楊曉鵬,劉波,宋淼,2,鞏新,唱韶紅,薛奎晶,2,吳軍
1 軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院生物工程研究所,北京 100071
2 沈陽藥科大學(xué)生命科學(xué)與生物制藥學(xué)院,沈陽 110016
近年來,藥用蛋白市場的需求越來越大,在這些蛋白中糖蛋白占絕大多數(shù),例如各種治療性抗體、細胞因子等。糖蛋白是糖基與蛋白共價相連構(gòu)成的結(jié)合蛋白,糖蛋白的糖基與蛋白的功能、穩(wěn)定性均有著密切的聯(lián)系[1]。糖蛋白根據(jù)糖基和蛋白質(zhì)的連接方式不同,可分為2大類,即O-連接和N-連接糖蛋白。其中,對N-連接糖蛋白的糖基化修飾研究得比較透徹,其修飾序列極端保守,即在Asn-X-Thr/Ser (X為除Pro外的任意氨基酸) 的Asn殘基上。
目前重組糖蛋白藥物的生產(chǎn)主要是哺乳動物細胞表達系統(tǒng)。但該系統(tǒng)培養(yǎng)成本高、生產(chǎn)周期長[2]。因此,利用酵母細胞來替代哺乳動物細胞生產(chǎn)重組蛋白藥物已日益受到人們的重視。酵母表達系統(tǒng)具有原核細胞系統(tǒng)生長速度快、便于基因操作和可工業(yè)化大規(guī)模培養(yǎng)等優(yōu)點,同時又具有真核細胞大部分的翻譯后加工修飾能力,因而廣泛用于各種蛋白的表達[3]。巴斯德畢赤酵母屬于甲基營養(yǎng)型酵母,是第2代酵母表達系統(tǒng)的代表,作為成熟的表達系統(tǒng),它還具有表達量高、較穩(wěn)定、可分泌、易純化及成本低等優(yōu)點[4-7],但目前主要應(yīng)用于非糖蛋白的生產(chǎn),這是因為當畢赤酵母表達系統(tǒng)用于多數(shù)重組糖蛋白藥物的生產(chǎn)時,還存在一些問題,其中最關(guān)鍵的是畢赤酵母對糖蛋白的過度糖基化修飾,即形成不同于哺乳動物細胞的雜合型或復(fù)雜型糖基結(jié)構(gòu),而是高甘露糖型糖基或過度糖基化結(jié)構(gòu)[8-9],這種高甘露糖型糖基結(jié)構(gòu)的糖蛋白在人體中容易被清除、半衰期較短、且易產(chǎn)生較高的免疫原性;同時對某些蛋白過度的糖基化修飾也會造成產(chǎn)物的分子量不均一,或者一些活性位點的遮蔽[10],影響其功能和活性。這些都限制了畢赤酵母在糖蛋白類藥物生產(chǎn)方面的應(yīng)用。
酵母和哺乳動物N-糖基化修飾途徑在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的起始步驟都是相同的,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,在寡糖轉(zhuǎn)移酶作用下,Glc3Man9GlcNAc2被連接到新生肽鏈的專一序列上,即Asn-X-Thr/Ser的Asn殘基上,隨后在葡萄糖苷酶Ⅰ、Ⅱ和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)甘露糖苷酶 I (MnsI)的作用下,蛋白的糖基最終被加工成 Man8GlcNAc2糖基,并轉(zhuǎn)運至高爾基體。在高爾基體內(nèi),酵母和哺乳動物糖基修飾過程明顯不同,在酵母高爾基體中,由于存在一個關(guān)鍵起始酶 α-1,6-甘露糖轉(zhuǎn)移酶(Och1p),Man8GlcNAc2糖基在它的作用下接受第一個 α-1,6-甘露糖,形成 Man9GlcNAc2糖基,該糖基是 α-1,2、α-1,3甘露糖轉(zhuǎn)移酶及一些磷酸甘露糖轉(zhuǎn)移酶的底物,在這些甘露糖轉(zhuǎn)移酶的作用下,蛋白的糖基可以被加至數(shù)十至上百個甘露糖,形成高甘露糖,發(fā)生過度糖基化修飾[10];而在哺乳動物高爾基體內(nèi),蛋白的糖基在 α-1,2甘露糖苷酶 I (MDSI)的作用下,Man8GlcNAc2糖基會被剪切去除 3個α-1,2連接的甘露糖,而形成Man5GlcNAc2糖基,這一糖基是哺乳動物細胞合成雜合型和復(fù)雜型糖基的前體,也是哺乳動物表達的甘露糖型糖蛋白的主要糖型,如牛核糖核酸酶B (Ribonuclease B)。而這種糖基在酵母中并不存在,所以這一結(jié)構(gòu)也是酵母和哺乳動物N-糖基化修飾過程的“分界線”。
我們前期已經(jīng)敲除了 Och1這一形成高甘露糖型糖基結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵酶基因,獲得了過度糖基化缺失的畢赤酵母菌株GJK01 (ura3、och1)[11]。本研究擬通過選擇不同物種來源MDSI及其定位信號,并實現(xiàn)其在GJK01 (ura3、och1) 中的融合表達,以獲得從酵母糖基向哺乳動物糖基改造的第一個關(guān)鍵糖型,即Man5GlcNAc2結(jié)構(gòu)。
1.1.1 質(zhì)粒和菌株
α-1,6-甘露糖轉(zhuǎn)移酶 (Och1p) 基因缺陷的畢赤酵母 GJK01 (ura3、och1) 菌株由本室構(gòu)建。HSA/GM-CSF表達載體 pHIL-D2/HSA/GM-CSF、PGE1203-URA3 均由本室構(gòu)建保存[11]。載體pPICZαA、pIB2、畢赤酵母GS115均購自Invitrogen公司。HepG2細胞由本室保存。
1.1.2 試劑和儀器
培養(yǎng)基和試劑:酵母抽提物、蛋白胨均為Oxoid公司產(chǎn)品;無氨基酸酵母氮源 (Yeast nitrogen base without amino acids,YNB) 為Difco公司產(chǎn)品;所用限制性內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶和去磷酸化酶(CIAP) 均為大連寶生物工程有限公司產(chǎn)品;牛核糖核酸酶B (RNase B)、氫化硼氰化鈉 (NaBH3CN) 均為Sigma產(chǎn)品;Sephadex-G10 柱色譜填料 (AB);DNA 3100 測序儀 (ABI);8-氨基芘基-1,3,6-三磺酸(8-aminopyrene-1,3,6-trisulfonate,APTS) (Molecular probes);碳黑柱 (Alltech associates)。
1.2.1 PGE-URA3-GAP1載體構(gòu)建
GAP啟動子基因的獲?。阂詐GAP01和pGAP02為引物,以畢赤酵母表達載體pIB2為模板,PCR擴增500 bp GAP啟動子基因片段;CY CTT終止子基因的獲?。阂詐CYCTT01和pCYCTT02為引物,以畢赤酵母表達載體 pPICZαA為模板,PCR擴增300 bp的CYCTT終止子基因片段;然后通過引物pGAP01和pCYCTT02,利用PCR方法融合GAP和CYCTT,獲得GAP表達盒,片段大小約800 bp。利用Kpn Ⅰ/XbaⅠ酶切該片段,并與經(jīng)過同樣酶切的pGE1203-URA3進行連接,獲得含GAP表達盒的載體 pGEURA3-GAP。利用一對互補配對的寡核苷酸引物1203MSC5、1203MSC3,退火形成雙鏈,構(gòu)建至pGEURA3-GAP載體中,獲得含有多克隆位點Ssp I-Sse838 I-Swa I的載體,命名為 pGEURA3-GAP1載體。
1.2.2 載體PGE-URA3-GAP1-signal-MDSI的構(gòu)建
定位信號的克?。阂葬劸平湍富蚪M為模板,以pMnsI5、pMnsI3為引物,PCR擴增90 bp的MnsI定位信號,以pSCsec12-5、pSCsec12-3為引物,PCR擴增300 bp 的Sec12定位信號;以乳酸克魯維酵母基因組為模板,以pKLsec12-5、pKLsec12-3為引物,PCR擴增300 bp的Sec12定位信號。將擴增得到的3種定位信號基因片段分別用Sse8387Ⅰ/SspⅠ酶切,構(gòu)建至同樣酶切的pGE-URA3-GAP1載體中,獲得3種pGE-URA3-GAP1-signal載體。
MDSI基因的克?。簭娜说母伟┘毎鸋epG2中提取總RNA,以pHmdsi(Δ185)、pHMDSI3為引物,RT-PCR擴增1 800 bp人源的編碼缺失N端185個氨基酸但包含完整C端催化區(qū)的MDSI基因片段,記為 HMDSI(Δ185);從植物擬南芥葉片中提取總RNA,以 pATMDSI5(Δ48)、pATMDSI3為引物,RT-PCR擴增1 700 bp擬南芥的編碼缺失N端48個氨基酸但包括完整C端催化區(qū)的MDSI基因片段,記為ATMDSI(Δ48)。利用Sse8387Ⅰ/SwaⅠ酶切位點將2種基因片段分別構(gòu)建至3種pGE-URA3-GAP1-signal載體中,獲得 6種載體 PGE-URA3-GAP1-signal-MDSI。
1.2.3 表達載體PGE-URA3-PNOI-GAP-signal-MDSI的構(gòu)建
為了實現(xiàn)MDSI表達載體在酵母基因組中的定點整合,本研究選取了磷酸甘露糖轉(zhuǎn)移酶PNO1基因開放讀碼框ORF上游同源序列作為整合位點。因此,以畢赤酵母GS115基因組為模板,以PNOI5-5、Pno為引物,PCR擴增PNO1基因ORF上游序列,片段大小為1 000 bp左右,電泳回收,然后,再以回收產(chǎn)物與PNOI3-3為引物,以畢赤酵母GS115基因組為模板,PCR擴增2 000 bp左右基因片段,電泳回收,回收產(chǎn)物利用 KpnⅠ/XbaⅠ酶切位點克隆至pGE-URA3-GAP載體中,獲得pGE-URA3-PNOI載體;NotⅠ酶切 6個基因載體 PGE-URA3-GAP-signal-MDSI,將獲得的帶有MDSI基因的表達盒克隆到限制性內(nèi)切酶 NotⅠ酶切并 CIAP去磷酸化的pGE-URA3-PNOI載體中,獲得表達載體 PGEURA3-PNOI-GAP1-signal-MDSI。
表1 α-1,2-甘露糖苷酶 (MDSI) 表達載體的構(gòu)建引物Table 1 Primer used for constructing α-1,2-mannosidase I (MDSI) expression plasmid
制備GJK01 (ura3、och1) 的電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞,將 pHIL-D2/HSA/GM-CSF(His6-tag) 以限制性內(nèi)切酶NotⅠ線性化后電轉(zhuǎn)入感受態(tài)細胞中,將電擊后的菌液涂布于含有尿嘧啶和精氨酸的 MD 培養(yǎng)基(YNB 1.34%,生物素4×10?5%,葡萄糖2%,瓊脂1.5%,精氨酸100 μg/mL,尿嘧啶 100 μg/mL) 上。5~8 d后,隨機挑取克隆接種到2 mL YPD培養(yǎng)基中,25 ℃培養(yǎng)48 h后,以5%的接種量接種到BMGY培養(yǎng)基中,24 h后加入0.5%甲醇進行誘導(dǎo)表達,每12 h補加1次甲醇,誘導(dǎo)72 h后離心取上清,上清用于融合蛋白的表達分析,篩選HSA/GM-CSF(His6-tag)在缺陷菌GJK01 (ura3、och1) 中的表達株。
制備HSA/GM-CSF(His6-tag) 在GJK01 (ura3、och1) 中的表達株的感受態(tài)細胞,將 6種 PGEURA3-PNOI-GAP1-signal-MDSI分別以位于 PNOI基因 ORF上游手臂上的限制性內(nèi)切酶 BamHⅠ酶切,線性化后分別電轉(zhuǎn)入感受態(tài)細胞中,將電擊后的菌液涂布于含有精氨酸的 MD培養(yǎng)基 (YNB 1.34%,生物素4×10?5%,葡萄糖2%,瓊脂1.5%,精氨酸 100 μg/mL) 上。5~8 d后,對長出的URA3+菌進行基因組鑒定,鑒定引物為MDSI釣取引物。將鑒定得到的MDSI轉(zhuǎn)入的陽性菌接種到2 mL YPD培養(yǎng)基中,25 ℃培養(yǎng)48 h后,以5%的接種量接種到BMGY培養(yǎng)基中,24 h后加入0.5%甲醇進行誘導(dǎo)表達,每 12 h補加一次甲醇,誘導(dǎo)72 h后離心取上清,上清備用。
收集培養(yǎng)上清,利用鎳親和層析方法純化末端帶有6個His標簽的報告蛋白HSA/GM-CSF。流動相為20 mmol/L Tris-HCl,0.5 mol/L NaCl,pH 7.5,洗脫液另含0.5 mol/L咪唑。在280 nm處紫外吸收峰值收集純化產(chǎn)物,10%的SDS-PAGE鑒定表達產(chǎn)物。
1.6.1 HSA/GM-CSF(His6-tag) 糖基的釋放
蛋白在0.5% SDS和1% β-巰基乙醇變性緩沖液中100 ℃變性10 min,然后在含有50 mmol/L磷酸鈉 (pH 7.5)、1% NP-40、N-糖苷酶F (PNGase F)的溶液中37 ℃酶切16 h,使HSA/GM-CSF(His6-tag)釋放糖基。
1.6.2 HSA/GM-CSF(His6-tag)糖基的純化
用80%乙腈、0.1%三氟醋酸活化碳黑柱,20%乙腈、0.05%三氟醋酸洗脫,所得糖鏈真空冷凍抽干備用。
1.6.3 APTS標記糖鏈
取糖鏈樣品,加0.02 mol/L的APTS溶液1 μL[溶于1.2 mol/L檸檬酸],1 mol/L 的NaBH3CN溶液1 μL (溶于DMSO)?;靹?,封管,置37 ℃水浴反應(yīng)18 h。
1.6.4 APTS標記糖鏈Sephadex G10純化
據(jù)文獻[12]報道該方法簡單,可除去約 90%的單體 APTS,同時能保留約 70%以上的標記物復(fù)合物。樣品經(jīng)G10兩次純化后真空抽干。
1.6.5 3100 DNA測序儀分析APTS標記糖鏈[17]
5 μL純水溶解G10純化且冷凍抽干的APTS標記糖鏈。最終待測樣品中含1 μL樣品,8 μL去離子甲酰胺和1 μL ROX修飾內(nèi)標混合物,其中ROX內(nèi)標混合物是指由羅丹明修飾的6-、30-寡核苷酸 (由5′-TAC-3′重復(fù)序列組成,由 Invitrogen公司 PAGE純化得到)。上樣后利用標準的 36 cm 毛細管及POP-6膠 (ABI) 分離,并利用GeneScan 3.7軟件進行數(shù)據(jù)分析。
為了分析外源的MDSI在GJK01 (ura3、och1)中的活性,本研究以HSA/GM-CSF(His6-tag) 作為報告蛋白。為此,必須獲得HSA/GM-CSF(His6-tag) 在GJK01 (ura3、och1) 中的表達菌株。將表達質(zhì)粒pHIL-D2/HSA/GM-CSF(His6-tag) 轉(zhuǎn)入畢赤酵母GJK01 (ura3、och1) 后,隨機挑取克隆,接種至BMGY進行誘導(dǎo)表達,取培養(yǎng)上清進行SDS-PAGE分析,1、2、4、5、7號克隆在分子量接近97 kDa處出現(xiàn)一條蛋白條帶 (圖 1),而非糖基化的HSA/GM-CSF(His6-tag) 分子量為85 kDa,提示該條帶為糖基化的HSA/GM-CSF(His6-tag)。
圖1 HSA-GM/CSF(His6-tag) 在 P. pastoris GJK01 (ura3、och1) 中表達的SDS-PAGE圖譜Fig. 1 The SDS-PAGE for identification of HSA/GM-CSF expressed in P. pastoris GJK01 (ura3, och1). M: molecular weight marker; 1, 2, 4, 5, 7: positive transformants; 3, 6, 8, 9: negative transformants.
構(gòu)建的 α-1,2-甘露糖苷酶 (MDSI) 表達載體(圖2),包含PNOI基因ORF上下游各1 000 bp的同源臂、GAP啟動子、目的基因及其定位信號、CYCTT終止子。其中,兩種不同來源的 MDSI基因:人源的編碼缺失N端185個氨基酸但包含完整C端催化區(qū)的 MDSI基因[HMDSI(Δ185)]和擬南芥的編碼缺失N端48個氨基酸但包含完整C端催化區(qū)的MDSI基因[ATMDSI(Δ48)];3種不同的定位信號:釀酒酵母 MnsI (ScMnsI) 的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位信號、釀酒酵母Sec12 (Scsec12) 的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位信號以及乳酸克魯維酵母Sec12 (KLSec12) 的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位信號,分別組合,構(gòu)成6種表達載體 (表2)。
圖2 PGE-GAP-URA3-PNOI-signal-MDSI的構(gòu)建Fig. 2 Construction of the plasmid PGE-GAP-URA3-PNOI-signal-MDSI.
表2 MDSI表達載體Table 2 MDSI expression plasmid
定位信號擴增的片段,瓊脂糖核酸電泳如圖3A所示,在90 bp左右、300 bp左右有特異的擴增產(chǎn)物片段,分別與ScMnsI、Scsec12、KLSec12的定位信號大小一致;MDSI基因克隆的片段,瓊脂糖核酸電泳如圖3B、圖3C所示,在1 800 bp左右、1 700 bp左右有特異的擴增片段,分別與 HMDSI (Δ185)、ATMDSI(Δ48)大小一致。最終獲得的表達載體PGE-URA3-PNOI-GAP1-signal-MDSI經(jīng)Not I酶切分析,發(fā)現(xiàn)有約2.5~3.0 kb的基因表達盒片段與理論值一致 (圖 4)。并且經(jīng)過測序分析顯示表達載體 PGE-URA3-PNOI-GAP1-signal-MDSI構(gòu)建成功。
將3種定位信號 (ScMnsI的定位信號、Scsec12的定位信號、KLSec12的定位信號) 與 2種來源的MDSI (人源的及擬南芥來源) 表達載體電轉(zhuǎn)化GJK01(ura3、och1、pHIL-D2/HSA/GM-CSF(His6-tag)菌,對轉(zhuǎn)化菌基因組進行PCR鑒定,篩選MDSI基因整合到酵母染色體上的重組菌,1 800 bp左右的條帶與MDSI大小一致 (圖5)。
圖3 定位信號及MDSI基因PCR擴增分析Fig. 3 PCR analysis of signal and MDSI. M: DL2000 DNA marker. (A) 1: ScmnsI; 2: Scsec12; 3: KLsec12. (B) HMDSI(Δ185). (C) ATMDSI(Δ48).
圖4 PGE-GAP-URA3-PNOI-signal-MDSI載體質(zhì)粒的Not I酶切圖譜Fig. 4 Characterization of PGE-GAP-URA3-PNOI-signal-MDSI digestion by Not I. M:15 kb DNA marker; 1: Scsec12-ATMDSI(Δ48); 2: KLsec12-ATMDSI(Δ48); 3: Scsec12-HMDSI(Δ185); 4: KLsec12-HMDSI(Δ185); 5: ScMnsI-ATMDSI (Δ48); 6: ScMnsI-HMDSI(Δ185).
圖5 MDSI轉(zhuǎn)化GJK01 (ura3、och1、pHIL-D2/HSA/ GM-CSF(His6-tag) 的PCR鑒定Fig. 5 PCR identification of MDSI transformed in GJK01(ura3, och1, pHIL-D2/HSA/GM-CSF(His6-tag). 1?4: GJK01(ura3, och1, pHIL-D2/HSA/GM-CSF(His6-tag) transformed with MDSI; 5: positive control; M: 2000 plus DNA marker.
利用PNGaseF酶對MDSI轉(zhuǎn)化GJK01/ (ura3、och1、pHIL-D2/HSA/GM-CSF(His6-tag)) 基因組鑒定正確的克隆中表達的報告蛋白 HSA/GM-CSF (His6-tag) 進行酶切,利用 SDS-PGAE對酶切的報告蛋白分析,發(fā)現(xiàn)HSA/GM-CSF的糖基經(jīng)PNGaseF酶切后,分子量減小,說明其N-糖鏈被PNGaseF酶切除 (圖6)。
圖6 PNGaseF酶切報告蛋白 HSA/GM-CSF (His6-tag)的SDS-PAGE圖譜Fig. 6 The SDS-PAGE for characterization of HSA/GM-CSF digested by PNGaseF. 1, 3: HSA/GM-CSF expressed in GJK01 (ura3, och1, ScmnsI, ATMDSI, pHIL-D2/HSA/GM-CSF) digestion by PNGaseF; 2, 4: HSA/GM-CSF expressed in GJK01 (ura3, och1, ScmnsI, ATMDSI, pHIL-D2/HSA/GM-CSF); M: molecular weight marker.
PNGaseF酶切報告蛋白HSA/GM-CSF(His6-tag)后,樣品經(jīng)碳黑柱純化獲得糖鏈,APTS標記糖鏈。由于單體 APTS的存在會影響糖鏈分析,所以再用Sephadex G10柱純化標記糖鏈,以去除單體APTS。然后利用3100 DNA測序儀分析APTS標記、純化的報告蛋白糖鏈,并利用GeneScan 3.7軟件進行數(shù)據(jù)分析,分析結(jié)果如圖7所示。
從圖 7A 中可以看出,α-1,6-甘露糖轉(zhuǎn)移酶(Och1p)基因缺陷的畢赤酵母GJK01 (ura3、och1) 表達的報告蛋白 HSA/GM-CSF(His6-tag)的糖基是Man12GlcNAc2~Man16GlcNAc2高甘露糖型糖基,其中Man14GlcNAc2、Man15GlcNAc2占絕大部分。而將釀酒酵母 MnsI基因內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位信號與編碼擬南芥MDSI(Δ48)基因進行融合,并將這一融合基因整合到GJK01基因組誘導(dǎo)表達后,糖基分析發(fā)現(xiàn)擬南芥MDSI能在酵母GJK01 (ura3、och1) 宿主菌中發(fā)揮了較好的生物活性,能夠?qū)⒔湍窯JK01中表達的報告蛋白的糖基Man12GlcNAc2~Man16GlcNAc2絕大部分剪切成 Man5GlcNAc2~Man9GlcNAc2結(jié)構(gòu) (圖7B),這與哺乳動物來源的牛核糖核酸酶 B的Man5GlcNAc2~Man9GlcNAc2甘露糖型糖基一致 (圖7C)。通過本研究,我們利用釀酒酵母MnsI內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位信號與外源擬南芥 MDSI(Δ48)基因的融合表達,在GJK01 (ura3、och1) 基礎(chǔ)上,構(gòu)建了具有合成Man5GlcNAc2哺乳動物甘露糖型糖蛋白能力的畢赤酵母表達系統(tǒng)。這為在酵母體內(nèi)合成類似于哺乳動物雜合型或復(fù)雜型糖基奠定了基礎(chǔ)。
酵母糖基工程改造是在酵母中模擬哺乳動物的糖基修飾過程,即阻斷酵母形成高甘露糖型糖基,引入外源的參與糖基修飾的酶基因,并將其定位在適當位置,使其發(fā)揮活性對糖基進行修飾,從而獲得類似于哺乳動物雜合型或復(fù)雜型糖基的過程。哺乳動物中的糖苷酶或糖基轉(zhuǎn)移酶對糖基修飾是逐個順序完成的。Man5GlcNAc2是雜合型糖基修飾酶N-乙酰葡萄糖胺轉(zhuǎn)移酶 (GnTI) 的底物,在GnTI的作用下,Man5GlcNAc2上添加一個N-乙酰葡萄糖胺,形成 GlcNAcMan5GlcNAc2雜合型糖基。因而獲得Man5GlcNAc2糖基是酵母糖基化改造中的關(guān)鍵一步,沒有Man5GlcNAc2結(jié)構(gòu),GnTI就很難發(fā)揮作用進而會影響到后續(xù)酶的進一步加工。酵母糖基工程改造是一個復(fù)雜的系統(tǒng)工程,這其中涉及到諸多因素。
圖7 DSA-FACE分析報告蛋白HSA/GM-CSF(His6-tag)的N-糖基結(jié)構(gòu)Fig. 7 Analysis of N-Glycan on HSA/GM-CSF(His6-tag) by DSA-FACE. (A) N-Glycan of GJK01(ura3, och1, pHIL-D2/HSA/GM-CSF(His6-tag)). (B) N-Glycan of GJK01(ura3, ochI, ScmnsI-ATmdsI pHIL-D2/HSA/GM-CSF(His6-tag)). (C) N-Glycan of RNaseB M5?M9: Man5GlcNAc2?Man9GlcNAc2; M12?M16: Man12GlcNAc2?Man16GlcNAc2.
例如要實現(xiàn)外源基因的高效表達,需解決以下3個方面的問題。第一,基因來源的選擇,作為異源表達必須考慮外源基因在酵母中的活性問題,即酵母內(nèi)環(huán)境、pH值、最適溫度等等。我們優(yōu)先選擇了哺乳動物自身來源的基因以獲得哺乳動物的糖基結(jié)構(gòu),如本研究中的 MDSI基因。但由于人體溫度在37 ℃左右,與酵母生長溫度25 ℃~30 ℃存在差異,因此又選擇了植物來源的基因,其生存環(huán)境溫度范圍很廣,包含了酵母生長溫度。參與糖基化修飾的酶都是II型膜蛋白 (如MDSI),II型膜蛋白的共同特點是,具有N端的氨基端細胞質(zhì)尾、穿膜錨定區(qū)、莖區(qū)以及C端的催化區(qū)[13]。本研究中我們保留了不同長度的莖區(qū)和完整的C端催化區(qū)。其次,外源基因的準確定位問題。糖蛋白的糖基是蛋白經(jīng)過內(nèi)質(zhì)網(wǎng),內(nèi)側(cè)、中間和外側(cè)高爾基體過程中逐個順序添加上去的,因此,模擬哺乳動物的糖基修飾過程,將酶定位在準確位置是必要的。為了將MDSI定位于糖基化修飾的初始環(huán)境中,即內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或內(nèi)側(cè)高爾基體,本研究選擇釀酒酵母MnsI、Sec12的定位信號和乳酸克魯維酵母Sec12的定位信號。第三,啟動子問題,我們選擇了GAP啟動子。一般用于畢赤酵母表達的醇氧化酶 (AOX) 啟動子屬于強啟動子,它需要甲醇誘導(dǎo),存在一定的毒性隱患,不便于操作;GAP啟動子不需要甲醇誘導(dǎo),是一種中等強度的組成型啟動子,是一種成熟的用于酵母表達的啟動子,例如人殼多糖酶基因在GAP調(diào)控下連續(xù)表達超過1個月,表達量穩(wěn)定在300 mg/L[14]。同時,GAP啟動子在AOX啟動報告蛋白 (HSA/GM-CSF)之前,就啟動MDSI基因的表達,使得MDSI能更好地修飾隨后表達的報告蛋白。
本室在構(gòu)建酵母缺陷菌時,利用了URA3作為營養(yǎng)缺陷型篩選標記,URA3是一種常用的篩選標記,可以用來進行正負篩選。缺陷菌GJK01為URA3缺陷型[11],本研究構(gòu)建的表達載體以URA3為篩選標記,當MDSI表達載體被轉(zhuǎn)入工程菌GJK01中時,在目的基因 MDSI被整合至基因組的同時,URA3也被整合至基因組,重組酵母菌可以在無尿嘧啶的培養(yǎng)基上生長,得到URA3+MDSI菌株;進一步可以利用5-氟乳清酸 (5-FOA) 使URA3+菌株發(fā)生第2次重組,即URA3基因重新被剔除出基因組,從而再次獲得URA3的缺陷菌株,該篩選標記將運用于下一次基因的敲除。如本實驗前期利用URA3基因已經(jīng)成功敲除了畢赤酵母的 Och1p[11]和乳酸克魯維酵母的Och1p和Mnn1p (α-1,3-甘露糖轉(zhuǎn)移酶)[15]。
HSA/GM-CSF(His6-tag) 是本實驗室構(gòu)建的HSA與GM-CSF的融合蛋白,GM-CSF即粒細胞-巨噬細胞集落刺激因子,由127個氨基酸組成,有2個N-糖基化位點 (Asn27、Asn37),天然的GM-CSF約有 34%的糖基化[16]。為了對糖基進行有效分析,本研究采用了基于 DNA測序儀熒光輔助糖電泳(DNA sequencer assisted FACE,DSA-FACE)[14]的方法,現(xiàn)在用于糖基分析的方法大都是熒光輔助糖電泳 (FACE)、質(zhì)譜 (MS)、核磁共振 (NMR),這些方法需要大量的樣品,而且很難做到高通量。DSA-FACE是借助于 DNA測序儀的一種新型的熒光毛細管電泳方法,在常規(guī)的FACE的基礎(chǔ)上建立起來的一種高靈敏度的糖分析方法。它用毛細管電泳代替了傳統(tǒng)的PAGE膠,用熒光檢測器代替了紫外燈下的熒光觀察,從而在分離能力、靈敏度上都有了很大提高。DSA-FACE方法借助DNA測序儀,如ABI 3100,可以實現(xiàn)了96個樣品的同步分析,因而可以滿足糖工程和糖組學(xué)高流通量篩選的要求。
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