基于CiteSpace 的SCoT分子標(biāo)記技術(shù)研究熱點(diǎn)和前沿分析

龐敏霞 姚國(guó)祥 戚勇 謝雄杰

摘要? 采用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)可視化分析的方法分析SCoT分子標(biāo)記技術(shù)研究進(jìn)程與現(xiàn)狀，揭示研究熱點(diǎn)及演化過(guò)程。檢索中國(guó)知網(wǎng)（CNKI）和Web of Science （WOS）核心合集數(shù)據(jù)庫(kù)中2000—2022年相關(guān)文獻(xiàn)，通過(guò)Citespace 6.2.R2 軟件分析文獻(xiàn)作者、機(jī)構(gòu)、關(guān)鍵詞、引文情況。結(jié)果表明，CNKI檢索出297篇文獻(xiàn)，WOS檢索出319篇文獻(xiàn)，SCoT分子標(biāo)記技術(shù)研究發(fā)文量呈逐年增加趨勢(shì)。中文文獻(xiàn)大都呈散點(diǎn)狀，沒(méi)有形成復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)合作關(guān)系，發(fā)文量以廣西大學(xué)何新華教授居多，其次是陜西理工大學(xué)的張羽教授。英文文獻(xiàn)發(fā)文量以Islamic Azad University的Etminan Alireza教授居多，但沒(méi)有形成復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)合作關(guān)系；而來(lái)自四川農(nóng)業(yè)大學(xué)的張宇（Zhang Yu）教授與其他團(tuán)隊(duì)交流緊密，形成較大的研究團(tuán)隊(duì)和合作網(wǎng)絡(luò)。高頻關(guān)鍵詞有種質(zhì)資源、親緣關(guān)系、體系優(yōu)化、genetic diversity（遺傳多樣性）、scot （start codon targeted）（靶向起始密碼子）、polymorphism（多態(tài)性）等，近年頻率突現(xiàn)關(guān)鍵詞為指紋圖譜、獼猴桃、葛根、variability（可變性）、gene flow（基因流）、genotype（基因型）、traits（特性）等。英文分析高被引文章大都為遺傳多樣性分析文獻(xiàn)，引文關(guān)鍵詞為callus（愈傷組織）、spectral fingerprinting（光譜指紋）。綜上所述，中文和英文文獻(xiàn)對(duì)SCoT分子標(biāo)記技術(shù)研究的關(guān)鍵詞相似，前沿?zé)狳c(diǎn)稍有不同，作者機(jī)構(gòu)間應(yīng)繼續(xù)加強(qiáng)合作，促進(jìn)同專(zhuān)業(yè)的學(xué)術(shù)交流，共同推動(dòng)SCoT分子標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用發(fā)展。

關(guān)鍵詞? SCoT分子標(biāo)記技術(shù)；CiteSpace；研究熱點(diǎn)；前沿分析；可視化分析

中圖分類(lèi)號(hào)? S-058? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼? A? 文章編號(hào)? 0517-6611（2024）09-0212-08

doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2024.09.046

開(kāi)放科學(xué)（資源服務(wù)）標(biāo)識(shí)碼（OSID）：

Research Hotspots and Frontier Trends Analysis of SCoT Molecular Marker Technology Based on CiteSpace

PANG Min-xia1，2，YAO Guo-xiang1，QI Yong1 et al

（1.Zhejiang Yunzhitang Biotechnology Co.，Ltd.-Zhejiang Jianjiuhe Pharmaceutical Group Co.，Ltd.，Yuyao，Zhejiang 315402;2.College of Environmental & Resource Sciences of Zhejiang University，Hangzhou，Zhejiang 310012）

Abstract? We analyzed the progress and status of research on SCoT Molecular Marker Technology by the method of literature metrology visualization，and the research hotspots and evolution process was revealed.Relevant literatures from 2000 to 2022 were retrieved from CNKI and Web of Science.The authors，research institutions，keywords and citations of literatures in this field were analyzed by using CiteSpace 6.2.R2. The results showed that 297 literatures were retrieved from CNKI，and 319 literatures retrieved from WOS.The number of publications on SCoT molecular marker technology was increasing year by year.The Chinese literature was mostly in scattered form without forming a complex network of cooperative relationships.The number of publications was mostly led by Prof. He Xinhua from Guangxi University，followed by Prof. Zhang Yu from Shaanxi University of Technology.The number of publications in English literature was mostly led by Prof.Etminan Alireza from Islamic Azad University，but without forming a complex network of cooperative relationships.On the other hand，Prof. Zhang Yu from Sichuan Agricultural University had close communication with other teams，forming a larger research team and cooperation network.High-frequency keywords included germplasm resources，genetic relationship，system optimization，genetic diversity，SCoT，polymorphism，etc.In recent years，keywords with sudden change in frequency included fingerprint map，kiwifruit，kudzu root，variability，gene flow，genotype，and traits，etc.The highly cited articles in English were mostly genetic diversity analysis literature，with citation keywords such as callus and spectral fingerprinting.In summary，the keywords of Chinese and English literature on SCoT molecular marker technology research were similar，with slight differences in the frontier hotspots.Collaborations among institutions and authors should be strengthened to promote academic communication in the same field and jointly promote the application and development of SCoT molecular marker technology.

Key words? SCoT Molecular Marker Technology;CiteSpace;Research hotspots;Frontier trends;Visualization analysis

基金項(xiàng)目

國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目（2017YFC1702203）；寧波市自然科學(xué)基金項(xiàng)目（202003N4301）。

作者簡(jiǎn)介? 龐敏霞（1989—），女，浙江天臺(tái)人，副研究員，博士，從事中藥藥理與新產(chǎn)品開(kāi)發(fā)研究、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境研究。*通信作者，高級(jí)經(jīng)濟(jì)師，碩士，從事鐵皮石斛產(chǎn)業(yè)化研究。

收稿日期? 2023-06-02

隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展，DNA分子標(biāo)記的種類(lèi)逐漸豐富，除傳統(tǒng)的RAPD、AFLP、SSR、ISSR分子標(biāo)記外，近年來(lái)新發(fā)展的SCoT（Start Codon Targeted Polymorphism，目標(biāo)起始密碼子多態(tài)性標(biāo)記）分子標(biāo)記是一種依據(jù)植物基因中ATG翻譯起始位點(diǎn)側(cè)翼序列的保守性，設(shè)計(jì)單引物并對(duì)基因組進(jìn)行擴(kuò)增的新型目的基因靶向標(biāo)記［1-2］，被認(rèn)為是一種很有前途的靶向植物基因起始密碼子的標(biāo)記。目前SCoT分子標(biāo)記方面的中英文研究較多，但相關(guān)文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)可視化分析尚鮮見(jiàn)報(bào)道。

CiteSpace（Citation Space，引文空間）軟件是一款著眼于分析科學(xué)文獻(xiàn)中蘊(yùn)含的潛在知識(shí)，并在科學(xué)計(jì)量學(xué)、數(shù)據(jù)和信息可視化背景下逐漸發(fā)展起來(lái)的多元、分時(shí)、動(dòng)態(tài)的引文可視化分析軟件［3］。該軟件包含合作圖譜、共現(xiàn)圖譜、共引圖譜和突現(xiàn)詞探測(cè)等多種功能圖譜，可用于識(shí)別科學(xué)文獻(xiàn)趨勢(shì)，進(jìn)行研究熱點(diǎn)分析和預(yù)測(cè)未來(lái)研究趨勢(shì)，并且從能繪制精美、色彩鮮明、富有美感圖片等優(yōu)勢(shì)在文獻(xiàn)劑量學(xué)中被廣泛應(yīng)用［4-5］。鑒于此，筆者采用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)可視化分析的方法對(duì)近年來(lái)發(fā)表的SCoT分子標(biāo)記相關(guān)中英文文獻(xiàn)進(jìn)行分析，以更直觀(guān)的方式方便大家了解SCoT分子標(biāo)記的研究進(jìn)程與現(xiàn)狀，揭示研究熱點(diǎn)及演化過(guò)程，為學(xué)者更好地應(yīng)用SCoT分子標(biāo)記提供依據(jù)和思路。

1? 資料與方法

1.1? 數(shù)據(jù)來(lái)源

檢索中國(guó)知網(wǎng)（CNKI）和 Web of Science核心合集TM（以下簡(jiǎn)稱(chēng)WOS）數(shù)據(jù)庫(kù)，檢索時(shí)間設(shè)定為 2000年1月1日—2022年12月31日。CNKI 上采用專(zhuān)業(yè)檢索方式，以檢索式“SU%=（（SCoT） OR （SCoT分子標(biāo)記） ）AND（（種質(zhì)資源） OR （親緣關(guān)系） OR （遺傳多樣性））”為檢索主題，共檢索到文獻(xiàn) 659篇，對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行篩選，去除與主題無(wú)關(guān)的、會(huì)議等類(lèi)型后得到297篇；WOS 上采用高級(jí)檢索方式多次檢索對(duì)比，以檢索式“（（（（（TS=（SCoT）） OR TS=（SCoT Molecular Marker）） OR TS=（SCoT Molecular Marker Technology）OR TS=（start codon targeted）） ）AND （（（TS=（germplasm resource）） OR TS=（genetic relationship）） OR TS=（the genetic diversity）））NOT （TS=（scots pine））”為檢索主題，共檢索到文獻(xiàn)325篇，精選論文、綜述、English后319篇，最終納入文獻(xiàn)616篇。

1.2? 數(shù)據(jù)處理

將CNKI 上的檢索結(jié)果導(dǎo)出為 Refworks 格式，并用 CiteSpace 的“Data-CNKI”功能轉(zhuǎn)換為可分析格式；將WOS 上的檢索結(jié)果以純文本格式導(dǎo)出包括作者、標(biāo)題、摘要、關(guān)鍵詞、類(lèi)別和來(lái)源出版物等全記錄及引用的參考文獻(xiàn)在內(nèi)的數(shù)據(jù)信息。應(yīng)用Citespace 6.2.R2 軟件，繪制對(duì)應(yīng)的知識(shí)圖譜。

1.3? 統(tǒng)計(jì)分析

應(yīng)用 Microsoft Excel 2010 統(tǒng)計(jì)相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)信息，包括發(fā)表時(shí)間、作者、研究機(jī)構(gòu)、關(guān)鍵詞、文獻(xiàn)類(lèi)型等。用 CiteSpace 6.2.R2軟件進(jìn)行關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析，機(jī)構(gòu)、作者合作網(wǎng)絡(luò)可視化分析；通過(guò)突現(xiàn)檢測(cè)識(shí)別前沿領(lǐng)域，通過(guò)構(gòu)建文獻(xiàn)網(wǎng)絡(luò)定位關(guān)鍵文獻(xiàn)，通過(guò)時(shí)間線(xiàn)視圖描述關(guān)鍵詞的發(fā)展進(jìn)程和趨勢(shì)。參數(shù)設(shè)置：時(shí)間分區(qū)為2000年1月至2022年12月，時(shí)間切片為1年，節(jié)點(diǎn)類(lèi)型選擇“作者”和“機(jī)構(gòu)”，選擇標(biāo)準(zhǔn)設(shè)置為g-index（k=25）；節(jié)點(diǎn)類(lèi)型選擇“關(guān)鍵詞”，選擇標(biāo)準(zhǔn)設(shè)置為T(mén)opN=50（中文）、30（英文），修剪方式選擇Pathfinder中“Pruning sliced networks”和“Pruning the merged network”；控制面板中選擇Burstness，將γ設(shè)置為0.4（中文）、0.7（英文），其他默認(rèn)值不做修改。在CiteSpace生成的科學(xué)知識(shí)圖譜中，節(jié)點(diǎn)字體越大說(shuō)明該作者的發(fā)文量越多；具有較高頻數(shù)和中心性的關(guān)鍵詞代表著該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)；Q值（模塊值）>0.3表示結(jié)構(gòu)顯著；S值（輪廓值）>0.5表示聚類(lèi)合理，S值>0.7表示聚類(lèi)結(jié)果可信度高；Strength表示突現(xiàn)強(qiáng)度，強(qiáng)度越高越能反映該領(lǐng)域的研究前沿和發(fā)展趨勢(shì)［6］。

2? 結(jié)果與分析

2.1? 年度發(fā)文趨勢(shì)

對(duì)納入的616篇SCoT相關(guān)文獻(xiàn)按照發(fā)表年份進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，中文文獻(xiàn)從2009年開(kāi)始才有應(yīng)用SCoT技術(shù)進(jìn)行種質(zhì)資源、親緣關(guān)系或遺傳多樣性相關(guān)研究文獻(xiàn)的報(bào)道，在2013和2018年達(dá)到高峰，分別發(fā)表36、41篇相關(guān)文獻(xiàn)；在2019年以后呈下降趨勢(shì)（圖1）。英文文獻(xiàn)也是在2009年才開(kāi)始有文獻(xiàn)報(bào)道，發(fā)文量總體呈逐年上升趨勢(shì)，在2022年達(dá)到高峰，發(fā)表68篇相關(guān)文獻(xiàn)，這說(shuō)明利用SCoT分子標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用逐漸深入，研究水平也逐漸提高。

2.2? 作者合作網(wǎng)絡(luò)

對(duì)涉及867位中文文獻(xiàn)作者和1 276位英文文獻(xiàn)作者進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。作者合作網(wǎng)絡(luò)局部圖（圖2）是根據(jù)發(fā)文量和合作關(guān)系繪制的，節(jié)點(diǎn)大小代表了發(fā)文量的多少，不同節(jié)點(diǎn)的大小代表作者的發(fā)文頻次存在差異，圖中的節(jié)點(diǎn)越大，代表作者的發(fā)文頻次越高；顏色為時(shí)間年輪，顏色越鮮艷說(shuō)明近年發(fā)文越活躍；連線(xiàn)代表作者間合作關(guān)系，連線(xiàn)越粗表示作者合作次數(shù)越多。中文主要研究學(xué)者有何新華（7）、張羽（6）、陳虎（6）、嚴(yán)華兵（6），括號(hào)內(nèi)數(shù)值代表頻數(shù)；何新華團(tuán)隊(duì)自2009年就開(kāi)始應(yīng)用SCoT分析技術(shù)開(kāi)展研究，在中文文獻(xiàn)中是最早的，引用該技術(shù)后對(duì)龍眼 SCoT-PCR 反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化［7］；何教授在中英文期刊均發(fā)表高水平論文，利用SCoT和ISSR標(biāo)記研究芒果品種的遺傳多樣性［8］等。英文主要學(xué)者有Etminan Alireza（10）、Zhang Yu（6）、Sheidai Masoud（6）。其中，來(lái)自四川農(nóng)業(yè)大學(xué)的張宇（Zhang Yu）教授與其他團(tuán)隊(duì)交流緊密，形成較大的研究團(tuán)隊(duì)和合作網(wǎng)絡(luò)。作者頻數(shù)結(jié)果見(jiàn)表1。

2.3? 機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)

中文研究機(jī)構(gòu)主要有廣西大學(xué)（20）、廣西作物遺傳改良生物技術(shù)重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室（15）、廣西大學(xué)

農(nóng)學(xué)院（8）、廣州中醫(yī)藥大學(xué)（8）。從機(jī)構(gòu)屬性看，大部分研

究機(jī)構(gòu)屬于綜合類(lèi)系統(tǒng)；從時(shí)間年輪看，大部分機(jī)構(gòu)發(fā)文量

近10年增長(zhǎng)明顯，其中以廣西大學(xué)系統(tǒng)最為顯著，其次是廣西作物遺傳改良生物技術(shù)重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)。根據(jù)節(jié)點(diǎn)離散程度可知，研究機(jī)構(gòu)以高校為主，當(dāng)?shù)匮芯克?院與高校合作密切，不同系統(tǒng)獨(dú)立研究明顯（圖3a）。英文研究機(jī)構(gòu)主要有Islamic Azad University（38）、Egyptian Knowledge Bank （EKB）（38）、Indian Council of Agricultural Research （ICAR）（20）、Agricultural Research Center - Egypt（14）、Cairo University（13）、Shahid Beheshti University（11）（圖3b）。Islamic Azad University（伊斯蘭阿扎德大學(xué)）是世界上規(guī)模較大的大學(xué)之一，根據(jù)荷蘭萊頓（Leiden）大學(xué)發(fā)布的CWTS大學(xué)排名，伊斯蘭阿扎德大學(xué)在伊朗排名第1，Etminan Alireza教授就是來(lái)自這所大學(xué)。機(jī)構(gòu)頻數(shù)表結(jié)果見(jiàn)表2。

2.4? 關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)

文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞反映了一篇文章的核心內(nèi)容，對(duì)文章的關(guān)鍵詞進(jìn)行分析，往往被用來(lái)探尋和確定一個(gè)研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)問(wèn)題。將同義詞、近義詞、縮寫(xiě)詞、大小寫(xiě)字母等合并。中文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜網(wǎng)絡(luò)共有382個(gè)節(jié)點(diǎn)，517條邊，密度為0.007 1（圖4a）。其中，頻數(shù)位于前5的關(guān)鍵詞是“分子標(biāo)記”“種質(zhì)資源”“親緣關(guān)系”“體系優(yōu)化”和“正交設(shè)計(jì)”，主要涉及關(guān)于SCoT分子標(biāo)記方法的應(yīng)用及其研究對(duì)象；英文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜網(wǎng)絡(luò)共有460個(gè)節(jié)點(diǎn)，1 771條邊，密度為0.016 8（圖4b）。其中，頻數(shù)位于前5的關(guān)鍵詞是“genetic diversity”（遺傳多樣性）、“scot （start codon targeted）”（靶向起始密碼子）、“polymorphism”（多態(tài)性）、“markers”（標(biāo)記）和“diversity”（差異性），主要涉及關(guān)于SCoT分子標(biāo)記方法的應(yīng)用及與其他研究方法的比較。關(guān)鍵詞頻數(shù)結(jié)果見(jiàn)表3。

2.5? 關(guān)鍵詞聚類(lèi)分析

對(duì)關(guān)鍵詞進(jìn)行聚類(lèi)形成熱點(diǎn)研究領(lǐng)域，聚類(lèi)數(shù)字越小，所包含的關(guān)鍵詞越多，每個(gè)聚類(lèi)都是多個(gè)緊密相關(guān)的詞組成；聚類(lèi)內(nèi)部節(jié)點(diǎn)之間的連線(xiàn)表示共現(xiàn)關(guān)系，連線(xiàn)越多，表明該領(lǐng)域的關(guān)鍵詞之間共現(xiàn)程度越高；聚類(lèi)跨聚類(lèi)的連線(xiàn)較多，表明這些研究方向間的共被引程度高。中文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)共有382個(gè)，連線(xiàn)527條，Q值為0.880 5，S值為0.961 6，共形成#0親緣關(guān)系、#1指紋圖譜、#2聚類(lèi)分析、#3分子標(biāo)記、#4種質(zhì)資源、#5大豆等14個(gè)大聚類(lèi)群組（圖5a），#1與#3、#5與#8差異表達(dá)、#7表型性狀與#11優(yōu)化聚類(lèi)圖譜內(nèi)的連線(xiàn)大多數(shù)是在聚類(lèi)內(nèi)部的，但仍存在一些跨聚類(lèi)的連線(xiàn)，這些研究方向間的共被引程度較高。其中#4種質(zhì)資源、#6遺傳圖譜、#10遺傳結(jié)構(gòu)、#12龍眼4個(gè)聚類(lèi)幾乎沒(méi)有跨聚類(lèi)的共現(xiàn)，因此可以從種質(zhì)資源、遺傳圖譜、遺傳結(jié)構(gòu)方面作為研究的切入點(diǎn)。英文文獻(xiàn)關(guān)鍵詞網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)共有450個(gè)，連線(xiàn)1 741條，Q值為0.815 7，S值為0.930 5，共形成#0 molecular marker（分子標(biāo)記）、#1 elymus sibiricus（老芒麥）、#2 pcoa（principal coordinate analysis，主坐標(biāo)分析）、#3 cbdp（CAAT box-derived polymorphism，CAAT盒多態(tài)性標(biāo)記）、#4 molecular polymorphism（分子多態(tài)性）、#5 solanum nigrum（龍葵）等14個(gè)大聚類(lèi)群組（圖5b），#0與#1#2#4、#3與#8、#6與#10聚類(lèi)圖譜內(nèi)的連線(xiàn)大多數(shù)是在聚類(lèi)內(nèi)部的，但仍存在一些跨聚類(lèi)的連線(xiàn)，這些研究方向間的共被引程度較高。其中#5、#7遺傳保真度、#9非生物脅迫、#11甜菊糖苷、#16超氧化物歧化酶這5個(gè)聚類(lèi)幾乎沒(méi)有跨聚類(lèi)的共現(xiàn)，因此可以從遺傳保真度、非生物脅迫、超氧化物歧化酶方面作為研究的切入點(diǎn)。文獻(xiàn)關(guān)鍵詞聚類(lèi)信息結(jié)果見(jiàn)表4、5。

2.6? 關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析（前沿內(nèi)容）

突現(xiàn)詞分析可以篩選某個(gè)時(shí)間段頻數(shù)突然增加的關(guān)鍵詞，表明相關(guān)領(lǐng)域的新趨勢(shì)或者轉(zhuǎn)折點(diǎn)，用以指導(dǎo)未來(lái)研究方向。由圖6可知，中文文獻(xiàn)中突現(xiàn)強(qiáng)度排名前3的突現(xiàn)詞是“甘蔗”“聚類(lèi)分析”和“鐵皮石斛”，近幾年研究前沿突現(xiàn)詞是“指紋圖譜”“獼猴桃”和“葛根”。英文文獻(xiàn)中突現(xiàn)強(qiáng)度排名前3的突現(xiàn)詞是“variability”（可變性）、“cluster analysis”（聚類(lèi)分析）和“sequences”（排列順序），近幾年研究前沿突現(xiàn)詞是“variability”（可變性）、“gene flow”（基因流）、“genotype”（基因型）、“traits”（特性）。

2.7? 文獻(xiàn)共被引

文獻(xiàn)共被引指2篇（或多篇論文）同時(shí)被后來(lái)1篇或多篇論文所引證，則稱(chēng)這2篇文獻(xiàn)構(gòu)成共被引關(guān)系，引用越多，強(qiáng)度越大，越能說(shuō)明文獻(xiàn)在該領(lǐng)域的指導(dǎo)地位。共被引用頻次前12位的文獻(xiàn)主要來(lái)源MOL BIOL REP、BIOTECHNOL BIOTEC EQ等影響力中等的期刊，引用最高的作者為Etminan A，其次為Guo DL，中國(guó)作者在國(guó)際雜志上發(fā)表高影響力的文章占比也逐年增加，這些文獻(xiàn)最顯著的特征是SCoT分子標(biāo)記在遺傳多樣性分析中的應(yīng)用研究，并且出版時(shí)間新（最晚的是2016年），說(shuō)明SCoT分子標(biāo)記應(yīng)用不斷更新，技術(shù)不斷成熟。對(duì)共被引文獻(xiàn)進(jìn)行關(guān)鍵詞的時(shí)間線(xiàn)分析，得到12個(gè)聚類(lèi)。聚類(lèi)#0 polygonati rhizoma（何首烏）、#3 mangifera indica L.（芒果）、#5 durum wheat（硬粒小麥）、#7 orchardgrass（鴨茅）涉及SCoT分子標(biāo)記應(yīng)用的研究對(duì)象，其中#2 callus（愈傷組織）、#14 spectral fingerprinting（光譜指紋）為近幾年興起的引用熱點(diǎn)詞聚類(lèi)，預(yù)示著SCoT分子標(biāo)記在愈傷組織及光譜指紋等領(lǐng)域的研究是前沿?zé)狳c(diǎn)。

3? 討論

3.1? 發(fā)文特征

研究采用可視化分析方法，以2000—2022年CNKI和WOS數(shù)據(jù)庫(kù)中有關(guān)SCoT分子標(biāo)記技術(shù)的616篇核心文獻(xiàn)為研究對(duì)象，通過(guò)年度發(fā)文趨勢(shì)、作者合作及機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)、關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)、關(guān)鍵詞聚類(lèi)與突現(xiàn)分析及文獻(xiàn)共被引分析，繪制出SCoT分子標(biāo)記技術(shù)應(yīng)用的研究主題與網(wǎng)絡(luò)圖。

結(jié)果發(fā)現(xiàn)，2000—2022年間，從2009年開(kāi)始才有了關(guān)于SCoT分子標(biāo)記技術(shù)研究文獻(xiàn)的報(bào)道，這與其誕生的時(shí)期吻合，并且該技術(shù)一經(jīng)開(kāi)發(fā)便有學(xué)者開(kāi)展應(yīng)用研究，涉及種質(zhì)資源、親緣關(guān)系或遺傳多樣性相關(guān)研究。中文文獻(xiàn)在2013和2018年達(dá)到高峰，分別發(fā)表36、41篇相關(guān)文獻(xiàn)；在2019年以后呈下降趨勢(shì)；英文文獻(xiàn)發(fā)文量總體呈逐年上升趨勢(shì)，在2022年達(dá)到高峰，發(fā)表68篇相關(guān)文獻(xiàn)。這說(shuō)明利用SCoT分子標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用逐漸深入，研究水平也逐漸提高。作者合作網(wǎng)絡(luò)圖與機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)圖很好地反映了中英文文獻(xiàn)的特點(diǎn)，中文文獻(xiàn)大都呈散點(diǎn)狀，沒(méi)有形成復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)合作關(guān)系，發(fā)文量以廣西大學(xué)何新華教授居多，其次是陜西理工大學(xué)的

張羽教授。張羽教授主要從事植物分子標(biāo)記的構(gòu)建及應(yīng)用研究，在水稻、油菜、小麥、茶葉及魔芋等植物的分子遺傳研究方面有豐富的科研經(jīng)驗(yàn)，在《HEREDITAS》《中國(guó)水稻

科學(xué)》《遺傳》《西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版）》《湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版）》《植物遺傳資源學(xué)報(bào)》《分子植物育種》等學(xué)術(shù)期刊發(fā)表論文50余篇，并且與其他團(tuán)隊(duì)交流緊密，形成較大的研究團(tuán)隊(duì)和合作網(wǎng)絡(luò)。英文文獻(xiàn)發(fā)文量以Islamic Azad University的Etminan Alireza教授居多，但沒(méi)有形成復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)合作關(guān)系；而來(lái)自四川農(nóng)業(yè)大學(xué)的張宇（Zhang Yu）教授與其他團(tuán)隊(duì)交流緊密，形成較大的研究團(tuán)隊(duì)和合作網(wǎng)絡(luò)。

3.2? 演化進(jìn)程

中、英文文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞分析顯示SCoT分子標(biāo)記的不同演化進(jìn)程，中文文獻(xiàn)主要側(cè)重于種質(zhì)資源、親緣關(guān)系、體系優(yōu)化等方面的研究，并主要針對(duì)藥用植物、水果、豆類(lèi)進(jìn)行探索。英文文獻(xiàn)主要側(cè)重于遺傳多樣性、多態(tài)性、差異性等方面的研究，并主要針對(duì)谷物、作物進(jìn)行探索，少有針對(duì)藥用植物探索，大多為中國(guó)學(xué)者。關(guān)鍵詞聚類(lèi)分析顯示可以從種質(zhì)資源、遺傳圖譜、遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳保真度、非生物脅迫、超氧化物歧化酶等方面作為研究的切入點(diǎn)。關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析顯示，SCoT分子標(biāo)記的發(fā)展歷程，并進(jìn)一步預(yù)測(cè)研究的熱點(diǎn)方向：聚類(lèi)分析、指紋圖譜、可變性、基因流、基因型、特性等。文獻(xiàn)共被引顯示，SCoT分子標(biāo)記在愈傷組織及光譜指紋等領(lǐng)域的研究是前沿?zé)狳c(diǎn)。

現(xiàn)代研究表明，RAPD、ISSR、SSR和SCoT等基于DNA的分子標(biāo)記已被用于組織培養(yǎng)植物的遺傳保真度分析［9-11］。在過(guò)去的10年中，SCoT標(biāo)記被單獨(dú)或與其他傳統(tǒng)分子標(biāo)記，如RAPD和ISSR一起用于檢測(cè)許多植物物種的組培植物的體細(xì)胞無(wú)性系變異和評(píng)估遺傳同質(zhì)性。大多數(shù)涉及腋芽增殖的微繁殖方法在組織培養(yǎng)的植物中顯示出100%的單態(tài)性［12］，而通過(guò)愈傷組織再生的植物在體外繁殖的植物中表現(xiàn)出多態(tài)性［13］?？梢?jiàn)，通過(guò)愈傷組織或原生質(zhì)體等未分化細(xì)胞進(jìn)行植株再生對(duì)無(wú)性系繁殖是不可靠的，與體細(xì)胞無(wú)性系變異相比更敏感［9，14］。而在少數(shù)情況下，SCoT標(biāo)記也能夠檢測(cè)腋芽增殖直接再生植株的低水平多態(tài)性。這可能是由于培養(yǎng)細(xì)胞或組織中預(yù)先存在的遺傳變異或影響體外再生的不同因素引起的變異［15］。

3.3? 小結(jié)? 該研究基于文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)可視化分析方法，對(duì)近幾年來(lái)SCoT分子標(biāo)記研究的現(xiàn)狀、熱點(diǎn)和發(fā)展趨勢(shì)等進(jìn)行簡(jiǎn)要分析，研究提示SCoT分子標(biāo)記在愈傷組織及光譜指紋等領(lǐng)域的研究是前沿?zé)狳c(diǎn)；自2009年被發(fā)現(xiàn)以來(lái)，SCoT分子標(biāo)記因具有簡(jiǎn)單、高效、經(jīng)濟(jì)、不需要事先獲得基因組序列信息、能定位基因或特定性狀等優(yōu)點(diǎn)，在遺傳和基因組研究以及不同植物類(lèi)群的作物改良計(jì)劃中具有優(yōu)勢(shì)；并且其在基因組信息有限、研究較少的非模式植物中也具有很高的應(yīng)用價(jià)值。SCoT分子標(biāo)記已廣泛應(yīng)用于組織培養(yǎng)植物的遺傳多樣性分析、遺傳和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、種/品種鑒定、連鎖圖譜構(gòu)建、關(guān)聯(lián)圖譜分析、差異基因表達(dá)、遺傳保真度等遺傳和基因組學(xué)研究中。

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