張烜榕,顏軍,李文龍,侯敏,蔣玉佳,卜舒,李桂滿
(昆明市疾病預(yù)防控制中心,昆明650228)
單核細(xì)胞增生李斯特菌三種檢測(cè)方法的比較
張烜榕,顏軍,李文龍,侯敏,蔣玉佳,卜舒,李桂滿
(昆明市疾病預(yù)防控制中心,昆明650228)
目的:通過(guò)比較國(guó)標(biāo)法、real-time PCR法和LAMP方法,得到適合基層實(shí)驗(yàn)室快速檢測(cè)單核細(xì)胞增生李斯特菌的方法。方法:分別用國(guó)標(biāo)法、real-time PCR法和環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)法檢測(cè)李斯特菌,并進(jìn)行方法比較。結(jié)果:三種方法對(duì)單增李斯特菌的檢測(cè)結(jié)果一致.國(guó)標(biāo)法整個(gè)檢測(cè)過(guò)程需5~7 d;real-time PCR法實(shí)驗(yàn)條件要求高,成本高,檢測(cè)需1.5~2.5 d;LAMP法實(shí)驗(yàn)條件低,成本低,檢測(cè)時(shí)限與real-time PCR相同。結(jié)論:LAMP法檢測(cè)單增李斯特菌靈敏度高、特異性強(qiáng)、快速高效和低成本,適合基層實(shí)驗(yàn)室應(yīng)急檢測(cè)和現(xiàn)場(chǎng)監(jiān)測(cè)使用。
國(guó)標(biāo)法;LAMP;PCR;單核細(xì)胞增生李斯特菌檢測(cè)
單核細(xì)胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)是一類兼性細(xì)胞內(nèi)生長(zhǎng)的革蘭陽(yáng)性桿菌,致病力較強(qiáng),可引起人畜李斯特病,臨床表現(xiàn)為敗血癥、腦膜炎、單核細(xì)胞增多和胃腸炎,主要通過(guò)污染的肉類、乳制品和蔬菜等引起李斯特菌感染。國(guó)內(nèi)外對(duì)單增李斯特菌高度重視,1986年WHO已將其列為食品四大致病菌之一,2000年在WHO食品安全工作計(jì)劃中,已將該菌列為重點(diǎn)檢測(cè)的食源性致病菌之一〔1〕。最近,美國(guó)從2011年7月31日出現(xiàn)首例李斯特病病例報(bào)告至同年12月8日,共報(bào)告病例146例,死亡30例,這是10多年來(lái)美國(guó)最嚴(yán)重的一起食源性疾病暴發(fā)事件〔2〕。所以及時(shí)有效的控制食品中LM的污染是食品安全的重要保障之一。
LM的鑒定方法有國(guó)標(biāo)的分離鑒定法、免疫學(xué)鑒定法、PCR法等。分離培養(yǎng)鑒定法較簡(jiǎn)單,但操作繁瑣,鑒定過(guò)程需要5~7 d,檢出限較低,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,難以滿足突發(fā)事件的快速檢測(cè)要求。免疫學(xué)鑒定法由于菌體及鞭毛抗原交叉反應(yīng)的存在,難以進(jìn)行李斯特菌種間的特異性鑒別〔3〕。PCR法具有特異性強(qiáng)、靈敏度高和反應(yīng)速度快的優(yōu)點(diǎn),但需要昂貴的PCR儀,且檢測(cè)成本高,不適宜基層實(shí)驗(yàn)室使用。由Notomi等〔4〕在2000年設(shè)計(jì)的LAMP法是一種恒溫核酸擴(kuò)增方法,該方法是通過(guò)4條特異性引物識(shí)別靶基因的6個(gè)區(qū)域和具有鏈置換活性的Bst(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶作用,在65℃的恒溫條件下擴(kuò)增。與PCR不同,LAMP不需要精密的PCR儀和昂貴的試劑〔5〕,尤其適合在缺乏設(shè)備支持的基層實(shí)驗(yàn)室和突發(fā)現(xiàn)場(chǎng)開(kāi)展檢測(cè)工作。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)同時(shí)應(yīng)用國(guó)標(biāo)的分離鑒定法,PCR法和LAMP法檢測(cè)鑒定LM來(lái)比較LAMP方法在LM檢測(cè)中的高效性、準(zhǔn)確性和可靠性。
1.1 菌株實(shí)驗(yàn)室保存的李斯特菌11株。
1.2 主要試劑和儀器設(shè)備單增李斯特菌檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法)購(gòu)自深圳易瑞生物技術(shù)有限公司;單核細(xì)胞增生李斯特氏菌核酸檢測(cè)試劑盒(環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增法)購(gòu)自廣州華峰生物科技有限公司;瓊脂購(gòu)自基因公司;10000×SYBR GreenI購(gòu)自北京優(yōu)尼康生物科技有限公司;全自動(dòng)微生物生化鑒定儀(VITEK32);上海一恒恒溫水浴鍋;BIO-RAD凝膠成像系統(tǒng);北京八一六廠電泳儀。
1.3 方法
1.3.1 國(guó)標(biāo)法根據(jù)食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)《食品微生物學(xué)檢驗(yàn)單核細(xì)胞增生李斯特氏菌檢驗(yàn)》GB4789.30-2010分離鑒定菌株。李氏增菌肉湯LB1 30℃培養(yǎng)24 h,轉(zhuǎn)種李氏增菌肉湯LB2 30℃培養(yǎng)24 h,接種于PALCAM平板和李斯特氏顯色培養(yǎng)基36℃培養(yǎng)24 h,取菌落分別接種在木糖和鼠李糖發(fā)酵管36℃培養(yǎng)24 h,同時(shí)在TSA-YE上純化30℃培養(yǎng)24 h,選擇木糖陰性、鼠李糖陽(yáng)性的菌繼續(xù)進(jìn)行全自動(dòng)生化鑒定6~7 h,并依次進(jìn)行動(dòng)力試驗(yàn)、生化鑒定和溶血試驗(yàn)。
1.3.2 real-time PCR法取培養(yǎng)24 h的LB2增菌液1 mL,10 000 r/min離心2 min,棄上清,加入80 μL DNA提取液混勻煮沸裂解10 min,置冰上10 min,10 000 r/min離心2 min,上清即為模板。按試劑盒說(shuō)明書(shū)準(zhǔn)備反應(yīng)體系,分別取5 μL陰性、陽(yáng)性質(zhì)控品和提取的DNA加入反應(yīng)體系中。循環(huán)參數(shù):預(yù)變性95℃10 min,1次循環(huán);變性95℃10 s,退火、延伸及檢測(cè)熒光58℃45 s,40次循環(huán)。
1.3.3 LAMP法菌株DNA提取參見(jiàn)real-time PCR法。根據(jù)試劑盒說(shuō)明書(shū)分別取2.5 μL陰性、陽(yáng)性質(zhì)控品和提取的DNA加入反應(yīng)體系中,置65℃60 min。
1.4 結(jié)果判定
1.4.1 國(guó)標(biāo)法VITEK32直接判讀結(jié)果后,進(jìn)行后續(xù)的生化試驗(yàn)鑒定。所用李斯特菌株生化反應(yīng)特征,見(jiàn)表1。
表1 單核細(xì)胞增生李斯特氏菌生化特征與其他李斯特氏菌的區(qū)別
1.4.2 real-time PCR法陽(yáng)性結(jié)果呈現(xiàn)典型的S型擴(kuò)增曲線。Ct值≥38或undet為陰性結(jié)果,Ct值<35為陽(yáng)性結(jié)果,35≤Ct值<38為檢測(cè)灰區(qū),重復(fù)測(cè)定兩次,兩次測(cè)定Ct值≥38為陰性結(jié)果,其中一次Ct值<38為陽(yáng)性結(jié)果。
1.4.3 LAMP法肉眼觀察產(chǎn)物顏色變化,出現(xiàn)綠色判定為陽(yáng)性,橙色為陰性。擴(kuò)增產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳,有不同大小的梯形條帶為陽(yáng)性結(jié)果,不產(chǎn)生條帶為陰性結(jié)果。
2.1 國(guó)標(biāo)法檢測(cè)11株李斯特菌中7株為L(zhǎng)M,3株為英諾克李斯特菌,1株為伊氏李斯特氏菌,見(jiàn)表2。11株李斯特菌4株從速凍熟制米面制品中分離,3株從熟肉制品中分離,2株從即食非發(fā)酵性豆制品中分離,1株為省疾控下發(fā)質(zhì)控,1株為國(guó)家臨檢中心下發(fā)考核樣。其中,檢出7株LM中除1株為省疾控下發(fā)質(zhì)控樣外,其余為2株從速凍熟制米面制品中分離,2株從熟肉制品中分離,2株從即食非發(fā)酵性豆制品中分離;3株英諾克李斯特菌中1株從熟肉制品中分離,2株從速凍熟制米面制品中分離;1株伊氏李斯特菌是國(guó)家臨檢中心下發(fā)考核樣,見(jiàn)表2。說(shuō)明李斯特菌對(duì)環(huán)境要求和營(yíng)養(yǎng)要求都不高,可污染不同的食物,特別是加工后即食的食品。
2.2 real-time PCR法采用針對(duì)目標(biāo)菌為L(zhǎng)M的熒光PCR法分別對(duì)11株實(shí)驗(yàn)菌株核酸進(jìn)行擴(kuò)增,其中有7株菌株P(guān)CR擴(kuò)增呈現(xiàn)典型S型擴(kuò)增曲線,Ct值均<35,檢測(cè)結(jié)果為L(zhǎng)M,其它4株李斯特菌為陰性,檢測(cè)結(jié)果與國(guó)標(biāo)法一致,見(jiàn)表3。
表2 國(guó)標(biāo)法檢測(cè)結(jié)果
表3 三種方法檢測(cè)單增李斯特菌結(jié)果比較
2.3 LAMP法恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)驗(yàn)菌株核酸,目測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,11株李斯特菌中有7株綠色為L(zhǎng)M,其余橙色為其它李斯特菌,結(jié)果見(jiàn)圖1。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳后,7株LM菌株與陽(yáng)性質(zhì)控菌株一樣有相同的明亮的梯形條帶,4株非單增李斯特菌沒(méi)有典型的LAMP擴(kuò)增條帶,見(jiàn)圖2。其LM檢測(cè)結(jié)果與國(guó)標(biāo)法和real-time PCR法檢測(cè)一致,見(jiàn)表3。
圖1 LAMP法檢測(cè)單增李斯特菌目測(cè)結(jié)果
圖2 LAMP法檢測(cè)單增李斯特菌瓊脂糖電泳圖
LM廣泛存在于自然界中,生存條件要求不高,在極端環(huán)境中仍可生長(zhǎng)。該菌在5~45℃均可生長(zhǎng),經(jīng)58~59℃10 min可殺死,在5℃低溫生長(zhǎng)是典型特征之一,在-20℃可存活一年,能在冰箱冷藏室內(nèi)較長(zhǎng)時(shí)間生長(zhǎng)繁殖,不易被凍融,耐堿不耐酸,在pH 9.6中仍能生長(zhǎng),在10%NaCl中可生長(zhǎng),在4℃的20%NaCl中仍可存活8周。該菌引起致病的物質(zhì)為李斯特菌溶素O,此溶素須細(xì)菌被吞噬后在細(xì)胞內(nèi)生長(zhǎng)時(shí)釋放。幾乎所有被診斷為單增李斯特菌感染的患者均有侵襲性感染癥狀(即細(xì)菌從胃腸道擴(kuò)散到血液或其他部分),突出的臨床表現(xiàn)為敗血癥、腦膜炎、腦脊髓炎、發(fā)熱,有時(shí)可引起心內(nèi)膜炎。
隨著社會(huì)經(jīng)濟(jì)的快速發(fā)展,生活節(jié)奏越來(lái)越快,人們對(duì)即食食品、冷藏和速凍食品的需求量迅速增加,這也同時(shí)增加了LM對(duì)人們的威脅,因此對(duì)LM進(jìn)行快速、靈敏、準(zhǔn)確的檢測(cè)能有效的保證食品安全衛(wèi)生。本實(shí)驗(yàn)選取的11株李斯特菌有分離于速凍熟制米面制品、熟肉制品和即食非發(fā)酵性豆制品,說(shuō)明LM在我們周圍是普遍存在的,其生存條件要求不高,生存耐受力很強(qiáng),在冰箱冷藏室內(nèi)仍可生長(zhǎng)繁殖的生存能力使其具有極高的感染人畜的潛在危險(xiǎn)機(jī)率。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)用三種方法對(duì)LM檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比較,獲得一種較為簡(jiǎn)便易行的檢測(cè)方法。國(guó)標(biāo)法是對(duì)分離培養(yǎng)后的可疑菌落通過(guò)生化試驗(yàn)、動(dòng)力試驗(yàn)和溶血試驗(yàn)等進(jìn)行鑒定,檢驗(yàn)過(guò)程需要5~7 d,耗時(shí)耗力、且操作復(fù)雜,不能達(dá)到迅速為食物中毒等食品安全突發(fā)事件提供病原學(xué)依據(jù)的要求。Real-time PCR法特異性強(qiáng)、靈敏度高,省時(shí)省力,其檢驗(yàn)過(guò)程需要1.5~2.5 d,但需要昂貴的PCR儀,而且對(duì)試驗(yàn)環(huán)境要求和操作人員技術(shù)的要求都很高,在一定程度上限制了其發(fā)展和應(yīng)用。近年來(lái)的研究〔6-9〕表明LAMP法在檢測(cè)各種食源性致病菌方面具有很多優(yōu)勢(shì)。本實(shí)驗(yàn)應(yīng)用LAMP法檢測(cè)了11株李斯特菌株,結(jié)果對(duì)其中7株LM的核酸均有擴(kuò)增,對(duì)其余4株其它李斯特菌的核酸均無(wú)擴(kuò)增,其結(jié)果與國(guó)標(biāo)法和realtime PCR法一致,檢驗(yàn)過(guò)程需1.5~2.5 d,顯示出該方法對(duì)LM的檢測(cè)的特異性、靈敏性和準(zhǔn)確性不亞于PCR法,且對(duì)試劑要求簡(jiǎn)單,儀器要求不高,只需要提供恒定溫度的設(shè)備即可,產(chǎn)物鑒定簡(jiǎn)便易行,視覺(jué)觀察產(chǎn)物變綠的是LM,橙色是非單增李斯特菌,因而能在短時(shí)間內(nèi)、簡(jiǎn)單的實(shí)驗(yàn)條件和要求不高的實(shí)驗(yàn)環(huán)境下為食品安全突發(fā)事件提供快速的病原學(xué)的初步檢測(cè)依據(jù)。
綜上所述,通過(guò)對(duì)三種檢測(cè)鑒定方法的結(jié)果比較可知LAMP法檢測(cè)LM是三種檢測(cè)法中較簡(jiǎn)便和快速的方法,與其它核酸擴(kuò)增技術(shù)相比,具有實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單、快速、成本低、對(duì)設(shè)備條件要求低等方面的優(yōu)勢(shì)。其特異性強(qiáng)、靈敏度高、快速高效和產(chǎn)物鑒定簡(jiǎn)便的優(yōu)點(diǎn),適合縣區(qū)級(jí)疾病預(yù)防控制中心快速檢測(cè)和現(xiàn)場(chǎng)監(jiān)測(cè)等應(yīng)用。
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(責(zé)任編輯 李楊)
Comparison of Three Methods of Listeria monocytogenes Detection
ZHANG Xuanrong,YAN Jun,LI Wenlong,HOU Min,JIANG Yujia,BU Shu,LI Guiman
(Disease Control and Prevention Center of Kunming,Kunming 650228,China)
Objective:To find a suitable method for rapid detection of Listeria monocytogenes(LM)in grassroots labs.Methods: GB law,real-time PCR and LAMP were adopted to detect LM,then,the results were evaluated.Results:The results of the three mothods were quite consistent.The detection process of GB law took 5 to 7 days.While the real-time PCR requiring high experimental conditions and cost took 2.5 days.LAMP method,requiring low experimental conditions and cost,took the same time as the real-time PCR.Conclusion:The LAMP assay was a sensitive,specific,rapid and economical method for the detection of LM, which could be widely used by grassroots labs.
GB law;LAMP;PCR;detection of Listeria monocytogenes
R155.5
A
1672-2345(2013)06-0038-05
10.3969/j.issn.1672-2345.2013.06.011
2012-09-16
2012-10-16
張烜榕,初級(jí)檢驗(yàn)師,主要從事病原生物檢驗(yàn)研究.