趙孟斌,顧華蓉,穆洪濤,高向陽*
(1.華南農(nóng)業(yè)大學食品學院,廣東省功能食品活性物重點實驗室,嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學與技術(shù)廣東省實驗室,廣東廣州 510642)(2.廣東第二師范學院生物與食品工程學院,廣東廣州 510303)
鮮味,是繼酸、甜、苦、咸味后,第五個被確定的基本味覺,具有增加食物口感豐富性和令人舒服愉快的特點[1]。引起鮮味的物質(zhì)根據(jù)化學成分可分為氨基酸類、核苷酸類、有機酸類、有機堿類和鮮味肽[2],其中鮮味肽是一種分子量約為150~3 000 u的小分子肽,具有增鮮、增香及增強食品整體味感作用,并且有良好的加工特性、熱穩(wěn)定性和營養(yǎng)價值。鮮味肽不僅具有鮮味,而且可以掩蓋和減弱苦味以改善食品風味[3],與其他物質(zhì)協(xié)同增鮮還可減少食鹽和谷氨酸鈉的攝入[4]。1978年,Yamasaki等[5]首次從木瓜蛋白酶水解的牛肉水解液中分離純化得到氨基酸序列為Lys-Gly-Asp-Glu-Glu-Ser-Leu-Ala的鮮味肽,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)鮮味肽在魚類[6]、雞湯[7]、火腿[8]和菌類[9]等許多食品中廣泛存在,是食品中重要的呈味物質(zhì)?,F(xiàn)階段對鮮味肽的研究主要集中在分離鑒定等方面,具體的呈鮮機理與構(gòu)效關(guān)系尚不明確。鮮味在人體的感知主要依靠異源二聚體味覺受體第一家族亞型1/3(Taste Receptor Type 1/3,T1R1/T1R3)[10]、味型代謝性谷氨酸受體4(Metabotropic Glutamate Receptor 4,mGluR4)[11]、胞外鈣敏感受體(Calcium-sensing Receptor,CaSR)[12]和G蛋白偶聯(lián)受體C家族6組A亞型(G Protein-coupled Receptor Family C Group 6 Member A Receptor,GPRC6A)[13],均屬于G蛋白偶聯(lián)受體家族的C亞族,可廣泛感知多種鮮味物質(zhì),將鮮味信號傳遞至大腦[14],但人類鮮味受體的晶體結(jié)果尚未被完全解析[15],因此有必要通過蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測來獲得其三維結(jié)構(gòu),利用計算機輔助受體-配體結(jié)合的分子對接技術(shù),從小分子(配體)及蛋白大分子(受體)各自的三維結(jié)構(gòu)入手,檢驗兩者結(jié)合能力,預(yù)測其結(jié)合模式及關(guān)鍵結(jié)合位點,分析鮮味肽與受體間的相互作用,有助于闡明鮮味肽呈鮮機制。
本研究以魚露中鑒定得到的脯氨酸二肽和谷氨酸二肽[16]為研究對象,通過分子對接技術(shù)表征二肽與T1R1、T1R3及CaSR鮮味受體的結(jié)合模式,尋找二肽與鮮味受體結(jié)合的關(guān)鍵位點,同時結(jié)合二肽的呈鮮強度與閾值來探究其呈鮮機理與構(gòu)效關(guān)系。
谷氨酸鈉、蔗糖、檸檬酸、氯化鈉均為食品級,購自廣州利成實業(yè)有限公司??鼘帲荷V純,購自廣州叢源儀器有限公司。
根據(jù)前期實驗分離鑒定得到的魚露寡肽序列[17],從中選取12個二肽:絲氨酸-脯氨酸(Serine-proline,Ser-Pro)、脯氨酸-絲氨酸(Proline-serine,Pro-Ser)、丙氨酸-脯氨酸(Alanine-proline,Ala-Pro)、脯氨酸-丙氨酸(Proline-alanine,Pro-Ala)、纈氨酸-脯氨酸(Valine-proline,Val-Pro)、脯氨酸-纈氨酸(Proline-valine,Pro-Val)、γ-谷氨酸-蛋氨酸(γ-Glutamic Acid-methionine,γ-Glu-Met)、蛋氨酸-谷氨酸(Methionine-glutamic Acid,Met-Glu)、γ-谷氨酸-甘氨酸(γ-Glutamic Acid-glycine,γ-Glu-Gly)、甘氨酸-谷氨酸(Glycine-glutamic Acid,Gly-Glu)、γ-谷氨酸-亮氨酸(γ-Glutamic Acid-leucine,γ-Glu-Leu)和亮氨酸-谷氨酸(Leucine-glutamic Acid,Leu-Glu),采用固相合成法合成以上二肽,并進行脫鹽處理,使純度≥98%,委托生工生物工程(上海)股份有限公司完成。
鮮味受體蛋白均來自Uniprot蛋白數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org):T1R1、T1R3和CaSR的檢索號分別為Q7RTX1、Q7RTX0、P41180。模板蛋白來自PDB數(shù)據(jù)庫(https://www.rcsb.org)。
序列對比、同源建模及模型評估涉及的平臺:SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasy.org)、NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)、SAVES v6.0(https://saves.mbi.ucla.edu/)。
1.2.1 感官評價
感官評價小組由20名味覺正常人員組成(10女10男,20~25歲),并依據(jù)GB/T 16291.1-2012[18]接受了感官培訓(xùn)以辨別五種基本味覺(酸、甜、苦、咸、鮮)。參考叢艷君等[19]分別以檸檬酸(0.8 mg/mL)、蔗糖(10 mg/mL)、奎寧(0.8 mg/mL)、氯化鈉(3.5 mg/mL)和谷氨酸鈉(3.5 mg/mL)作為酸、甜、苦、咸、鮮的評價標準,配制2 mg/mL合成肽供評價小組進行感官描述。采用三角試驗法[20]確定二肽的呈鮮閾值,樣品用超純水溶解,將起始質(zhì)量濃度為2 mg/mL的合成肽溶液逐級稀釋,至評價小組無法品嘗出溶液中的鮮味,則該合成肽的呈鮮閾值即為倒數(shù)第2個合成肽溶液的質(zhì)量濃度值。采用各感官評價員評定結(jié)果的平均值,且每個評定員之間的誤差應(yīng)不超過2個稀釋水平。感官評價在恒定溫度(24±1)℃下進行。
1.2.2 鮮味受體同源建模與能量優(yōu)化
獲取目標蛋白序列后,于NCBI網(wǎng)站進行protein blast比對,以序列覆蓋率較高、E值小于10-5以及序列相似性大于30%為標準[21],選取打分較高的蛋白作為備選模板。利用SYBYL-X 2.0將模板與目標蛋白進行序列比對,選取序列一致性最高且RMSD值最小的模板,利用SWISS-MODEL進行建模。利用SYBYL-X 2.0軟件中的Powell法對模型進行能量最小化(Minimize)處理。
1.2.3 模型評估
利用拉氏圖與Verify 3D對優(yōu)化后的模型進行結(jié)構(gòu)評估。
1.2.4 Pro、Glu二肽與鮮味受體的分子對接
1.2.4.1 小分子配體的準備
通過SYBYL-X 2.0中的sketch模塊與蛋白質(zhì)自動生成模塊建立目標二肽結(jié)構(gòu),采用tripos力場對二肽分子進行能量最小化處理。
1.2.4.2 分子對接
采用Docking suite模塊準備模塊蛋白與二肽分子。對模塊蛋白進行末端殘基修復(fù)與加氫處理后,Automatic模式生成活性口袋,Surflex for searching模式對二肽分子進行準備處理,最后利用Surflex-Dock Screen模式進行分子對接,計算受體與配體的對接分值并預(yù)測結(jié)合位點,綜合考慮打分函數(shù)的一致性,選擇對接總評分最高的構(gòu)象以進行后續(xù)分析研究。
1.2.4.3 配體-受體相互作用研究
利用SYBYL-X 2.0中的Merge功能將配體的最優(yōu)對接構(gòu)象與受體進行合并,得到配體-受體復(fù)合物,再利用Proteins Plus中的PoseView 2D interaction diagrams模塊做出配體與受體的相互作用模式圖。利用SYBYL-X 2.0中的MOLCAD模塊創(chuàng)建分子表面。
1.2.5 數(shù)據(jù)分析
分子對接所用軟件為SYBYL-X 2.0。二肽與鮮味受體結(jié)合的2D模式圖利用在線服務(wù)器Proteins Plus(https:proteins.plus/)得出。
對合成Pro、Glu二肽進行感官評價,結(jié)果見表1。除Pro-Ser、Val-Pro和Leu-Glu不呈鮮,其余二肽的呈鮮閾值均低于谷氨酸鈉閾值(0.3 mg/mL)。其中γ-Glu-Met和Gly-Glu的呈鮮閾值最低,為0.07 mg/mL,說明其鮮味強度最高,Pro-Ala的呈鮮閾值最高,為0.21 mg/mL,說明其鮮味強度最低。呈鮮閾值較低的肽如γ-Glu-Met、Gly-Glu、Ser-Pro、Ala-Pro、Pro-Ala和Pro-Val等具有較強的鮮味。所有二肽均未表現(xiàn)出苦味,表明含有疏水性氨基酸的二肽不一定呈現(xiàn)苦味,可能是由于部分疏水性基團對呈鮮起輔助作用[22]。呈鮮味的二肽都伴隨著一定的酸味和甜味,Zhang等[23]也發(fā)現(xiàn)鮮味肽除了呈鮮味,也呈酸味、苦味和甜味,證明鮮味肽并不是呈單一鮮味,而是具有以鮮味為主的多種呈味效果,對鮮味肽呈鮮起重要作用。具有相同氨基酸但排列順序不同的二肽呈鮮閾值有差異,當Pro位于肽鏈C端時,二肽呈鮮閾值相對較低,表明鮮味肽的鮮味與其氨基酸排列順序及肽鏈的構(gòu)效有關(guān)。γ-Glu-Met和Gly-Glu均比其相反氨基酸序列二肽的呈鮮閾值低,可能是由于相反序列導(dǎo)致二肽空間構(gòu)效差異,改變肽與受體的相互作用,影響肽與受體的結(jié)合位置,使其產(chǎn)生不同的呈鮮效果。
表1 二肽的感官評價結(jié)果Table 1 The sensory evaluation of dipeptides
T1R1、T1R3及CaSR受體同源模板結(jié)果如表2~4所示,T1R1和T1R3模板序列覆蓋率均≥54.00%,E值均接近于0。E值越低則打分結(jié)果越可靠[21]。序列相似性大于30%表明模型可靠[21],CaSR模板序列一致性≥64.00%,同源性較高。RMSD表示模板蛋白與目標蛋白的結(jié)構(gòu)一致性,該值越小則蛋白的結(jié)構(gòu)一致性越強。因此T1R1、T1R3建模模板為5x2m,CaSR建模模板為5fbh,其他學者也采用了5x2m[21]和5fbh[24]作為建模模板。
表2 T1R1同源模板序列比對結(jié)果Table 2 Sequence alignment results of T1R1 homologous template
表3 T1R3同源模板序列比對結(jié)果Table 3 Sequence alignment results of T1R3 homologous template
表4 CaSR同源模板序列比對結(jié)果Table 4 Sequence alignment results of CaSR homologous template
表5 二肽與T1R1、T1R3及CaSR受體的分子對接評分Table 5 Molecular docking score of dipeptides with T1R1,T1R3 and CaSR receptors
T1R1、T1R3和CaSR受體的模型圖、拉氏圖與Verify 3D打分結(jié)果如圖1、圖2所示,圖1中a、c為受體蛋白模型圖,b、d為拉氏圖,e、f和圖2c為Verify 3D評分圖。
圖1 T1R1(a、b、e),T1R3(c、d、f)模型結(jié)構(gòu)與模型評估Fig.1 T1R1 (a, b, e), T1R3 (c, d, f) model structure and model evaluation
圖2 CaSR模型結(jié)構(gòu)與模型評估Fig.2 CaSR model structure and model evaluation
拉氏圖中的圓點代表蛋白的氨基酸殘基,綠色越深則氨基酸殘基構(gòu)象越合理,白色區(qū)域為不可接受區(qū)[25]。結(jié)果顯示,T1R1模型中99.13%的氨基酸處于合理區(qū),其中94.14%處于最適區(qū),4.99%處于可接受區(qū);T1R3模型中98.07%的氨基酸處于合理區(qū),其中92.70%處于最適區(qū),5.37%處于可接受區(qū);CaSR模型中99.12%的氨基酸處于合理區(qū),其中95.71%處于最適區(qū),3.41%處于可接受區(qū)。當不低于90%的ψ,φ二面角分布在可接受區(qū)則表明模型合理[26],因此3個模型均合理。Verify 3D打分顯示模型均具有超過90%的氨基酸殘基3D/1D值大于0.2,表明模型質(zhì)量合格。三個受體蛋白的配體結(jié)合口袋如受體模型圖中綠色區(qū)域所示,均位于受體中心的空腔區(qū)域,位置與前人研究結(jié)果基本一致[24,27,28]。
2.4.1 對接評分
選擇感官評價結(jié)果中呈鮮的4個Pro二肽和5個Glu二肽及鮮味基準物谷氨酸鈉(MSG)與T1R1、T1R3及CaSR受體進行分子對接評分,考慮了分子極性、疏水性、焓和溶劑化等因素,對配體與受體的結(jié)合親和程度,一般認為評分≥7表示受體與配體結(jié)合能力強,小于4則結(jié)合能力弱[29]。
Pro二肽與T1R1對接評分均高于與T1R3和CaSR的評分,與T1R1結(jié)合較為緊密,顧華蓉等[30]在Pro二肽呈鮮特性中也發(fā)現(xiàn)T1R1可能是Pro二肽呈鮮的重要受體。
Glu二肽與受體的對接評分均大于6.90,同時也均大于MSG的相應(yīng)對接評分,大多數(shù)超過8分,肽與受體的親和程度較高。除Gly-Glu和γ-Glu-Leu,其余Glu二肽與T1R1和CaSR的對接評分高于T1R3,提示Glu二肽主要與T1R1和CaSR結(jié)合呈鮮,可能與T1R3受體特殊的結(jié)合構(gòu)象有關(guān)[31]。與T1R1和CaSR的對接評分顯示,N-γ-Glu二肽的評分均高于相同氨基酸組成的C-Glu二肽,與T1R1和CaSR結(jié)合更為緊密,進一步說明鮮味肽呈鮮效果與氨基酸排列順序有關(guān),Masahiro等[32]發(fā)現(xiàn)二肽氨基酸順序排列相反時,Lys-Glu不具有鮮味,Glu-Lys具有鮮味,與本研究結(jié)果類似。
2.4.2 二肽與鮮味受體結(jié)合的關(guān)鍵氨基酸殘基分析
表6為二肽與鮮味受體的對接能量。Glu二肽的對接能量整體大于Pro二肽,對接能量越低,肽與受體結(jié)合的親和力越強,說明Glu二肽更易與受體結(jié)合。其中γ-Glu-Met和Gly-Glu進入T1R1、T1R3和CaSR結(jié)合腔所需能量最低,結(jié)合的親和力最強,可能是由于能更嵌入到受體的結(jié)合口袋部位,最終導(dǎo)致γ-Glu-Met和Gly-Glu的呈鮮閾值低。
表6 二肽與鮮味受體的對接能量(kcal/mol)Table 6 The docking energies of dipeptides with umami receptors
表7中結(jié)合位點Asp147和Arg277出現(xiàn)頻率和成鍵數(shù)量均較多,可能是二肽與T1R1的關(guān)鍵結(jié)合位點。Thr149和Ser172出現(xiàn)4次,與T1R1形成氫鍵的均為Glu二肽,同時Thr149是MSG與T1R1的結(jié)合位點,Thr149和Ser172可能是Glu二肽與T1R1結(jié)合的關(guān)鍵位點,與其他學者的研究結(jié)果一致[26,33],T1R1是Glu二肽呈鮮的重要受體。Liu等[28]和Zhang等[33]鑒定出T1R1的關(guān)鍵氨基酸殘基有D147、S148、T149、S172、Y220、R277、Q278、A302,S385,除Ala302外,其余殘基也在本研究中Pro、Glu二肽與T1R1的對接位點,進一步證明其具有呈鮮特性。
表7 二肽與T1R1受體的結(jié)合位點Table 7 Binding sites of dipeptides to T1R1 receptor
表8中Glu45、Ser147、Val277和His278出現(xiàn)頻率和成鍵數(shù)量較多,Ser147同時是MSG與T1R3的結(jié)合位點,這些殘基可能是二肽與T1R3的關(guān)鍵結(jié)合位點。與Ser147結(jié)合的均為N-γ-Glu二肽,而谷氨酸位于C端的二肽,除Gly-Glu外其余均不能與Ser147結(jié)合,Ser147可能是N-γ-Glu二肽與T1R3的關(guān)鍵結(jié)合位點。Pro、Glu二肽均能在His145、Ser147、Ser170和Gly168結(jié)合T1R3,Cascales等[34]發(fā)現(xiàn)這些位點是T1R3上的關(guān)鍵氨基酸殘基,進一步表明二肽可通過T1R3受體呈鮮。
表8 二肽與T1R3受體的結(jié)合位點Table 8 Binding sites of dipeptides to T1R3 receptor
表9顯示Leu173、Asn176、Gln179、Arg220和Ser244是Pro、Glu二肽與CaSR結(jié)合較多的位點,其中在Asn176、Gln179殘基處對接的肽有5個,成鍵數(shù)也較多,這些位點可能是二肽與CaSR的關(guān)鍵結(jié)合位點。Pro二肽中的Pro-Ala與Ser-Pro分別在Asp275處與受體形成3或4個氫鍵,主要原因是其引起鮮味受體細胞產(chǎn)生強烈信號[30],產(chǎn)生較多的氫鍵結(jié)合;除Gln179和Asp275位點外,其余4個位點主要結(jié)合Glu二肽,氫鍵數(shù)也較多,說明相比于Pro二肽,Glu二肽更易與CaSR結(jié)合。Asn102、Asp216、Ser272、Asp275是CaSR激活劑與CaSR的相互作用位點[24],部分二肽可在這些位點與CaSR形成氫鍵,進一步驗證Pro、Glu二肽也能通過與上述殘基結(jié)合激活CaSR受體。
表9 二肽與CaSR受體的結(jié)合位點Table 9 Binding sites of dipeptides to CaSR receptor
2.4.3 Pro、Glu二肽的呈鮮構(gòu)效關(guān)系
Pro、Glu二肽與T1R1、T1R3和CaSR不同的結(jié)合能力影響鮮味閾值和呈鮮強度,主要與二肽與受體間的構(gòu)效關(guān)系有關(guān),因此分析了Pro、Glu二肽及其潛在鮮味受體的構(gòu)效關(guān)系,同時分別將未呈鮮二肽Pro-Ser、Val-Pro和Leu-Glu的受體-配體結(jié)合情況與鮮味較強的Ser-Pro、Pro-Val和Glu-Leu進行對比,探究導(dǎo)致其呈鮮效果差異的原因。
圖3顯示Ser-Pro與T1R1受體上的Ser107、Ser148、Asp218、Arg277及Gln278 殘基形成氫鍵,與Gln278存在疏水相互作用。圖4中Pro-Ser的對接位點為Thr149、Asn150、Ser216及Ser276,比Ser-Pro少結(jié)合一個殘基且不存在疏水接觸。疏水相互作用是受體-配體結(jié)合的驅(qū)動力[35,36],當配體與受體的疏水區(qū)發(fā)生相互作用時,其間的水分子從疏水區(qū)排出,增加配體與受體的結(jié)合親和力,Ser-Pro與T1R1的疏水接觸使結(jié)合更加穩(wěn)定;Ser-Pro中絲氨酸位于N端有一個游離的氨基與受體形成氫鍵,而Pro-Ser中N端脯氨酸的亞氨基未能與受體形成氫鍵,因此Pro-Ser與T1R1的結(jié)合力相較于Ser-Pro更弱,Ser-Pro呈鮮閾值低,呈現(xiàn)較強鮮味,Pro-Ser不能呈鮮。
圖3 Ser-Pro與T1R1受體結(jié)合模式圖Fig.3 Binding pattern of Ser-Pro to T1R1 receptor
圖4 Pro-Ser與T1R1受體結(jié)合模式圖Fig.4 Binding pattern of Pro-Ser to T1R1 receptor
如圖5和圖6所示,Ala-Pro及Pro-Ala與T1R1均在Ser107與Asp147處對接,但Pro-Ala與Ala302殘基間存在疏水接觸,與T1R1的結(jié)合相對緊密。Ala-Pro及Pro-Ala與CaSR的結(jié)合位點完全不同,但均能形成氫鍵,丙氨酸是分子量僅大于甘氨酸的氨基酸,僅含有一個甲基,Ala-Pro與Pro-Ala由于分子量小、體積小更易與鮮味受體結(jié)合,Ala-Pro中的丙氨酸殘基比Pro-Ala更接近受體活性口袋,因此Ala-Pro表現(xiàn)出較低的呈鮮閾值和較強鮮味,Dang等[37]報道在鮮味肽與鮮味受體研究中也發(fā)現(xiàn)小分子量的二肽或三肽更易與受體結(jié)合。
圖5 Ala-Pro與T1R1(a)、CaSR(b)受體結(jié)合模式圖Fig.5 Binding pattern of Ala-Pro to T1R1 (a), CaSR (b) receptor
圖6 Pro-Ala與T1R1(a)、CaSR(b)受體結(jié)合模式圖Fig.6 Binding pattern of Pro-Ala to T1R1 (a), CaSR (b) receptor
由圖7可知,Pro-Val和Val-Pro與T1R1均有3個對接位點,其中Pro-Val與Arg277結(jié)合形成兩個氫鍵,Arg277是報道的關(guān)鍵氨基酸殘基[26];Val-Pro與Ser276形成氫鍵,與Ser148及Ser276存在疏水相互作用,3D圖顯示Val-Pro的親水區(qū)域暴露于受體外,未能與受體產(chǎn)生相互作用,可能與溶劑水結(jié)合,導(dǎo)致與T1R1的結(jié)合親和力減弱。
圖7 Pro-Val與T1R1(a)、T1R3(b)受體結(jié)合模式圖Fig.7 Binding pattern of Pro-Val to T1R1 (a), T1R3 (b) receptor
Pro-Val和Val-Pro與T1R3之間均形成多個氫鍵且存在疏水接觸,其中Pro-Val與Glu45及Val277均形成兩個氫鍵,其疏水區(qū)被包裹在受體空腔內(nèi)部,配體-受體復(fù)合物更加穩(wěn)定;Val-Pro與圖8中結(jié)合口袋左側(cè)部分僅與His145的1個氫鍵連接,對接位置相比于Pro-Val更淺,疏水區(qū)域更接近結(jié)合口袋表面,導(dǎo)致Val-Pro與受體結(jié)合穩(wěn)定性差,未能呈鮮。鮮味肽與T1R3的結(jié)合歸因于C端氨基酸與受體關(guān)鍵氨基酸殘基之間的靜電相互作用、氫鍵等[38],不同的C端氨基酸殘基使其產(chǎn)生有差異的結(jié)合力,導(dǎo)致Pro-Val和Val-Pro相反的呈味效果。
圖9所示,γ-Glu-Met與CaSR有5個對接位點,形成8個氫鍵,其中與Asn176形成3個氫鍵,與Tyr246存在疏水接觸。γ-Glu-Met分子各部分均可與CaSR形成相互作用,Glu殘基嵌入受體深處,與受體結(jié)合更緊密,呈鮮閾值低至0.07 mg/mL。莊金達[39]研究發(fā)現(xiàn)鮮味肽與受體形成的疏水相互作用可增強二者的親和力,與本研究結(jié)果一致。Met-Glu與CaSR有5個對接位點,形成9個氫鍵,從3D圖可見Met-Glu的親水區(qū)Glu殘基朝向受體表面,易與溶劑水結(jié)合導(dǎo)致與受體親和力減弱,與CaSR的對接評分(8.80)小于γ-Glu-Met,呈鮮閾值也高于γ-Glu-Met兩倍多,故Met-Glu鮮味程度小于γ-Glu-Met,從受體與分子的角度表明γ-Glu-Met可通過結(jié)合CaSR受體呈現(xiàn)較強鮮味。
圖9 γ-Glu-Met(a)、Met-Glu(b)與CaSR受體結(jié)合模式圖Fig.9 Binding pattern of γ-Glu-Met (a), Met-Glu (b) to CaSR receptor
圖10和11可知,Gly-Glu與多個氨基酸殘基形成氫鍵,均完全嵌于兩個受體結(jié)合口袋內(nèi)部,可能與分子大小有關(guān)[37],Gly-Glu中甘氨酸的R基僅為一個氫原子,Gly-Glu分子更易進入受體的結(jié)合口袋。γ-Glu-Gly與T1R1、T1R3分別有5個或6個對接位點,氫鍵數(shù)較多,但呈味強度弱于Gly-Glu,可能與二肽與受體的結(jié)合位置有關(guān):與T1R1的結(jié)合圖可知,γ-Glu-Gly的親水區(qū)趨向受體外表面,易與水分子親和而減弱二肽與受體的結(jié)合力;在與T1R3結(jié)合時,γ-Glu-Gly分子整體位于結(jié)合口袋的淺表處,疏水區(qū)域暴露于受體表面,水溶液中的配體與受體結(jié)合不穩(wěn)定,阮仕艷[40]發(fā)現(xiàn)鮮味肽與T1R3受體氫鍵數(shù)越多,距離越短,越能結(jié)合受體口袋,本研究中位于結(jié)合口袋淺表處的γ-Glu-Gly可能由于與受體口袋中心距離較遠,使γ-Glu-Gly呈味強度弱于Gly-Glu。
圖10 Gly-Glu與T1R1(a)、T1R3(b)受體結(jié)合模式圖Fig.10 Binding pattern of Gly-Glu to T1R1 (a), T1R3 (b) receptor
圖11 γ-Glu-Gly與T1R1(a)、T1R3(b)受體結(jié)合模式圖Fig.11 Binding pattern of γ-Glu-Gly to T1R1 (a), T1R3 (b) receptor
圖12顯示γ-Glu-Leu、Leu-Glu與T1R1均存在多個對接位點且形成7個氫鍵,但Leu-Glu的對接評分(7.60)遠低于γ-Glu-Leu(9.70),感官評價顯示Leu-Glu未呈鮮,上述結(jié)果表明Leu-Glu與T1R1的結(jié)合效果不理想,與二肽分子的對接位置有關(guān)。從3D圖可見,γ-Glu-Leu以水平向的狀態(tài)被包裹于受體結(jié)合口袋內(nèi)部較深的位置,而Leu-Glu是以豎直向狀態(tài)嵌于受體結(jié)合口袋,位置較淺,疏水區(qū)域暴露于受體表面,因此Leu-Glu與T1R1的結(jié)合穩(wěn)定性弱于γ-Glu-Leu,導(dǎo)致呈鮮能力弱。
圖12 γ-Glu-Leu(a)、Leu-Glu(b)與T1R1受體結(jié)合模式圖Fig.12 Binding pattern of γ-Glu-Leu (a), Leu-Glu (b) to T1R1 receptor
本研究以感官評價為基礎(chǔ),利用同源建模、分子對接技術(shù)研究Pro、Glu二肽與鮮味受體T1R1、T1R3和CaSR的構(gòu)效關(guān)系。結(jié)果表明:除Pro-Ser、Val-Pro和Leu-Glu不呈鮮,其余二肽的呈鮮閾值均低于谷氨酸鈉閾值,γ-Glu-Met、Gly-Glu、Ser-Pro、Ala-Pro、Pro-Ala和Pro-Val等具有較強鮮味。二肽與T1R1的關(guān)鍵結(jié)合位點為Asp147、Thr149、Ser172和Arg277,T1R1是Glu二肽呈鮮的重要受體;與T1R3的關(guān)鍵結(jié)合位點為Glu45、Ser147、Val277和His278,Ser147是N-γ-Glu二肽與T1R3受體的關(guān)鍵結(jié)合位點;與CaSR的關(guān)鍵結(jié)合位點為Leu173、Asn176、Gln179、Arg220、Ser244和Asp275,Glu二肽比Pro二肽更易與CaSR受體結(jié)合。二肽與受體之間主要通過氫鍵與疏水相互作用結(jié)合,呈味較強的二肽在對接時多嵌于受體結(jié)合口袋的深處,或與受體間形成多個氫鍵及疏水接觸;呈味較弱的二肽有的位于結(jié)合口袋較淺的位置,有的肽疏水區(qū)或親水區(qū)暴露于受體表面,配體與受體結(jié)合不穩(wěn)定或易與溶劑水發(fā)生相互作用影響結(jié)合穩(wěn)定性。本研究明晰了Pro、Glu二肽呈鮮的構(gòu)效關(guān)系,有助于闡明二肽與T1R1、T1R3和CaSR鮮味受體分子相互作用機制,為鮮味肽呈鮮機理的研究提供了理論依據(jù)。