郝瑋瑋,宋銳鋒,曾引才,徐 峰
(鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院消化內(nèi)科 河南鄭州 450052)
DNA在遭受電離輻射、類輻射性藥物、化學(xué)損傷等刺激后會(huì)發(fā)生DNA雙鏈斷裂(Double-strand break,DSB),此時(shí) DNA損傷反應(yīng)(DNA damage response,DDR)調(diào)控激活一系列細(xì)胞周期檢查點(diǎn)、DNA修復(fù)網(wǎng)絡(luò)并促使凋亡反應(yīng)發(fā)生,以確保精確修復(fù)損傷位點(diǎn),維持基因的完整性。許多研究報(bào)道,受體相關(guān)蛋白80(receptor-associated protein 80,RAP80)在DNA損傷反應(yīng)中有著重要作用,可促使一系列修復(fù)蛋白定位到正確的DNA損傷位點(diǎn)。現(xiàn)對(duì)RAP80在DNA損傷反應(yīng)中的作用綜述如下。
1.1 RAP80的結(jié)構(gòu) RAP80定位于人類染色體5q35,基因片段全長(zhǎng)超過(guò)90 kb,具有15個(gè)外顯子及14個(gè)內(nèi)含子,編碼一個(gè)含有719個(gè)氨基酸,分子質(zhì)量為79.6 kDa的蛋白。RAP80一級(jí)結(jié)構(gòu)的N末端有兩個(gè)核定位信號(hào)(nuclear localization signal,NLS),在 C末端還有第三個(gè)NLS,其中N末端第二個(gè)NLS對(duì)其在細(xì)胞核內(nèi)定位起著關(guān)鍵性的作用。激光共聚焦顯微鏡也發(fā)現(xiàn) RAP80主要以斑點(diǎn)型分布于細(xì)胞核內(nèi)[1]。RAP80蛋白羧基端包含兩個(gè)鋅指結(jié)構(gòu),氨基端包含兩個(gè)泛素相互作用基序(ubiquitin-interacting motifs,UIM)的核內(nèi)蛋白。在電離輻射族誘導(dǎo)的損傷中,UIM及204-304氨基酸區(qū)是RAP80重新定位所必需的[2]。現(xiàn)已在多種蛋白內(nèi)發(fā)現(xiàn)有UIM結(jié)構(gòu),其在細(xì)胞胞吞、泛素化和 DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、修復(fù)等方面均有重要作用[3-4]。
1.2 RAP80的功能 2002年,首次克隆分離出RAP80,發(fā)現(xiàn)其高表達(dá)于睪丸及卵巢,此外在乳腺、心臟等器官也大量表達(dá)。酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)證實(shí),RAP80可與類固醇激素核受體超家族成員RTR結(jié)合,并調(diào)節(jié)部分發(fā)育相關(guān)基因的表達(dá)[1]。近期又有研究表明RAP80通過(guò)依賴激動(dòng)劑的方式與雌激素受體α(estrogen receptor α,ERα)作用,并可調(diào)節(jié) ERα 的轉(zhuǎn)錄活性[5]。此外還發(fā)現(xiàn),RAP80可與泛素相關(guān)小修飾蛋白(small ubiquitin-related modifier,SUMO)結(jié)合酶 UBC9結(jié)合而被SUMO化,但SUMO化后的RAP80與DDR信號(hào)傳導(dǎo)的作用尚不知曉[6]。目前關(guān)于RAP80的研究主要集中于DNA損傷修復(fù)定位。
DSB發(fā)生時(shí),為確?;蛲暾院图?xì)胞定位損傷位點(diǎn),通過(guò)周期停滯修復(fù)DNA及細(xì)胞凋亡,對(duì)DNA損傷產(chǎn)生反應(yīng)。在DNA受到損傷后,一系列DDR相關(guān)的蛋白迅速結(jié)合,并聚集在細(xì)胞核損傷灶周?chē)?,該定位過(guò)程涉及多種嚴(yán)格控制的翻譯后修飾手段,包括乙?;⒘姿峄?、泛素化,SUMOA化等。近來(lái),一種腫瘤抑制基因(也被稱為乳腺癌易患基因)BRCA1在DNA損傷修復(fù)、維持基因完整性及細(xì)胞的正常發(fā)育中所起的作用日益受到重視。而在其作用過(guò)程中涉及一系列蛋白,包括 CCDC98/Abraxas,RAP80,MDC1,RNF8 和UBC13等,其中RAP80在損傷后的定位過(guò)程中起關(guān)鍵作用[7-8]。
以電離輻射導(dǎo)致的損傷灶(ionizing radiation-induced foci,IRIF)為例。DNA損傷后,共濟(jì)失調(diào)—毛細(xì)血管擴(kuò)張突變基因(ataxia-telangiectasia mutated geng,ATM基因)可快速磷酸化組蛋白 H2A亞型H2AX的C末端,此磷酸化H2AX(即γ-H2AX)在DSBs產(chǎn)生后數(shù)秒即開(kāi)始出現(xiàn),10 min達(dá)到高峰。有研究表明,在H2AXC末端磷酸化位點(diǎn)發(fā)生突變時(shí),一系列與調(diào)節(jié)及修復(fù)有關(guān)的蛋白無(wú)法大量正確定位于IRIF[9]。這說(shuō)明 γ-H2AX在 DDR相關(guān)蛋白定位于IRIF起著重要作用。DNA損傷檢測(cè)點(diǎn)介質(zhì)1(DNA damage checkpoint 1,MDC1)的 C末端區(qū)包含兩個(gè)BRCA1的 C末端結(jié)構(gòu)區(qū)(BRCA1 C-terminal repeat,BRCT),N末端區(qū)包含一個(gè)叉狀頭部區(qū)(forkhead-associated,F(xiàn)HA)。通過(guò) BRCT結(jié)構(gòu)域,MDC1可與 γ-H2AX的C末端磷酸肽結(jié)合,這樣MDC1可以保護(hù)γ-H2AX去磷酸化而提高其DNA修復(fù)功能;此外,MDC1可通過(guò)其FHA結(jié)構(gòu)域與ATM相互作用,從而促使更多的ATM聚集在DSBs周?chē)⑹笻2AX磷酸化,通過(guò)該機(jī)制可使DNA損傷信號(hào)放大[10]。一旦DSB發(fā)生,在斷裂處H2AX就會(huì)發(fā)生磷酸化,形成γ-H2AX。然后MDC1這一適配體蛋白就會(huì)直接與γ-H2AX結(jié)合,這一步驟是細(xì)胞進(jìn)行修復(fù)的關(guān)鍵。隨后 RAP80、CCDC98/Abraxas及RNF8發(fā)生一系列轉(zhuǎn)錄后修飾的級(jí)聯(lián)反應(yīng),以促使BRCA1定位到IRIF。有研究表明,RAP80在 DSB發(fā)生90~120 min后才重新定位于DNA損傷位點(diǎn)[2],這說(shuō)明RAP80是作為DNA損傷反應(yīng)信號(hào)的下游調(diào)節(jié)者而發(fā)揮作用,其具體作用機(jī)制如下。
2.1 RAP80結(jié)構(gòu)中的UIM功能 泛素化是一種重要的蛋白質(zhì)修飾,其通過(guò)特異性地降解蛋白質(zhì),來(lái)調(diào)節(jié)細(xì)胞分化、調(diào)控轉(zhuǎn)錄、參與DNA損傷應(yīng)答等。UIM不僅可通過(guò)調(diào)節(jié)蛋白單泛素化而影響其活性及功能,并且可通過(guò)識(shí)別單泛素化及多泛素化序列,而調(diào)節(jié)蛋白分子內(nèi)及分子間的相互作用。RAP80氨基端包含兩個(gè)UIM,其可直接結(jié)合泛素而促進(jìn)RAP80的多泛素化過(guò)程。有研究表明,在電離輻射時(shí)缺失UIM的RAP80突變體無(wú)法定位于DNA損傷位點(diǎn)[8-9];UIM基序中重要的氨基酸發(fā)生突變,RAP80則無(wú)法形成IRIF[11]。這些表明DSB發(fā)生時(shí),RAP80及下游相關(guān)蛋白是通過(guò)RAP80結(jié)構(gòu)中的UIM與泛素化相關(guān)蛋白作用,從而在損傷灶重新定位。
2.2 RAP80與細(xì)胞周期 RAP80可通過(guò)招募形成BRCA1-BARD1-BRCC36復(fù)合物定位于IRIF,來(lái)調(diào)節(jié)DNA損傷反應(yīng)信號(hào)的傳導(dǎo)。有研究表明,敲除RAP80表達(dá)可提高細(xì)胞對(duì)IR引起凋亡的敏感性,減少細(xì)胞周期檢測(cè)點(diǎn)激酶1(checkpoint kinase 1,CHK1)的活性,損傷G2/M期檢查點(diǎn)的調(diào)控作用[8-9]。
2.3 RAP80與BRCA1作用 BRCA1是一種重要的DNA損傷應(yīng)答相關(guān)蛋白,它參與了DNA損傷修復(fù)過(guò)程,特別是在此過(guò)程中需要泛素的參與。BRCA1有一個(gè)關(guān)鍵的C末端結(jié)構(gòu)域BRCT(carboxyl-terminal domain of BRCA1),該結(jié)構(gòu)域在突變修復(fù)過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。BRCT為一個(gè)磷酸化肽結(jié)合結(jié)構(gòu)域,可以與磷酸化的蛋白質(zhì)有效結(jié)合,特別是對(duì)含有pSer-X-XPhe序列的蛋白質(zhì)結(jié)合能力更強(qiáng)。約50%的家族乳腺癌患者和20%~30%的遺傳性卵巢癌患者BRCA1基因發(fā)生突變,且大部分突變發(fā)生于BCRT結(jié)構(gòu)域[11-12]。有研究發(fā)現(xiàn),乳腺癌及卵巢癌患者BRCT結(jié)構(gòu)域發(fā)生突變者BRCA1則無(wú)法與RAP80結(jié)合,這表明RAP80與BRCA1結(jié)合發(fā)揮作用需要BRCT結(jié)構(gòu)域的作用。
然而RAP80并不包含可與BRCT結(jié)合的pSer-XX-Phe序列,這表明RAP80與BRCA1并不是通過(guò)直接結(jié)合而發(fā)揮作用,而是需要其它BRCT結(jié)合蛋白的輔助作用。隨后經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)一種新型蛋白CCDC98,可以與BRCA1中的BRCT通過(guò)pSer-X-X-Phe而有效結(jié)合[13]。重要的是正是這種結(jié)合使RAP80被有效招募到BRCA1附近而形成復(fù)合體,從而參與對(duì)DNA損傷的修復(fù),同時(shí)RAP80可以輔助BRCA1在IRIF發(fā)生后定位于準(zhǔn)確的損傷位點(diǎn)。
BRCA1作為最早發(fā)現(xiàn)的乳腺癌抑制基因,它的突變可導(dǎo)致乳腺癌等相關(guān)腫瘤發(fā)生率明顯升高,而RAP80是作為BRCA1發(fā)揮作用時(shí)的一個(gè)重要伴侶蛋白。低BRCA1、低Rap80水平的患者,其中位生存期顯著延長(zhǎng),這說(shuō)明Rap80對(duì)腫瘤化療效果可能起關(guān)鍵性的調(diào)節(jié)作用[14]。
2.4 RAP80磷酸化 大部分參與IR導(dǎo)致的DNA損傷的蛋白均被ATM磷酸化[15]。RAP80也包含8個(gè)潛在的ATM磷酸化位點(diǎn)。已有報(bào)到證實(shí)其中3個(gè)(Ser101,Ser205,Ser402)在體外被 ATM 磷酸化[2,8,16]。但在不同的種屬中,這些磷酸化的位點(diǎn)并非高度保守著。在UV引起的DNA損傷中,RAP80可被ATR磷酸化而發(fā)揮作用,這些表明RAP80在不同形式的DNA損傷中及細(xì)胞周期調(diào)控中均起著重要作用[12]。IR發(fā)生5 min后,RAP80即發(fā)生磷酸化,這一過(guò)程遠(yuǎn)遠(yuǎn)早于其定位于正確的損傷位點(diǎn),其早期的磷酸化是否有著特殊的調(diào)節(jié)功能尚未明了。磷酸化可以影響蛋白之間的相互作用及蛋白的功能,但RAP80的多個(gè)磷酸化位點(diǎn)發(fā)生突變,并不影響RAP80與BRCA1的定位,據(jù)此可認(rèn)為在IRIF發(fā)生時(shí)RAP80的定位并不依賴于ATM的磷酸化。因此,在DDR中RAP80的磷酸化可能有著尚未知曉的額外作用。
由于RAP80在IRIF引起的DNA損傷修復(fù)中起著重要作用,因此目前關(guān)于其研究多集中于DNA修復(fù)及是否可成為新的腫瘤易感基因等方面。研究證實(shí),大約5%~10%的不同類型腫瘤患者血清中含有RAP80抗體,因此可認(rèn)為RAP80是一種新的腫瘤相關(guān)抗原[17],而關(guān)于RAP80的其它功能如泛素化及轉(zhuǎn)錄等,研究較少。有研究表明在乳腺癌細(xì)胞中過(guò)量表達(dá)RAP80可減少ERα蛋白因泛素化作用而發(fā)生的降解,從而提高ERα蛋白水平以及ERα靶基因pS2的轉(zhuǎn)錄活性[5]。這些說(shuō)明RAP80可能是ERα的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,而ERα與多種腫瘤的發(fā)生均有密切關(guān)系,ERα的活化可促進(jìn)腫瘤的生長(zhǎng)、侵襲及轉(zhuǎn)移。因此,RAP80很可能通過(guò)改變ERα蛋白水平和轉(zhuǎn)錄活性進(jìn)而促進(jìn)其下游基因的轉(zhuǎn)錄來(lái)調(diào)控腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。這些為研究RAP80在腫瘤發(fā)生中的作用提供了新的方向。而RAP80在腫瘤中所起的作用也有待于進(jìn)一步的研究。
[1]Yan Z,Kim Y S,Jetten A M.RAP80,a novel nuclear protein that interacts with the retinoid-related testis-associated receptor[J].J Biol Chem,2002,277(35):32379-32388.
[2]Yan J,Kim Y S,Yang X P,et al.The ubiquitin-interacting motif containing protein RAP80 interacts with BRCA1 and functions in DNA damage repairresponse[J].CancerRes, 2007, 67(14):6647-6656.
[3]Di Fiore P P,Polo S,Hofmann K.When ubiquitin meets ubiquitin receptors:a signalling connection[J].Nat Rev Mol Cell Biol,2003,4(6):491-497.
[4]Hoeller D,Crosetto N,Blagoev B,et al.Regulation of ubiquitinbinding proteins by monoubiquitination[J].Nat Cell Biol,2006,8(2):163-169.
[5]Yan J,Kim Y S,Yang X P,et al.Ubiquitin-interaction motifs of RAP80 are critical in its regulation of estrogen receptor alpha[J].Nucleic Acids Res,2007,35(5):1673-1686.
[6]Yan J,Yang X P,Kim Y S,et al.RAP80 interacts with the SUMO-conjugating enzyme UBC9 and is a novel target for sumoylation[J].Biochem Biophys Res Commun,2007,362(1):132-138.
[7]Wang B,Matsuoka S,Ballif B A,et al.Abraxas and RAP80 form a BRCA1 protein complex required for the DNA damage response[J].Science,2007,316(5828):1194-1198.
[8]Sobhian B,Shao G,Lilli D R,et al.RAP80 targets BRCA1 to specific ubiquitin structures at DNA damage sites[J].Science,2007,316(5828):1198-1202.
[9]Celeste A,F(xiàn)ernandez-Capetillo O,Kruhlak M J,et al.Histone H2AX phosphorylation is dispensable for the initial recognition of DNA breaks[J].Nat Cell Biol,2003,5(7):675-679.
[10]Lou Z,Minter-Dykhouse K,F(xiàn)ranco S,et al.MDC1 maintains genomic stability by participating in the amplification of ATM-dependent DNA damage signals[J].Mol Cell,2006,21(2):187-200.
[11]Narod S A,F(xiàn)oulkes W D.BRCA1 and BRCA2:1994 and beyond[J].Nat Rev Cancer,2004,4(9):665-676.
[12]Yan J,Yang X P,Kim Y S.RAP80 responds to DNA damage induced by both IR and UV irradiation and is phosphorylated at Ser205[J].Cancer Res,2008,68(11):4269-4276.
[13]Kim H,Huang J,Chen J.CCDC98 is a BRCA1-BRCT domain-binding protein involved in the DNA damage response[J].Nat Struct Mol Biol,2007,14(8):710-715.
[14]Rafael R,Laia P R,Jose J S,et al.Customized Treatment in Non-Small-Cell Lung Cancer Based on EGFR Mutations and BRCA1 mRNA Expression[J].Plos One,2009,4(5):1-9.
[15]Kurz E U,Lees-Miller S P.DNA damage-induced activation of ATM and ATM-dependent signaling pathways[J].DNA Repair(Amst),2004,3(8):889-900.
[16]Kim H,Chen J,Yu X.Ubiquitin-binding protein RAP80 mediates BRCA1-dependent DNA damage response[J].Science,2007,316(5828):1202-1205.
[17]Yuriy V S,Ekaterina P K,Svetlana V K,et al.RAP80/UIMC1 as cancer-associated antigen:Alternative splice variants and their immunogenicity[J].Cancer Lett,2007,255(2):255-262.