科學(xué)家深挖表觀遺傳組鑒別出引發(fā)髓母細(xì)胞瘤的關(guān)鍵原因

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科學(xué)家深挖表觀遺傳組鑒別出引發(fā)髓母細(xì)胞瘤的關(guān)鍵原因

近日，來自圣猶大兒童研究醫(yī)院的研究人員通過研究鑒別出了引發(fā)腦部腫瘤亞型4組髓母細(xì)胞瘤的細(xì)胞，該研究或為開發(fā)新型靶向療法抵御常見腦部腫瘤提供一定幫助和希望。

研究人員利用分析工具Chip-Seq，基于表觀遺傳調(diào)節(jié)子的活性鑒別并且追蹤了不同亞型髓母細(xì)胞瘤的差異性，這些表觀遺傳調(diào)節(jié)子包括一些已知的主要調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子，其可以結(jié)合名為增強(qiáng)子及超級增強(qiáng)子的DNA序列，這種主要的調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子和超級增強(qiáng)子可以聯(lián)合作用來調(diào)節(jié)關(guān)鍵基因的表達(dá)，比如負(fù)責(zé)細(xì)胞身份的基因等。

研究者使用的工具對28種髓母細(xì)胞瘤腫瘤中超過3 000種超級增強(qiáng)子進(jìn)行了鑒別，同時他們還根據(jù)不同腫瘤亞型鑒別出了超級增強(qiáng)子的活性，這些超級增強(qiáng)子可以開啟一些癌癥基因，包括ALK、MYC、SMO和OTX2基因等，這些基因都和髓母細(xì)胞瘤直接相關(guān)。研究者發(fā)現(xiàn)，Lmx1A或許是4型髓母細(xì)胞瘤亞型的主要轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)子，Lmx1A被認(rèn)為在小腦等結(jié)構(gòu)中扮演著重要角色，研究者表示，這項研究是對單一癌癥亞型進(jìn)行的大型表觀遺傳學(xué)研究，更重要的是他們首次對原始的病人腫瘤組織進(jìn)行了大型的隊列梯度研究，此前研究中因為研究對象僅限于細(xì)胞系，所以他們僅能對腫瘤的表觀遺傳組進(jìn)行研究，而研究中對髓母細(xì)胞瘤亞型進(jìn)行單獨的研究或許為后期闡明疾病發(fā)生機(jī)制，以及開發(fā)特殊的個體化療法提供新的基礎(chǔ)和思路。