趙玉苗,孫文聰,張景亮,王麗雯,劉 華,程曉麗#
1)鄭州大學基礎(chǔ)醫(yī)學院細胞生物學與醫(yī)學遺傳學教研室 鄭州 450001 2)鄭州大學臨床醫(yī)學系 鄭州 450052 3)鄭州華信學院護理系基礎(chǔ)教研室 鄭州 451150 4)鄭州大學第三附屬醫(yī)院生殖醫(yī)學中心 450052
兩個漢族少汗型外胚層發(fā)育不良家系患者EDA基因突變檢測*
趙玉苗1,2),孫文聰1,2),張景亮1,3),王麗雯1,4),劉 華1),程曉麗1)#
1)鄭州大學基礎(chǔ)醫(yī)學院細胞生物學與醫(yī)學遺傳學教研室 鄭州 450001 2)鄭州大學臨床醫(yī)學系 鄭州 450052 3)鄭州華信學院護理系基礎(chǔ)教研室 鄭州 451150 4)鄭州大學第三附屬醫(yī)院生殖醫(yī)學中心 450052
#通訊作者,女,1963年4月生,副教授,研究方向:遺傳病的分子機制與診斷,E-mail:chengxiaoli@zzu.edu.cn
少汗型外胚層發(fā)育不良;EDA基因;突變
目的:檢測兩個漢族少汗型外胚層發(fā)育不良家系患者少汗型外胚層發(fā)育不良基因(EDA)1、3、5、8、9外顯子的突變情況。方法從兩個家系共16名成員中抽取7名成員,A家系4名、B家系3名。提取7人外周血全基因組的DNA,采用聚合酶鏈反應擴增目的基因后直接進行DNA序列測定,使用BLAST軟件對測序結(jié)果進行比對分析,檢測突變。結(jié)果3、5、8外顯子上存在G740A、G904A和A1165G點突變,1、8、9外顯子上出現(xiàn)5種移碼突變;家系A(chǔ)和家系B均有患者發(fā)生33delC移碼突變和G904A點突變,且這兩種突變在兩個家系上下代之間傳遞。結(jié)論少汗型外胚層發(fā)育不良的突變基因有很大異質(zhì)性。33delC、G904A突變可能與少汗型外胚層發(fā)育不良的發(fā)生有關(guān),33delC和G904A突變對兩家系再發(fā)風險的預測具有一定的臨床意義。
X連鎖隱性遺傳型少汗型外胚層發(fā)育不良(hypohidrotic ectodermal dysplasia,HED)又被稱為1型外胚層發(fā)育不良或Christ-Siemens-Touraine綜合征,是一種以汗腺、毛發(fā)、牙齒等外胚層組織發(fā)育不全或形態(tài)缺陷及免疫力低下為主要特征的罕見先天性遺傳病,符合在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(OMIM:#305100)中X連鎖HED的典型臨床表現(xiàn)。新生兒發(fā)病率約為1:1 000 000[1],其基因(ectodysplasin A,EDA)定位于Xq12-13.1,有9個外顯子,編碼391個氨基酸。已公布的與發(fā)病相關(guān)的各種EDA基因突變種類逾100種[2]。EDA基因存在較大的異質(zhì)性和種族差異[3]。據(jù)Canueto等[2-5]報道,95%的突變都發(fā)生在1、3、5、8、9外顯子。該研究中作者檢測了兩個漢族HED家系患者及親屬EDA基因在1、3、5、8、9外顯子的突變類型,以期豐富EDA基因分子數(shù)據(jù)庫,為開展HED胎兒產(chǎn)前診斷及新生兒病早期臨床分子診斷等服務。
1.1研究對象HED家系A(chǔ)和家系B均為漢族,來自河北邯鄲相鄰的農(nóng)村。兩家系系譜圖見圖1(箭頭標注者為先證者),患者均為男性。兩先證者(鄭州大學第一附屬醫(yī)院皮膚科門診患者)臨床癥狀相似,先天性數(shù)顆牙齒缺失、毛發(fā)稀少、皮膚干燥,左前臂腹側(cè)行毛果蕓香堿發(fā)汗試驗未見藍色斑點(發(fā)汗試驗陰性),皮膚組織病理檢測示汗腺密度明顯下降、皮脂腺極少,智力發(fā)育正常。其他患者與兩先證者臨床癥狀相似。所有患者符合在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(OMIM:#305100)中X連鎖HED的典型臨床表現(xiàn)。經(jīng)知情同意后,采集到家系A(chǔ)中Ⅱ2、Ⅱ3、Ⅲ3、Ⅲ4,家系B中Ⅰ2、Ⅱ1和Ⅱ2外周靜脈血各5 mL,EDTA抗凝。采用以往研究中保留的健康個體血樣DNA作對照。
1.2DNA提取經(jīng)典酚/氯仿法[4]提取DNA,滅菌雙蒸水稀釋,置于-20 ℃冰箱中保存。
1.3PCR擴增引物設(shè)計參考文獻[3],由上海生工生物工程股份有限公司合成。各外顯子退火溫度、擴增片段長度見表1。PCR總反應體系20 μL:100 ng DNA,10 μL 2×Taq MasterMix,1 μL上、下游引物(500 nmol/L),8 μL ddH2O。PCR循環(huán)參數(shù)[3]:95 ℃預變性5 min;95 ℃變性30 s,退火45 s,72 ℃延伸45 s,共45個循環(huán);最后72 ℃延伸8 min。產(chǎn)物用15 g/L的瓊脂糖凝膠電泳,電泳時間0.5~1.0 h,電壓100 V,紫外線成像儀檢測結(jié)果,照相記錄。
1.4測序與數(shù)據(jù)分析將擴增產(chǎn)物送北京百泰克生物技術(shù)有限公司測序,用Chromas軟件讀取測序結(jié)果,Clustal X 軟件進行多重序列比對。應用美國國立生物技術(shù)信息中心的BLAST軟件與Gene數(shù)據(jù)庫公布的人類EDA基因核苷酸序列(Gene ID 1 896)進行比對分析。
圖1 A、B兩HED家系系譜圖
表1 EDA基因各外顯子引物
2.1PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果EDA基因外顯子1、3、5、8、9 PCR擴增產(chǎn)物見圖2。
圖2 外顯子1、3、5、8、9的擴增結(jié)果
M:Maker;1:外顯子9;2:外顯子5;3、5:外顯子3;4:外顯子8;6:外顯子1;7:對照。
2.2基因突變檢測結(jié)果患者和家系其他成員的外顯子3、5、8上存在G740A、G904A和A1165G點突變;1、8、9外顯子上出現(xiàn)5種移碼突變(表2)。第5外顯子的904位堿基G→A與第9外顯子 1511 位堿基C插入見圖3(箭頭示突變位點),這兩個位點與Gene數(shù)據(jù)庫公布的人類EDA基因核苷酸序列(Gene ID 1 896)進行比對分析,結(jié)果見圖4、5。33delC和G904A突變在兩個家系上下代之間都存在。
表2 患者和家系其他成員各外顯子突變結(jié)果
*:新發(fā)突變;ins:插入突變;del:缺失突變。
圖3 外顯子5的904 位堿基G→A突變峰值圖(左)和外顯子的1511位堿基插入峰值圖(右)
圖4 外顯子5 部分核苷酸序列比對結(jié)果
Query:患者外顯子5部分序列;Sbjct:NCBI 正常人核苷酸標準序列(Gene ID 1 896);箭頭示外顯子5的904 位堿基G→A突變。
圖5 外顯子9 部分核苷酸序列比對結(jié)果
Query:患者外顯子9部分序列;Sbjct:NCBI 正常人核苷酸標準序列(Gene ID 1 896);箭頭示外顯子9的1511位插入1個堿基G。
EDA基因主要在外胚層中特定的與角質(zhì)、毛囊、汗腺等起源相關(guān)的細胞中表達,其編碼的蛋白含有391個氨基酸,為Ⅱ型三聚體單次跨膜蛋白,具有1個大的細胞外結(jié)構(gòu)域、1個單一跨膜結(jié)構(gòu)域和1個短小的細胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域,其胞外區(qū)含膠原結(jié)構(gòu)域(Gly-X-Y)19和腫瘤壞死因子結(jié)構(gòu)域。腫瘤壞死因子結(jié)構(gòu)域片段內(nèi)的突變將會影響EDA與受體的特異性結(jié)合,可導致正常外胚層上皮細胞信號通路中斷,對皮膚及其附屬物的正常發(fā)育產(chǎn)生嚴重影響[6-7]。
外顯子5的904位點G→A突變是兩家系患者均存在的突變;該位點位于EDA蛋白胞外區(qū)膠原結(jié)構(gòu)域,該突變導致密碼子由GGT變?yōu)镚AT,可使蛋白多肽鏈第302位甘氨酸變?yōu)樘於彼?。甘氨酸為水溶性氨基酸,天冬氨酸則為酸性。氨基酸性質(zhì)的轉(zhuǎn)變可能影響肽鏈胞外區(qū)電荷的性質(zhì),繼而影響EDA與受體的特異性結(jié)合、外胚層上皮細胞信號的傳遞等功能。推測該位點突變可能與外胚層發(fā)育有一定關(guān)系。
Hashiguchi等[8]對8個不相關(guān)的日本EDA家系外顯子1的研究發(fā)現(xiàn)存在31delC突變;該突變可引起框移和終止密碼子的提前出現(xiàn)。該研究結(jié)果顯示A、B兩家系患者EDA基因外顯子1上均存在33delC突變。1號外顯子33位點位于多肽鏈N端,屬于胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域,是EDA及其受體結(jié)合后激活核轉(zhuǎn)錄因子-κB信號通路的關(guān)鍵區(qū)域,該通路對細胞信息的轉(zhuǎn)錄調(diào)控起核心作用,在EDA蛋白的二級結(jié)構(gòu)中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。
值得注意的是兩個家系中表型正常的AⅡ2、AⅢ4和BⅠ2也被檢出存在外顯子1 33delC和外顯子5 G904A突變,可以推定患者AⅢ3的33delC和G904A突變來自表型正常的AⅡ2;BⅡ1、BⅡ2的33delC和G904A突變來自表型正常的BⅠ2,即這兩個突變在這兩個家系的上下代之間傳遞,這對臨床預測該病是否再發(fā)具有一定的診斷意義,特別是A家系中的Ⅲ1和Ⅲ4婚育時以及B家系中Ⅰ2再生育時有必要進行相關(guān)遺傳咨詢與分子水平的基因診斷。此外,A1165G、G740A、520delCTC、1163del GAAGTA、1425insC、1511insG等突變的出現(xiàn)提示誘發(fā)HED的突變基因有很大異質(zhì)性。異質(zhì)性的存在增添、加大了建立一個適合較大人群的HED分子診斷標準的難度,因此HED的相關(guān)分子生物學研究尚需深入進行。
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(2013-12-24收稿 責任編輯徐春燕)
Mutation detection of EDA gene in two Han pedigrees with hypohidrotic ectodermal dysplasia
ZHAOYumiao1,2),SUNWencong1,2),ZHANGJingliang1,3),WANGLiwen1,4),LIUHua1),CHENGXiaoli1)
1)DepartmentofCellBiologyandMedicalGenetics,CollegeofBasicMedicalSciences,ZhengzhouUniversity,Zhengzhou450001 2)DepartmentofClinicalMedicine,ZhengzhouUniversity,Zhengzhou450052
3)BasicTeachingandResearchingSection,DepartmentofNursing,ZhengzhouHuaxinUniversity,Zhengzhou451150 4)CenterforReproductiveMedicine,theThirdAffiliatedHospital,ZhengzhouUniversity,Zhengzhou450052
hypohidrotic ectodermal dysplasia;EDA gene;mutation
Aim:To detect mutations in ectodysplasin A(EDA) gene in two pedigrees with hypohidrotic ectodermal dysplasia(HED).Methods:Seven from 2 pedigrees(16 family members in total) were chosen,among which,4 were from pedigree A,and 3 were from pedigree B.The peripheral blood samples were collected and DNA was extracted.The fragments of exons 1,3,5,8,and 9 were amplified using PCR,the PCR products were sequenced and the results were analyzed by BLAST.Results:There were mutations of G740A,G904A and A1165G in exons 3,5,and 8,and 5 kinds of frameshift mutations in exons 1,8,and 9.33delC and G904A were found in pedigree A and pedigree B,and both mutations could be passed down between generations.Conclusion:33delC and G904A mutations may be associated with HED.33delC and G904A mutations may have some clinical significance in predicting the risk of recurrence of HED.
10.13705/j.issn.1671-6825.2014.05.029
*鄭州大學大學生創(chuàng)新實驗項目資助課題 2009CXSY002
R715.5