重點實驗室/小麥玉米國家工程實驗室,山東濟南250100)
摘要:為培育高度抗逆和無選擇標記的轉(zhuǎn)基因小麥,本研究從NCBI數(shù)據(jù)庫中搜索到ThIPK2基因序列,依據(jù)該基因編碼的氨基酸序列,參照小麥偏愛的密碼子對該基因進行密碼子優(yōu)化,并將重復的和不必要的酶切位點去掉后進行人工合成。將改造后的ThIPK2基因插入到強啟動子Ubiquitin和終止子AtSac66之間,然后將其插入到含有玉米Ac/Ds轉(zhuǎn)座子背景骨架的植物表達載體中,獲得了具有刪除選擇標記功能的、由玉米Ubiquitin啟動子驅(qū)動ThIPK2基因的植物表達載體。經(jīng)過限制性內(nèi)切酶分析鑒定,該植物表達載體構(gòu)建成功。
關(guān)鍵詞:ThIPK2基因;密碼子優(yōu)化;表達載體構(gòu)建
中圖分類號:Q786文獻標識號:A文章編號:1001-4942(2013)05-0018-06
小麥是世界上分布最廣、種植面積最大的糧食作物之一。隨著人口增多和自然環(huán)境的不斷惡化、水資源短缺以及土壤鹽堿化,培育抗逆小麥品種已成為當務之急。傳統(tǒng)的小麥育種主要利用品種間雜交,而基因工程技術(shù)的發(fā)展和應用,打破了物種間基因流動的限制,將外源基因?qū)胄←溂毎@得轉(zhuǎn)基因植株,為小麥育種開辟了新途徑,對提高小麥耐鹽抗旱性具有重要的戰(zhàn)略意義。
磷脂酰肌醇信號傳導途徑在植物生長發(fā)育和感受刺激并對之應答的過程中發(fā)揮十分重要的作用。多磷酸肌醇激酶/三磷酸肌醇3激酶(inositol polyphosphate kinase/inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase, IPK2/IP3K)是該信號途徑中的一個關(guān)鍵酶,磷酸化IP3成為1,3,4,5-四磷酸肌醇(inositol 1,3,4,5-tetrakisphosphate, IP4)和1,3,4,5,6-五磷酸肌醇(1,3,4,5,6-pentakisphospate, IP5),IP4能夠與IP3協(xié)同作用調(diào)節(jié)胞外鈣離子入膜和維持細胞內(nèi)鈣離子平衡。因此,IPK2在協(xié)調(diào)IP3和IP4水平、維持鈣離子穩(wěn)態(tài)過程中起關(guān)鍵作用,參與了多種生理過程的調(diào)控。有研究報道,IPK2與植物對鹽脅迫等非生物脅迫的應答有關(guān)。例如Yang等[1]的研究表明,IPK2具有增強轉(zhuǎn)基因煙草耐受高鹽脅迫和滲透脅迫的能力。Zhu等[2]從鹽芥(Thellungiella halophila)克隆基因ThIPK2,并將該基因轉(zhuǎn)化到油菜(Brassica napus L cv)滬油1號中,結(jié)果表明轉(zhuǎn)ThIPK2基因油菜植株表現(xiàn)出較強抗鹽、抗旱和抗氧化的特點。進一步的研究表明,在轉(zhuǎn)基因油菜中,ThIPK2基因的表達能提高脅迫應答基因的轉(zhuǎn)錄和改善脂肪酸的組成;在鹽脅迫下轉(zhuǎn)ThIPK2具有提高植物抗干旱和耐低溫脅迫的能力。在上述研究的基礎上,本工作準備利用ThIPK2基因通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)對小麥的抗逆性進行遺傳改良。
另外,遺傳密碼子有64種,但絕大多數(shù)生物傾向于利用這些密碼子中的一部分,表現(xiàn)出某種程度的密碼子利用的差異或偏愛。利用偏愛密碼子避免利用率低的或稀有的密碼子稱為密碼子優(yōu)化。為了提高目的基因ThIPK2的表達量,本研究根據(jù)小麥的偏愛性密碼子對該基因進行了密碼子優(yōu)化。
有效的篩選標記基因?qū)τ谵D(zhuǎn)基因植物的獲得至關(guān)重要,目前常用的標記基因如新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶(neomycin phosphotransferaseⅡ)NPTⅡ基因、潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶(hygromycin phosphotransferase)HPT基因等抗生素抗性基因及膦絲菌素乙酰轉(zhuǎn)移酶(phosphinothricin acetyltransferase)Bar基因、乙酰乳酸合成酶(acetolactate synthase)ALS基因等。但這些標記基因滯留在植物體內(nèi)并持久表達不僅會給植物生長帶來負擔,而且還會給其他有利性狀基因的表達帶來一定的影響,因此它們的使用也引發(fā)了人們對轉(zhuǎn)基因安全性的隱憂[3~6]。為了解決這些弊端,獲取無選擇標記的轉(zhuǎn)基因植物,應運而生了玉米的Ac/Ds轉(zhuǎn)座子系統(tǒng),該系統(tǒng)作為無選擇標記基因的載體,利用了Ds元件能從染色體的一個位點轉(zhuǎn)移到另一個位點的特性,再通過后代重組自交與原初位點上的標記基因及Ac元件分離,進而得到只含有Ds元件的轉(zhuǎn)基因植株。該系統(tǒng)已經(jīng)被應用于多種異源植物如轉(zhuǎn)基因番茄[7]、煙草[8]、水稻[9]、油菜[10]中并取得成功。
本研究利用DNA重組技術(shù),構(gòu)建了一個含有密碼子優(yōu)化后的ThIPK2基因、強啟動子Ubiquitin及Ac/Ds轉(zhuǎn)座子的植物表達載體。該載體可進一步用于小麥的遺傳轉(zhuǎn)化,以期獲得高抗逆性及無選擇標記基因的轉(zhuǎn)基因小麥植株。
1材料與方法
11材料
111質(zhì)粒和菌株載體pBluescript SK、pBIOS1487、pBIOS645和pBIOS1717由本實驗室保存。大腸桿菌DH5α購自全式金公司。
112藥品及試劑高保真酶 Fast-pfu購自全式金公司;限制性內(nèi)切酶EcoR Ⅴ、SalⅠ、SmaⅠ和NcoⅠ購自Fermentas公司;SalⅠ和PmeⅠ購自NEB(New England Biolabs)公司;DNA片段回收試劑盒購自Axygen公司;T4連接酶購自NEB公司;測序由上海生工生物工程技術(shù)服務有限公司完成。
12載體的構(gòu)建
121ThIPK2基因的密碼子優(yōu)化從NCBI網(wǎng)站上獲得ThIPK2基因序列和蛋白序列,根據(jù)野生型ThIPK2基因及蛋白的序列,參考小麥偏愛的密碼子,將重復的和不必要的酶切位點去掉,并兼顧優(yōu)化后低水平的GC含量,對ThIPK2基因進行密碼子優(yōu)化。
122載體PSAA001的構(gòu)建合成優(yōu)化好的ThIPK2基因序列(synZPK2)并連接到載體pBluescript SK,然后通過測序的方式鑒定目的序列的插入方向,完成載體PSAA001的構(gòu)建。這一步由上海生工生物工程技術(shù)服務有限公司合成,流程圖中未列出。
123載體PSAA002的構(gòu)建用SalⅠ和NcoⅠ雙酶切載體PSAA001和pBIOS1487,將目的片段Ubiquitin啟動子連接到PSAA001 ThIPK2基因的上游,轉(zhuǎn)化Ecoli,對重組質(zhì)粒進行酶切檢測。
124載體PSAA003的構(gòu)建SalⅠ和SmaⅠ雙酶切載體PSAA002,用SalⅠ和EcoRⅤ雙酶切載體pBIOS645,將目的片段AtSac66終止子連接到PSAA002 ThIPK2基因的下游,轉(zhuǎn)化Ecoli,對重組質(zhì)粒進行酶切檢測。因為SmaⅠ和EcoRⅤ這兩種酶都是平末端限制性內(nèi)切酶,酶切后產(chǎn)生的都是平末端,可以用T4連接酶進行連接。
125載體PSAA004的構(gòu)建用SalⅠ和PmeⅠ雙酶切載體PSAA003和pBIOS1717,將上下游分別連接有啟動子和終止子的ThIPK2基因序列連接到植物表達載體骨架上,轉(zhuǎn)化Ecoli,對重組質(zhì)粒進行酶切檢測。