丁 萌 王紅娟 周 潔 高 強
膠質(zhì)瘤是顱內(nèi)常見惡性腫瘤[1],常規(guī)采用顯微手術(shù)切除腫瘤聯(lián)合術(shù)后放化療等綜合治療,但是治療效果仍不理想。目前,膠質(zhì)瘤的病因、發(fā)病機制尚不明確。近年來,長鏈非編碼RNA(long chain noncoding RNA,lncRNA)在膠質(zhì)瘤發(fā)病機制中的作用逐漸受到重視[2,3]。lncRNA ZNF674-AS1是近年來發(fā)現(xiàn)的lncRNA,在非小細(xì)胞肺癌[4]、甲狀腺癌[5]和宮頸癌[6]中作為抑癌基因發(fā)揮作用。有研究發(fā)現(xiàn),lncRNA ZNF674-AS1 在腦膠質(zhì)瘤組織中低表達(dá),并且與病人預(yù)后有關(guān)[7],但其作用機制尚不清楚。本研究分析lncRNA ZNF674-AS1 對膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、侵襲和遷移的影響。
1.1 細(xì)胞與試劑 正常星形膠質(zhì)細(xì)胞(HA1800)和膠質(zhì)瘤細(xì)胞(A172、U251、U87、U373)購于中科院上海細(xì)胞庫;DMEM 培養(yǎng)基和胎牛血清購于浙江天杭生物科技股份有限公司;LipofectamineTM 2000試劑購于美國Sigma 公司;ZNF674-AS1 mimics、ZNF674-AS1 inhibitor、SOX9 siRNA 均由上海Gene Pharma 公司合成并提供;雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒購于上海碧云天生物技術(shù)有限公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒及2×SYBR Green PCR Mastermix 試劑盒購于美國Sig?ma 公司;CCK8 細(xì)胞檢測試劑盒及Transwell 小室購于上海語純生物科技有限公司。
1.2 細(xì)胞培養(yǎng) 正常星形膠質(zhì)細(xì)胞(HA1800)和膠質(zhì)瘤細(xì)胞(A172、U251、U87、U373)置于含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基中培養(yǎng),每兩天換液一次,每三天傳代一次。
1.3 RT-PCR 檢測lncRNA ZNF674-AS1 表達(dá)水平收集A172、U251、U87、U373、HA1800 細(xì)胞,加入TRIzol 試劑提取總RNA,通過反轉(zhuǎn)錄獲取cDNA,隨后用熒光定量試劑盒進(jìn)行檢測,操作步驟按照試劑盒說明書進(jìn)行,用2-△△Ct法計算lncRNA ZNF674-AS1相對表達(dá)量。引物序列:lncRNA ZNF674-AS1 上游5′-GGCGATCATACTGGGAGATG-3′,下游5′-TGT?GATTCAAGTTGGGGTCA-3′;內(nèi)參U6 上游5′-CAT?GTACGTTGCTATCCAGGC-3′,下游5′-CTCCTTA?ATGTCACGCACGAT-3′。
1.4 細(xì)胞轉(zhuǎn)染和分組 將膠質(zhì)瘤U87細(xì)胞接種于6孔板,密度為5×105個/孔。待細(xì)胞融合度達(dá)80%時,按照LipofectamineTM 2000 試劑說明書轉(zhuǎn)染陰性對照序列和ZNF674-AS1 mimics(濃度為100 nmol/L),設(shè)置為CON組、ZNF674-AS1過表達(dá)組。
1.5 細(xì)胞增殖能力檢測 用CCK-8 試劑盒檢測細(xì)胞活性。將轉(zhuǎn)染不同質(zhì)粒的膠質(zhì)瘤U87 細(xì)胞培養(yǎng)24 h,每個培養(yǎng)孔添加10 μl CCK-8 試劑。用酶標(biāo)儀檢測450 nm波長處吸光度值。
1.6 細(xì)胞侵襲和遷移能力檢測 應(yīng)用Transwell 實驗檢測細(xì)胞侵襲和遷移。遷移實驗:在Transwell 遷移板上室加入5×104個細(xì)胞,下室中加入600 μl完全培養(yǎng)基,培養(yǎng)24 h 后,甲醇固定膜底細(xì)胞并進(jìn)行0.1%結(jié)晶紫染色20 min,光學(xué)顯微鏡觀察并計數(shù)。侵襲實驗:使用預(yù)先加入Matrigel 膠的小室,上室中加入5×104個細(xì)胞,培養(yǎng)48 h,其余步驟同遷移實驗。
1.7 lncRNAZNF674-AS1 對SOX9 調(diào)控作用的驗證檢索TargetScan 數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)lncRNA ZNF674-AS1 與性別決定區(qū)Y 框蛋白9(sex-determining region Y boxprotein 9,SOX9)基因有互補結(jié)合位點。雙熒光素酶報告實驗確定二者的靶向關(guān)系。構(gòu)建SOX9 基因野生型3'-UTR熒光素酶報告基因質(zhì)粒plncRNAWt、突 變 型 質(zhì) 粒plncRNA-Mut。將plncRNA-Wt、plncRNA-Mut 與ZNF674-AS1 mimics 和對照質(zhì)粒plncRNA-Reporter 共轉(zhuǎn)染U87 細(xì)胞,轉(zhuǎn)染24 h 后加入100 μL PLB 裂解液。參照雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒檢測熒光素酶活性。為進(jìn)一步驗證ln?cRNA ZNF674-AS1 對SOX9 基因的調(diào)控作用,將陰性對照序列(NC 組)、ZNF674-AS1 mimics(ZNF674組)和ZNF674-AS1 inhibitor(ZNF674-AS1 inhibitor組)分別轉(zhuǎn)染至U87細(xì)胞,檢測SOX9 mRNA水平。
1.8 lncRNA ZNF674-AS1 通過SOX9 基因?qū)δz質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、侵襲和遷移的影響 為驗證lncRNA ZNF674-AS1 通過SOX9 基因?qū)δz質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、侵襲和遷移的作用,對U87 細(xì)胞分別轉(zhuǎn)染陰性對照(CON 組)、ZNF674-AS1 mimics(ZNF674-AS1 過表達(dá) 組)、ZNF674-AS1 mimics+SOX9 沉 默 質(zhì) 粒(ZNF674-AS1 過表達(dá)+SOX9 沉默組)。隨后用CCK-8 法檢測細(xì)胞增殖、Transwell 實驗檢測細(xì)胞侵襲和遷移。
1.9 統(tǒng)計學(xué)方法 應(yīng)用SPSS 20.0軟件處理;計量資料以±s表示,采用單因素方差分析和LSD-t檢;P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 膠質(zhì)瘤細(xì)胞lncRNA ZNF674-AS1 的表達(dá) 與正常星形膠質(zhì)細(xì)胞(HA1800)比較,膠質(zhì)瘤細(xì)胞(A172、U251、U87、U373)lncRNA ZNF674-AS1 的表達(dá)水平均明顯降低(P<0.05,圖1);四種膠質(zhì)瘤細(xì)胞中,U87細(xì)胞表達(dá)水平最低。
圖1 正常星形膠質(zhì)細(xì)胞(HA1800)和膠質(zhì)瘤細(xì)胞(A172、U251、U87、U373)lncRNA ZNF674-AS1的表達(dá)水平
2.2 lncRNA ZNF674-AS1對膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、侵襲、遷移的影響 上調(diào)U87 細(xì)胞lncRNA ZNF674-AS1 表達(dá),明顯抑制U87 細(xì)胞增殖、侵襲、遷移(P<0.05;圖2)。
圖2 lncRNA ZNF674-AS1過表達(dá)對U87細(xì)胞增殖、侵襲、遷移的影響
2.3 lncRNA ZNF674-AS1 對SOX9 基因的調(diào)控作用Starbase軟件預(yù)測顯示lncRNA ZNF674-AS1與SOX9基因有結(jié)合位點(圖3A)。雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灲Y(jié)果顯示,上調(diào)lncRNA ZNF674-AS1 表達(dá),明顯抑制plncRNA-Wt 質(zhì)粒熒光素酶活性(P<0.05;圖3B);沉默lncRNA ZNF674-AS1表達(dá),則明顯增強其活性(P<0.05;圖3B)。但是,上調(diào)或沉默lncRNA ZNF674-AS1 表達(dá)并不影響plncRNA-Mut 質(zhì)粒熒光素酶活性(P>0.05;圖3B)。上調(diào)U87 細(xì)胞lncRNA ZNF674-AS1 表達(dá),明顯降低U87 細(xì)胞SOX9 mRNA表達(dá)水平(P<0.05;圖3C);沉默U87 細(xì)胞lncRNA ZNF674-AS1 表達(dá),則明顯升高U87 細(xì)胞SOX9 mRNA表達(dá)水平(P<0.05;圖3C)。
圖3 lncRNA ZNF674-AS1靶基因分析
2.4 lncRNA ZNF674-AS1 靶向調(diào)控SOX9 對膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、侵襲和遷移的影響 上調(diào)U87 細(xì)胞ln?cRNA ZNF674-AS1 表達(dá),明顯抑制U87 細(xì)胞增殖、侵襲和遷移(P<0.05,圖4);上調(diào)lncRNA ZNF674-AS1 表達(dá)的同時沉默SOX9 基因表達(dá),明顯增強U87細(xì)胞增殖、侵襲和遷移(P<0.05,圖4)。
圖4 lncRNA ZNF674-AS1過表達(dá)靶向調(diào)控SOX9對膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、侵襲和遷移的影響
lncRNA 是一類長度超過200 nt 的非編碼RNA,具有轉(zhuǎn)錄后調(diào)控功能[8,9]。研究表明,lncRNA可能是膠質(zhì)瘤的分子生物學(xué)標(biāo)志物,在膠質(zhì)瘤發(fā)生、發(fā)展中起到重要作用,并且對膠質(zhì)瘤診斷、治療和預(yù)后評估有重要價值[10~12]。lncRNA ZNF674-AS1 位于染色體Xp11.23,在非小細(xì)胞肺癌[4]、甲狀腺癌[5]、宮頸癌[6]和肝細(xì)胞癌[13]中低表達(dá),可能作為抑癌基因發(fā)揮作用。Luan等[7]發(fā)現(xiàn)lncRNA ZNF674-AS1在膠質(zhì)瘤中低表達(dá),但是其生物學(xué)機制尚不清楚。
本研究發(fā)現(xiàn),與正常星形膠質(zhì)細(xì)胞(HA1800)比較,膠質(zhì)瘤細(xì)胞(A172、U251、U87、U373)lncRNA ZNF674-AS1 的表達(dá)水平明顯降低。為了進(jìn)一步分析lncRNA ZNF674-AS1 的生物學(xué)機制,我們應(yīng)用U87 細(xì)胞,轉(zhuǎn)染不同質(zhì)粒進(jìn)行上調(diào)或沉默lncRNA ZNF674-AS1表達(dá),結(jié)果顯示,上調(diào)lncRNA ZNF674-AS1,明顯抑制U87 細(xì)胞增殖、侵襲、遷移。說明lncRNA ZNF674-AS1在膠質(zhì)瘤中可能作為抑癌基因發(fā)揮生物學(xué)作用。SOX9基因與腫瘤關(guān)系密切,其高表達(dá)可以誘導(dǎo)膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖,下調(diào)該基因表達(dá)會誘導(dǎo)膠質(zhì)瘤細(xì)胞凋亡,并抑制S期細(xì)胞生長[14,15]。我們用Starbase 軟件預(yù)測顯示lncRNA ZNF674-AS1 與SOX9 基因有結(jié)合位點;雙熒光素酶報告實驗證實SOX9是lncRNA ZNF674-AS1對SOX9的靶基因。
總之,膠質(zhì)瘤lncRNA ZNF674-AS1 呈低表達(dá),可能通過靶向下調(diào)SOX9基因表達(dá),促進(jìn)膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、侵襲和遷移。