肺癌相關(guān)單核苷酸多態(tài)性的研究進(jìn)展

滑峰 綜述 周清華 審校

肺癌是目前全球范圍內(nèi)對(duì)人類健康威脅最大的惡性腫瘤之一，關(guān)于肺癌的病因?qū)W、預(yù)防、診斷、治療等研究已經(jīng)成為世界各國(guó)的重要課題[1-3]。已有研究表明遺傳因素在肺癌的發(fā)生、發(fā)展、治療反應(yīng)、預(yù)后等中具有重要作用，因此開(kāi)展肺癌的遺傳研究對(duì)于肺癌易感人群的篩查、治療選擇、預(yù)后判斷具有重要的意義，也成為肺癌基礎(chǔ)研究領(lǐng)域中的一個(gè)重要內(nèi)容。肺癌同多數(shù)腫瘤一樣，不表現(xiàn)為典型的孟德?tīng)柺竭z傳，而是表現(xiàn)為微效基因的累加效應(yīng)，即多基因遺傳模式。單核苷酸多態(tài)性（single neucleotide polymorphism, SNP）是第三代遺傳標(biāo)志，已經(jīng)被廣泛地應(yīng)用于肺癌的數(shù)量性狀位點(diǎn)（quantitative trait loci, QTL）定位，并發(fā)現(xiàn)了大量相關(guān)多態(tài)性位點(diǎn)?，F(xiàn)將近年關(guān)于SNP及其與肺癌遺傳關(guān)聯(lián)研究的進(jìn)展作一簡(jiǎn)要綜述。

1 SNP與肺癌關(guān)聯(lián)研究的概述

SNP是指在染色體序列上由于單個(gè)核苷酸位置上存在轉(zhuǎn)換、顛換、插入、缺失等變異而引起的DNA序列多態(tài)性，且至少在一個(gè)人群中這種變異的發(fā)生頻率在1%以上[4]。SNP在基因序列中的高密度、代表性、遺傳穩(wěn)定性以及檢測(cè)的易實(shí)現(xiàn)等特點(diǎn)體現(xiàn)了新一代遺傳標(biāo)記的優(yōu)越性，使其被迅速接受從而成為遺傳研究領(lǐng)域中極為活躍的內(nèi)容。應(yīng)用于肺癌的關(guān)聯(lián)研究是該領(lǐng)域最活躍的內(nèi)容之一。大量的SNP信息的發(fā)現(xiàn)催生了一些相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)，如dbSNP、HGVbase、HapMap、EGPsnp、JSNP、HOWDY、GeneSNPs等，其中國(guó)際人類基因組單體型圖計(jì)劃（international HapMap project, www.hapmap.org）所建立的HapMap數(shù)據(jù)庫(kù)能提供包括中國(guó)漢族人群在內(nèi)的世界三大族群經(jīng)過(guò)驗(yàn)證后的基因組多態(tài)性信息，與dbSNP成為最重要的參考數(shù)據(jù)庫(kù)，與快速進(jìn)展的檢測(cè)技術(shù)一同推動(dòng)著肺癌關(guān)聯(lián)研究的進(jìn)展[5]。

1.1 基于單個(gè)位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)研究 在已開(kāi)展的SNP與肺癌的關(guān)聯(lián)研究中，最初采用的策略是選擇位于待選基因啟動(dòng)子區(qū)域或者編碼子上可以導(dǎo)致編碼氨基酸改變的多態(tài)性位點(diǎn)，也就是功能性SNP。通過(guò)這一策略，大量研究發(fā)現(xiàn)了一些與常見(jiàn)疾病具有關(guān)聯(lián)的功能性SNP。但這一研究策略的一個(gè)重大缺陷是具有關(guān)聯(lián)的單個(gè)位點(diǎn)的相對(duì)危險(xiǎn)度一般只有1倍-2倍，在實(shí)際應(yīng)用中的意義是非常有限的。但是這一階段研究的一個(gè)更重要的意義是支持了肺癌為微效基因累加的結(jié)果這一假設(shè)，而且為后續(xù)的研究奠定了基礎(chǔ)。

1.2 基于單體型水平的研究 隨著對(duì)SNP研究的深入，發(fā)現(xiàn)了越來(lái)越多SNP位點(diǎn)間連鎖不平衡的信息，HapMap計(jì)劃的進(jìn)展更是極大地推動(dòng)著基因單體型信息的研究，從而為基于單體型水平的肺癌關(guān)聯(lián)研究提供了可能。由于單體型更能反映疾病遺傳的本質(zhì)，而且技術(shù)成本低，對(duì)基因的覆蓋率高，使其越來(lái)越為研究者所運(yùn)用，并具有取代單個(gè)位點(diǎn)研究的趨勢(shì)。近年開(kāi)展的一些肺癌遺傳相關(guān)研究，明顯地體現(xiàn)了這種研究策略的優(yōu)勢(shì)[6-9]。

1.3 基于基因組水平的研究 基于單個(gè)基因水平的研究在實(shí)際應(yīng)用中的意義是有限的，即使有研究者嘗試應(yīng)用大樣本量的人群進(jìn)行了多個(gè)基因的聯(lián)合分析，結(jié)論仍然難以滿足實(shí)際應(yīng)用的需要[10-12]。針對(duì)肺癌系微效基因累加的假設(shè)，從基因組水平上開(kāi)展基因與肺癌關(guān)聯(lián)研究是當(dāng)前迫切的需要，當(dāng)前已經(jīng)有研究者嘗試從基因組水平上進(jìn)行肺癌的關(guān)聯(lián)研究，比如采用高通量芯片技術(shù)掃描、測(cè)序技術(shù)、高效液相色譜等，但從嚴(yán)格意義上來(lái)說(shuō)還不屬于全基因組水平的研究[13-17]?？上驳氖钱?dāng)前新的大規(guī)模測(cè)序的方法先后出現(xiàn)，從而為實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)提供了現(xiàn)實(shí)的可能性[18]。

2 SNP與肺癌的遺傳易感性

肺癌的流行病學(xué)研究已經(jīng)表明肺癌是一種典型的環(huán)境相關(guān)疾病，吸煙、環(huán)境污染等是導(dǎo)致肺癌發(fā)生的主要原因，但是研究也發(fā)現(xiàn)在同樣的致癌因素作用下，只有少部分個(gè)體罹患肺癌，這現(xiàn)象表明了基于個(gè)體差異的遺傳易感性的存在對(duì)于肺癌的發(fā)生具有重要作用。肺癌的家族聚集現(xiàn)象也表明了遺傳因素對(duì)于肺癌發(fā)生的作用[19]。因此，開(kāi)展肺癌的易感性研究對(duì)于肺癌易感人群的篩查具有重要意義，也成為肺癌遺傳研究中得到最廣泛研究的內(nèi)容，涉及代謝酶基因、癌基因、抑癌基因、修復(fù)酶基因、凋亡基因等等。

2.1 代謝酶基因 肺癌的發(fā)生發(fā)展是一個(gè)多因素介入的多步驟過(guò)程，煙草及環(huán)境化學(xué)致癌物要在體內(nèi)經(jīng)過(guò)復(fù)雜的生物學(xué)代謝，因此肺癌易感性的不同在一定程度上可能取決于外來(lái)化學(xué)致癌物在體內(nèi)的代謝差異。特別是在癌變的始動(dòng)階段，生物轉(zhuǎn)化酶類的基因多態(tài)性對(duì)環(huán)境致癌物的致癌效應(yīng)可能起著關(guān)鍵作用。體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶P1（glutathione-S-transferase P1, GSTP1）、髓過(guò)氧化物酶（myeloperoxidase, MPO）、細(xì)胞色素P450（cytochrome P450, CYP450）酶系等基因的多態(tài)性影響了煙草致癌物的代謝，也明顯支持這一假設(shè)，因此目前生物轉(zhuǎn)化酶的基因多態(tài)性是腫瘤易感性研究的熱點(diǎn)之一[20-24]。目前開(kāi)展的腫瘤代謝酶基因的研究主要集中在CYP450、谷胱甘肽轉(zhuǎn)硫（glutathione-S-transferase, GST）酶系。

CYP450同功酶是一類含血紅素的單加氧酶，也是體內(nèi)最重要的I相代謝酶，廣泛存在于人體肺、肝、腎、腦等組織中。CYP450的作用的底物非常廣泛，除了參與對(duì)煙草等前致癌物的代謝，而且還通過(guò)參與絕大多數(shù)內(nèi)源性底物（如類固醇激素、維生素類、花生四烯酸、前列腺素、白介素等）的催化反應(yīng)進(jìn)而影響細(xì)胞的分化功能及細(xì)胞間信息傳遞。因此，CYP450酶系被認(rèn)為是在肺癌形成中具有重要作用的一類代謝酶，關(guān)于其常見(jiàn)多態(tài)性與肺癌易感性關(guān)系的研究得到了廣泛的研究，其中得到充分研究并認(rèn)為與肺癌易感性相關(guān)的CYP450酶系有CYP1A1、CYP2A6、CYP2D6、CYP2A13、CYP2E1等。其中CYP2A13被認(rèn)為是人呼吸系統(tǒng)中最常見(jiàn)的CYP450酶，而且多名研究者的研究結(jié)果高度一致，因此非常值得關(guān)注，其有可能在肺癌致癌物生成中具有重要意義。Wang[25]首次研究了CYP2A13常見(jiàn)多態(tài)性位點(diǎn)rs8192789（Arg257Cys）與中國(guó)漢族人群的肺癌易感性，研究發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與肺腺癌具有相關(guān)性，CT+TT基因型較CC基因型降低了腺癌的易感性。之后法國(guó)的研究者[26]研究了高加索人群另一個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)（Arg101Stop）與肺癌易感性的關(guān)系，研究發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與小細(xì)胞肺癌具有相關(guān)性。Agostino研究發(fā)現(xiàn)多態(tài)性位點(diǎn)CT或TT基因型（Arg257Cys）的CYP2A13明顯降低了對(duì)煙草前致癌物的代謝，與Wang的研究結(jié)果[27]是一致的。

GST是參與機(jī)體解毒的一組具有多種生理功能的蛋白質(zhì)，催化機(jī)體內(nèi)有害極性化合物與谷胱甘肽結(jié)合，也可由非酶結(jié)合方式將體內(nèi)各種潛在毒性化學(xué)藥物、致癌劑及親脂性化合物從體內(nèi)排出，達(dá)到解毒目的，同時(shí)還具有過(guò)氧化物酶和異物酶活性，結(jié)合膽紅素和某些激素功能，從而參與機(jī)體內(nèi)抗氧化和保護(hù)細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)合成、儲(chǔ)存和轉(zhuǎn)運(yùn)的過(guò)程?？梢?jiàn)GST同工酶的表達(dá)和活性，在機(jī)體對(duì)致癌物等有害物質(zhì)去毒、避免對(duì)遺傳物質(zhì)在進(jìn)一步損傷的過(guò)程中有重要作用。當(dāng)前得到廣泛研究的GST代謝酶是GSTT1、GSTM1、GSTP1[28-32]。

除了CYP450酶系、GST酶系以外，得到廣泛研究并認(rèn)為與肺癌易感性具有相關(guān)性還有N-乙酰轉(zhuǎn)移酶（N-acetyltransferase, NAT）[33,34]、微粒體換氧化物酶（microsomal epoxide hydrolase 1, EPHX1）[35]。除了從致癌物生成角度研究腫瘤的易感性外，Chen[36]最近還發(fā)現(xiàn)了位于芳香烴受體基因（aryl hydrocarbon receptor, AHR）上的一個(gè)單倍體能夠明顯增加中國(guó)漢族人群對(duì)肺癌的易感性。具有高水平證據(jù)的幾項(xiàng)多中心大樣本研究都證明了位于人類15號(hào)染色體上的編碼煙堿乙酰膽堿受體多個(gè)亞基的區(qū)域內(nèi)特定SNP基因型與吸煙量、尼古丁依賴或肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，其中有兩篇文章都發(fā)表在了Nature上[37,38]。

2.2 癌基因 癌基因是指其編碼的產(chǎn)物與細(xì)胞的腫瘤性轉(zhuǎn)化有關(guān)的基因，其蛋白產(chǎn)物在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、分化的調(diào)控方面起著重要作用，當(dāng)這些調(diào)節(jié)或轉(zhuǎn)導(dǎo)發(fā)生改變，即有可能影響人群對(duì)腫瘤易感性的不同。許多癌基因由于單堿基突變，導(dǎo)致癌基因產(chǎn)物中單個(gè)氨基酸的替換，而喪失其調(diào)節(jié)的活性。第一個(gè)被鑒定的人類癌基因是ras基因家族，其中H-ras、K-ras和N-ras是在人類腫瘤中最常見(jiàn)的癌基因，它們?cè)诖蠹s15%的人類惡性腫瘤中被檢出，包括50%的結(jié)腸癌和25%的肺癌。Kohno[39]研究了人K-ras基因常見(jiàn)多態(tài)性與肺癌易感性的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)有兩個(gè)常見(jiàn)多態(tài)性K-ras1、K-ras6與腺癌易感性具有一定相關(guān)性。Chin[40]研究發(fā)現(xiàn)位于K-ras基因3,末端的一個(gè)SNP位點(diǎn)能夠通過(guò)影響基因的表達(dá)進(jìn)而影響到攜帶不同基因型的個(gè)體對(duì)肺癌易感性的不同。

2.3 抑癌基因 抑癌基因（tumor suppressor gene）是一類抑制腫瘤形成的負(fù)調(diào)節(jié)基因，其表達(dá)蛋白產(chǎn)物包括一系列調(diào)節(jié)因子，如轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子、負(fù)調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子、周期蛋白依賴性激酶抑制因子、信號(hào)通路的抑制因子、與發(fā)育和干細(xì)胞增殖相關(guān)的信號(hào)途徑組分。因此，抑癌基因與調(diào)控生長(zhǎng)的原癌基因協(xié)調(diào)表達(dá)在腫瘤的發(fā)生發(fā)展等方面起著重要作用。

p53基因是迄今發(fā)現(xiàn)與人類腫瘤相關(guān)性最高的抑癌基因，已知在幾乎所有的腫瘤中p53都起著一定的作用，因此在腫瘤研究領(lǐng)域中得到了廣泛研究，并且有望成為重要的腫瘤治療基因。人類p53基因定位于17p13.1，其編碼蛋白產(chǎn)物主要集中于核仁區(qū)，能與DNA特異結(jié)合，其活性受磷酸化調(diào)控。正常p53的一個(gè)重要生物功能是監(jiān)視基因組的完整性。如有損傷，p53蛋白阻止DNA復(fù)制，以提供足夠的時(shí)間使損傷DNA修復(fù)。如果修復(fù)失敗，p53蛋白則引發(fā)細(xì)胞凋亡，現(xiàn)在已知p53在很多細(xì)胞凋亡信號(hào)通路中都扮演著十分重要的作用，包括膜凋亡信號(hào)、線粒體凋亡通路以及在細(xì)胞核內(nèi)與凋亡相關(guān)的因子的轉(zhuǎn)錄與表達(dá)。Zhang等[41]研究了p53常見(jiàn)多態(tài)性位點(diǎn)rs1042522、Arg72Pro與肺癌易感性的關(guān)系，結(jié)果發(fā)現(xiàn)在高加索人群中攜帶Pro72Pro基因型的個(gè)體的肺癌的易感性增加。Mechanic[42]從單體型水平上研究了高加索人群和非洲人群中p53基因多態(tài)性與肺癌易感性的關(guān)系，他在對(duì)p53基因整體分析的基礎(chǔ)上選擇了16個(gè)常見(jiàn)SNP，包括標(biāo)簽SNP（tagger SNP）和功能性SNP，結(jié)果發(fā)現(xiàn)rs1042522、rs9895829、rs2909430、rs1625895、rs12951053在非洲人群中與肺癌易感性以及預(yù)后有關(guān)聯(lián)，而由rs1042522、rs9895829、rs2909430、rs1625895組成的一個(gè)單體型OR值達(dá)到2倍以上。Li等[43]對(duì)公開(kāi)發(fā)表的關(guān)于p53 Arg72Pro與肺癌易感性的關(guān)系的文獻(xiàn)進(jìn)行了薈萃分析，共納入研究人群15,857例，結(jié)果發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與肺癌的易感性具有相關(guān)性，分層后發(fā)現(xiàn)這種相關(guān)性主要體現(xiàn)在亞洲及高加索人群、腺癌或者吸煙者中。

p21基因是另一個(gè)得到廣泛重視的抑癌基因，Choi[44]分析了p21基因上兩個(gè)常見(jiàn)SNP及其組成的單體型與肺癌易感性的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)其與韓國(guó)人群易感性具有重要關(guān)聯(lián)。其它得到研究并認(rèn)為與肺癌有關(guān)聯(lián)的抑癌基因還有p73[45]、Ras相關(guān)區(qū)域家族1基因（Ras-association domain family-1, RASSF1）[46]、過(guò)氧化物酶激活受體基因（peroxisome proliferator-activated receptor-γ, PPAR-γ）等[47]。

2.4 腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移相關(guān)基因 腫瘤的侵襲與轉(zhuǎn)移是其惡性標(biāo)志和特征，也是影響治療效果和導(dǎo)致患者死亡的主要原因。腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移是一個(gè)極其復(fù)雜的多基因調(diào)控和多步驟發(fā)展過(guò)程，涉及到一系列相關(guān)基因的結(jié)構(gòu)和功能的異常，腫瘤血管生成被認(rèn)為是腫瘤侵襲和轉(zhuǎn)移的一個(gè)重要機(jī)制。血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子（vascular endothelial growth factor, VEGF）及表皮生長(zhǎng)因子受體（epidermal growth factor receptor, EGFR）在促進(jìn)內(nèi)皮細(xì)胞的分裂與增殖、促進(jìn)血管生成中起著關(guān)鍵作用。Kim[48]研究了VEGF基因常見(jiàn)SNP在韓國(guó)肺癌人群中的分布，發(fā)現(xiàn)單個(gè)SNP與肺癌易感性沒(méi)有相關(guān)性，但有一個(gè)單體型與肺癌易感性具有明顯相關(guān)性。Zhai[49]研究了高加索人群VEGF基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）易感性的關(guān)系，納入了1,900例病例和1,458例正常對(duì)照，也發(fā)現(xiàn)有一個(gè)常見(jiàn)單體型可能與高加索男性人群的腺癌有一定相關(guān)性。Jo等[50]研究了407例韓國(guó)肺癌人群和407例完全匹配的正常人群表皮生長(zhǎng)因子受體2基因（epidermal growth factor receptor, HER-2）常見(jiàn)多態(tài)性與肺癌易感性的關(guān)系，結(jié)果發(fā)現(xiàn)3個(gè)常見(jiàn)SNP（-3444C＞T、-1985G＞T、P1170A C＞G）與非吸煙、女性、非飲酒肺癌患者的易感性具有一定相關(guān)性。

基質(zhì)金屬蛋白酶（matrix metalloproteinases, MMPs）能降解細(xì)胞外基質(zhì)（extracellular matrix, ECM）中的各種蛋白成分，因此有可能在腫瘤侵襲與轉(zhuǎn)移中具有重要作用，Su[51]研究了高加索人群MMP多態(tài)性與肺癌之間的關(guān)系，研究納入了2,013例病例和1,323例正常對(duì)照人群，發(fā)現(xiàn)4個(gè)具有連鎖關(guān)系的常見(jiàn)SNP（rs1799750、rs3025058、rs2276109、rs652438）與肺癌發(fā)生具有相關(guān)性，單體型分析OR值達(dá)到3.65。Sauter的研究[52]也發(fā)現(xiàn)了在高加索人群中MMP1的常見(jiàn)多態(tài)性與肺癌的發(fā)生具有相關(guān)性。

2.5 凋亡基因 細(xì)胞凋亡（apoptosis）亦稱程序化死亡（programmed cell death）或凋亡性細(xì)胞死亡（apoptosis cell death），是器官組織中細(xì)胞的一種正常的生理機(jī)制，是多細(xì)胞有機(jī)體調(diào)控機(jī)體發(fā)育、維護(hù)內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定的細(xì)胞主動(dòng)死亡過(guò)程。一般認(rèn)為，腫瘤細(xì)胞的凋亡機(jī)制異常導(dǎo)致的細(xì)胞增殖和凋亡的失衡是導(dǎo)致腫瘤惡性生物學(xué)行為的一個(gè)基本機(jī)制，也被認(rèn)為是影響腫瘤患者預(yù)后的一個(gè)重要的因素。所以可以推論凋亡相關(guān)基因的多態(tài)性有可能影響腫瘤的發(fā)生、侵襲與轉(zhuǎn)移等。半胱天冬氨酸酶（caspase）是一組參與細(xì)胞凋亡的重要蛋白，Lee等[53]研究了韓國(guó)肺癌人群caspase7常見(jiàn)SNPs的分布，發(fā)現(xiàn)rs2227310位點(diǎn)及一個(gè)單體型（rs12415607、rs11593766、rs2227310、rs10787498）與肺癌發(fā)生具有相關(guān)性。來(lái)源于同樣人群的研究[54-56]發(fā)現(xiàn)caspase-3、caspase-8、caspase-9常見(jiàn)多態(tài)性與肺癌均具有一定的相關(guān)性。

生存素基因（survivin）是新近發(fā)現(xiàn)的一個(gè)凋亡抑制蛋白家族新成員，它通過(guò)直接抑制caspase-3和caspase-7的活性和間接抑制caspase-9的活性阻斷細(xì)胞凋亡，是具有抑制細(xì)胞凋亡和調(diào)節(jié)細(xì)胞分裂的雙功能蛋白[57,58]?，F(xiàn)在已知survivin選擇性表達(dá)于喉癌、肝癌、乳腺癌、卵巢癌等多種常見(jiàn)的惡性腫瘤，而在正常成人分化成熟的組織中基本不表達(dá)。因此在理論上survivin可以作為一個(gè)待選基因分析其常見(jiàn)多態(tài)性與腫瘤易感性的關(guān)系。Jang等[59]研究了韓國(guó)肺癌人群survivin常見(jiàn)多態(tài)性與肺癌發(fā)生的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)在其選擇的8個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)中位于啟動(dòng)子區(qū)域的位點(diǎn)rs17884799及包括該位點(diǎn)的一個(gè)單體型與肺癌具有關(guān)聯(lián)，因此可以推論位于該基因上游啟動(dòng)子區(qū)域的一個(gè)常見(jiàn)多態(tài)性位點(diǎn)可能影響了該基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)，進(jìn)而影響了對(duì)肺癌的易感性。

2.6 修復(fù)酶基因 DNA修復(fù)是一系列與恢復(fù)正常DNA序列結(jié)構(gòu)和維持遺傳信息相對(duì)穩(wěn)定有關(guān)的細(xì)胞反應(yīng)，目前已知大概有超過(guò)100個(gè)修復(fù)酶參與DNA的修復(fù)作用，根據(jù)其修復(fù)機(jī)制的不同大體上可以分為5類，即直接修復(fù)、堿基切除修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)、錯(cuò)配修復(fù)、雙鏈斷裂修復(fù)。因此，可以推論DNA修復(fù)酶的多態(tài)性有可能引起的DNA修復(fù)能力的差異，進(jìn)而在一定程度上影響著肺癌遺傳易感性的不同。目前關(guān)于修復(fù)基因多態(tài)性與肺癌易感性關(guān)系的研究是腫瘤易感性研究的一個(gè)熱點(diǎn)，其中得到廣泛研究并認(rèn)為與腫瘤易感性具有相關(guān)性的有錯(cuò)配切除修復(fù)基因1（excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 1, ERCC1）、錯(cuò)配切除修復(fù)基因2（excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 2, ERCC2）、錯(cuò)配切除修復(fù)基因6（excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 6, ERCC6）、X射線交叉補(bǔ)體1基因（X-ray cross-complementing group1, XRCC1）、X射線交叉補(bǔ)體4基因（X-ray cross-complementing group 4, XRCC4）、O6-甲基鳥(niǎo)嘌呤-DNA甲基轉(zhuǎn)移酶（O6-methylguanine-DNA methyltransferase, MGMT）等[15,60-67]。最近以中國(guó)漢族人群為研究對(duì)象的一項(xiàng)大樣本量研究對(duì)比了ERCC1常見(jiàn)多態(tài)性分布在肺癌人群和正常人群的差異，共納入了1 010例肺癌人群和1 010例正常人群，結(jié)果發(fā)現(xiàn)在檢測(cè)的7個(gè)常見(jiàn)位點(diǎn)中，有兩個(gè)位點(diǎn)（rs3212948、rs1007616）以及包括該位點(diǎn)的一個(gè)常見(jiàn)單體型與肺癌具有明確的相關(guān)性[63]，該項(xiàng)研究也是少有的針對(duì)中國(guó)人群的具有較高證據(jù)水平的研究。

除了上述得到廣泛研究的修復(fù)酶基因，最近還發(fā)現(xiàn)了許多與肺癌具有相關(guān)性的其它修復(fù)酶基因，如8-羥基鳥(niǎo)嘌呤-DNA糖苷酶（8-oxoguanine DNA N-glycosylase 1, hOGG1）[68-70]、DNA依賴蛋白激酶（DNA dependent protein kinase, DNA-PK）、DNA連接酶（DNA ligase 1,LIG1）等[71,72]。

2.7 其它與肺癌易感性相關(guān)的基因 肺癌的發(fā)生、發(fā)展是一個(gè)多原因多步驟的過(guò)程，除了廣泛開(kāi)展的關(guān)于代謝酶基因、抑癌基因、修復(fù)酶基因、轉(zhuǎn)移相關(guān)基因、凋亡基因外，還有其它大量相關(guān)基因被發(fā)現(xiàn)與肺癌的發(fā)生有相關(guān)性。共濟(jì)失調(diào)毛細(xì)血管擴(kuò)張突變基因（ataxia telangiectasia mutated gene, ATM）基因在DNA的信號(hào)識(shí)別、修復(fù)中具有重要作用，針對(duì)中國(guó)漢族人群的一項(xiàng)應(yīng)用較大樣本量的研究發(fā)現(xiàn)該基因的常見(jiàn)多態(tài)性與非吸煙人群的肺癌易感性具有相關(guān)性[73]。其它被發(fā)現(xiàn)的與肺癌易感性相關(guān)的基因還有白介素1A基因（interleukin 1A, IL1A）、白介素1B基因（interleukin 1B, IL1B）[74]、多藥耐藥基因1（multidrug resistance 1, MDR1）[75]、絲氨酸/蘇氨酸激酶15基因（serine/threonine kinase 15, STK15）[76]、β2腎上腺素受體基因（beta-2 adrenergic receptor, ADRB2）[77]、轉(zhuǎn)錄生長(zhǎng)因子-β基因（transforming growth factor-β, TGF-β）[78]、DNA甲基轉(zhuǎn)移酶-3B基因（DNA-methyltransferase-B, DNMT3B）[79]、5,10-亞甲基四氫葉酸還原酶基因（5,10-methylenetetrahyd rofolate reductase, MTHFR）[80-82]、血管緊張素轉(zhuǎn)化酶基因（angiotensin-converting enzyme, ACE）[83]、白酪氨酸磷酸酶激酶基因（protein tyrosine phosphatase, PTP）[84]、脫氧嘧啶核酸內(nèi)切酶基因（apyrimidinic endonuclease, APE1）[85,86]、人硫轉(zhuǎn)移酶基因1A1（human sulfotransferase 1A1, SULT1A1）[87]、甲基化鳥(niǎo)苷結(jié)合蛋白4（methyl-CpG binding domain protein 4,MBD4）[88]等。總之，關(guān)于SNP與肺癌易感性的研究是肺癌遺傳研究領(lǐng)域中的一個(gè)熱點(diǎn)，大量的研究發(fā)現(xiàn)了可能與肺癌發(fā)生具有關(guān)聯(lián)的易感性SNP，這些有關(guān)聯(lián)的SNP理論上有望成為篩選肺癌易感人群的分子標(biāo)志物。需要指出的是，國(guó)內(nèi)針對(duì)中國(guó)漢族人群也開(kāi)展了廣泛的研究，但是大多數(shù)研究采用的樣本量過(guò)小，從而限制了研究結(jié)果的有效性，開(kāi)展多中心的合作是解決這一問(wèn)題的關(guān)鍵和必然途徑。

3 SNP與肺癌的治療及預(yù)后

不同肺癌患者間對(duì)藥物治療往往具有不同的反應(yīng)，包括治療效果及藥物的毒性作用，這反映了個(gè)體間基因的差異會(huì)導(dǎo)致藥理作用的不同，研究這種不同個(gè)體間基因的差異對(duì)于肺癌的臨床個(gè)體化治療具有重要意義[89]。鉑類是肺癌的化療中最常應(yīng)用的藥物，臨床應(yīng)用中不同個(gè)體間用藥效果和毒性作用往往具有很大差異。Wu[9]研究了中國(guó)人群著色性干皮病D型基因（xerodemar pigmentosum group D, XPD）的常見(jiàn)多態(tài)性與進(jìn)展期NSCLC患者應(yīng)用順鉑治療的3級(jí)-4級(jí)血液學(xué)毒性的關(guān)系，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，位于156密碼子上的多態(tài)性位點(diǎn)（rs238406）的常見(jiàn)基因型Arg156Arg能夠明顯地增加患者3級(jí)-4級(jí)血液學(xué)毒性，OR值達(dá)到3.24，而且在白細(xì)胞減少上作用更突出。Sun等[90]研究了XRCC及XPD常見(jiàn)多態(tài)性與進(jìn)展期肺癌應(yīng)用含鉑類藥物化療的反應(yīng)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)位于XRCC 194位氨基酸密碼子上的一個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)與治療反應(yīng)具有明顯相關(guān)性，但是該研究納入樣本量過(guò)小，限制了研究的證據(jù)學(xué)水平。Sohn[91]研究了應(yīng)用EP方案化療的小細(xì)胞肺癌患者多藥耐藥基因MDR1常見(jiàn)多態(tài)性與化療反應(yīng)之間的關(guān)系，結(jié)果發(fā)現(xiàn)位于外顯子26上第3,435核苷酸位點(diǎn)處攜帶CC基因型的患者較攜帶CT/TT基因型的患者具有更明顯的化療反應(yīng)，由該位點(diǎn)以及第2,677核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)組成的單體型與化療反應(yīng)具有更明顯的相關(guān)性。還有研究者[92]探討了陰離子轉(zhuǎn)運(yùn)多態(tài)基因（anion-transporting polypeptides,OATP1B1）的常見(jiàn)SNP與NSCLC患者應(yīng)用順鉑治療的化療敏感性及毒性作用的關(guān)系，也得出了有意義的結(jié)論。

SNP影響到肺癌患者對(duì)治療的反應(yīng)，必然會(huì)影響肺癌患者的生存期。吉非替尼是針對(duì)EGFR的特異性酪氨酸酶抑制劑，被廣泛應(yīng)用于進(jìn)展期NSCLC的臨床治療，Liu[93]研究了EGFR基因常見(jiàn)多態(tài)性-216G/T、-191C/A、Arg497Lys與進(jìn)展期NSCLC患者應(yīng)用吉非替尼治療效果的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)-216位點(diǎn)攜帶T等位基因的患者獲得了較長(zhǎng)時(shí)間的無(wú)進(jìn)展生存。Ma等[94]應(yīng)用標(biāo)簽SNPs的方法研究了84例應(yīng)用吉非替尼的中國(guó)漢族肺癌患者EGFR常見(jiàn)多態(tài)性與肺癌治療結(jié)局的關(guān)系，研究發(fā)現(xiàn)rs2293347與患者的生存期具有明顯相關(guān)性，可以成為一個(gè)預(yù)測(cè)指標(biāo)。Heist[95]研究了維生素D受體基因（vitamin D receptor, VDR）與進(jìn)展期NSCLC生存期之間的關(guān)系，共納入294例病例，結(jié)果發(fā)現(xiàn)rs10735810位點(diǎn)CC基因型較CT/TT基因型患者具有更長(zhǎng)的生存期，平均生存時(shí)間為21.4個(gè)月，進(jìn)一步的單體型分析也得到同樣的結(jié)果。Kim[96]研究了乳腺癌易感性基因1（breast cancer susceptibility gene 1, BRCA1）常見(jiàn)多態(tài)性與NSCLC生存期之間的關(guān)系，納入了300例進(jìn)行鉑類為基礎(chǔ)化療的患者，結(jié)果發(fā)現(xiàn)了一個(gè)單體型與肺癌的生存期具有明顯的相關(guān)性，作者認(rèn)為該單體型可以成為判斷患者化療后生存期預(yù)測(cè)的生物標(biāo)記物。Carcereny等[97]在一項(xiàng)納入III期臨床試驗(yàn)的肺癌患者中，研究了芳香烴受體基因亞單位常見(jiàn)多態(tài)性與應(yīng)用吉西他濱、鉑類等藥物的治療反應(yīng)及預(yù)后之間的關(guān)系，結(jié)果發(fā)現(xiàn)一個(gè)常見(jiàn)多態(tài)性位點(diǎn)rs1051730能夠明顯提高患者對(duì)化療的治療反應(yīng)，并且延長(zhǎng)無(wú)進(jìn)展生存期及總生存期。其它研究還發(fā)現(xiàn)與肺癌患者生存期具有相關(guān)性的基因還有甘露糖結(jié)合凝集素基因（mannose-binding lectin 2, MBL2）[98]、MDR1[99-101]等。但是上述開(kāi)展的幾項(xiàng)研究由于樣本量的原因?qū)е伦C據(jù)水平不足。

4 基因組水平的研究

肺癌是SNP與疾病相關(guān)性研究領(lǐng)域中得到最充分研究的疾病，經(jīng)過(guò)10余年世界范圍內(nèi)的研究工作，大量的侯選基因得到研究，研究人群覆蓋幾乎所有種族，發(fā)現(xiàn)了許多與腫瘤易感性、生存期、治療反應(yīng)等具有相關(guān)性的多態(tài)性位點(diǎn)，但一個(gè)共同缺陷是幾乎所有有意義的SNP位點(diǎn)與疾病的關(guān)聯(lián)度均是非常微弱的，雖然應(yīng)用單體型分析方法進(jìn)一步提高了研究效率，但單個(gè)基因的研究結(jié)果仍難以具有實(shí)際應(yīng)用的意義[102]。目前已經(jīng)有作者應(yīng)用測(cè)序及芯片技術(shù)等方法從基因組水平上研究了肺癌的易感性，但從技術(shù)方法上仍然不屬于全基因組水平上的肺癌群體遺傳研究，而且樣本量是有限的[103-105]。隨著人類基因組計(jì)劃的完成以及新一代基因分型技術(shù)的發(fā)展，使得從全基因組水平進(jìn)行多態(tài)性與腫瘤關(guān)聯(lián)研究具有現(xiàn)實(shí)的可能性[106,107]。開(kāi)展多中心合作、采用大樣本人群、應(yīng)用新一代大規(guī)模測(cè)序技術(shù)開(kāi)展肺癌的群體遺傳研究將是未來(lái)的研究方向。

5 問(wèn)題與展望

關(guān)于SNP與肺癌關(guān)系的研究?jī)?nèi)容非常廣泛，通過(guò)我們所作的簡(jiǎn)要回顧，已經(jīng)可以明確地看到，作為新一代遺傳標(biāo)記，有著豐富數(shù)量的SNP能夠解釋肺癌的復(fù)雜遺傳現(xiàn)象。肺癌作為一種典型的多基因遺傳疾病，其在發(fā)生、發(fā)展、治療反應(yīng)、預(yù)后等方面所表現(xiàn)出來(lái)的遺傳性差異就是由基因組上一系列相關(guān)基因的SNP群的共同作用導(dǎo)致的，是許多微效基因累加的結(jié)果。隨著新一代大規(guī)模測(cè)序技術(shù)的進(jìn)展，使得我們有望從全基因組水平對(duì)人類疾病進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析，將有可能在基因水平上幫助我們揭示肺癌遺傳現(xiàn)象的本質(zhì)。