IRGM-4958847 A/G基因多態(tài)性與克羅恩病易感性的關(guān)系

崔德軍 王景林 黃博

IRGM-4958847 A/G基因多態(tài)性與克羅恩病易感性的關(guān)系

崔德軍 王景林 黃博

目的 評價免疫相關(guān)鳥苷三磷酸酶基因（IRGM）多態(tài)性與克羅恩?。–D）易感性的關(guān)系。方法 用主題詞或關(guān)鍵詞檢索Cochrane圖書館、Pubmed、Embase、ISI數(shù)據(jù)庫、中文科技期刊數(shù)據(jù)庫、中國期刊全文數(shù)據(jù)庫，萬方數(shù)據(jù)庫以獲得相關(guān)研究，檢索時間從建庫至2012年10月。根據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn)由兩名研究者獨立進(jìn)行文獻(xiàn)質(zhì)量評價，使用Review Manager 5.2.6統(tǒng)計軟件進(jìn)行Meta分析，效應(yīng)量為比值比（OR）。結(jié)果 共有9個病例-對照研究和隊列研究納入分析。Meta分析結(jié)果顯示在IRGM-4958847 A/G多態(tài)性位點，雜合子AG與野生型相比，合并效應(yīng)量OR=1.17，95% CI（1.01～1.35），P=0.03。結(jié)論 IRGM-4958847 位點AG型基因可能與CD遺傳易感性相關(guān)。

克羅恩??；免疫相關(guān)鳥苷三磷酸酶基因；基因多態(tài)性；Meta分析

克羅恩病（Crohn's disease，CD）是一種病因不明的胃腸道慢性非特異性、炎性肉芽腫性疾病。在我國，CD發(fā)病率逐步增高，已成為國內(nèi)常見的消化系統(tǒng)疾病。CD有復(fù)發(fā)傾向，甚至遷延不愈。目前認(rèn)為CD的發(fā)病與遺傳、免疫、感染、環(huán)境等相關(guān)。近來認(rèn)為自體吞噬（自噬）基因缺陷在CD發(fā)病中起著重要作用[1]。免疫相關(guān)鳥苷三磷酸酶基因（immunity-related GTPase family, M，IRGM）是一種重要的自噬相關(guān)基因，與CD發(fā)病可能相關(guān)[2]。但東西方CD患者遺傳背景有差異，IRGM基因多態(tài)性與CD易感性關(guān)系的研究結(jié)論不完全一致[3]。因而，本研究采用Meta分析方法，定量評價IRGM-4958847 A/G基因多態(tài)性與CD發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性。

1 資料與方法

1.1 資料來源 計算機(jī)檢索Cochrane圖書館，PubMed，Embase，ISI數(shù)據(jù)庫，VIP，CNKI，萬方數(shù)據(jù)庫，同時用Google學(xué)術(shù)搜索引擎檢索，檢索時限為從建庫至2012年10月。語言限中文和英文。另外手工檢索相關(guān)文獻(xiàn)的參考文獻(xiàn)和胃腸病會議摘要。英文檢索詞：immunity-related GTPase family M，polymorphism，Crohn's disease，inflammatory bowel disease；中文檢索詞：免疫相關(guān)鳥苷三磷酸酶基因，多態(tài)性，克羅恩病，炎癥性腸病。

1.2 方法

1.2.1 納入與排除標(biāo)準(zhǔn) 納入標(biāo)準(zhǔn)：納入公開發(fā)表的IRGM基因多態(tài)性與CD關(guān)系的病例對照研究、巢式病例對照研究或隊列研究。研究對象為確診CD的患者，性別、年齡、人種和國籍等不限。檢測多態(tài)性位點的實驗方法科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)。等位基因分布頻率符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律。數(shù)據(jù)完整、可靠。排除標(biāo)準(zhǔn)：排除重復(fù)發(fā)表的文獻(xiàn)、數(shù)據(jù)不完整和無法提取相關(guān)數(shù)據(jù)的文獻(xiàn)。

1.2.2 質(zhì)量評價 根據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn)由兩名研究者獨立進(jìn)行文獻(xiàn)質(zhì)量評價，有分歧時由第三位研究者參加討論，并最終決定是否納入文獻(xiàn)。采用Cochrane協(xié)作網(wǎng)推薦使用的Newcastle-Ottawa Scale (NOS)量表[4]進(jìn)行質(zhì)量評價。從研究人群選擇、組間可比性和暴露因素的測量3大方面進(jìn)行質(zhì)量評價。滿分9分，得分≥7分為高質(zhì)量研究。

1.2.3 資料提取 由兩位研究者獨立進(jìn)行文獻(xiàn)篩選、資料提取，交叉核對。若意見不一致時，由第3位研究者參與討論并解決分歧。

1.2.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用Cochrane協(xié)作網(wǎng)提供的RevMan 5.2.6軟件進(jìn)行Meta分析。效應(yīng)量為比值比（Odds ratio，OR），計算 95%可信區(qū)間（Confidence interval，CI）。分別計算純合子、雜合子、顯性遺傳模型和隱性遺傳模型的OR值及其95%CI。異質(zhì)性檢驗采用卡方檢驗（chi-square test，χ2），P＞0.1，I2≤50%時異質(zhì)性不明顯，用固定效應(yīng)模型估計合并效應(yīng)量；P≤0.10，I2＞50%）時異質(zhì)性明顯，用隨機(jī)效應(yīng)模型。若異質(zhì)性過大時（I2＞75%）須分析異質(zhì)性來源，進(jìn)行亞組分析及敏感性分析，甚至放棄定量合成。合并效應(yīng)量的檢驗采用Z檢驗，P＜0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。納入9篇以上研究時采用倒漏斗圖分析發(fā)表偏倚。

2 結(jié)果

2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果 通過文獻(xiàn)檢索，初檢出文獻(xiàn)379篇。剔重、閱讀文題和摘要、閱讀全文后最終納入9篇文獻(xiàn)[5-13]進(jìn)行Meta分析。文獻(xiàn)篩選流程與結(jié)果見圖1。

2.2 納入研究的基本特征與質(zhì)量評價 納入研究的9篇文獻(xiàn)中，1篇中文文獻(xiàn)，8篇英文文獻(xiàn)。累計病例組6442例，對照組7624例。研究人群分布廣，有亞洲、歐洲、美洲和大洋洲研究人群。采用NOS量表評分，結(jié)果顯示各納入研究得分在7分以上。納入研究的基本特征和質(zhì)量評分見表1。

表1 各納入研究基本特征和質(zhì)量評分

2.3 Meta分析結(jié)果 與野生型純合子比較，變異純合子4958847GG基因型個體與克羅恩病易感性無相關(guān)性[OR=1.18，95% CI（0.88,1.57），P=0.28]。而雜合子4958847AG基因型個體與克羅恩病發(fā)病風(fēng)險增高相關(guān)[OR=1.17，95% CI（1.01,1.35），P=0.03]，見圖 2。在顯性遺傳模式（GG/AG比AA）中CD發(fā)病風(fēng)險增高無統(tǒng)計學(xué)意義[OR=1.16，95% CI（0.99,1.36），P=0.07]。在隱性遺傳模式（GG比AG/AA）中也無統(tǒng)計學(xué)意義[OR=1.09，95% CI（0.86,1.39），P=0.48]。Meta分析結(jié)果詳見表2。對雜合子和顯性遺傳模式進(jìn)行敏感性分析，結(jié)果穩(wěn)定性差。但對純合子和隱性遺傳模式進(jìn)行敏感性分析，各合并效應(yīng)量穩(wěn)定性好。

2.4 發(fā)表偏倚分析 采用RevMan5.2.6軟件繪制倒漏斗圖，圖3示雜合子與野生型比較的倒漏斗圖。研究結(jié)果分布不對稱，可能存在發(fā)表偏倚。

表2 各遺傳模式的Meta分析結(jié)果

圖3 IRGM-4958847 A/G雜合子與野生型比較的倒漏斗圖

3 討論

IRGM基因位于染色體5q33.1，其合成的蛋白與自體吞噬相關(guān)，在CD免疫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用[14]。國內(nèi)外對IRGM基因多態(tài)性與CD易感性關(guān)系進(jìn)行了大量研究。關(guān)于IRGM-4958847 A/G多態(tài)性與CD的關(guān)系尚無定論。為此，本研究采用Meta分析方法，分析IRGM-4958847 A/G基因多態(tài)性與CD易感性的關(guān)系，為CD的發(fā)病機(jī)制研究打下基礎(chǔ)。

本文共納入9個病例對照研究和隊列研究，有東西方人種研究，樣本量大。納入的研究NOS評分7分以上，為高質(zhì)量研究，但檢索語言限中文和英文，可能存在一定選擇性偏倚。各納入研究CD診斷標(biāo)準(zhǔn)不完全一致，可出現(xiàn)選擇性偏倚。本研究Meta分析結(jié)果表明雜合子4958847AG基因型個體與CD易感性相關(guān)，另外幾種遺傳模式未見CD易感性相關(guān)結(jié)論。由于存在異質(zhì)性，采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行Meta分析。針對雜合子和顯性遺傳模式進(jìn)行的敏感性分析結(jié)果顯示穩(wěn)定性差，但未能找到異質(zhì)性來源，未能進(jìn)行亞組分析。倒漏斗圖分析發(fā)現(xiàn)有發(fā)表偏倚可能，影響Meta分析結(jié)果的可信度。本研究與Palomino-Morales等[15]的研究結(jié)果相類似，但本文研究只針對CD，異質(zhì)性較小，納入臨床研究較多，樣本量較大，統(tǒng)計效能較強(qiáng)。

Meta分析避免研究樣本小、種族和地區(qū)局限等不足，但Meta分析是對以往發(fā)表的文獻(xiàn)進(jìn)行二次研究，不可避免地受到各種偏倚的影響，存在一定局限性。本研究存在異質(zhì)性，敏感性分析結(jié)果穩(wěn)定性不好，且有發(fā)表偏倚可能，因而，應(yīng)慎重對待本研究結(jié)論。

綜上所述，本Meta分析提示IRGM-4958847 A/G基因多態(tài)性與CD易感性存在一定相關(guān)性。但本研究結(jié)論尚待更多大樣本、高質(zhì)量、多中心參與的研究加以驗證。

[1] Gardet A,Xavier RJ.Common alleles that influence autophagy and the risk for inflammatory bowel disease[J].Curr Opin Immunol,2012,24(5):522-529.

[2] Brest P,Lapaquette P,Mograbi B,et al.Risk predisposition for Crohn disease：a "ménage à trois" combining IRGM allele,miRNA and xenophagy[J].Autophagy,2011,7(7):786-787.

[3] Cheon JH.Genetics of inflammatory bowel diseases：a comparison between Western and Eastern perspectives[J].J Gastroenterol Hepatol,2013,28(2):220-226.

[4] Wells GA,Shea B,O'connell D,et al.The Newcastle-Ottawa Scale(NOS) for assessing the quality of nonrandomised studies in meta-analyses Ottawa Health Research Institute[oL].www..ohri..ca/programs/Clinical_epidemiology/oxford..asp.

[5] Franke A,Balschun T,Karlsen TH,et al.Replication of signals from recent studies of Crohn's disease identifies previously unknown disease loci for ulcerative colitis[J].Nat Genet,2008,40(6):713-715.

[6] Latiano A,Palmieri O,Cucchiara S,et al.Polymorphism of the IRGM gene might predispose to fistulizing behavior in Crohn's disease[J].Am J Gastr oenterol,2009,104(1):110-116.

[7] Moon CM,Shin DJ,Kim SW,et al.Associations between genetic variants in the IRGM gene and inflammatory bowel diseases in the Korean population[J].Inflamm Bowel Dis,2013,19(1):106-114.

[8] Parkes M,Barrett JC,Prescott NJ,et al.Sequence variants in the autophagy gene IRGM and multiple other replicating loci contribute to Crohn's disease Susceptibility[J].Nat Genet,2007,39(7):830-832.

[9] Prager M,Büttner J,Haas V,et al.The JAK2 variant rs10758669 in Crohn's disease：altering the intestinal barrier as one mechanism of Action[J].Int J Colorectal Dis,2012,27(5):565-573.

[10] Roberts RL,Hollis-Moffatt JE,Gearry RB,et al.Confirmation of association of IRGM and NCF4 with ileal Crohn's disease in a populationbased cohort[J].Genes Immun,2008,9(6):561-565.

[11] Wang MH,Okazaki T,Kugathasan S,et al.Contribution of higher risk genes and European admixture to Crohn's disease in African Americans[J].Inflamm Bowel Dis,2012,18(12):2277-2287.

[12] Yamazaki K,Takahashi A,Takazoe M,et al.Positive association of genetic variants in the upstream region of NKX2-3 with Crohn's disease in Japanese patients[J].Gut,2009,58(2):228-232.

[13] 智佳，智發(fā)朝.ATG16L1和IRGM基因多態(tài)性與克羅恩病相關(guān)性的初步研究[D].南方醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文，2008.

[14] Scharl M,Rogler G.Inflammatory bowel disease：dysfunction of autophagy?[J].Dig Dis,2012,30(Suppl 3):12-19.

[15] Palomino-Morales RJ,Oliver J,Gómez-GarcíaM,et al.Association of ATG16L1 and IRGM genes polymorphisms with inflammatory bowel disease：a meta-analysis approach[J].Genes Immun,2009,10(4):356-364.

Objective To investigate the association between immunity-related GTPase family M（IRGM）gene polymorphisms and genetic susceptibility to Crohn's disease（CD）. Methods MeSH and keyword searches of the Cochrane Database, Pubmed, Embase, Science Citation Index,the Database of Chinese Science Journals，F(xiàn)ull-text Database of Chinese Journals,and Wanfang Database from the inception of each database to October 2012 were performed to identify all available studies. Two independent reviewers assessed studies for inclusion and exclusion based on methodological quality criteria, and then conducted Meta-analysis of （Odds ratio，OR）using Review Manager 5.2.6 software. Results A total of nine case-control or cohort studies were included. Meta-analyses showed for the IRGM-4958847 A/G gene polymorphism, the AG genotype was associated with the risk of CD(OR=1.17，95% CI（1.01-1.35）, P=0.03). Conclusion The meta-analysis suggests that the IRGM-4958847 AG genotype might be a risk factor for CD.

Crohn's disease；Immunity-related GTPase family, M； Polymorphism; Meta-analysis

10.3969/j.issn.1009-4393.2013.36.001

貴州省衛(wèi)生廳科學(xué)技術(shù)基金（gzwkj2012-1-032） 貴州省科技計劃（黔科合SY字[2013]3030號）

貴州 550002 貴州省人民醫(yī)院消化內(nèi)科（ 崔德軍 王景林 黃博）