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    應(yīng)用聚類分析和主成分分析法評價洋蔥新品種

    2014-12-25 12:21:46朱新明常國軍趙海霞
    甘肅農(nóng)業(yè)科技 2014年10期
    關(guān)鍵詞:皮色單球鱗莖

    朱新明,常國軍,何 丹,趙海霞,馬 超

    (甘肅省酒泉市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,甘肅 酒泉 735000)

    酒泉市是全國重要的洋蔥產(chǎn)區(qū)[1],種植面積近13 333.33 hm2。近年,各種子企業(yè)引進了大量的品種,給農(nóng)民選擇品種帶來困難。2013年,酒泉市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院對酒泉市引進的27個洋蔥品種應(yīng)用系統(tǒng)聚類分析和主成分分析結(jié)合的方法進行了綜合評價,現(xiàn)將結(jié)果報道如下。

    1 材料與方法

    1.1 供試材料

    參試品種(系)27個,為新紅早豐、卡麗布、莊園1號、保羅、黃皮02、紅運紫星、歡呼6064、卡欽、紅盾801、紫鈺、紅天、新紅福、千里馬、新豐田黃金、新豐田紅珠、新豐田黃貴人、新豐田黃玉、新豐田黃寶、阿波羅2號、1002、NO102、 ON20141R、 ON20142R、 ON20143R、ON20144Y、ON20145Y、ON20146W,均由酒泉市洋蔥經(jīng)銷商提供。

    圖1 27個品種(系)歐氏距離聚類

    1.2 試驗方法

    試驗采用隨機區(qū)組排列,3次重復(fù),小區(qū)面積4.0 m2(2.5 m×1.6 m),每小區(qū)9行,行距15 cm,株距16 cm,小區(qū)間距25 cm,重復(fù)間間距50 cm,折合35.16萬株/hm2。試驗覆黑色地膜育苗移栽。管理同當(dāng)?shù)卮筇?,小區(qū)收獲計產(chǎn)。

    對品種的葉片形態(tài)、葉色、生長天數(shù)、鱗莖縱徑、橫徑、球形、皮色、亮度、著色皮層數(shù)、鱗莖皮脫落度、硬度、收口、單球重、干皮厚度、產(chǎn)量15個變量的觀測值進行系統(tǒng)聚類分析和主成分分析[2],聚類分析按歐氏距離進行聚類。聚類分析和主成分分析用統(tǒng)計分析軟件IBMSPSS19.0的分類和降維兩個分析模塊[3]。在聚類分析和主成分分析的基礎(chǔ),對品種的特征特性進行綜合評定。

    2 結(jié)果與分析

    1.2 聚類分析

    從圖1分析,歸入同一類的品種特征特性相似性較高,彼此的遺傳距離較小,具有相近的鱗莖皮色、生育期、品質(zhì)及產(chǎn)量,而不同類群之間的品種特征特性具有較大的差異。根據(jù)洋蔥品種特征特性,將類群間區(qū)分的歐氏距離定為10,分為5類,符合洋蔥品種類群區(qū)分習(xí)慣,能較好的反映洋蔥品種不同類群的特征特性。洋蔥品種在酒泉通常按鱗莖皮色分為銅蔥(俗稱黃蔥)、紅蔥和白蔥品種。按生育期分為早熟、中晚熟、晚熟品種。分類結(jié)果見表1。

    從表1看出,第1類共有15個品種(系),鱗莖皮色為銅色和深銅色,生育期112~124 d,屬于晚熟品種,單球重平均281.74 g;第2類1個品種,鱗莖皮色為白色,生育期114 d,屬于晚熟品種,單球重275.7 g;第3類共9個品種(系),鱗莖皮色為紅色或深紅色,生育期104~117 d,屬于中晚熟品種,單球重平均202.40 g;第4類和第5類品種各1個,鱗莖皮色為深紅色和淺紅色,生育期為94 d和84 d,屬于早熟品種,單球重分別為 250.7、199.3 g。

    1.3 主成分分析

    主成分分析因子方差提取見表2。提取的公因子方差從表2的結(jié)果可知,15個變量的共性方差除收口為0.476外,其余均大于0.5,故提取的公因子能夠很好地反映原始變量的主要信息。

    如果主成分分析中所提取的多個主成分的特征值貢獻率能達到70%以上,就可以用這幾個主成分對事物的屬性進行概括性分析,基本可以得出影響事物性質(zhì)的主要因素[4]。從表3看出,提取前4個主成分累計貢獻率已達76.849%,可以概括不同洋蔥品種主要特征特性的15個性狀的絕大部分信息。

    表1 各類群內(nèi)品種與表現(xiàn)

    表2 公因子方差

    表3 27個洋蔥品種(系)主成分相關(guān)矩陣的特征值

    表4為因子得分系數(shù)矩陣,由此可得最終因子得分公式:

    Z x1、Z x2、Z x3……Z x15為葉態(tài) x1、葉色 x2、生長天數(shù)x3……產(chǎn)量x15經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)化處理的值,數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化是指Z標(biāo)準(zhǔn)化。

    第1主成分產(chǎn)量、單球重、硬度系數(shù)較大,其次是干皮厚度、皮脫落度、縱徑、橫徑的系數(shù)較大,可歸納為產(chǎn)量因子;第2主成分生育期系數(shù)較大,為生育期因子;第3主成分縱徑、收口、橫徑較大、為球型形態(tài)因子;第4主成分球型系數(shù)較大,為商品率因子。

    表4 27個洋蔥品種(系)主要性狀的主成分相關(guān)矩陣成分矩陣

    表5 因子得分矩陣

    1.4 綜合得分評價

    對27個品種(系)進行綜合評價,對4個公因子F1、F2、F3、F4得分進行加權(quán)求和,權(quán)數(shù)取方差貢獻值。

    綜合得分=48.477F1+12.927F2+8.164F3+7.311F4

    綜合得分結(jié)果按聚類分析的5個類群分別進行排序,結(jié)果見表5。從表5看出,在第1類皮色為銅色的15個晚熟品種組中,綜合得分高的品種(系)有千里馬、ON20145Y、新豐田黃貴人、卡欽、保羅;第3類皮色為紅色或深紅色的9個中晚熟紅蔥品種組中,得分較高的為ON20143R、1002、莊園1號和新紅福;第2、4、5類各只有1個品種,不做排序。第4、5類的兩個品種雖然各獨立成為1類,但外在表現(xiàn)和生育期基本接近,屬早熟紅蔥品種。其中新豐田紅珠得分較高。以上綜合得分評定結(jié)果與品種在田間的表現(xiàn)吻合。

    3 小結(jié)與討論

    1)對27個洋蔥新品種(系)的葉片形態(tài)、葉色、生育期、產(chǎn)量等15個因子進行聚類分析,按鱗莖顏色、產(chǎn)量、品質(zhì)綜合分為5類。在此基礎(chǔ)上,對27個品種的15個因子變量觀測值進行主成分分析,前4個公因子對所考察性狀變異的累計方差貢獻率達76.849%,較好的反映了所有性狀大部分信息。

    2) 根據(jù)各品種(系)在各公因子上的得分值,對27個品種(系)綜合評價,綜合得分按聚類分析結(jié)果分類排序。皮色為銅色的5個晚熟品種(千里馬、ON20145Y、新豐田黃貴人、卡欽、保羅)、4個中晚熟紅蔥品種(ON20143R、1002、莊園1號和新紅福)、早熟紅蔥品種新豐田紅珠以及晚熟白蔥品種ON20146W綜合得分較高,可作為進一步示范推廣的品種。

    [1] 蒲興秀,馬令卉.酒泉市洋蔥生產(chǎn)現(xiàn)狀與發(fā)展對策[J]. 甘肅農(nóng)業(yè)科技,2004(11):32-34.

    [2] 唐守正.多元統(tǒng)計分析方法[M].北京:中國林業(yè)出版社,1984:20;61.

    [3] 杜 強,賈麗艷.SPSS統(tǒng)計分析從入門到精通[M].北京:人民郵電出版社,2013:248;260.

    [4] 辛秀琚,于鳳瑤,周順啟,等.黑龍江省近期審定大豆品種的聚類分析和主成分分析[J].浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報,2010(4):806-810.

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