閆華文,陳 璐,姚淑敏*
(曲阜師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山東 曲阜 273165)
酒釀(sweet ferment rice)為江、浙、滬一帶的“白糟”,可習(xí)慣上稱為“香糟”,其味甘、性溫,可益氣、生津、活血、散結(jié)、消腫[1]。酒釀富含碳水化合物、蛋白質(zhì)、B族維生素、礦物質(zhì)等人體必需的營養(yǎng)成分[2],具有健身、暖胃、維持腸道菌種平衡、美容等功效。其中B族維生素有促進(jìn)乳汁分泌的作用,而少量的酒精具有促進(jìn)血液循環(huán),有助消化及增進(jìn)食欲的功能[3]。酒釀種類繁多,其制作過程大致相同,都需要添加一種發(fā)酵劑,即酒曲。
近年來,隨著人們對酒釀的認(rèn)識的提高,在不同的地區(qū)都有了酒釀的制作,并且各大商場都有銷售,即酒釀的制作有工業(yè)化的趨勢。但因傳統(tǒng)制酒釀條件簡單,受環(huán)境影響很大,不同地區(qū)制得的酒釀營養(yǎng)成分、微生物的組成也有所不同,這樣無法保證酒釀品質(zhì)的穩(wěn)定性,也無法保證酒釀中有效微生物的組成和數(shù)量,甚至可能含有害微生物[4],從而導(dǎo)致酒釀制造過程的不可控性和質(zhì)量的不穩(wěn)定性。酵母菌包括釀酒酵母和非釀酒酵母[5],是酒釀中主要的功能微生物之一。酒釀中酵母菌組成的研究,對提高酒釀的質(zhì)量及進(jìn)一步弄清其對酒釀品質(zhì)的影響有重要意義。
酵母菌的常規(guī)鑒定主要依賴于形態(tài)和生理生化特征等表型特征,然而這些表型特征會隨著環(huán)境的變化有所改變,從而造成菌株鑒定結(jié)果的不穩(wěn)定。隨著DNA分析技術(shù)的日漸成熟,利用rDNA鑒定菌種已經(jīng)廣泛被應(yīng)用[6-8],特別是模式菌株的18S rDNA、26S rDNA的D1/D2區(qū)域很多已經(jīng)被公布于GenBank/EMBL等國際核酸序列庫,這使酵母菌的分類鑒定更加快捷和準(zhǔn)確。26S rDNA的D1/D2區(qū)域位于大亞基的5′端,序列長度在600bp左右,擴(kuò)增常用通用引物NL1:5′-GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-3′和NL4:5′-GGTCCGTGTTTCAAGACGGG-3′。GUTEL LR R等[9]研究表明這段區(qū)域具有較高的變異率,可以用于親緣關(guān)系較近的菌株之間的分類研究。對大量子囊菌酵母模式菌種的26S rDNA的D1/D2的序列分析發(fā)現(xiàn),同種內(nèi)不同菌株D1/D2區(qū)核苷酸替換率一般不超過1%,而不同種菌株其核苷酸替換率一般較大,因此可以作為酵母菌種級水平鑒定指標(biāo)。本實驗利用26S rDNA序列對所分離的酵母菌進(jìn)行鑒定并結(jié)合生理生化特征探討了酒釀中酵母菌的多樣性,為酒釀的深加工提供理論依據(jù)。
1.1.1 酒曲
酒曲:湖南韶山、湘潭、祁東民間酒曲。
1.1.2 培養(yǎng)基[10]
酵母浸出粉胨葡萄糖(yeast extract peptone dextrose,YPD)固體培養(yǎng)基:葡萄糖1%,酵母粉0.5%,蛋白胨1%,瓊脂2%,用于分離酵母菌。
溶菌肉湯(lysogeny broth,LB)培養(yǎng)基:酵母粉0.5%,蛋白胨1%,NaCl 1%,用于分子生物學(xué)鑒定。
碳基礎(chǔ)培養(yǎng)基:葡萄糖2%,KH2PO40.1%,MgSO4·7H2O 0.05%,酵母粉0.02%,(NH4)2SO40.5%,KNO30.78%,分裝5mL/管。
氮基礎(chǔ)培養(yǎng)基:(NH4)2SO40.5%,NaCl0.01%,MgSO4·7H2O 0.05%,KH2PO40.1%,CaCl2·2H2O 0.01%,酵母粉0.02%,碳源(葡萄糖、蔗糖、麥芽糖、乳糖、棉籽糖)0.5%,分裝5mL/管。
醇類同化培養(yǎng)基:酵母膏0.01%,MgSO4·7H2O 0.025%,KH2PO40.05%,(NH4)2SO40.25%,分裝5mL/管+2滴醇(山梨醇、乙醇、甘油、赤蘚醇)。
糖發(fā)酵培養(yǎng)基:蛋白胨1%,NaCl 0.5%,1.6%溴甲酚紫乙醇溶液1~2mL,pH7.6,分裝試管5mL/管+1mL糖(葡萄糖、乳糖、半乳糖、麥芽糖、蜜二糖、棉籽糖)+杜氏管。
1.1.3 其他
大腸桿菌DH5α:實驗室保存;氨芐青霉素,TaqDNA聚合酶,Dntp,10×buffer,2 000bp Marker,引物(NL1和NL4):生工生物工程(上海)股份有限公司。
HNY-1102C 恒溫培養(yǎng)振蕩器:天津市歐諾儀器儀表有限公司;DNP-9082型電熱恒溫培養(yǎng)箱:上海精宏實驗設(shè)備有限公司;LDZX-50KBS 立式壓力蒸汽滅菌器:上海申安醫(yī)療器械廠;A300型ArtGeneTM 基因擴(kuò)增儀:杭州朗基科學(xué)儀器有限公司;StarPrep 膠回收試劑盒:北京康潤誠業(yè)生物科技有限公司;DYY-6C 瓊脂糖水平電泳板:北京六一儀器廠;Tanon 2500 凝膠成像系統(tǒng):上海天能科技有限公司;SW-CJ-2F 潔凈工作臺:蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司。
1.3.1 酵母菌的分離純化
采取梯度稀釋的方法。取0.5g酒曲樣品,倒入裝有50mL滅菌蒸餾水的錐形瓶中,振蕩20~30min,制成10-1濃度的稀釋液。然后按10倍稀釋法進(jìn)行稀釋分離,即用移液槍取0.5mL 10-2濃度稀釋液加入到裝有4.5mL滅菌蒸餾水的小試管中,充分混勻,制得10-3稀釋液,采用同樣方法依次獲得10-3、10-4、10-5、10-6濃度的稀釋液。分別將上述6個濃度的稀釋液,用移液槍移取0.1mL于不同的YPD固體培養(yǎng)基上,用無菌涂布棒在超凈工作臺上將其涂布均勻,作標(biāo)記,30℃恒溫培養(yǎng),12d后觀察并記錄,每個濃度設(shè)置3個重復(fù)。
1.3.2 形態(tài)觀察
參照《酵母菌分類學(xué)鑒定標(biāo)準(zhǔn)方法》對供試菌株在形態(tài)上進(jìn)行觀察,進(jìn)行初步鑒定[11]。
1.3.3 生理生化分析
將分離得到的9株菌株分別接種到糖發(fā)酵培養(yǎng)基、氮源同化培養(yǎng)基、碳源同化培養(yǎng)基和醇類同化培養(yǎng)基中,觀察菌株的利用情況。
1.3.4 基因組總DNA的提取[12]
參照《基因工程實驗指導(dǎo)》上介紹的酵母菌基因組提取方法,對篩選的酵母菌進(jìn)行基因組的提取。
1.3.5 26S rDNA擴(kuò)增及測序
以制備的酵母菌基因組為模板,以26S rRNA的通用引物,進(jìn)行擴(kuò)增。
NL1(5′-GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-3′)為上游引物。
NL4(5′-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3′)為下游引物。
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物切膠回收,與pMD-18T載體連接,轉(zhuǎn)化入感受態(tài)大腸桿菌DH5α中,篩選陽性克隆,將具有陽性克隆的樣品送至上海生物工程公司測序完成。將測序結(jié)果登錄美國國立生物技術(shù)信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)網(wǎng)站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)用BLAST程序進(jìn)行序列比對。比對之后用MEGA5建立系統(tǒng)進(jìn)化樹。以便確定分離菌株的種屬。
經(jīng)過分離,從湖南酒曲中共分離出35株酵母菌菌株,通過形態(tài)觀察、生理生化分析和分子生物學(xué)鑒定,這35株酵母菌中有一些是序列相同的菌株,通過比對最終確定為9株菌株,分別為A、C、I、L、M、N、O、P、R。所分離的酵母菌的個體形態(tài)見圖1。
圖1 酵母菌個體形態(tài)Fig.1 Colonial individual form of yeast
經(jīng)過對這9株酵母菌進(jìn)行糖發(fā)酵、碳源同化、醇類同化、氮源同化的實驗,結(jié)果見表1。從表1可以看出,這9株酵母菌的對糖、醇、醛及氮源的利用結(jié)果有所不同,這說明不同酒曲發(fā)酵的甜酒釀的口感和成分也不同,因此發(fā)酵后的酒釀的風(fēng)味各有不同。后續(xù)工作將繼續(xù)研究不同的酒釀中的非酵母菌菌株的多樣性和酒釀中的蛋白質(zhì)、多糖、灰分、氨基酸、有機(jī)酸等的不同之處,從而為工業(yè)發(fā)酵提供理論依據(jù)。
表1 酵母菌的形態(tài)和生理生化特征Table 1 Morphological,physiological and biochemical characteristics of yeast
圖2 26S rDNA PCR結(jié)果Fig.2 PCR result of 26S rDNA
利用26S rDNA的通用引物通過PCR擴(kuò)增出600bp左右的條帶,結(jié)果見圖2,將PCR產(chǎn)物割膠回收,與pMD-18T載體連接,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α中,篩選陽性克隆,將具有陽性克隆的樣品送至上海生物工程公司測序,將所測的序列在NCBI上進(jìn)行Blast比對,結(jié)果顯示A與畢赤克魯酵 母LY9AB499014.1 相 似 性 達(dá) 到99%,M 和P 菌 株 與LY9AB499014.1菌株的相似性分別為98%和97%,菌株R與畢赤克魯酵母CEC RCS-0-9JX103190.1菌株相似性達(dá)99%。菌株O、I、C分別和釀酒酵母D3C JF715188.1、HA1835 AM262820.1、JN7N-19KC715802.1菌株相似度達(dá)到97%、98%、99%,而菌株N、L和釀酒酵母YJM789 JQ277730.1菌株相似度達(dá)到98%和99%,由此可見,從酒釀中分離的菌株多為釀酒酵母和畢赤酵母,利用MEGA5構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果見圖3。
對來自福建、江蘇、湖南、上海、浙江等地的酒釀做了初步的菌種鑒定,從結(jié)果可以看出,在福建酒曲、蘇州蜂蜜和安琪酒曲中的酵母菌主要是釀酒酵母和覆膜酵母[1],而在湖南酒曲中主要分離得到的酵母菌是釀酒酵母和畢赤酵母,由此可以了解在酒釀中其主要作用的是釀酒酵母,而非釀酒酵母在其中的作用有待進(jìn)一步的實驗驗證。從實驗中還分離得到一些霉菌,對這些菌株的驗證正在進(jìn)行中。接下來的工作重點將進(jìn)行酵母菌發(fā)酵的條件優(yōu)化,優(yōu)勢菌株的發(fā)酵機(jī)制以及酵母菌和其他非酵母菌之間發(fā)酵相關(guān)性的研究。
圖3 酵母菌的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.3 Phylogenetic tree of yeast
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