呂洋王煜,2孫佳佳弓春玲李光鵬
(1. 內(nèi)蒙古大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究中心,呼和浩特 010070;2. 內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院,呼和浩特 010050)
microRNA-483和microRNA-486在克隆和轉(zhuǎn)fat-1基因牛組織中的表達(dá)
呂洋1王煜1,2孫佳佳1弓春玲1李光鵬1
(1. 內(nèi)蒙古大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究中心,呼和浩特 010070;2. 內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院,呼和浩特 010050)
利用熒光定量PCR比較正常受精牛、克隆牛和轉(zhuǎn)基因牛的心、肝、脾、肺、腎、胎盤、子葉、子宮內(nèi)膜中miR-483和miR-486的表達(dá)水平。結(jié)果顯示,miR-483和miR-486在正常受精牛、克隆牛和轉(zhuǎn)fat-1基因牛的組織中均有表達(dá),其中在心臟中表達(dá)量顯著高于其他組織。而轉(zhuǎn)fat-1基因牛心臟中miR-483和miR-486表達(dá)量均低于正常牛。miR-483和miR-486在不同組織中表達(dá)量存在一定差異,在心臟中呈現(xiàn)高表達(dá),提示miR-483和miR-486表達(dá)降低可能與心肌肥大、心肌梗死等病理生理過程有關(guān)。
miR-483;miR-486;轉(zhuǎn)基因牛;心臟
miRNA表達(dá)分析和功能探索在轉(zhuǎn)基因生物領(lǐng)域中已成為熱點(diǎn)問題。microRNA(miRNA)是一類內(nèi)源性的21-25 nt大小的單鏈非編碼小分子RNA,在生物體內(nèi)廣泛存在,能夠在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達(dá),與機(jī)體的生長(zhǎng)、發(fā)育、繁殖、疾病等活動(dòng)相關(guān)[1]。miRNA在不改變基因結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上影響基因的表達(dá),成為表觀遺傳學(xué)的重要組成部分。目前對(duì)于miRNA 在生殖發(fā)育中的研究已逐步展開,包括對(duì)miRNA 高通量分析,特異性的組織或細(xì)胞中特定 miRNA 的表達(dá)、調(diào)控靶基因和功能研究[2]。fat-1基因來源于秀麗線蟲(Caenorhabditis elegans,C. elegans),又名ω-3多聚不飽和脂肪酸脫氫酶基因。其產(chǎn)物ω-3多聚不飽和脂肪酸脫氫酶以ω-6多聚不飽和脂肪酸(Omega-6 polyunsaturated fatty acids,ω-6 PUFAs)為底物,將其脫氫轉(zhuǎn)化為ω-3多聚不飽和脂肪酸(Omega-3 polyunsaturated fatty acids,ω-3 PUFAs)[3],ω-3 PUFAs作為重要生物活性物質(zhì),對(duì)人體健康尤其在預(yù)防和治療心腦血管、癌癥等多種疾病方面有著重要作用。增加膳食中ω-3 PUFAs的含量,能夠顯著減少冠心病發(fā)病率與死亡率,并且能延緩動(dòng)脈粥樣硬化進(jìn)展[4]。本研究利用熒光定量PCR分析轉(zhuǎn)fat-1魯西黃牛、克隆牛和正常受精牛主要器官組織中miR-483和miR-486的表達(dá)情況,旨在探討miR-483和miR-486可能的作用。
1.1 材料
轉(zhuǎn)fat-1基因魯西黃牛的制備:構(gòu)建fat-1基因pST200表達(dá)載體,轉(zhuǎn)染牛胎兒成纖維細(xì)胞,G418篩選后挑選轉(zhuǎn)基因單克隆,核移植獲得供體細(xì)胞,得到轉(zhuǎn)基因克隆胚胎,通過胚胎移植到代孕魯西黃牛體內(nèi),出生后經(jīng)鑒定為轉(zhuǎn)fat-1基因牛。采集3例正常受精、2例克隆、2例轉(zhuǎn)基因魯西黃牛心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、胎盤、子葉、子宮內(nèi)膜組織,迅速放入液氮保存。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)經(jīng)內(nèi)蒙古大學(xué)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。
1.2 方法
1.2.1 各組織總RNA的提取 將組織從-80℃取出后,用RNAiso for small RNA kit(TaKaRa)提取組織RNA,取2 μL在1%瓊脂糖凝膠電泳上檢測(cè)總RNA的質(zhì)量并利用Nanodrop測(cè)量濃度并測(cè)定總RNA的A260/A280的值在1.8-2.1之間。
1.2.2 合成cDNA 利用Primer 5.0引物設(shè)計(jì)軟件分別根據(jù)miRBase提供的miR-483和miR-486,以及內(nèi)參U6的序列設(shè)計(jì)microRNA定量引物(表1),根據(jù)One Step PrimeScript? miRNA cDNA Synthesis Kit(TaKaRa)反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書合成cDNA。反應(yīng)結(jié)束后產(chǎn)物保存于-20℃條件下備用。
表1 microRNA引物序列
1.2.3 microRNA實(shí)時(shí)熒光定量PCR 使用 SYBR?premix Ex TaqTMⅡ(TaKaRa)檢測(cè)miR-483和miR-486在牛心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、胎盤、子葉和子宮內(nèi)膜組織的表達(dá)水平,美國(guó)Bio-Rad 7300公司進(jìn)行定量PCR反應(yīng)參數(shù)為:95℃預(yù)變性30 s;95℃ 5 s,60℃ 31 s熒光檢測(cè)1次,共40循環(huán)。記錄每個(gè)反應(yīng)管中的熒光信號(hào)到達(dá)所設(shè)定的閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)Ct值,反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)熔解曲線分析產(chǎn)物特異度,每組均設(shè)3個(gè)復(fù)孔,分析 miR-483和 miR-486 的相對(duì)表達(dá)量。
1.2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 以U6 作為內(nèi)參,miRNA的相對(duì)表達(dá)水平的數(shù)值通過2-ΔΔCt法進(jìn)行計(jì)算。運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件 SPSS16.0 進(jìn)行單因素方差分析。
2.1 miR-483在正常受精、克隆、轉(zhuǎn)基因魯西黃牛不同組織中的表達(dá)
miR-483在心臟中表達(dá)量最高,約為在肺臟中表達(dá)量的10倍,其次在腎臟中的表達(dá)量是肺臟中的6倍左右,在肺臟中的表達(dá)量最低(圖1)。
圖1 miR-483在牛不同組織中的表達(dá)
2.2 miR-486在正常受精、克隆、轉(zhuǎn)基因魯西黃牛不同組織中的表達(dá)
miR-486在心臟中表達(dá)量最高,約為在肝臟中表達(dá)量的13倍(P=0.021,具有顯著差異);其次在肺臟中表達(dá)量是肝臟中表達(dá)量的2倍左右;在肝臟和子葉中表達(dá)量最低(圖2)。
2.3 miR-483和miR-486在正常受精、克隆、轉(zhuǎn)基因魯西黃牛心臟表達(dá)的比較
miR-483和miR-486在克隆牛、轉(zhuǎn)基因牛心臟中的表達(dá)要低于正常受精牛的心臟(圖3)。
圖2 miR-486在牛不同組織中的表達(dá)(a代表P<0.05)
圖3 miR-483(A)和miR-486(B)在正常受精、克隆和轉(zhuǎn)基因魯西黃牛心臟表達(dá)(a代表P<0.05)
ω-3 PUFAS能提高心肌細(xì)胞的電穩(wěn)定性,而心肌細(xì)胞的電穩(wěn)定性的提高能防治心率不齊[5],對(duì)體內(nèi)ω-6/ω-3 PUFAS比值的改變和對(duì)體內(nèi)脂代謝的調(diào)節(jié),能有效的降低血壓、血脂[6]。武珅等[7]發(fā)現(xiàn)增加fat-1基因在體內(nèi)的表達(dá)是預(yù)防心血管硬化的有效方法。miRNA 的表達(dá)具有時(shí)序性和空間特異性,王家驥等[8]通過對(duì)靶基因進(jìn)行調(diào)節(jié)從而實(shí)現(xiàn)對(duì)動(dòng)物發(fā)育的調(diào)控。隨著研究的不斷深入,人們逐漸認(rèn)識(shí)到miRNA在進(jìn)化過程中的保守性以及在生物進(jìn)化和疾病發(fā)展過程中起著重要的調(diào)控作用,通過抑制靶基因的表達(dá)產(chǎn)生基因沉默的效應(yīng)。
近年來研究發(fā)現(xiàn),miRNA參與調(diào)控心臟病理生理過程,推測(cè) miRNA 在心肌肥大、心肌梗死中扮演重要角色[9-11]。目前,在生物體內(nèi)已鑒定出超過6 000個(gè)miRNA 分子,而在人類基因組中約30% 的基因受 miRNA調(diào)控[12],其在心臟、肝臟及腦等不同組織中都具有特異性表達(dá),有研究通過分析6個(gè)心衰胎兒和4個(gè)正常胎兒心臟microRNA芯片[13],獲得110個(gè)顯著差異microRNA,其中miR-483和miR-486表達(dá)量顯著下調(diào),推測(cè)與胎兒心衰有關(guān)。Sucharov等[14]通過對(duì)6個(gè)非心衰、5個(gè)缺血性擴(kuò)張型心臟病和5個(gè)特發(fā)性擴(kuò)張型心臟病的病人的microRNA芯片分析,也得出miR-483和miR-486在非心衰病人組中表達(dá)量顯著下調(diào)的結(jié)論,證明microRNA可能調(diào)控心肌疾病中關(guān)鍵性重編程重塑基因的表達(dá),參與到心肌疾病中。郝艷坤等[15]篩查肥胖大鼠心臟microRNA的表達(dá)變化,尋找與肥胖誘發(fā)心肌損傷及心律失常相關(guān)的miRNA,發(fā)現(xiàn)在肥胖模型組的 miRNA 表達(dá)譜中明顯差異表達(dá)的miRNA共有 7個(gè),其中miR-483表達(dá)下調(diào),提示miRNA可能參與肥胖誘發(fā)心肌損傷和心律失常的調(diào)節(jié)作用。Zhang等[16]研究發(fā)現(xiàn)miR-483在懷孕和哺乳期喂養(yǎng)母體高脂肪(HF)飲食的子代中表達(dá)顯著降低。
miRNA的差異表達(dá)及對(duì)基因的調(diào)控機(jī)制已成為當(dāng)前科學(xué)研究的熱點(diǎn)之一。miRNA可能參與調(diào)控多個(gè)靶基因,而一個(gè)基因也可能受多個(gè)miRNA調(diào)控。從miRBase數(shù)據(jù)庫中預(yù)測(cè)出人源的miR-483 定位于胰島素樣生長(zhǎng)因子2(insulin-like growth factor 2,IGF2)的第2內(nèi)含子[17]。Zhang等[16]的研究結(jié)果提示miR-483在喂養(yǎng)高脂肪飲食的小鼠后代中表達(dá)量顯著降低,同時(shí)伴隨著IGF2 mRNA表達(dá)水平顯著提高,預(yù)示著IGF2可能是miR-483的靶基因。小鼠胎兒體重可能受IGF2基因上的多態(tài)性的影響[18],低濃度IGF2可能涉及增重和肥胖[19]。
miR-486在哺乳動(dòng)物中是保守的,富集于心肌、骨骼肌和平滑肌中,肌肉生長(zhǎng)抑制素(Myostatin)是骨骼肌生長(zhǎng)的負(fù)調(diào)控因子,可降低肌肉中蛋白合成,Hitachi等[20]在敲除myostatin小鼠后發(fā)現(xiàn)miR-486表達(dá)水平顯著提高,證實(shí)miR-486可能是連接肌肉生長(zhǎng)抑制素信號(hào)和調(diào)控骨骼肌通路中的調(diào)控分子。Small等[21]證明同源性磷酸酶-張力蛋白(PTEN)可能是miR-486靶位點(diǎn),PTEN是磷酸肌醇3激酶/ Akt信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控基因,后者是胰島素受體下游的主要通路,推測(cè)miR-486能在骨骼肌中調(diào)節(jié)胰島素依賴的葡萄糖攝取。本研究結(jié)果表明,miR-483和miR-486在正常受精和轉(zhuǎn)fat-1基因牛心臟中差異表達(dá),提示其表達(dá)變化可能與fat-1表達(dá)有關(guān)。
通過檢測(cè)miR-483和miR-486在正常受精、克隆、轉(zhuǎn)fat-1基因魯西黃牛不同組織中的相對(duì)表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)miR-483和miR-486在正常受精牛、克隆牛和轉(zhuǎn)fat-1基因牛的組織中均有表達(dá),其中在心臟中表達(dá)量顯著高于其他組織。而轉(zhuǎn)基因牛心臟中miR-483和miR-486表達(dá)量均低于正常受精牛。
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(責(zé)任編輯 馬鑫)
Expression of microRNA-483 and microRNA-486 in the Cloned and fat-1-transgenic Bovine
Lü Yang1WANG Yu1,2SUN Jia-jia1GONG Chun-ling1LI Guang-peng1
(1. Research Center for Laboratory Animal Science,Inner Mongolia University,Hohhot 010070;2. The Affiliated Hospital,Inner Mongolia University,Hohhot 010050)
The expression levels of microRNA-483 and microRNA-486 in heart,liver,spleen,lung,kidney,placenta,cotyledons,endometrium from normal,cloned,and transgenic bovine were measured by real time quantitative PCR. The results showed that microRNA-483 and microRNA-486 were expressed in all tissues of normal,cloned and fat-1-transgenic bovine;significantly higher in the heart than other tissues. However,the expression levels of microRNA-483 and microRNA-486 in transgenic bovine were lower than normal one. Further,the expressions of microRNA-483 and microRNA-486 varied in different tissues and high in the heart,indicating that the expressions of microRNA-483 and microRNA-486 may be correlated with pathophysiological process of myocardial hypertrophy and myocardial infarction.
microRNA-483;microRNA-486;transgenic bovine;heart
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.03.017
2015-06-12
國(guó)家基礎(chǔ)研究計(jì)劃(2012CB722306);國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(201410126034)
呂洋,男,博士研究生,研究方向:哺乳動(dòng)物生殖生物學(xué);E-mail:lvyang678762006@163.com
李光鵬,男,教授,研究方向:哺乳動(dòng)物生殖生物學(xué)、胚胎生物技術(shù);E-mail:gpengli@imu.edu.cn