劉 昆 宋小亞 蔣 俊 路新彥
(麗水農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,浙江 麗水 323000)
食用菌拮抗反應(yīng)的定量分析
劉 昆 宋小亞 蔣 俊 路新彥
(麗水農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,浙江 麗水 323000)
應(yīng)用Photoshop軟件對(duì)拮抗反應(yīng)中的菌絲生長(zhǎng)面積進(jìn)行量化分析。試驗(yàn)采用18個(gè)香菇菌株,經(jīng)對(duì)各菌株菌絲培養(yǎng),測(cè)量相對(duì)生長(zhǎng)面積,計(jì)算對(duì)照菌株L808對(duì)其他17個(gè)菌株的拮抗系數(shù)。以拮抗系數(shù)為依據(jù),判別各參試菌株的拮抗能力,拮抗系數(shù)越大,其拮抗能力越強(qiáng)。此可作為食用菌菌種鑒別新的量化指標(biāo)參數(shù)。
Photoshop;拮抗反應(yīng);香菇
擔(dān)子菌中的拮抗現(xiàn)象(antagonism)是由多基因控制的異源不親合反應(yīng)。控制兩個(gè)菌株雙核菌絲體不親合性的多個(gè)基因位點(diǎn)只要有一處不同,菌絲體相互接觸時(shí)不親合反應(yīng)就會(huì)發(fā)生,并會(huì)在接觸區(qū)出現(xiàn)色素,菌絲隆起和菌絲稀疏等[1]。因拮抗反應(yīng)的試驗(yàn)操作簡(jiǎn)單,結(jié)果也比較容易辨別,常被用于食用菌的菌種鑒別研究。但以往的研究多關(guān)注拮抗線部位的形態(tài)特征,而未對(duì)菌絲生長(zhǎng)面積的大小做過探討。
隨著科技的進(jìn)步,數(shù)字化圖像處理和分析技術(shù)在多個(gè)行業(yè)中被廣泛應(yīng)用。Photoshop軟件因其圖像處理功能強(qiáng)大常被科研工作者應(yīng)用。利用軟件中直方圖分析不規(guī)則形狀面積的方法在林業(yè)遙感測(cè)量、醫(yī)療中瘢痕計(jì)算、植物病斑面積計(jì)算等工作中發(fā)揮了重要功能[2~4]。本文在他人的研究基礎(chǔ)上,介紹一種應(yīng)用Photoshop軟件對(duì)拮抗反應(yīng)中菌絲生長(zhǎng)面積進(jìn)行量化分析的方法。
1.1 試驗(yàn)材料
18個(gè)香菇菌株,分別為L(zhǎng)808、L868、L135、L9015、L939、L241-4、慶科20、武香1號(hào)、蘇香1號(hào)、申香1號(hào)、申香2號(hào)、申香8號(hào)、申香10號(hào)、申93、L26、Cr04、Cr66和Cr33,均由麗水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院大型真菌種質(zhì)資源庫(kù)提供。
Adobe Photoshop CS6 簡(jiǎn)體中文試用版由Adobe公司的中文主頁(yè)下載而得。
1.2 試驗(yàn)方法
(1)菌絲的培養(yǎng)。培養(yǎng)基量為每皿20 mL,在培養(yǎng)皿底部(直徑90 mm,下同)平面上,距圓心15 mm處分別作直徑為5 mm的圓,滅菌備用。將供試菌株轉(zhuǎn)接至PDA試管中,25 ℃黑暗條件下活化培養(yǎng)。試管長(zhǎng)滿菌絲后,將菌株接種至PDA平板的中央,在25 ℃黑暗條件下培養(yǎng)。
當(dāng)菌絲長(zhǎng)至培養(yǎng)皿的2/3面積時(shí),用直徑5 mm的打孔器在菌絲邊緣打孔,取菌絲塊。分別將L808與其他17個(gè)菌株的菌絲塊接種到上述備用培養(yǎng)皿圓中,于25 ℃黑暗下對(duì)峙培養(yǎng)。當(dāng)兩菌株菌絲相互接觸后,在光下培養(yǎng)5~7天。培養(yǎng)結(jié)束后,對(duì)每個(gè)培養(yǎng)皿在相同的拍攝參數(shù)上進(jìn)行正反面拍照。
(2)菌絲相對(duì)生長(zhǎng)面積的測(cè)量。用Photoshop軟件打開培養(yǎng)皿背面的拮抗照片。菜單欄中選擇“圖像—調(diào)整—曲線”,打開曲線調(diào)整對(duì)話框,向下調(diào)整曲線中間調(diào)(圖1),提高菌絲與背景之間及拮抗線自身的清晰度。工具欄中選取“磁性套索工具”,羽化值設(shè)為3,沿拮抗線和培養(yǎng)皿的邊緣選取一個(gè)菌株的菌絲覆蓋處。菜單欄中選擇“窗口—直方圖”調(diào)出直方圖對(duì)話框(圖2),記錄其中的像素?cái)?shù),記做P1。同樣的方法測(cè)量整個(gè)培養(yǎng)皿底部的像素?cái)?shù),記做P2。
圖1 曲線調(diào)整對(duì)話框
圖2 從直方圖中讀取整個(gè)培養(yǎng)皿的像素信息
(3)相對(duì)生長(zhǎng)面積的計(jì)算。試驗(yàn)原理參照參考文獻(xiàn)[4],方法略有修改。數(shù)碼照片的分辨率是單位長(zhǎng)度上容納像素的數(shù)量。通常所講72像素的分辨率指1英寸長(zhǎng)度的位置上包含72個(gè)像素,即1平方英寸面積上含有72×72=5 184個(gè)像素。因此數(shù)碼照片中的實(shí)際面積S可以用其所包含的像素?cái)?shù)P除以分辨率R得到。拮抗反應(yīng)試驗(yàn)同一照片(分辨率R相同)中兩不同菌絲覆蓋面積的比值A(chǔ)(以下稱為拮抗系數(shù))可用下列公式求得:
S1表示測(cè)試菌株的菌絲生長(zhǎng)面積;S2表示對(duì)照菌株的菌絲生長(zhǎng)面積;P1表示測(cè)試菌株菌絲所覆蓋培養(yǎng)皿的像素?cái)?shù);P2表示整個(gè)培養(yǎng)皿的像素?cái)?shù),R表示分辨率。
2.1 圖片的選用
拮抗反應(yīng)試驗(yàn)中L808與大部分菌株均有明顯的拮抗反應(yīng),培養(yǎng)皿中不同的菌株以拮抗線為分界線形成了2個(gè)區(qū)域,界限明顯,方便軟件進(jìn)行測(cè)量。但也有部分菌株,從培養(yǎng)皿正面觀察不易分清兩者菌絲的生長(zhǎng)邊界,而培養(yǎng)皿背面則非常容易將兩者區(qū)分開(圖3)。同時(shí)因拮抗時(shí)所用的菌株菌絲一般均為同一顏色,而且某些菌株因其特性會(huì)形成色素、菌絲球和菌落不均勻等現(xiàn)象,會(huì)干擾軟件的測(cè)量。因此測(cè)量數(shù)據(jù)時(shí),以培養(yǎng)皿背面的圖片為好。
圖3 L808與L135的拮抗反應(yīng)試驗(yàn)正面(左)與背面(右)
圖4 L808對(duì)其他菌株的拮抗系數(shù)曲線
試驗(yàn)中的數(shù)據(jù)以照片中的像素?cái)?shù)為基礎(chǔ),因此在拍照時(shí),圖片的參數(shù)要統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。
2.2 拮抗能力分析
根據(jù)L808對(duì)其他17個(gè)菌株拮抗系數(shù)的分析結(jié)果(圖4),拮抗系數(shù)曲線呈明顯的上升趨勢(shì)。隨著拮抗系數(shù)的增加,L808對(duì)其他菌株的拮抗能力依次增強(qiáng),其中對(duì)L868的拮抗能力最弱,對(duì)L135的拮抗能力最強(qiáng)。
根據(jù)統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果(表1),按照顯著性差異大小,可將17個(gè)試驗(yàn)菌株分成7組:L868、Cr04、L26、申香1號(hào)4個(gè)菌株為第1組;申香8號(hào)、Cr33、武香1號(hào)、L939、蘇香1號(hào)、申香2號(hào)、申93共7個(gè)菌株為第2組;申香10號(hào)、Cr66為第3組;L241-4、L9015、慶科20、L135分別單獨(dú)成為第4、第5、第6、第7組。
L808與第一組菌株之間的拮抗系數(shù)小于1,說明其菌絲對(duì)組中菌株的拮抗能力較弱;L808與第2組菌株間的拮抗系數(shù)接近于1,說明其菌絲對(duì)組中菌株的拮抗能力相當(dāng);L808與第3組的拮抗系數(shù)均超過了1但小于1.3,說明其菌絲對(duì)被測(cè)菌株的拮抗能力較強(qiáng);L808與第4、第5、第6、第7組的拮抗系數(shù)均超過了1.3,甚至接近2,說明其菌絲對(duì)被測(cè)菌株的拮抗能力非常強(qiáng)。由此可見,拮抗系數(shù)可有效地分析出L808對(duì)不同菌株拮抗能力的大小。
表1 L808對(duì)不同菌株的拮抗系數(shù)
在藥物的抑菌試驗(yàn)中,常通過抑菌圈的大小來判斷藥物的抑菌效應(yīng)。其操作是將供試菌涂布于整個(gè)培養(yǎng)皿中,在其上接種待測(cè)藥物。抑菌圈一般是規(guī)則的圓形,只需要測(cè)定圓的直徑便可測(cè)量出抑菌能力大小。而食用菌的拮抗反應(yīng)試驗(yàn)一般是兩個(gè)菌株或多個(gè)菌株近距離的對(duì)峙培養(yǎng),其菌絲生長(zhǎng)速度快,在出現(xiàn)拮抗現(xiàn)象時(shí),菌絲已經(jīng)布滿培養(yǎng)皿,形成兩個(gè)或多個(gè)不規(guī)則的扇形區(qū),手工不易準(zhǔn)確測(cè)量其面積的大小。本文結(jié)合藥物抑菌實(shí)驗(yàn)的原理,應(yīng)用Photoshop軟件的直方圖像素信息,實(shí)現(xiàn)對(duì)食用菌拮抗反應(yīng)中菌絲相對(duì)生長(zhǎng)面積的測(cè)量。
以往利用拮抗反應(yīng)鑒別菌種過程中,會(huì)出現(xiàn)因拮抗反應(yīng)現(xiàn)象不明顯、試驗(yàn)操作不規(guī)范和各人觀察角度不同,導(dǎo)致試驗(yàn)結(jié)論有誤差,影響鑒別結(jié)果的準(zhǔn)確性。本研究通過用電腦軟件測(cè)量菌絲生長(zhǎng)面積的方法,實(shí)現(xiàn)對(duì)不同菌株間的拮抗能力鑒別,輔助拮抗反應(yīng)最終結(jié)果的判定,增加拮抗試驗(yàn)的準(zhǔn)確性。當(dāng)兩菌株之間無明顯的拮抗反應(yīng),而拮抗系數(shù)明顯小于或大于1時(shí),則表示兩菌株有差異的概率明顯提高。
通過比較新品種與對(duì)照菌種的拮抗系數(shù),可實(shí)現(xiàn)對(duì)其生長(zhǎng)勢(shì)的判斷。測(cè)量新品種與對(duì)照菌之間拮抗系數(shù)的大小,還可判斷其抑菌能力。因此,拮抗系數(shù)可在食用菌育種試驗(yàn)中作為一種新的量化指標(biāo)應(yīng)用。
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S646
A
2095-0934(2015)06-364-03
麗水市科技計(jì)劃項(xiàng)目(2012JYZB26)
劉昆(1984—),男,助理研究員,碩士研究生,主要從事食用菌菌種質(zhì)量檢測(cè)工作。E-mail:tjliukun@126.com