數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格示范站點(diǎn)建設(shè)與應(yīng)用取得良好效果*

文/中國(guó)科學(xué)院高能物理研究所（北京 100039） 中國(guó)科學(xué)院計(jì)劃財(cái)務(wù)局（北京 100864）

數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格示范站點(diǎn)建設(shè)與應(yīng)用取得良好效果*

文/中國(guó)科學(xué)院高能物理研究所（北京 100039） 中國(guó)科學(xué)院計(jì)劃財(cái)務(wù)局（北京 100864）

中國(guó)科學(xué)院，知識(shí)創(chuàng)新工程重大項(xiàng)目，數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格

近年來(lái)，隨著科學(xué)研究規(guī)模的日益擴(kuò)大，科學(xué)家需要采集海量數(shù)據(jù)用于研究和解決復(fù)雜的科學(xué)問(wèn)題，而科學(xué)數(shù)據(jù)呈數(shù)量級(jí)增長(zhǎng)對(duì)計(jì)算技術(shù)提出了更大的挑戰(zhàn)。數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)建立在網(wǎng)格技術(shù)基礎(chǔ)上，是一種對(duì)海量數(shù)據(jù)進(jìn)行高效分析處理的有效工具，在物理、化學(xué)、生物科學(xué)、醫(yī)學(xué)、核能技術(shù)、石油探勘、航天工程等眾多領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用前景，并得到了快速推廣。2008年，中科院?jiǎn)?dòng)了知識(shí)創(chuàng)新工程重大項(xiàng)目“數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)示范站點(diǎn)”（英文名稱(chēng)：Data Intensive Grid Platform），項(xiàng)目以高能物理所為依托單位，聯(lián)合計(jì)算技術(shù)所、網(wǎng)絡(luò)信息中心及研究生院等單位共同承擔(dān)。

項(xiàng)目以學(xué)科實(shí)際應(yīng)用的持續(xù)需求為牽引，采用成熟先進(jìn)的網(wǎng)格中間件搭建和整合數(shù)據(jù)網(wǎng)格資源，建立了由1 760個(gè)CPU核、617.3TB磁盤(pán)存儲(chǔ)組成的計(jì)算資源網(wǎng)格環(huán)境，已成為國(guó)際高能物理網(wǎng)格平臺(tái)WLCG(Worldwide LHC Computing Grid)的重要組成部分，并實(shí)現(xiàn)了與中國(guó)國(guó)家網(wǎng)格（CNGrid）的互操作，有效支持了與歐洲粒子物理中心、法國(guó)國(guó)家核物理與粒子物理研究所計(jì)算中心、美國(guó)國(guó)家費(fèi)米實(shí)驗(yàn)室等國(guó)際上重要的科研機(jī)構(gòu)以及國(guó)內(nèi)多家研究機(jī)構(gòu)之間的合作。該網(wǎng)格站點(diǎn)運(yùn)行穩(wěn)定，任務(wù)飽滿(mǎn)，在國(guó)際高能物理網(wǎng)格系統(tǒng)的200多個(gè)站點(diǎn)中被評(píng)為‘Leadership’站點(diǎn)。

項(xiàng)目建設(shè)的數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)已成功應(yīng)用于高能物理、地球動(dòng)力學(xué)及生物信息學(xué)等若干領(lǐng)域，并成為多領(lǐng)域科學(xué)計(jì)算的重要支撐系統(tǒng)。在粒子物理計(jì)算領(lǐng)域，超環(huán)面儀器實(shí)驗(yàn)（ATLAS）是運(yùn)行在LHC（Large Hadron Collider）上最大規(guī)模的實(shí)驗(yàn)之一，數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)為中國(guó)物理學(xué)家參與該大型國(guó)際合作項(xiàng)目提供了高性能計(jì)算環(huán)境。緊湊型繆子螺線管探測(cè)器實(shí)驗(yàn)（CMS）則是類(lèi)似于ATLAS的另一個(gè)大型LHC實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目，數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)同樣為中國(guó)科學(xué)家參與CMS物理分析提供了必要的支撐條件。數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)每年為ATLAS和CMS實(shí)驗(yàn)提供約500萬(wàn)CPU小時(shí)的機(jī)時(shí)，完成400余萬(wàn)個(gè)計(jì)算作業(yè)，在希格斯粒子尋找和性質(zhì)研究、超對(duì)稱(chēng)粒子的尋找、超對(duì)稱(chēng)破缺共振態(tài)的尋找、W和Z玻色子特性研究以及top夸克的特性研究，μ+ μ–研究、J/y、?極化研究做出了重要成果。

大連化學(xué)物理所利用數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)進(jìn)行了具有高度序列一致性但不同三維結(jié)構(gòu)的蛋白折疊機(jī)理理論研究。該研究進(jìn)行了大規(guī)模的、一系列不同溫度下的分子動(dòng)力學(xué)模擬，通過(guò)計(jì)算找到了蛋白質(zhì)折疊的過(guò)渡態(tài)，發(fā)現(xiàn)了主導(dǎo)蛋白質(zhì)折疊規(guī)律的重要相互作用，對(duì)于認(rèn)知蛋白質(zhì)折疊的機(jī)理，序列、結(jié)構(gòu)和功能之間的關(guān)系具有非常重要的意義，為進(jìn)一步人工設(shè)計(jì)和改造蛋白質(zhì)奠定了一定的理論基礎(chǔ)。

此外，項(xiàng)目根據(jù)網(wǎng)格平臺(tái)的需求研究開(kāi)發(fā)了多網(wǎng)格作業(yè)管理系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)了不同網(wǎng)格平臺(tái)間的互操作。項(xiàng)目開(kāi)發(fā)了基于異構(gòu)介質(zhì)的存儲(chǔ)系統(tǒng)、分布式海量數(shù)據(jù)存儲(chǔ)系統(tǒng)、網(wǎng)格運(yùn)行監(jiān)控系統(tǒng)等并得到較好的應(yīng)用。

基于該項(xiàng)目所取得的成果，項(xiàng)目組將進(jìn)一步致力于推進(jìn)數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)的實(shí)用化和產(chǎn)業(yè)化工作。數(shù)據(jù)密集型網(wǎng)格平臺(tái)將繼續(xù)以學(xué)科實(shí)際應(yīng)用的持續(xù)需求為牽引，與信息技術(shù)的最新發(fā)展緊密結(jié)合，采用成熟先進(jìn)的網(wǎng)格中間件建立和整合數(shù)據(jù)網(wǎng)格資源，形成e-Science示范平臺(tái)，通過(guò)高效合理的運(yùn)維管理保證網(wǎng)格平臺(tái)的穩(wěn)定運(yùn)行，并為大科學(xué)工程、國(guó)際合作等科學(xué)計(jì)算需求提供優(yōu)質(zhì)服務(wù)。

*本文由中科院計(jì)劃財(cái)務(wù)局項(xiàng)目管理處茹加（rujia@cashq.ac. cn）、高能物理所科技處王曉輝共同組織撰寫(xiě)

2012年5月22日