1 Optimization of Transrenal DNA Analysis:Detection of Fetal DNA in Maternal Urine.Eugene M.Shekhtman,Kalpana Anne,Hovsep S.Melkonyan,David J.Robbins,Steven L.Warsof,and Samuil R.Umansky∥Xenomics Inc.,1 Deer Park Dr.,SuiteF,Monmouth Junction,NJ 08852.ClinicalChemistry,2009,55(4):723-729
本文于2009年發(fā)表在《Clinical Chemistry》雜志上。分別用傳統(tǒng)的硅膠吸附法與新式Q-樹脂分離法分離尿液中的DNA,又設(shè)計(jì)了對(duì)應(yīng)不同長度的PCR靶位的引物分別進(jìn)行使用比較。結(jié)果表明DNA分離方式與PCR靶位大小影響胎兒的腎臟流通DNA(即流到了母體腎臟里,后會(huì)在尿液中檢出)的檢測。當(dāng)PCR靶位縮短,診斷敏感性變好。采用Q-樹脂分離的實(shí)驗(yàn)比采用硅膠分離的實(shí)驗(yàn)有更高的DNA檢出率,尤其在靶位較大時(shí)。Q-樹脂分離技術(shù)可以分離出較短的DNA片段,也能改善DNA檢測。用Q-樹脂分離技術(shù)以及一個(gè)“超短”DNA靶位,可以在懷男孩的孕婦尿液的82個(gè)樣本中的78個(gè)檢測到SRY。但是懷女孩的孕婦尿液的91個(gè)樣本中有11個(gè)也有SRY假陽性。陽性準(zhǔn)確率是87.6%,陰性準(zhǔn)確率是95.2%。
2 Preimplantation genetic screening as an alternative to prenatal testing for Down syndrome: preferences of women undergoing in vitro fertilization/intracytoplasmic sperm injection treatment.Twisk M,Haadsma ML,van der Veen FD,Repping S∥ Univ Amsterdam, Acad Med Ctr,Ctr Reprod Med, Dept Obstet&Gynaecol,NL-1105 AZ Amsterdam, Netherlands.Univ Med Ctr Groningen,Dept Obstet &Gynaecol,Groningen,Netherlands.Univ Amsterdam,Acad Med Ctr,Dept Clin Epidemiol & Biostat, NL-1105 AZ Amsterdam,Netherlands.
Twisk,M,Univ Amsterdam,Acad Med Ctr, Ctr Reprod Med, Dept Obstet &Gynaecol,Meibergdreef 9,Room H4-205,NL-1105 AZ Amsterdam,Netherlands.Fertil Steril.2007,88(4):804-10.
本文于2007年發(fā)表在《FertilSteril》雜志上。文章指出,盡管植入前遺傳篩查是為了增加進(jìn)行了IVF治療的婦女的妊娠率,它也可以用來作為產(chǎn)前篩查唐氏綜合征的一個(gè)方法。在兩所大學(xué)的生殖醫(yī)學(xué)中心選取244例輔助生殖婦女,進(jìn)行協(xié)商問卷,在說明植入前遺傳篩查后的不同妊娠機(jī)會(huì)以及唐氏綜合征風(fēng)險(xiǎn)的減少情況后,仍愿意進(jìn)行植入前遺傳篩查的概率。結(jié)果提示,大部分婦女愿意進(jìn)行唐氏綜合征的植入前遺傳篩查,即便診斷達(dá)不到100%的靈敏性。病人對(duì)植入前遺傳篩查的接受率更多地取決于植入前遺傳學(xué)診斷對(duì)受孕幾率的影響。
3 Aberrant DNA methylation associated with bipolar disorder identified from discordant monozygotic twins.Kuratomi G,Iwamoto K, Bundo M,Kusumi I∥Kuratomi,G RIKEN,Brain SciInst,2-1 Hirosawa,Wako,Saitama,Japan RIKEN,Brain SciInst,Wako,Saitama,Japan Univ Tokyo,F(xiàn)ac Med,Dept Neuro Psychiat,Tokyo,Japan.Mol Psychiatr.2008,13(4):429-441.
本文于2008年發(fā)表在《MolPsychiatr》雜志上。為了研究患雙相障礙不一致的單卵雙胎之間的DNA甲基化是否有差異,作者采用了全基因組掃描法和甲基化敏感性代表性差異分析法(MS-RDA)分析了雙胎的淋巴樣干細(xì)胞。MS-RDA從已知基因或EST的5’區(qū)分離出10個(gè)DNA片段,其中4個(gè)片段經(jīng)重亞硫酸鹽測序證實(shí),患雙相障礙的1胎和對(duì)照的另1胎的DNA甲基化存在差異。作者對(duì)這4個(gè)片段的甲基化狀態(tài)用焦磷酸測序法進(jìn)行了病例對(duì)照研究。在雙相障礙患者,有2個(gè)片段的上游區(qū)段精胺合酶(SMS)和肽酰脯氨酰異構(gòu)酶E樣(PPIEL)(CN265253)的基因顯示了異常的甲基化狀態(tài)。SMS基因在X染色體上,患雙相障礙的女性SMS基因的DNA甲基化水平明顯高于對(duì)照組的女性,但其m RNA的表達(dá)卻無差異。雙相Ⅱ障礙患者PPIEL基因的DNA甲基化水平明顯低于對(duì)照組,而其PPIEL的表達(dá)水平明顯高于對(duì)照組。由此可發(fā)現(xiàn),PPIEL基因的表達(dá)水平和DNA甲基化水平呈反比關(guān)系。作者認(rèn)為,PPIEL基因DNA甲基化狀態(tài)的改變可能對(duì)雙相障礙的病理生理學(xué)有一定的意義。
4 Amniotic fluid markers of fetal cardiac dysfunction in twin-to-twin transfusion syndrome.Van Mieghem T,Done E,Gucciardo L,Klaritsch P,Allegaert K,Van BreeR,Lewi L,Deprest J.∥ Department of Obstetrics and Gynecology,University Hospitals Leuven,Belgium.AmJObstetGynecol.2010,202(1):48.e1-e7
本文于2010年發(fā)表在《Am J Obstet Gynecol》雜志上。單絨毛膜雙羊膜囊雙胎妊娠發(fā)生雙胎輸血綜合征(TTTS)的概率為9%~15%,TTTS中受血兒由于血容量增加,導(dǎo)致尿量增加、膀胱充盈、羊水過多,嚴(yán)重時(shí)可因循環(huán)負(fù)荷過重出現(xiàn)水腫、胸腔積液、腹水、心包積液、心功能衰竭等。早期診斷是減少圍生期發(fā)病率和死亡率的重要手段之一。本文探究了TTTS羊水中的心臟肌鈣蛋白T(c Tn T)和鈉尿肽濃度水平與受血兒超聲心動(dòng)圖檢查和受血兒存活率的一致性關(guān)系。研究對(duì)象包括52例TTTS孕婦和16例對(duì)照組孕婦。34例TTTS受血兒接受超聲檢查,項(xiàng)目包括房室血流流型、心肌功能指數(shù)(MPI)和心前區(qū)靜脈多普勒檢查。產(chǎn)后48h內(nèi)評(píng)估受血兒存活率。結(jié)果顯示TTTS組羊水中c Tn T和β-鈉尿肽濃度水平升高,且與超聲心動(dòng)圖中影像學(xué)發(fā)現(xiàn)吻合。當(dāng)羊水中c Tn T和左室心肌功能指數(shù)均升高時(shí),產(chǎn)后受血兒存活率僅為72%,如果其中之一指標(biāo)正常,存活率可達(dá)100%(P=0.046)。作者認(rèn)為結(jié)合超聲心動(dòng)圖檢查和羊水c Tn T檢查可更有效地篩查出產(chǎn)后有死亡風(fēng)險(xiǎn)的胎兒。
5 A microarray-based approach for the identification of epigenetic biomarkers for the noninvasive diagnosis of fetal disease.Chu T,Burke B,Bunce K,Surti U,Hogge W A,Peters D G∥ Centre for Fetal Medicine, Magee-Womens Research Institute,Pittsburgh,PA,USAPrenat Diagn.2009,29:1020-1030.
該文章于2009年發(fā)表于《PrenatDiagn》雜志上。本研究結(jié)合1種215060探針的定制寡核苷酸芯片與綜合性文庫預(yù)備方法,以及新式的統(tǒng)計(jì)工具,研究比較了絨膜絨毛樣本(CVS)與對(duì)應(yīng)妊娠期的相配年齡的孕婦血細(xì)胞(MBC)樣本的DNA甲基化模式,借助定制寡核苷酸芯片可以給出人類13、18、21號(hào)染色體的高分辨率重合。在研究的所有3對(duì)染色體中,有組織特異的不同Cp G甲基化模式的MspⅠ/HpaⅡ位點(diǎn)(即CCGG序列)共有6311個(gè)。為了將得到有臨床意義的位點(diǎn)的可能性最大化,研究從得到的數(shù)據(jù)中又篩選出含有150bp的高單核苷酸多態(tài)性的MspⅠ/HpaⅡ位點(diǎn),這樣其等位基因頻率可以用于找出胎兒染色體數(shù)目異常。實(shí)驗(yàn)的芯片陣列設(shè)計(jì)以及使用軟件都可以完整地下載到。此妊娠早期胎盤中DNA甲基化模式的高分辨率分析在13、18、21號(hào)染色體上指出了用于診斷胎兒染色體數(shù)目異常的眾多標(biāo)記物。
6 Magnetic resonance imaging in the prenatal diagnosis of congenital diarrhea ColombaniM,F(xiàn)erry M,TogaC,LacrozeV,RubesovaE, Barth RA, Cassart M,Gorincour G.∥Service de Radiopediatrie,H?opitald’Enfants,la Timone 264,Rue Saint-pierre,Marseille 13385,F(xiàn)ranceUltrasoundObstetGynecol.2010,35:560-565
該文章于2010年發(fā)表于《Ultrasound Obstet Gynecol》雜志上。先天性腹瀉很罕見,胎兒出生后,只有在出現(xiàn)致死性的體液丟失和電解質(zhì)障礙的時(shí)候才會(huì)被診斷出來;因此對(duì)該病的產(chǎn)前診斷非常重要。作者通過超聲和磁共振成像的方法對(duì)該病進(jìn)行產(chǎn)前診斷。在對(duì)4例懷孕22~30周孕婦的超聲檢查中,發(fā)現(xiàn)有泛發(fā)中度的腸膨脹和羊水過多癥,表明有腸梗塞癥狀。對(duì)24~32周孕婦的磁共振研究表明:貫穿于小腸和結(jié)腸腔中的水分自始至終是可見的,提示腸膨脹是胃腸道源的;但是在結(jié)腸和直腸中本應(yīng)該可見的胎糞卻在磁共振中沒有信號(hào),這提示胎糞已經(jīng)完全溶解在腸道中的水分中,之前的先天性腹瀉癥診斷會(huì)由于腸梗塞而造成誤診,但磁共振信號(hào)可以提供精確的結(jié)果。由此作者提出對(duì)孕婦進(jìn)行磁共振的檢查可以對(duì)先天性腹瀉癥進(jìn)行產(chǎn)前診斷。
7 Cell-free fetal DNA in maternal blood:kinetics,source and structure.Bischoff FZ,Lewis DE,Simpson JL.∥ Departments of Obstetrics and Gynecology,Immunology and Human and Molecular Genetics, Baylor College of Medicine,Houston,TX 77030,USA.HumanReproductionUpdate.2005,11(1):59-67.
該文章于2010年發(fā)表于《Human ReproductionUpdate》雜志上。本文是關(guān)于母血游離DNA研究的一篇綜述。孕婦血漿中普遍存在游離DNA,其結(jié)構(gòu)和動(dòng)力學(xué)分析還在研究中。血漿游離DNA在分娩后迅速消失,但妊娠時(shí)血漿游離DNA的濃度通常恒定,這提示妊娠時(shí)有持續(xù)的游離DNA釋放入目前循環(huán)系統(tǒng)。為了更清楚的理解循環(huán)DNA的動(dòng)力學(xué)、存在于胎兒和母親血漿中游離DNA的生物學(xué)結(jié)構(gòu)以及血漿游離DNA變化的機(jī)制,需要對(duì)血漿游離DNA定量分析。目前認(rèn)為循環(huán)中的游離DNA是由胎兒和(或)胎盤細(xì)胞凋亡時(shí)產(chǎn)生。因此,游離DNA多存在于膜包被的小囊泡(凋亡小體)中。文章指出游離DNA可作為評(píng)估母親-胎兒健康情況的標(biāo)志物,目前研究最充分的是作為子癇前期,有研究指出母血漿游離DNA濃度在子癇前期出現(xiàn)癥狀之前就有明顯升高,且癥狀嚴(yán)重程度與濃度升高程度有一致性。此外,利用游離DNA進(jìn)行PCR,還可用于檢測單基因突變引起的疾病,如軟骨發(fā)育不全、營養(yǎng)不良性肌強(qiáng)直、先天性腎上腺增生、地中海貧血、囊性纖維化和亨廷頓病。