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    吸血蠓分子分類研究進(jìn)展*

    2012-01-25 17:11:55王飛鵬黃恩炯宋誠(chéng)本王宇平
    關(guān)鍵詞:分類研究

    王飛鵬,黃恩炯,肖 武,宋誠(chéng)本,王宇平

    吸血蠓(Blood-sucking midges)是一類微小型昆蟲,屬雙翅目(Diptera)蠓科(Ceratopogonidae),幾乎廣泛分布于世界各地,可攜帶數(shù)十種人獸共患病病原,是醫(yī)學(xué)昆蟲的重要類群之一。蠓的分類研究最早記載于林奈的《Systema Nat urae》中,距今已有250余年的發(fā)展歷史,形成了較為成熟的分類體系[1]。但由于蠓科昆蟲中存在許多具有多處相似特征的隱種(cr yptic species)組成的復(fù)合體(co mplex)或種團(tuán)(gr oup),沿用傳統(tǒng)靠識(shí)別形態(tài)學(xué)特征的方法對(duì)這類群昆蟲進(jìn)行分類和鑒定往往較為困難,進(jìn)而也影響了對(duì)其系統(tǒng)進(jìn)化及其與病原生物關(guān)系的深入研究。因此,尋找可靠的分類鑒定方法,以期快速、準(zhǔn)確地識(shí)別蠓科昆蟲,尤其是吸血蠓,是現(xiàn)代昆蟲分類學(xué)家研究的重要內(nèi)容之一,也是蠓傳疾病防治工作的基礎(chǔ)。

    分子分類技術(shù)是以遺傳物質(zhì)DNA序列分析為依據(jù)來(lái)闡明物種間的差別,從分子水平上快速而準(zhǔn)確地鑒別物種。它是分子生物學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)與傳統(tǒng)分類學(xué)相結(jié)合的產(chǎn)物,作為一種嶄新的分類學(xué)技術(shù),極大彌補(bǔ)了傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)鑒定的缺陷,已引起越來(lái)越多生物學(xué)家們的重視。蠓科昆蟲的分子分類研究起步較遲,從1992年研究變翅庫(kù)蠓(Culicoides variipennis)種群的基因差異起[2],才陸續(xù)有報(bào)道。近年來(lái),隨著以PCR基礎(chǔ)的DNA序列測(cè)定方法的建立和廣泛使用,核糖體DNA(r DNA)的內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)、線粒體 DNA(mt DNA)的細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅰ(COⅠ)、細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅱ(COⅡ)等基因逐漸受到蠓科分類學(xué)家們的重視。本文就近幾年來(lái)吸血蠓的分子分類研究進(jìn)展綜述如下。

    1 r DNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列的應(yīng)用

    r DNA廣泛分布于各種生物細(xì)胞中,在功能上具有高度的保守性和良好的時(shí)鐘性,其測(cè)定序列常用于物種分類和生物間系統(tǒng)發(fā)育的研究,尤其是物種的種間分類研究[3-5]。目前r DNA作為遺傳標(biāo)記在寄生蟲鑒定中的應(yīng)用日趨廣泛,前人對(duì)此作了詳盡的描述[6-8]。ITS是位于r DNA 上18S和28S基因之間的區(qū)域片段,包括ITS1和ITS2兩段序列,由于該區(qū)域不加入成熟核糖體,所以受到的選擇壓力較小,進(jìn)化速度較其他區(qū)域快,具有種內(nèi)變異小而種間變異大的特性,加上協(xié)同進(jìn)化作用保證了該片段在基因組不同單元間的一致性,因而適合進(jìn)行各種分子操作,是較理想的種間鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析的遺傳標(biāo)志[9-12]。近幾年來(lái)國(guó)內(nèi)外對(duì)ITS序列標(biāo)記在蠓科昆蟲中的研究和應(yīng)用越來(lái)越多,r DNA的ITS1和ITS2序列在蠓類昆蟲的鑒定中發(fā)揮了重要的作用。

    1.1 ITS1序列標(biāo)記 2004年,Cetre-Sossah等[13]通過(guò)設(shè)計(jì)特異性引物,利用ITS1序列標(biāo)記建立了庫(kù)蠓屬(Culicoides spp.)和殘肢庫(kù)蠓(C.i micol a)的分子分類方法。研究發(fā)現(xiàn):包括殘肢庫(kù)蠓(C.i micol a)在內(nèi)的9種庫(kù)蠓的ITS1序列長(zhǎng)度范圍在316-500 bp,其中,殘肢庫(kù)蠓(C.i micol a)有一條303 bp的特異性條帶;之后,Cetre-Sossah等[14]又提出以ITS1作為靶標(biāo)基因的實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),該技術(shù)特異性強(qiáng)、靈敏度高,在殘肢庫(kù)蠓(C.i micol a)的監(jiān)測(cè)和研究項(xiàng)目上具有廣闊的應(yīng)用前景。Perrin等[15]再次對(duì)殘肢庫(kù)蠓(C.i micol a)進(jìn)行ITS1序列測(cè)定和系統(tǒng)發(fā)育分析,同源性高達(dá)99.8%,驗(yàn)證了ITS1在物種進(jìn)化和遺傳關(guān)系研究中的價(jià)值。Mathieu等[16]利用PCR技術(shù)對(duì)不顯庫(kù)蠓復(fù)合體(obsolet us co mplex)的ITS1序列進(jìn)行測(cè)定發(fā)現(xiàn):雪翅庫(kù)蠓(C.chiopter us)、不顯庫(kù)蠓(C.obsoletus)、蘇格蘭庫(kù)蠓(C.scoticus)、丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)和山丘庫(kù)蠓(C.montanus)的同源性分別為98.93%、99.43%、98.33%、99.1%和98.47%,對(duì)這5種蠓的ITS1片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增表明,不顯庫(kù)蠓復(fù)合體均有一條166 bp的條帶,但雪翅庫(kù)蠓(C.chiopter us),丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)和不顯庫(kù)蠓(C.obsoletus)還分別有一條78 bp、117 bp、302 bp的條帶,山丘庫(kù)蠓(C.montanus)還有125 bp和302 bp條帶,而蘇格蘭庫(kù)蠓(C.scoticus)僅見(jiàn)166 bp這唯一的條帶。從遺傳關(guān)系看,不顯庫(kù)蠓復(fù)合體(obsolet us co mplex)中的丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)與殘肢庫(kù)蠓(C.i micol a)最為親近。Stephan[17]采用降落PCR法擴(kuò)增、克隆丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)的ITS1基因。結(jié)果表明:丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)有一條295 bp的特異性條帶,這一結(jié)論為丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)在不顯庫(kù)蠓復(fù)合體中的準(zhǔn)確鑒定提供了新的依據(jù)。Matsu moto[18]研究提出庫(kù)蠓的ITS1基因可根據(jù)堿基的缺失或插入情況不同分為長(zhǎng)型和短型兩種類型,并認(rèn)為長(zhǎng)型ITS1是庫(kù)蠓ITS1基因的原型,一些短型ITS1庫(kù)蠓是由于堿基缺失所引起,而二囊亞屬有其ITS1特異序列,并形成單系群。Li等[19]根據(jù)荒川庫(kù)蠓(C.a(chǎn)r aka wai)、淺色庫(kù)蠓(C.a(chǎn)lbicans)、肘臂庫(kù)蠓(C.cubitalis)等10種庫(kù)蠓的ITS1基因片段長(zhǎng)度,將10種庫(kù)蠓分為457-469 bp和316-347 bp兩群。從總體上看,10種庫(kù)蠓ITS1片段在288-388 bp的范圍出現(xiàn)一個(gè)高度保守的區(qū)域,由此提出可以在1-287 bp和385-500 bp范圍內(nèi)設(shè)計(jì)特異性引物,以ITS1為擴(kuò)增的靶標(biāo)序列,通過(guò)PCR的方法來(lái)鑒別各種庫(kù)蠓。

    1.2 ITS2序列標(biāo)記 Go mulski等[20]對(duì)包括灰黑庫(kù)蠓復(fù)合體(pulicaris co mplex)在內(nèi)的11種庫(kù)蠓的r DNA-ITS2區(qū)基因進(jìn)行克隆和序列分析,推斷意大利主要庫(kù)蠓亞屬的系統(tǒng)發(fā)育。結(jié)果認(rèn)為庫(kù)蠓亞屬是由Culicoides sensu stricto,Sil vicol a,Hoff mania Fox和迄今不詳?shù)腇agineus復(fù)合體4個(gè)家系組成的多源聚合體。提出ITS2作為吸血蠓PCR擴(kuò)增的靶標(biāo)序列,不僅有利于鑒定蠓新種,還能有效輔助澄清庫(kù)蠓亞屬里的同種異名,分子鑒定與形態(tài)學(xué)鑒定相佐證能夠解決吸血蠓形態(tài)學(xué)鑒定中的難題。Monaco等[21]提出以ITS2為標(biāo)記基因的實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)準(zhǔn)確率高,比常規(guī)PCR更適合運(yùn)用于不顯庫(kù)蠓復(fù)合體(obsolet us co mplex)的快速鑒定,特別是在鑒定大規(guī)模不顯庫(kù)蠓復(fù)合體(obsolet us co mplex)標(biāo)本的情況下更具高效性。胡友蘭和李國(guó)清[22]對(duì)荒川庫(kù)蠓(C.a(chǎn)r aka wai)、變翅庫(kù)蠓(C.variipennis)和殘肢庫(kù)蠓(C.i micol a)等6種雙翅目昆蟲r DNA-ITS2的研究表明,雙翅目昆蟲ITS 2片段大小在不同屬間的差異很大,即使是同一屬的庫(kù)蠓,同源性也不高,最大為40.9%[荒川庫(kù)蠓(C.a(chǎn)r aka wai)與殘肢庫(kù)蠓(C.i micol a)],荒川庫(kù)蠓(C.a(chǎn)r aka wai)與變翅庫(kù)蠓(C.variipennis)的同源性稍低,為32.7%。從而驗(yàn)證了真核生物ITS2序列具有高度變異性的特點(diǎn),同時(shí)也說(shuō)明了ITS2片段作為庫(kù)蠓PCR鑒別的靶標(biāo)序列,能提供比較豐富的遺傳信息。

    2 線粒體DNA(mt DNA)的應(yīng)用

    線粒體DNA是細(xì)胞內(nèi)相對(duì)獨(dú)立的基因組,具有結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、基因組小、易分離純化、序列順序和組成一般比較保守、嚴(yán)格遵循母系遺傳、單拷貝、進(jìn)化速率較核DNA快、無(wú)重組等特點(diǎn),它的傳遞、重組、分離、復(fù)制、轉(zhuǎn)錄都可應(yīng)用分子生物學(xué)的許多手段和方法進(jìn)行分析,是分子進(jìn)化遺傳研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)[23-24]?,F(xiàn)已知線粒體的基因組至少含有13個(gè)蛋白質(zhì)基因,其中僅COⅠ、Cyt b、ND4、ND5這4個(gè)基因滿足基因插入和缺失現(xiàn)象較少、長(zhǎng)度在900 bp左右這兩個(gè)條件,但ND4、ND5進(jìn)化太快,不可能設(shè)計(jì)出通用引物,限制了它們作為全面DNA鑒定系統(tǒng)的目標(biāo)基因[25]。近年來(lái)線粒體COⅠ、COⅡ基因在蠓科昆蟲分類上的應(yīng)用較為廣泛,尤其是COⅠ基因,在一定程度上可作為傳統(tǒng)分類學(xué)的補(bǔ)充驗(yàn)證,推動(dòng)了蠓科昆蟲分子分類的研究進(jìn)展,但Cyt b在蠓的分子分類中至今未見(jiàn)報(bào)道。

    2.1 細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅰ(COⅠ)基因 自Hebert等[26-28]提出DNA條形碼技術(shù)并在全球開(kāi)展相關(guān)的協(xié)作研究后,COⅠ基因作為條形碼技術(shù)的標(biāo)準(zhǔn)目的基因推動(dòng)了以分子生物學(xué)技術(shù)為基礎(chǔ)的物種鑒定技術(shù),目前已經(jīng)在脊椎動(dòng)物和昆蟲中得到廣泛研究[29-32]。在吸血蠓分子鑒定研究方面,Linton等[33]對(duì)殘肢庫(kù)蠓復(fù)合體(C.i micol a complex)中5種庫(kù)蠓的COⅠ基因進(jìn)行序列測(cè)定,結(jié)果發(fā)現(xiàn):殘肢庫(kù)蠓復(fù)合體(C.i micol a complex)種間差異大,存在顯著的A-T堿基顛換。采用鄰接法(NJ)和最大簡(jiǎn)約法(MP)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),分子系統(tǒng)樹(shù)顯示各蠓種間區(qū)別明顯。Dallas等[34]對(duì)殘肢庫(kù)蠓復(fù)合體(C.i micol a complex)的CO I基因研究表明,殘肢庫(kù)蠓CO I基因單體型的地理結(jié)構(gòu)與藍(lán)舌病病毒(BTV)的血清型具相關(guān)性。Pages and Sarto I Monteys[35]通過(guò)設(shè)計(jì)特異性引物,對(duì)CO I基因進(jìn)行半巢式PCR擴(kuò)增、克隆,成功鑒定不顯庫(kù)蠓(C.obsoletus)和蘇格蘭庫(kù)蠓(C.scoticus)雌蟲,并且認(rèn)為形態(tài)學(xué)鑒定吸血蠓并不完全可靠,CO I基因可作為吸血蠓種間鑒定的遺傳標(biāo)志。Nolan等[36]也利用基于CO I基因的PCR方法快速準(zhǔn)確地鑒定灰黑庫(kù)蠓復(fù)合體(pulicaris co mplex)和不顯庫(kù)蠓復(fù)合體(obsolet us co mplex)。Pages等[37]又報(bào)道利用條形碼技術(shù)鑒定識(shí)別了庫(kù)蠓屬中的隱存種;同年,Sch wenkenbecher等[38]對(duì)不顯庫(kù)蠓復(fù)合體[obsolet us co mplex,含丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)]與灰黑庫(kù)蠓復(fù)合體(pulicaris co mplex)幼蟲的CO I基因進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增、克隆及序列分析。研究表明CO I基因可作為分子標(biāo)記用于吸血蠓幼蟲的高通量鑒定。幼蟲的鑒定結(jié)果發(fā)現(xiàn):僅丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)在糞堆中有孳生,而其余庫(kù)蠓幼蟲多數(shù)孳生于水流或積水濕泥,這對(duì)掌握吸血蠓幼蟲的生態(tài)習(xí)性具有重要指導(dǎo)意義。Augot等[39]利用基于CO I基因的條形碼技術(shù),同時(shí)結(jié)合對(duì)頭部、生殖器和胸部的形態(tài)測(cè)量,成功鑒定了88份不顯庫(kù)蠓(C.obsoletus)和蘇格蘭庫(kù)蠓(C.scoticus)雌蟲標(biāo)本。但是,利用基于CO I基因的DNA條形碼技術(shù)鑒定吸血蠓在我國(guó)至今未見(jiàn)報(bào)道。

    2.2 細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅱ(COⅡ)基因 COⅡ序列具有很高的趨異性,尤其是在一些雙翅目和膜翅目昆蟲中,COⅡ基因序列和氨基酸順序均表現(xiàn)出高度的趨異性[40],因此,COⅡ基因序列在這類昆蟲的進(jìn)化機(jī)制及系統(tǒng)發(fā)育研究方面是一種非常有效的分子標(biāo)記。通過(guò)分析臺(tái)灣地區(qū)臺(tái)灣蠛蠓(Lasiohelea tai wana)的COⅡ基因序列發(fā)現(xiàn):不同臺(tái)灣蠛蠓(La.tai wana)個(gè)體間核苷酸分化程度可高達(dá)2.7%。群體內(nèi)以及群體間的平均變異水平在0.7% 左右。因此,遺傳交流可能是導(dǎo)致如今臺(tái)灣地區(qū)臺(tái)灣蠛蠓(La.tai wana)種群組成多元化的原因[41]。對(duì)蚊科、蠓科、搖蚊科以及蚋科等昆蟲的COII序列分析表明蠓群體間的分化程度較大,其在所屬的科中屬于較古老的種,而且相對(duì)于其他雙翅目長(zhǎng)角亞目昆蟲具有更為顯著的序列進(jìn)化[42]。

    3 結(jié) 語(yǔ)

    尋求快速、準(zhǔn)確、可靠的吸血蠓種類鑒定技術(shù),不僅是口岸一線檢疫工作人員開(kāi)展檢疫工作和有效防制蠓傳疾病的重要基礎(chǔ),更是生物學(xué)家發(fā)現(xiàn)新種和隱存種,重建物種和高級(jí)階元的演化關(guān)系,豐富生物資源的有效途徑。雖然分子分類與鑒定技術(shù)興起時(shí)間較晚,但其正以穩(wěn)步、快速的態(tài)勢(shì)發(fā)展。吸血蠓分子水平上的研究不僅有助于準(zhǔn)確地分類鑒定,也將有利于對(duì)其媒介功能的研究。目前,分子生物學(xué)技術(shù)已多見(jiàn)于吸血蠓種團(tuán)、復(fù)合體的分類鑒別中,少數(shù)也涉及到種群分化的研究,這將為解決蠓科研究中存有爭(zhēng)議的問(wèn)題提供指導(dǎo)性資料。當(dāng)今,國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)吸血蠓的分子分類已做了大量研究工作,但都仍處于實(shí)驗(yàn)室研究階段,各種分子分類應(yīng)用的靶標(biāo)基因有優(yōu)點(diǎn)也存在其一定的局限性。核糖體DNA上的ITS區(qū)域序列進(jìn)化速度快,在物種水平上變異較大,序列多態(tài)性強(qiáng)并含有足夠量的遺傳信息,已被廣泛用于物種分類及系統(tǒng)進(jìn)化研究,但是這些基因中存在大量的插入和缺失現(xiàn)象,從而使序列比對(duì)受到障礙,不便操作,而且還容易造成錯(cuò)誤的比對(duì)[43]?;诰€粒體基因編碼的DNA條形碼技術(shù)及其應(yīng)用前景雖被眾多學(xué)者所看好,但也有學(xué)者認(rèn)為如此短的DNA片段不能提供物種水平的可靠信息,完全依靠 DNA 條形碼會(huì)導(dǎo)致鑒定錯(cuò)誤[44-45]。更有人認(rèn)為采用DNA條形碼技術(shù)將是一種倒退,會(huì)將分類學(xué)退回到類型學(xué)[46-47]。在利用任何一個(gè)基因或多個(gè)基因片段進(jìn)行物種分類和種屬鑒定時(shí),不能只考慮所選用標(biāo)記基因的片段長(zhǎng)度,而應(yīng)該結(jié)合序列組成及其同源性綜合評(píng)價(jià)。例如,Sch wenkenbecher[48]選用ITS1、ITS2和 COⅠ3個(gè)靶標(biāo)基因通過(guò)系統(tǒng)發(fā)育分析提出了丘夫庫(kù)蠓(C.dewul f i)不應(yīng)屬于不顯庫(kù)蠓復(fù)合體的觀點(diǎn)。鑒于此,分子分類技術(shù)依舊無(wú)法完全取代傳統(tǒng)的吸血蠓分類鑒定方法,傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)手段不能完全拋棄。

    總之,分子分類技術(shù)目前所表現(xiàn)出的局限性不應(yīng)是其應(yīng)用和發(fā)展的阻礙,對(duì)于其面臨的問(wèn)題,可以探索、嘗試新的分子標(biāo)記及多個(gè)分子標(biāo)記相結(jié)合使用來(lái)解決,同時(shí)也不排斥其他分類方法,包括生物化學(xué)、計(jì)算機(jī)數(shù)值分類學(xué)和細(xì)胞遺傳學(xué)等方法,多層次、多方面、系統(tǒng)地研究吸血蠓分類,這樣就更能反映吸血蠓的種群進(jìn)化和親緣關(guān)系。今后,隨著分子生物學(xué)的不斷發(fā)展,吸血蠓的分子分類技術(shù)也將不斷地進(jìn)步和成熟。充分發(fā)揮分子分類技術(shù)的獨(dú)特優(yōu)勢(shì),利用分子分類技術(shù)與傳統(tǒng)的分類方法相互佐證,將大大有助于吸血蠓的分類鑒定。

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