醫(yī)學(xué)開放存取資源的分布與獲取途徑

劉 暢

華中科技大學(xué)圖書館,武漢 430074

1 開放存取資源概述

開放存取(Open Access,簡稱OA),又被譯為公開獲取、公開訪問、開放使用等。根據(jù)目前國際上關(guān)于OA較權(quán)威的三大宣言《布達佩斯開放存取倡議》[1]、《巴斯達開放存取出版聲明》[2]以及《柏林宣言》[3]對于OA的定義,筆者認為開放存取資源(Open Access Resource,簡稱OA資源)是作者或出版社在擁有版權(quán)和授權(quán)的情況下,將其發(fā)表或出版的科研成果通過OA形式在互聯(lián)網(wǎng)上進行發(fā)布,并以O(shè)A形式提供給公眾的一種開放性學(xué)術(shù)資源。

作為一種在網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中發(fā)展起來的新型學(xué)術(shù)交流機制和全新的學(xué)術(shù)信息出版模式,OA資源的宗旨在于打通學(xué)術(shù)交流空間以及使用權(quán)限上的障礙,利用網(wǎng)絡(luò)條件促進學(xué)術(shù)資源的傳播和交流,實現(xiàn)科學(xué)成果的廣泛共享,提高科學(xué)研究的效率以及提升科學(xué)研究成果的公共利用率,受到了學(xué)術(shù)界、出版界和圖書情報界廣泛的認同和支持。

隨著OA運動的不斷發(fā)展,近年來,OA資源迅速增長,數(shù)量可觀。當(dāng)前OA資源主要有OA期刊和OA倉儲兩種形式[4],根據(jù)已有研究成果顯示,著名期刊指南《烏利希國際期刊指南》所收錄的OA期刊中,生物學(xué)、醫(yī)學(xué)的數(shù)量最多[5]。在全球最大的開放存取倉儲目錄OpenDOAR統(tǒng)計的OA倉儲學(xué)科分布上,醫(yī)學(xué)倉儲數(shù)量位居第一,已達122個[6]。在質(zhì)量控制方面,大部分OA期刊要求提交的論文必須經(jīng)由同行評審或者有編輯進行質(zhì)量控制,一些著名的OA出版社出版的OA期刊大多都被SCI索引,其影響因子還居于所屬學(xué)科前列[7]。因此,醫(yī)學(xué)類OA資源的數(shù)量多,質(zhì)量也相對有保障,筆者將常用的醫(yī)學(xué)OA資源的獲取歸納為OA資源出版機構(gòu)、學(xué)科庫以及OA期刊目錄三種途徑,供廣大醫(yī)學(xué)工作者參考。

2 OA資源出版機構(gòu)

OA運動的興起帶動了一批OA資源出版機構(gòu)的發(fā)展,在醫(yī)學(xué)方面以 PLoS、BioMed Central和 High-Wire Press最有影響力。這些出版社出版的OA期刊不僅在學(xué)術(shù)質(zhì)量上有保證,也利于用戶收集利用。

2.1 PLoS

公共科學(xué)圖書館(Public Library of Science,簡稱PLoS)(網(wǎng)址:http://www.plos.org/)是一個由科學(xué)家和醫(yī)生組成的非營利機構(gòu),致力于把世界上科學(xué)和醫(yī)學(xué)的文獻作為免費資源向公眾開放。

目前,已出版7種經(jīng)過同行評審的生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的 OA期刊,分別是:PLoS Biology、PLoS Medicine、PLoS Computational Biology、PLoS Genetics、PLoS Pathogens、PLoS ONE、PLoS Neglected Tropical Diseases,它們均被 SCI[8]和 MEDLINE[9]收錄。以上七種期刊可在PLoS網(wǎng)站上免費獲取全文。

其中PLoS Biology、PLoS Medicine是PLoS第一檔次的期刊,實行非常嚴格的同行評審制度,退稿率達到90%以上。PLoS Biology更是被定位為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的高端期刊,希望趕超Science、Nature和Cell三大傳統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域權(quán)威期刊,該刊自2003年出版以來影響因子一直居于生物學(xué)期刊榜首且遠遠高于本學(xué)科其他期刊,五年平均影響因子達14.798[10]。PLoS Medicine也表現(xiàn)不俗,五年平均影響因子為14.023,在其所屬學(xué)科 MEDICINE、GENERAL&INTERNAL 2009年期刊影響因子排名中位居第六[11]。PLoS ONE定位為發(fā)表任何在方法學(xué)上合理的文章,采用“輕度”同行評審(light-peerviewed)的評審機制,投稿相對容易。

2.2 BioMed Central

生物醫(yī)學(xué)中心(BioMed Central)(網(wǎng)址:http://www.biomedcentral.com/)是一家提供經(jīng)過同行評審的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)研究論文開放出版的獨立出版社。

BioMed Central對論文的質(zhì)量進行嚴格控制,對所有提交的研究論文進行嚴格的同行評議,并且要求評審人員在每篇論文后面署名,論文的初稿、評審人員的意見、修改稿等都發(fā)布在網(wǎng)站上。BioMed Central除了將其出版的所有論文全部及時存入PubMed Central學(xué)科庫和多個其他國際資源庫,如 Google、Google Scholar、OAIster、Scirus、Socdar和 Zetoc 中外,還允許作者立即將已發(fā)表文章的最終正式版存入任何適當(dāng)?shù)臄?shù)字資源庫,因此,用戶可以通過多種途徑獲取BioMed出版的OA期刊。此外,BioMed Central所有雜志的論文都采用Scopus和 Google Scholar進行跟蹤,以便作者們查看自己的研究被引用的次數(shù)[12]。

截至2010年9月9日,BioMed提供了206種經(jīng)過同行評審的生物醫(yī)學(xué)研究方面的期刊[13],其中有99種期刊被SCI索引[14],這說明該出版社出版的期刊中已有48%的期刊被 ISI索引,BioMed Central已成為出版高質(zhì)量的OA期刊的重要力量。但與PLoS相比,BioMed Central發(fā)行的OA期刊數(shù)量多,但影響力略低。

2.3 HighWire Press

HighWire Press(網(wǎng)址:http://highwire.stanford.edu)是全球最大的提供免費全文的學(xué)術(shù)文獻出版商之一,于1995年由美國斯坦福大學(xué)圖書館創(chuàng)立。最初僅出版著名的周刊“Journal of Biological Chemistry”,目前已收錄電子期刊1 236種,內(nèi)容覆蓋生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、物理學(xué)、社會科學(xué),其中以生物醫(yī)學(xué)方面的OA期刊論文居多。

HighWire Press的出版物中不乏一些影響力比較高的期刊,如 Journal of Biological Chemistry、Health Policy and Planning、Health Services Research and Policy、Journal of Infection Prevention、Journal of Public Health和Occupation and Environmental Medicine。在所收錄的期刊中,46種完全免費 ,如Journal of Clinical Investigation、CA:A Cancer Journal for Clinicians、Clinical Diabetes;282 種免費提供部分過刊全文、即在期刊出版一定時間(6～18個月)后免費開放,如 American Journal of Clinical Nutrition、American Journal ofPhysiology 和 Blood等[15]。目前共有1 987 039篇可免費獲得的全文[16]。

HighWire Press界面友好,檢索功能豐富,可以通過瀏覽主題詞來檢索對應(yīng)的期刊,同時也提供了一些個性化推送服務(wù)和研究工具,如引文管理軟件、桌面關(guān)鍵詞、地圖等[17]。因此,筆者認為該網(wǎng)站是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究者較好的信息參考來源。

3 醫(yī)學(xué)學(xué)科庫

學(xué)科庫,也被稱為“學(xué)科知識庫”、“學(xué)科開放存取倉儲”或“學(xué)科倉儲”,在國外通常被稱為“disciplinary archives”、“subject(discipline)based repositories”、“subjectspecific repositories”、“discipline-oriented repositories”和“domain specific data archives”等。有學(xué)者認為“學(xué)科庫”最能代表這個主題概念[18],筆者亦贊同這一觀點。

關(guān)于學(xué)科庫的準(zhǔn)確定義尚無明確標(biāo)準(zhǔn),筆者認為,從學(xué)科庫建設(shè)角度來說,它是以學(xué)科為主線,對某個學(xué)科領(lǐng)域的各種類型的資源進行捕獲、收集、整理、描述、組織、索引,實現(xiàn)這些對象的長期保存和廣泛傳播,以實現(xiàn)對這些對象資源的共享和利用為目的的知識庫。

用戶可訪問全球最大的開放存取倉儲目錄Open-DOAR(網(wǎng)址:http://www.opendoar.org/)通過學(xué)科瀏覽功能方便找到醫(yī)學(xué)倉儲庫。前文中已說明在目前的OA倉儲學(xué)科分布上,醫(yī)學(xué)倉儲數(shù)量最多,無法詳細列舉,在此僅介紹最著名的醫(yī)學(xué)學(xué)科庫公共醫(yī)學(xué)中心(PubMed Central,簡稱 PMC)。

PMC(網(wǎng) 址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/)創(chuàng)建于2000年2月,是一個數(shù)字化的全文數(shù)據(jù)庫,由美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(National Library of Medicine,簡稱NLM)下的生物技術(shù)信息國家中心[美國國家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information),簡稱 NCBI]開發(fā)、管理和維護。學(xué)科領(lǐng)域涉及生物醫(yī)學(xué)、行為科學(xué)和臨床研究等學(xué)科領(lǐng)域,提供完全免費的全文服務(wù)。PMC目前已收錄1 062種期刊,另外,還提供 MEDLINE、PREMEDLINE的文摘信息。出版社自愿加入PMC,但加入的期刊必須滿足編輯出版標(biāo)準(zhǔn),PMC論文的版權(quán)屬于期刊或作者所有[19]。

在資源開放程度上,由于 PMC中的論文大多有版權(quán)限制,因此全文開放存取的時間有所差異,分為可立即獲取(Immediate)、1個月后(After 1 month)、3個月后(After 3 months)、4個月后(After 4 months)、5個月后 (After 5 months)、6個月后 (After 6 months)、12個月后(After 12 months)和 36個月后(After 36 months)開放存取幾種形式,但83.6%的全文都是可以立即獲取的。PMC的資源獲取僅僅在獲取時間這一個方面有所限制。

在資源質(zhì)量控制方面,PMC收錄的期刊論文均經(jīng)過同行評議,質(zhì)量非常高,它收錄的很多期刊都被SCI所收錄。2009年3月11日,美國總統(tǒng)奧巴馬簽署了《2009年綜合撥款法案》(The 2009 Consolidated Appropriations Act),其中包括使美國國家衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health,NIH)的強制性實施的公共存取政策(Public Access Policy)永久生效[20]。該政策要求受NIH資助開展研究而產(chǎn)出的經(jīng)同行評審的最終版本論文全文在期刊發(fā)表后至多12個月內(nèi)均應(yīng)通過PMC提供免費在線利用與檢索。這一法案為PMC的資源數(shù)量和質(zhì)量提供了政策上的根本保障。

PMC的成立和發(fā)展是一批有志于推動學(xué)術(shù)論文自由出版的科學(xué)家共同努力的結(jié)果,成為目前生物醫(yī)學(xué)研究者一站式獲取資源的理想站點。

4 OA期刊目錄

除了專門的醫(yī)學(xué)OA資源出版機構(gòu)、醫(yī)學(xué)學(xué)科庫之外,綜合性的OA期刊目錄也是獲取醫(yī)學(xué)OA期刊的途徑之一。目前,不少機構(gòu)和研究人員對現(xiàn)有的OA期刊進行了收集整理,并提供站點和強大的檢索功能,有的甚至提供了期刊內(nèi)論文級別的檢索功能。筆者將其中最有影響的站點整理如下(表中數(shù)據(jù)均于2010年9月9日更新)。見表1。

以下5個站點可以說是目前世界上收錄范圍最廣、影響力最大的OA期刊目錄網(wǎng)站,具有發(fā)展迅速、資源數(shù)量龐大的特點,并都提供較為健全和方便的檢索和瀏覽功能以及實用而有特色的增值服務(wù),限于篇幅不再展開。

表1 國內(nèi)外著名的OA期刊目錄站點(依首字母字順排列)

除了以上這3種醫(yī)學(xué)OA資源直接的來源渠道之外,還可以通過一些專業(yè)OA資源的搜索引擎,如OAIster、ePrints-U K來查找OA資源,這些搜索引擎對遵守OAI-PMH協(xié)議的OA資源進行搜索,其中也能找出有關(guān)OA期刊的信息,并提供全文檢索服務(wù)。

5 結(jié)語

總之,OA期刊對降低科學(xué)文化傳播的成本,促進科學(xué)信息的廣泛傳播、加快學(xué)術(shù)信息的交流、保障科學(xué)信息的長期保存,達到文獻資源的免費共享,具有深遠的進步意義。隨著資源共享理念得到越來越多的政府機構(gòu)、學(xué)術(shù)團體以及出版商的認同,OA資源在質(zhì)量和數(shù)量上都有質(zhì)的飛躍,希望廣大醫(yī)學(xué)工作者能關(guān)注、利用OA資源并最終成為OA運動的參與者。

[1] What does BOAI mean by“open access”?[EB/OL].[2010-09-06].http://www.earlham.edu/～peters/fos/boaifaq.htm#Opena ccess.

[2] Definition of Open Access Publication[EB/OL].[2010-09-06].http://www.earlham.edu/～peters/fos/bethesda.htm#definition.

[3] Berlin Declaration on Open Access to Knowledge in the Sciences and Humanities[EB/OL].[2010-09-06].http://oa.mpg.de/openaccess-berlin/berlindeclaration.html.

[4] 李武.開放存取出版的兩種主要實現(xiàn)途徑[J].大學(xué)圖書館學(xué)報,2005,23(4):58-63.

[5] 陳傳夫,王云娣.開放存取期刊的分布及獲取策略研究[J].中國圖書館學(xué)報,2007,(6):82-87.

[6] OPENDOAR.[EB/OL].[2010-09-06].http://www.opendoar.org/find.php?format=charts.

[7] 劉暢.開放存取期刊的影響力分析[J].圖書情報工作,2008,(12):9-12.

[8] Web of knowledge[EB/OL].[2010-09-06].http://isiknowledge.com/wos.

[9] MEDLINE.[EB/OL].[2010-09-06].http://apps.isiknowledge.com/MEDLINE_GeneralSearch.

[10] JCR.[EB/OL].[2010-09-06].http://admin-apps.isiknowledge.com/JCR/JCR?RQ=RECORD&rank=1&journal=PLOS+BIOL.

[11] JCR.[EB/OL].[2010-09-06].http://admin-apps.isiknowledge.com/JCR/JCR?RQ=RECORD&rank=6&journal=PLOS+MED.

[12] BioMed Central Journals[EB/OL].[2010-9-8].http://www.biomedcentral.com/info/LibrAri es/indexing.

[13] BioMed Central[EB/OL].[2010-9-8].http://www.biomedcentral.com.

[14] Journal Indexing[EB/OL].[2010-9-8].http://www.biomedcentral.com/info/libraries/indexing.

[15] 路懷明.國外開放獲取醫(yī)學(xué)期刊全文網(wǎng)站的開發(fā)利用[J].醫(yī)學(xué)信息,2009,(8):9-12.

[16] Journal Indexing[EB/OL].[2010-9-8].http://highwire.stanford.edu/lists/freeart.dtl.

[17] Journal Indexing[EB/OL].[2010-9-8].http://highwire.stanford.edu/tools.dtl.

[18] 黃如花,馮晴.論學(xué)科庫的建設(shè)[J].圖書館論壇,2007,(6):131-136.

[19] PubMed Central[EB/OL].[2010-9-2].http://www.pubmedcentral.nih.gov/about/intro.html.

[20] Peter Suber.Open Access news.[EB/OL].[2010-4-12].www.earlham.edu/～peters/fos/fosblog.Html.