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      去泛素化酶BRCC36功能的研究進展

      2014-01-26 21:30:51李如君龔開政張振剛
      中國病理生理雜志 2014年9期
      關鍵詞:化酶亞基泛素

      李如君, 龔開政, 張振剛

      去泛素化酶是自然界中廣泛存在于真核細胞內(nèi)的一種生物活性酶,它與泛素化酶的作用相反,可將泛素或泛素鏈從底物上去除。BRCC36(BRCA1-BRCA2-containing complex subunit 36)是2003年發(fā)現(xiàn)的去泛素化酶家族新成員,屬于 JAMM(Jab1/MPN/Mov34 metalloenzyme)/MPN+(Mpr1/Pad1 N-terminal)亞類,參于DNA損傷修復、細胞信號轉導及細胞周期控制等多種細胞活動,在腫瘤發(fā)生、血管生成、抗心肌損傷過程中均發(fā)揮重要作用。不同于泛素化酶的種類繁多、可作用于某一特定環(huán)節(jié),人體內(nèi)的去泛素化酶僅發(fā)現(xiàn)不到80種,提示其具有多種生物學功能。目前關于去泛素化酶BRCC36的研究還存在爭議,因此研究去泛素化酶的結構、作用形式、生理學功能可望給疾病新型治療靶點的探索提供必要的信息,具有較大的臨床意義。

      1 BRCC36的結構和歸屬

      BRCC36是由BRCC3基因編碼,含316個氨基酸,分子量為36 kD的多肽[1]。最初發(fā)現(xiàn) BRCC36是BRCA1-BRCA2-containing complex(BRCC)中的一個亞基,其基因位于人類X染色體長臂28區(qū),該蛋白又被稱為C6.1A、CXorf53或 RP11-143H17.2。不同于泛素化酶可以催化底物蛋白進行泛素化修飾,該蛋白是一種相反的可以特異性從底物蛋白上移除聚泛素鏈的酶,即去泛素化酶(deubiqui-tinating enzymes,DUBs)。到目前為止人類已發(fā)現(xiàn)了600余種泛素化酶,但去泛素化酶僅有不到80種,這也意味著去泛素化酶功能的調(diào)控可能與其相連接的蛋白質有關。根據(jù)同源性,去泛素化酶目前可分成5大類,即泛素羧基末端水解酶家族(ubiquitin C-terminal hydrolases,UCHs)、泛素特異性蛋白酶家族(ubiquitin-specific proteases,USPs)、卵巢腫瘤結構域蛋白酶(ovarian tumor domain proteases,OTUs)、Josephin 和JAMM/MPN+蛋白酶家族[2]。除了 JAMM/MPN+蛋白酶家族是金屬肽酶外,其余4類去泛素化酶均屬于半胱氨酸蛋白酶。BRCC36是JAMM/MPN+蛋白酶家族成員之一,目前該家族中被報告的其它成員有26S蛋白酶體非ATP酶調(diào)節(jié)亞基14[26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14;一種人類PAD1(proteasome alpha subunit 1)的類似物,在酵母細胞中的同源物被稱為 Rpn11][3]、CSN5(COP9 信號體亞基)[4]、與胞內(nèi)分選復合物運輸相關(ESCRT machinery-associated)的去泛素化酶AMSH(associat-ed molecule with the SH3 domain of STAM1)和AMSHLP(AMSH-like protease)[5]。該家族 DUBs的特點是含有JAMM/MPN+結構域,其中包含2個組氨酸殘基和1個天冬氨酸殘基,可與二價鋅離子穩(wěn)定結合形成催化中心,發(fā)揮去泛素化作用[6]。BRCC36可特異性識別泛素間通過第63位賴氨酸殘基(K)連接形成的泛素鏈,并對其進行水解從而減弱靶物的泛素化修飾程度,其余成員均具有特異性水解K63位聚泛素鏈的功能[7]。研究已證實,通過K63位點連接的聚泛素鏈所介導的泛素化修飾在DNA損傷修復[8]、NF-κB 信號轉導[9]、細胞周期和核糖體功能控制[10]、蛋白質靶向運輸[11]中發(fā)揮重要作用。

      2 BRCC36參與形成的復合物

      在細胞內(nèi),BRCC36主要通過參與 BRCC和BRISC(BRCC36-containing isopeptidase complex)這2種復合物的形成來發(fā)揮作用。免疫染色顯示BRCC復合物定位于細胞核,由 BRCC36、BRCA1、BRCA2、Merit40/NBA1、 BARD1、 RAD51、 BRCC45/BRE、RAP80和Abraxas/CCDC98等亞基組成;BRISC復合物則定位于細胞質,由 BRCC36、BRCC45/BRE、Merit40/NBA1和Abro1/KIAA0157亞基組成,2種復合物中的 Abraxas(即 CCDC98)和 Abro1(即KIAA0157)分別分布在胞核和胞質,其動態(tài)平衡可共同調(diào)節(jié) BRCC36的活性及細胞內(nèi)定位[8]。Feng等[2]研究顯示,敲除內(nèi)源性 Abraxas可導致胞核內(nèi)BRCC36水平顯著下降;而消減Abro1則使胞質中BRCC36含量顯著減少,但胞核內(nèi)無明顯變化。他們認為一方面與二者參與形成的復合物減少有關,另一方面與其可調(diào)節(jié)BRCC36同復合物中其它亞基的親和力有關。此外,機體還可通過調(diào)節(jié)2種復合物之間的比例來應對不同細胞事件對DUB活性的需要。例如通過下調(diào)Abro1導致胞質中BRISC復合物的減少、胞核中BRCC復合物相應增多,從而應對DNA損傷修復時對BRCC復合物的大量需求。Hu等[12]還發(fā)現(xiàn),2種 BRCC36復合物共有組成亞基Merit40(即NBA1)和BRCC45(即BRE)的相互作用對維持復合物的完整性發(fā)揮關鍵作用。在細胞內(nèi)消減這2種亞基的任意一個都會引發(fā)復合物中其余亞基表達減少,且復合物的穩(wěn)定性降低,易被蛋白酶體降解。這是由于Merit40羧基端保守序列PXXR可通過與BRCC45羧基端第2個UEV(ubiquitin-conjugating enzyme variant)域相作用,共同維持BRCC36復合物的完整性;并且Merit40可促使BRCA1聚集在DNA損傷部位,參與BRCC復合物介導的DNA損傷修復。這表明,BRCC36通過與復合物中其余亞基的交互來發(fā)揮作用。研究發(fā)現(xiàn)[8],在BRISC復合物中,Abro1是BRCC36發(fā)揮作用的必需亞基;而缺乏BRCC45則無法探測出BRCC復合物具有DUB活性。研究者觀察到BRCC45的2個UEV域變異后并不影響其與其余亞基的相互作用,提示其通過其它途徑影響DUB活性,但具體機制尚待進一步研究。

      3 BRCC36已知細胞生物學功能

      由于目前僅發(fā)現(xiàn)不到80種去泛素化酶,提示去泛素化酶可參與多種代謝活動。其中BRCC36參與的K63位點去泛素化修飾調(diào)控,已被證實具有多種生物學功能。

      3.1 參與DNA損傷修復 多種內(nèi)外源性理化、生物因素均會導致基因組發(fā)生損傷,人類每天會發(fā)生至少10 000處DNA損傷,尤其是DNA雙鏈斷裂(DNA double-strand breaks,DSBs)可導致基因突變、甚至細胞死亡。而細胞主要通過同源重組(homologous recombination,HR)和非同源末端連接(non-homologous end joining,NHEJ)來進行 DSBs修復工作[13],研究表明 BRCC36均參與了上述過程。Block-Schmidt等[14]發(fā) 現(xiàn),植 物 阿 拉 伯 芥 存 在BRCC36同源基因AtBRCC36A和AtBRCC36B。前者的突變會導致染色體之間及自身內(nèi)部出現(xiàn)嚴重的同源重組修復異常,而后者的突變則基本無影響,是否作為細胞內(nèi)BRCC36的冗余尚需進一步研究;但缺失任意一種BRCC36基因均會使得細胞對DNA交聯(lián)劑的敏感性下降,提示兩者在DNA交叉連接修復(DNA crosslink repair)中均起作用。此外還發(fā)現(xiàn)BRCC36發(fā)揮去泛素化作用要先于BRCA1的磷酸化,此點可作為研究BRCC復合物依賴的HR修復具體過程的依據(jù)。Coleman等[15]發(fā)現(xiàn),細胞內(nèi)缺失BRCC36會引起DSBs時核酸酶對DNA 5′端過度切除,并相應地引起依靠3′端突出段為模板的同源重組修復增強,這種過度的同源重組修復會損害基因組的完整性。

      3.2 參與細胞周期調(diào)控 細胞在進行增殖時,通常會經(jīng)歷一個G2/M期關卡,用于檢測DNA是否存在缺陷。當關卡檢測到嚴重的缺陷及損傷時,細胞會暫時停止增殖,并啟動相應修復機制。若修復成功則繼續(xù)增殖,若修復失敗則啟動相應細胞死亡程序。BRCC36可降低關卡對DNA損傷的容忍度。Dong等[1]發(fā)現(xiàn),消減細胞內(nèi)BRCC36和BRCC45的表達,會導致G2/M期關卡的作用消失。尤其是消減BRCC36至原先水平33%以下時,細胞將繞過自檢程序進入有絲分裂,導致DNA存在的缺陷遺傳給下一代細胞,使得子代抗損傷能力下降,生存能力明顯減弱。研究還發(fā)現(xiàn)散發(fā)性乳房腫瘤患者的腫瘤細胞中BRCC36異常高表達,表現(xiàn)為腫瘤細胞對放射治療不敏感;而消減BRCC36卻使得細胞對電離輻射的敏感性增強[16]。這與 BRCC36增強了關卡對DNA損傷的檢查并啟動相應DNA修復有關。對于該點的深入研究,可成為提高癌癥患者放療療效的新靶點,BRCC36也有望成為檢測放療敏感性的新指標。

      3.3 參與細胞內(nèi)信號轉導 經(jīng)典的轉化生長因子β1(transforming growth factor β1,TGF-β1)信號通路已被證實在細胞分化、增殖、遷移、免疫應答,炎癥反應中發(fā)揮重要作用[17-18],由其是在慢性壓力負荷等致心肌肥厚因素刺激下,心肌內(nèi)TGF-β1表達顯著增加。而我們新近的研究顯示[19],在肺動脈平滑肌細胞中,環(huán)磷酸鳥苷(cGMP)可使胞漿內(nèi)的β2-微管蛋白扣押轉化生長因子β1通路胞內(nèi)主要效應蛋白Smad3,從而抑制該通路,并發(fā)現(xiàn)扣押時與Smad3,結合的BRCC36明顯增加,提示BRCC36可能通過調(diào)節(jié)Smad3的泛素化修飾來參與TGF-β1信號通路的調(diào)節(jié)。但目前國內(nèi)外尚無報道,我們現(xiàn)正對這一課題進行研究。此外,核因子κB(NF-κB)信號通路的研究證實[9],對腫瘤壞死因子受體相關因子(TNF receptor-associated factor)2、6的K63位點泛素化修飾的移除,可負向調(diào)節(jié)該通路,提示BRCC36可通過對NF-κB通路關鍵轉換因子的去泛素化修飾來發(fā)揮調(diào)節(jié)作用。

      3.4 參與泛素化修飾調(diào)節(jié) BRCC36可特異性移除靶物K63位點的泛素,是其生物學功能的基礎。眾所周知,DNA損傷后可誘導 ATM/ATR使組蛋白H2AX的S139上發(fā)生磷酸化來招募MDC1因子,隨后MDC1磷酸化來促使泛素連接酶RNF8/UBC13和RNF168/UBC13在受損染色質部位連接上K63位點聚泛素鏈,為BRCC復合物創(chuàng)造出一個停泊位點,并促使 BRCA1向此部位聚集[12]。BRCC復合物中Rap80的串聯(lián)泛素作用域(ubiquitin interaction motif,UIM)可特異性識別K63位點聚泛素鏈修飾的染色質,介導修復因子的定位[20]。而修復完成后泛素化信號的及時解除至關重要。研究指出[21],Rap80通過介導復合物中BRCC36在DNA受損部位定位,通過BRCC36特異性水解K63位點聚泛素鏈來提供損傷修復后的終止信號,從而解除G2/M期關卡對細胞周期的阻滯,使細胞恢復增殖能力。在胞質中,雖然BRCC36參與了BRISC復合物的組成,但該復合物對連接在K48、63位點的聚泛素鏈親和力相同。之所以BRISC復合物僅水解K63位點聚泛素鏈,并非由于其特異性識別該聚泛素鏈,而是由于底物與酶催化部位連接的特殊構象。因為K63位點上形成的聚泛素鏈其內(nèi)部的異肽鏈構象有利于BRCC36發(fā)揮水解作用[22]。但有研究也發(fā)現(xiàn),BRCC36還可增強特定泛素連接酶的活性,從而上調(diào)泛素化水平。例如BRCC36可能通過抑制BRCA1的底物或泛素交聯(lián)酶(E2)結合位點發(fā)生泛素化修飾,從而增強BRCA1復合物泛素連接酶(E3)活性達20倍[23]。因此,BRCC36的多功能形態(tài)值得進一步深入研究。

      4 BRCC36與疾病的關系

      越來越多的證據(jù)顯示BRCC36參與了多種疾病的發(fā)生過程。Chen等[16]研究發(fā)現(xiàn),BRCC36在絕大多數(shù)的乳房腫瘤中異常高表達。消減腫瘤細胞內(nèi)BRCC36水平并不會影響細胞的正常生長,但給予一定劑量的電離輻射后,細胞凋亡明顯增加。這與缺乏BRCC36導致的BRCA1無法正常磷酸化及其無法在受損DNA部位形成修復核灶有關。Cilenti等[24]研究發(fā)現(xiàn),Abro1參與的 BRCC36調(diào)控可能是一種新型的心臟保護機制。他們在心肌梗死患者的病變心肌區(qū)域發(fā)現(xiàn)Abro1水平顯著增高。通過對心肌缺血再灌注損傷模型的研究顯示,增加Abro1會引起具有K63位點泛素化修飾的蛋白靶物顯著減少,可明顯減少氧化應激誘導的細胞凋亡;而降低Abro1的水平則相反,會加重由于缺血及再灌注所導致的心肌細胞損傷及凋亡。但作者并未指出K63泛素化修飾水平的下降與BRCC36有直接關系,需要進一步探索。此外,Singh通過對敲除了BRCC復合物中關鍵成份BRCA2的轉基因小鼠研究發(fā)現(xiàn)[25],當給予具有心臟毒性的抗腫瘤藥物多柔比星后,轉基因小鼠比野生對照鼠出現(xiàn)了更為顯著的心臟毒害反應,包括更為嚴重的心功能不全、全組死亡率提高及更為廣泛的DSBs和修復核灶形成明顯不足,左心室病理切片也反映出更多的心肌細胞凋亡。這與消減BRCC36引起的BRCC復合物減少導致的DNA損傷修復能力減弱一致。相關的研究還涉及了BRCA1在心力衰竭、缺血再灌注損傷中所起的作用,都表明減弱DNA的修復會導致更為嚴重的心臟病變。Miskinyte等[26]對綜合性煙霧病的研究發(fā)現(xiàn),BRCC3基因的缺失,是導致該病發(fā)生的重要原因。通過基因敲除技術暫時去除斑馬魚的BRCC3基因也出現(xiàn)了血管形成障礙,而通過補充BRCC36則可逆轉這一現(xiàn)象,提示BRCC36在血管形成中發(fā)揮重要作用。

      5 展望

      綜上所述,BRCC36作為生物體內(nèi)為數(shù)不多的特異性K63位點去泛素化酶,參與多種細胞活動,在DNA修復、信號轉導、細胞周期控制、血管形成等調(diào)控中發(fā)揮重要作用;其調(diào)控主要通過與BRCC36復合物中其它亞基的相互作用而實現(xiàn);與乳房腫瘤、心臟缺血缺氧損傷、煙霧綜合征等疾病的發(fā)生聯(lián)系密切。對其深入研究,可成為提高腫瘤放療效果的靶點[16]和預測心臟疾病發(fā)生風險的敏感指標[27],具有較強的臨床價值。

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