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    雞交叉喙研究進(jìn)展

    2022-11-29 12:38:48石雷孫研研李云雷白皓陳繼蘭

    石雷,孫研研,李云雷,白皓,陳繼蘭*

    (1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所,農(nóng)業(yè)部動(dòng)物遺傳育種與繁殖(家禽)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193;2.河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,河北 保定 071001;3.揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,江蘇 揚(yáng)州 225009;4.揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)業(yè)科技發(fā)展研究院,教育部農(nóng)業(yè)與農(nóng)產(chǎn)品安全國(guó)際合作聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,江蘇 揚(yáng)州 225009)

    交叉喙特征為上下喙錯(cuò)位、咬合不全、呈交叉狀態(tài),發(fā)生率在2%左右[1-3]。地方雞種如北京油雞、絲羽烏骨雞和惠陽(yáng)胡須雞等均有不同程度的交叉喙現(xiàn)象。喙畸形雞無(wú)法正常采食飲水,導(dǎo)致生長(zhǎng)發(fā)育受阻,死亡率通常高出正常雞數(shù)倍[4-6],即使存活下來(lái),成年后的繁殖力也低于正常雞50%以上[7],該性狀制約著地方雞的產(chǎn)業(yè)化發(fā)展。喙同時(shí)是禽類重要的觸覺(jué)感受器[8-9]和溫度調(diào)節(jié)器[10-17],畸形喙也嚴(yán)重?fù)p害了動(dòng)物福利。

    雞交叉喙的形成包括遺傳和非遺傳兩種因素。Yamauchi等[18]報(bào)道,斷喙操作可使雞群交叉喙發(fā)生率達(dá)到16.3%。然而,未斷喙的雞也會(huì)發(fā)生交叉喙現(xiàn)象,研究人員結(jié)合交配試驗(yàn)證實(shí)了交叉喙具有遺傳性[5-7]。近幾年,關(guān)于雞交叉喙發(fā)生原因和遺傳機(jī)制的研究不斷深入[4-6],本文對(duì)交叉喙性狀研究進(jìn)展進(jìn)行綜述,以期為后續(xù)相關(guān)工作的開(kāi)展提供參考。

    1 交叉喙發(fā)生率

    1934年至今,全球已公開(kāi)報(bào)道10余個(gè)雞種存在遺傳性交叉喙現(xiàn)象,發(fā)生率介于0.20%~7.40%(表1)。本課題組調(diào)研發(fā)現(xiàn),北京油雞、貴妃雞、惠陽(yáng)胡須雞、絲羽烏骨雞、象洞雞、河田雞和洪山雞等品種也存在交叉喙,發(fā)生率為0.03%~2.00%。

    表1 不同雞品種交叉喙發(fā)生率Table 1 Incidence of crossed beak in different chicken strains

    北京油雞在排除不良孵化條件和營(yíng)養(yǎng)等非遺傳因素后,每個(gè)世代繁種時(shí)仍有少量個(gè)體發(fā)生交叉喙。北京畜牧獸醫(yī)研究所培育的第12世代北京油雞交叉喙個(gè)體向上追溯4代,發(fā)現(xiàn)存在共同祖先。另外,白皓[24]通過(guò)構(gòu)建交叉喙資源群體,發(fā)現(xiàn)親本均為交叉喙時(shí),子一代的交叉喙發(fā)生率高達(dá)7.8%,是同期正常繁育群體的11.8倍,由此推斷交叉喙具有遺傳性。Landauer[20]對(duì)交叉喙性狀的遺傳調(diào)控研究表明,交叉喙的Silver Spangled Hamburgh雞群近交可使后代交叉喙發(fā)生率提高至50%[20]。

    綜上所述,交叉喙具有遺傳性,并廣泛分布于全球多個(gè)雞種中。我國(guó)地方雞種資源豐富,未來(lái)有必要對(duì)這些資源進(jìn)行詳細(xì)的調(diào)研,以完善交叉喙在國(guó)內(nèi)雞種的分布研究。

    2 交叉喙表型分類與特征

    表型是機(jī)體內(nèi)許多分子生物學(xué)過(guò)程發(fā)生發(fā)展的結(jié)果,認(rèn)識(shí)交叉喙的表型特征是深入研究遺傳機(jī)理的前提,對(duì)深入理解基因組對(duì)交叉喙表型的復(fù)雜作用具有重要作用。

    2.1 交叉喙表型分類

    1938年,Landauer[20]通過(guò)觀察Silver Spangled Hamburgh和白來(lái)航雞(White Leghorn)等品種的交叉喙表型特征,提出交叉喙存在4種類型,其中,Ⅰ型和Ⅱ型分別由不良孵化條件和致死基因引起,Ⅲ型和Ⅳ型由遺傳因素導(dǎo)致。Ⅰ型和Ⅱ型交叉喙特征為雞胚或雛雞缺少某一側(cè)眼球或同時(shí)缺少兩側(cè)眼球,引起上喙偏向無(wú)眼球或眼球缺失嚴(yán)重的一側(cè)。Ⅲ型交叉喙的雛雞出殼時(shí)面部完整,喙形正常,但在隨后1~2個(gè)月內(nèi)逐漸表現(xiàn)交叉喙,并隨日齡增長(zhǎng)喙畸形逐漸加重。Ⅲ型交叉喙表現(xiàn)為上喙偏離中軸線,且上喙右偏的頻率高于左偏,個(gè)體間畸形程度差別也較大。輕度交叉喙個(gè)體的上喙只在其遠(yuǎn)端處扭曲,重度交叉喙個(gè)體的上喙則從顱面骨處開(kāi)始扭曲,并伴有鼻骨和眼眶骨不對(duì)稱,最終導(dǎo)致顱面骨畸形。Ⅳ型交叉喙在白來(lái)航雞(White Leghorn)中發(fā)生率較高,特點(diǎn)為胚胎期表現(xiàn)交叉喙,但個(gè)體在出殼后的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中會(huì)逐漸恢復(fù)正常。Landauer[20]系統(tǒng)歸納了各類交叉喙表型特征,推測(cè)各類型形成原因,為后續(xù)雞交叉喙的研究奠定了基礎(chǔ)。

    21世紀(jì)以來(lái),國(guó)內(nèi)外學(xué)者發(fā)現(xiàn)地方雞種同樣存在交叉喙現(xiàn)象。Joller等[5]、Hong等[4]和白皓[24]分別在Appenzeller Barthuhn雞、惠陽(yáng)胡須雞和北京油雞群體中發(fā)現(xiàn)交叉喙,主要特征為剛出殼的雛雞喙形正常,但在飼養(yǎng)過(guò)程中部分個(gè)體逐漸出現(xiàn)喙畸形,與Landauer[20]提出的Ⅲ型交叉喙發(fā)生規(guī)律相同。深入分析發(fā)現(xiàn),Appenzeller Barthuhn雞、惠陽(yáng)胡須雞和北京油雞均以下喙偏轉(zhuǎn)為主,發(fā)生率分別為98.70%,68.67%和95.77%[5],但下喙偏轉(zhuǎn)方向無(wú)顯著差異,與Landauer[20]報(bào)道的Silver Spangled Hamburgh交叉喙雞多以上喙偏轉(zhuǎn)、右偏為主的結(jié)果不同,其原因可能是不同品種間遺傳背景不同所造成的表型差異。另外,Hong等[4]測(cè)量雞面部對(duì)稱性發(fā)現(xiàn),交叉喙雞存在面部扭曲和不對(duì)稱情況,這與Landauer[20]報(bào)道的交叉喙可導(dǎo)致雞顱面骨畸形的結(jié)論一致。

    2.2 交叉喙表型特征

    Shi等[22]研究北京油雞交叉喙發(fā)生規(guī)律發(fā)現(xiàn),交叉喙發(fā)生率在0日齡時(shí)僅為0.09%,隨后以每周10%~20%的發(fā)生率增加,6周齡達(dá)到總發(fā)生率的93.33%,直至8周齡不再新增交叉喙個(gè)體。與此同時(shí),交叉角度隨日齡的增長(zhǎng)也逐漸增大,直至8周齡時(shí),交叉角度達(dá)到最大。上述結(jié)果與Landauer[20]報(bào)道的Ⅲ型交叉喙表型特征一致。因此,目前發(fā)現(xiàn)的地方雞種交叉喙多與Landauer[20]報(bào)道的Ⅲ型特征相同。

    朱靜等[23]和Shi等[22]詳細(xì)分析了交叉喙雞的顱骨特點(diǎn),首次報(bào)道北京油雞交叉喙由左右側(cè)下頜骨長(zhǎng)度不等導(dǎo)致,即某一側(cè)下頜骨支短于對(duì)側(cè)正常骨支,下喙偏向于下頜骨短支側(cè)(圖1)。同時(shí),下喙彎曲偏離中軸線,阻礙了上下喙的正常閉合,導(dǎo)致畸形個(gè)體在采食和飲水過(guò)程中短側(cè)骨支與其同側(cè)顴弓骨的頻繁碰撞,進(jìn)而引起顴弓骨變形,最終畸形的顴弓骨造成上喙偏轉(zhuǎn)和顱面骨扭曲。北京油雞群體也存在上下喙同時(shí)向一側(cè)偏轉(zhuǎn)的情況,發(fā)生率為0.28%,解剖發(fā)現(xiàn)同樣為雙側(cè)下頜骨支長(zhǎng)度不對(duì)稱,并伴有顴弓骨畸形[22]。因此,確定下頜骨支生發(fā)中心逐漸成為解析交叉喙的關(guān)鍵。Shi等[22]進(jìn)一步分析下頜骨HE染色切片,發(fā)現(xiàn)下頜骨髁部存在不同發(fā)育階段的成骨細(xì)胞,進(jìn)而確定了骨支的生發(fā)中心是下頜骨髁部。人類相關(guān)研究也表明,單側(cè)下頜骨髁部功能損傷可導(dǎo)致下頜骨不對(duì)稱[25-26],提示下頜骨髁部功能異常引起雞交叉喙。

    圖1 正常喙與交叉喙北京油雞顱骨解剖觀察[22]Fig.1 Morphological observation of crossed beak and normal beak in Beijing-You chickens[22]

    綜上所述,交叉喙表型的復(fù)雜性為遺傳方式和分子機(jī)制的研究帶來(lái)了難度。目前,北京油雞的致畸原因分析較為全面,包括致畸部位定位和發(fā)病時(shí)間規(guī)律,為后續(xù)深入探究交叉喙性狀的遺傳機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。然而,目前仍無(wú)法解釋上喙彎曲而下喙正常類型的發(fā)病原因。在人類醫(yī)學(xué)中,同樣存在因下頜骨疾病導(dǎo)致咬合不全,顱面骨不對(duì)稱等疾病,包括安氏Ⅲ錯(cuò)頜和第一、二鰓弓綜合征等[27-29]。人類下頜骨形態(tài)異常的研究已處于發(fā)展相對(duì)較快、趨于成熟和完善的階段,而雞喙形態(tài)的研究相對(duì)較少,尤其是遺傳方面的研究。因此,未來(lái)可以借鑒人類口腔疾病的研究思路和方法,尋找影響交叉喙的遺傳因素。

    3 交叉喙遺傳方式

    遺傳方式是指遺傳信息傳遞的特點(diǎn),可通過(guò)親代與子代遺傳性狀的相似性及其變異情況進(jìn)行分析,研究交叉喙的遺傳方式是解析性狀形成機(jī)制的重要手段。Hutt[30]和Schrapel[31]根據(jù)系譜信息首次提出雞交叉喙性狀是隱性遺傳,后續(xù)多位學(xué)者通過(guò)交配實(shí)驗(yàn)證實(shí),交叉喙是非孟德?tīng)栠z傳的復(fù)雜性狀[6,20,24,32]。

    Landauer[20]將Silver Spangled Hamburgh交 叉喙雞進(jìn)行隨機(jī)交配,發(fā)現(xiàn)后代交叉喙發(fā)生率在0.02%~0.13%。通過(guò)構(gòu)建交叉喙近交群體,后代交叉喙發(fā)生率也僅達(dá)到50%,據(jù)此提出交叉喙并非孟德?tīng)栠z傳性狀,畸形親本的后代正常個(gè)體可能攜帶某種修飾基因而抑制了喙畸形基因的表達(dá);進(jìn)一步研究雜交后代的交叉喙發(fā)生率發(fā)現(xiàn),子一代均未出現(xiàn)交叉喙,推測(cè)可能是不同種群間的交叉喙基因相互獨(dú)立,或者至少在1個(gè)主效基因上存在差異。通過(guò)比較交叉喙與正常個(gè)體的孵化性能,發(fā)現(xiàn)交叉喙性狀并不攜帶致死基因[20,24]。

    Joller等[5]對(duì)Appenzeller Barthuhn雞的交叉喙規(guī)律進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)正常繁種的子一代交叉喙發(fā)生率為2.9%,但雙親均為交叉喙時(shí),子一代交叉喙發(fā)生率提高至15.7%,推測(cè)交叉喙遺傳方式相對(duì)復(fù)雜。白皓[24]利用12只交叉喙公雞先后與24只交叉喙母雞隨機(jī)交配,構(gòu)建了交叉喙資源群體。在獲得的921只子一代個(gè)體中,交叉喙發(fā)生率為7.82%,是同批正常繁育群體的11.84倍(畸形率為0.66%)。另外,子一代交叉喙性別比例約為1∶1?;亟辉囼?yàn)發(fā)現(xiàn),當(dāng)子一代與親本同為交叉喙時(shí),子二代交叉喙發(fā)生率可達(dá)10%。由于交叉喙資源群體并未表現(xiàn)出孟德?tīng)栠z傳規(guī)律,提示交叉喙是由非性染色體參與的復(fù)雜性狀。本課題組通過(guò)對(duì)交叉喙北京油雞與閉鎖繁育且無(wú)交叉喙史的白來(lái)航雞進(jìn)行正反交試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)正交組(北京油雞♂×白來(lái)航♀)子一代交叉喙發(fā)生率為4.48%,反交組(白來(lái)航♂×北京油雞♀)為18.75%。隨后子一代配種(正?!琳?、畸形×正常、畸形×畸形),發(fā)現(xiàn)正交組子二代的畸形率分別為3.83%、6.21%、16.92%,反交組子二代的畸形率分別為8.71%、5.14%、7.34%,上述結(jié)果并未出現(xiàn)明顯規(guī)律,推測(cè)交叉喙是多基因控制的復(fù)雜性狀。

    綜上所述,交叉喙遺傳規(guī)律復(fù)雜已引起諸多學(xué)者關(guān)注,通過(guò)一系列交配試驗(yàn)確定交叉喙是多基因控制的復(fù)雜性狀。另外,交叉喙性狀是否與冠型、胡須、羽色等質(zhì)量性狀存在連鎖關(guān)系還需進(jìn)一步研究。

    4 交叉喙的分子調(diào)控機(jī)制

    隨著高通量測(cè)序技術(shù)快速發(fā)展,國(guó)內(nèi)外學(xué)者專家分別從基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白組等方面研究交叉喙的分子調(diào)控機(jī)制。

    4.1 基因組學(xué)分析

    本課題組利用雞600K的SNP芯片,對(duì)48只交叉喙和48只正常北京油雞進(jìn)行單個(gè)SNP和基于通路的全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome wide association studies,GWAS),檢測(cè)到位于3號(hào)染色體的1個(gè)SNP位點(diǎn)與交叉喙性狀顯著關(guān)聯(lián),以及7個(gè)潛在SNP位點(diǎn),位于1、3、5、6、10和23號(hào)染色體[6,21,33]。針對(duì)上述位點(diǎn)附近的基因進(jìn)行功能注釋,發(fā)現(xiàn)類轉(zhuǎn)錄延伸因子B多肽(transcription elongation factor B polypeptide 3-like,LOC421892)基因、Tudor結(jié)構(gòu)蛋白3(tudor domain containing protein 3,TDRD3)基 因、原癌基因(ret protooncogene,RET)和癌基因1(stathmin 1,STMN1)可能是雞交叉喙性狀的重要候選基因,6條顯著性關(guān)聯(lián)信號(hào)通路包括鈣離子信號(hào)調(diào)控通路、卵母細(xì)胞減數(shù)分裂通路、泛酸和輔酶A的生物合成通路、丙酮酸鹽代謝通路、甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝通路以及核糖體通路。在全基因組拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNV)分析中,6個(gè)CNV區(qū)域的檢出率在交叉喙和正常組之間差異極顯著,在喙畸形雞CNV區(qū)域中鑒定出免疫球蛋白樣多肽(leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2,LRIG2)基因。LRIG2在人、獼猴、犬、牛、鼠等動(dòng)物中高度保守[34],該基因突變可引起人類常染色體隱性、先天性的面部怪異表情疾病[35]。喙的起源和進(jìn)化與神經(jīng)嵴細(xì)胞密切相關(guān)[36],而RET基因在神經(jīng)嵴生長(zhǎng)中具有至關(guān)重要的作用[37]。同時(shí),RET與細(xì)胞增殖相關(guān),當(dāng)基因編碼產(chǎn)物增多或活性增強(qiáng)時(shí),細(xì)胞快速增殖,形成腫瘤[38]。因此,LRIG2可能與RET互作調(diào)控雞喙的發(fā)育,并造成交叉喙。然而,Joller等[5]同樣利用600K的SNP芯片對(duì)53只交叉喙和102只正常Appenzeller Barthuhn雞進(jìn)行GWAS分析,最終并未篩選出與交叉喙性狀顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)。研究結(jié)果的差異可能是由于不同品種間導(dǎo)致交叉喙的基因相互獨(dú)立或主效基因存在差異。綜上,雞交叉喙形成可能與LOC421892、TDRD3、LRIG2、RET、STMN1等位點(diǎn)突變相關(guān)。

    4.2 轉(zhuǎn)錄組與蛋白組學(xué)分析

    朱靜[23]利用數(shù)字基因表達(dá)譜技術(shù)研究交叉喙的形成原因,通過(guò)對(duì)比56日齡交叉喙個(gè)體及其全同胞正常個(gè)體下喙的差異表達(dá)基因,發(fā)現(xiàn)骨形態(tài)發(fā)生蛋白4(bone morphogenetic protein 4,BMP4)、類似爪角蛋白(claw keratin-like,LOC426217)、O-巖藻糖肽3-β-N-乙酰氨基葡萄糖轉(zhuǎn)移酶(lunatic fringe,LFNG)、黏液蛋白(mucin protein,MUC)、乙酰輔酶A?;D(zhuǎn)移酶1(acetyl-coA acyltransferase 1,ACAA1)和醛脫氫酶7家族成員A1(aldehyde dehydrogenase 7 family,member A1,ALDH7A1)等候選基因與交叉喙形成相關(guān)。BMP4位于雞5號(hào)染色體,含有3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子,其表達(dá)產(chǎn)物為骨形成蛋白,參與生物過(guò)程“喙形態(tài)”的條目。同時(shí),BMP4是胚胎期影響雞喙形成的關(guān)鍵基因[39-41]。胚胎發(fā)育過(guò)程中,隨著BMP4增加,喙長(zhǎng)度、寬度、深度也相應(yīng)增長(zhǎng)[24]。另外,Hong等[4]通過(guò)對(duì)105日齡交叉喙雞的下頜骨、頜前骨、額骨和頂骨等進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real time-PCR,qRT-PCR)分析發(fā)現(xiàn),喙畸形雞的下頜骨、頜前骨、淚骨、額骨和頂骨的BMP4表達(dá)量隨交叉喙嚴(yán)重程度增加而上升。由于顱面骨來(lái)源于顱神經(jīng)嵴細(xì)胞[42-43],且顱神經(jīng)嵴細(xì)胞參與調(diào)節(jié)破骨細(xì)胞活性和骨吸收功能[44],因此推測(cè)BMP4過(guò)表達(dá)促使顱神經(jīng)嵴細(xì)胞及其衍生物凋亡[45-47],從而形成交叉喙。LOC426217在畸形喙中顯著上調(diào),并與角蛋白調(diào)控密切相關(guān)[24,48]。通過(guò)對(duì)比交叉喙與正常個(gè)體的LOC426217序列,發(fā)現(xiàn)G36C和A192T在交叉喙雞的基因型頻率顯著高于正常個(gè)體。Joller等[5]對(duì)交叉喙Appenzeller Barthuhn雞的LOC426217測(cè)序,發(fā)現(xiàn)G62T、T24C、G36C、T222C和T363C位點(diǎn)與白皓[49]的SNP結(jié)果一致,進(jìn)一步證實(shí)LOC426217參與雞交叉喙形成。

    白皓[49]基于朱靜[23]數(shù)字基因表達(dá)譜結(jié)果,對(duì)細(xì)胞角蛋白19(cytokeratin 19,CK19)、半乳糖苷酶6(galactosidase alpha,GLA)、ALDH7A1等候選基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄表達(dá)和SNP分析,發(fā)現(xiàn)CK19、GLA在正常喙中高表達(dá),BMP4在交叉喙中高表達(dá)。細(xì)胞角蛋白作為細(xì)胞骨架的重要組成蛋白,對(duì)維持正常細(xì)胞形態(tài)至關(guān)重要。CK19是細(xì)胞角蛋白家族成員之一,該基因的表達(dá)與人類鼻咽癌的分化和轉(zhuǎn)移有關(guān)。通過(guò)直接測(cè)序方法檢測(cè)候選基因的SNP,發(fā)現(xiàn)交叉喙雞CK19啟動(dòng)子區(qū)G272A位點(diǎn)和GLA第7個(gè)外顯子的C4815T位點(diǎn)處未突變,但正常雞的基因型頻率差異顯著。另外,交叉喙雞與正常雞的GLA基因以及內(nèi)含子6區(qū)域的A4552C位點(diǎn)均發(fā)生突變,兩者的基因型頻率差異極顯著。在ALDH7A1基因A7816T位點(diǎn),正常雞未發(fā)生突變,其與喙畸形雞的基因型頻率差異極顯著,因此,CK19、GLA、ALDH7A1可能是交叉喙形成的候選基因。雖然未見(jiàn)上述基因與喙形成相關(guān),但基因調(diào)控本就是復(fù)雜的過(guò)程,具有一因多效或多因一效作用。Sun等[32]利用iTRAQ技術(shù)篩選12日齡的交叉喙和正常雞喙的差異蛋白,發(fā)現(xiàn)清蛋白和脂蛋白脂肪酶是導(dǎo)致雞交叉喙的候選蛋白,并可能在調(diào)節(jié)軟骨、骨細(xì)胞和骨量的細(xì)胞內(nèi)游離鈣離子緩沖方面具有重要作用。綜上,通過(guò)轉(zhuǎn)錄和翻譯水平發(fā)現(xiàn)多個(gè)候選基因差異表達(dá),但其與雞交叉喙的因果關(guān)系仍需進(jìn)一步驗(yàn)證。

    4.3 表觀遺傳學(xué)分析

    交叉喙由單側(cè)下頜骨支發(fā)育緩慢引起,下頜骨髁部是骨支的生發(fā)中心[23]。Shi等[50]對(duì)交叉喙雞雙側(cè)下頜骨髁部進(jìn)行全基因組甲基化測(cè)序(whole genome BS-Seq,WGBS)和RNA-seq聯(lián)合分析,發(fā)現(xiàn)FIGNL1啟動(dòng)子區(qū)存在差異甲基化區(qū)域(圖2),且FIGNL1在交叉喙的短骨支側(cè)髁部表達(dá)下調(diào)。FIGNL1是與細(xì)胞活性蛋白相關(guān)的ATP酶亞組成員,能夠抑制成骨細(xì)胞增殖,促進(jìn)成骨細(xì)胞分化。干擾FIGNL1基因會(huì)降低顱骨細(xì)胞增殖,骨鈣素和堿性磷酸酶表達(dá)下調(diào),進(jìn)而導(dǎo)致成骨細(xì)胞礦化能力下降[51]。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),2個(gè)差異表達(dá)lncRNA(MSTRG.22262.17和MSTRG.22262.19)對(duì)FIGNL1具有順式表達(dá)調(diào)控作用,推測(cè)非編碼RNA通過(guò)調(diào)控靶基因FIGNL1影響下頜骨髁部礦化過(guò)程,進(jìn)而導(dǎo)致交叉喙。

    圖2 FIGNL1的基因組位置信息[50]Fig.2 Genome browser track plot around the FIGNL1 locus[50]

    綜上,高通量測(cè)序已篩選出大量與交叉喙性狀相關(guān)的候選基因、SNP位點(diǎn)和蛋白,但這些遺傳因子的功能還需要在細(xì)胞和個(gè)體水平進(jìn)行驗(yàn)證,以進(jìn)一步揭示交叉喙性狀的分子調(diào)控機(jī)制。另外,隨著單細(xì)胞測(cè)序和ATAC測(cè)序等新技術(shù)的應(yīng)用,將有助于加快解析交叉喙的遺傳機(jī)制。

    5 結(jié)語(yǔ)

    雞交叉喙對(duì)家禽業(yè)造成了一定程度的經(jīng)濟(jì)損失,并阻礙了地方雞種的資源開(kāi)發(fā)和利用,如何檢測(cè)和預(yù)防交叉喙性狀是目前需要解決的難題。交叉喙性狀的遺傳機(jī)制復(fù)雜,已發(fā)現(xiàn)的多個(gè)候選基因尚未完全得到驗(yàn)證,相關(guān)病理通路也有待進(jìn)一步解析。在前期研究的基礎(chǔ)上,建立專門的雞交叉喙近交系,應(yīng)用最新測(cè)序技術(shù),進(jìn)行跨學(xué)科的聯(lián)合性研究,將有助于精準(zhǔn)挖掘雞交叉喙性狀的致病基因和突變位點(diǎn),減少遺傳缺陷的發(fā)病率,最終提升種用價(jià)值,實(shí)現(xiàn)動(dòng)物福利和家禽的健康繁育。

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