陳達(dá)年,馬旭升,代軍飛,汪 洋,李 茜,白 衡,毛甜甜,劉永生,丁 龍,陳昊翰,陳思言,饒宇飛,賈 寧*,張 杰,*,鄭海學(xué),劉湘濤
(1.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,蘭州 730070; 2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所 蘭州大學(xué)動物醫(yī)學(xué)與生物安全學(xué)院 家畜疫病病原生物學(xué)國家重點實驗室,蘭州 730000;3.河北科技師范學(xué)院動物科技學(xué)院 河北省預(yù)防獸醫(yī)學(xué)重點實驗室,秦皇島 066004;4.深圳真瑞生物科技有限公司,深圳 518000)
非洲豬瘟(African swine fever, ASF)是由非洲豬瘟病毒(ASF virus, ASFV)感染引起家豬和野豬的一種急性、出血性的烈性傳染病[1]。動物感染不同的ASFV毒株產(chǎn)生不同臨床癥狀,從亞臨床型到高度致死型[2]。2018年,我國首次爆發(fā)ASF疫情之后,該病在我國迅速蔓延,對我國養(yǎng)豬業(yè)的發(fā)展和國內(nèi)動物食品安全造成了嚴(yán)重威脅[3]。ASFV的基因組龐大,且對其病毒基因的功能注釋仍不完全清楚,是導(dǎo)致目前沒有獲得有效疫苗的重要原因之一。目前,該病仍在非洲、歐洲和亞洲持續(xù)傳播,防控形勢至今仍異常嚴(yán)峻[4]。因此,對于ASFV的基因進行功能注釋顯得尤為重要。
ASFV是一種大型、高度結(jié)構(gòu)化的包膜DNA病毒,具有雙鏈DNA基因組(180~190 kb),編碼至少160個開放閱讀框(ORFs),包括結(jié)構(gòu)蛋白、免疫逃避蛋白、病毒復(fù)制相關(guān)蛋白、多基因家族蛋白和許多功能未知蛋白[5]。ASFV基因組中大約30%的基因具有多個拷貝,稱為多基因家族(multigene families,MGF),包括 MGF100、MGF110、MGF300、MGF360和MGF505/530,由于MGF基因插入和刪除,ASFV基因組長度在不同毒株間存在差異[6]。不同ASFV毒株的基因組含有數(shù)目不同的MGF,這些基因與ASFV的嗜性、天然免疫逃逸及病毒毒力相關(guān)[7]。有研究報道,在強毒力ASFV Georgia 2007/1(ASFV-G)中特異性地刪除包括MGF360-13L在內(nèi)的6個MGF基因后免疫家豬,能夠有效提高免疫豬受強毒株ASFV-G感染的存活率[8],這提示了MGF360-13L在ASFV致病過程中可能具有重要功能。目前,已有研究證明MGF360-13L能夠通過cGAS-STING信號通路抑制宿主Ⅰ型干擾素的產(chǎn)生[9],但該研究僅通過外源表達(dá)的方法研究了蛋白功能。在實際情況中,ASFV編碼多種蛋白,其中許多蛋白間存在相互作用,因此,利用單基因缺失株研究MGF360-13L基因功能具有重要意義。
炎癥反應(yīng)是天然免疫的重要組成部分,與病毒感染后的發(fā)病進程和致病力有關(guān)[10]。在豬體內(nèi),ASFV主要在血液中的單核細(xì)胞和組織中的巨噬細(xì)胞中復(fù)制,不同ASFV感染巨噬細(xì)胞后,促炎性細(xì)胞因子的分泌活化能力也存在差異[11]。而目前關(guān)于 ASFV 調(diào)控機體炎癥反應(yīng)相關(guān)研究仍然不完全清楚,因此對于ASFV調(diào)控炎癥反應(yīng)的研究勢在必行。
非洲豬瘟基因II型野生毒株ASFV CN/GS/2018 由蘭州獸醫(yī)研究所P3實驗室分離并保存;豬肺泡巨噬細(xì)胞(porcine alveolar macrophages, PAMs)和豬骨髓巨噬細(xì)胞(porcine bone marrow macrophages,BMDM)取自40日齡仔豬;pAVX1真核表達(dá)載體、大腸桿菌 DH5α感受態(tài)細(xì)胞、293T人源上皮細(xì)胞和IL-1β、IL-6、TNF-α和GAPDHqPCR檢測引物[12]由蘭州獸醫(yī)研究所口蹄疫與新發(fā)流行病學(xué)團隊保存;DMEM培養(yǎng)基、1640培養(yǎng)基、胎牛血清購自 Gibco 公司;ELISA檢測試劑盒購自欣博盛公司;質(zhì)粒大提取試劑盒、PCR產(chǎn)物純化試劑盒購自Promega生物科技有限公司;脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑lipofectamine2000購自Invitrogen公司;辣根過氧化物酶標(biāo)記的山羊抗小鼠IgG購于中杉金橋公司;一步法TB Green?RT-PCR定量檢測試劑盒、PrimeSTAR?HS 高保真PCR酶購自TaKaRa公司;ClonExpress II One Step Cloning Kit重組酶購自南京諾唯贊生物公司。
以ASFV CN/GS/2018全基因組序列中MGF360-13L基因為分析對象,使用 ProtScale(https://web.expasy.org/protscale/)分析MGF360-13L蛋白的親疏水性;使用TMHMM Server v.2.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)預(yù)測 MGF360-13L蛋白的跨膜結(jié)構(gòu);用SignalP-5.0 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)在線預(yù)測蛋白質(zhì)的信號肽;利用PredictProtein在線工具(http://www.predictprotein.org/)對蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)進行預(yù)測;用SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasy.org/)的同源建模方法構(gòu)建蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)模型。通過EBI(https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/)對基因II型ASFV的MGF360-13L基因進行氨基酸序列比對,利用MEGA7.0.26 構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。
根據(jù)ASFV CN/GS/2018毒株序列設(shè)計含有真核表達(dá)載體pVAX1同源臂的MGF360-13L全基因擴增引物 F1/R1(表1),并在目的基因N端添加Flag標(biāo)簽序列;以提取的ASFV CN/GS/2018基因組為模板,使用PrimeSTAR?HS 高保真PCR酶擴增MGF360-13L基因片段,擴增PCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性3 min;95 ℃變性30 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸70 s,34次循環(huán);72 ℃總延伸5 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定并回收。使用ClonExpress II One Step Cloning Kit連接酶將載體與目的片段進行連接,37 ℃連接30 min,構(gòu)建完成的重組質(zhì)粒pVAX1-MGF360-13L送至蘭州天啟基因生物科技有限公司測序,測序正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞中進行蛋白表達(dá)驗證。
單基因缺失毒株ASFV-ΔMGF360-13L由親本毒株ASFV CN/GS/2018與重組轉(zhuǎn)移載體p72mCherry MGF360-13L同源重組生成。p72mCherry MGF360-13L重組轉(zhuǎn)移載體包含MGF360-13L基因上、下游各約1 000 bp的同源臂序列(對應(yīng)病毒基因組位置分別為29 584~20 594 bp和31 657~32 657 bp),上、下游同源臂序列間為p72啟動子和mCherry基因。分別設(shè)計上游同源臂擴增引物360-13L-L-F2/R2、下游同源臂擴增引物360-13L-R-F3/R3和p72mCherry熒光報告盒擴增引物360-13L-mCherry-F4/R4(表1),擴增同源臂和p72mCherry熒光基因,使用ClonExpress II One Step Cloning Kit重組酶將上述3個片段與線性化載體 pUC19進行連接,將構(gòu)建完成的p72mCherry-MGF360-13L進行單酶切鑒定后測序驗證。
表1 本研究用引物
將測序正確的p72mCherry MGF360-13L轉(zhuǎn)染BMDM細(xì)胞,1 h后感染ASFV CN/GS/2018毒株,使ASFV CN/GS/2018與p72mCherry MGF360-13L在細(xì)胞內(nèi)進行同源重組,生成重組病毒ASFV-ΔMGF360-13L,感染48 h后通過觀察mCherry熒光,挑取具有mCherry熒光的BMDM,通過連續(xù)14輪極限稀釋純化得到重組ASFV-ΔMGF360-13L。為檢測制備缺失毒株的純度,根據(jù)MGF360-13L基因設(shè)計引物 360-13L-F5/R5(表1);分別以提取的ASFV CN/GS/2018和ASFV-ΔMGF360-13L基因組為模板,進行PCR擴增,反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性3 min;95 ℃變性30 s,62 ℃退火15 s,72 ℃延伸70 s,34次循環(huán);72 ℃總延伸5 min。將提取的ASFV-ΔMGF360-13L基因組送基因公司進行測序。
比較ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018的體外生長趨勢。將PAMs細(xì)胞鋪于96孔板中過夜培養(yǎng)形成單層細(xì)胞,并以MOI=0.01的ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018感染細(xì)胞,置于37 ℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱,吸附1 h后去除接種物,用PBS沖洗3次,加入1.5 mL培養(yǎng)基,在37 ℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中孵育2、24、48、72和96 h,在感染后不同時間點收取樣品,凍融后,在PAMs細(xì)胞上進行病毒滴定,通過血細(xì)胞吸附試驗(HAD)計算病毒滴度。
為了探究ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018 在感染巨噬細(xì)胞后細(xì)胞炎性因子表達(dá)水平是否相同;將BMDM細(xì)胞鋪于6孔板中過夜培養(yǎng)形成單層細(xì)胞,并以MOI=1分別感染ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018,在37 ℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中各分別孵育4、8、12、24、48 h后收取細(xì)胞樣品;用TRIzol總RNA提取試劑提取總RNA,使用一步法TB Green?RT-PCR定量檢測試劑盒檢測細(xì)胞IL-1β、IL-6和TNF-α炎癥因子的mRNA水平。熒光定量PCR反應(yīng)條件:42 ℃ 反轉(zhuǎn)錄5 min、95 ℃ 預(yù)變性10 s;95 ℃ 5 s、60 ℃ 40 s,40次循環(huán);使用ELISA檢測試劑盒檢測上清樣品中分泌的IL-1β、IL-6和TNF-α含量;并用qPCR檢測病毒基因組拷貝數(shù)[13]。
涉及ASFV病原的操作及樣品的制備在中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所P3實驗室開展,試驗中所產(chǎn)生的廢棄物均經(jīng)過滅菌殺毒后無害化處理。
利用ProtScale軟件對MGF360-13L基因做親水性分析,縱坐標(biāo)負(fù)值表示親水區(qū),可見組成MGF360-13L 蛋白的氨基酸多集中在正值,整體表現(xiàn)為疏水性(圖1A);TMHMM Server v.2.0 軟件預(yù)測表明,MGF360-13L 蛋白不存在跨膜區(qū)(圖1B);使用SignalP-5.0 Server軟件預(yù)測發(fā)現(xiàn),MGF360-13L 蛋白S值為0.110 1(S>0.5,則判斷為分泌蛋白并且有信號肽),說明該蛋白不是分泌蛋白且不存在信號肽(圖1C);預(yù)測MGF360-13L蛋白二級結(jié)構(gòu)中α-螺旋、β-折疊、β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲分別占52.12%、0.00%、5.38%和27.20%,α-螺旋和無規(guī)則卷曲比例高則有助于蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性;其三級結(jié)構(gòu)如圖1D,有α-螺旋結(jié)構(gòu)富集域,以β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲連接形成其特定結(jié)構(gòu),與二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果一致。通過EBI對比不同ASFV 的MGF360-13L蛋白氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)在不同基因II型病毒分離株中MGF360-13L蛋白序列相對保守,從系統(tǒng)進化樹可知我國流行的ASFV基因II型毒株與ASFV-G關(guān)系密切(圖2)。
A.蛋白親疏水性分析;B.跨膜區(qū)預(yù)測;C.信號肽預(yù)測;D.三級結(jié)構(gòu)預(yù)測A. Hydrophilic analysis; B. Prediction of transmembrane region; C. Signal peptide prediction; D. Tertiary structure prediction圖1 MGF360-13L生物信息學(xué)分析Fig.1 Bioinformatics analysis of MGF360-13L
圖2 ASFV MGF360-13L 基因系統(tǒng)進化樹Fig.2 Phylogenetic tree of ASFV MGF360-13L gene
使用ASFV CN/GS/2018基因組DNA為模板,通過PCR方法擴增目的片段MGF360-13L,經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測可見與預(yù)期目的片段大小相同(圖3A)。將連接后的載體進行單酶切(HindⅢ)驗證,條帶大小與預(yù)期條帶大小相一致,同時送測序驗證(圖3B);測序正確后提取表達(dá)質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞,培養(yǎng)24 h后利用Western blot檢測蛋白表達(dá),結(jié)果顯示,在41 ku處出現(xiàn)特異性條帶,ASFV MGF360-13L基因外源表達(dá)成功(圖4)。
為進一步研究MGF360-13L基因在病毒復(fù)制過程中的功能,使用同源重組方法構(gòu)建基因缺失毒株ASFV-ΔMGF360-13L(圖5)。首先擴增同源臂及熒光基因片段(圖6A),構(gòu)建重組轉(zhuǎn)移載體p72mCherry-MGF360-13L,酶切驗證(HindⅢ)符合預(yù)期大小后質(zhì)粒測序(圖6B)。將測序正確的重組轉(zhuǎn)移載體轉(zhuǎn)染BMDM細(xì)胞,1 h后感染ASFV CN/GS/2018。通過觀察熒光判斷病毒重組效率及純化效率(圖7),連續(xù)純化多代,其間收集細(xì)胞病毒提取基因組DNA,利用PCR鑒定病毒純度,最終經(jīng)過14輪純化獲得單純的MGF360-13L單基因缺失毒株(圖6C)。對經(jīng)過PCR驗證后的基因缺失毒株進行測序驗證,結(jié)果顯示ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018比較,于MGF360-13L基因位置缺失1 063個核苷酸(MGF360-13L),插入1 294個核苷酸(p72mCherry),表明ASFV-ΔMGF360-13L毒株構(gòu)建成功。
A. MGF360-13L基因條帶擴增:M.DNA相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1.陰性對照 2.擴增目的基因條帶(1 063 bp)。B.重組質(zhì)粒PCR擴增:M.DNA相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1.載體對照(2 999 bp);2.重組質(zhì)粒擴增條帶(4 062 bp)A. Amplification of MGF360-13L; M. DNA relative molecular weight standard: 1. Negative control; 2. Amplification of the target gene(1 063 bp). B. PCR amplification of recombinant plasmid: M. DNA relative molecular weight standard; 1. Vector control(2 999 bp); 2. Amplification band of recombinant plasmid(4 062 bp)圖3 MGF360-13L基因PCR擴增及載體酶切驗證Fig.3 PCR amplification and vector enzyme digest verification of MGF360-13L gene
1.空白對照;2.轉(zhuǎn)染pAVX1-MGF360-13L在細(xì)胞中表達(dá)1. Blank control; 2. Transfected pVAX1-MGF360-13L was expressed in cells圖4 質(zhì)粒pAVX1-MGF360-13L 表達(dá)鑒定Fig.4 Expression and identification of plasmid pAVX1-MGF360-13L
圖5 ASFV-ΔMGF360-13L構(gòu)建策略示意圖Fig.5 The schematic diagram of ASFV-ΔMGF360-13L construction strategy
A.同源臂片段PCR擴增:M.DNA相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1、3、5. 陰性對照;2. MGF360-13L上游同源臂擴增(1 000 bp);4. MGF360-13L下游同源臂擴增(1 000 bp);6.p72mCherry基因擴增(1 200 bp)。B.重組質(zhì)粒PCR擴增:M. DNA相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1. 載體對照(2 300 bp);2. 重組質(zhì)粒擴增條帶(5 499 bp)。C. ASFV-ΔMGF-360-13L純度PCR鑒定:M. DNA相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1. 陰性對照;2.ASFV-ΔMGF360-13L基因組DNA為擴增模板,無條帶;3. ASFV CN/GS/2018 基因組DNA為擴增模板,擴增出目的基因MGF360-13L條帶(1 063 bp)A. PCR amplification of homologous arm fragment: M. DNA relative molecular weight standard; 1, 3, 5. Negative control; 2. Upstream homologous arm amplification of MGF360-13L(1 000 bp) 4. Downstream homologous arm amplification of MGF360-13L(1 000 bp); 6. p72mCherry gene amplification(1 200 bp). B.PCR amplification of recombinant plasmid: M. DNA relative molecular weight standard; 1. Carrier control(2 300 bp); 2. Amplification band of recombinant plasmid (5 499 bp). C.ASFV-ΔMGF-360-13L purity PCR identification: M. DNA relative molecular weight standard; 1. Negative control; 2. ASFV-ΔMGF360-13L genomic DNA as amplification template, without bands; 3.ASFV CN/GS/2018 genomic DNA was used as the amplification template, and the target gene MGF360-13L band was amplified(1 063 bp)圖6 重組轉(zhuǎn)移載體p72mCherry-MGF360-13L構(gòu)建及缺失毒純度鑒定Fig.6 Construction of recombinant transfer vector p72mCherry-MGF360-13L and purity identification of the gene deleted strain
Bright.自然光觀察結(jié)果;mCherry.熒光觀察結(jié)果;Merge.合并觀察結(jié)果;F1. 第一輪純化結(jié)果;F5. 第五輪純化結(jié)果;F9. 第九輪純化結(jié)果;F14. 第十四輪純化結(jié)果Bright. Natural light observation results; mCherry. Fluorescence observation results; Merge. Combined observation results; F1. The first round of purification rersults; F5. The fifth round of purification results; F9. The ninth round of purification results; F14. The fourteenth round of purification results圖7 ASFV-ΔMGF360-13L純化結(jié)果Fig.7 Purification result of ASFV-ΔMGF360-13L
用MOI=0.01的ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018分別感染PAMs細(xì)胞,分別在感染2、24、48、72和96 h收取樣品,凍存于-70 ℃冰箱,并用解凍后的裂解液測定病毒滴度。結(jié)果顯示,ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018在不同時間點的病毒量無顯著差異(圖8)。
用MOI=1的ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018分別感染BMDM細(xì)胞,在感染后4、8、12、24、48 h分別收集樣品,提取細(xì)胞總RNA,測定總RNA濃度,使用qPCR方法檢測細(xì)胞IL-1β、IL-6和TNF-α炎性因子相對表達(dá)量,采用ELISA檢測上清液中炎性因子的含量。結(jié)果顯示,在ASFV-ΔMGF360-13L與ASFV CN/GS/2018感染后4 h時,檢測細(xì)胞產(chǎn)生的IL-1β、IL-6和TNF-α炎性因子mRNA水平和蛋白水平無顯著性差異;在感染12 h后炎癥因子表達(dá)mRNA水平和蛋白水平存在顯著性差異(圖9A~F,P<0.05)。qPCR方法測定病毒拷貝數(shù)在不同時間點的增長(圖9G)。
A. HAD50試驗顯微鏡觀察結(jié)果:Bright. 自然光觀察結(jié)果;mCherry. 熒光觀察結(jié)果;Merge. 合并觀察結(jié)果;Mock. 陰性對照;ASFV CN/GS/2018. 親本毒株;ASFV-ΔMGF360-13L. 缺失毒株;B. ASFV-ΔMGF360-13L和ASFV CN/GS/2018體外生長特性比較。ns. 差異不顯著(P>0.05)A.HAD50 experimental microscope observation: Bright. Natural light observation results; mCherry. Fluorescence observation results; Merge. Combined observation results; Mock. Negative control; ASFV CN/GS/2018. Parent strain; ASFV-ΔMGF360-13L. The gene deleted strain. B.Comparison of in vitro growth characteristics between ASFV-ΔMGF360-13L and ASFV CN/GS/2018. ns. No significant difference (P>0.05)圖8 血吸附試驗觀察結(jié)果與病毒體外生長比較Fig.8 The results of blood adsorption experiment were compared with the growth of virus in vitro
A、C、E. 感染后4、8、12、24、48 h時IL-1β、IL-6和TNF-α相對mRNA表達(dá)量;B、D、F. 感染后4、8、12、24、48 h時IL-1β、IL-6和TNF-α的ELISA結(jié)果;G. 不同時間點ASFV拷貝數(shù);ns. 差異不顯著(P>0.05);*、**、***. 差異顯著(P<0.05)A, C, E. The relative mRNA expression levels of IL-1β, IL-6 and TNF-α at 4, 8, 12, 24 and 48 h after infection; B, D, F. The ELISA results of IL-1β, IL-6 and TNF-α at 4, 8, 12, 24 and 48 h after infection; G. ASFV copy number at different time points. ns. No significant difference (P>0.05);*, **, ***. Significant difference(P<0.05)圖9 細(xì)胞炎性因子相對表達(dá)量及病毒拷貝數(shù)檢測Fig.9 Detection of relative expression level of cytokines and virus copy number
目前,ASFV仍然威脅著我國的養(yǎng)豬業(yè),嚴(yán)重影響農(nóng)業(yè)經(jīng)濟的發(fā)展。由于免疫環(huán)境復(fù)雜且涉及多種免疫機制和免疫決定因素,ASFV疫苗的研發(fā)具有重重阻礙,目前尚沒有有效的疫苗,只能通過動物檢疫和屠宰來控制疫情。
ASFV基因組編碼多達(dá)150到200個蛋白,其中大多數(shù)還沒有經(jīng)過功能鑒定,ASFV編碼的毒力基因、宿主-病毒相互作用方式和發(fā)病機制仍遠(yuǎn)未被了解[14]。因此,識別病毒蛋白功能,解析病毒在體內(nèi)和體外復(fù)制的規(guī)律,以及對病毒毒力基因的研究具有重要意義,是研發(fā)ASFV疫苗的一個至關(guān)重要的環(huán)節(jié)。
減毒活疫苗是有效開發(fā)ASF疫苗的方法之一[15]。研究發(fā)現(xiàn),在高毒力ASFV-G中分別刪除9GL、UK和I177L等基因能夠致弱ASFV-G的致病性,其缺失毒株在免疫豬只后受到同源親本ASFV-G攻擊時獲得了一定的保護[16-17]。也有研究發(fā)現(xiàn),在高毒力ASFV-G中刪除MGF360-1L、X69R、J64R基因時并不減弱病毒毒力,與親本ASFV-G感染時引起的癥狀無明顯區(qū)別[18-19]。因此,在龐大的ASFV基因組篩選有效的毒力基因,是成功制備ASFV減毒活疫苗的關(guān)鍵。
現(xiàn)已知MGF家族蛋白在病毒的轉(zhuǎn)錄、翻譯和免疫逃逸等多個階段發(fā)揮重要作用。研究發(fā)現(xiàn),在高毒力ASFV-G中刪除MGF360和MGF505部分基因以及在高毒力ASFV CN/GS/2018中刪除MGF110-9L、MGF505-7R基因可以減弱親本ASFV毒力[8,12-13]。因此,本研究以MGF360-13L為對象進行研究。通過生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)MGF360-13L蛋白為親水性蛋白,且不具有跨膜區(qū),也不是分泌蛋白;成功構(gòu)建了外源表達(dá)質(zhì)粒pVAX1-MGF360-13L,在293T細(xì)胞中成功表達(dá)MGF360-13L蛋白;通過同源重組方法構(gòu)建了單基因缺失毒株ASFV-ΔMGF360-13L,并通過生長曲線的繪制證明其在病毒復(fù)制中的非必需性。
ASFV有嚴(yán)格的細(xì)胞噬性,其主要靶細(xì)胞是巨噬細(xì)胞和單核細(xì)胞,也有報道其在樹突狀細(xì)胞中復(fù)制[20]。這些細(xì)胞類型在先天免疫反應(yīng)中發(fā)揮著關(guān)鍵作用[21]。其中,巨噬細(xì)胞是專門識別和破壞病原體并啟動炎癥反應(yīng)的關(guān)鍵,ASFV感染巨噬細(xì)胞會誘導(dǎo)炎癥因子表達(dá)和促進細(xì)胞凋亡[22]。有研究發(fā)現(xiàn),ASFV病毒蛋白L83L能夠特異性結(jié)合宿主基因IL-1β, L83L基因缺失的ASFV毒株毒力并沒有減弱[23],這也提示了ASFV致病過程的復(fù)雜性。本研究通過構(gòu)建基因缺失毒株,證實了MGF360-13L能夠抑制宿主炎性因子的表達(dá)。
在本研究中,使用生物信息學(xué)軟件分析了ASFV MGF360-13L基因的初步信息,成功構(gòu)建了外源表達(dá)質(zhì)粒pVAX1-MGF360-13L,構(gòu)建了單基因缺失毒株ASFV-ΔMGF360-13L,證明該基因為ASFV非必需基因,在感染BMDM細(xì)胞時,缺失毒株刺激細(xì)胞產(chǎn)生的IL-1β、IL-6和TNF-α等炎性因子水平高于親本毒株,證明MGF360-13L基因在AFSV感染BMDM細(xì)胞產(chǎn)生炎癥因子應(yīng)答反應(yīng)具有一定的抑制作用。本文研究為進一步揭示ASFV MGF360-13L基因功能做了鋪墊。