楊航、羅明堯、殷昆侖、陳前龍綜述,常謙、周洲審校
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遺傳性主動脈疾病基因檢測的應(yīng)用
楊航、羅明堯、殷昆侖、陳前龍綜述,常謙、周洲審校
摘要遺傳性主動脈疾病以主動脈擴(kuò)張、主動脈瘤/夾層為特征,可發(fā)生于馬凡綜合征、Loeys-Dietz綜合征、血管型Ehlers-Danlos綜合征、家族性胸主動脈瘤/夾層等多種疾病,其共同特點(diǎn)是主動脈瘤發(fā)生破裂的風(fēng)險高,必須通過手術(shù)置換損傷部位動脈而避免發(fā)生致命性動脈瘤破裂。這些疾病有著不同程度的臨床表型重合,僅靠臨床癥狀往往難以區(qū)分確診。這種情況下,基因檢測在患者癥狀完全表現(xiàn)之前即可明確診斷,顯示出無可比擬的優(yōu)勢。針對遺傳性主動脈疾病基因檢測,主要采用基因組合測序的方法,其檢測結(jié)果對于患者的早期、明確診斷和家屬篩查具有重要意義,對于患者手術(shù)方案的選擇及預(yù)后判斷也有一定的指導(dǎo)作用。
關(guān)鍵詞綜述;主動脈疾??;基因
自20世紀(jì)90年代起,隨著人類基因組計劃的開展,生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域涌現(xiàn)出許多新的理論與技術(shù),疾病的分子診斷作為一個新興的臨床診斷方向逐漸得到廣泛應(yīng)用。近年來,測序平臺與技術(shù)的不斷進(jìn)步和完善,極大地推動了分子診斷的應(yīng)用進(jìn)程?;赟anger雙脫氧鏈終止法的一代測序,對于致病基因單一且外顯子數(shù)較少的疾病篩查,仍不失為一個好的方法。相比一代測序技術(shù),二代測序技術(shù)以其高通量、低成本的優(yōu)勢很快得到了廣泛應(yīng)用。目前臨床上應(yīng)用比較多的是基因組合檢測,對相關(guān)疾病的一組基因進(jìn)行檢測,旨在篩查已知致病基因是否存在突變。隨著測序費(fèi)用的降低、數(shù)據(jù)庫的積累以及研究者對數(shù)據(jù)結(jié)果解讀經(jīng)驗的加深,全外顯子組測序的方法已越來越多地應(yīng)用于復(fù)雜疾病或新致病基因的探索研究,并逐步應(yīng)用于臨床診斷。越來越多的遺傳異質(zhì)性疾病的相關(guān)致病基因被檢出,2010年~2015年間,利用全外顯子測序技術(shù)已經(jīng)檢測出550多個疾病相關(guān)致病基因[1]。經(jīng)過近二十年的快速發(fā)展與積累,分子診斷技術(shù)已成為推動當(dāng)代醫(yī)學(xué)發(fā)展的重要前沿領(lǐng)域之一。本文所述的遺傳性主動脈疾病分子診斷的成功應(yīng)用就是基因檢測使臨床獲益的一個很好案例。
遺傳性主動脈疾病以主動脈擴(kuò)張、主動脈瘤/夾層為特征,可發(fā)生于馬凡綜合征(MFS)、Loeys-Dietz綜合征(LDS)、血管型Ehlers-Danlos綜合征(vEDS)、家族性胸主動脈瘤/夾層(FTAAD)等多種疾病。這些疾病有著不同程度的臨床表型重合,又有著各自的疾病特征,早期時候僅依靠臨床癥狀加以區(qū)分和診斷。它們的共同特點(diǎn)是主動脈瘤發(fā)生破裂的風(fēng)險高,必須通過手術(shù)置換損傷部位動脈而避免發(fā)生致命性動脈瘤破裂[2]。這些綜合征臨床異質(zhì)性很強(qiáng),患者往往難以具有非常典型的疾病特征,診斷相對困難。因此,基因檢測可在患者癥狀完全表現(xiàn)之前明確診斷,顯示出無可比擬的優(yōu)勢。此外,還可能影響患者手術(shù)時機(jī)的選擇。通常情況下,當(dāng)患者主動脈直徑達(dá)到5.0~5.5 cm時,醫(yī)生會建議進(jìn)行預(yù)防性手術(shù)干預(yù)[3]。然而研究結(jié)果顯示,多達(dá)60%的急性A型主動脈夾層在直徑<5.5 cm時即發(fā)生了破裂[4]。在過去十年對MFS及相關(guān)疾病的研究中,人們已經(jīng)積累了一定的經(jīng)驗,了解到特定基因的突變可預(yù)示著患者主動脈直徑<5.0 cm時即有發(fā)生破裂的風(fēng)險,以及患者預(yù)后情況[5,6]。下面就以基因檢測在遺傳性主動脈疾病診斷和預(yù)后評估中的應(yīng)用為例,闡述基因檢測在臨床中的重要作用。
1.1MFS
MFS是一種常染色體顯性遺傳的結(jié)締組織疾病,發(fā)病率約為1:3 000~1:5 000[7]。病變累及多個器官系統(tǒng),主要涉及心血管、骨骼和眼睛。其中,心血管系統(tǒng)異常包括主動脈瘤/夾層,是導(dǎo)致MFS患者死亡的最主要原因。若無干預(yù),患者平均壽命約為32歲。若得到適當(dāng)干預(yù)和治療,其平均壽命可接近于正常人[8]。
鑒于MFS臨床表現(xiàn)的高度異質(zhì)性,國際上對于MFS的診斷標(biāo)準(zhǔn)也在不斷修改和完善。目前國際上普遍采用的是2010年修訂版Ghent標(biāo)準(zhǔn)[9],它更加重視主動脈根部瘤/夾層和晶體異位這兩大表現(xiàn)。同時,該診斷標(biāo)準(zhǔn)首次將分子診斷(致病性基因突變篩查)納入主要診斷條件,并賦予其重要意義。FBN1是MFS唯一致病基因,編碼原纖維蛋白(fibrillin)-1,是細(xì)胞外微纖維的重要組成部分[10]。
目前已發(fā)現(xiàn)的FBN1突變已有上千個,多數(shù)是單個家庭特有的。其中,錯義突變是最常見類型,半胱氨酸的單堿基置換占絕大多數(shù)?,F(xiàn)有的FBN1基因型-表型關(guān)聯(lián)分析提示,F(xiàn)BN1基因半胱氨酸發(fā)生錯義突變的患者發(fā)生晶體異位的幾率高于其它突變類型[11]。此外,早發(fā)嚴(yán)重的MFS(新生兒MFS)患者,F(xiàn)BN1突變多發(fā)生在24~32號外顯子[12],具體機(jī)制還有待深入研究。
越來越多的臨床數(shù)據(jù)顯示,MFS患者主動脈直徑<5.5 cm時發(fā)生急性破裂的風(fēng)險較小,其它動脈發(fā)生動脈瘤的幾率較低[13]。有趣的是,F(xiàn)BN1基因的常見變異位點(diǎn)(基因多態(tài)性位點(diǎn))可增加普通人群患胸主動脈瘤的風(fēng)險[14],有研究正在嘗試探索是否可以據(jù)此判斷哪些患者可以采用與MFS患者相似的方案進(jìn)行治療。
1.2LDS
LDS是一種常染色體顯性遺傳的結(jié)締組織疾病,很多心血管系統(tǒng)和骨骼異常與MFS有著相似表現(xiàn),曾被定義為2型MFS。2005年,Loeys等[5]首次將其報道為一個獨(dú)立的疾病,患者平均死亡年齡只有26歲。除了表現(xiàn)出與MFS患者相似的心血管和骨骼異常外,此類患者還可能表現(xiàn)出一些特有的特征,如眼距過寬、懸雍垂/腭裂、顱縫早閉等。與MFS患者相比,LDS患者主動脈瘤/夾層臨床進(jìn)展更為迅猛,患者平均發(fā)病年齡和死亡年齡更早,除主動脈根部外,其它部位發(fā)生動脈瘤和動脈扭曲的風(fēng)險較高。
美國心臟病協(xié)會建議,LDS患者主動脈直徑達(dá)到4.2 cm時,即可進(jìn)行預(yù)防性手術(shù)[3]。然而許多歐洲國家對MFS和LDS進(jìn)行類似處理,待患者主動脈直徑達(dá)到5.0 cm時才進(jìn)行手術(shù)治療,卻并未發(fā)現(xiàn)LDS患者出現(xiàn)更早的動脈瘤/夾層破裂[15]。因此,LDS患者在主動脈直徑<5.0 cm時發(fā)生急性動脈瘤/夾層破裂的風(fēng)險,可能還需要更大樣本量的研究驗證。
因為LDS的診斷不存在最小診斷標(biāo)準(zhǔn),因此致病基因的檢測在LDS診斷中起著重要作用。TGFBR1和TGFBR2是最早發(fā)現(xiàn)的LDS致病基因,兩者引起的患者表型并無明顯差別。隨著研究的深入,人們發(fā)現(xiàn)SMAD3和TGFB2突變也可引發(fā)LDS,它們均可導(dǎo)致轉(zhuǎn)化生長因子β(TGFβ)信號通路增強(qiáng)[16-18]。其中,SMAD3突變引發(fā)的LDS患者,發(fā)生骨關(guān)節(jié)炎的風(fēng)險較高[16]。
1.3vEDS
vEDS是一種常染色體顯性遺傳疾病,主要表現(xiàn)為除主動脈根部外,全身中到大血管都容易發(fā)生動脈瘤/夾層。骨骼系統(tǒng)異常包括關(guān)節(jié)松弛(常局限于小關(guān)節(jié)),新生兒患者可能出現(xiàn)畸形足、髖關(guān)節(jié)脫位等。此類患者血管脆弱,發(fā)生器官破裂(脾、腸、妊娠子宮)的風(fēng)險較高。有數(shù)據(jù)顯示,患有vEDS的妊娠婦女約有12%的風(fēng)險發(fā)生圍產(chǎn)期動脈破裂或子宮破裂而導(dǎo)致死亡[19]。25%的vEDS 患者在20歲之前表現(xiàn)出明顯的癥狀,80%以上在40歲以前表現(xiàn)出明顯癥狀,患者中位死亡年齡為48歲[20]。COL3A1是目前已知的唯一致病基因[21]。
1.4Shprintzen-Goldberg綜合征(SGS)
SGS與MFS和LDS均有表型重合,包括細(xì)長指、胸廓畸形、脊柱側(cè)突等,最顯著特征表現(xiàn)為顱縫早閉?;颊呱僖娭鲃用}膨大,另外可能出現(xiàn)發(fā)育遲緩、智力障礙等特征。SKI是目前已知的唯一致病基因[22]。
1.5FTAAD
20%的非綜合征型胸主動脈瘤/夾層(TAAD)患者具有家族史,意味著是由遺傳因素導(dǎo)致的疾病。針對這些FTAAD家系進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)FTAAD主要是常染色體顯性遺傳、外顯度不高的單基因疾病。不同家系乃至同一家系不同患者間疾病表現(xiàn)程度可能有所不同,主要表現(xiàn)在發(fā)病年齡、直徑<5.0 cm時升主動脈破裂的風(fēng)險、病變累及主動脈根部或升主動脈或兩者都累及等方面。另外,患者還可不同程度地具有心血管系統(tǒng)其它并發(fā)癥狀,如二葉主動脈瓣、動脈導(dǎo)管未閉和其它血管疾病(如顱內(nèi)動脈瘤、閉塞性動脈疾?。┑萚23]。目前已發(fā)現(xiàn)11個基因與FTAAD有關(guān):FBN1、TGFBR1、TGFBR2、SMAD3和TGFB2突變已在6%~8%的無MFS或LDS特征的FTAAD家系中發(fā)現(xiàn)[24-27],提示這些綜合征和FTAAD的主動脈瘤形成可能有著相似的病理機(jī)制。ACTA2、 MYH11、MYLK、PRKG1、SMAD4、NOTCH1等基因也被發(fā)現(xiàn)與FTAAD有關(guān)[28],其中ACTA2是最為常見的FTAAD致病基因,約占患者人數(shù)的14%[29]。ACTA2突變除了引起TAAD外,還易引起小動脈閉塞性疾病,如早發(fā)性冠狀動脈疾病、中風(fēng)以及原發(fā)性肺動脈高壓等。
ACTA2突變患者主動脈瘤常常同時累及主動脈根部和升主動脈,與MFS患者相比,此類患者更容易發(fā)生急性動脈瘤破裂。1/3的患者主動脈直徑<5.0 cm時發(fā)生了動脈破裂[6]。因此對攜帶ACTA2突變的TAAD患者,當(dāng)主動脈直徑達(dá)到4.5 cm時,即可考慮進(jìn)行預(yù)防性手術(shù)。
針對遺傳性主動脈疾病的基因檢測,通常采用基因組合(gene panel)的方法,即用二代測序的方法對疾病相關(guān)的若干基因的外顯子及其側(cè)翼序列進(jìn)行檢測,查找致病性點(diǎn)突變或較小的插入/缺失。國內(nèi)外市場已出現(xiàn)多個檢測主動脈疾病gene panel試劑盒,包含的基因從數(shù)個到十幾個不等。阜外醫(yī)院實(shí)驗診斷中心目前開展遺傳性主動脈疾病基因檢測項目,組合中包括了MFS、LDS、vEDS、SGS、FTAAD等相關(guān)的15個基因。到目前為止,阜外醫(yī)院實(shí)驗診斷中心已對近200例主動脈瘤患者進(jìn)行了基因組合檢測,其中癥狀較為典型的MFS患者診斷率高達(dá)90%。另外還對若干容易混淆、難以鑒別診斷的相似病例給予了明確診斷。未找到可能致病突變的MFS患者,若臨床癥狀典型或有明顯家族史,我們會進(jìn)行大片段插入/缺失檢測。對于此類型變異,二代測序方法本身存在局限性,難以檢測到,而有報道表明,未檢測到點(diǎn)突變或小片段插入/缺失的MFS患者中,高達(dá)7%的人存在FBN1大片段缺失。對于仍未找到致病突變的MFS患者以及其它有明顯家族史但未找到致病突變的主動脈瘤患者,我們將進(jìn)行全外顯子組測序,嘗試尋找新致病基因。
首先,基因檢測使得癥狀前診斷成為可能,這就為預(yù)防性干預(yù)和及時的監(jiān)測及治療提供了時機(jī)。有研究表明,發(fā)生急性動脈破裂(AAD)的MFS患者,即便首次手術(shù)成功,主動脈其它節(jié)段需要再次干預(yù)的頻率也大于未發(fā)生AAD的患者[30]。因此,疾病的早期診斷尤為重要,基因檢測在此方面顯示出了其特有優(yōu)勢。第二,因為2010年修訂版Ghent標(biāo)準(zhǔn)[7]首次將分子診斷(致病性FBN1基因突變篩查)納入主要診斷條件,所以結(jié)合基因檢測結(jié)果,一些疑似但不滿足診斷標(biāo)準(zhǔn)的MFS患者得以確診。第三,通過基因檢測,臨床表型有重合、容易混淆的疾病,可以得到準(zhǔn)確診斷。如LDS因疾病罕見,再加上國內(nèi)醫(yī)生對此疾病認(rèn)識不足,往往會誤診成MFS。通過基因檢測,不僅患者得到準(zhǔn)確診斷,臨床醫(yī)生也加深了對相關(guān)疾病的認(rèn)識。第四,針對某些特定疾病的基因檢測,還可能指導(dǎo)治療方案,更好地對患者預(yù)后進(jìn)行評估。如LDS,手術(shù)指征(主動脈直徑>4.2 cm)要嚴(yán)于MFS(主動脈直徑>5.0 cm)[3];再如vEDS,妊娠期發(fā)生子宮破裂的風(fēng)險高于其它主動脈瘤患者[19],應(yīng)予以重視。此外,單基因疾病的基因檢測結(jié)果,還可指導(dǎo)患者進(jìn)行生殖選擇,通過早期孕檢或移植前胚胎診斷等方法,避免將疾病傳給下一代,減輕社會和家庭經(jīng)濟(jì)和精神的雙重負(fù)擔(dān)。
總之,基因檢測對于遺傳性主動脈疾病患者的早期、明確診斷和家屬篩查具有重要意義,對于患者手術(shù)方案的選擇及預(yù)后判斷也有一定的指導(dǎo)作用。隨著基因檢測技術(shù)的廣泛應(yīng)用,人們有望發(fā)現(xiàn)遺傳性主動脈疾病新的致病基因,探索更多、更為確鑿的基因型-表型關(guān)聯(lián),同時結(jié)合其它組學(xué)技術(shù),如全外顯子組、轉(zhuǎn)錄組、microRNA組學(xué)分析等[31],進(jìn)一步剖析遺傳性主動脈疾病的發(fā)病機(jī)理,為患者臨床治療方案的選擇提供更為可靠、有力的個性化指導(dǎo)。
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(編輯:梅平)
綜述
(收稿日期:2015-10-13)
中圖分類號:R541.4
文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A
文章編號:1000-3614(2016)03-0304-03
doi:10.3969/j.issn.1000-3614.2016.03.024
作者簡介:楊航 實(shí)習(xí)研究員 博士 主要從事心血管疾病分子診斷和病理機(jī)制研究 Email:chrisyang_1999@163.com 通訊作者:周洲 Email:fwcomd@126.com
作者單位:100037北京市,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 國家心血管病中心 阜外醫(yī)院 實(shí)驗診斷中心 心血管疾病分子診斷北京市重點(diǎn)實(shí)驗室心血管疾病國家重點(diǎn)實(shí)驗室 (楊航、殷昆侖、 陳前龍、周洲),血管外科中心(羅明堯、常謙)