何 升,李東明,賴允麗,張 強(qiáng),闕 婷,唐燕青
南寧市2685例貧血患兒α-地中海貧血基因診斷分析
何 升,李東明,賴允麗,張 強(qiáng),闕 婷,唐燕青
目的 了解南寧地區(qū)貧血患兒α-地中海貧血(地貧)發(fā)生情況、基因類型及頻率。方法 采用單管多重PCR體系擴(kuò)增結(jié)合瓊脂糖凝膠電泳和反向點(diǎn)雜交技術(shù),對(duì)診斷為貧血的患兒2685例進(jìn)行常見α-地貧基因檢測(cè),對(duì)HbA2和HbF升高者再進(jìn)行β-地貧基因檢測(cè)。結(jié)果 2685例患兒中,檢出α-地貧1243例(46.29%),22種基因類型,主要為--sea/αα(23.76%),其次為-α3.7/αα(4.69%),--sea/-α3.7(3.84%),--sea/αCSα(3.17%);包括6種等位基因1563個(gè),主要為--sea(56.62%),其次為-α3.7(15.74%)和αCSα(14.52%);α復(fù)合β地貧檢出率為5.18%。結(jié)論 南寧地區(qū)貧血患兒α-地貧基因突變率、中間型α-地貧及復(fù)合β地貧發(fā)生率均較高,應(yīng)在該類患兒中進(jìn)行基因診斷,為該類患者的病因診斷和治療提供依據(jù)。
南寧;地中海貧血;基因診斷;兒童;類型
地中海貧血(thalassemia,簡(jiǎn)稱地貧)是廣西地區(qū)最常見的血液學(xué)遺傳疾病。育齡人群中α-地貧發(fā)生率為13.78%~17.46%[1],新生兒中發(fā)生率約為7.8%[2],貧血患兒中發(fā)生率更是高達(dá)20.11%[3]。為了解本地區(qū)貧血患兒中α-地貧發(fā)生情況及其基因分布,本研究對(duì)2006年1月~2012年8月在我院就診,經(jīng)血液學(xué)分析、生化檢查確診為貧血的患兒2685例進(jìn)行α-地貧基因診斷,現(xiàn)報(bào)告如下。
1.1 研究對(duì)象 2006年1月~2012年7月在本院門診進(jìn)行健康體檢、遺傳咨詢及住院患兒2685例,經(jīng)血液學(xué)、生化檢查診斷為貧血,其中男1698例,女987例,年齡3 d~14歲。
1.2 方法 空腹取肘靜脈血2 ml置于EDTA-K2抗凝血管中,采用Lab-Aid 820核酸提取儀(廈門致善生物公司)提取全血DNA,利用iCycler PCR儀(美國(guó)Biorad公司)對(duì)東南亞缺失型α-地貧1雜合子(--sea)、α-地貧2雜合子(-α3.7,-α4.2)缺失型或Hb CS(CD142TAA→CAA)、QS(125CTG→CCG)及WS(CD122CAA→CAG))進(jìn)行擴(kuò)增,3種缺失型α-地貧擴(kuò)增產(chǎn)物在DY-2C電泳儀(北京六一儀器廠)經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳,經(jīng)Gel Doc XR凝膠成像分析儀(美國(guó)Biorad公司)進(jìn)行分析;3種突變型α-地貧,經(jīng)100 ℃煮沸變性后,在SHA-B水浴恒溫振蕩器(金壇金南儀器制造公司產(chǎn)品)45 ℃水浴雜交,肉眼讀取結(jié)果。對(duì)HbA2>3.5%和HbF>4.0%者,再進(jìn)行β-珠蛋白基因17種突變:CD41-42(-TCTT)、IVS-2-654(C→T)、CD17(A→T)、-28(A→ G)、CD26(G→A)、CD71-72(+A)、 CD43(G→ T)、-29(A→G)、起始密碼子ATG→AGG、CD14-15(+G)、CD27-28(+C)、-32(C→A)、-30(T→C)、IVS-1-1(G→T)、IVS-1-5(G→C)、CD31(-C)、CAP+40-+43(-AAAC)檢測(cè),試劑盒購(gòu)于深圳益生堂生物公司,按試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行操作、質(zhì)量控制及結(jié)果判斷;對(duì)部分可疑罕見地貧者,送深圳益生堂生物公司進(jìn)行基因序列分析。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,組間率的比較采用χ2檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 α-地貧基因檢出情況 2685例中,檢出α-地貧1243例,檢出率為46.29%。其中Hb H病247例,α-地貧1雜合子638例,α-地貧2雜合子、純合子和雙重雜合子分別為330例、10例和18例。共有22種基因型(表1)。另檢出α-復(fù)合β地貧139例。男女性患兒中檢出率分別為45.76%(466/987)和47.21%(777/1698),兩者比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.5308,P>0.05)。
表1 α-地貧基因類型與突變發(fā)生率
2.2 α-地貧基因突變類型及其分布 1243例α-地貧中,共檢出1563個(gè)含有6種常見類型α-地貧的等位基因,其攜帶率、頻率和分布情況見表2。缺失型α-地貧占79.85%(1248/1563),突變型α-地貧占20.15%(315/1563),其中除αCSα突變型α-地貧構(gòu)成比略低于-α3.7、高于-α4.2外(χ2=39.5238,P<0.01)外,其余兩種等位基因構(gòu)成比均明顯低于缺失型(χ2=312.1245,χ2=38.0215,P<0.01)。
表2 α-地貧基因攜帶率、等位基因突變頻率和構(gòu)成比
2.3 α復(fù)合β-地貧檢出情況 1243例α-地貧患者中,同時(shí)檢出β-地貧139例,α復(fù)合β-地貧檢出率為5.18%。其中以α復(fù)合β41-42/βA最高為1.75%,其次β17/βA為1.01%,α復(fù)合重型和中間型β地貧率為1.01%(表3)。
流行病學(xué)資料顯示,α-地貧廣泛分布于地中海沿岸、東南亞及我國(guó)南方地區(qū),其發(fā)生率、基因突變類型和頻率存在明顯的種族、地域及人群差異。本研究對(duì)2685例貧血患兒進(jìn)行α-地貧基因檢測(cè),共檢出α-地貧1243例,檢出率為46.29%明顯高于本地區(qū)新生兒的9.86%[2],育齡人群的13.781%~17.46%[1],表明本地區(qū)地貧是導(dǎo)致兒童貧血的主要原因之一[4]。
表3 α復(fù)合 β地貧基因類型
注:a:包括α-地貧1雜合子,α-地貧-2純合子和雙重雜合子;b:包括α-地貧2雜合子;c:包括α-地貧1雜合子復(fù)合α-地貧2雜合子
在α-地貧攜帶者或患兒中共檢出基因型23種,以缺失型雜合子為主,占67.10%,其中東南亞缺失型占51.33%,-α3.7和-α4.2缺失型分別占10.14%和5.63%,與國(guó)內(nèi)人群中構(gòu)成比相似[5-6]。Hb H病患者可表現(xiàn)為輕到重度貧血、黃疸及肝脾腫大等,尤其是少數(shù)Hb H-CS或QS病有較重的貧血似[7]。本研究中突變型α-地貧-2雜合子檢出率為10.78%,其中Hb-CS檢出率為2.72%,Hb H-CS檢出率高達(dá)3.17%,占Hb H病的34.41%(85/247),僅低于-α3.7缺失型Hb H病的3.84%,且多表現(xiàn)為中到重度貧血。表明應(yīng)加強(qiáng)的Hb-CS檢測(cè),這不但可作為該類Hb H病患兒貧血診斷與治療依據(jù),也可為其流行病學(xué)調(diào)查或干預(yù)提供資料。同時(shí),還檢出α-地貧-2純合子和雙重雜合子28例,檢出率1.04%。
本研究中共檢出6種常見類型α-地貧的等位基因1563個(gè),未發(fā)現(xiàn)其他罕見類型的等位基因;仍以缺失型為主,占79.85%(1248/1563),突變型占20.15%(315/1563),與國(guó)內(nèi)報(bào)道相似[3,5]。值得注意的是,雖缺失型基因構(gòu)成比均高于αWSα和αQSα突變基因(P>0.01),αCSα突變型基因的構(gòu)成比僅明顯地低于東南亞缺失型,與-α3.7缺失型相近(P>0.05),明顯高于-α4.2缺失型(P<0.01),這與玉林地區(qū)報(bào)道[5]存在一定的差異。導(dǎo)致這種差異可能與本地區(qū)人群中αCSα基因發(fā)生率較高有關(guān),同時(shí)也表明在該地區(qū)進(jìn)行該基因檢測(cè)是非常有必要的。
廣西地區(qū)β-地貧亦有較高的發(fā)生率,人群中同時(shí)有α-地貧復(fù)合β-地貧的亦不少。研究表明[6],α復(fù)合β-地貧患者血液學(xué)表現(xiàn)為β-地貧特點(diǎn),因此,對(duì)HbA2和HbF升高者或已確診的β-地貧者應(yīng)進(jìn)行α-地貧基因檢測(cè),以檢出α復(fù)合β-地貧。本研究在2685例患兒中,對(duì)HbA2和HbF升高者同時(shí)進(jìn)行α和β-地貧基因檢測(cè),共檢出β-地貧139例,檢出率為5.18%。其中以β41-42和β17雜合子檢出率最高,分別為1.75%和1.01%。α復(fù)合重型和中間型β-地貧率為1.01%,其中α-地貧-2復(fù)合重型和中間型β-地貧占64%;另檢出中間型α-地貧復(fù)合β-地貧6例,這與該地區(qū)人群中α復(fù)合β-地貧的發(fā)生率較高有關(guān),提示對(duì)夫婦均為復(fù)合型地貧者進(jìn)行雙重產(chǎn)前診斷尤為重要[8]。
廣西地區(qū)貧血患者中α-地貧及其復(fù)合β-地貧的發(fā)生率均較高,應(yīng)加強(qiáng)新生兒地貧篩查,以做到早篩查、早診斷。同時(shí),應(yīng)加強(qiáng)育齡人群地貧篩查與診斷,掌握流行病學(xué)資料,進(jìn)一步建立并完善高危人群跟蹤體系,對(duì)高危夫婦進(jìn)行產(chǎn)前診斷,才能有效避免中間型及重型地貧患兒的出生,這是降低出生缺陷的有效措施。
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Genetic diagnosis of α-thalassemia in 2685 children with anemia from Nanning City
He Sheng,Li Dongming,Lai Yunli,Zhang Qiang,Que Ting,Tang Yanqing
Central Laboratory of Genetic Metabolism,Maternal and Child Health Hospital of Guangxi Chuang Autonomous Region,Nanning,Guangxi,530003,China
Objective To investigate the incidence,genotypes,and frequency of α-thalassemia(thal)in children with anemia in Nanning area.Methods The amplification by polymerase chain reaction system combined with agarose electrophoresis and reverse dot blot hybridization technology were used to detect the α-thal genes in 2685 children diagnosed as anemia from Nanning City.At the same time,those with the increase of HbA2 and HbF levels
the detection of β-thal gene.Results Among the 2685 cases,α-thal was detected in 1243 ones(46.29%).There were 22 different genotypes which mainly were --sea/αα(23.76%),and the next were -α3.7/αα(4.69%),--sea/-α3.7(3.84%),and --sea/αCSα(3.17%).There were 1563 alleles of six kinds which mainly were --sea(56.62%)followed by -α3.7(15.74%),and αCSα(14.52%).The detection rate of α-composited-β-thal was 5.18%.Conclusion The gene mutation rate and the incidence of α-thal,intermediate type of α-thal,and composited β-thal are very high in children with anemia from Nanning City.Genetic diagnosis should be carried out among those children patients in order to provide basis for the etiological diagnosis and treatment.
Nanning;thalassemia;genetic diagnosis;child;type
530003 南寧,廣西壯族自治區(qū)婦幼保健院遺傳代謝中心實(shí)驗(yàn)室
何 升,電話:18648914684;E-mail:18648914684@126.com
R 556.71
A
1004-0188(2014)01-0036-03
10.3969/j.issn.1004-0188.2014.01.014
2013-01-17)