馬濤綜述,蔣孝華審校
(南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院感染科,湖南衡陽421001)
丙型肝炎病毒體外復(fù)制模型的研究進展
馬濤綜述,蔣孝華審校
(南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院感染科,湖南衡陽421001)
肝炎,丙型;肝炎病毒;體外研究;細胞模型;綜述
持續(xù)感染的丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)是一個重要的醫(yī)學(xué)問題。全球有130~170萬人感染了這種病菌,感染者發(fā)生肝臟損傷的風(fēng)險很高,包括肝硬化和肝細胞癌[1]。由于丙型肝炎的潛伏期長且大部分病人早期無明顯表現(xiàn),估計在未來的5~10年HCV相關(guān)的肝臟疾病患者數(shù)量將會持續(xù)上漲[2]。迄今為止,未研究出可預(yù)防HCV感染的疫苗。然而,在靶向治療病毒和宿主方面,直接作用的抗病毒藥物(direct-acting antiviral drugs,DAAs)取得巨大進步,能有效地阻止HCV的復(fù)制[3]。首個抑制HCV非結(jié)構(gòu)蛋白3(NS3)的蛋白酶類抑制劑,增加了感染HCV1型患者的持續(xù)病毒應(yīng)答率,在聯(lián)合聚乙二醇化的α干擾素/利巴韋林這2種藥物治療的情況下,應(yīng)答率從45%上升至75%[4]。但是,這三重組合療法有許多不良反應(yīng)和一些禁忌證,并僅限于基因型1病毒。因此,更有效的DAAs是必需的。大部分DAAs的發(fā)展,都需要有可靠、實用的HCV細胞培養(yǎng)模型。本文對HCV體外細胞模型的研究進展作一綜述。
HCV是黃病毒科的一員,形成丙型肝炎病毒屬?;蚪M為單股正鏈RNA,含9 600個核苷酸。它包含1個長開放閱讀框和兩側(cè)5′和3′非編碼區(qū)(nontranslated regions,NTRS)。5′非編碼區(qū)包含1個內(nèi)部核糖體進入位點(internal ribosome entry site,IRES),可編碼約3 000個氨基酸的前體多聚蛋白[5],翻譯后,前體多聚蛋白被宿主信號肽酶和病毒基因編碼的蛋白酶切割成10個獨立的片段[6]。包括核心蛋白,包膜糖蛋白E1和E2、p7中的離子通道蛋白,非結(jié)構(gòu)蛋白NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B。核心蛋白是病毒核衣殼的重要組成部分,其作用得到越來越多的關(guān)注,最近發(fā)現(xiàn)核心蛋白在肝癌的發(fā)生中可能直接作為致病因子[7]。高藝[8]認(rèn)為E1可能與載脂蛋白有關(guān),主要是通過低密度脂蛋白受體得以進入哺乳動物細胞。E1和E2屬于膜蛋白,構(gòu)成病毒外膜。E1、E2與病毒受體發(fā)生特異性結(jié)合,并介導(dǎo)膜融合與細胞穿入,是引發(fā)宿主受病毒感染的始動因素[5]。p7不是病毒復(fù)制所必需的,但是在細胞培養(yǎng)系統(tǒng)病毒擴增時是必不可少的蛋白[5]。NS2具有半胱氨酸蛋白酶活性,能切割NS2和NS3的連接位點。NS3在N末端結(jié)構(gòu)域編碼絲氨酸蛋白酶,其需要NS4A輔助因子的激活。C端NS3區(qū)域編碼RNA復(fù)制所需的NTPase/解旋酶。NS4B誘導(dǎo)膜重塑,與病毒復(fù)制有關(guān)。NS5A是一種高度磷酸化的蛋白,參與病毒復(fù)制和組裝。NS5B是病毒依賴性RNA聚合酶。
1999年趙婷等[9]建立了選擇性雙順反子亞基因組HCV RNA復(fù)制子系統(tǒng),標(biāo)志著HCV體外培養(yǎng)技術(shù)的一大進步。此系統(tǒng)將核心蛋白至p7或核心蛋白至NS2區(qū)域的編碼用2個非HCV序列替代,即新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(neo)和由腦心肌炎病毒(encephalomyocarditis virus,EMCV)衍生的一個額外IRES。由此形成了HCV復(fù)制子的雙順反子。將該復(fù)制子轉(zhuǎn)染至人肝癌細胞系Huh7,經(jīng)G418抗性篩選,發(fā)現(xiàn)通過敏感的Northern blotting分析很容易檢測(一個含有HCV復(fù)制子的細胞含有1 000~5 000正鏈RNAs和10倍以下的負(fù)鏈)[10]。在此基礎(chǔ)上,研究者在HCV復(fù)制子基因序列中插入適應(yīng)性突變,發(fā)現(xiàn)可以增強復(fù)制子的感染與復(fù)制能力,但這些適應(yīng)性突變增強復(fù)制的機制仍不清楚[11-12]。
研究主張HCV復(fù)制子的自主復(fù)制,但仍不能排除一些無意整合進入細胞DNA的病毒序列及因此合成的病毒RNA,這是主要的問題。當(dāng)發(fā)現(xiàn)在放線菌素D(一種DNA依賴的RNA聚合酶強抑制劑)的存在下,病毒RNA能夠放射性標(biāo)記與代謝[3H]尿苷,問題得以解決。因此,第一個可靠實用的HCV亞基因復(fù)制子細胞模型成功建立了。然而復(fù)制子只能模擬HCV復(fù)制,不能產(chǎn)生感染性病毒顆粒。
最初,只有少數(shù)HCV分離物衍生的復(fù)制子可在細胞培養(yǎng)中繁衍,包括CON1、HCV-N和H77株(基因型1)。后來觀察到了其他病毒株,如HCV-BK(基因型1b)和J6(基因型2a)[13]。直到Takaji Wakita等從日本1例爆發(fā)性肝炎患者的血清中克隆出了一種基因型2a病毒株,命名為JFH-1,在沒有適應(yīng)性突變的情況下能有非常高水平的復(fù)制。此病毒株也可以在不易感染的細胞系復(fù)制,如HepG2、宮頸癌Hela或293T細胞。JFH-1高效復(fù)制的分子機制還沒有完全清楚。然而,在Con-1和JFH-1復(fù)制子的比較中,確定了更快的JFH-1的負(fù)鏈RNA合成動力學(xué),他們認(rèn)為這種病毒株能編碼更有效的復(fù)制酶[14]。用JFH-1全基因組RNA體外轉(zhuǎn)染Huh7細胞,轉(zhuǎn)染24 h后Northern blotting檢測到HCV RNA,并在72 h后仍為陽性結(jié)果;免疫熒光檢測顯示,轉(zhuǎn)染后72 h,70%~80%的細胞表達核心蛋白和NS3蛋白,證明該細胞模型能穩(wěn)定地支持HCV RNA復(fù)制[15]。在轉(zhuǎn)染后5 d,檢測發(fā)現(xiàn)HCV RNA和蛋白的表達達到高峰,并在接下來的7 d中維持在高水平,稍后出現(xiàn)輕微下降。
第一個在非Huh-7細胞如Hela或鼠的肝癌細胞系Hepa-6上成功建立的HCV復(fù)制子在2003年被報道,從而證明了HCV RNA復(fù)制本身不依賴于僅在人肝細胞表達的宿主因子。通過在這些復(fù)制子上使用高效的JFH-1病毒株,可以在許多不同的細胞系如人肝細胞系HepG2和IMY-9、非肝細胞系293和HeLa和小鼠胚胎成纖維細胞(mouse embryonic fibroblasts,MEFs)相當(dāng)容易地建立起來[16-17]。
可用的易感染細胞克隆系、復(fù)制增強的突變和JFH-1株大大拓寬了HCV復(fù)制的應(yīng)用范圍。高效含有熒光素酶基因的復(fù)制子,適用于瞬時(短期)測定,也是可用的。此外,含有選擇性報道基因復(fù)制子的細胞株適用于高通量篩選的目的。只含有HCV IRES的單順反子復(fù)制子的構(gòu)建,更加真實地模仿了病毒基因組的轉(zhuǎn)錄屬性[18]。最后,NS5A一個位點的發(fā)現(xiàn)允許其內(nèi)部框架插入綠色熒光蛋白(GFP),從而首次允許通過細胞生命成像來進行推定病毒復(fù)制位點的研究[19]。
HCV轉(zhuǎn)染的細胞模型在細胞內(nèi)的復(fù)制水平較高,但其轉(zhuǎn)染方法操作比較繁雜,需要構(gòu)建復(fù)制子、重組質(zhì)?;騺喕驈?fù)制子才能進行轉(zhuǎn)染。且不能真實反映病毒復(fù)制狀態(tài)。感染模型雖病毒復(fù)制水平低,但與自然感染狀態(tài)最為接近,能夠比較真實地模擬HCV感染細胞的狀態(tài),比較適于進行HCV發(fā)病機制及藥物研發(fā)等相關(guān)研究。
日本東京大學(xué)醫(yī)學(xué)院和日本國立衛(wèi)生研究院的學(xué)者認(rèn)為感染細胞模型的建立必不可少的是HCV陽性血清:(1)血清中HCV的懸浮密度小于1.06 g/mL;(2)抗病毒核心抗體檢不出或很低;(3)HCV顆粒對細胞的吸附性好,HCV RNA含量高。
在感染細胞模型的建立中,易感的靶細胞是另一個必不可少的條件,肝細胞是HCV自然感染的細胞,成為建立細胞模型的首選靶細胞。有研究證明人類淋巴細胞Ⅰ型病毒感染的T細胞,人類肝癌細胞系,外周血單個核細胞等都不同程度對HCV敏感。根據(jù)研究目的不同,可選擇不同的靶細胞。
通過研究表明篩選合適的HCV陽性血清樣品,并選擇敏感的細胞株作為感染靶細胞,可以建立HCV體外細胞感染模型,在培養(yǎng)上清中能夠持續(xù)檢測到HCV RNA正鏈的表達,并可間斷檢測到HCV負(fù)鏈RNA。這可作為綜合評價感染細胞模型的指標(biāo),也可能被用于抗HCV藥物及疫苗研究的評價。近幾年,由于感染模型更加貼近于自然感染,已有不少學(xué)者成功建立了自然感染模型,但仍需要進一步優(yōu)化,這將成為未來研究發(fā)展的主要方向。
亞基因組復(fù)制系統(tǒng)在丙型肝炎病毒靶向的DAAs的發(fā)展中起著重大作用[20]。(1)它是第一個可用的HCV細胞培養(yǎng)系統(tǒng),1999年,當(dāng)復(fù)制模式第一次被報道后,HCV的2個關(guān)鍵酶被編碼出,NS3蛋白酶和NS5B RdRp,這兩種酶能充分顯示和高度篩選已確定的候選抑制劑的靶向目標(biāo)。(2)該復(fù)制子概括了細胞內(nèi)病毒復(fù)制循環(huán)的步驟。(3)亞基因組復(fù)制子包含所有抗病毒治療的主要目標(biāo),也就是,NS3蛋白酶和NS5B RdRp[21],提供了一個基于細胞的合適的篩選平臺。(4)高通量篩查復(fù)制子細胞中新的和未知的目標(biāo),最顯著的是NS5A復(fù)制酶因子[22]和宿主細胞編碼的親環(huán)A[23-24]。(5)第一個復(fù)制子是基于基因型1分離出的,對于以干擾素為基礎(chǔ)療法的研究,這是最普遍和艱難的。(6)亞基因組復(fù)制子不支持病毒生產(chǎn),因此可以在一個沒有特殊的生物安全防護的標(biāo)準(zhǔn)細胞培養(yǎng)實驗室使用。(7)亞基因組復(fù)制子可適應(yīng)多重篩選格式。例如,含有穩(wěn)定選擇性復(fù)制子的細胞系能夠表達螢光素酶報道基因,非常適用于細胞化合物的高通量篩選。用于抗病毒藥物研發(fā)的雙重選擇性穩(wěn)定復(fù)制子細胞可以提供一種極好的工具,以產(chǎn)生耐藥變異體,因為這種方法通常產(chǎn)生的克隆細胞群,能夠使其中的抗性突變保守的保留在病毒基因組中。這種方法是必不可少的屏障,以表征某些化合物的阻力,并確定了之后觀察到的被治療患者的主要耐藥變異[25-26]??傊搹?fù)制系統(tǒng)一個不可缺少的工具,不僅為DAAs的發(fā)展和篩選抗病毒藥物,還是對這些藥物病毒抗性的表征。
但該復(fù)制系統(tǒng)也具有幾個明顯的缺點:(1)選擇性復(fù)制子中異源IRES的存在是一個在進行藥物篩選時可能的缺陷。(2)在細胞增殖過程中要細心的培養(yǎng),因為在基于Huh-7系的復(fù)制子細胞中的HCV復(fù)制非常依賴于宿主細胞的生長。(3)復(fù)制增強的突變可能會影響藥物靶點的特性。(4)不能排除結(jié)構(gòu)蛋白對給定化合物抗病毒活性的影響。然而,利用基因組復(fù)制子,這可以被檢測出。(5)缺乏病毒的生產(chǎn),因而排除了使用該復(fù)制系統(tǒng)來篩選影響早期和晚期的病毒復(fù)制周期步驟的抑制劑(病毒進入和裝配/釋放)。
限制了HCVcc的模型在HCV藥物研發(fā)中的使用有幾個原因:(1)基因型2a對于藥物的研發(fā)是不理想的,因為已經(jīng)被認(rèn)可的干擾素/利巴韋林治療用在這種基因型上,有很高的應(yīng)答率。許多的DAAs只對某些基因型產(chǎn)生作用,特別是非核苷NS5B抑制劑和第一代蛋白酶抑制劑[39]。事實上,有許多對基因型1b高效的DAAs(第一代),原因可能是基因型1b復(fù)制子是最初唯一可用的。(2)與亞基因組復(fù)制子相比,感染病毒的工作需要更高的生物安全水平。然而,最近建立的具有復(fù)制能力的病毒株和HCVcc模型,覆蓋了更廣泛的HCV變異體,可能為未來研發(fā)針對每個HCV基因型的最佳組合療法有著重要的作用。
丙型肝炎患病率的持續(xù)增長,已經(jīng)成為全球迫切需要解決的公共衛(wèi)生問題。目前關(guān)于丙型肝炎研究大部分以HCV細胞模型為基礎(chǔ)。HCV體外細胞培養(yǎng)系統(tǒng),不僅是DAAs發(fā)展必不可少的先決條件,也推動了基礎(chǔ)研究。HCV體外自然感染模型需進一步研究改善。
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10.3969/j.issn.1009-5519.2015.03.026
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2014-11-19)
馬濤(1989-),女,湖南常德人,碩士研究生,主要從事慢性肝病的防治工作;E-mail:308502676@qq.com。
蔣孝華(E-mail:matao5047@163.com)。