“開放科學(xué) 數(shù)據(jù)共享 軟件共享”, 你準(zhǔn)備好了嗎？

朱 瀅

(北京大學(xué)心理系, 北京 100871)

當(dāng)前, “開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”(Open science, data sharing, software sharing)的趨勢(shì)十分明顯, 它是科學(xué)的未來(lái)(Gewin, 2016)。那么,“開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”是如何體現(xiàn)的呢？

它的最明確的信號(hào)是刊登在2015年《科學(xué)》雜志上的“促進(jìn)期刊透明性和開放性的指南” (以下簡(jiǎn)稱指南) (Nosek, et al. 2015)一文, 接受該指南的雜志或研究團(tuán)體, 就意味著它們支持科學(xué)的透明性、開放性和重現(xiàn)性(reproducibility, 一項(xiàng)實(shí)驗(yàn)可以由原作者或其他人重復(fù)進(jìn)行)。具體說(shuō)來(lái),就是可以僅僅刊登實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì), 廣泛征求意見(jiàn)后再進(jìn)行實(shí)驗(yàn); 實(shí)驗(yàn)結(jié)束后將原始數(shù)據(jù)公布, 以便人們使用或檢查; 刊登無(wú)顯著差別的發(fā)現(xiàn)以及重復(fù)的研究, 等等。這些做法可以改善科研的重現(xiàn)性,擴(kuò)大科學(xué)觀察的范圍。據(jù)報(bào)道, 名為《Research Ideas and Outcomes》(RIO)的雜志已于2015年11月正式登場(chǎng)。它可以僅僅刊登研究設(shè)想, 或方法,或工作流程(Workflows), 或數(shù)據(jù), 或報(bào)告, 或軟件。一句話, 它可以僅僅刊登研究周期中的任何一項(xiàng)產(chǎn)品(參見(jiàn)2015年9月《Science》News)。這樣的雜志正好體現(xiàn)了當(dāng)今的科學(xué)精神——科學(xué)的開放性。它與過(guò)去的刊物僅僅刊登科研的最后成果——論文不同, 更關(guān)心做科學(xué)的做法(Take more care about the modus operandi of doing science than only the publication of results)。這樣, 科研的每一環(huán)節(jié)都可以得到監(jiān)控, 從而大大提高了科學(xué)自身的糾錯(cuò)能力, 并改善了科研的重現(xiàn)性。另外, 有一類雜志的總稱叫 PLOS, 它包括生物學(xué)及醫(yī)學(xué)各分支的8份期刊。PLOS從2014年3月起要求作者在投稿時(shí)包含一項(xiàng)數(shù)據(jù)可用性的聲明, 讓讀者可以得到該數(shù)據(jù)。PLOS相信, 數(shù)據(jù)可用性允許數(shù)據(jù)重復(fù), 再分析, 新分析, 解釋, 或包含在元分析中, 從而促進(jìn)研究的重現(xiàn)性, 所有這些都會(huì)提供一個(gè)更好的“貨真價(jià)實(shí)”的科學(xué)研究。

目前, 538個(gè)出版社和雜志(包括 Elserier和Springer出版社)以及 57個(gè)研究團(tuán)體(包括美國(guó)科學(xué)促進(jìn)會(huì))已采用指南。另外, 實(shí)行數(shù)據(jù)公開政策的基金會(huì)也愈來(lái)愈多, 他們要求申請(qǐng)者在科研中公開數(shù)據(jù)。這些基金會(huì)包括美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)(the US National Science Foundation)以及一些慈善基金會(huì)(the Bill & Melinda Gates Foundation in Seattle, Washington, and the Wellcome Trust in London)。還有一些基金會(huì)目前對(duì)公開數(shù)據(jù)不作硬性要求, 但鼓勵(lì)人們這樣做。因此, 有人認(rèn)為, 如果不走“開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”這條道路,今后做科學(xué)研究將會(huì)變得十分艱難(Gewin, 2016)。

但是, 許多年輕人包括研究生與博士后還沒(méi)有決定是否接受數(shù)據(jù)共享。一方面是因?yàn)樗?她們的老板才有選擇的權(quán)利, 因?yàn)槔习鍨樗?她們提供科研經(jīng)費(fèi); 另一方面, 人們擔(dān)心數(shù)據(jù)共享可能的副作用。例如, 數(shù)據(jù)共享后有可能會(huì)讓別人在科研上搶先一步做出成果; 公布數(shù)據(jù)后要回答來(lái)信詢問(wèn), 會(huì)花很多時(shí)間, 等等。提倡數(shù)據(jù)共享的人提醒說(shuō), 參與開放科學(xué)的人們有可能得到三種引用：引用數(shù)據(jù), 引用軟件和引用最后的文章。這些引用最終會(huì)導(dǎo)致好的名聲, 即知名度——這是申請(qǐng)基金和找工作的一個(gè)極為重要的條件。至于一些可能的副作用也不必?fù)?dān)心, 例如, 根據(jù)數(shù)據(jù)、軟件公布的時(shí)間是可以防止剽竊行為的; 在公布數(shù)據(jù)的同時(shí)附上怎樣使用數(shù)據(jù)的說(shuō)明, 可以節(jié)約作者的許多時(shí)間。還有, 當(dāng)前共享數(shù)據(jù)不存在什么技術(shù)障礙。例如, 線上的存儲(chǔ)庫(kù)如Fig Share或Zenodo使數(shù)據(jù)存儲(chǔ)愈來(lái)愈容易。

“開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”的開放精神,源于當(dāng)下科學(xué)研究的需要, 即改善科學(xué)的重現(xiàn)性。2015年在《科學(xué)》雜志上撰寫“促進(jìn)期刊透明性和開放性的指南”的作者(Nosek, B. et al.2015), 就是在2015年在《科學(xué)》雜志上刊登實(shí)驗(yàn)報(bào)告, 報(bào)道100項(xiàng)心理學(xué)實(shí)驗(yàn)成功重現(xiàn)的不足1/2的作者(Open Science Collaboration, 2015), 這絕不是偶然的！因?yàn)樾睦砜茖W(xué)研究重現(xiàn)性差的問(wèn)題在科學(xué)界具有普遍意義。科研發(fā)現(xiàn)必須能夠重復(fù),它才能成為累積起來(lái)的科學(xué)知識(shí), 成為科學(xué)長(zhǎng)城中的一塊磚或是一顆沙粒; 科研發(fā)現(xiàn)如果不能重復(fù), 它就會(huì)被拋棄掉。因此, 科學(xué)的進(jìn)步既依賴創(chuàng)新也依賴重現(xiàn)(Open Science Collaboration, Science,2015)。而改善科學(xué)重現(xiàn)性的唯一方法就是提倡“開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”的開放精神, 這涉及科研人員, 學(xué)術(shù)期刊與出版社, 資助科研的基金會(huì)及各種學(xué)術(shù)團(tuán)體, 以及公眾對(duì)科學(xué)的關(guān)注與參與, 可以說(shuō), 這就是當(dāng)代的科學(xué)精神。

心理學(xué)科學(xué)研究的重現(xiàn)性不佳, 更為迫切地要求公開數(shù)據(jù)(朱瀅, 伍錫洪, 2016)。為此,《Psychological Science》雜志采取措施鼓勵(lì)人們進(jìn)行重復(fù)性研究。具體的做法是, 如果作者愿意,該雜志給某些文章貼上“公開數(shù)據(jù)”的標(biāo)簽, 清楚地告訴讀者, 這些數(shù)據(jù)在哪里可以找到。據(jù)報(bào)道,從2013年到2015年貼有“公開數(shù)據(jù)”標(biāo)簽的文章由10%增加到38%, 這也就是“數(shù)據(jù)共享”比例的增長(zhǎng)。

國(guó)內(nèi)心理學(xué)學(xué)者已經(jīng)開始對(duì)“開放科學(xué)”進(jìn)行了有益的探索。如復(fù)旦大學(xué)心理系教授張學(xué)新與同行發(fā)起了學(xué)術(shù)期刊的“公評(píng)”審稿制度, 他們正在創(chuàng)辦由多個(gè)高校共建的雙語(yǔ)期刊《中國(guó)心理學(xué)家》(Chinese Psychologist)。這份期刊所發(fā)表的科研報(bào)告將在網(wǎng)上做公開評(píng)審, 作者也可以與評(píng)論者在網(wǎng)上展開相互討論(黃永明, 南方周末,2015?11?05)。中國(guó)科學(xué)院心理研究所研究員、副所長(zhǎng)劉勛正在加緊建設(shè)一個(gè)網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器平臺(tái), 并設(shè)計(jì)移動(dòng)客戶端與該平臺(tái)交換數(shù)據(jù), 包括大規(guī)模行為數(shù)據(jù)和腦成像數(shù)據(jù)。借此達(dá)到數(shù)據(jù)共享的目的, 推動(dòng)心理學(xué)實(shí)驗(yàn)任務(wù)的標(biāo)準(zhǔn)化(私人通信2016)。

“開放科學(xué)、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”依賴互聯(lián)網(wǎng)讓科學(xué)成為更多人的科學(xué)(有人稱為“公民科學(xué)” (citizen science)), 使科學(xué)更健康地發(fā)展。有人用一句話總結(jié)“開放科學(xué)”：“科學(xué)有問(wèn)題, 但網(wǎng)絡(luò)可以修復(fù)” (Science has its problems, but the Web could be fix)。

致謝：本文得到陸巖女士大力幫助, 在此表示感謝！

朱瀅, 伍錫洪. (2016).《科學(xué)》和《自然》雜志 2015 年的兩篇心理學(xué)文章.心理科學(xué), 39(2), 474?477.

Gewin, V. (2016). An open mind on open data. Nature,529,117?119

Nosek, B, et al. (2015). Supplementary materials for promoting an open research culture.Science, 348, 1422?1425. DOI:10. 1126/science.aab2734

Open Science Collaboration. (2015). Estimating the reproducibility of psychological science.Science, 349,aac4716 DOI: 10. 1126/science.aac4716