王靈敏,孟小莽,許豫南,孟宇辰
(1.石家莊市種子管理站,河北 石家莊 050051;2.東北林業(yè)大學國家生命科學學院,黑龍江 哈爾濱 150040)
淺議種子真實性與品種純度鑒定方法的適用范圍與優(yōu)劣
王靈敏1,孟小莽1,許豫南1,孟宇辰2
(1.石家莊市種子管理站,河北 石家莊 050051;2.東北林業(yè)大學國家生命科學學院,黑龍江 哈爾濱 150040)
在鑒定品種純度時,根據(jù)不同品種采用不同方法進行真實性鑒定,對種子的鑒定工作可以起到事半功倍的效果。筆者總結了形態(tài)鑒定法、電泳法以及分子標記法等幾種鑒定種子純度的方法及適用范圍,并總結了各方法的優(yōu)劣,供同行參考借鑒。
種子;純度鑒定
品種純度與真實性是農作物種子質量重要指標之一,品種純度的高低和種子的真假直接影響農作物的產(chǎn)量和品質。
品種純度與種子真實性鑒定的方法目前有形態(tài)鑒定法、生理生化法以及DNA分子標記法。不同作物、不同品種通過選擇適合的方法,可以做到簡單、經(jīng)濟、快速又準確。
形態(tài)鑒定法包括種子形態(tài)鑒定法、種苗形態(tài)鑒定法和植株鑒定法幾種。
1.1 種子形態(tài)鑒定法
根據(jù)種子形狀、大小、顏色、質地及種子外表各部位的特征,鑒別本品種與異品種。如玉米種子可以根據(jù)粒型(馬齒型、半馬齒型、硬粒型)、粒色(白色、黃色、紅色、紫色),籽粒的頂部形狀(長方、長圓、圓),頂部顏色以及粉質的多少,胚的大小、形狀,胚部皺折的有無、多少,花絲遺跡的位置與明顯程度,稃色、籽粒棱角的有無及明顯程度等進行鑒定。
一些玉米雜交品種存在胚乳直感現(xiàn)象,可以用此法鑒別自交粒和雜交種。該法簡單、經(jīng)濟、快速,但用于鑒定品種純度的特征有限,而且適用于形態(tài)性狀豐富且易觀察的作物品種,并且種子的大小、顏色易受成熟度、土壤和氣候的影響,且受主觀影響較大,故準確性較差,可酌情使用。
1.2 種苗形態(tài)鑒定法
根據(jù)不同品種幼苗的獨特性狀進行鑒定。如玉米芽鞘顏色分為紫色和綠色,用此性狀只適用于鑒別芽鞘顏色不同的玉米品種。該法簡便、省時,但僅適用于十字花科、豆科等幼苗形態(tài)性狀豐富的有限幾種作物,而且苗期所依據(jù)的性狀有限,受環(huán)境的影響頗大,測定結果不太準確。
1.3 植株形態(tài)鑒定法
即田間小區(qū)種植鑒定法。田間小區(qū)種植鑒定法是鑒定品種真實性和測定品種純度的最為可靠、準確的方法之一。
為了鑒定品種真實性,應在鑒定的各個階段與標準樣品進行比較,而且為使品種特征特性充分表現(xiàn),在試驗設計和布局上要選擇氣候環(huán)境條件適宜、土壤均勻、肥力一致、前茬無同類作物和雜草的地塊,并有適宜的栽培管理措施。種植株數(shù)要根據(jù)種子質量標準而定,若標準為(N-1)×100%/N,種植株數(shù)應為4N。
通常根據(jù)品種審定公告中描述的特征特性,在苗期、花期、成熟期3個時期進行鑒定,尤其在特征特性表現(xiàn)最明顯時期必須逐株鑒定。如玉米種子必須在花期根據(jù)株型、株高、葉色、花絲花藥顏色、雄穗分枝等特征特性鑒定。
因依據(jù)的性狀較多,是以前最為通用且比較可靠的方法,但要求有適宜的光照、溫度等氣候環(huán)境條件,如玉米要采用冬季的海南種植鑒定,此法受地域的限制,或者采用當?shù)氐耐诜N植鑒定(當年所生產(chǎn)的種子要等下一個生長季節(jié)才能鑒定),需時較長,種子下地前不能鑒定種子優(yōu)劣。
同時,要求檢驗員擁有豐富的經(jīng)驗,熟悉被檢品種的特征特性,能正確鑒別植株是屬于本品種還是變異株,并能區(qū)分變異株是遺傳變異,而不是受環(huán)境影響所引起的變異。
另外,如果遭遇冰雹、大風、過熱過冷極端天氣及長期多陰雨天氣難以保證植株正常生長,就談不上鑒定準確。
目前一些作物骨干親本的集中頻繁使用,使育成品種間的遺傳差異越來越小,形態(tài)性狀檢驗越來越困難。電泳技術和DNA分子標記技術的應用,恰恰彌補了形態(tài)法的不足。
電泳法中常用的技術有同工酶電泳技術和蛋白質電泳技術。
2.1 同工酶電泳法
利用電泳技術分離各種酶的同工酶,通過比較同工酶譜,鑒定種子純度。此法能分析大量樣品,較簡單、快速、可靠,不受環(huán)境影響。
但是,同工酶具有組織特異性、可利用的數(shù)量少、多態(tài)性少,對酶的提取要求高和電泳條件較為嚴格,還常因同工酶選擇不當、同工酶活性及表達易隨種子的貯藏和萌發(fā)過程發(fā)生變化等因素,影響鑒定結果的準確性,并且因酶易失活,難以大范圍推廣。
2.2 蛋白質電泳法
主要包括鹽溶蛋白聚丙烯酰胺凝膠電泳、醋酸尿素聚丙烯酰胺凝膠電泳和超薄等電聚焦電泳。禾谷類根據(jù)種子醇溶蛋白的多樣性,形成電泳圖譜差異加以鑒別。該方法品種間譜帶差異較為明顯,互補帶清晰、分辨率高,提取和染色時間較短,簡單、經(jīng)濟,穩(wěn)定性、重復性好,在品種相對少的時期,為鑒定種子真實性和品種純度發(fā)揮了相對準確、較為快速的優(yōu)勢,但對親緣關系較近的品種難以鑒別。
醋酸尿素聚丙烯酰胺凝膠電泳法測定玉米種子的純度,不需要用緩沖液配制分離膠和濃縮膠,簡化了操作步驟,并且其樣品提取和電泳時間都比較短,但是也有其局限性,如譜帶彎曲、界限不太清晰等。
超薄等電聚焦電泳技術采用水平平板電泳槽,凝膠超薄、雙聚焦,大大增加了點樣數(shù)量,操作方便、準確性高、制膠速度快,縮短了固定、染色和脫色時間,但是電泳所用的兩性電解質價格較貴。
同工酶電泳技術和蛋白質電泳技術具有快速、準確性高、重復性好的優(yōu)點。但其畢竟是基因產(chǎn)物,勢必會受到各種環(huán)境因素的影響,而影響鑒定結果的準確性。
分子技術主要有RFLP技術、RAPD技術、AFLP技術、SSR技術以及新興的SNP技術。
3.1 RFLP技術
利用限制性內切酶切割不同品種的DNA時,產(chǎn)生DNA片段的數(shù)目和大小不同,通過電泳再進行Southern轉移到膜上,利用放射性同位素,用該探針與支持膜上的DNA雜交得到DNA的限制性片段,多態(tài)性加以區(qū)分。
RFLP標記大多數(shù)為共顯性,多態(tài)性穩(wěn)定、特異性強、準確性高,但其過程繁瑣、周期長、操作難度較大,需要大量純度較高的DNA,耗費高,且放射性同位素的使用影響人體安全。這些缺點限制了其推廣應用。
3.2 RAPD技術
利用隨機引物對不同品種的基因組DNA進行PCR擴增、電泳,得到多態(tài)性DNA譜帶進行鑒定。此技術反應靈敏、多態(tài)性強、分辨率高、快速簡便、無放射性污染、DNA用量極少、成本較低,既有大量的隨機引物可供篩選之用,又不受種屬的限制。
但RAPD技術存在提供的信息不夠全、一般為顯性標記、不能區(qū)分雜合子與純合子、不同引物之間的擴增結果重復性和穩(wěn)定性相差較大、引物篩選工作量大等不足,有一定的局限性。
3.3 AFLP技術
利用基因組DNA經(jīng)酶切后形成大小不等的隨機限制性DNA片段,片段兩端連接上與酶切位點配對的特定接頭,用與接頭互補的專用引物進行PCR擴增、電泳、放射自顯影顯示DNA指紋。
AFLP是RFLP和PCR技術的結合,兼?zhèn)銻FLP的可靠性和PCR的高效性。但AFLP多態(tài)性檢出率過高,能檢出樣本內個體之間細微的差異,易形成假雜株,而且對DNA和內切酶的質量要求較高,實驗技能高和儀器設備精密,操作復雜,試驗周期長,加之是專利技術,不宜普及推廣。
3.4 SSR技術
根據(jù)SSR序列兩端保守的單拷貝序列,設計特異的引物,通過PCR擴增、電泳,得知不同個體在某個SSR座位上的多態(tài)性。
SSR標記完全符合作物品種鑒別的4個基本準則:環(huán)境的穩(wěn)定性、品種間變異的可識別性、最小的品種內變異性和實驗結果的可靠性。
但是,對于品種間沒有位點差異的,誤判為兩個品種相同;不同平臺之間不能直接比較,整合需要設立參照樣品,甚至不同型號毛細管電泳儀之間的數(shù)據(jù)也需要進行位點的校準才能實現(xiàn)互通;毛細管電泳雖然可以實現(xiàn)多重,如果要增加通量和引物的數(shù)量,就會成倍增加工作量,大幅增加檢測成本。
3.5 SNP標記技術
SNP標記是在基因組上單個核苷酸的變異形成的遺傳標記。此法標記密度高,與功能基因的關聯(lián)度高,更容易開發(fā)到與性狀相關的SNP功能標記,遺傳穩(wěn)定性強,檢測通量高,易實現(xiàn)自動化分析。SNP標記一般只有兩種等位基因型,數(shù)據(jù)統(tǒng)計簡單,且不依賴檢測平臺,容易實現(xiàn)不同來源數(shù)據(jù)的整合和標準化。
我國在農作物DNA鑒定指紋研究發(fā)展較快,特別是在主要農作物品種DNA分子檢測技術標準化和應用方面。在GB/T3543.5-1995《農作物種子檢驗規(guī)程真實性和品種純度鑒定》第1號修改單中,增加6.2.4條即DNA分子檢測方法:品種真實性驗證或身份鑒定,允許采用SSR和SNP分子標記方法。
截至2014年6月底,現(xiàn)行有效的農作物分子檢測標準有18項,涉及15類農作物。如NY/T 1432-2014、NY/T 2470-2013、NY/T 2595-2014、NY/T 2469-2013、NY/T 1433-2014,即玉米、小麥、大豆、陸地棉和水稻品種鑒定技術規(guī)程SSR標記法等。同時,新種子法第四十七條規(guī)定“:農業(yè)、林業(yè)主管部門可以采用國家規(guī)定的快速檢測方法對生產(chǎn)經(jīng)營的種子品種進行檢測,檢測結果可以作為行政處罰依據(jù)”,這為種子質量監(jiān)督及時到位提供了法律依據(jù),也更加速了SSR標記法的推廣應用,在種子質量管理上發(fā)揮越來越重要的作用,為打擊假冒偽劣種子,保護育種者、種子生產(chǎn)經(jīng)營企業(yè)和農民的合法權益提供重要的技術保障。
1005-2690(2016)08-0033-02
:S339.36+1
:A
2016-07-21)
王靈敏(1986-),女,河北石家莊人,本科,高級農藝師,從事種子質量監(jiān)督與種子管理工作。