朱志明,鄭嫩珠,繆中緯,段園園,辛清武,陳 暉*
(1. 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 畜牧獸醫(yī)研究所,福建 福州 350013;2. 農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)與科技信息研究所,福建 福州 350003)
隨著雜種優(yōu)勢(shì)在畜牧業(yè)上的利用日益廣泛,雜種優(yōu)勢(shì)的預(yù)測(cè)亦越顯重要,對(duì)畜禽雜種優(yōu)勢(shì)做出快速有力的預(yù)測(cè)已經(jīng)成為一個(gè)研究熱點(diǎn)[1]。微衛(wèi)星標(biāo)記因具有數(shù)量多,基因組中分布廣泛,多態(tài)性豐富,呈孟德?tīng)柟诧@性遺傳方式,檢測(cè)容易、快速等優(yōu)點(diǎn)而越來(lái)越廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物研究中[2]。雜種優(yōu)勢(shì)的利用是提高家畜生產(chǎn)水平的重要手段,而對(duì)雜種優(yōu)勢(shì)的預(yù)測(cè)則是利用雜種優(yōu)勢(shì)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。因此,尋求最佳雜種優(yōu)勢(shì)預(yù)測(cè)方法一直是育種學(xué)研究的熱點(diǎn)問(wèn)題。本研究以幾個(gè)白羽半番鴨親本為研究對(duì)象,采用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)估測(cè)雜交親本間的遺傳距離,研究微衛(wèi)星標(biāo)記遺傳距離與雜交后代半番鴨生長(zhǎng)性狀雜種優(yōu)勢(shì)率的相關(guān)關(guān)系,以期為白羽半番鴨優(yōu)良雜交組合的選擇提供參考依據(jù)。
試驗(yàn)鴨共分為九組,包括1個(gè)父本(白番鴨),4個(gè)母本種鴨,其中:M18由克里莫公司培育、大型、中型和小型分別是以北京鴨、白羽蛋鴨與北京鴨雜交合成系以及蛋鴨為素材培育的專門(mén)化品系。4個(gè)雜交后代半番鴨(番鴨♂×大型♀、番鴨♂×中型♀和番鴨♂×小型♀)。每個(gè)親本及其雜交后代半番鴨各100~120只,共900~1 180只。試驗(yàn)鴨群同時(shí)出雛,全程飼養(yǎng)管理?xiàng)l件一致。飼養(yǎng)至70日齡時(shí),每組選取平均體重6只(公母各半)供屠宰試驗(yàn),同時(shí)親本各組隨機(jī)采血40只(公母各半),4 ℃保存?zhèn)溆茫糜谔崛⊙夯蚪MDNA,微衛(wèi)星標(biāo)記分析。
從20多個(gè)微衛(wèi)星引物中篩選了8個(gè)多態(tài)性較好的作為試驗(yàn)位點(diǎn)。所有引物均由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。
常規(guī)酚/氯仿提取DNA,溶于適量的TE(pH8.0)中,置于-20 ℃保存。
PCR反應(yīng)體系采用25 μL:模板DNA 50 ng,10×buffer 2.5 μL,dNTPs 0.2 mM,上下游引物各5 pM,Mg2+2.0 mM,Taq DNA聚合酶1 U。反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性4 min,94 ℃變性50 s,50~65 ℃復(fù)性50 s,72 ℃延伸1 min,30~35個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸10 min;4 ℃保存。擴(kuò)增產(chǎn)物95 ℃變性5 min后,放入冰水中冷卻,點(diǎn)樣6 μL在8%變性聚丙烯酰胺凝膠上電泳檢測(cè),200 V恒壓電泳,電泳時(shí)間的長(zhǎng)短依據(jù)DNA片段大小確定,電泳結(jié)束后銀染。
1.5.1 群體遺傳信息的計(jì)算 統(tǒng)計(jì)5個(gè)鴨群體的等位基因組成,利用PopGen32軟件計(jì)算各微衛(wèi)星座位的基因頻率,多態(tài)信息含量(Polymorplism Information Content, PIC)和平均雜合度(Heterozygosity, H);利用Phylip軟件計(jì)算各品種間的Nei氏遺傳距離(DA)。
表1 8對(duì)微衛(wèi)星引物信息Table 1 Information of 8 pair primers of microsatellite
1.5.2 雜種優(yōu)勢(shì)率的計(jì)算 每組試驗(yàn)鴨測(cè)定0~10周齡體重、耗料量,10周齡時(shí)隨機(jī)抽取接近組平均體重的6只試驗(yàn)鴨(公母各半)按照中華人民共和國(guó)農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(NY/T823-2004)“家禽生產(chǎn)性能名詞術(shù)語(yǔ)和度量統(tǒng)計(jì)方法”進(jìn)行相應(yīng)性狀的現(xiàn)場(chǎng)測(cè)定,計(jì)算各性狀雜交后代雜種優(yōu)勢(shì)率。雜種優(yōu)勢(shì)率(H%)的計(jì)算公式[3]如下:
H%=H/(P1+P2)/2×100%
式中:H為雜種優(yōu)勢(shì)值,P1、P2分別代表父本、母本均值。
1.5.3 遺傳距離與雜種優(yōu)勢(shì)率的相關(guān)分析 采用SPSS13.0軟件對(duì)親本間的遺傳距離與各性狀的雜種優(yōu)勢(shì)率進(jìn)行相關(guān)分析。
等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)、多態(tài)信息含量和基因雜合度,計(jì)算結(jié)果見(jiàn)表2。由表2可知,8個(gè)微衛(wèi)星測(cè)定的5個(gè)種群等位基因數(shù)在3.1250~4.0000之間,平均等位基因數(shù)為3.6250;有效等位基因數(shù)在2.5699~3.0737之間,平均有效等位基因數(shù)為2.8881;基因雜合度在0.5918~0.6580之間,平均基因雜合度為0.6331;多態(tài)信息含量在0.4222~0.5977之間,平均多態(tài)信息含量為0.5181。結(jié)果顯示5個(gè)種群的雜合度和多態(tài)性為中等。
表2 供試種群遺傳信息Table 2 Genetic information of populations tested
注:M18-M18母本;LFP-大型母本;MFP-中型母本;SFP-小型母本;MD-番鴨。下表同。
Note:M18-M18 female parent;LFP-Large female parent;MFP-Middle female parent;SFP-Small female parent;MD-Mule duck。The same in the below.
根據(jù)親本間的奈氏遺傳距離(DA)見(jiàn)表3。由表3可知,番鴨♂×M18♀的遺傳距離最大,其次番鴨♂×中型♀、番鴨♂×大型♀,而番鴨♂×小型♀的遺傳距離最小,分別為0.4452、0.3671、0.3623和0.3224。
2.3.1 親本間的遺傳距離與半番鴨日增重雜種優(yōu)勢(shì)率的相關(guān)性 表4為各親本及其后代半番鴨各周齡日增重實(shí)測(cè)值,表5為親本間的遺傳距離與半番鴨各周齡日增重雜種優(yōu)勢(shì)率的相關(guān)關(guān)系。由表5可知,4組半番鴨在各個(gè)周齡的累積日增重呈現(xiàn)明顯的雜種優(yōu)勢(shì),其中番鴨♂× M18♀最大,其次為番鴨♂×大型♀、番鴨♂×中型♀,番鴨♂×小型♀雜種優(yōu)勢(shì)最小。各組半番鴨的雜種優(yōu)勢(shì)率隨著周齡日益遞減。半番鴨日增重的雜種優(yōu)勢(shì)率與其親本間的遺傳距離相關(guān)分析結(jié)果表明,它們之間存在較強(qiáng)的正相關(guān)關(guān)系,相關(guān)系數(shù)在0.9285~0.9978,顯著性檢驗(yàn)結(jié)果表明親本間遺傳距離與8周齡日增重呈極顯著相關(guān)(P<0.01),與10周齡日增重呈顯著相關(guān)(P<0.05)。
表3 親本種群間的遺傳距離(DA)Table 3 Genetic distance between parental populations
表4 親本及后代半番鴨日增重實(shí)測(cè)值Table 4 Observerd value of ADG of parental population and its hybrid offspring with mule duck
表5 親本間遺傳距離與半番鴨日增重的相關(guān)性 Table 5 Correlation between genetic distance of parental populations and ADG of hybrid offspring of mule duck
注:*表示差異顯著,**表示差異極顯著。
Note: * means significant difference, ** means extreme difference.
2.3.2 親本間的遺傳距離與半番鴨飼料轉(zhuǎn)化率雜種優(yōu)勢(shì)率的相關(guān)性 表6為各親本及其后代半番鴨飼料轉(zhuǎn)化率實(shí)測(cè)值,表7為親本間的遺傳距離與半番鴨飼料轉(zhuǎn)化率雜種優(yōu)勢(shì)率的相關(guān)關(guān)系。由表7可知,4組半番鴨各周齡的累積飼料轉(zhuǎn)化率的雜種優(yōu)勢(shì)呈負(fù)值,且隨著周齡日益遞減。半番鴨累積飼料轉(zhuǎn)化率的雜種優(yōu)勢(shì)率與其親本間的遺傳距離相關(guān)分析結(jié)果表明,它們之間呈較強(qiáng)的負(fù)相關(guān)關(guān)系,相關(guān)系數(shù)在-0.8246~-0.9426,顯著性檢驗(yàn)結(jié)果表明各性狀相關(guān)系數(shù)均不顯著(P>0.05)。
表6 親本及后代半番鴨累積飼料轉(zhuǎn)化率實(shí)測(cè)值Table 6 Observerd value of feed conversion rate of parental population and its hybrid offspring with mule duck
2.3.3 親本間的遺傳距離與半番鴨10周齡屠宰性狀雜種優(yōu)勢(shì)率的相關(guān)性 表8為各親本及其后代半番鴨10周齡屠宰性狀實(shí)測(cè)值,表9為親本間的遺傳距離與半番鴨10周齡屠宰性狀雜種優(yōu)勢(shì)率的相關(guān)關(guān)系。由表9可知,4組半番鴨10周齡屠宰性狀中的半凈膛率、全凈膛率、胸肌率和腿肌率的雜種優(yōu)勢(shì)均呈正值,皮脂率和腹脂率呈負(fù)值。半番鴨10周齡屠宰性狀的雜種優(yōu)勢(shì)率與其親本間的遺傳距離相關(guān)分析結(jié)果表明,它們之間呈較強(qiáng)的正相關(guān)關(guān)系,相關(guān)系數(shù)0.7983~0.9378,顯著性檢驗(yàn)結(jié)果表明各性狀的相關(guān)系數(shù)均不顯著(P>0.05)。
表7 親本間遺傳距離與半番鴨飼料轉(zhuǎn)化率的相關(guān)性 Table 7 Correlation between genetic distance and heterosis of feed conversion rate
表8 親本及后代半番鴨10周齡屠宰性狀測(cè)定值Table 8 Observerd value of carcass traits at 10 weeks age of parental population and its hybrid offspring with mule duck
表9 親本間遺傳距離與半番鴨10周齡屠宰性狀的相關(guān)性Table 9 Correlation between genetic distance and heterosis of carcass traits at 10 weeks age
本研究所用的番鴨和M18母本是從法國(guó)克里莫公司引進(jìn)的經(jīng)多年提純選育的品種,大、中、小型白羽半番鴨母本為福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)過(guò)4~8個(gè)世代選育的白羽半番鴨母本專門(mén)化品系[4]。 利用8個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記測(cè)定的5個(gè)半番鴨親本種群均表現(xiàn)中度雜合度和多態(tài)性,這與5個(gè)親本均為高度選育的品系,基因純合度較高有關(guān)。
番鴨與各個(gè)母本雜交后代半番鴨的日增重、飼料轉(zhuǎn)化率和屠宰性能分別為番鴨♂×M18♀最高、番鴨♂×大型♀和番鴨♂×中型♀次之、而番鴨♂×小型♀最低。一般來(lái)說(shuō),來(lái)源差別較大的種群間雜交以及基因型相對(duì)較純的種群間雜交,可以獲得較大的雜種優(yōu)勢(shì)[5]。雜種優(yōu)勢(shì)的大小主要決定于雙親的遺傳差異和性狀互補(bǔ),差異越大雜種優(yōu)勢(shì)越明顯,而本研究獲得的結(jié)果可能是由于各個(gè)母本早期生長(zhǎng)速度差異較大,決定了各雜交組合各個(gè)性狀上的遺傳差異的原因。由估測(cè)的遺傳距離可以看出,番鴨♂×M18♀的遺傳距離最大,其次為番鴨♂×中型♀、番鴨♂×大型♀,而番鴨♂×小型♀的遺傳距離最小。一般而言,種群間的遺傳差異可用遺傳距離定量描述[6],遺傳距離越大,雜種優(yōu)勢(shì)越大。這與本研究結(jié)果相一致。
研究結(jié)果表明,親本間的遺傳距離與不同經(jīng)濟(jì)性狀呈正相關(guān)或負(fù)相關(guān),相關(guān)程度的大小亦不同。遺傳距離與雜交后代日增重呈強(qiáng)正相關(guān)關(guān)系,與飼料轉(zhuǎn)化率呈強(qiáng)負(fù)相關(guān)關(guān)系,與屠宰性狀的部分性狀呈正相關(guān)(10周齡的半凈膛率和全凈膛率等)或負(fù)相關(guān)系數(shù)(如腿肌率)。黃生強(qiáng)等[2]對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記與豬經(jīng)濟(jì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)關(guān)系的研究結(jié)果表明,遺傳距離與日增重、料肉比呈正相關(guān),與胴體性狀呈負(fù)相關(guān)。左福元等[7]開(kāi)展的肉牛雜交親本遺傳距離與雜種優(yōu)勢(shì)的相關(guān)性研究的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,親本間遺傳距離與體尺、體重雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)系數(shù)偏小(-0.003~0.304),未達(dá)到顯著水平。朱慶等[8]利用微衛(wèi)星分析了不同品系黃羽肉雞的遺傳距離與體重雜種優(yōu)勢(shì)的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)遺傳距離與后代體重雜種優(yōu)勢(shì)率多數(shù)沒(méi)有相關(guān)性,僅C×B組合遺傳距離與8周齡體重雜種優(yōu)勢(shì)率呈顯著相關(guān)。此外,國(guó)內(nèi)不少研究人員對(duì)其他物種進(jìn)行了相類似的研究。從研究結(jié)果可以看出,親本間的遺傳距離與雜種優(yōu)勢(shì)的相關(guān)程度隨不同性狀而異,造成差異的因素有很多,包括研究的物種不同,遺傳背景不同,選取微衛(wèi)星標(biāo)記的位點(diǎn)、數(shù)量不同,用于試驗(yàn)的樣本含量差異較大等因素。因此,要準(zhǔn)確評(píng)價(jià)微衛(wèi)星標(biāo)記遺傳距離與雜種優(yōu)勢(shì)的相關(guān)性,還需要更加深入地研究。
本研究表明,親本種群間的遺傳距離與后代半番鴨累積日增重呈強(qiáng)正相關(guān),與飼料轉(zhuǎn)化率呈強(qiáng)負(fù)相關(guān),與10周齡的屠宰性狀均呈較強(qiáng)相關(guān)關(guān)系,相關(guān)系數(shù)均達(dá)到0.8以上。利用微衛(wèi)星標(biāo)記預(yù)測(cè)半番鴨主要經(jīng)濟(jì)性狀的雜種優(yōu)勢(shì)是可行的。
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