韓如冰 鐘巍 趙靜 張力 夏瑩 王寒 李龍蕓 王孟昭
越來越多的證據(jù)表明非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor, EGFR)基因突變狀態(tài)影響NSCLC的治療策略。近90%的EGFR基因突變集中于外顯子19的缺失突變和外顯子21點(diǎn)突變[1,2]。對(duì)于EGFR基因突變陽性的NSCLC患者,EGFR酪氨酸激酶抑制劑(epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitor, EGFR-TKI),包括吉非替尼和厄洛替尼,有明顯療效。然而我們應(yīng)注意到,對(duì)于最初EGFR基因突變陽性的人群,EGFR-TKIs作為二/三線治療和一線治療的客觀有效率是有差異的,分別為30%-40%[3-5]和70%[6-8]。因此我們推測(cè)化療會(huì)對(duì)EGFR基因突變狀態(tài)產(chǎn)生影響,從而影響EGFR-TKIs作為NSCLC二/三線治療的有效率。
然而化療前后分別取肺癌組織標(biāo)本進(jìn)行EGFR基因突變檢測(cè)臨床實(shí)踐困難。研究[9]表明,實(shí)體腫瘤形成和發(fā)展過程中常有少量的腫瘤細(xì)胞從原發(fā)腫瘤脫落進(jìn)入血循環(huán),此類癌細(xì)胞在血循環(huán)中凋亡并將遺傳物質(zhì)釋放到血液中,這提示血液游離DNA可成為檢測(cè)腫瘤基因突變的一種方法,而且標(biāo)本獲得更加方便。幾項(xiàng)較大樣本的研究[10,11]均發(fā)現(xiàn)晚期肺癌患者血清和腫瘤組織EGFR基因突變狀態(tài)檢測(cè)的一致性為79.7%-94%,這些研究提示血清DNA可替代腫瘤組織DNA進(jìn)行腫瘤EGFR基因突變檢測(cè)。本研究收集晚期肺腺癌患者化療前后的配對(duì)血清標(biāo)本,使用酶切突變富集巢式PCR法直接測(cè)序進(jìn)行EGFR基因突變檢測(cè),觀察化療對(duì)EGFR基因突變狀態(tài)是否存在影響。
1.1 研究對(duì)象 收集2009年11月-2010年5月就診于北京協(xié)和醫(yī)院呼吸內(nèi)科肺癌中心的患者血清標(biāo)本?;颊呷脒x標(biāo)準(zhǔn)包括:組織學(xué)和/或細(xì)胞學(xué)證實(shí)的肺腺癌患者,分期為IIIb期或IV期,有全身化療前和化療2個(gè)-6個(gè)周期后的配對(duì)標(biāo)本。每次收集全血標(biāo)本2 mL,分離血清,-20oC保存。共收集化療前后配對(duì)標(biāo)本33例。所有患者均簽署知情同意書。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法 采用磁珠法提取200 μL血清中游離DNA(磁珠法游離DNA提取試劑盒,北京金麥格生物技術(shù)有限公司),獲得游離DNA 30 μL,測(cè)得平均DNA濃度為7.3 ng/μL(2.7 ng/μL-17.4 ng/μL),置于1.5 mL離心管中凍存?zhèn)溆谩?/p>
EGFR基因外顯子19和21的擴(kuò)增采用酶切突變富集巢式PCR法。引物的序列見表1(上海Invitrogen公司合成)。第一輪PCR反應(yīng)體系為10 μL,包括GoTaq mix 5 μL、上下游引物(10 pm/μL)各0.5 μL、基因組DNA 3 μL,無核酸水補(bǔ)齊至10 μL。反應(yīng)條件為95oC、5 min;95oC、30 s,56oC、30 s,72oC、50 s,5個(gè)循環(huán);95oC、3 s,61oC、30 s,72oC、50 s,15個(gè)循環(huán);72oC、10 min。
酶切反應(yīng)體系及條件:體系20 μL,包括PCR1產(chǎn)物1 μL、限制性內(nèi)切酶Mse I 0.5 μL(外顯子19)或限制性內(nèi)切酶Msc I 0.5 μL(外顯子21)、10×buffer 1 μL,無核酸水補(bǔ)齊至20 μL;反應(yīng)條件為37oC、5 h。
第二輪PCR反應(yīng)體系為25 μL,包括GoTaq mix 12.5 μL、上下游引物(10 pm/μL)各1.5 μL、模板DNA(即PCR1產(chǎn)物酶切后的DNA)1 μL,無核酸水補(bǔ)齊至25 μL。外顯子19反應(yīng)條件為95oC、5 min;95oC、30 s,55oC、30 s,72oC、30 s,40個(gè)循環(huán);72oC、10 min。外顯子21反應(yīng)條件為95oC、5 min;95oC、30 s,58oC、30 s,72oC、30 s,40個(gè)循環(huán);72oC、10 min。
1.3 EGFR基因外顯子19和21突變狀態(tài)判斷 最終PCR產(chǎn)物由上海Invitrogen公司完成測(cè)序,使用DNAMAN軟件閱讀序列。EGFR基因外顯子19突變?yōu)槿笔蛔?,巢式PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列測(cè)序結(jié)果與野生序列進(jìn)行比對(duì),若與野生型序列吻合,判讀為野生型;若為單一序列且其序列表現(xiàn)為一段堿基缺失時(shí),判讀為突變型;若為野生型序列和突變型序列的疊加,也判讀為突變型(圖1)。EGFR基因外顯子21突變?yōu)長(zhǎng)858R點(diǎn)突變,巢式PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列測(cè)序結(jié)果與野生序列進(jìn)行比對(duì),若與野生型序列吻合,判讀為野生型;若為單一序列且其序列表現(xiàn)為突變型堿基G時(shí),判讀為突變型;若為野生型序列和突變型序列的疊加,即野生型堿基T和突變型堿基G混合,也判讀為突變型(圖2)。EGFR基因敏感突變包括外顯子19的缺失突變和/或外顯子的21點(diǎn)突變。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 使用SPSS 16.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,使用χ2檢驗(yàn)分析不同亞組患者EGFR基因突變率的差異,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 患者的一般情況 入組33例患者中男性20例,女性13例;年齡36歲-75歲,中位年齡57歲;吸煙者11例,不吸煙者22例。其中29例接受一線化療,方案包括吉西他濱聯(lián)合鉑類13例,紫杉醇聯(lián)合鉑類10例,培美曲塞聯(lián)合順鉑5例,VP-16聯(lián)合順鉑1例;4例接受二線單藥多西紫杉醇化療?;煰熜В翰糠志徑猓╬artial response,PR)5例,疾病穩(wěn)定(stable disease, SD)22例,疾病進(jìn)展(progresive disease, PD)6例。
2.2 化療前血清EGFR基因突變狀態(tài) 化療前血清DNA樣本檢測(cè)結(jié)果顯示患者EGFR基因突變發(fā)生率為39.4%(13/33)。外顯子19突變8個(gè),突變率為24.2%(8/33),外顯子21突變11個(gè),突變率為33.3%(11/33),可見以外顯子21突變?yōu)橹鳎?7.9%, 11/19),其中6例患者同時(shí)伴有外顯子19和21突變。女性患者EGFR基因突變率為46.2%(6/13),男性患者突變率為35.0%(7/20),女性高于男性,但無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.52)。吸煙患者突變率為45.5%(5/11),不吸煙患者突變率為36.4%(8/22),吸煙患者略高于不吸煙患者,但無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.61)。
表1 EGFR基因外顯子19和21巢式PCR擴(kuò)增引物序列Tab 1 Primer sequences used for nested PCR of exon 19 and 21 of EGFR gene
圖1 EGFR外顯子19 PCR2產(chǎn)物直接測(cè)序圖。A:野生型序列;B:混合型序列;C:突變型序列。Fig 1 Direct sequencing of PCR2 products for exon 19 of EGFR gene. A: wild type; B: mixture of both wild and mutant type; C: mutant type.
圖2 EGFR外顯子21 PCR產(chǎn)物直接測(cè)序圖。A:野生型序列;B:混合型序列;C:突變型序列。Fig 2 Direct sequencing of PCR products for exon 21 of EGFR gene. A: wild type; B: mixture of both wild and mutant type; C: mutant type.
2.3 化療后血清EGFR基因突變狀態(tài) 化療后血清DNA樣本檢測(cè)結(jié)果顯示患者EGFR基因突變發(fā)生率為54.5%(18/33)。外顯子19突變10個(gè),突變率為30.3%(10/33),外顯子21突變14個(gè),突變率42.4%(14/33),可見以外顯子21突變?yōu)橹鳎?8.3%, 14/24),其中6例患者同時(shí)伴有外顯子19和21突變。女性患者EGFR基因突變率為38.5%(5/13),男性患者突變率為65.0%(13/20),女性低于男性,但無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.14)。吸煙患者突變率為72.8%(8/11),不吸煙患者突變率為45.5%(10/22),吸煙患者高于不吸煙患者,但無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.14)。
2.4 化療前后的比較 化療前患者檢出EGFR基因敏感突變陽性率為39.4%(13/33),化療后患者檢出EGFR基因敏感突變陽性率為54.5%(18/33),無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.51)?;颊呋熐昂驟GFR基因敏感突變狀態(tài)一致率為54.5%(18/33),患者化療前后EGFR基因敏感突變具體變化見表2。
對(duì)于EGFR外顯子19缺失突變,化療前陽性率為24.2%(8/33),化療后陽性率為30.3%(10/33),無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.16),其中化療前后均陽性4例,化療前后均陰性19例患者,化療前陰性化療后陽性6例,化療前陽性化療后陰性4例。對(duì)于EGFR外顯子21點(diǎn)突變,化療前陽性率為33.3%(11/33),化療后陽性率為42.4%(14/33),無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.08),其中化療前后均陽性7例,化療前后均陰性15例,化療前陰性化療后陽性7例,化療前陽性化療后陰性4例。
2.5 化療前后EGFR基因突變狀態(tài)變化與療效的關(guān)系 化療前后EGFR基因突變狀態(tài)變化與療效的關(guān)系見表3,可見基因突變狀態(tài)的變化與化療療效無明顯相關(guān)性(χ2=3.26,P=0.775)。
本研究前瞻性分析了化療是否會(huì)對(duì)NSCLC患者EGFR基因突變狀態(tài)產(chǎn)生影響,結(jié)果顯示化療后EGFR基因敏感突變陽性率似乎高于化療前(54.5%vs39.4%),化療前后EGFR基因突變狀態(tài)一致率僅為54.5%(18/33);不一致的15例中,10例由化療前EGFR基因突變陰性變?yōu)殛栃裕?例由化療前陽性變?yōu)殛幮浴?/p>
分析化療前后EGFR基因突變狀態(tài)發(fā)生變化的原因有很多推測(cè)或假設(shè)。首先,化療對(duì)于EGFR基因突變陽性的腫瘤細(xì)胞表現(xiàn)出更強(qiáng)的活性,可以使外周血中EGFR突變基因比例增高。IPASS研究[7]中EGFR基因突變陽性人群化療的客觀有效率為47.3%;日本NEJ002研究[8]中EGFR基因突變陽性人群一線化療的客觀有效率為29%;WJTOG3405研究[12]中EGFR基因突變陽性人群一線化療的客觀有效率為32.2%,均高于文獻(xiàn)報(bào)道的非選擇性人群含鉑雙藥方案的大約20%的客觀有效率,這提示EGFR基因突變陽性腫瘤對(duì)化療藥物更加敏感,化療可能使EGFR基因突變陽性的腫瘤細(xì)胞更易被殺傷,因而釋放更多DNA入血,因此化療后突變陽性比例升高。
其次,腫瘤在進(jìn)展過程中EGFR基因突變狀態(tài)可能發(fā)生變化。Gow等[13]對(duì)67例NSCLC患者腫瘤組織及其相應(yīng)的轉(zhuǎn)移灶進(jìn)行EGFR基因突變檢測(cè),結(jié)果顯示18例原發(fā)灶樣品EGFR基因突變陽性,而其中9例(50%)轉(zhuǎn)移灶表現(xiàn)為EGFR基因突變陰性,而轉(zhuǎn)移灶表現(xiàn)為EGFR基因突變陽性的26例樣品中,相應(yīng)的原發(fā)灶有17例(65%)表現(xiàn)為突變陰性,原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶EGFR基因突變狀態(tài)的不一致多是由于轉(zhuǎn)移灶表現(xiàn)為EGFR基因突變陽性而原發(fā)灶表現(xiàn)為陰性造成的。因此,在腫瘤發(fā)展過程中可能存在EGFR基因突變狀態(tài)的改變,而且可能以轉(zhuǎn)移灶EGFR基因突變陽性率增高為主。
化療也可能促使EGFR基因耐藥突變的產(chǎn)生。Chin等[14]將含有EGFR外顯子19缺失突變的NSCLC細(xì)胞系-PC9細(xì)胞系經(jīng)過鉑類化療藥物處理耐藥后,再使用厄洛替尼,發(fā)現(xiàn)厄洛替尼的敏感性降低,說明化療可能在酪氨酸激酶激活通路中發(fā)揮作用。因此二/三線EGFR-TKIs治療有效率的降低可能部分歸因于化療導(dǎo)致的EGFR-TKIs耐藥,具體機(jī)制有待進(jìn)一步臨床研究證實(shí)。
本研究結(jié)果提示化療前后肺腺癌患者的EGFR基因突變狀態(tài)可能會(huì)發(fā)生變化,本研究雖然采用了前瞻性設(shè)計(jì)來收集標(biāo)本,但是仍然存在一定缺陷。樣本量小會(huì)產(chǎn)生一定的偏差,需要設(shè)計(jì)大樣本多中心的臨床試驗(yàn);采用外周血DNA檢測(cè),雖然樣本能相對(duì)容易獲得,但不如組織標(biāo)本更有說服力,需要化療前后的患者組織標(biāo)本來證實(shí)我們發(fā)現(xiàn)的現(xiàn)象;本實(shí)驗(yàn)中外周血標(biāo)本是在化療前和化療后采集的,實(shí)際上應(yīng)該采集化療前和化療后患者疾病進(jìn)展時(shí)的標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),更能對(duì)治療提供線索。因此希望能開展多中心大樣本的臨床試驗(yàn)并收集化療前和化療后疾病進(jìn)展時(shí)的組織標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)以證實(shí)化療對(duì)EGFR基因突變狀態(tài)的影響。
表2 33例患者化療前后EGFR基因突變狀態(tài)具體變化Tab 2 The EGFR gene mutation status of pre- and post-chemotherapy serum samples in 33 patients enrolled
表3 33例患者化療前后EGFR基因突變狀態(tài)變化與療效的關(guān)系Tab 3 The profile of EGFR gene mutation status of pre- and post-chemotherapy serum samples and its relation with efficacy of chemotherapy in 33 patients enrolled