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    2009~2011年上海市手足口病流行病學(xué)和病原學(xué)特征

    2013-01-14 04:34:30邵俊杰王嘉瑜滕崢潘浩陳洪友匡小舟俞雪蓮朱兆奎張曦
    微生物與感染 2013年4期
    關(guān)鍵詞:腸道病毒口病流行病學(xué)

    邵俊杰,王嘉瑜,滕崢,潘浩,陳洪友,匡小舟,俞雪蓮,朱兆奎,張曦

    上海市疾病預(yù)防控制中心, 上海 200336

    手足口病 (hand, foot and mouth disease, HFMD)是嬰幼兒常見傳染病,臨床表現(xiàn)以發(fā)熱和手、足、口腔等部位出現(xiàn)皮疹、潰瘍等為主,個(gè)別患兒可引起心肌炎、肺水腫、無菌性腦膜腦炎等致命并發(fā)癥[1,2]。手足口病是世界范圍內(nèi)流行的傳染病[3],近10年來許多國家和地區(qū)均有此病暴發(fā)或流行的報(bào)道,已引起普遍關(guān)注。手足口病可由多種腸道病毒引起,其中人腸道病毒71型(human enterovirus 71,HEV71)和柯薩奇病毒A組16型(Coxsackievirus A16,CA16)為主要病原體。

    2008年5月,我國將手足口病納入丙類法定傳染病報(bào)告與管理。同年,上海市開展對手足口病常規(guī)監(jiān)測,并于2009年建立各區(qū)(縣)手足口病監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室。 本研究對上海市2009~2011年手足口病的流行病學(xué)資料、手足口病監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和總結(jié);對3年內(nèi)分離獲得的部分HEV71毒株的VP1基因序列進(jìn)行分析,以初步闡明本市手足口病的流行病學(xué)及病原學(xué)特征,為本市手足口病預(yù)防和控制策略的制定提供一定的科學(xué)依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 流行病學(xué)資料

    流行病學(xué)分析所用數(shù)據(jù)來源于國家疾病監(jiān)測信息報(bào)告管理系統(tǒng)。

    1.2 標(biāo)本

    收集2009~2011年上海市18個(gè)區(qū)(縣)手足口病監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室采集的手足口病病例臨床標(biāo)本共6 676份(2009年徐匯區(qū)、黃浦區(qū)、長寧區(qū)無送檢標(biāo)本),其中2009年799份、2010年2 902份、2011年2 975份。

    1.3 核酸提取及檢測

    咽拭子或皰疹液標(biāo)本經(jīng)1 500g離心10 min后,取200 μ l上清液用于核酸提取。使用NucliSens SCNS(梅里埃公司,法國)核酸抽提試劑提取核酸,在待檢標(biāo)本中加入400 μ l 裂解液,室溫孵育10 min 后加入65 μ l磁珠,上機(jī)提取核酸。程序設(shè)置按照儀器說明書進(jìn)行。

    使用腸道病毒通用熒光定量反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(reverse transcriptase-polymerase chain reaction,RT-PCR)檢測試劑盒、HEV71 熒光定量RT-PCR 檢測試劑盒和CA16 熒光定量RT-PCR 檢測試劑盒(上海之江生物科技股份有限公司)對所有樣品進(jìn)行檢測。擴(kuò)增反應(yīng)體系和條件按照說明書操作和設(shè)置,在Roche LightCycler 480型熒光定量PCR儀上進(jìn)行。

    1.4 病毒分離

    將2009~2011年上送的257份HEV71核酸陽性標(biāo)本接種于正常生長的人橫紋肌肉瘤(rhabdomyosarcoma,RD)細(xì)胞,鏡下逐日觀察細(xì)胞病變情況,對未發(fā)生細(xì)胞病變的標(biāo)本盲傳2代。將發(fā)生細(xì)胞病變的培養(yǎng)物凍融3次,離心后取上清液,用HEV71 熒光定量RT-PCR 檢測試劑盒進(jìn)行毒株鑒定。

    1.5 基因擴(kuò)增及序列測定

    從2009~2011年分離獲得的HEV71陽性毒株中,選取27株(2009年7株、2010年10株、2011年10株)進(jìn)行VP1編碼區(qū)序列測定,用于HEV71基因特征分析。 引物采用中國疾病預(yù)防控制中心設(shè)計(jì)的VP1基因全長(891 bp),上游引物:5′ -GCAGCCCAAAAGAACTTCAC-3′ ,下游引物:5′ -AAGTCGCGAGAGCTGTCTTC-3′ 。 擴(kuò)增反應(yīng)采用Invitrogen公司的SuperScriptTMIII One-Step RT-PCR System with Platinum?Taq High Fidelity試劑盒,具體操作參照說明書。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳確認(rèn)后進(jìn)行測序和分析(測序由上海博尚生物技術(shù)有限公司完成)。

    1.6 序列分析

    將本研究中27條HEV71 VP1序列與GenBank下載的不同基因型/亞型HEV71代表株的VP1序列進(jìn)行同源性及基因進(jìn)化關(guān)系分析,采用Vector NTI生物信息軟件進(jìn)行序列拼接分析、同源性比對,親緣性關(guān)系樹采用MEGA5.05軟件進(jìn)行構(gòu)建。

    2 結(jié)果

    2.1 流行病學(xué)

    2.1.1疫情概況2009~2011年上海市累計(jì)報(bào)告手足口病102 756例,重癥968例,占病例總數(shù)的0.94%;死亡19例。其中,2010年上海市手足口病報(bào)告41 151例,發(fā)病率為214.22/10萬,較2009年上升68.68%;重癥418例,上升113.27%;死亡11例,均為3年中最高值(表1)。

    表1 2009~2011年上海市手足口病流行病學(xué)概況

    Tab.1 Epidemiological characteristic of HFMD cases in Shanghai, 2009-2011

    YearCases Severe casesDeathMorbidity(/100 000)Fatality rate(%)200924 2821966128.590.025 201041 15141811214.220.027 201137 3233542162.140.005

    2.1.2地區(qū)、時(shí)間分布2009~2011年上海市18個(gè)區(qū)(縣)均有手足口病病例報(bào)告,3年內(nèi)發(fā)病數(shù)居前3位的是浦東新區(qū)20 127例、閔行區(qū)16 012例及寶山區(qū)7 705例。

    就發(fā)病時(shí)間來看,2009年發(fā)病高峰期為4~7月,此期報(bào)告病例數(shù)占全年病例數(shù)的48.97%,11月出現(xiàn)第2個(gè)發(fā)病小高峰,病例數(shù)占10.46%。2010年發(fā)病集中在4~6月,其中5月最高,峰值較2009年明顯上升。2011年發(fā)病高峰期較2010年推遲約1個(gè)月,主要集中在6~7月,峰值亦明顯降低。

    2.1.3人群分布主要發(fā)病年齡為≤5歲的嬰幼兒,其次為6~7歲學(xué)生。2009年≤5歲嬰幼兒占發(fā)病人數(shù)的84.2%,2010年和2011年分別占93.1%和91.8%。其中,2009年以2歲組幼兒發(fā)病數(shù)最高,占26.8%;2010和2011年均以1歲組幼兒發(fā)病數(shù)最高,分別占24.8%和24.5%。職業(yè)分布以散居兒童、幼托兒童為主。性別分布以男性為主,男女性別比為1.6∶1。

    2.2 病原構(gòu)成

    2.2.1不同地區(qū)的病原構(gòu)成對2009~2011年上海市18個(gè)區(qū)(縣)手足口病監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室6 676例病例標(biāo)本進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室診斷(2009年徐匯區(qū)、黃浦區(qū)、長寧區(qū)無送檢標(biāo)本),4 647例病例標(biāo)本核酸檢測為腸道病毒陽性,陽性率為69.61%。3年間上海市HEV71和CA16陽性檢出率分別為38.83%和21.26%。除虹口區(qū)、普陀區(qū)、閘北區(qū)以CA16為主外,崇明縣HEV71與CA16構(gòu)成比相當(dāng),其他區(qū)(縣)均以HEV71為主(表2)。

    表2 2009~2011年上海市18個(gè)區(qū)(縣)手足口病病例病原構(gòu)成

    Tab.2 Pathogen constituent of HFMD cases in Shanghai, 2009-2011

    District/CountyCases Positive cases (n,%)Constituent ratio (n,%)HEV71CA16Other HEVBaoshan326235(72.09)141(60.00)70(29.79)24(10.21)Changning686486(70.85)246(50.62)140(28.81)100(20.58)Chongming276183(66.30)71(38.80)70(38.25)42(22.95)Fengxian297214(72.05)103(48.13)59(27.57)52(24.30)Hongkou248152(61.29)55(36.18)68(44.74)29(19.08)Huangpu177123(69.49)61(49.59)24(19.51)38(30.89)Jiading213182(85.45)90(49.45)64(35.16)28(15.38)Jing’an454328(72.25)160(48.78)124(37.80)44(13.41)Jinshan177141(79.66)59(41.84)56(39.72)26(18.44)Luwan296186(62.84)111(59.68)72(38.71)3(1.61)Minhang1 2861 027(79.86)834(81.21)125(12.17)68(6.62)Pudong310205(66.13)106(51.71)86(41.95)13(6.34)Putuo470282(60.00)107(37.94)150(53.19)25(8.87)Qingpu423187(44.21)125(66.84)59(31.55)3(1.60)Songjiang171128(74.85)55(42.97)44(34.38)29(22.66)Xuhui318234(73.58)101(43.16)89(38.03)44(18.80)Yangpu332241(72.59)136(56.43)60(24.90)45(18.67)Zhabei216113(52.32)31(27.43)59(52.21)23(20.35)

    2.2.2不同年份的病原構(gòu)成對不同年份的病原構(gòu)成情況進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果表明,2009年手足口病人腸道病毒通用型核酸陽性比例最高,為75.97%,2010和2011年分別為68.71%和68.77%。從HEV71檢出率來看, 2011年HEV71核酸陽性的檢出率為41.34 %,高于2009年的38.67%和2010年的36.29%。CA16核酸陽性的檢出率從2009年的33.54%降至2011年的16.40%,呈逐年下降的趨勢(圖1)。

    圖1上海地區(qū)2009~2011年手足口病各病原陽性檢出率

    Fig.1 Detection rate of pathogen in Shanghai, 2009-2011

    2.3 病毒分離結(jié)果

    將257例HEV71核酸陽性標(biāo)本接種細(xì)胞傳代后,獲得陽性毒株57株(圖2),病毒分離陽性率為22.18%。

    2.4 HEV71基因特征分析

    在2009~2011年分離獲得的HEV71陽性毒株中,選取27株進(jìn)行HEV71的VP1基因片段擴(kuò)增(電泳結(jié)果見圖3),大小為927 bp。測序后獲得的VP1基因片段通過Vector NTI軟件對比標(biāo)準(zhǔn)VP1序列剪接后,得到的序列均為891 bp,用于對基因序列分析。

    從GenBank上下載A基因型(GenBank號:BrCr/USA/87)、B1基因型(GenBank號:6910/USA/87、Nagoya/JPN/1973)、B2基因型(GenBank號:2952/USA/81、7423/USA/1987)、B3基因型(GenBank號:SK-EV006-SAR/MAS/97、4F/AUS/4/99)、B4基因型(GenBank號:2027/SIN/01、C7-Osaka/JPN/1997)、B5基因型(GenBank號:SB12007-SAR/MAS/03、SB12282-SAR/MAS/03)、C1基因型(GenBank號:0915/USA/87、SB9508-SAR/MAS/03)、C2基因型(GenBank號:8M/AUS/6/99、2641/AUS/95)、C3基因型(GenBank號:03/KOR/00、97-56/HLJ/CHN/97)、C4a基因型(GenBank號:521-09F/SD/CHN/07、521-19T/SD/CHN/07)、C4b基因型(GenBank號:H25/SH/CHN/00、H26/SH/CHN/00)及國內(nèi)部分地區(qū)代表株的VP1序列,作為參考序列進(jìn)行基因分析。

    A: Control RD cells. B: Cells infected with HEV71.

    圖2 HEV71引起RD細(xì)胞病變

    Fig.2 Cytopathic effect of RD cells induced by HEV71

    A: From left to right: scdc01/sh/chn/2009, scdc02/sh/chn/2009, scdc03/sh/chn/2009, scdc04/sh/chn/2009, scdc05/sh/chn/2009, scdc06/sh/chn/2009, scdc07/sh/chn/2009, scdc01/sh/chn/2010, scdc02/sh/chn/2010, scdc03/sh/chn/2010, scdc04/sh/chn/2010, scdc05/sh/chn/2010, scdc06/sh/chn/2010, scdc017sh/chn/2010, and marker. B: From left to right: scdc08/sh/chn/2010, scdc09/sh/chn/2010, scdc10/sh/chn/2010, scdc01/sh/chn/2011, scdc02/sh/chn/2011, scdc03/sh/chn/2011, scdc04/sh/chn/2011, scdc05/sh/chn/2011, scdc06/sh/chn/2011, scdc07/sh/chn/2011, scdc08/sh/chn/2011, scdc09/sh/chn/2011, scdc10/sh/chn/2011 and marker.

    圖3 VP1基因擴(kuò)增電泳結(jié)果

    Fig.3 Electrophoresis results of product amplified by primer VP1

    從MEGA5.05生物信息學(xué)軟件構(gòu)建的基因進(jìn)化樹(圖4)可看出,上海市27株HEV71與C4a 亞型毒株聚為一簇,具有最近的進(jìn)化親緣性。本研究中27個(gè)VP1基因核苷酸同源性為95%~100%,氨基酸同源性為98%~100%。與國內(nèi)其他省市代表株(核苷酸同源性為94%~100%,氨基酸同源性為97%~100%)相比,未發(fā)現(xiàn)特征性差異。

    圖4基于VP1核苷酸序列(891 nt)構(gòu)建的上海HEV71與各基因型/亞型的親緣性關(guān)系樹

    Fig.4 Phylogenetic tree reconstructed from HEV71 strains from Shanghai and representatives of each genotype/subgenotype, based on nucleotide acid sequences of VP1-coding region (891 nt)

    3 討論

    手足口病是腸道病毒引起的嬰幼兒常見病,其最主要的病原體是HEV71型和CA16型,少數(shù)病例可由CA4、CA5、CA7、CA9、CA10、CB5、CB6型引起[4-9]。近年來,在亞太地區(qū)不斷有手足口病暴發(fā)流行[10],且呈上升趨勢。自1969年首次分離到HEV71以來[11],由于其感染宿主后更易侵犯神經(jīng)系統(tǒng)而導(dǎo)致重癥及死亡病例[12]而越來越受到各方關(guān)注。自1981年上海報(bào)道手足口病以來[13],各省市每年均有散發(fā)、暴發(fā)病例。2008年安徽阜陽暴發(fā)的手足口病疫情引起社會(huì)各界廣泛關(guān)注,衛(wèi)生部將手足口病列入法定丙類傳染病進(jìn)行監(jiān)管,上海市于2009年建立手足口病防控與監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)。本研究通過對2009~2011年上海地區(qū)手足口病流行病學(xué)及病原學(xué)結(jié)果進(jìn)行分析,以了解上海地區(qū)手足口病流行規(guī)律及特點(diǎn)。

    與以往研究相似[14],2009~2011年上海市發(fā)生的手足口病病例男性多于女性,主要以0~5歲嬰幼兒為主,多發(fā)于散居及幼托兒童。因此,該年齡段兒童應(yīng)列為手足口病防控的主要對象,也是防止手足口病發(fā)展為重癥、死亡病例的重點(diǎn)人群。從區(qū)域分布來看,3年內(nèi)發(fā)病數(shù)居前2位的分別是浦東新區(qū)和閔行區(qū),這可能與這些區(qū)存在大型兒童醫(yī)院相關(guān)。

    對3年來上海市18個(gè)區(qū)(縣)6 676例手足口病病例進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室診斷,結(jié)果顯示2009~2011年造成上海地區(qū)手足口病流行的主要病原仍為HEV71和CA16。值得關(guān)注的是,HEV71感染的病例呈上升趨勢,2011年HEV71檢出率高于2009及2010年,這也與HEV71感染存在隔2年出現(xiàn)高發(fā)的特點(diǎn)相符[15],但其原因有待進(jìn)一步研究。此外,由于HEV71感染后易侵犯中樞神經(jīng)系統(tǒng)并導(dǎo)致重癥及死亡病例,上海地區(qū)手足口病的防控形勢依然嚴(yán)峻。CA16感染的病例數(shù)呈逐年下降趨勢,而其他腸道病毒致手足口病病例的構(gòu)成逐年上升,提示對其他腸道病毒的鑒定與分型有助于手足口病防控工作的開展。對不同區(qū)(縣)HEV71和CA16檢出率的比較發(fā)現(xiàn),虹口區(qū)、普陀區(qū)、閘北區(qū)以CA16感染為主, 崇明縣兩者比例相當(dāng),其余區(qū)(縣)以HEV71感染為主(表2),提示必須同時(shí)對HEV71和CA16采取監(jiān)測和控制措施,才能切實(shí)開展好手足口病的防控工作。

    此次研究分析的27株HEV71 VP1基因核苷酸序列的同源性為95%~100%,氨基酸同源性為98%~100%,均非常接近國內(nèi)C4a流行株,與其有非常高的同源性,證實(shí)上海市2009~2011年流行的HEV71為C4a亞型。本研究與周邊省市[1,16-18]流行株相同,而與國外[2,19-21]研究結(jié)果比較,流行株不盡相同,說明國內(nèi)手足口病存在穩(wěn)定優(yōu)勢株。目前國內(nèi)HEV71主要以C4a流行株為主[22-26]。

    由此可見,腸道病毒引起的手足口病已成為上海及國內(nèi)其他省市嬰幼兒常見病,發(fā)病率較高,HEV71和CA16仍為主要病原體。對其進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測和病原體檢測有助于了解本地區(qū)流行株型別及流行株變異對疾病流行的影響,從而對疾病進(jìn)行更加有效的防控。

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