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    擬南芥乙烯合成酶ACS基因家族研究進(jìn)展

    2014-03-21 11:47:05呂淑芳江靜
    生物技術(shù)通報 2014年11期
    關(guān)鍵詞:擬南芥乙烯二聚體

    呂淑芳江靜

    (1.河南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 棉花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,開封 475004;2.河南科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院,洛陽 471003)

    擬南芥乙烯合成酶ACS基因家族研究進(jìn)展

    呂淑芳1,2江靜1

    (1.河南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 棉花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,開封 475004;2.河南科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院,洛陽 471003)

    1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid,ACC)合酶(ACC synthase,ACS)是乙烯生物合成的限速酶。ACS酶活性是ACC和乙烯調(diào)控植物生長發(fā)育的基礎(chǔ),其酶活性調(diào)節(jié)主要涉及轉(zhuǎn)錄啟動、翻譯后修飾、酶高級結(jié)構(gòu)形成、生化特性等方面。簡要總結(jié)擬南芥ACS酶活性研究進(jìn)展。

    ACS酶 活性調(diào)控 乙烯

    植物激素乙烯(ethylene)是氣體小分子(C2H4),不僅調(diào)節(jié)植物種子萌發(fā)、細(xì)胞伸長、組織分化、葉片和花的衰老脫落、果實(shí)成熟[1-8]等生長發(fā)育過程,還調(diào)控生物脅迫和非生物脅迫[9-11]等應(yīng)答反應(yīng)。多種逆境因子都可以增加乙烯生物合成量,并因此改變植物抵抗和耐受逆境脅迫能力。

    植物乙烯生物合成是一系列酶促反應(yīng)過程:首先腺苷蛋氨酸合成酶催化蛋氨酸與腺苷酸(AMP)反應(yīng)生成腺苷蛋氨酸(SAM);然后,SAM由ACC合酶催化生成ACC;最后,ACC氧化酶(ACC oxidase,ACO)催化ACC發(fā)生氧化反應(yīng)而生成乙烯[11-14]。其中,ACS催化SAM向ACC轉(zhuǎn)化是關(guān)鍵的限速步驟,所以ACS被認(rèn)為是ACC和乙烯生物合成的限速酶。現(xiàn)已從番茄、冬瓜、蘋果、康乃馨、筍瓜、豇豆及擬南芥中克隆到一些ACS基因[15-18],這些同源的ACS酶活性調(diào)節(jié)過程各種各樣。本研究著重介紹模式植物擬南芥ACS酶活性及其調(diào)控特點(diǎn)。

    1 擬南芥ACS基因家族成員及其生理特性

    擬南芥基因組包含12個ACS同源基因,分別分布在5條染色體上。家族成員之間的氨基酸序列相似性為32%-91%,核苷酸序列相似34%-84%[19],ACS蛋白序列具有7個相同的功能結(jié)構(gòu)域和11個保守性位點(diǎn),包含了輔基磷酸吡哆醛結(jié)合位點(diǎn)、底物特異性結(jié)合位點(diǎn)、磷酸化位點(diǎn)等結(jié)構(gòu)信息。其中,ACS1缺少3個保守的氨基酸(T、N和P),沒有酶促活性[20],ACS3的基因是假基因[19,21],ACS10和

    ACS12執(zhí)行氨基轉(zhuǎn)移酶功能[19],其余9個ACS酶具有催化ACC生物合成功能。根據(jù)其蛋白C末端序列的差異分為3個類型,即TypeI:ACS1、2和6;TypeII:ACS4、5、8和9;TypeIII:ACS7、11[22-24](圖1)。其中,TypeI有一個鈣依賴蛋白激酶(Calcium-dependent protein kinase,CDPK)磷酸化位點(diǎn)和3個有絲分裂原蛋白激酶(Mitogen activated protein kinase,MAPK)磷酸化位點(diǎn),TypeII僅有一個單獨(dú)CDPK磷酸化位點(diǎn),TypeIII沒有以上所述蛋白激酶磷酸化位點(diǎn)。

    圖1 擬南芥ACS蛋白C端差異及其分類

    研究表明,ACS蛋白序列和結(jié)構(gòu)存在一定的保守性和差異性。就蛋白序列而言,肽鏈長度,分子量的不同,氨基酸的豐度、功能性位點(diǎn)各不相同[27];就結(jié)構(gòu)特點(diǎn)而言,N末端序列的保守性、C末端序列的多樣性等也不相同[28]。這些決定了其生化特性不同,如等電點(diǎn)、底物親和力和最大反應(yīng)速度的不同,對ACS抑制劑AVG、Sinefungin的敏感程度不同[19],同時也決定了其功能差異(表1)。

    表1 ACS家族成員的生化指標(biāo)[19]

    擬南芥ACS酶活性直接關(guān)系到體內(nèi)乙烯含量。野生型植株(Wild type,WT)的黃化苗過量產(chǎn)生乙烯(Ethylene over-produce),在ACS5和ACS9功能缺失突變體acs5、acs9或者acs5acs9這一過程受限[25,26],說明ACS5和ACS9是WT植株黃化苗時期乙烯過度產(chǎn)生的主效基因。光照條件下,5 d齡的WT植株中的乙烯含量高于功能缺損的acs1-1突變體;類似的功能缺失突變體acs4-1與acs9-1植株中的乙烯含量要顯著高于WT;而單突變acs2-1,acs5-1 對乙烯含量的影響并不顯著[29]。這些結(jié)果暗示,ACS酶活性隨著植物生長發(fā)育階段而改變,且各成員具有功能特異性。但是,令人費(fèi)解的是,ACS1被認(rèn)為無催化乙烯合成活性[29,30],acs1-1突變體卻表現(xiàn)出乙烯含量顯著變化。據(jù)此推測,單個ACS基因突變可能影響ACS基因家族整體表達(dá)水平的調(diào)節(jié)。

    ACS單個成員具有功能特異性和專一性,主要表現(xiàn)在下胚軸伸長、開花時間和子葉面積的大小3個方面。acs1-1 和 acs9-1黑暗中生長的黃化幼苗下胚軸伸長得到促進(jìn),而acs4-1下胚軸長度受到抑制;光下生長的所有ACS單突變體下胚軸伸長得

    到促進(jìn),子葉面積增加。acs1-1、acs6-1、acs7-1和acs9-1開花時間較WT提前,但acs6-1 acs7-1雙突變體早花表型受到抑制,開花時間較WT延遲[29]。暗示ACS6和ACS7在調(diào)控開花時間方面可能存在功能拮抗作用。

    2 ACS基因家族轉(zhuǎn)錄調(diào)控

    基因的轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控是植物應(yīng)答各種信號刺激的重要過程。借助于基因芯片技術(shù)、Northern blot、定量PCR技術(shù)、GUS轉(zhuǎn)基因和酶活性分析等技術(shù),分析不同的生長發(fā)育時期、不同外界信號刺激下ACS基因家族的轉(zhuǎn)錄活性調(diào)節(jié)發(fā)現(xiàn),ACS家族成員轉(zhuǎn)錄調(diào)控各有特點(diǎn)。

    2.1 不同發(fā)育時期、不同器官組織中特點(diǎn)

    除ACS9在發(fā)育后期表達(dá)外,擬南芥ACS家族其它基因在5 d的黃化苗、光下生長的幼苗及表皮細(xì)胞、保衛(wèi)細(xì)胞、維管組織中均有表達(dá)[9,31-34];其中ACS11在萼片的香毛簇中特異表達(dá),ACS1在胚座框中特異表達(dá);而在擬南芥中胚軸、根、花的不同組織和長角果中表現(xiàn)為多個ACS基因共表達(dá)[21]。

    2.2 不同環(huán)境因素調(diào)節(jié)的ACS表達(dá)特點(diǎn)

    生物脅迫與非生物脅迫可改變ACS轉(zhuǎn)錄活性和乙烯合成。物理傷害雖然能抑制下胚軸中ACS1、ACS5的組成性表達(dá),但卻誘導(dǎo)ACS2、ACS4、ACS6、ACS7、ACS8的表達(dá)[21];冷處理抑制ACS5 和ACS11表達(dá),且改變了ACS8表達(dá)模式;熱處理增強(qiáng)了ACS4的mRNA含量,改變了ACS8和ACS11的表達(dá)模式;缺氧環(huán)境下誘導(dǎo)ACS2、ACS6、ACS7、ACS9的表達(dá)[21]。ACS基因轉(zhuǎn)錄活性也被外源激素所調(diào)控。IAA可提高ACS2、ACS4、ACS5、ACS6、ACS7、ACS8、ACS11在擬南芥根中的表達(dá),特異的誘導(dǎo)擬南芥黃化苗中ACS4表達(dá)[32];油菜素內(nèi)酯能夠增強(qiáng)ACS4的mRNA含量[33]。同時,基因芯片結(jié)果(http://bar.utoronto.ca/efp)顯示,處理150 mmol/L NaCl時,ACS家族各基因mRNA含量呈現(xiàn)不同的時間相關(guān)性。光照誘導(dǎo)ACS8表達(dá)呈現(xiàn)晝夜節(jié)律變化[35]。

    ACS基因表達(dá)也會受到體內(nèi)或體外乙烯水平自催化調(diào)節(jié)。ACS4、ACS 7、ACS9受到ACC顯著性的誘導(dǎo)[34,36];ACS9在乙烯不敏感突變體etr1-1與ein2-1均表現(xiàn)為mRNA含量的下降,且ACC處理不能恢復(fù)ACS9的mRNA含量[37]。這些研究結(jié)果暗示,ACC處理對ACS酶活性誘導(dǎo)是必要而非充分的,同時也暗示了乙烯的自催化調(diào)節(jié)是通過乙烯受體感受乙烯信號后反饋調(diào)節(jié)ACS基因表達(dá)。

    另外,張舒群等[38]報道ACS2和ACS6轉(zhuǎn)錄活性可被促有絲分裂活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase,MPK)3/MPK6和轉(zhuǎn)錄因子WRKY33所調(diào)控,從而影響乙烯的合成。

    3 ACS家族蛋白水平調(diào)控

    ACS是以磷酸吡哆醛為輔因子的胞質(zhì)酶,半衰期很短,通常只有30 min到幾小時[39-41]。ACS蛋白結(jié)構(gòu)決定了自身的生化功能,保守性較低的C端往往是蛋白修飾位點(diǎn);位于中間某些位置的Arg、Try是二聚體相互作用的位點(diǎn)。這些位點(diǎn)屬于非酶活性位點(diǎn),但是調(diào)節(jié)著ACS命運(yùn)。

    3.1 ACS家族蛋白修飾

    廣譜蛋白激酶抑制劑K252a或十字孢堿(Staurosporine)能夠抑制真菌誘導(dǎo)劑對番茄懸浮細(xì)胞ACS酶活性的誘導(dǎo)作用[42],而用蛋白磷酸化酶抑制劑花萼海綿誘癌素A(Calyculin A)處理番茄后能夠組成型的誘導(dǎo)ACS酶活性[42,43],說明磷酸化可以調(diào)節(jié)ACS活性。進(jìn)一步的研究證明,磷酸化對ACS活性的調(diào)節(jié)是通過對其穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)來改變ACS活性[22,44,45]。

    TypeI和TypeII ACSs在沒有乙烯存在時通過蛋白酶體降解。對于TypeI ACSs,乙烯的存在可能誘導(dǎo)E3識別位點(diǎn)的磷酸化從而阻止了E3的識別。TypeII ACSs,其降解受到擬南芥3個BTB 結(jié)構(gòu)域的E3180 連接酶的作用,其適配器蛋白是ETO1、EOL1和EOL2。其中ETO1與cullin3和AtACS5互作,ETO1表達(dá)的破壞導(dǎo)致了ACS5的穩(wěn)定性和持續(xù)乙烯的合成,所以ETO1可能作為一個特異的底物適配器介導(dǎo)AtACS5的降解[46-48]。ACS4、ACS8和ACS9具有與ACS5相似的C端,都含有類似的絲氨酸位點(diǎn),同時ACS5蛋白的C端絲氨酸位點(diǎn)被證明是CDPK磷酸化位點(diǎn)[49]。XBAT32是E3連接酶環(huán)指區(qū)域的一個蛋白,酵母雙雜交顯示XBAT32能與ACS4和ACS7相互作用,修飾ACS蛋白負(fù)調(diào)控乙烯的合成,從而調(diào)控擬南芥?zhèn)雀陌l(fā)育[50-52]。

    14-3-3蛋白在乙烯信號傳遞中發(fā)揮一定的作用,14-3-3蛋白可能通過結(jié)合ACS磷酸化的C末端來調(diào)節(jié)ACS的活性,保護(hù)ACS在乙烯生物合成時不被降解。用串聯(lián)親和純化標(biāo)簽(Tandem affinity purification,TAP)標(biāo)記擬南芥14-3-3ω(At1g78300),并在轉(zhuǎn)基因植物中表達(dá)。串聯(lián)MS分析純化復(fù)合物,結(jié)果表明14-3-3蛋白能與121個蛋白相互作用,其中包括參與乙烯合成的ACC合成酶(ACS-6、-7和-8)[53]。 最近,Huang等[54]證明14-3-3與ACS7相互作用參與根的向重力性。Yao等[55]通過酵母雙雜交系統(tǒng),證明在酵母細(xì)胞中水稻14-3-3蛋白和ACS能發(fā)生相互作用。

    圖2 ACS蛋白在乙烯合成中的調(diào)控模式[58]

    表2 ACS蛋白之間互作[8]

    番茄成熟后期,Le-ACS2位于C端的第460位氨基酸被磷酸化后,表現(xiàn)出乙烯的過量產(chǎn)生,而Le-ACS4并沒有表現(xiàn)出磷酸化[22]。說明ACS蛋白磷酸化是由其蛋白結(jié)構(gòu)決定的,更準(zhǔn)確地說是由其C末端的序列決定的[56,57]。植物體內(nèi)、體外因子都可以改變ACS蛋白的磷酸化進(jìn)程。正常條件下,ACS表現(xiàn)出低活性,當(dāng)植物受到外界刺激的時候,能夠迅速產(chǎn)生乙烯,蛋白激酶通過直接與ACS相互作用并對其磷酸化來參與這一過程。擬南芥I型ACS家族成員具有保守的MPK3和MPK6作用位點(diǎn),ACS2、6能夠被MPK6磷酸化[45,57]。II型與III型的ACS家族成員不具備MPK磷酸化位點(diǎn)(圖2),當(dāng)ACS6沒有被磷酸化的情況下,能夠被迅速形成的26S蛋白酶復(fù)合體降解,而磷酸化的作用就是抑制蛋白酶復(fù)合體對C端的結(jié)合,從而改變其蛋白穩(wěn)定性[56]。驗(yàn)發(fā)現(xiàn),ACS蛋白之間能夠形成同源二聚體與異源二聚體,位于其肽鏈中間位置的Arg、Try是二聚體相互作用位點(diǎn)。不同的二聚體具有不同的生化特性,也決定了不同的蛋白純化條件[36],同時表現(xiàn)出不同的酶活力[59],包括對底物SAM結(jié)合的米氏常數(shù)(Km值:8.3-4 mol/L)、催化常數(shù)(kcat值:0.19-4.82 s-1)和對抑制劑AVG的抑制常數(shù)(Ki值:0.019-0.8 mol/L)。但并不是所有的二聚體都具有酶活力。ACS單體間能夠形成25個具有酶活力的二聚體與20個不具有酶活力的二聚體。除了ACS1外,擬南芥ACS家族其他蛋白同源二聚體都具有酶活力(表2)。ACS7能夠與TypeI和TypeII的ACS單體形成功能性的異源二聚體。意外的是,ACS1同源二聚體不具備酶活力,但能夠與ACS2和ACS6形成具有酶活力的異源二聚體[9]。但是,迄今為止,這些二

    3.2 ACS蛋白互作

    通過大腸桿菌(E. coli)ACS蛋白體外純化實(shí)

    聚體如何形成,以何種方式結(jié)合,亞細(xì)胞定位以及具有什么樣的生物學(xué)調(diào)控功能與意義都還不確定。

    4 小結(jié)

    ACS每個基因成員的表達(dá)調(diào)控受不同脅迫因素的誘導(dǎo),基因的表達(dá)也較為復(fù)雜,其調(diào)節(jié)主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平上,同時也發(fā)生在翻譯水平上[60,61]。因此,乙烯生物合成的調(diào)控可能存在多種因素,通過不同的調(diào)控因子分別接受不同的刺激,誘導(dǎo)特定的ACS的表達(dá)[62-65],同時也通過所編碼蛋白的氨基酸序列的差異決定其反應(yīng)的動力學(xué)性質(zhì)及乙烯生物合成的速度[13,65]。但是到目前為止,調(diào)控ACS表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子、轉(zhuǎn)錄調(diào)控的信號通路等都鮮少報道。

    乙烯生物合成途徑中的ACC合成酶基因不斷被分離克隆,有的已經(jīng)通過基因工程技術(shù),將其轉(zhuǎn)入到不同的物種中,通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)來調(diào)控植物ACC合成酶基因的表達(dá)。但植物體內(nèi)參與乙烯生物合成的ACC合成酶基因的數(shù)目及特性尚不清楚。今后,需要進(jìn)一步從分子和蛋白水平上進(jìn)行研究。

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    (責(zé)任編輯 狄艷紅)

    Review of Arabidopsis 1-Aminocyclopropane-1-Carboxylic Acid Synthases

    Lü Shufang1,2Jiang Jing1
    (1. State Key Laboratory of Cotton Biology,College of Life Science,Henan University,Kaifeng 475004;2. College of Agricultural,Henan University of Science and Technology,Luoyang 471003)

    1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid(ACC)synthase(ACS)is the key rate-limiting enzyme of ethylene biosynthesis. The activity of ACS enzyme is the basis of ACC or ethylene regulates plant growth and development. This regulation is mainly involved in various levels:transcription, post-transcriptional modification, enzyme structure formation, biochemical characteristics, and so on. Here we briefly review the research progresses of ACS enzymic activity.

    ACS enzyme Activity regulation Ethylene

    2014-03-27

    國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31271510)

    呂淑芳,女,講師,碩士研究生,研究方向:植物學(xué)與分子生物學(xué);E-mail:lvshufang780515@sina.com

    江靜,博士,教授,研究方向:植物抗逆生理與分子生物學(xué);E-mail:jiangjing@henu.edu.cn

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