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    K-Means 算法最優(yōu)聚類數(shù)量的確定

    2022-12-04 07:39:52何選森樊躍平
    電子科技大學(xué)學(xué)報 2022年6期
    關(guān)鍵詞:均值聚類數(shù)量

    何選森,何 帆,徐 麗,樊躍平

    (1. 廣州商學(xué)院信息技術(shù)與工程學(xué)院 廣州 511363;2. 湖南大學(xué)信息科學(xué)與工程學(xué)院 長沙 410082;3. 北京理工大學(xué)管理與經(jīng)濟(jì)學(xué)院 北京 海淀區(qū) 100081)

    在大數(shù)據(jù)時代[1],數(shù)據(jù)分類是數(shù)據(jù)應(yīng)用的基礎(chǔ),由于無監(jiān)督的分類(unsupervised classification)或聚類(clustering)[2]不需要對數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練,因而獲得了廣泛應(yīng)用。聚類是采用多元統(tǒng)計方法,依據(jù)數(shù)據(jù)間的相似性或距離測度直接把性質(zhì)相近的數(shù)據(jù)歸為一類,性質(zhì)差異較大的樣本歸屬于不同的類。聚類分析中的聚類結(jié)構(gòu)有3 種:分區(qū)(partitional)聚類、層次(hierarchical)聚類和單個(individual)集群。層次聚類又分為凝聚層次聚類[3]和分裂層次聚類[4]。常用的聚類法有模糊C 均值聚類[5]、密度基(density-based)聚類[6]以及K-均值(K-Means)類的聚類[7]等。

    在無先驗(yàn)知識情況下對數(shù)據(jù)分析的關(guān)鍵是找出數(shù)據(jù)中的固有劃分(inherent partitions),盡管聚類算法可以劃分?jǐn)?shù)據(jù),但不同算法或同一種算法采用不同的參數(shù)將產(chǎn)生出不同的數(shù)據(jù)劃分或揭示不同的聚類結(jié)構(gòu)(clustering structures)。因此,客觀、定量地評價算法的聚類結(jié)果就顯得十分重要。換句話說,由一種聚類算法得到的聚類結(jié)構(gòu)是否有意義,即聚類驗(yàn)證(cluster validation)非常重要。層次聚類是基于鄰近矩陣(proximity matrix)將數(shù)據(jù)組織到層次結(jié)構(gòu)中,其結(jié)果通常用樹狀圖[8]表示。與層次聚類相比,分區(qū)聚類將一組數(shù)據(jù)對象分配到?jīng)]有任何層次結(jié)構(gòu)的k個聚類中[9],而且這個過程通常伴隨著對一個準(zhǔn)則函數(shù)的不斷優(yōu)化。在分區(qū)聚類算法中,應(yīng)用最廣泛的一種準(zhǔn)則函數(shù)是平方誤差和準(zhǔn)則(sum-of-squared-error criterion)[2]。使得平方誤差和為最小的劃分被認(rèn)為是最優(yōu)的,一般稱其為最小方差(minimum variance)劃分[7]。數(shù)據(jù)的聚類是指:在同一類中數(shù)據(jù)對象具有很高的相似度(similarity),而不同聚類之間的數(shù)據(jù)則具有較高的相異性(dissimilarity)[10]。顯然,相似性與相異性(或稱距離)可概括為鄰近性,它既可以描述數(shù)據(jù)點(diǎn)之間、數(shù)據(jù)類之間的遠(yuǎn)近關(guān)系,又可以描述數(shù)據(jù)點(diǎn)與數(shù)據(jù)類之間的遠(yuǎn)近關(guān)系。對于聚類分析,常用的距離是歐幾里得(歐氏)距離,利用歐氏距離形成的聚類對特征空間中的平移和旋轉(zhuǎn)變換具有不變性[11]。

    1 K-均值算法與聚類有效性分析

    K-均值屬于分區(qū)聚類的結(jié)構(gòu),目標(biāo)是將數(shù)據(jù)組織成若干類,并且任一數(shù)據(jù)點(diǎn)只能屬于一個類而不能同時屬于多個類,這就意味著K-均值算法生成的是特定數(shù)量、互不相交、非層次的聚類。K-均值算法通過迭代優(yōu)化步驟,利用最小化平方誤差和準(zhǔn)則來尋求數(shù)據(jù)的最佳劃分,屬于爬山(hill-climbing)類算法的范疇[7]。本質(zhì)上,K-均值就是期望最大化(expectation maximization, EM)算法的經(jīng)典范例。EM 算法的第一步是尋找與聚類相關(guān)的期望點(diǎn),第二步是利用第一步的知識改進(jìn)對聚類的估計,重復(fù)這兩個步驟直到算法收斂。

    K-均值算法中,數(shù)據(jù)對象之間采用歐氏距離來度量相異性。設(shè)數(shù)據(jù)集有n個樣本,它的p維觀測為:

    任意兩個樣本點(diǎn)xi,xj(i,j=1, 2, ···,n)之間的歐氏距離表示為dij=d(xi,xj)。如果將n個樣本分成k個聚類,則選擇全部數(shù)據(jù)之間距離最遠(yuǎn)的兩個(序號為i1,i2)樣本作為初始聚類中心(聚點(diǎn)):

    然后再確定下一個聚點(diǎn)(序號i3),使得i3與i1,i2距離最小者等于所有其他點(diǎn)與i1,i2較小距離中的最大者:

    不斷重復(fù)以上過程,即可確定全部k個初始聚點(diǎn)。因此,K-均值算法的基本過程可以歸納如下。

    1) 設(shè)隨機(jī)選取的k個初始聚點(diǎn)的集合為:

    對于任意的數(shù)據(jù)點(diǎn)x,對它的劃分原則為:

    即將所有樣本分成不相交的k個類,得到初始分類:

    顯然,K-均值聚類算法的基本思想是將數(shù)據(jù)空間首先隨機(jī)地劃分為事先指定的k個類,然后通過迭代計算不斷更新每個類的質(zhì)心。當(dāng)相鄰兩次迭代計算的結(jié)果基本相同時,則算法收斂。盡管K-均值算法被證明是收斂的[12],然而困擾K-均值聚類的第一個問題是它的迭代優(yōu)化過程不能保證算法收斂到全局最優(yōu)。由于K-均值算法可以收斂到局部最優(yōu)[7],不同的初始劃分將導(dǎo)致不同的收斂質(zhì)心。第二個問題是K-均值算法對數(shù)據(jù)中的異常值也即野值(outliers)以及噪聲(noise)很敏感[2,7],在迭代計算聚點(diǎn)的過程中算法卻是考慮了所有的樣本。即使某個樣本點(diǎn)離質(zhì)心很遠(yuǎn),但K-均值算法仍然將該點(diǎn)強(qiáng)行納入最鄰近的類中用于計算其質(zhì)心,這樣就造成了聚類形狀的扭曲。另外,K-均值類算法要求用戶事先指定聚類數(shù)量,這在實(shí)際中很難做到。聚類數(shù)量是否正確將直接影響聚類效果,確定最優(yōu)的聚類數(shù)量也稱為聚類有效性分析(clustering validity analysis)[13]。因此,在聚類分析中,一個必不可少的步驟是驗(yàn)證聚類結(jié)果并確保它能正確地反映數(shù)據(jù)的本質(zhì)結(jié)構(gòu)?;诮y(tǒng)計理論對算法生成的聚類結(jié)構(gòu)進(jìn)行評估,強(qiáng)調(diào)以客觀和定量的方式對聚類結(jié)果進(jìn)行評價,這就是聚類趨勢分析(clustering tendency analysis)[14]。

    分區(qū)聚類、層次聚類和單個集群的結(jié)構(gòu)所對應(yīng)的聚類有效性測試標(biāo)準(zhǔn)分別為外部的(external)、內(nèi)部的(internal)和相對的標(biāo)準(zhǔn)(relative criteria)[15],這3 種標(biāo)準(zhǔn)的適用范圍不同。外部與內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)都涉及到統(tǒng)計方法和假設(shè)檢驗(yàn)[16],這將導(dǎo)致計算開銷增加。而相對標(biāo)準(zhǔn)則無須進(jìn)行統(tǒng)計檢驗(yàn),它致力于比較不同的聚類結(jié)果。因此,相對標(biāo)準(zhǔn)可用于比較K-均值類算法一系列不同聚類數(shù)量k的聚類效果,以便找出數(shù)據(jù)劃分最適合的k值,這個問題也被稱為聚類有效性的基本問題(fundamental problem)[17]。

    K-均值類算法包括一系列聚類方法,如Kmedoids 算法[18]和K-均值算法,它們的適用范圍和特點(diǎn)各不相同。K-均值的時間復(fù)雜度為O(nkpT),其中,n為樣本數(shù)量,k為聚類數(shù)量,p為數(shù)據(jù)維數(shù),T為算法迭代次數(shù),由于k,p,T通常都比n小很多,因此K-均值的時間復(fù)雜度為近似的線性關(guān)系[2,7],因而它以低計算復(fù)雜度體現(xiàn)出高效率[18],但它的聚類結(jié)果很大程度上受數(shù)據(jù)中噪聲與異常值的影響。為了解決K-均值算法的這個缺陷,Kmedoids 算法以中心點(diǎn)(medoids)作為聚類中心,對噪聲及異常點(diǎn)處理能力優(yōu)秀且具有較強(qiáng)的魯棒性。然而它的缺點(diǎn)是計算復(fù)雜度較高,因此學(xué)者們致力于改進(jìn)K-medoids 算法,以期在計算效率上追趕K-均值算法[18]。在眾多改進(jìn)的K-medoids 方法中,圍繞中心點(diǎn)劃分(partitioning around medoids,PAM)算法[19]被認(rèn)為是最有效的K-medoids 算法之一。但PAM 算法的迭代次數(shù)較多,時間效率低[19]。在不考慮迭代次數(shù)的情況下,K-medoids 和PAM算法的時間復(fù)雜度都為O(k(n-k)2)[18],即為二次函數(shù)。對于這3 種經(jīng)典的K-均值類聚類算法,僅從時間開銷的角度來看,K-均值算法的計算速度是最快的。另外,這3 種算法的共同缺點(diǎn)仍是聚類數(shù)量k作為算法的參數(shù)必須事先指定。聚類數(shù)量k過大或過小的估計都將嚴(yán)重影響最終的聚類質(zhì)量。過多的聚類數(shù)量造成真正的數(shù)據(jù)聚類結(jié)構(gòu)變得復(fù)雜,使得對聚類結(jié)果的解釋和分析變得困難,而過少的聚類數(shù)量將損失信息并造成錯誤的聚類結(jié)果。

    本文主要研究經(jīng)典K-均值聚類算法中最佳聚類數(shù)量的確定問題,因此,其基本的思路為:對于具體的數(shù)據(jù)集,首先在聚類數(shù)量的可能范圍內(nèi),采用不同的聚類數(shù)量來運(yùn)行K-均值算法以獲得相應(yīng)的聚類結(jié)果;然后以聚類數(shù)量k為自變量構(gòu)造一種聚類有效性函數(shù)(指標(biāo))對K-均值的聚類結(jié)果進(jìn)行評估,通過優(yōu)化聚類有效性函數(shù)來確定最優(yōu)的聚類數(shù)量。

    2 聚類有效性評價函數(shù)

    對于理想的聚類效果,從相似性角度要求類內(nèi)樣本點(diǎn)之間盡可能相似,同時類與類之間的樣本點(diǎn)盡可能相異。從距離的角度則要求類內(nèi)樣本點(diǎn)之間距離的代數(shù)和應(yīng)盡量小,而在不同類之間樣本點(diǎn)距離的代數(shù)和應(yīng)盡量大。在整個數(shù)據(jù)空間中,樣本點(diǎn)與它所在類的聚點(diǎn)之間的距離,要比它與其他類的聚點(diǎn)間的距離都要小。滿足這個條件的聚類就是有效的數(shù)據(jù)劃分。

    對于全部的n個數(shù)據(jù)點(diǎn),其樣本均值(質(zhì)心)為:

    在所有的數(shù)據(jù)中,假設(shè)第i個聚類Ci中有ni個數(shù)據(jù)對象,則定義該類的樣本質(zhì)心(中心)為:

    從定義1 的表達(dá)式可看出,當(dāng)所有樣本都屬于同一個類(即聚類數(shù)量k=1)時,則這個類的中心就是全體數(shù)據(jù)的質(zhì)心xˉ。在這種情況下,類間質(zhì)心距離之和Dbetw取值為0,即取Dbetw(k)的極小值。隨著聚類數(shù)量k的增加,類間質(zhì)心距離之和函數(shù)Dbetw(k)是遞增的。

    定義2 類內(nèi)距離之和 在聚類空間I 上,由每個類中的各樣本到該類中心的歐氏距離之和為同一類的內(nèi)部距離,而所有k個聚類的內(nèi)部距離之和則定義為類內(nèi)距離之和:

    從定義2 可知,當(dāng)整個數(shù)據(jù)集的樣本屬于同一個類(聚類數(shù)量k=1)時,Dwith就是所有數(shù)據(jù)點(diǎn)與其質(zhì)心xˉ的距離之和,即取Dwith(k)的極大值。隨著聚類數(shù)量k的增加,類內(nèi)距離之和函數(shù)Dwith(k)是遞減的。

    定義3 聚類有效性評價函數(shù) 在聚類空間I上,基于類間質(zhì)心距離之和Dbetw與類內(nèi)距離之和Dwith,定義一種綜合評價函數(shù)(指標(biāo)):

    式中,|?|表示取絕對值。當(dāng)所有數(shù)據(jù)樣本點(diǎn)都屬于同一類(聚類數(shù)量k=1)時,由于Dbetw(k)=0,則f(k)=1。顯然,隨著聚類數(shù)量k的變化,函數(shù)f(k)的值也發(fā)生相應(yīng)變化,即f(k)是以聚類數(shù)量k為自變量的函數(shù)。對于K-均值算法,最好的聚類效果意味著聚類數(shù)量k是最優(yōu)的,因此將f(k)稱為聚類有效性評價函數(shù)(指標(biāo))。

    在統(tǒng)計學(xué)中,經(jīng)驗(yàn)規(guī)則(empirical rules)[20]常用來預(yù)測最終的結(jié)果,它也稱為3σ 規(guī)則或68-95-99.7 規(guī)則。經(jīng)驗(yàn)規(guī)則表明:對于正態(tài)分布,幾乎所有的觀測數(shù)據(jù)X都將落在平均值E[X]的3 個標(biāo)準(zhǔn)差σ 之內(nèi)。具體地說,68%的數(shù)據(jù)落在平均值的1 個σ 之內(nèi),95%的數(shù)據(jù)落在平均值的2 個σ 之內(nèi),99.7%的數(shù)據(jù)落在平均值的3 個σ 之內(nèi)[21]。在某些情況下,獲取數(shù)據(jù)的分布可能很耗時,甚至是不可能的,因此正態(tài)概率分布可以作為一種臨時啟發(fā)式(heuristic)方法,如當(dāng)一家公司正在審查其質(zhì)量控制措施或評估其風(fēng)險暴露(risk exposure)時,風(fēng)險價值(value-at-risk)作為常用的風(fēng)險工具,假設(shè)風(fēng)險事件的概率服從正態(tài)分布,對于服從其他分布的觀測數(shù)據(jù)來說,將經(jīng)驗(yàn)規(guī)則推廣為經(jīng)驗(yàn)貝葉斯規(guī)則(empirical Bayes rules)[22-23],則可實(shí)現(xiàn)對具有k類的觀測數(shù)據(jù)總體進(jìn)行推斷。因此,在計算出數(shù)據(jù)的均值和標(biāo)準(zhǔn)偏差之后,經(jīng)驗(yàn)規(guī)則可用于粗略地估計觀測數(shù)據(jù)總體中所隱含的數(shù)據(jù)類k的數(shù)量范圍。

    定理 最佳聚類數(shù)量準(zhǔn)則 在聚類空間I 上,根據(jù)經(jīng)驗(yàn)規(guī)則,可以估計出聚類數(shù)量k可能的最小值kmin和最大值kmax,因而獲得k的取值范圍[kmin,kmax]。當(dāng)k在[kmin,kmax]變化時,如果聚類有效性評價函數(shù)f(k)獲得最小值,則K-均值算法的聚類效果為最優(yōu),即對應(yīng)的最佳聚類數(shù)量k為:

    證明:由定義1 可知,類間質(zhì)心距離之和Dbetw(k)是聚類數(shù)量k的單調(diào)增函數(shù),由定義2 可知,類內(nèi)距離之和Dwith(k)是k的單調(diào)減函數(shù)。因此隨著k取值的變化,由定義3 可知,聚類有效性評價函數(shù)f(k)存在極小值,但并不存在有限的極大值。換句話說,函數(shù)f(k)可能取值為無窮大,此時對應(yīng)的聚類數(shù)量k是不合理的。

    在實(shí)際應(yīng)用中,聚類數(shù)量k只能取正整數(shù),而且函數(shù)Dbetw(k)和Dwith(k)也都只能取正實(shí)數(shù)值(非負(fù)值)。在k的有限取值范圍[kmin,kmax]內(nèi),函數(shù)f(k)一定存在有全局的極小值,即最小值。顯然,聚類有效性評價函數(shù)的最小值所對應(yīng)的k值就是數(shù)據(jù)集的最優(yōu)聚類數(shù)量。由定義3 可知,只有當(dāng)Dbetw(k)和Dwith(k)的取值相等或二者非常接近時,函數(shù)f(k)才能取得最小值。換句話說,通過調(diào)整聚類數(shù)量k的取值使得Dbetw(k)和Dwith(k)達(dá)到最接近的程度,K-均值聚類的效果才是最佳的,此時對應(yīng)的聚類數(shù)量k值就使得數(shù)據(jù)的分類達(dá)到最優(yōu)。因此,利用聚類有效性評價函數(shù)f(k)作為確定最佳聚類數(shù)量k的準(zhǔn)則,也就是確定f(k)的最小值準(zhǔn)則。

    為了找到K-均值算法的最佳聚類數(shù)量k,從可視化的角度,在k值的可能變化范圍[kmin,kmax]內(nèi),通過繪制聚類有效性評價函數(shù)f(k)隨聚類數(shù)量k的變化曲線,直觀地搜尋函數(shù)f(k)的最小值點(diǎn)所對應(yīng)的聚類數(shù)量k,即為最佳的聚類數(shù)量。

    3 驗(yàn)證與分析

    為了驗(yàn)證本文提出的聚類有效性評價函數(shù)的性能以及由此獲得的最佳聚類數(shù)k是否符合數(shù)據(jù)本身內(nèi)在的分類結(jié)構(gòu),利用加州大學(xué)歐文分校的機(jī)器學(xué)習(xí)庫(UC Irvine machine learning repository)中的多個數(shù)據(jù)集進(jìn)行仿真實(shí)驗(yàn)。

    仿真PC 機(jī)的CPU 為:Intel(R) Celeron(R)1007U-1.5 GHz,內(nèi)存4 GB,操作系統(tǒng)為Windows 10,仿真是在MATLAB 9 (R2016a)上運(yùn)行。

    對于數(shù)據(jù)的分類與聚類問題,最常用的UCI數(shù)據(jù)集有Iris、Seeds 和Wind 數(shù)據(jù)集。這3 種數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)樣本數(shù)量、屬性(特征)數(shù)量以及數(shù)據(jù)真實(shí)的聚類數(shù)量如表1 所示。

    表1 3 種UCI 數(shù)據(jù)集的有關(guān)信息

    仿真的基本過程為:對于每一種數(shù)據(jù)集,根據(jù)經(jīng)驗(yàn)規(guī)則估計數(shù)據(jù)的可能聚類數(shù)量范圍[kmin,kmax]。在這個范圍內(nèi)的每個k值,首先分別運(yùn)行K-均值算法一次,并計算相對應(yīng)的聚類有效性評價函數(shù)f(k)。然后多次運(yùn)行K-均值算法以觀察函數(shù)f(k)的變化趨勢,從而對聚類有效性評價指標(biāo)f(k)的平均性能進(jìn)行測試。

    3.1 數(shù)據(jù)集Iris 的仿真

    鳶尾花Iris 數(shù)據(jù)集記錄了3 種花setosa、versicolor 和virginica 的4 種屬性,即萼片長(sepal length)表示為x1、萼片寬(sepal width)表示為x2、花瓣長(petal length)表示為x3、花瓣寬(petal width)表示為x4。3 種花各記錄了50 組特征(即屬性)的數(shù)據(jù),按照setosa、versicolor 和virginica 的順序存放。

    為了觀察Iris 數(shù)據(jù)集對應(yīng)特征的統(tǒng)計中心位置,即不同屬性值的分布范圍所圍繞的大致中心,首先計算出每種鳶尾花的4 個屬性,即變量x1,x2,x3,x4的均值,如表2 和圖1 所示。

    圖1 3 種鳶尾花特征變量均值的條形圖

    表2 3 種花4 個屬性的均值 cm

    根據(jù)數(shù)據(jù)樣本數(shù)量以及經(jīng)驗(yàn)規(guī)則,設(shè)Iris 數(shù)據(jù)可能的聚類數(shù)量范圍為[kmin,kmax],其中kmin=2,kmax=12。對于[kmin,kmax]中的每個k值,運(yùn)行K-均值算法一次,并計算出相對應(yīng)的聚類有效性評價函數(shù)f(k)的值,其結(jié)果如表3 和圖2 所示。

    表3 Iris 數(shù)據(jù)的f(k)與k 的對應(yīng)表

    圖2 Iris 數(shù)據(jù)的f(k)隨聚類數(shù)量k 的變化曲線

    從圖2 和表3 可以看出:1)函數(shù)f(k)隨著k值做相應(yīng)變化,這就說明聚類有效性評價函數(shù)f(k)用來對聚類數(shù)量k的選擇進(jìn)行評價是有效的;2)當(dāng)k=3 時,f(k)取得最小值,即最佳的聚類數(shù)量為3。這個結(jié)果證明聚類有效性評價函數(shù)f(k)能夠從Iris 數(shù)據(jù)集中找出最佳的聚類數(shù)量,即真實(shí)的鳶尾花所包含的種類。

    這里需要說明,K-均值算法的另一個缺陷是它可以收斂到局部最優(yōu),而且每次運(yùn)行K-均值算法時,初始的聚類中心是從所有數(shù)據(jù)中隨機(jī)選取的。因此算法要求必須有一個合理的初始化,在實(shí)際應(yīng)用中這是不現(xiàn)實(shí)的。對于不同的初始劃分,將導(dǎo)致K-均值算法收斂到不同的質(zhì)心位置。一種解決方案是通過重復(fù)運(yùn)行K-均值算法多次,并以多次運(yùn)行的平均結(jié)果來降低隨機(jī)初始化的影響。為此,將K-均值算法按照上述的仿真條件重復(fù)運(yùn)行10次,每次分別記錄下對應(yīng)的聚類有效性評價函數(shù)f(k)的值。為觀察方便,這里僅繪制出每次運(yùn)行中函數(shù)f(k)隨聚類數(shù)量k的變化曲線,其結(jié)果如圖3所示。

    圖3 10 次運(yùn)行中Iris 數(shù)據(jù)的f(k)隨k 變化的曲線

    從圖3 可以看出,雖然K-均值算法的10 次運(yùn)行結(jié)果各不相同,但在每次運(yùn)行中,聚類有效性評價函數(shù)f(k)的最小值都是在k=3 時取得的,這是不變的。圖3 的結(jié)果說明f(k)對于確定最佳聚類數(shù)量是有效的。

    在多次運(yùn)行K-均值算法的基礎(chǔ)上,再考慮聚類有效性評價函數(shù)f(k)的平均性能。對于每個可能的k值,將10 次運(yùn)行的f(k)求平均值可得到E[f(k)],其結(jié)果如表4 和圖4 所示。可以看出,聚類有效性評價函數(shù)f(k)在K-均值算法10 次運(yùn)行中的平均值E[f(k)]仍然在k=3 時取得最小值,這也反映了Iris 數(shù)據(jù)集中真實(shí)的鳶尾花品種為k=3。另外,由于K-均值算法對數(shù)據(jù)采用隨機(jī)的初始劃分,使得每次運(yùn)行獲得的聚類中心位置并不相同,但從多次運(yùn)行的結(jié)果來看,E[f(k)]仍然能夠準(zhǔn)確地反映Iris 數(shù)據(jù)集的本質(zhì)結(jié)構(gòu)。即聚類有效性評價函數(shù)對K-均值的隨機(jī)初始化具有魯棒性(robustness)。

    表4 Iris 數(shù)據(jù)的E[f(k)]值與k 的對應(yīng)表

    圖4 10 次運(yùn)行中Iris 數(shù)據(jù)的E[f(k)]隨k 變化的曲線

    3.2 數(shù)據(jù)集Seeds 的仿真

    種子(Seeds)數(shù)據(jù)包括3 種小麥粒(wheat kernels)的7 個幾何參數(shù)(屬性):面積(area)x1、周長(perimeter)x2、密度(compactness)x3、長度(length)x4、寬度(width)x5、不對稱系數(shù)(asymmetry coefficient)x6、溝槽長度(length of kernel groove)x7。顯然,這些屬性的度量單位是不相同的。Seeds 數(shù)據(jù)集對每一類小麥分別記錄了70 組特征的數(shù)據(jù),按照類標(biāo)簽1、2、3 的順序存放。

    對于Seeds 數(shù)據(jù),分別計算3 類(class 1, 2,3)小 麥7 個 屬 性x1,x2, ···,x7的 均 值,如 圖5 所示。以上均值給出的是3 類小麥所有樣本幾何參數(shù)的分布中心。根據(jù)數(shù)據(jù)集的樣本數(shù)量以及經(jīng)驗(yàn)規(guī)則,設(shè)Seeds 數(shù)據(jù)集中可能的聚類數(shù)量范圍為[kmin,kmax],其中kmin=2,kmax=13。對于[kmin,kmax]中的每個k值,運(yùn)行K-均值算法一次,并計算出相對應(yīng)的聚類有效性評價函數(shù)f(k),其結(jié)果如圖6所示。

    圖5 3 種小麥特征變量均值的條形圖

    由聚類有效性評價函數(shù)(指標(biāo))的定義可知,若所有數(shù)據(jù)都屬于同一類(即k=1),則指標(biāo)f(k)=1。為了便于觀察和比較,在圖6 中還給出了k=1 的波形??梢钥闯觯?dāng)k=3 時,聚類有效性評價指標(biāo)f(k)取得一個最小值0.327 1,即給出了K-均值算法的最佳聚類數(shù)量為3。這一結(jié)果與Seeds 數(shù)據(jù)集的實(shí)際情況是一致的。

    圖6 Seeds 數(shù)據(jù)的f(k)隨聚類數(shù)量k 的變化曲線

    同樣地,為了考察K-均值算法在重復(fù)多次運(yùn)行情況下的整體性能。對于Seeds 數(shù)據(jù)集,在k的可能取值范圍[kmin,kmax]內(nèi)重復(fù)運(yùn)行K-均值算法15 次,每次運(yùn)行記錄和保存聚類有效性評價函數(shù)f(k)的對應(yīng)值,其結(jié)果如圖7 所示??梢钥吹剑贙-means 算法的15 次運(yùn)行中,盡管每次運(yùn)行f(k)的取值以及取值的分布情況都不相同,但是指標(biāo)f(k)的最小值毫無例外地在k=3 時獲得。這表明聚類有效性評價函數(shù)f(k)在確定最優(yōu)聚類數(shù)量方面的性能是非常穩(wěn)定的。

    對于每個可能的k值,把上述15 次K-均值算法運(yùn)行所得到的f(k)值取平均得到E[f(k)],繪制出E[f(k)]隨k值變化的曲線如圖8 所示。

    由圖8 可以看出,從聚類有效性評價函數(shù)的平均性能E[f(k)]仍然可以清晰地識別出Seeds 數(shù)據(jù)集的真實(shí)聚類結(jié)構(gòu)(k=3)。另外,從圖7 和圖8 的結(jié)果可知,在最優(yōu)聚類數(shù)量的確定方面,指標(biāo)f(k)以及其平均值E[f(k)]的性能不會受到K-均值算法隨機(jī)初始化的影響。

    圖7 15 次運(yùn)行中Seeds 數(shù)據(jù)的f(k)隨k 變化的曲線

    圖8 15 次運(yùn)行中Seeds 數(shù)據(jù)的E[f(k)]隨k 變化的曲線

    3.3 數(shù)據(jù)集Wine 的仿真

    葡萄酒(Wine)數(shù)據(jù)是對在意大利同一地區(qū)種植,但來自3 個不同品種的葡萄酒進(jìn)行化學(xué)分析的結(jié)果。這種分析確定了3 種類型的葡萄酒中所含13 種成分(屬性、特征)的含量。這些屬性分別為酒精(x1)、蘋果酸(x2)、灰(x3)、灰分堿度(x4)、鎂(x5)、總酚(x6)、黃酮素類化合物(x7)、非黃酮類酚類(x8)、原花青素(x9)、顏色強(qiáng)度(x10)、色調(diào)(x11)、稀釋葡萄酒的OD280/OD315(x12)和脯氨酸(x13)。這些特征值的度量單位是不相同的。Wine數(shù)據(jù)集中共記錄了178 組數(shù)據(jù),3 種類型葡萄酒的類標(biāo)簽分別為1, 2, 3,它們各自的樣本數(shù)分別為59, 71, 48。對于Wine 數(shù)據(jù)集,由于不同屬性(變量)的取值之間差距太大(相差3 720 倍),無法用圖形表示變量的均值。這里僅給出全部13 個變量的平均值(包括所有葡萄酒的種類),其結(jié)果如表5所示。

    表5 Wine(全部種類)數(shù)據(jù)各屬性的平均值

    Wine 數(shù)據(jù)的均值給出了各屬性值分布的大致統(tǒng)計中心??紤]到Wine 數(shù)據(jù)集的屬性較多,根據(jù)經(jīng)驗(yàn)規(guī)則將數(shù)據(jù)可能的聚類數(shù)量設(shè)置為kmin=2,kmax=16。首先對于區(qū)間[kmin,kmax]中的每個k值,運(yùn)行K-均值算法一次,并計算出相對應(yīng)的聚類有效性評價函數(shù)f(k)的值,其結(jié)果如表6 和圖9 所示。

    表6 Wine 數(shù)據(jù)的f(k)與k 的對應(yīng)表

    圖9 Wine 數(shù)據(jù)的f(k)隨聚類數(shù)量k 的變化曲線

    為觀察方便,圖9 也給出了k=1 對應(yīng)的數(shù)據(jù)。由于f(k)取值的范圍較大,最小值附近其差別不易區(qū)分,為此把圖9 中的數(shù)據(jù)列在表6 中。從表6 中的數(shù)據(jù)可知,f(2)是f(3)的143 倍,f(4)是f(3)的236 倍。顯然,k=3 是指標(biāo)f(k)的最小值點(diǎn),即k=3 是最優(yōu)的聚類數(shù)量,這與Wine 數(shù)據(jù)本質(zhì)結(jié)構(gòu)是一致的。

    類似地,對于Wine 數(shù)據(jù)集,在可能的聚類數(shù)量范圍[kmin,kmax]內(nèi)重復(fù)運(yùn)行K-均值算法15 次,計算并記錄每次運(yùn)行中指標(biāo)f(k)的取值,其結(jié)果如圖10 所示。

    從圖10 也可看出,在運(yùn)行K-均值算法的過程中,由于指標(biāo)f(k)的取值范圍較大,在它的最小值點(diǎn)附近的指標(biāo)f(k)取值也不易區(qū)分。為此,考慮15 次運(yùn)行K-均值算法得到的平均性能E[f(k)],其結(jié)果如圖11所示。

    圖10 15 次運(yùn)行中Wine 數(shù)據(jù)的f(k)隨k 變化的曲線

    從圖11 可以看出,對于Wine 數(shù)據(jù),隨著聚類數(shù)量k值的增加,指標(biāo)的平均值E[f(k)]曲線變化的大致趨勢是:當(dāng)k<3 時,E[f(k)]曲線是遞減的;當(dāng)k>3 時,E[f(k)]曲線是遞增的,因此在k=3 時取得E[f(k)]的最小值。為了更清楚地比較在E[f(k)]最小值附近數(shù)值上的差別,將圖11 中的E[f(k)]值列在表7 中。可以看出,E[f(2)]大約是E[f(3)]的3.65 倍,而E[f(4)]大約是E[f(3)]的6.8 倍。

    圖11 15 次運(yùn)行中Wine 數(shù)據(jù)的E[f(k)]隨k 變化的曲線

    表7 Wine 數(shù)據(jù)的E[f(k)]值與k 的對應(yīng)表

    盡管Wine 數(shù)據(jù)集的平均性能E[f(k)]的取值范圍相當(dāng)大,但從它的全局極小值即最小值來說,仍然能辨別出k=3 是Wine 數(shù)據(jù)集最優(yōu)的聚類數(shù)量。

    從以上對3 個UCI 數(shù)據(jù)集(Iris, Seeds, Wine)的仿真結(jié)果可知,利用聚類有效性評價函數(shù)f(k),不僅能夠?qū)υ紨?shù)據(jù)集提供最優(yōu)的聚類數(shù)量,而且從多次重復(fù)運(yùn)行K-均值算法的效果來看,函數(shù)f(k)還能夠?qū)﹄S機(jī)初始化提供很強(qiáng)的魯棒性。

    4 結(jié) 束 語

    為了克服K-均值聚類算法需要用戶預(yù)先指定聚類數(shù)量的缺陷,本文對K-均值算法的基本迭代步驟和聚類有效性進(jìn)行了分析;然后,基于數(shù)據(jù)點(diǎn)的歐幾里得距離,給出了類間質(zhì)心距離之和、類內(nèi)距離之和的定義,用于度量不同聚類間和同一聚類的數(shù)據(jù)距離;最后,提出了一種由類間質(zhì)心距離之和與類內(nèi)距離之和構(gòu)造而成的聚類有效性評價函數(shù),用以確定數(shù)據(jù)最優(yōu)的聚類數(shù)量。在數(shù)據(jù)可能的聚類數(shù)量范圍內(nèi),利用求解聚類有效性評價函數(shù)的最小值來確定K-均值算法的最佳聚類數(shù)量。通過對UCI 中Iris、Seeds 和Wine 數(shù)據(jù)集的仿真,證明了所提出的聚類有效性評價函數(shù)不僅能夠準(zhǔn)確地反映原始數(shù)據(jù)的真實(shí)聚類結(jié)構(gòu),而且還能有效地降低K-均值算法對隨機(jī)初始化的敏感性。

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