與中華按蚊位于同一進(jìn)化分支內(nèi)。 表明了采用分子鑒定的方法可有效地進(jìn)行蚊蟲(chóng)種類鑒定。
中華按蚊 COII基因 分子鑒定
中華按蚊(An.sinensis)是按蚊中分布最廣且最常見(jiàn)的種類之一;它偏嗜動(dòng)物血液,外棲或半外棲,種群數(shù)量大,是我國(guó)以往文獻(xiàn)記載中瘧疾和絲蟲(chóng)病的重要傳播媒介,對(duì)人類和家畜動(dòng)物危害極大[1-2]。但與其他按蚊形態(tài)學(xué)上非常相似,用傳統(tǒng)形態(tài)分類的方法很難對(duì)這些蚊蟲(chóng)進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定[2]。因此,本文對(duì)采集的中華按蚊進(jìn)行分子鑒定以及COII基因序列分析,從分子水平了解采集的蚊蟲(chóng)標(biāo)本與中華按蚊的遺傳進(jìn)化關(guān)系,為研究我國(guó)蚊蟲(chóng)分子分類提供資料,這對(duì)預(yù)防和控制以中華按蚊為傳播媒介的疾病發(fā)生和傳播具有重要的科學(xué)意義。
1.1 標(biāo)本采集 2014年7月在云南省師宗縣縣城周圍和江蘇省盱眙縣桂五鎮(zhèn)農(nóng)戶家牛圈采用誘蚊燈(功夫小帥,12 V; 300 mA; 湖北武漢)進(jìn)行標(biāo)本采集,采集時(shí)間段約為晚間18:00至次日早晨8:00共14 h。次日早晨收集標(biāo)本,將標(biāo)本置于-20℃冰箱中冷凍20~30min,待存活的蚊蟲(chóng)剛好冷凍死亡后,取出標(biāo)本根據(jù)蚊蟲(chóng)形態(tài)學(xué)特征采用解剖鏡進(jìn)行蚊蟲(chóng)形態(tài)學(xué)鑒定,將形態(tài)學(xué)鑒定為按蚊的蚊蟲(chóng)標(biāo)本放入70%乙醇中保存。
1.2 蚊蟲(chóng)DNA提取及PCR擴(kuò)增 從乙醇中取出按蚊標(biāo)本,在解剖顯微鏡下分離頭胸部及腹部,腹部用DNA提取試劑盒(天根生化科技(北京)有限公司)按說(shuō)明書(shū)提取蚊蟲(chóng)DNA,操作步驟如下:每只按蚊標(biāo)本用緩沖液GA 200 μL,充分研磨,加20 μL Proteinase K,56 ℃溫浴過(guò)夜,加200 μL緩沖液GB混勻,70 ℃放置10 min。加200 μL無(wú)水乙醇充分混勻15 min,過(guò)柱,分別用500 μL緩沖液GD和 600 μL 漂洗液PW洗滌,加 60 μL 洗脫緩沖液TE洗脫DNA。取2 μL cDNA做反應(yīng)模板,用COII特異引物[3]進(jìn)行PCR擴(kuò)增,依次加入10XBuffer 5 μL、2.5mmol /ld NTP 5 μL、上下游引物各1.25 μL、rTaq酶0.75 μL、去離子水31.75 μL,充分混勻,94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃30 s,52 ℃30 s,72 ℃60 s,35個(gè)循環(huán),72 ℃延伸10 min,1%瓊脂糖電泳檢查擴(kuò)增條帶,用TaKaRa DNA fragment Purification Kit純化PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物由昆明碩科公司進(jìn)行測(cè)序。
1.3 序列分析 使用Clustal X Version 2.1 軟件包進(jìn)行病毒基因核苷酸序列比對(duì),DNASTAR 軟件中MegAlign進(jìn)行核苷酸序列同源性分析。使用MEGA5.05 軟件完成基于Neighbor-joining (NJ) 方法的進(jìn)化樹(shù)繪制,bootstrap值為1 000。
1.4 使用日本奧林巴斯SZX-7解剖顯微鏡及明美顯微數(shù)碼成像系統(tǒng)對(duì)按蚊的頭胸部進(jìn)行照相,用于形態(tài)學(xué)鑒定。
2.1 蚊蟲(chóng)采集 2014年7月在云南省師宗縣縣城周圍采集蚊蟲(chóng)標(biāo)本314只,在江蘇省盱眙縣桂五鎮(zhèn)采集蚊蟲(chóng)標(biāo)本212只,共526只。經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定,云南省師宗縣采集按蚊234只(74.52%),庫(kù)蚊23只(7.32%),阿蚊45只(14.33%),其他蚊蟲(chóng)12只(3.82%);江蘇省盱眙縣桂五鎮(zhèn)采集按蚊為143只(67.45%),庫(kù)蚊45只(21.23%),阿蚊13只(6.13%),其他蚊蟲(chóng)11只(5.19%)。表明在云南省師宗縣和江蘇省盱眙縣,按蚊都是7月份的優(yōu)勢(shì)種類。
2.2 核苷酸序列同源性分析 從云南師宗縣的蚊蟲(chóng)樣品中取8只形態(tài)學(xué)鑒定為疑似中華按蚊的樣品,標(biāo)記為YN-SZ-1至YN-SZ-8(均為雌性,5只飽血,3只未吸血);從江蘇省盱眙縣的蚊蟲(chóng)樣品中取8只形態(tài)學(xué)鑒定為疑似中華按蚊的樣品,標(biāo)記為JS-1至JS-8(均為雌性,6只飽血,2只未吸血)。進(jìn)行DNA提取和COII基因PCR擴(kuò)增,總共16只蚊蟲(chóng)標(biāo)本擴(kuò)增均為陽(yáng)性,經(jīng)序列測(cè)定獲得約740個(gè)核苷酸序列。16只按蚊的核苷酸序列同源性在98.4%至100%之間??偣?6只中華按蚊與GenBank中的巨大按蚊,岡比亞按蚊,微小按蚊,中華按蚊,多斑按蚊和八代按蚊的相應(yīng)序列進(jìn)行分析(見(jiàn)表1)。所有的16只按蚊與中華按蚊的核苷酸序列同源性最高,在98.8%-100%之間,與巨大按蚊的核苷酸序列同源性最低,在78.62-80%之間,與岡比亞按蚊、微小按蚊、多斑按蚊的核苷酸序列同源性均低于90% ,與八代按蚊的核苷酸序列同源性在在 94.73%-95.93%之間。
表1 云南省師宗縣和江蘇省盱眙縣按蚊的COII基因核苷酸序列同源性分析
圖1 云南省師宗縣和江蘇省盱眙縣采集中華按蚊COII基因(600nt)遺傳進(jìn)化分析
2.3 遺傳進(jìn)化分析 對(duì)兩地采集的共16只蚊蟲(chóng)與GenBank中4條中華按蚊序列、2條八代按蚊序列、1條岡比亞按蚊序列、6條微小按蚊序列、3條多斑按蚊序列及1條巨大按蚊序列共6個(gè)種,17條按蚊序列一起構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),見(jiàn)圖1。結(jié)果顯示,不同的按蚊種均形成較大的分支,與核苷酸序列同源性分析結(jié)果一致;云南省師宗縣采集的8只蚊蟲(chóng)標(biāo)本和江蘇省盱眙縣采集的8只蚊蟲(chóng)標(biāo)本均位于中華按蚊分支內(nèi),與其他種的按蚊分支有明顯區(qū)別,表示云南省師宗縣采集的8只蚊蟲(chóng)標(biāo)本和江蘇省盱眙縣采集的8只蚊蟲(chóng)標(biāo)本均為中華按蚊。
2.4 形態(tài)學(xué)分析 雌蚊下顎有白環(huán);翅前緣有明顯的亞緣脈白斑和亞端白斑,基段可雜有少數(shù)淡色鱗,符合中華按蚊的形態(tài)學(xué)特征。
圖2 江蘇省盱眙縣和云南省師宗縣的中華按蚊形態(tài)學(xué)
DNA序列分析是鑒定生物體不同種、亞種和地理株,以及研究其系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系的方法之一[4]。近年來(lái),一些國(guó)內(nèi)外學(xué)者采用線粒體基因COI、COII、COIII和ITS基因序列以及其他一些基因作為分子靶標(biāo)進(jìn)行蚊蟲(chóng)種類鑒定,其中線粒體基因COII進(jìn)化速率適中,在能夠保證足夠變異的同時(shí)又很容易被通用引物擴(kuò)增[5-6]。本試驗(yàn)采用COII基因作為分子靶標(biāo)對(duì)云南省師宗縣和江蘇省盱眙縣采集到的蚊蟲(chóng)標(biāo)本進(jìn)行分子鑒定,結(jié)果顯示,16只形態(tài)學(xué)鑒定為中華按蚊的標(biāo)本,在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)上全部與中華按蚊位于同一進(jìn)化簇,核苷酸序列同源性均在98%以上,符合蚊蟲(chóng)COII基因種內(nèi)判定值98%以上[7]的要求。而其他進(jìn)化簇的核苷酸序列同源性均低于96%,因此可確定這16只蚊蟲(chóng)標(biāo)本均為中華按蚊。
大多數(shù)從事動(dòng)物傳染病病原研究的科研人員并沒(méi)有良好的昆蟲(chóng)學(xué)背景,而蚊蟲(chóng)的種類極多,屬內(nèi)蚊蟲(chóng)在形態(tài)學(xué)上容易混淆產(chǎn)生錯(cuò)誤,對(duì)不太熟練的科研人員尤其如此。因此本次研究中先進(jìn)行形態(tài)學(xué)分類,剔除不同屬的蚊蟲(chóng)以及容易辨別的蚊蟲(chóng),再進(jìn)行分子鑒定和遺傳進(jìn)化關(guān)系的研究,既提高了工作效率,也避免了形態(tài)學(xué)對(duì)相近蚊蟲(chóng)種類的錯(cuò)誤分類,從分子水平較好明確這些蚊蟲(chóng)分類,為人和動(dòng)物蚊傳疾病的傳播控制提供科學(xué)依據(jù)。
云南省曲靖市師宗縣和江蘇省淮安市盱眙縣,地理位置相距2 000 km,海拔高差1 500 m以上,氣候環(huán)境相差巨大,但兩地的蚊蟲(chóng)在7月份都是按蚊占絕對(duì)優(yōu)勢(shì)(67%)以上,且兩地的中華按蚊在核苷酸序列同源性和系統(tǒng)發(fā)育上并沒(méi)有明顯區(qū)別。兩地的按蚊在種類分布、核苷酸序列同源性和系統(tǒng)發(fā)育方面的區(qū)別有待進(jìn)一步研究。
[1] 雅軍,瞿逢伊,徐建農(nóng),等.我國(guó)中華按蚊群體分子遺傳多態(tài)研究[J]. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào), 2001, 07(2):56-58.
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Molecular Identification and COII gene analysis of Anopheles sinensis from Shizong County, Yunnan Province and Xuyi County, Jiangsu Province
HU Qi, WANG Jing-lin, HE Yu-wen, SUN Qiang, WU Jing
(Yunnan Tropical and Subtropical Animal Virus Disease Laboratory Animal Science and Veterinary Institute,kunming 650224,China)
To understand the molecular taxonomy ofAn.sinensisand the characteristics of COII gene in Shizong County, Yunnan Province and Xuyi County, Jiangsu Province. In July 2014, we collected insects from Shizong County, Yunnan Province and Xuyi County, Jiangsu Province. We first identifiedAn.sinensisby insect morphology. And then the genome DNA of mosquitos were extracted and amplified by COII gene specific primers and sequenced, which were analyzed by bioinformatics software for nucleotide sequence homology and phylogenetic relationships.We collected 314 insects from Shizong County, Yunnan Province, including 234Anopheles(74.52%, and 212 insects from Xuyi County, Jiangsu Province, including 143Anopheles(67.45%). We identified them by morphology, and then selected 8 suspectedAn.sinensisfrom each of the two places for sequencing analysis. Results showed that the nucleotide sequence homology of all 16 insects COII genes varied from 98%-100%, and the phylogenetic analysis showed that all 16 insects andAn.sinensislocated in the same cluster. Molecular identification method is a very effective way to identify mosquito species.
An.sinensis; COII gene; Molecular Identification
WANG Jing-lin
2016-05-03
云南省科技計(jì)劃青年項(xiàng)目(2014FD075)
胡騎(1980- ),男,助理研究員,碩士,從事動(dòng)物傳染病原研究,E-mail:ynkmhq999@163.com
王靜林,E-mail:Wangjl107@163.com
S855
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0529-6005(2016)11-0020-03