劉 丹 黃 燚 陳勃江 蒲 蓉 曾 靜 王 蕾 李為民
肺癌是一種嚴(yán)重威脅人類健康的惡性腫瘤,其中,約80% ~85%是非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)。盡管肺癌治療已取得顯著的進(jìn)步,但患者5年生存率仍無(wú)明顯改善[1]。因此探索肺癌發(fā)病機(jī)制,尋求新的治療靶點(diǎn)已成為當(dāng)前的一項(xiàng)重要任務(wù)。
Akt信號(hào)通路作為潛在的腫瘤治療靶點(diǎn),是目前腫瘤治療領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。Akt是一種絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,作為信號(hào)通路的重要樞紐,它通過(guò)調(diào)節(jié)下游靶分子活性,參與多種細(xì)胞生物學(xué)功能,促進(jìn)腫瘤的發(fā)生發(fā)展及血管的發(fā)生[2-3]。Akt共有三種亞型,包括Akt1、Akt2、Akt3。其中,Akt2是Akt的重要亞型,在許多腫瘤中都發(fā)現(xiàn)Akt2的基因擴(kuò)增、蛋白有過(guò)度表達(dá),然而Akt2在NSCLC中的作用尚存在爭(zhēng)議,其介導(dǎo)的特異性信號(hào)通路也未闡述清楚,相關(guān)研究報(bào)道較少[4-5]。本研究旨在采用慢病毒shRNA表達(dá)載體介導(dǎo)的RNA干擾技術(shù),在NSCLC細(xì)胞株中靶向抑制Akt2基因表達(dá),獲得穩(wěn)定干擾Akt2表達(dá)的NSCLC細(xì)胞株,為進(jìn)一步探討Akt2在肺癌中的作用機(jī)制奠定研究基礎(chǔ)。
1.細(xì)胞株、菌株及病毒載體:人肺腺癌細(xì)胞株(A549),293T細(xì)胞及大腸桿菌菌株DH5α均為本實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng),慢病毒載體系統(tǒng)購(gòu)自上海吉?jiǎng)P基因公司。
2.主要試劑:DMEM、胎牛血清、胰蛋白酶及雙抗購(gòu)自美國(guó)Hyclone公司,質(zhì)粒抽提試劑盒購(gòu)自美國(guó)Qiagen公司,Age I及EcoRI內(nèi)切酶購(gòu)自美國(guó)New England Biolabs公司,蛋白提取試劑盒購(gòu)自南京凱基生物公司,Akt2抗體購(gòu)自美國(guó)Cell Signaling Technology公司,BCA蛋白定量試劑盒購(gòu)自美國(guó)Pierce公司。
1.細(xì)胞培養(yǎng):A549及293T細(xì)胞以10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,100 U/ml青霉素和100 μg/ml鏈霉素,在37℃、5%CO2、飽和濕度細(xì)胞培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng)。貼壁生長(zhǎng)的細(xì)胞2~3 d更換培養(yǎng)液一次,觀察細(xì)胞貼壁鋪滿培養(yǎng)皿70%~80%時(shí)可進(jìn)行傳代。
2.制備特異性沉默Akt2的重組質(zhì)粒(pGCsil-shAkt2-GFP載體的構(gòu)建):根據(jù)RNA干擾設(shè)計(jì)序列原則及既往文獻(xiàn)報(bào)道,采用Invitrogen公司BLOCK-iT在線設(shè)計(jì)并進(jìn)行評(píng)估測(cè)定(表1),選擇最佳動(dòng)力學(xué)參數(shù)靶點(diǎn)于上海吉?jiǎng)P基因公司合成含干擾序列的dsDNA oligo(表2)。把合成的引物干粉溶解于退火緩沖液中,經(jīng)Age I和EcoRI酶切pGCsil-GFP載體,以使其線性化。載體和dsDNA Oligo連接,于16℃連接過(guò)夜,干擾序列插入pGCsil-GFP質(zhì)粒,經(jīng)感受態(tài)細(xì)胞5DHα轉(zhuǎn)化、陽(yáng)性克隆測(cè)序鑒定所插入的片段。PCR反應(yīng)體系:Primer(+):5’-CCTATTTCCCATGATTCCTTCATA-3’;Primer(-):5’-GTAATACGGTTATCCACGCG-3’,pGCsil空載:306bp,陽(yáng)性克隆:343bp。抽提重組質(zhì)粒及輔助包裝元件載體質(zhì)粒pHelper 1.0和p-Helper 2.0,通過(guò)陽(yáng)離子脂質(zhì)體lipofectemin2000介導(dǎo)細(xì)胞轉(zhuǎn)染及慢病毒包裝,收集濃縮病毒,分裝、-80℃保存。
表1 Akt2 siRNA干擾序列設(shè)計(jì)信息Table 1 Information of Akt2 siRNA interference sequence
表2 干擾序列dsDNA oligo設(shè)計(jì)信息Table 2 Information of dsDNA oligo interference sequence
3.病毒滴度測(cè)定(孔稀釋法測(cè)定滴度):準(zhǔn)備96孔板,以4×104細(xì)胞/孔密度鋪板,體積為100 μl。37℃、5%CO2孵箱培養(yǎng)24 h,使細(xì)胞貼壁。準(zhǔn)備7~10個(gè)無(wú)菌的EP管,倍比稀釋病毒原液,并以第一個(gè)EP管中的10 μl病毒原液記為1E+1 μl,第二個(gè)EP管中為第一個(gè)EP管的1/10,記為 1E+0 μl,第三個(gè):1E-1μl…… 第七個(gè):1E-5 μl,第八個(gè):1E-6 μl。吸取96 孔板中待檢測(cè)細(xì)胞孔內(nèi)的90 μl培養(yǎng)基,丟棄。依次加入90 μl稀釋好的病毒溶液。將96孔板置入細(xì)胞孵箱培養(yǎng)24 h后,加入完全培養(yǎng)基100 μl,注意不要吹起細(xì)胞。繼續(xù)放入細(xì)胞孵箱培養(yǎng)。4 d后,觀察熒光表達(dá)情況,熒光細(xì)胞數(shù)隨稀釋倍數(shù)的增加而減少。根據(jù)公式:病毒滴度=感染熒光的細(xì)胞數(shù)/病毒原液量,計(jì)算病毒滴度。
4.shAkt2重組慢病毒感染靶細(xì)胞A549:將A549細(xì)胞按5×104/孔接種于6孔板中,37℃、5%CO2培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)至細(xì)胞融合度約達(dá)30%。根據(jù)預(yù)實(shí)驗(yàn)感染條件摸索,A549細(xì)胞的MOI值為50,感染條件為完全培養(yǎng)基+5 μg/ml polybrene。根據(jù)MOI值加入適量病毒及polybrene,在水平方向輕輕拍打培養(yǎng)板,使培養(yǎng)基和病毒等試劑充分混勻,然后放入孵箱培養(yǎng)孵育。培養(yǎng)24 h后更換為含10%胎牛血清的完全培養(yǎng)基。感染3 d后觀察慢病毒報(bào)告基因GFP的表達(dá)情況。
5.篩選穩(wěn)定表達(dá)shAkt2的細(xì)胞克隆:流式細(xì)胞分選具有分選精度高(99%以上)速度快的特點(diǎn)。成功感染shAkt2細(xì)胞同時(shí)表達(dá)報(bào)告基因GFP蛋白,以GFP為標(biāo)記獲得高純度穩(wěn)定轉(zhuǎn)染shAkt2的細(xì)胞克隆。根據(jù)BD FACSCalibur流式儀操作要求進(jìn)行分選,將表達(dá)GFP強(qiáng)陽(yáng)性細(xì)胞群分選至無(wú)菌離心管中。離心管內(nèi)的細(xì)胞懸液平分至培養(yǎng)皿中,37℃,5%CO2孵箱培養(yǎng)細(xì)胞。24 h后觀察細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài)及GFP表達(dá)情況。
6.熒光定量PCR檢測(cè)細(xì)胞Akt2的表達(dá):細(xì)胞共分3組:正常對(duì)照(A549)組,陰性對(duì)照病毒(NC)組,Akt2干擾(shAkt2)組。抽提三組細(xì)胞的總RNA,根據(jù)Promega公司M-MLV操作說(shuō)明書進(jìn)行,總RNA經(jīng)70℃變性,0℃冰浴退火。經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)1 h,獲得逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)產(chǎn)物-cDNA,取部分用于PCR,余保存在-80℃下。PCR引物信息如下:
Akt2:
上游引物:5’-GCGGAAGGAAGTCATCATTG-3’
下游引物:5’-GTGGGTCTGGAAGGCATAC-3’
設(shè)定程序?yàn)閮刹椒≧eal-Time PCR:經(jīng)變性、退火、延伸過(guò)程,并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行Real time分析,分析采用 2-ΔΔCt分析法進(jìn)行。
7.Western blot檢測(cè)Akt2的蛋白表達(dá):根據(jù)凱基生物蛋白抽提試劑盒操作說(shuō)明抽提細(xì)胞蛋白。并采用二喹啉甲酸(bicinchoninic acid,BCA)法測(cè)定總蛋白含量,經(jīng)SDS-PAGE凝膠電泳,80~100 V電泳1~2 h后,采用濕轉(zhuǎn)方法轉(zhuǎn)膜,用封閉液(含5%脫脂牛奶的TBST溶液),室溫、搖床上封閉PVDF膜2 h。4℃孵育過(guò)夜。第2天,TBST洗膜5 min×3次。室溫孵育二抗(1︰1000)及內(nèi)參GAPDH(1︰5000)1 h。Millipore公司 Luminata Crescendo Western HRP substrate顯色液孵育3 min,Molecular Image ChemiDoc XRS System(Bio-Rad)曝光5 s~10 min。Quantity one分析軟件測(cè)定條帶灰度。
8.統(tǒng)計(jì)學(xué)分析:用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,數(shù)據(jù)表示為,采用方差分析(analysis of variance,ANOVA),最小顯著差(least-significant difference,LSD)法兩兩比較。P<0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
1.陽(yáng)性克隆的PCR鑒定:pGCsil-shAkt2-GFP連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌,經(jīng)37℃過(guò)夜培養(yǎng),挑選出的陽(yáng)性克隆溶于LB培養(yǎng)基,作為菌落PCR模板。PCR凝膠電泳圖如圖1,以dd H2O(1泳道)為陰性對(duì)照,排除系統(tǒng)中外源核酸污染導(dǎo)致的假陽(yáng)性結(jié)果,Maker指示PCR產(chǎn)物的片段大小(3泳道),結(jié)果顯示,陽(yáng)性克隆組(4-7組)PCR產(chǎn)物條帶大小約為343bp(從載體中切出24bp),大于空載體自連對(duì)照組(2泳道)(片段大小約306bp),說(shuō)明陽(yáng)性克隆已插入外源片段,需進(jìn)一步測(cè)序驗(yàn)證。
圖1 pGCsil-shAkt2-GFP質(zhì)粒菌落PCR電泳圖Figure 1 PCR electrophoretogram of pGCsil-shAkt2-GFP plasmid
2.重組質(zhì)粒的測(cè)序:挑選重組質(zhì)粒陽(yáng)性克隆送至Invitrogen公司測(cè)序。測(cè)序報(bào)告見(jiàn)圖2,結(jié)果顯示:陽(yáng)性克隆序列內(nèi)含有干擾Akt2的shRNA片段序列,片段序列為:
CcggGCACAGGTTCTTCCTCAGCTTCAAGAGAGCTGAGGAAGAACCTGTGCTTTTTg,片段大小為57 bp,與之前所設(shè)計(jì)的針對(duì)Akt2的shRNA片段序列完全符合。證明shAkt2序列已成功克隆到慢病毒pGCsil-GFP載體中。
圖2 重組pGCsil-shAkt2-GFP質(zhì)粒測(cè)序鑒定Figure 2 Sequence of recombinant pGCsill-shAkt2-GFP plasmid
逐孔稀釋法測(cè)定病毒滴度,病毒原液經(jīng)倍比稀釋感染293T細(xì)胞,培養(yǎng)4 d后,觀察細(xì)胞熒光表達(dá)情況。以病毒原液記為1E+1μl,遞次稀釋十倍,依次類推稀釋病毒記為1E+0μl,1E-1μl,1E-2μl……1E-6μl。根據(jù)細(xì)胞熒光表達(dá)情況如圖3所示,在加入1E-6μl病毒原液的孔中觀察到3個(gè)帶有熒光的細(xì)胞,則本實(shí)驗(yàn)獲得重組Akt2-shRNA慢病毒滴度為:3/(1E-6)=3E+6 TU/μl,即3E+9 TU/ml,滿足實(shí)驗(yàn)需要。
1.重組慢病毒shAkt2感染A549細(xì)胞:將重組慢病毒shAkt2和NC對(duì)照病毒同時(shí)感染人肺腺癌細(xì)胞株A549,24 h后更換為完全培養(yǎng)基,觀察細(xì)胞熒光表達(dá)情況。5 d后,A549細(xì)胞感染效率達(dá)80%以上,感染后細(xì)胞狀態(tài)良好(圖4)。
圖3 重組shAkt2慢病毒滴度測(cè)定Figure 3 Lentivirus titer of recombinant shAkt2
圖4 各組細(xì)胞病毒感染率及GFP熒光表達(dá)水平Figure 4 Virus infection,and GFP expression in cells
2.流式分選篩選穩(wěn)定干擾Akt2的細(xì)胞克隆:成功感染shAkt2細(xì)胞同時(shí)表達(dá)基因GFP蛋白,以GFP為標(biāo)記,經(jīng)流式細(xì)胞儀分選GFP強(qiáng)陽(yáng)性細(xì)胞,占細(xì)胞總數(shù)的90.1%(圖5),獲得穩(wěn)定沉默Akt2基因的細(xì)胞克隆。
圖5 流式細(xì)胞分選表達(dá)GFP強(qiáng)陽(yáng)性的shAkt2細(xì)胞Figure 5 GFP Strong positive shAkz cells obtained by flow cytometer
1.熒光定量PCR檢測(cè)Akt2 mRNA的表達(dá)水平:抽提A549、NC及純化后shAkt2細(xì)胞組細(xì)胞的總RNA,采用β-actin作為內(nèi)參,2-ΔΔCt分析法分析Akt2 mRNA含量,方差統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果示,陰性對(duì)照組與未感染病毒A549細(xì)胞mRNA水平無(wú)明顯變化,而shAkt2細(xì)胞組與A549及NC組比較,Akt2 mRNA明顯抑制(P=0.001和 P=0.002,圖6),與正常組相比,抑制率約為 63.39%,提示shAkt2細(xì)胞克隆顯著干擾Akt2 mRNA的表達(dá)。
圖6 各組細(xì)胞中Akt2 mRNA的表達(dá)水平Figure 6 Akt2 mRNA expression in A549,NC and shAkt2
2.Western blot檢測(cè)Akt2的蛋白表達(dá)水平:未感染病毒A549細(xì)胞、NC陰性對(duì)照組和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染shAkt2細(xì)胞組抽提總蛋白,以β-actin為內(nèi)參,進(jìn)行western blot檢測(cè),統(tǒng)計(jì)各組條帶灰度值,比較Akt2蛋白在各組細(xì)胞中的表達(dá)水平。如圖7所示,shAkt2細(xì)胞組中Akt2的蛋白表達(dá)較其他兩組明顯抑制(P<0.01),與正常對(duì)照組A549相比,蛋白表達(dá)量抑制率為91.56%,說(shuō)明shAkt2組細(xì)胞Akt2蛋白表達(dá)獲得穩(wěn)定抑制。
圖7 A549、NC及shAkt2組細(xì)胞Akt2蛋白表達(dá)水平的比較Figure 7 Comparison of Akt2 protein expression in A549,NC and shAkt2
Akt2基因是Akt家族的重要亞型,負(fù)責(zé)編碼絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,定位于人類染色體的19q13.1-q13.2。已證實(shí)Akt2作為癌基因參與了多種腫瘤的發(fā)生和發(fā)展,并介導(dǎo)腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)、黏附、運(yùn)動(dòng)、侵襲和轉(zhuǎn)移。本研究擬通過(guò)制備有效的靶向干擾Akt2基因的重組慢病毒載體,感染肺腺癌細(xì)胞株A549,并檢測(cè)其對(duì)A549細(xì)胞的Akt2基因的沉默效率,建立穩(wěn)定干擾Akt2基因的細(xì)胞克隆,為后續(xù)研究Akt2在NSCLC中的作用奠定基礎(chǔ)。
RNA干擾(RNA interference,RNAi)技術(shù)是由雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)誘導(dǎo)同源靶基因mRNA特異性降解,從而特異性抑制目的蛋白的表達(dá),導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄后基因沉默的現(xiàn)象[6]。由于其具有高度靶向性和高效性等特點(diǎn),成為腫瘤研究領(lǐng)域的重要方法,廣泛應(yīng)用于基因功能、干細(xì)胞發(fā)育、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及抗腫瘤治療等多學(xué)科領(lǐng)域。
在細(xì)胞內(nèi),dsRNA分子被胞內(nèi)RNA酶Dicer降解為大小約21~23個(gè)堿基的小片段RNA,即siRNA,隨之,siRNA在RNA解旋酶的作用下解鏈成正義鏈和反義鏈,其中,反義siRNA與體內(nèi)的內(nèi)切酶、外切酶、解旋酶等結(jié)合形成 RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RNA-induced silencing complex,RISC)[7-8]。RISC具有核酸酶功能,能夠與外源性基因表達(dá)的mRNA在同源區(qū)內(nèi)進(jìn)行特異性的結(jié)合,并在此結(jié)合部位切割降解mRNA,誘發(fā)宿主細(xì)胞產(chǎn)生針對(duì)這些mRNA的降解反應(yīng)。同時(shí),在RNA聚合酶作用下,以siRNA為引物與靶RNA結(jié)合從而合成大量的dsRNA,使RNAi作用進(jìn)一步放大,最終促使靶mRNA完全降解[6,9-10]。RNAi具有高效、特異的靶向沉默基因的作用,目前已經(jīng)成為基因治療和基因功能研究的重要工具。
目前RNAi的制備方法主要包括化學(xué)合成、體外轉(zhuǎn)錄、體內(nèi)表達(dá)。盡管化學(xué)合成的siRNA能特異性抑制細(xì)胞內(nèi)同源基因的表達(dá),但在細(xì)胞內(nèi)容易降解,穩(wěn)定性差,而將小發(fā)卡RNA(small hairpin RNA)導(dǎo)入細(xì)胞后,能在細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)定轉(zhuǎn)錄生成shRNA,并進(jìn)一步加工成靶基因特異性siRNA,從而發(fā)揮穩(wěn)定、長(zhǎng)期抑制靶基因的表達(dá)作用[11-12]。然而,一般的shRNA盡管能夠轉(zhuǎn)染到分裂細(xì)胞中,但是很難導(dǎo)入到非分裂細(xì)胞、原代細(xì)胞及人或動(dòng)物體內(nèi)去。因此,利用病毒載體包括慢病毒及腺病毒等,因其操作方便、轉(zhuǎn)染效率高及穩(wěn)定性表達(dá)等而被廣泛應(yīng)用。使用腺病毒載體感染細(xì)胞時(shí),病毒DNA游離在細(xì)胞核內(nèi),不能整合到染色體上,在體內(nèi)不能實(shí)現(xiàn)穩(wěn)定長(zhǎng)期表達(dá),并且容易引起免疫反應(yīng)[13-15]。慢病毒載體是以人類免疫缺陷型病毒(human immunodeficiency virus,HIV)為基礎(chǔ)發(fā)展起來(lái)的基因治療載體,既能夠感染分裂細(xì)胞,而且可以感染非分裂細(xì)胞,尤其是攜帶shRNA的慢病毒載體,不僅能夠廣泛的感染宿主細(xì)胞,而且也能夠穩(wěn)定整合于靶細(xì)胞的基因組內(nèi),具有表達(dá)時(shí)間長(zhǎng)、靶向性佳,不易誘發(fā)宿主免疫反應(yīng)、安全性好等優(yōu)點(diǎn)。因此,表達(dá)shRNA的慢病毒載體已廣泛應(yīng)用于多種細(xì)胞內(nèi)基因功能的研究[16]。
本研究所使用的慢病毒載體系統(tǒng)由pGCsil-LV載體、p-Helper 1.0載體和p-Helper 2.0載體組成。pGC-LV載體中含有HIV的基本元件5’LTR和3’LTR以及其他輔助元件,例如WRE(woodchuck hepatitis virus posttranscriptional regulatory element)。根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)康尼槍?duì)pGC-LV載體改造以進(jìn)行啟動(dòng)子活性研究、基因表達(dá)研究、RNAi等研究。pHelper 1.0載體中含有HIV病毒的gag基因,編碼病毒主要的結(jié)構(gòu)蛋白;pol基因,編碼病毒特異性的酶;rev基因,編碼調(diào)節(jié)gag和pol基因表達(dá)的調(diào)節(jié)因子。pHelper 2.0載體中含有單純皰疹病毒來(lái)源的VSV-G基因,提供病毒包裝所需要的包膜蛋白。
本研究根據(jù)RNAi干擾原理,針對(duì)Akt2設(shè)計(jì)干擾序列,并合成其寡核苷酸,連接至已線性化的慢病毒pGCsil-LV載體U6啟動(dòng)子下游,在大腸桿菌H5α內(nèi)同源重組,經(jīng)過(guò)限制性內(nèi)切酶酶切和測(cè)序,證實(shí)重組成功后,轉(zhuǎn)入哺乳動(dòng)物細(xì)胞,載體表達(dá)出shRNA,這種shRNA很快在細(xì)胞中加工成為21~23個(gè)堿基大小的dsRNA分子,隨后啟動(dòng)RNAi過(guò)程。同時(shí)質(zhì)粒攜帶GFP序列,用于判讀轉(zhuǎn)染效果并篩選出穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞。經(jīng)進(jìn)一步采用熒光定量PCR及western-blot檢測(cè)Akt2基因表達(dá)水平。結(jié)果顯示,實(shí)驗(yàn)組Akt2 mRNA水平較對(duì)照組下降大于63.39%,而蛋白水平減少91.56%,說(shuō)明本研究構(gòu)建的慢病毒shRNA表達(dá)載體在A549細(xì)胞內(nèi)能持續(xù)、特異、高效的抑制Akt2基因表達(dá),為后續(xù)研究奠定了技術(shù)基礎(chǔ),也為腫瘤基因靶向沉默治療帶來(lái)了新希望。
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