陳佳勝,張?chǎng)卧拢瑒⒖『?,孟文琪,張?/p>
(1.徐州醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院,江蘇 徐州 221004;2.海軍軍醫(yī)大學(xué)海軍醫(yī)學(xué)系,上海 200433)
明確小分子藥物和(或)毒物直接作用靶點(diǎn),有助于更全面地認(rèn)識(shí)其藥理和(或)毒理作用機(jī)制。傳統(tǒng)的組學(xué)技術(shù)只能發(fā)現(xiàn)藥物和(或)毒物對(duì)機(jī)體mRNA、蛋白質(zhì)和代謝物表達(dá)的改變,很難從一系列復(fù)雜的指標(biāo)變化中找到關(guān)鍵的起始環(huán)節(jié)?;诨钚缘牡鞍踪|(zhì)表達(dá)譜(activity-based protein profiling,ABPP)和基于親和性的蛋白質(zhì)表達(dá)譜(affinitybased protein profiling,AfBPP)為研究小分子藥物和(或)毒物與蛋白質(zhì)相互作用提供了可靠的技術(shù)[1]。ABPP 和AfBPP 技術(shù)是利用小分子探針標(biāo)記與其直接作用的蛋白,并將結(jié)合蛋白分離、鑒定的化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)。該類技術(shù)使用的小分子探針由活性基團(tuán)、連接基團(tuán)和報(bào)告基團(tuán)3 部分組成?;钚曰鶊F(tuán)即藥物和(或)毒物的母體結(jié)構(gòu),一般具有特定的生物活性,可結(jié)合特定的分子靶標(biāo);連接基團(tuán)主要連接活性基團(tuán)與報(bào)告基團(tuán),通常需具有一定的長(zhǎng)度和親水性,對(duì)探針的生物活性至關(guān)重要;熒光染料和生物素是最常用的報(bào)告基團(tuán),用于化合物在細(xì)胞/組織中定位以及后續(xù)的蛋白分離、鑒定[2]。但熒光基團(tuán)和生物素的體積、質(zhì)量較大,對(duì)活性化合物本身的理化性質(zhì)和活性改變較大,可能引起靶點(diǎn)鑒定的誤差。為解決這一問(wèn)題,研究者們通過(guò)應(yīng)用點(diǎn)擊化學(xué)和生物正交化學(xué)技術(shù),用生物正交基團(tuán)如炔烴、疊氮化物、反環(huán)辛烯及環(huán)丙烯等替換原有的熒光染料或生物素,以減少報(bào)告基團(tuán)對(duì)活性化合物的影響[3](圖1A)。ABPP 和AfBPP 技術(shù)均屬于化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)范疇,均通過(guò)化學(xué)法向目標(biāo)化合物中引入報(bào)告基團(tuán),用于鑒定目標(biāo)化合物在組織或細(xì)胞中的直接作用蛋白。二者在應(yīng)用上的區(qū)別及優(yōu)缺點(diǎn)為:①在活性探針構(gòu)建方面,ABPP 只需引入炔基、疊氮等生物正交基團(tuán);AfBPP 在引入上述正交基團(tuán)的基礎(chǔ)上,還需引入二苯甲酮[4]、芳基疊氮[5]、雙吖丙啶、芳基四唑等光親和基團(tuán)[6](圖1B),其中雙吖丙啶基團(tuán)由于尺寸較小且光交聯(lián)效率高,是目前使用最為廣泛的光交聯(lián)劑[7]。②在蛋白鉤釣過(guò)程中,ABPP 與細(xì)胞或組織勻漿孵育后可直接進(jìn)行蛋白鉤釣;而AfBPP 孵育后需進(jìn)行紫外照射,與探針的光親和基團(tuán)附近的蛋白進(jìn)行共價(jià)連接,后再進(jìn)行蛋白鉤釣。③在鑒定結(jié)果方面,ABPP 只能釣取與目標(biāo)化合物共價(jià)結(jié)合的蛋白;而AfBPP 還可釣取與目標(biāo)化合物非共價(jià)作用(氫鍵、范德華力等)的靶標(biāo)蛋白,所獲得的靶標(biāo)蛋白更為全面,但同時(shí)也會(huì)存在非特異性背景蛋白的影響。
圖1 基于活性的蛋白質(zhì)表達(dá)譜(ABPP)和基于親和性的蛋白質(zhì)表達(dá)譜(AfBPP)分析技術(shù)中常用的正交化學(xué)基團(tuán)和光交聯(lián)劑.A:ABPP和AfBPP中常用的正交化學(xué)基團(tuán);B:AfBPP中常用的光親和基團(tuán),在紫外光照射下能夠與蛋白質(zhì)形成牢固的共價(jià)結(jié)合.
目前,已有研究通過(guò)ABPP/AfBPP 技術(shù)鑒定出小分子化合物二甲雙胍、青蒿素、膽固醇和顛茄素等的直接作用靶蛋白[8]。本綜述主要聚焦ABPP和AfBPP 技術(shù)在小分子藥物脫靶和毒物靶點(diǎn)鑒定方面的研究進(jìn)展,為探索小分子藥物脫靶、毒物的毒性機(jī)制提供新的研究思路。
2016 年,脂肪酸酰胺水解酶(fatty acid amide hydrolase,F(xiàn)AAH)抑制劑BIA 10-2474(圖2A,化合物1)的臨床Ⅰ期試驗(yàn)導(dǎo)致1 例患者死亡,4 例患者住院,所有試驗(yàn)患者均出現(xiàn)輕度至重度神經(jīng)毒性癥狀[9]。FAAH 是一種膜結(jié)合型絲氨酸水解酶,能降解內(nèi)源性大麻素和相關(guān)的酰胺化脂質(zhì)[10]。盡管其導(dǎo)致臨床神經(jīng)毒性的原因尚不清楚,但考慮到常用FAAH 抑制劑PF04457845(圖2A,2)較高的臨床安全性[11],研究人員推測(cè)BIA 10-2474 可能存在脫靶效應(yīng)。之前的ABPP 研究顯示,BIA 10-2474及其主要代謝物之一(圖2A,3)能抑制FAAH 所屬的絲氨酸水解酶類的多個(gè)成員的活性[12]。在BIA 10-2474 代謝產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)中引入乙炔基(圖2A,4),對(duì)共價(jià)靶點(diǎn)進(jìn)行全蛋白質(zhì)組分析,發(fā)現(xiàn)其可共價(jià)結(jié)合乙醛脫氫酶中保守的半胱氨酸殘基,該靶點(diǎn)對(duì)保護(hù)大腦免受氧化應(yīng)激損傷發(fā)揮重要作用[13]。
圖2 小分子活性化合物及用于研究其脫靶效應(yīng)的探針結(jié)構(gòu).A:脂肪酸酰胺水解酶(FAAH)抑制劑;B:克雷諾拉尼(CR)及探針CR-1,CR-2,CR-3;C:多卡霉素SA、多卡霉素開環(huán)藥物及探針;D:3-去氮腺嘌呤A(DzNep)及探針D2-1,NP-1,NP-2.
目前急性髓細(xì)胞白血?。╝cute myeloid leukemia,AML)治療方法有限。約30% AML 患者攜帶Fms 樣酪氨酸激酶3(fms related tyrosine kinase 3,F(xiàn)LT3)突變,F(xiàn)LT3可能是治療該疾病的靶點(diǎn)。已開發(fā)多種針對(duì)FLT3 的抑制劑,部分已進(jìn)入臨床試驗(yàn)后期[14],其中克雷諾拉尼(圖2B,5)可有效抑制具有FLT3 內(nèi)部串聯(lián)復(fù)制和FLT3突變的白血病細(xì)胞的生長(zhǎng)[15]。此外,該藥還是血小板衍生生長(zhǎng)因子受體的有效抑制劑,可抑制伊馬替尼耐藥的胃腸間質(zhì)瘤[16]?;谄湓谇捌谂R床試驗(yàn)中的良好作用,該藥已進(jìn)入治療AML的Ⅲ期臨床試驗(yàn),但其潛在不良反應(yīng)也受到關(guān)注。體外激酶篩選實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)了該藥的一系列新靶點(diǎn),包括可溶性N-乙基馬來(lái)酰亞胺附著蛋白受體和非受體型酪氨酸激酶等[17]。蛋白下拉(pull down)實(shí)驗(yàn)表明,克雷諾拉尼可與Rho關(guān)聯(lián)含卷曲螺旋蛋白激酶2 和周期蛋白依賴性激酶7 相互作用[18]。為進(jìn)一步探索克雷諾拉尼的潛在靶點(diǎn),研究人員合成了3 個(gè)基于其結(jié)構(gòu)的探針,其中1 個(gè)為光親和探針(圖2B,6);2 個(gè)為帶有熒光母核的探針,1 個(gè)探針的熒光團(tuán)為BODIPY(圖2B,7),另一個(gè)探針的熒光團(tuán)為acedan染料(圖2B,8)。應(yīng)用這些探針發(fā)現(xiàn)了該藥的其他靶點(diǎn),包括絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶、線粒體二羧酸載體蛋白和低氧誘導(dǎo)基因1等[14],為進(jìn)一步明確其潛在毒性靶點(diǎn)提供了重要線索。
多卡霉素家族顯示出高效的抗腫瘤活性,對(duì)幾種已知癌細(xì)胞系的IC50值約10 pmol·L-1,但其具有高骨髓毒性?;诙嗫顾豐A(圖2C,9),一方面通過(guò)結(jié)構(gòu)改造,合成新的多卡霉素開環(huán)藥物(圖2C,10)來(lái)降低毒性;另一方面通過(guò)將藥物連接到抗體上,利用抗體直接作用于腫瘤部位,避免對(duì)正常細(xì)胞造成損傷,這種抗體偶聯(lián)藥物目前處于Ⅰ期臨床試驗(yàn)[19]。先前的研究認(rèn)為多卡霉素作用靶標(biāo)僅為DNA[20]。Sieber 課題組運(yùn)用ABPP 技術(shù),合成了帶有炔基鏈的探針(圖2C,11),該探針可在體內(nèi)原位激活成環(huán)(圖2C,12),分離出一種60 ku蛋白質(zhì),經(jīng)液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)鑒定為乙醛脫氫酶(aldehyde dehydrogenase,ALDH)[21]。該酶可抑制癌細(xì)胞增殖,并引起抗癌藥在機(jī)體內(nèi)失活。對(duì)多卡霉素類化合物與DNA 和ALDH 的相互作用研究發(fā)現(xiàn),無(wú)吲哚基團(tuán)衍生物只能與ALDH 結(jié)合,不能與DNA相互作用[22]。
在真核生物中,組蛋白翻譯后修飾是調(diào)控染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)的重要過(guò)程。DzNep(圖2D,13)不僅是S-腺苷同型半胱氨酸水解酶的有效抑制劑,還是一種有效的組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑。Yao 課題組基于DzNep 合成了一種親和性探針,并將其命名為DZ-1(圖2D,14),其具備與DzNep 等同的抗凋亡活性[23]。他們還合成了2 個(gè)對(duì)照探針NP-1(圖2D,15)和NP-2(圖2D,16),以減少非特異性光交聯(lián)反應(yīng)導(dǎo)致的背景蛋白質(zhì),3 個(gè)探針都用于細(xì)胞中的原位蛋白質(zhì)組分析。結(jié)果顯示,除甲基轉(zhuǎn)移酶外,DzNep 還可與多種激酶、磷酸酶和ATP酶發(fā)生共價(jià)結(jié)合。此發(fā)現(xiàn)為將DzNep 用作表觀遺傳學(xué)研究和作為癌癥治療潛在候選藥物提供了新思路。
奧利司他(圖3A,17)是一種用于治療肥胖的上市藥物,其作用機(jī)制是通過(guò)抑制脂肪酶減少熱量攝入。研究發(fā)現(xiàn),其還可通過(guò)抑制脂肪酸合酶(fatty acid synthase,F(xiàn)AS)起抗腫瘤作用。FAS 是癌細(xì)胞而非正常細(xì)胞生長(zhǎng)的必需酶,其抗腫瘤作用機(jī)制雖已闡明,但潛在的脫靶或不良反應(yīng)尚未展開詳細(xì)研究。Yang 等[24]通過(guò)ABPP 技術(shù)對(duì)奧利司他的蛋白靶標(biāo)進(jìn)行了鉤釣。該藥物含有幾個(gè)長(zhǎng)的脂肪鏈,在脂肪鏈末端引入炔基,對(duì)該藥物的生物活性影響程度最小?;诖瞬孪?,他們合成了3 個(gè)奧利司他探針THL-R,THL-L 和THL-T(圖3A,18~20),并將其與活細(xì)胞共孵育,通過(guò)點(diǎn)擊化學(xué)連接羅丹明,然后進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳和膠內(nèi)熒光掃描,結(jié)果顯示有8 種蛋白質(zhì)與之結(jié)合。之后,使用疊氮化物標(biāo)記的生物素作為標(biāo)簽,通過(guò)瓊脂糖親和素微珠和質(zhì)譜分離并鑒定與其結(jié)合的蛋白質(zhì)。結(jié)果顯示除FAS、甘油醛-3-磷酸脫氫酶和β-微管蛋白水解酶外,其還與核糖體蛋白L7a,14 和S9 發(fā)生結(jié)合,上述3 種酶在前列腺癌、腦癌、肝癌、乳腺癌和結(jié)腸癌中高表達(dá)。
圖3 幾種上市藥物及用于研究其脫靶效應(yīng)的探針化學(xué)結(jié)構(gòu).A:奧利司他;B:達(dá)沙替尼;C:依魯替尼;D:伊立替康;E:萬(wàn)古霉素.
蛋白激酶通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞存活、生長(zhǎng)、侵襲、轉(zhuǎn)移和血管生成,在癌癥的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。達(dá)沙替尼(圖3B,21)是美國(guó)FDA 批準(zhǔn)的蛋白酪氨酸激酶抑制劑,已被用于治療伊馬替尼耐藥的慢性粒細(xì)胞白血病。包括達(dá)沙替尼在內(nèi)的大多數(shù)激酶抑制劑能抑制多個(gè)蛋白靶標(biāo),細(xì)胞特異性較低。通過(guò)將藥物中非必需羥乙基哌嗪替換為含炔基的末端光交聯(lián)劑,合成達(dá)沙替尼光親和探針(圖3B,22和23)[25],22為二氮雜吖嗪,23為二苯甲酮,保留了原始藥物大部分生物活性。將探針與癌細(xì)胞共孵育,并通過(guò)紫外照射固定,進(jìn)一步通過(guò)蛋白下拉、質(zhì)譜鑒定以及生物學(xué)分析表明,除Abl和Src家族酪氨酸激酶外,還鑒定出許多以前未發(fā)現(xiàn)的絲氨酸/蘇氨酸激酶,包括細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶18、真核起始因子2A和PKN2等,這些新發(fā)現(xiàn)的蛋白靶點(diǎn)與達(dá)沙替尼的相關(guān)性尚需進(jìn)一步驗(yàn)證。
布魯頓酪氨酸激酶(Bruton tyrosine kinase,BTK)在B 細(xì)胞發(fā)育、B 細(xì)胞受體信號(hào)通路和免疫球蛋白合成中發(fā)揮重要作用。依魯替尼(圖3C,24)可不可逆地抑制BTK 通路,對(duì)多種B 細(xì)胞惡性腫瘤具有顯著臨床治療效應(yīng),已于2013 年被美國(guó)FDA批準(zhǔn)上市[26]。其結(jié)構(gòu)中含有α,β-不飽和酰胺類親電體,可與目標(biāo)激酶BTK 結(jié)合口袋中的活性部位半胱氨酸共價(jià)結(jié)合。為研究依魯替尼的脫靶效應(yīng),Lanning 等[27]首先合成了基于依魯替尼的探針(圖3C,25)。該探針將炔基連接到分子的一個(gè)苯環(huán)上,不會(huì)影響邁克爾受體的固有反應(yīng)活性,通過(guò)親和富集、蛋白下拉以及生物學(xué)分析顯示,該探針除與BTK 和表皮生長(zhǎng)因子受體結(jié)合外,還可與B 淋巴細(xì)胞酪氨酸激酶和絲裂原活化蛋白激酶7等激酶發(fā)生作用。令人驚訝的是,還鑒定出了許多非激酶靶標(biāo),包括視黃醛脫氫酶和芳烴受體等未表征的蛋白質(zhì),其共同特征之一是具有保守的半胱氨酸活性位點(diǎn)。體外實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí),依魯替尼對(duì)這些靶點(diǎn)具有抑制作用。
腸道微生物群能代謝多種藥物,且腸道微生物對(duì)藥物的生物轉(zhuǎn)化能降低其藥效,甚至在某些情況下誘導(dǎo)疾病發(fā)生[28-29]。有研究表明,人類腸道微生物組成的個(gè)體差異會(huì)導(dǎo)致不同的藥物反應(yīng)[30]。臨床發(fā)現(xiàn),并非所有接受抗癌藥伊立替康治療的患者都發(fā)生胃腸道毒性,有研究者認(rèn)為,這種差異是腸道細(xì)菌β-葡萄糖苷酸酶(β-glucuronidase,GUS)類型和水平差異的結(jié)果[31]。GUS 可將非活性藥物葡萄糖醛酸結(jié)合物水解變成活性藥物,藥物毒性增加,從而破壞胃腸道上皮細(xì)胞。為此,開發(fā)了環(huán)酚醇基環(huán)氧化合物(圖3D,26)和氮丙啶抑制劑(圖3D,27),基于化合物27,合成了2 個(gè)探針,1 個(gè)探針上的報(bào)告基團(tuán)是生物素(圖3D,28),另一個(gè)探針上的報(bào)告基團(tuán)是五碳花菁(圖3D,29)[32],用以分析人類細(xì)胞中的GUS。人類糞便樣本中存在GUS,其可催化伊立替康產(chǎn)生毒性代謝物7-乙基-10-羥基喜樹堿。GUS 可作為生物標(biāo)志物和新藥靶點(diǎn),為開發(fā)新的藥物提供有價(jià)值的信息。
萬(wàn)古霉素是一種有效的糖肽類抗生素,特異性結(jié)合到新生肽聚糖的D-Ala-D-Ala 二肽末端。該分子與肽主干形成一系列氫鍵,阻止青霉素結(jié)合蛋白進(jìn)一步加工,從而抑制肽聚糖和細(xì)胞壁的生物合成。但其長(zhǎng)期使用會(huì)產(chǎn)生耐藥性,限制了臨床應(yīng)用。為了探索萬(wàn)古霉素在金葡菌和糞腸球菌菌株中新的靶點(diǎn),研究者開發(fā)了一系列基于萬(wàn)古霉素的小分子光親和探針(圖3E,30~32)[33]。運(yùn)用AfBPP技術(shù),經(jīng)蛋白質(zhì)組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)了2個(gè)新的萬(wàn)古霉素靶蛋白,一是萬(wàn)古霉素光親和探針與自溶素相互作用,進(jìn)而改變了金葡菌的細(xì)胞形態(tài);二是在糞腸桿菌中,萬(wàn)古霉素光親和探針特異性地與ATP 結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體結(jié)合,減少了細(xì)菌對(duì)糖類和多肽等必需營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收,這一發(fā)現(xiàn)有助于闡明萬(wàn)古霉素在細(xì)菌中發(fā)揮藥理作用的機(jī)制。
以神經(jīng)性毒劑為代表的有機(jī)磷類化合物對(duì)公共安全構(gòu)成極大的安全威脅。人體暴露于VX 等神經(jīng)毒劑會(huì)導(dǎo)致一系列與暴露水平相關(guān)的毒性反應(yīng),包括瞳孔縮小、分泌物過(guò)量、抽搐、癲癇發(fā)作甚至死亡,引起這些癥狀的主要機(jī)制是抑制乙酰膽堿酯酶,破壞膽堿能通路[34-35]。目前對(duì)于VX 通過(guò)其他途徑引起全身毒性效應(yīng)的研究仍然很少。在十一碳鏈的羥基上(圖4A,33)進(jìn)行酯化反應(yīng),生成酯類化合物(圖4A,34)。在此基礎(chǔ)上,在酰胺鍵上連接生物素(圖4A,35),進(jìn)一步發(fā)生重排反應(yīng),合成了一種帶生物素標(biāo)簽的VX 探針(圖4A,36),運(yùn)用ABPP 技術(shù)[36],分離、濃縮與探針共價(jià)結(jié)合的蛋白質(zhì),并對(duì)其進(jìn)行鑒定分析,發(fā)現(xiàn)與VX 直接作用的132 個(gè)蛋白,包括線粒體異檸檬酸脫氫酶2、異檸檬酸脫氫酶3、蘋果酸脫氫酶和琥珀酰輔酶A 連接酶等與能量代謝相關(guān)的蛋白,進(jìn)一步驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)VX 可抑制異檸檬酸脫氫酶2 的活性。該研究首次明確VX 可直接影響機(jī)體的能量代謝,為開發(fā)新的VX 診斷方法提供思路。
圖4 用于研究小分子有毒化合物靶點(diǎn)鑒定的探針結(jié)構(gòu).A:神經(jīng)毒劑VX探針的合成過(guò)程;B:殺螟硫磷及其體內(nèi)代謝物和氟磷酸鹽熒光探針的結(jié)構(gòu);C:丙烯醛修飾蛋白和點(diǎn)擊探針的反應(yīng)機(jī)制.
常規(guī)的有機(jī)磷殺蟲劑毒性較神經(jīng)性毒劑VX低[37],但接觸有機(jī)磷殺蟲劑可能會(huì)導(dǎo)致人類精子染色體非整倍體以及染色質(zhì)改變,引起精子損傷,導(dǎo)致精子密度降低。殺螟硫磷(fenitrothion,F(xiàn)NT,圖4B,37)是一種重要的有機(jī)磷殺蟲劑,F(xiàn)NT oxon(圖4B,38)是FNT 的體內(nèi)生物活性代謝物。為明確FNT 精子毒性的可能靶點(diǎn),利用帶生物素標(biāo)簽(圖4B,39)和熒光素標(biāo)簽(圖4B,40)的氟化磷熒光探針,通過(guò)ABPP 技術(shù)發(fā)現(xiàn)FAAH 是FNT 在精子中的主要靶點(diǎn),而FAAH 也在精子產(chǎn)生和精子運(yùn)動(dòng)能力獲得中起關(guān)鍵作用。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),小鼠ig 給予FNT 10 d后,睪丸或附睪尾的FAAH 活性顯著降低,進(jìn)一步驗(yàn)證了FAAH 可能是有機(jī)磷殺蟲劑引起精子毒性的潛在靶點(diǎn)[38]。
丙烯醛(圖4C,41)是一種普遍存在的有毒污染物,主要存在于香煙煙霧、烹調(diào)煙霧以及石油燃料燃燒產(chǎn)生的汽車尾氣中。它與多種疾病有關(guān),包括酒精性肝損傷、阿爾茨海默病、糖尿病和肺癌。當(dāng)細(xì)胞處于長(zhǎng)期過(guò)度飲酒引起的酒精應(yīng)激等氧化應(yīng)激時(shí),通過(guò)脂質(zhì)過(guò)氧化會(huì)產(chǎn)生不飽和脂肪酸聚合物。作為結(jié)構(gòu)最小且反應(yīng)性最強(qiáng)的α,β-不飽和親電試劑,丙烯醛可與細(xì)胞內(nèi)谷胱甘肽發(fā)生邁克爾加成,生成化合物42(圖4C),影響氧化還原穩(wěn)態(tài)。它還可與蛋白質(zhì)中的親核基團(tuán)發(fā)生反應(yīng),引起蛋白質(zhì)內(nèi)或蛋白質(zhì)間的交聯(lián),但具體作用蛋白尚不明確。研究人員開發(fā)了一種定量化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)方法,基于化合物42 和間乙炔苯胺(圖4C,43)反應(yīng)生成席夫堿(圖4C,44),再經(jīng)氰化硼氫化鈉還原生成點(diǎn)擊探針(圖4C,45),通過(guò)間乙炔苯胺來(lái)標(biāo)記丙烯醛結(jié)合的蛋白[39]。結(jié)果表明,丙烯醛靶向>2300 種蛋白質(zhì)、>500 個(gè)半胱氨酸位點(diǎn),為全面認(rèn)識(shí)丙烯醛的毒性機(jī)制提供了較全面的信息。
ABPP 和AfBPP 技術(shù)的迅速發(fā)展,可對(duì)小分子藥物和(或)毒物的蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行全面和定量分析,從而能更全面研究其作用方式,評(píng)估可能的不良反應(yīng)。該技術(shù)的應(yīng)用已將其領(lǐng)域從靶點(diǎn)識(shí)別擴(kuò)展到治療靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和基于靶點(diǎn)的藥物篩選。盡管ABPP 和AfBPP 技術(shù)已取得巨大進(jìn)展,但提升質(zhì)譜鑒定的準(zhǔn)確性是兩者面臨的一個(gè)重要問(wèn)題。近年來(lái),氨基酸穩(wěn)定同位素標(biāo)記、相對(duì)和絕對(duì)定量同位素標(biāo)記、串聯(lián)質(zhì)譜標(biāo)記等定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法已較好地解決了這一問(wèn)題。ABPP 和AfBPP 技術(shù)面臨的另外一個(gè)問(wèn)題是非特異性標(biāo)記和低效交聯(lián)[40-41]。相信隨著相關(guān)技術(shù)的不斷成熟,如生物正交化學(xué)和點(diǎn)擊化學(xué)的發(fā)展及學(xué)科交叉的日益深入,ABPP 和AfBPP 技術(shù)將在小分子化合物的藥理毒理機(jī)制研究中發(fā)揮更重要作用。