郭 瓊,王 劍,姚俊華,雷玲芳,陳小潔,鄧 蕓,黃兆勝,張翠仙
(1.廣州中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院,廣東廣州 510006;2.廣州中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,廣東廣州 510006;3.中山大學(xué)分析測(cè)試中心,廣東廣州 510275)
海洋微生物由于長(zhǎng)期生長(zhǎng)于高鹽、高壓、低溫和寡營(yíng)養(yǎng)的特殊生境中,導(dǎo)致其產(chǎn)生結(jié)構(gòu)獨(dú)特、新穎并具有高活性、高藥效的先導(dǎo)化合物。海洋微生物不僅具有環(huán)境友好、可持續(xù)發(fā)展的特點(diǎn),同時(shí)也是新穎結(jié)構(gòu)天然產(chǎn)物和活性天然產(chǎn)物的重要來(lái)源[1-8]。本課題組在研究海洋微生物混合共培養(yǎng)過(guò)程中細(xì)菌對(duì)真菌次生代謝產(chǎn)物的影響時(shí),發(fā)現(xiàn)海洋珊瑚內(nèi)生細(xì)菌L-4使真菌菌落生長(zhǎng)增快;相反內(nèi)生細(xì)菌B-2使真菌生長(zhǎng)延遲,甚至死亡。同時(shí)通過(guò)TLC分析發(fā)現(xiàn)混合培養(yǎng)時(shí)產(chǎn)生此二者微生物單獨(dú)培養(yǎng)時(shí)所不產(chǎn)生的物質(zhì)。同時(shí)抗腫瘤活性研究表明,L-4和B-2均具有抗腫瘤活性?;诖?,為了闡明混合培養(yǎng)時(shí)可能的代謝機(jī)制和發(fā)現(xiàn)抗腫瘤活性藥物先導(dǎo)化合物,首先對(duì)L-4的次生代謝產(chǎn)物進(jìn)行研究,初步從其發(fā)酵液中分離得到8個(gè)單體化合物,采用現(xiàn)代波譜技術(shù)和物理常數(shù)對(duì)照確定其結(jié)果依次為:環(huán) (色 -丙)二肽 (1)、環(huán) (甘 -酪)二肽 (2)、環(huán) (丙-酪)二肽 (3)、環(huán) (纈-酪)二肽 (4)、環(huán) (甘-苯丙)二肽 (5)、環(huán)(甘-脯)二肽 (6)、環(huán) (丙 -纈)二肽 (7)、和環(huán) (甘-丙)二肽 (8)。所有化合物首次從南海珊瑚內(nèi)生細(xì)菌中分離得到,且均為環(huán)二肽類化合物。
環(huán)二肽 (cyclic dipeptides)又名2,5-二氧哌嗪 (2,5-dioxopiperazines)或2,5-二酮哌嗪 (2,5-diketopiperazines),由兩個(gè)氨基酸通過(guò)肽鍵環(huán)合形成,是自然界中最小的環(huán)肽。目前自然界中存在的環(huán)二肽一般由α-L-氨基酸形成相對(duì)穩(wěn)定的六元環(huán)。此類物質(zhì)研究表明具有抑菌、抗腫瘤、心腦血管系統(tǒng)、神經(jīng)保護(hù)及脫癮解毒方面具有重要的生理活性[9],但能否在抗生素、抗腫瘤劑、抗凝血?jiǎng)?、神?jīng)保護(hù)劑、益智劑以及脫癮劑等藥物的研發(fā)中具有一定的應(yīng)用價(jià)值,仍有待深入研究。
AVANCE AV 400核磁共振儀 (瑞士Bruker公司),內(nèi)標(biāo)為 TMS,溶劑為氘代吡啶 (Pyr-d5);DSQ質(zhì)譜儀 (美國(guó)Thermo);制備型HPLC色譜柱(大連依利特):Kromasil 100-5-18-C18柱 (10 mm×250 mm,5 μm),葡萄糖、蛋白胨、酵母粉、蔗糖為生化試劑,購(gòu)于廣東環(huán)凱微生物科技有限公司。石油醚、乙酸乙酯、甲醇、氯仿等為市售AR試劑。制備液相中甲醇為色譜級(jí) (Merk公司)。
圖1 珊瑚內(nèi)生細(xì)菌L-4中的環(huán)二肽結(jié)構(gòu)1,2,3,4,5,6,7,8Fig.1 Structures of compounds 1,2,3,4,5,6,7,8 from coral-derived bacteria L - 4
實(shí)驗(yàn)用微生物L(fēng)-4和B-2由海南大學(xué)提供(種屬鑒定中,樣品編號(hào)L-4,B-2保存于廣州中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院海洋微生物實(shí)驗(yàn)室)。
內(nèi)生細(xì)菌L-4在馬鈴薯培養(yǎng)基 (馬鈴薯200 g,葡萄糖10 g,蔗糖20 g,蛋白胨2 g,人工海水100 mL,容至1 L,自然pH)中28℃下?lián)u瓶培養(yǎng)2 d,加入5 mL甲醇停止發(fā)酵,共發(fā)酵200 L。發(fā)酵液高速離心得菌絲體和上清液。上清液濃縮后依次用乙酸乙酯 (EtOAc)、正丁醇 (n-BuOH)萃取。乙酸乙酯萃取液減壓濃縮,得黃褐色浸膏(53 g)。將乙酸乙酯浸膏 (53 g)經(jīng)硅膠 (200~300目;60 g)拌樣,裝柱硅膠 (200~300目;500 g)進(jìn)行正相硅膠柱層析,采用極性逐漸增大的石油醚-乙酸乙酯體系 (V(PE)∶V(EtOAc)=10∶0、9∶1、8∶2、7∶3、6∶4、1∶1、4∶6、3∶7、2∶8、1∶9、0∶10)進(jìn)行洗脫,TLC 跟蹤并合并流分,共得16個(gè)流份。具體分離見(jiàn)分離流程圖 (圖2)。
圖2 化合物1,2,3,4,5,6,7,8分離流程圖Fig.2 Separation process of EtOAc fraction from coral-derived bacteria L - 4
化合物1:淡黃色粉末,φ=10%香草醛顯色劑顯紫紅色。分子式 C14H15N3O2。ESI-MSm/z:256 [M-H]-。1H NMR(400 MHz,Pyr-d5) δH:11.79(1H,s),9.03(1H,br s),8.91(1H,br s),8.45(1H,d,8.0),7.53(1H,d,8.0),7.45(1H,s),7.23(1H,q,8.0),7.20(1H,q,7.2),4.66(1H,m),4.18(1H,m),3.69(2H,m),1.17(3H,d,6.8);13C NMR(100 MHz,Pyrd5)δC:169.8(CH),168.9(C),138.1(CH),129.3(CH),126.0(CH),122.4(CH),120.3(CH),120.0(CH),112.5(CH),110.6(CH),57.4(CH),51.8(CH2),31.7(CH2),21.1(CH3)。
化合物2:白色粉末。碘熏顯色。分子式C11H12N2O3。ESI-MSm/z:219 [M-H]-。1H NMR(400 MHz,Pyr-d5)δH:11.36(1H,br s),9.26(1H,s),8.97(1H,s),7.38(2H,d,8.4),7.08(2H,d,8.4),4.57(1H,m),3.93(1H,dd,16.8,3.2),3.53(1H,d,16.8),3.44(1H,dd,16.2,5.6),3.24(1H,dd,13.5,4.2);13C NMR(100 MHz,Pyr-d5)δC:168.5(C),166.7(C),157.9(C),131.9(2 × CH),126.6(CH),116.0(2 ×CH),57.3(CH),44.8(CH2),39.8(CH2)。
化合物3:白色粉末,易溶于甲醇。碘熏顯色。分子式 C12H14N2O3。ESI-MSm/z:233 [MH]-。1H NMR(400 MHz,Pyr-d5)δH:11.32(1H,br s),9.10(1H,s),9.07(1H,s),7.40(2H,d,8.4),7.10(2H,d,8.4),4.60(1H,m),4.20(1H,m),3.51(1H,dd,16.0,5.2),3.30(1H,dd,13.4,4.2),1.30(3H,d,7.2);13C NMR(100 MHz,Pyr-d5)δC:169.8(C),168.8(C),154.5(C),132.8(2 × CH),129.3(CH),115.6(2 ×CH),60.3(CH),54.7(CH2),37.4(CH2),17.0(CH3)。
化合物4:白色粉末,易溶于甲醇。碘熏顯色。分子式 C14H18N2O3。ESI-MSm/z:261 [MH]-。1H NMR(400 MHz,Pyr-d5)δH:11.26(1H,br s),9.05(1H,s),9.01(1H,s),7.38(2H,d,8.0),7.10(2H,d,8.2),4.60(1H,m),4.07(1H,m),3.49(1H,dd,16.2,5.4),3.37(1H,dd,13.4,4.2),2.42(1H,m),1.12(3H,d,7.2),0.97(3H,d,6.8);13C NMR(100 MHz,Pyr-d5)δC:169.1(C),168.6(C),158.9(C),132.7(2 × CH),128.5(CH),117.2(2 × CH),62.0(CH),58.3(CH),41.3(CH),33.6(CH2),20.2(CH3),18.2(CH3)。
化合物5:白色粉末 (甲醇)。碘熏顯色。分子式 C11H12N2O2。ESI-MSm/z:203 [M-H]-。1H NMR(400 MHz,Pyr-d5)δH:9.29(1H,s),9.01(1H,s),7.24 ~7.45(2H,m),7.26 ~7.19(3H,m),4.59(1H,m),3.96(1H,dd,17.2,3.2),3.50(1H,d,17.2),3.45(1H,dd,13.2,5.6),3.29(1H,dd,13.2,4.4);13C NMR(100 MHz,Pyr-d5)δC:168.4(C),166.7(C),136.9(C),130.7(2 × CH),128.7(CH),127.2(2 × CH),57.3(CH),45.0(CH2),40.8(CH2)。
化合物6:無(wú)色透明方型結(jié)晶 (甲醇),θmp205~208℃。茚三酮試劑不顯色,高錳酸鉀試劑顯亮黃色斑點(diǎn)。分子式C7H10N2O2。ESI-MSm/z:153 [M-H]-。1H NMR(400 MHz,Pyr-d5) δH:9.12(1H,s),4.17(2H,br t,16.2),4.09(1H,td,16.0,4.4),3.60(1H,dt,8.2,3.2,11.2),3.45(1H,td,10.0,3.2),2.26(1H,m),2.09(1H,m),1.68(1H,m),1.62(1H,m);13C NMR(100 MHz,Pyr-d5)δC:171.3(C),165.6(C),60.2(CH),48.2(CH2),46.6(CH2),30.11(CH2),23.8(CH2)。
化合物7:白色粉末,易溶于甲醇。TLC呈:254 nm下無(wú)暗斑,香草醛濃硫酸不顯色,茚三酮顯色陰性。分子式 C8H14N2O2。ESI-MSm/z:169[M-H]-。1H NMR(400 MHz,Pyr-d5)δH:9.18(1H,s),8.90(1H,s),4.34(1H,q,6.4),4.15(1H,m,),2.65(1H,m),1.68(3H,d,7.2),1.16(3H,d,6.8),1.11(3H,d,6.8);13C NMR(100MHz,Pyr-d5)δC:169.7(C),167.8(C),60.9(CH),51.1(CH),32.1(CH),21.0(CH3),19.1(CH3),17.0(CH3)。
化合物8:白色粉末,茚三酮顯色陰性。分子式 C5H8N2O2。ESI-MSm/z:127 [M-H]-。1H NMR(400 MHz,Pyr-d5)δH:9.27(1H,s),9.06(1H,s),4.25(1H,q,6.8,),4.24(2H,br s),1.62(3H,d,7.8)。13C NMR(100 MHz,Pyr-d5)δC:170.8(C),168.1(C),51.9(CH),46.7(CH2),20.3(CH3)。
化合物1淡黃色粉末,φ=10%香草醛顯色劑顯紫紅色。1H NMR 中 δH9.03(1H,br s)和 8.91(1H,br s)為氨基上的活潑氫信號(hào),同時(shí)13C NMR譜中δC169.8(s),168.9(s)為兩個(gè)酰胺羰基碳信號(hào),δH4.66(1H,m)和4.18(1H,m)為氮雜環(huán)中叔碳上的質(zhì)子信號(hào),推測(cè)1可能為環(huán)二肽類化合物。其中 δH11.79(1H,br s)、8.45(1H,d,8.0)、7.53(1H,d,8.0)、7.45(1H,s)、7.23(1H,q,8.0)、7.20(1H,q,7.2)、δH4.66(1H,m)及3.69(2H,m)推斷結(jié)構(gòu)中有色氨酸片段,結(jié)合 δH4.18(1H,m)及1.17(3H,d,6.8)推斷可能有丙氨酸片段。將化合物1的NMR數(shù)據(jù)與文獻(xiàn) [10-11]環(huán) (色-丙)二肽對(duì)照,基本一致,確定1為環(huán) (色-丙)二肽 (cyclo(Trp-Ala))。
化合物2白色粉末,碘熏顯色。1H NMR中:δH9.26(1H,s)和8.97(1H,s)為2個(gè)氨基上的氫信號(hào);同時(shí)13C NMR 中 δC168.5(s),166.7(s)為兩個(gè)酰胺羰基碳信號(hào),說(shuō)明該化合物可能是一個(gè)環(huán)二肽類物質(zhì)。δH7.38(2H,d,8.4)和 7.08(2H,d,8.4)為典型對(duì)位取代芳環(huán)上的質(zhì)子信號(hào),以及 δC157.9(s)、131.9(d)、126.6(s)、116.0(d)信號(hào)與酪氨酸的碳信號(hào)接近,同時(shí)δH3.44(1H,dd,16.2,5.6)和 3.24(1H,dd,13.5,4.2)為1個(gè)亞甲基上的2個(gè)質(zhì)子信號(hào),且這2個(gè)質(zhì)子信號(hào)化學(xué)環(huán)境不同,結(jié)合δH4.57(1H,m)及δC57.3(d)、44.8(d),可推斷該化合物含酪氨酸殘基。δH3.93(1H,dd,16.8,3.2)、3.53(1H,d,16.8)和 δC166.7(s)、39.8(t)提示該化合物含甘氨酸殘基,由于有芳環(huán)支鏈的環(huán)二肽可能存在折疊構(gòu)象[12],折疊構(gòu)象使甘氨酸片段的亞甲基質(zhì)子受苯環(huán)的屏蔽影響,化學(xué)位移向高場(chǎng)偏移。將化合物2的NMR數(shù)據(jù)與文獻(xiàn) [13]環(huán) (甘-酪)二肽對(duì)照,基本一致,確定2為環(huán) (甘-酪)二肽 (cyclo(Gly-Tyr))。
化合物3,白色粉末,碘熏顯色。1H NMR譜中:δH9.10(1H,s)和9.07(1H,s)為2個(gè)氨基上的氫信號(hào);同時(shí)13C NMR譜中 δC169.8(s),168.8(s)為兩個(gè)酰胺羰基碳信號(hào),說(shuō)明為環(huán)二肽類物質(zhì)。δH7.40(2H,d,8.4)和7.10(2H,d,8.4)為典型對(duì)位取代芳環(huán)上的質(zhì)子信號(hào),以及δC154.5(s)、132.8(s)、129.3(s)、115.6(s)信號(hào)與酪氨酸的碳信號(hào)接近,同時(shí)δH3.51(1H,dd,16.0,5.2)和3.30(1H,dd,13.4,4.2)為1個(gè)亞甲基上的2個(gè)質(zhì)子信號(hào),且這2個(gè)質(zhì)子信號(hào)化學(xué)環(huán)境不同,結(jié)合 δH4.60(1H,m)及 δC60.3(d)、37.4(d),可推斷該化合物含苯丙氨酸殘基。δH4.20(1H,m)和 1.30(3 H,d,7.2)及δC54.7(d)、20.3(q,C -3)暗示結(jié)構(gòu)中存在丙氨酸殘基。將其 NMR數(shù)據(jù)與文獻(xiàn) [14-15]環(huán)(丙-酪)二肽對(duì)照,基本一致,確定3為環(huán) (丙-酪)二肽 (cyclo(Ala-Tyr))。
化合物4,白色粉末,易溶于甲醇。1H NMR中:δH9.05(1H,s)和9.01(1H,s)為2個(gè)氨基上的氫信號(hào);同時(shí)13C NMR中δC169.1(s),168.9(s)為兩個(gè)酰胺羰基碳信號(hào),說(shuō)明其為環(huán)二肽類物質(zhì)。δH7.38(2H,d,8.04)和 7.10(2H,d,8.2)為典型對(duì)位取代芳環(huán)上的質(zhì)子信號(hào),以及δC158.9(s)、132.7(d)、128.5(s)、117.2(d)信號(hào)與酪氨酸殘基信號(hào)相似,同時(shí)δH3.49(1H,dd,16.2,5.4)和 3.37(1H,dd,13.4,4.2)為 1 個(gè)亞甲基上的2個(gè)質(zhì)子信號(hào),且此二質(zhì)子信號(hào)化學(xué)環(huán)境不同,結(jié)合 δH4.60(1H,m)及 δC58.3(d)、41.3(d),可推斷該化合物含苯丙氨酸殘基。δH2.42(1H,m)、1.12(3H,d,7.2)、0.97(3H,d,6.8)顯示結(jié)構(gòu)中含異丙基片段,結(jié)合δH4.07(1H,m)說(shuō)明結(jié)構(gòu)中含纈氨酸殘基。將其NMR數(shù)據(jù)與文獻(xiàn) [16-17]環(huán) (纈-酪)二肽對(duì)照,基本一致,確定4為環(huán) (纈-酪)二肽(cyclo(Val-Tyr))。
化合物5,白色粉末,碘熏顯色。1H NMR中:δH9.29(1H,s)和9.01(1H,s)為2個(gè)氨基上氫信號(hào),13C NMR 中 δC168.4(s),166.7(s)為兩個(gè)酰胺羰基碳信號(hào),說(shuō)明該化合物亦為環(huán)二肽類化合物。δH7.24 ~ 7.45(2H,m),7.26 ~ 7.19(3H,m)為典型單取代芳環(huán)上的質(zhì)子信號(hào),同時(shí)δC168.4(s),136.9(s),130.7(d,2C),128.7(d,2C),127.2(d)碳信號(hào)與苯丙氨酸的碳信號(hào)接近,δH3.45(1H,dd,13.2,5.6)及3.29(1H,dd,13.2,4.4)為1個(gè)亞甲基上的2個(gè)質(zhì)子信號(hào),且這2個(gè)質(zhì)子信號(hào)化學(xué)環(huán)境不同,結(jié)合 δH4.59(1H,m)及δC57.3(d),40.8(t)可推斷化合物含苯丙氨酸殘基;δH3.96(1H,dd,17.2,3.2)、3.50(1H,d,17.2)和 δC166.7(s),45.0(d),提示該化合物含甘氨酸殘基。將化合物5的NMR數(shù)據(jù)與文獻(xiàn) [18-19]環(huán) (甘-苯丙)對(duì)照,基本一致,確定5為環(huán) (甘 -苯丙)二肽 (cyclo(Gly-Phe))。
化合物6,無(wú)色透明方型結(jié)晶,θmp205~208℃。茚三酮試劑不顯色,高錳酸鉀試劑顯亮黃色斑點(diǎn)。ESI-MSm/z153 [M-H]-提示相對(duì)分子質(zhì)量為154。1HNMR 譜中:δH9.12(1H,brs)為甘氨酸活潑氨基氫信號(hào) (N-H),δH3.60(1H,dt,8.2,3.2,11.2)、3.45(1H,td,10.0,3.2)、2.26(m,1H)、2.09(1H,m)、1.68(1H,m)、1.62(1H,m)和 δC171.3(s)、60.2(d)、46.6(t)、30.1(t)、23.9(t)為脯氨酸殘基信號(hào),δH4.09(1H,td,16.0,4.4)和4.17(2H,br t,16.2)及δC165.6(s)和48.2(t)暗示結(jié)構(gòu)中有甘氨酸片斷。將化合物6的NMR數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)環(huán) (甘-脯)二肽對(duì)照[19-21],基本一致,確定 6為環(huán) (甘 -脯)二肽 (cyclo(Gly-Pro))。
化合物7,白色粉末,香草醛濃硫酸不顯色,茚三酮顯色陰性。1H NMR中 δH9.18(1H,s)和8.90(1H,s)為兩個(gè)氨基活波氫信號(hào),δH2.65(1H,m)、1.16(3H,d,6.80)、1.11(3H,d,6.80)顯示結(jié)構(gòu)中含異丙基片段,結(jié)合 δH4.15(1H,dd,6.80,13.50)說(shuō)明結(jié)構(gòu)中含纈氨酸殘基。δH4.34(1H,q,6.4)和 1.68(3H,d,7.2)顯示結(jié)構(gòu)中含丙氨酸殘基。將化合物7的NMR數(shù)據(jù)與文獻(xiàn) [19,22-23]環(huán) (丙-纈)二肽對(duì)照,基本一致,確定7為環(huán) (丙 -纈)二肽 (cyclo(Ala-Val))。
化合物8,白色粉末,茚三酮顯色陰性,薄層原位酸水解后茚三酮顯色陽(yáng)性,提示為環(huán)肽類成分。ESI-MSm/z127[M-H]-提示相對(duì)分子質(zhì)量為128。1H NMR δH9.27(1H,s),9.06(1H,s)說(shuō)明存在活波的氨基質(zhì)子信息;δH4.00(1H,q,6.8)和1.62(3 H,d,6.6)及 δC51.93(d)、20.26(q)暗示結(jié)構(gòu)中存在丙氨酸殘基。δH3.91(2H,br s)和13C NMR中δC46.7(t)暗示存在甘氨酸殘基。將其NMR數(shù)據(jù)與文獻(xiàn) [24-25]環(huán) (甘 -丙)二肽對(duì)照,基本一致,確定8為環(huán) (甘-丙)二肽 (cyclo(Gly-Ala))。
致謝:感謝廣州中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院2009級(jí)本科生蔡劍雄、梁敏、李玉婷、張海霞、曾婷在微生物實(shí)驗(yàn)中的幫助;感謝中山大學(xué)分析測(cè)試中心關(guān)山越老師的測(cè)試支持。
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