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    4種方法評(píng)價(jià)甘蔗雜交組合優(yōu)劣的比較

    2016-12-22 09:18:44經(jīng)艷芬郎榮斌桃聯(lián)安董立華朱建榮周清明安汝?yáng)|楊李和孫有芳
    關(guān)鍵詞:區(qū)分度親本評(píng)判

    經(jīng)艷芬,邊 芯,郎榮斌,桃聯(lián)安,董立華,朱建榮,周清明,安汝?yáng)|,楊李和,孫有芳

    (云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所瑞麗育種站,云南 瑞麗 678600)

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    4種方法評(píng)價(jià)甘蔗雜交組合優(yōu)劣的比較

    經(jīng)艷芬,邊 芯*,郎榮斌,桃聯(lián)安,董立華,朱建榮,周清明,安汝?yáng)|,楊李和,孫有芳

    (云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所瑞麗育種站,云南 瑞麗 678600)

    為科學(xué)評(píng)價(jià)云瑞系列創(chuàng)新親本及組合的育種潛力,文章以云瑞甘蔗創(chuàng)新親本選配的32個(gè)雜交組合為研究材料,分別應(yīng)用R軟件分析、灰色接近度評(píng)估、同異分析、模糊綜合評(píng)判4種方法對(duì)參試組合有性世代主要工、農(nóng)藝性狀進(jìn)行綜合分析,并比較4種方法對(duì)雜交組合優(yōu)劣評(píng)價(jià)的準(zhǔn)確度、區(qū)分度、以及評(píng)價(jià)等級(jí)與雜種圃材料入選率高低的吻合程度,4種方法得出較為一致的結(jié)果:除6號(hào)組合外的1~9號(hào)組合均為優(yōu)級(jí)、較優(yōu)級(jí),29~32號(hào)組合為較差級(jí)、差級(jí);除少數(shù)組合外,評(píng)價(jià)等級(jí)的優(yōu)劣與其雜種圃入選率的高低基本吻合;灰色接近度評(píng)估對(duì)組合的區(qū)分度好,但準(zhǔn)確度較差;同異分析、模糊綜合評(píng)判對(duì)組合的區(qū)分度、準(zhǔn)確度均為最優(yōu)或優(yōu),可作為甘蔗雜交組合評(píng)價(jià)優(yōu)先使用的方法,與常用的R軟件分析共同構(gòu)成甘蔗雜交組合評(píng)價(jià)的技術(shù)方法體系。

    雜交組合;育種值;灰色接近度;綜合同一度;綜合優(yōu)級(jí)

    親本、組合評(píng)價(jià)是作物育種的永恒命題,亦是作物育種的前提與基礎(chǔ)。在長(zhǎng)期的作物育種實(shí)踐中,從品種表現(xiàn)反證其親本、組合優(yōu)劣[1]的定性評(píng)價(jià)到應(yīng)用生物統(tǒng)計(jì)、數(shù)量遺傳學(xué)原理的定量評(píng)價(jià),隨著定量評(píng)價(jià)方法的不斷發(fā)展,以及可用于分析不平衡數(shù)據(jù)的最佳線性無(wú)偏預(yù)測(cè)BLUP(Best Linear Unbiased Prediction)方法的應(yīng)用,對(duì)組合選配要求不高,計(jì)算簡(jiǎn)單、方便使用的評(píng)價(jià)方法應(yīng)運(yùn)而生,降低了親本組合評(píng)價(jià)難度,卻大大提升了對(duì)育種的指導(dǎo)作用。甘蔗雜交親本、組合的定量評(píng)價(jià)始于20世紀(jì)60年代,經(jīng)歷了根據(jù)完全雙列雜交設(shè)計(jì)、NC-Ⅱ不完全雙列雜交設(shè)計(jì)等[2-3],到近年來(lái)普遍用于甘蔗親本、組合評(píng)價(jià)的灰色綜合評(píng)判[4]、模糊綜合評(píng)判[5-6]、R軟件分析[7-10]等,對(duì)雜交組合選配的要求從嚴(yán)格的完全、不完全雙列雜交設(shè)計(jì),到任意選配組合的隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),使得甘蔗親本、組合評(píng)價(jià)更為容易。R軟件是一款可用于基于多性狀育種值估計(jì)的最佳線性無(wú)偏預(yù)測(cè)(Restricted BLUP)方法的免費(fèi)分析軟件,也是目前國(guó)內(nèi)、外動(dòng)植物育種普遍應(yīng)用的分析軟件,一般形式為Yijk=u+hi+eijk[11],近年來(lái),在甘蔗雜交組合親本評(píng)價(jià)中得到廣泛應(yīng)用[12-14]。基于灰色理論、同異理論的灰色接近度評(píng)估[15]、同異分析等在小麥、大豆、玉米等育種親本、組合評(píng)價(jià)中已得到普遍應(yīng)用[16-18],并證明這些方法計(jì)算更簡(jiǎn)便,結(jié)果可靠,不失為親本、組合評(píng)價(jià)的好方法。但是這些方法在甘蔗種質(zhì)、親本、組合評(píng)價(jià)中尚未得到應(yīng)用。

    表1 參試組合及其代號(hào)

    云瑞系列甘蔗創(chuàng)新親本是云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所在云南高原瑞麗內(nèi)陸型氣候條件下,利用原生地為云南的甘蔗野生種及其近緣屬種植物與甘蔗栽培原種(熱帶種、印度種、中國(guó)種等)、品種雜交,創(chuàng)新種質(zhì)培育的,其培育的策略是發(fā)掘利用甘蔗野生種的優(yōu)良抗逆基因,培育抗旱、耐寒、抗病性優(yōu)良的甘蔗創(chuàng)新親本,改良甘蔗品種的抗逆性,增強(qiáng)其適應(yīng)性,尋求甘蔗育種的新突破。經(jīng)過(guò)本課題組二十多年的努力,云瑞系列甘蔗創(chuàng)新親本已在全國(guó)甘蔗育種實(shí)踐中普遍應(yīng)用。

    以云瑞系列創(chuàng)新親本與國(guó)內(nèi)、外引進(jìn)品種選配的32個(gè)雜交組合為研究材料,分析比較了R軟件分析、灰色接近度評(píng)估、同異分析、模糊綜合評(píng)判四種方法的綜合評(píng)價(jià)結(jié)果,旨在篩選計(jì)算簡(jiǎn)單、結(jié)果可靠、方便使用的親本、組合評(píng)價(jià)方法,構(gòu)建含云南甘蔗野生種血緣創(chuàng)新種質(zhì)、親本、組合評(píng)價(jià)的方法體系,為甘蔗育種推薦優(yōu)良創(chuàng)新親本、優(yōu)級(jí)雜交組合提供科學(xué)依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    參試材料詳見(jiàn)表1。每個(gè)組合隨機(jī)選取90株實(shí)生苗,按隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)布置3重復(fù)單行區(qū)的雜種圃試驗(yàn),每個(gè)重復(fù)種植20株,株距25 cm,行距120 cm,于5月上旬定植于大田,12月中下旬結(jié)合雜種圃材料決選,每重復(fù)連續(xù)調(diào)查10叢的有效莖數(shù),每叢3株,每組合累計(jì)調(diào)查30叢的有效莖數(shù),90個(gè)單株的株高、莖徑、錘度,并根據(jù)經(jīng)驗(yàn)公式計(jì)算單莖重(kg)(莖徑2×株高×0.7854/1000),叢重(kg)(單莖重×叢莖數(shù)),錘重(kg)(叢重×錘度/100),蔗莖產(chǎn)量(t/hm2)(莖徑2×株高×0.785×有效莖數(shù)÷106),含糖量(t/hm2)[蔗莖產(chǎn)量×錘度×0.69/100(0.69為經(jīng)驗(yàn)數(shù)據(jù))],取各性狀3個(gè)重復(fù)的平均值進(jìn)行雜交組合的優(yōu)劣評(píng)價(jià)。

    1.2 分析方法

    由于雜種圃甘蔗生長(zhǎng)時(shí)間只有7個(gè)月,與甘蔗全生育期的12~15個(gè)月相比,生長(zhǎng)量明顯不足,在分析過(guò)程中,各性狀均按上限性狀進(jìn)行無(wú)量綱化轉(zhuǎn)換或相關(guān)處理,公式:ri(k)=Xi(k)/Xi(k)maxi。

    R軟件分析[7-14]、灰色接近度評(píng)估[15]、同異分析[16-18]、模糊綜合評(píng)判[5-6]均參照相關(guān)文獻(xiàn)的方法。為便于4種分析方法之間的優(yōu)劣比較,根據(jù)每種分析方法評(píng)價(jià)值的極差進(jìn)行5級(jí)分類,劃分評(píng)價(jià)等級(jí)。等級(jí)劃分與比較依據(jù):R軟件分析結(jié)果為組合育種值,模糊綜合評(píng)判以綜合優(yōu)級(jí),同異分析、灰色接近度評(píng)估為參試組合與理想組合的綜合同一度、灰色接近度。

    權(quán)重(Wk)的確定參照文獻(xiàn)[18]的‘離差最大化法’,各性狀的Wk={株高,莖徑,單莖重,叢莖數(shù),錘度,叢重,錘重}={0.070,0.092,0.183,0.194,0.056,0.188,0.216}。不同分析方法均用此權(quán)重。

    表2 32個(gè)雜交組合隨機(jī)區(qū)組3重復(fù)試驗(yàn)主要性狀平均結(jié)果

    2 結(jié)果與分析

    2.1 參試組合7個(gè)性狀表現(xiàn)

    表2列出了32個(gè)參試雜交組合7個(gè)性狀3次重復(fù)的平均值,從中可見(jiàn),由于雜種圃甘蔗的生長(zhǎng)時(shí)間僅半年,生長(zhǎng)量明顯不足,表現(xiàn)為株高偏矮,莖徑偏細(xì),錘度偏低,但是3個(gè)性狀的變異系數(shù)均不大,分別為7.80 %、8.18 %、5.54 %,在幾個(gè)直接調(diào)查取得的性狀中,叢莖數(shù)的變異系數(shù)最大為17.7 %,由經(jīng)驗(yàn)公式計(jì)算得到的單莖重、叢重、錘重3個(gè)性狀的變異系數(shù)分別為17.82 %、22.67 %、24.54 %。因此,有性世代材料的篩選,錘度、叢莖數(shù)是應(yīng)該重點(diǎn)考慮的性狀。

    2.2 4種方法評(píng)價(jià)結(jié)果比較

    2.2.1 4種方法分析結(jié)果 各種分析方法對(duì)組合的評(píng)價(jià)結(jié)果均按五級(jí)分類,從表3~4可見(jiàn),R軟件分析結(jié)果,組合育種值≥7.184為優(yōu)級(jí)、1.190≤育種值<7.184為較優(yōu)級(jí)、-4.804≤育種值<1.190為一般級(jí)、-10.798≤育種值<-4.804為較差級(jí)、育種值<-10.798為差級(jí),則1~9、12、15、19、24、26號(hào)共13個(gè)為優(yōu)級(jí)與較優(yōu)級(jí)組合,25、28~32號(hào)共6個(gè)為較差級(jí)與差級(jí)組合;灰色接近度分析結(jié)果:接近度≥0.8802為優(yōu)級(jí),0.8254≤接近度<0.8802為較優(yōu)級(jí)、0.7706≤接近度<0.8254為一般級(jí)、0.7158≤接近度<0.7706為較差級(jí)、接近度<0.7158為差級(jí),則1~12號(hào)共12個(gè)為優(yōu)級(jí)與較優(yōu)級(jí)組合,24~32號(hào)共9個(gè)為較差級(jí)與差級(jí)組合;同異分析結(jié)果:綜合同一度≥0.841為優(yōu)級(jí),0.752≤綜合同一度<0.841為較優(yōu)級(jí)、0.663≤綜合同一度<0.752為一般級(jí)、0.574≤綜合同一度<0.752為較差級(jí)、綜合同一度<0.574為差級(jí),則1~19號(hào)共19個(gè)為優(yōu)級(jí)與較優(yōu)級(jí)組合,28~32號(hào)共5個(gè)為較差級(jí)與差級(jí)組合;模糊綜合評(píng)判結(jié)果:綜合優(yōu)級(jí)(b1)≥0.470為優(yōu)級(jí),0.378≤綜合優(yōu)級(jí)(b1)<0.470為較優(yōu)級(jí)、0.285≤綜合優(yōu)級(jí)(b1)<0.378為一般級(jí)、0.193≤綜合優(yōu)級(jí)(b1)<0.285為較差級(jí)、綜合優(yōu)級(jí)(b1)<0.193為差級(jí),則除6外的1-16、19、21共17個(gè)為優(yōu)級(jí)與較優(yōu)級(jí)組合,6、24、25、26、27、29、30、32共8個(gè)為較差級(jí)與差組合。各種分析方法對(duì)32個(gè)參試組合的排序結(jié)果大同小異,相同的是4種方法分析結(jié)果1、2、4、5 4個(gè)組合均為優(yōu)級(jí),9、12均為較優(yōu)級(jí),20、22-23均為一般級(jí),32號(hào)組合均為差級(jí)。

    表3 雜交組合4種評(píng)價(jià)方法結(jié)果比較

    表4 雜交組合優(yōu)劣評(píng)價(jià)結(jié)果及其雜種圃入選率

    Notes: RJ=R Judgment, GCDJ=Grey Closeness Degree Judgment, SDJ=Similarity-difference Judgment, FCEJ=Fuzzy comprehensive evaluation Judgment, RSHN=Ratio of selection into hybrid nursery.

    表5 4種分析方法的區(qū)分度與離均差比較

    2.2.2 雜交組合優(yōu)劣評(píng)價(jià)結(jié)果及其雜種圃入選率 從表4可見(jiàn),雜種圃入選率達(dá)到4 %以上的6個(gè)組合依次為7(7.2 %)、3(5.8 %)、10(5.0 %)、19(4.6 %)、11(4.4 %)、6(4.2 %),其中除6號(hào)組合模糊綜合評(píng)判評(píng)語(yǔ)為較差級(jí),19號(hào)組合接近度、R軟件分析為一般級(jí)外,其余4個(gè)均為優(yōu)級(jí)、較優(yōu)級(jí)。4種評(píng)價(jià)結(jié)果均為優(yōu)級(jí)、較優(yōu)級(jí)的1~9、12號(hào)組合中,除4、5號(hào)組合外,雜種圃均有材料入選升級(jí),4種方法評(píng)價(jià)結(jié)果在一般級(jí)以下的20~32號(hào)組合中,雜種圃材料的入選率與評(píng)價(jià)結(jié)果吻合程度稍差。

    2.2.3 4種方法的區(qū)分度比較 區(qū)分度即表示評(píng)判值的離散程度,一般地,離散程度越大,區(qū)分度越好,相應(yīng)的分析方法則越優(yōu)。文章參照文獻(xiàn)[17]的方法,定義區(qū)分度,式中:γmax、γmin表示參數(shù)中最大值、最小值的絕對(duì)值。如同異分析的γmax為0.930,γmin為0.485,根據(jù)各種分析方法評(píng)判值計(jì)算區(qū)分度詳見(jiàn)表5,從中可見(jiàn),模糊綜合評(píng)判的區(qū)分度最優(yōu),其次是同異分析,區(qū)分度較差的是灰色接近度評(píng)估和R軟件分析。

    2.2.4 4種方法的離均值比較 根據(jù)數(shù)理統(tǒng)計(jì)原理,離均差值反映的是各種分析方法的分析結(jié)果偏離平均值的距離,用絕對(duì)差值表示,離均差值越小,反應(yīng)分析結(jié)果的準(zhǔn)確率越高。如果用離均差的絕對(duì)值比較各種分析方法的優(yōu)劣,從表5可見(jiàn),R軟件分析、灰色接近分析、同異分析、模糊綜合評(píng)判4種分析方法的離均差值分別為0.487、0.325、0.272、0.112,即4種分析方法對(duì)雜交組合評(píng)價(jià)準(zhǔn)確率優(yōu)劣依次為:模糊綜合評(píng)判、同異分析、灰色接近度分析、R軟件分析。

    3 討 論

    部分組合評(píng)價(jià)結(jié)果與入選率吻合程度較差的原因:一是評(píng)價(jià)為優(yōu)級(jí)的組合其多數(shù)性狀表現(xiàn)均較接近理想組合,但是往往因某一性狀的明顯不足,而導(dǎo)致其雜種圃入選率不高,反之,評(píng)價(jià)為較差級(jí)或差級(jí)的組合,多數(shù)性狀不盡人意,但是可能在雜種圃側(cè)重考慮的性狀上有較好表現(xiàn),而導(dǎo)致其有較好的入選率;二是云瑞系列創(chuàng)新親本是以發(fā)掘利用云南的甘蔗野生種優(yōu)良抗逆基因?yàn)槟康亩嘤挠H本,以其為主選配的雜交組合,除篩選品系外,篩選某方面性狀優(yōu)良的創(chuàng)新親本亦是雜種圃材料篩選的重要目的,勢(shì)必造成評(píng)價(jià)結(jié)果與雜種圃入選率的差別。

    4種方法均是依據(jù)參試組合有性世代多個(gè)性狀的表現(xiàn)綜合評(píng)價(jià)其優(yōu)劣,均可提供大量的信息,評(píng)價(jià)結(jié)果則各有千秋。R軟件是一款可用于不平衡數(shù)據(jù)分析的免費(fèi)軟件,其混合線性模型是將觀察值表示為對(duì)其有影響的各遺傳與環(huán)境因子之和,育種值估計(jì)是數(shù)量遺傳學(xué)和育種學(xué)的核心內(nèi)容之一[12-13]。近年來(lái),R軟件分析已在甘蔗雜交親本、組合評(píng)價(jià)中普遍應(yīng)用,文章依據(jù)家系育種值計(jì)算的區(qū)分度與離均差值評(píng)判結(jié)果不太理想,原因有待進(jìn)一步研究。模糊綜合評(píng)判用于甘蔗雜交組合評(píng)價(jià)時(shí)有報(bào)道[5-6],從區(qū)分度與離均差值比較結(jié)果,不失為一種雜交組合評(píng)價(jià)的好方法,但是計(jì)算工作量大;灰色接近度評(píng)估對(duì)組合評(píng)價(jià)的準(zhǔn)確度較好,但是區(qū)分度較差,計(jì)算簡(jiǎn)單,使用方便,這與郭瑞林[15]等的研究結(jié)果一致。同異分析是郭瑞林[18]繼灰色綜合評(píng)判之后,基于作物育種的同異理論與方法提出的一種綜合評(píng)價(jià)雜交組合優(yōu)劣的方法,已在小麥、玉米、大豆[18]等作物組合評(píng)價(jià)中得到較普遍的應(yīng)用,在甘蔗品種綜合評(píng)價(jià)中亦得到應(yīng)用[19-21],其用于甘蔗雜交組合的評(píng)價(jià)由本課題組開(kāi)始,本文應(yīng)用其評(píng)價(jià)甘蔗雜交組合具有區(qū)分度好、準(zhǔn)確率高的特點(diǎn),而且,在4種分析方法中計(jì)算最為簡(jiǎn)便,不失為一種甘蔗雜交組合評(píng)價(jià)的好方法。由此,提出R軟件分析、模糊綜合評(píng)判和同異分析3種方法相結(jié)合,構(gòu)建云瑞甘蔗創(chuàng)新親本、組合評(píng)價(jià)方法體系,旨在對(duì)含甘蔗野生種血緣的云瑞系列創(chuàng)新親本、組合進(jìn)行科學(xué)評(píng)價(jià),盡快為中國(guó)甘蔗育種推薦抗旱、耐寒、高產(chǎn)、高糖等特色鮮明的親本、組合提供科學(xué)依據(jù)。

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    [14]徐良年,鄧祖湖,林彥銓,等.經(jīng)濟(jì)遺傳值在甘蔗選育種的應(yīng)用研究系列(三).甘蔗親本經(jīng)濟(jì)育種值和家系經(jīng)濟(jì)遺傳值分析[J].中國(guó)糖料, 2013(2):5-8.

    [15]郭瑞林,劉亞飛,吳秋芳,等.雜交組合灰色接近度評(píng)估方法及其在小麥育種中的應(yīng)用[J].麥類作物學(xué)報(bào),2012,32(5):989-995.

    [16]關(guān) 立,韓 勇,齊光榮.雜交組合同異評(píng)估方法在小麥育種中的應(yīng)用[J].湖南農(nóng)業(yè)科學(xué),2014(7):18-21.

    [17]郭瑞林,劉亞飛,吳秋芳,等.小麥品種區(qū)域試驗(yàn)四種分析方法的比較研究[J].麥類作物學(xué)報(bào),2011, 31 (4):776-779.

    [18]郭瑞林.作物育種同異理論與方法[M].北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)技術(shù)出版社,2011.

    [19]劉家勇,陳學(xué)寬,范源洪,等.甘蔗品種同異分析法評(píng)價(jià)[J].中國(guó)糖料, 2006(2):1-3.

    [20]邊 芯,安汝?yáng)|,楊李和,等.國(guó)家第六輪甘蔗品種區(qū)試瑞麗點(diǎn)表現(xiàn)的同異分析[J].西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2012,25(2):2016-2020.

    [21]桃聯(lián)安,楊李和,安汝?yáng)|,等.5種分析方法對(duì) 08 系列云南割手密血緣 F2代的綜合分析及比較[J].西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2015,28 (2):1907-1915.

    (責(zé)任編輯 王家銀)

    Comparison of Four Methods for Evaluation of Sugarcane Hybrid Combinations

    JING Yan-fen, BIAN Xin*, LANG Rong-bin, TAO Lian-an, DONG Li-hua, ZHU Jian-rong, ZHOU Qing-ming, AN Ru-dong, YANG Li-he, SUN You-fang

    (Sugarcane Research Institute, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Yunnan Ruili 678600, China)

    32 innovative combinations which made of Yunrui parents were used as materials in this study, four methods of R software analysis, grey closeness degree evaluation, similarity- difference analysis and fuzzy comprehensive evaluation were used to test the main technical and agronomic characters of sexual generation, and the accuracy, degree of differentiation, evaluation grade and coincidence degree of the ration of selection on hybrid nursery by the four methods were compared. The results from the 4 methods were consistent. Except combination 6, combination 1 to 9 all were excellent or better, and combination29 to 32 were less inferior, inferior. Except a few combinations, the results of evaluate grade quality were same with the selection ration on hybrid nursery. The degree of differentiation of gray closeness degree analysis was good, but its accuracy was poor. The degree of differentiation and the accuracy of similarity- difference analysis and fuzzy comprehensive evaluation were all best excellent and excellent, so they could be used as priority methods in evaluating sugarcane hybrid combinations, and R software could be used with them to make a system to evaluate sugarcane hybrid combinations.

    Hybrid combination; Specific combining ability; Gray closeness degree; Comprehensive identical degree; High degree of membership

    1001-4829(2016)07-1514-07

    10.16213/j.cnki.scjas.2016.07.004

    2014-09-23

    云南省科技惠民專項(xiàng)(農(nóng)業(yè))(2014RA059);國(guó)家基金項(xiàng)目(31360358);國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)資金(CARS-20-1-1);云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院專項(xiàng)資金(YAAS2014ZY012)

    經(jīng)艷芬(1965-),女,云南麗江人,研究員,研究方向?yàn)楦收徇z傳育種,E-mail:rljyf@126.com,*為共同第一作者。

    S566.1

    A

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