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    不同物候期柑橘葉片鉀素水平預(yù)測建模

    2013-10-09 11:18:58黃雙萍岳學(xué)軍洪添勝吳偉斌黎蘊玉
    關(guān)鍵詞:皮爾森物候柑橘

    黃雙萍,岳學(xué)軍,4,洪添勝,吳偉斌,黎蘊玉

    (1.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)南方農(nóng)業(yè)機械與裝備關(guān)鍵技術(shù)省部共建教育部重點實驗室,廣東廣州510642;2.國家柑橘產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系機械研究室,廣東廣州510642;3.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 工程學(xué)院,廣東 廣州510642;4.南昆士蘭大學(xué) 工程與測繪學(xué)院,圖文巴QLD4350)

    鉀(K)是柑橘樹體內(nèi)活性極強的營養(yǎng)元素,適量的K素對柑橘果實發(fā)育和品質(zhì)起著十分重要的作用.為精準(zhǔn)動態(tài)地調(diào)整K肥噴施用量,保證柑橘樹體內(nèi)K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)適中,需要對K素營養(yǎng)水平進行無損檢測.

    近年來,隨著光譜技術(shù)的發(fā)展,利用光譜數(shù)據(jù)進行植物營養(yǎng)成分分析的研究日漸見多[1-19],但這些研究的工作主要是集中在植物氮素含量分析[1-7,9-10,12-15,18].國內(nèi)外基于光譜數(shù)據(jù)對植物 K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)進行預(yù)測建模的研究為數(shù)不多[8,11,17,19].郭賀等[8]利用近紅外光譜快速無損測定煙葉氮鉀含量,喬欣等[11]利用冠層光譜信息估算大豆全鉀含量,邢東興等[17]基于反射光譜率對蘋果樹鮮葉全氮、全磷、全鉀含量進行測定與分析.P.Menesatti等[19]利用近紅外-可見光譜定量測試柑橘葉片包括K在內(nèi)的多種營養(yǎng)元素含量,但沒有關(guān)注不同物候期的差異.易時來等[20]研究盆栽錦橙葉片鉀含量光譜監(jiān)測模型,取得0.82的預(yù)測相關(guān)系數(shù).這些研究結(jié)果表明,利用光譜技術(shù)檢測植物鉀營養(yǎng)狀態(tài)是有效可行的.

    文中以廣州市蘿崗區(qū)蟹莊村柑橘園117株羅崗橙樹為試驗對象,用ASD公司高光譜儀FieldSpec3采集柑橘萌芽期、穩(wěn)果期、壯果促梢期和采果期4個物候期鮮葉反射光譜值,構(gòu)成柑橘樹葉片樣本多元矢量描述.用火焰光度法測試同期同批葉片K素質(zhì)量分?jǐn)?shù),多元高光譜描述與K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)實測值構(gòu)成建模數(shù)據(jù)集.

    1 材料與方法

    1.1 樣本樹種植管理

    試驗選擇廣州市蘿崗區(qū)蟹莊村柑橘園117株4年生蘿崗橙樹為研究對象,這些樹位于柑橘園同一區(qū)域,生長狀況基本一致.對柑橘樹樣品進行規(guī)范化種植管理:參照嶺南柑橘品種生長發(fā)育程度,分別在萌芽期、穩(wěn)果期、壯果促梢期與采果期施用純度為45%,化學(xué)成分為氯化鉀(KCl)的鉀肥;為精確控制施肥處理,試驗采用2種不同鉀肥水平施肥,分別記為K1,K2,2種水平K肥全年施用量分別為490.67 g和122.67 g;117株樣本中,各有54株按照K1、K2水平施肥,剩下9株不施K肥;根據(jù)柑橘在不同生長時期對K肥的需求不同,分別在2011年2月、4月、6月、8月施用占全年總量的30%,30%,25%,15%的K肥.柑橘園內(nèi)保證良好的光照條件;在生長期內(nèi)灌溉頻度為每周2次;加配富含有機質(zhì),含水量高,pH值為4~5的疏松泥炭蘚或共生苔蘚的土壤.

    1.2 建模數(shù)據(jù)采集

    柑橘葉片采集時間為每次施肥15 d后,共采集了4次:2011年2月20日、4月24日、6月26日和8月23日.每株樹分東南西北和上下層共采集8片大小均勻的健康葉片,選位于頂梢起向下數(shù)的第3至第4片鮮葉.用ASD Fieldspec3采集柑橘鮮葉片的光譜反射值,8片葉子光譜反射值的均值作為柑橘樣本的光譜描述.該儀器光譜范圍為350~2 500 nm,光譜分辨率在350~1 000 nm范圍內(nèi)為3 nm,在1 000~2 500 nm范圍內(nèi)為7 nm;采樣間隔在350~1 000 nm范圍內(nèi)為1.4 nm,在1 000~2 500 nm范圍內(nèi)為2 nm.光譜采集時,從葉片基部將葉片完整裁剪下,將待測葉片展開平鋪于反射率近似為零的黑色橡膠上,入射光纖及人工光源Pro Lamp(A128932)通過手柄安裝在采集支架上,入射光纖探頭垂直向下,正對待測葉片,探頭與待測葉片距離6 cm(視場直徑約0.52 cm,小于葉片寬度),使待采集葉片的相應(yīng)部位充滿探測頭視場.人工光源天頂角為30°,方向與葉片保持一致.分別在每片葉子的葉尖、葉中、葉基附近采集3次,從葉尖開始采集光譜至葉片基部結(jié)束,取其平均值作為觀測葉片的光譜反射值.每次測量前均用白板校正,采集暗電流25次,白板10次.FieldSpec3輸出數(shù)據(jù)間隔為1 nm,因此,每株柑橘樣本的光譜描述是2 151維多元矢量.每株柑橘樹的8片鮮葉均勻混合后作為一個樣品,取樣品經(jīng)消煮或浸提后的稀釋液體,用火焰光度法測定稀釋液的鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù).不同批次117株柑橘樹樣本的葉片平均高光譜反射率見圖1,鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù)統(tǒng)計數(shù)據(jù)見表1.

    圖1 不同物候期117株柑橘樣本平均反射光譜

    表1 實驗室測定的不同物候期K素質(zhì)量分?jǐn)?shù) ‰

    從圖1看出,4個物候期的柑橘葉片在350~650 nm可見光區(qū)內(nèi)反射率較弱,在550 nm處有一個強反射峰.在650~700 nm,反射光譜迅速增強.在700~1 250 nm內(nèi)反射率處于高位,且隨著波長增加呈現(xiàn)非顯著的降低趨勢,形成一個高的“反射平臺”.由此可知,柑橘葉片反射光譜曲線在小于1 250 nm內(nèi)的可見光和近紅外光區(qū)內(nèi)呈現(xiàn)的規(guī)律和前人研究基本一致[20].在1 250~1 400 nm紅外區(qū)內(nèi),反射光譜迅速下降至局部谷點,在1 400~1 850 nm內(nèi),反射率又從谷點迅速上升,形成第2個反射值高位區(qū)間.在1 850~1 900 nm間反射值再次迅速下降至接近零的位置,1 900~2 400 nm之間又形成一個“反射山峰”.

    2 試驗結(jié)果分析

    2.1 鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù)敏感波段飄移現(xiàn)象分析

    柑橘在不同物候期對鉀素的需求不同,不同物候期測得的柑橘葉片反射光譜是其生理狀態(tài)和物理化學(xué)組分的綜合反映.本節(jié)試驗研究反射光譜與葉片鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù)間相關(guān)性在不同物候期呈現(xiàn)的規(guī)律,為柑橘在不同物候期鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù)的光譜監(jiān)測建模提供依據(jù).

    皮爾森(Pearson)相關(guān)系數(shù)r是反映2個變量x和y線性相關(guān)程度的統(tǒng)計量,其計算公式如下:

    圖2 反射光譜與K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)相關(guān)性分析

    式中:下標(biāo)i表示變量的不同抽樣值;n為樣本量;r的取值范圍是[-1,1].根據(jù)統(tǒng)計學(xué)理論,0.3≤|r|<0.8表示2個變量中等程度線性相關(guān),0.8≤|r|≤1表示強線性相關(guān),0<|r|≤0.3表示弱線性相關(guān),r=0表示非線性相關(guān).當(dāng)r>0時,表明2個變量正相關(guān),否則負(fù)相關(guān).

    選取4個批次K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)實測數(shù)據(jù)各117個,分別與350~2 500 nm波長范圍的反射率進行皮爾森相關(guān)系數(shù)分析計算,圖2畫出皮爾森系數(shù)曲線和相應(yīng)顯著性水平曲線.

    4個物候期分別對應(yīng)子圖2a-d,綜合4批數(shù)據(jù)的全發(fā)育期對應(yīng)子圖2e.圖中實線為皮爾森系數(shù)曲線,用藍(lán)色“□”標(biāo)注大于0.3的皮爾森系數(shù);虛線為顯著性水平曲線,用紅色“?”標(biāo)注小于等于0.01的顯著性校驗值.

    從圖2a看出,萌芽期內(nèi)顯著性水平為0.01的K素敏感特征波段位于1 000 nm內(nèi),全波段區(qū)間鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù)和反射光譜呈正線性相關(guān).從圖2b看出,穩(wěn)果期K素敏感特征波段主要位于700 nm以內(nèi)的可見光區(qū),但在1 900~1 960 nm的短波紅外區(qū)出現(xiàn)新的鉀素敏感特征波段.相比萌芽期,穩(wěn)果期在700~1 900 nm內(nèi)出現(xiàn)較寬范圍的弱負(fù)線性相關(guān)波段區(qū).壯果促梢期(圖2c)的弱負(fù)相關(guān)頻率區(qū)域相比穩(wěn)果期變窄,可見光區(qū)內(nèi)特征波段線性相關(guān)曲線包絡(luò)相比萌芽期有明顯變化,其中萌芽期包絡(luò)有明顯單峰特性,而壯果促梢期包絡(luò)曲線較為平坦.采果期(圖2d)顯著性為0.01的中度以上相關(guān)波段最遠(yuǎn)漂移至2 478~2 500 nm(見表2),可見光區(qū)出現(xiàn)皮爾森系數(shù)大于0.3的中等程度負(fù)線性相關(guān)的光譜波段為350,351和358 nm.這些分析表明,柑橘鉀素敏感光譜特征波段隨著不同物候期生物特性的變化,呈現(xiàn)明顯漂移現(xiàn)象.

    表2列出4個物候期和全發(fā)育期與鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù)中等程度線性相關(guān)的波段(即|r|≥0.3),且顯著性水平為0.01.

    表2 不同物候期鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù)敏感特征波段

    2.2 不同物候期鉀素預(yù)測建模結(jié)果分析

    由于柑橘在發(fā)育周期內(nèi)隨不同物候期出現(xiàn)K素敏感特征波段飄移現(xiàn)象,本節(jié)試驗進一步研究不同物候期鉀素預(yù)測建模規(guī)律.

    根據(jù)2.1節(jié)所述,選擇顯著性水平為0.01,皮爾森系數(shù)大于0.3的波長點作為K素敏感特征波段.如表2所示,萌芽期、穩(wěn)果期、壯果促梢期、采果期和全發(fā)育期分別選擇514,266,244,190和609 nm特征波段反射值構(gòu)成描述柑橘葉片樣本的多元矢量.文中試驗總共采集4個物候期4批次數(shù)據(jù),單批次樣本數(shù)為117,總樣本數(shù)為468.每次試驗任意選擇80%的數(shù)據(jù)用作訓(xùn)練建模,其他20%用作測試.試驗選定模型決定系數(shù)R2,均方誤差MSE(mean square error),平均相對誤差REa(average relative error)等指標(biāo),用以評估回歸模型性能.每個試驗方案獨立運行20次,取20次性能指標(biāo)的均值和標(biāo)準(zhǔn)差作為試驗結(jié)果記錄.模型性能在測試集上評估.

    2.2.1 多元線性回歸建模

    本節(jié)試驗用多元線性回歸法(multiple linear regression,MLR)[21]建立鉀素光譜監(jiān)測模型.試驗中采用Matlab(R2011a)命令regress編程實現(xiàn),試驗結(jié)果見表3.

    表3 不同物候期反射光譜M LR建模性能評估

    從表3看出,萌芽期和采果期K素光譜監(jiān)測模型R2分別為0.812和0.610,模型決定系數(shù)偏低;MSE分別為0.728和99.590,REa分別為4.19%和11.30%,均方誤差和平均相對誤差偏大;穩(wěn)果期及壯果促梢期模型決定系數(shù)R2都低于0.3,模型幾乎沒有預(yù)測能力.由此可知,提取與鉀素質(zhì)量分?jǐn)?shù)中等以上線性相關(guān)的光譜特征波段建立多元線性回歸模型,模型精度低,預(yù)測性能差.圖3畫出全發(fā)育期K素敏感特征波段間皮爾森相關(guān)系數(shù)比率統(tǒng)計分布曲線,其中縱軸表示顯著性為0.01時,敏感特征波段間皮爾森系數(shù)累計比率(例如,橫軸為0.5的點表示皮爾森系數(shù)小于等于0.5的特征波段比率約為0.25,以此類推).從圖3可以看出,顯著波段間皮爾森系數(shù)大于0.3的比例高達(dá)90%,大于0.8的達(dá)50%.由此可知,特征光譜波段間多重共線性突出,從而導(dǎo)致其構(gòu)成的矢量空間線性不可分.因此,試驗進一步研究基于核的非線性回歸SVR建模和去相關(guān)PLS建模效果.

    圖3 全發(fā)育期敏感波段皮爾森系數(shù)累計比率

    2.2.2 支持矢量回歸建模

    支持矢量回歸[22]是一個專門針對有限樣本情況的學(xué)習(xí)機器,其優(yōu)化的基本思想是結(jié)構(gòu)風(fēng)險最小化,即在數(shù)據(jù)逼近精度與逼近函數(shù)復(fù)雜性之間尋求折衷,以期獲得最好的模型泛化能力.SVR最終解決的是一個凸二次規(guī)劃問題,從理論上說,得到的將是全局最優(yōu)解.SVR巧妙地利用核函數(shù),將復(fù)雜的實際問題通過非線性變換轉(zhuǎn)換到高維特征空間,在高維空間中構(gòu)造線性決策函數(shù)來實現(xiàn)原空間中的非線性決策.核函數(shù)的引進,巧妙地規(guī)避高維映射定義和高維空間內(nèi)積運算問題,用線性方法解決線性不可分的數(shù)據(jù)回歸分析問題,并保證模型有較好的推廣能力.

    試驗中調(diào)用libsvm軟件包編程實現(xiàn),選擇RBF核函數(shù),并用格子搜索和交叉驗證的方法,搜索最佳模型參數(shù)和核函數(shù)參數(shù).試驗結(jié)果見表4.

    比較表3和表4,基于K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)敏感光譜特征波段的支持矢量回歸(SVR)模型預(yù)測性能相比多元線性回歸(MLR)模型明顯提升,每個物候期模型R2均明顯提升,達(dá)到0.94以上,壯果促梢期預(yù)測模型MSE最低僅為0.036,采果期預(yù)測模型REa低至1.01%.這種線性(MLR)和非線性(SVR)預(yù)測模型性能的顯著差異,表明K素敏感特征波段構(gòu)成的特征空間呈現(xiàn)較為復(fù)雜的非線性,而基于核的非線性SVR建模方法明顯提高了K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)預(yù)測精度.

    表4 不同物候期反射光譜SVR建模性能評估

    2.2.3 偏最小二乘法建模

    偏最小二乘法[23]是一種多元數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析方法,特別適用于解釋變量個數(shù)大于樣本量的問題,常用于光譜數(shù)據(jù)分析.該方法的分析過程同時實現(xiàn)多元線性回歸、主成分分析以及典型相關(guān)分析.其中主成分分析基于原始變量,綜合出盡可能少的互不相關(guān)的新變量,而這些新變量盡可能多地保持原始數(shù)據(jù)的信息.因此,PLS建模過程中,在一定程度上去除了原始變量間的相關(guān)性.

    試驗利用Matlab R2011a命令plsregress建模,該命令的核心算法是1993年Jong S.De[24]提出的簡單偏最小二乘.plsregress的參數(shù)ncomp是直接影響模型性能的重要參數(shù),試驗在閉區(qū)間[1,min(樣本數(shù)-1,樣本維度)]中根據(jù)最小均方誤差原則,采用交叉驗證方式搜索最佳參數(shù)值.試驗結(jié)果見表5.

    從表5可以看出,采果期的PLS預(yù)測模型R2達(dá)0.991,REa低至0.974%,壯果促梢期模型MSE為0.036.4個物候期中,穩(wěn)果期模型精度略差,其R2為0.867,MSE為 0.292,REa為 3.169%.對比表 3和表5,各個物候期預(yù)測模型R2均明顯提升,且MSE和REa顯著下降,表明基于K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)敏感光譜特征波段的PLS回歸模型相比MLR性能明顯提升.由此可知,PLS建模過程中的主成分分析一定程度去除了原始變量間的相關(guān)性,其模型預(yù)測性能明顯超出基于特征波段直接構(gòu)成的矢量空間而建立的線性模型,提高了K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)預(yù)測精度.比較表4和表5,萌芽期和采果期PLS模型性能較好,穩(wěn)果期和全發(fā)育期SVR模型性能較好,而壯果促梢期PLS與SVR模型性能基本一致.

    表5 不同物候期反射光譜PLS模型性能評估

    3 結(jié)論

    1)柑橘在不同物候期K素敏感光譜特征波段存在飄移現(xiàn)象.

    2)K素敏感特征波段構(gòu)成的矢量空間由于波段間多重共線性而呈現(xiàn)復(fù)雜的非線性,因此用MLR建立的K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)預(yù)測模型性能較差.

    3)SVR基于核實現(xiàn)非線性建模,PLS用主成分提取法去除原始變量間的相關(guān)性再建立線性模型,這2種建模思路均較好地解決光譜波段間多重共線性問題.

    4)雖然不同物候期敏感特征波段存在漂移現(xiàn)象,但將4個物候期數(shù)據(jù)混合建模也取得了較佳的預(yù)測效果,因此為簡單起見,可以在柑橘全生育期內(nèi)進行K素質(zhì)量分?jǐn)?shù)光譜建模.

    5)全發(fā)育期MLR,PLS,SVR綜合預(yù)測模型中,SVR取得最佳預(yù)測性能,其R2=0.994,MSE=0.120,平均相對誤差為1.33%.

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