母體血漿靶向性平行測序應(yīng)用于無創(chuàng)性單基因遺傳病的產(chǎn)前診斷

杜司晨 摘編

本文發(fā)表在2012年的《Clinical Chemistry》上。

目前，通過對母體血漿DNA 的深度測序可以確定胎兒的遺傳基因組和突變基因組，這項技術(shù)在許多單基因遺傳疾病的無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷（NIPD）中有重要應(yīng)用。在此過程中，相關(guān)單倍體劑量（RHDO）分析是十分關(guān)鍵的一步，即通過父母的SNP深度測序數(shù)據(jù)推斷出母體外周血中胎兒的單倍型。臨床上篩選致病基因位點時，RHDO 的靶向應(yīng)用可能會減少數(shù)據(jù)分析的成本及復(fù)雜性。因此，證明靶向RHDO 分析在NIPD 中的可行性是十分必要的。

作者運用大規(guī)模平行測序技術(shù)，對2個經(jīng)產(chǎn)前診斷為β-地中海貧血家系的β-珠蛋白基因進行測序，之后通過液相雜交實現(xiàn)靶向富集。同時，運用數(shù)字PCR 從理論上推斷親代的單倍型。最后，運用RHDO 分析技術(shù)，對富集的序列以及推斷的親代單倍型分析，以此判斷胎兒是否患有β-地中海貧血。結(jié)果顯示，一對具有相似單倍型結(jié)構(gòu)的親代家系，其所有的胎兒都是β-地中海貧血基因的攜帶者。因此，對靶向富集的基因數(shù)據(jù)的RHOD 分析是成功的。

綜上所述，母親血漿DNA 靶向測序應(yīng)用于單基因遺傳疾病的無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷是成立的。