楊湘蕃, 張華敏, 唐丹麗, 李 想, 李盈盈, 吳浩南, 劉思鴻△
(1.云南中醫(yī)藥大學(xué), 昆明 650500;2.中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所, 北京 100700;3.中國中醫(yī)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中心, 北京 100700;4.中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研究所, 北京 100700)
目前,中藥處方優(yōu)化方法多為撤藥和拆方,即將大處方拆分為多個小組合,隨后開展多次實(shí)驗(yàn)對比其療效,這需要經(jīng)過數(shù)十次甚至數(shù)百次的實(shí)驗(yàn),花費(fèi)大量的時間和精力,故亟需尋找一種新的處方優(yōu)化方法。課題組前期研發(fā)了一種基于中醫(yī)“君臣佐使”理論的加權(quán)網(wǎng)絡(luò)模塊劃分優(yōu)化方法[1],其以群體協(xié)同為核心開展網(wǎng)絡(luò)模塊劃分,同時參照中醫(yī)君臣佐使理論對藥理網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行加權(quán)處理,并提出了一種尋找網(wǎng)絡(luò)核心節(jié)點(diǎn)的方法。借助網(wǎng)絡(luò)的雙向性,可以從核心節(jié)點(diǎn)反推出核心藥物,從而實(shí)現(xiàn)處方優(yōu)化。
痰瘀同治方是課題組依據(jù)痰瘀同治法提出的臨床有效方,包含赤芍、瓜蔞等藥物。臨床實(shí)踐證明,痰瘀同治方是治療冠心病的有效方劑,具有活血化痰、通陽宣痹之效[2]。痰瘀同治方也是治療心肌缺血再灌注損傷(myocardial ischemia reperfusion injury, MI/RI)的有效中藥復(fù)方。前期研究證實(shí),該方可通過降低炎癥因子、抑制自噬與凋亡和調(diào)節(jié)血脂代謝異常等多途徑起到保護(hù)心肌、改善MI/RI的作用[2-7]。但本方包含13味中藥,藥味繁多、成分復(fù)雜,難以清晰闡明其藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)制。因此,本文將采用基于中醫(yī)“君臣佐使”理論的加權(quán)網(wǎng)絡(luò)模塊劃分優(yōu)化方法對其進(jìn)行優(yōu)化,并通過對比心梗面積、心肌酶譜、氧化應(yīng)激、炎癥因子等指標(biāo)觀察優(yōu)化后的方劑與原方對MI/RI的作用,驗(yàn)證該優(yōu)化方法的有效性與可行性,為中藥復(fù)方優(yōu)化提供新思路和新方法。本研究通過中國中醫(yī)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中心實(shí)驗(yàn)動物倫理委員會審查。
利用公開的中藥成分、靶點(diǎn)和疾病靶點(diǎn)等各類組學(xué)數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建痰瘀同治方抗MI/RI的“成分-靶點(diǎn)-疾病”藥理網(wǎng)絡(luò),在此基礎(chǔ)上根據(jù)君臣佐使理論對網(wǎng)絡(luò)的邊賦予權(quán)重(詳見前期研究)[1]。
采用群體協(xié)同算法,以群體協(xié)同模塊度為目標(biāo),進(jìn)行模塊識別和劃分,利用節(jié)點(diǎn)度中心性(degree centrality,DC)、接近中心性(closeness centrality,CC)和自定義的加權(quán)接近中心性(weighted closeness centrality,WCC)尋找核心成分群(詳見前期研究)[1]。
痰瘀同治方基礎(chǔ)方組成:藥物1~13。優(yōu)化方1組成:藥物1~6。優(yōu)化方2組成:藥物1~5,9,11(優(yōu)化方1和優(yōu)化方2優(yōu)化過程詳見后文)。中藥材購于北京同仁堂飲片有限責(zé)任公司,并由其出具藥材產(chǎn)地及品質(zhì)鑒定證明。
SPF級雄性SD大鼠80只,體質(zhì)量(200±20)g,購于北京維通利華實(shí)驗(yàn)動物技術(shù)有限公司,動物許可證號SCXK-(京)2016-0006。飼養(yǎng)于中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究所動物房,自由攝取滅菌水及普通飼料,飼養(yǎng)環(huán)境為溫度(22±1)℃,濕度(55±5)%。
肌酸激酶(creatine kinase, CK,批號201041)、肌酸激酶同工酶(creatine kinase-MB, CK-MB,批號201011)、乳酸脫氫酶(lactate dehydrogenase, LDH,批號200801)、天門冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(aspartate aminotransferase, AST,批號200801)、谷丙轉(zhuǎn)氨酶(alanine aminotransferase, ALT,批號200951)檢測試劑盒,中生北控生物科技股份有限公司;心肌肌鈣蛋白I(cardiac troponin I, cTnI)Elisa檢測試劑盒(武漢華美生物工程有限公司,批號Y19035697);丙二醛(malondialdehyde, MDA)檢測試劑盒、BCA法蛋白濃度檢測試劑盒(上海碧云天生物技術(shù)有限公司,批號010620200831,042820200913);腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor-α, TNF-α,批號218247-009)、白細(xì)胞介素(interleukin-1β, IL-1β)、IL-6(Elisa檢測試劑盒,賽默飛世爾科技中國有限公司,批號226593-006,219558-006)。
SynrgyH1型多功能酶標(biāo)儀,美國BioTek;Mikro 200 R型高速離心機(jī),德國Hettich;日立7180型全自動生化分析儀,日本HITACHI;Precellys Evolution生物樣品均質(zhì)混勻系統(tǒng),法國Bertin Technologies;ALC-V8型動物呼吸機(jī),上海奧爾科特公司;RM6240系列多道生理信號采集處理系統(tǒng),成都儀器廠。
將80只SD大鼠按隨機(jī)數(shù)表法分為假手術(shù)組、MI/RI模型組、基礎(chǔ)方組、優(yōu)化方1組及優(yōu)化方2組共5組各16只。各組藥物劑量按60 kg成人每日1劑原方用量換算出大鼠每日用量,分別濃縮成含生藥量1.2 g/mL、0.6 g/mL及0.76 g/mL的水煎液[8],按14 g/(kg·d)、7.5 g/(kg·d)、9.42 g/(kg·d)的劑量灌胃給藥,每日1次,連續(xù)給藥3周。假手術(shù)組、MI/RI模型組大鼠按10 mL/kg灌服去離子水。
動物模型的復(fù)制采用課題組前期造模方法[9],大鼠用20%烏拉坦全身麻醉并仰臥位固定,四肢皮下插入電極并連接RM6240系列多道生理信號采集處理系統(tǒng)并記錄心電圖。大鼠頸部和左胸手術(shù)備皮并將氣管接入呼吸機(jī)(呼吸頻率80次/min,吸呼比1∶2,潮氣量8 mL/kg),觀察大鼠呼吸狀態(tài)是否正常。胸骨左側(cè)第3~4肋間逐層打開胸腔,并用彎鑷撕開心包膜使心臟充分暴露,用6-0號縫合線在左心耳下2 mm處結(jié)扎,用粗棉線墊底結(jié)扎冠狀動脈左前降支30 min,后松開縫合線取出棉線再灌注2 h。造模成功標(biāo)準(zhǔn)為缺血時局部心肌壁發(fā)紺、膨出,心電圖ST段明顯抬高或T波高聳。
模型復(fù)制結(jié)束后,打開腹腔,腹主動脈采血,-80 ℃留存血清。心臟灌流后剪取心臟,-80 ℃?zhèn)溆谩?/p>
根據(jù)各指標(biāo)試劑盒說明書用全自動生化分析儀檢測大鼠血清AST、ALT、LDH、CK及CK-MB含量,或采用Elisa法檢測cTnI、IL-1β、IL-6和TNF-α含量。
1.8.1 心肌組織中MDA含量檢測 按照MDA檢測試劑盒和BCA蛋白檢測試劑盒說明書的操作步驟進(jìn)行實(shí)驗(yàn),在450 nm波長處用酶標(biāo)儀測定光密度值,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計算后得出MDA含量。
1.8.2 心肌梗死面積檢測 取全心冷凍20 min后,沿冠狀位由前向后切片,厚度約為2 mm,2,3,5-氯化三苯基四氮唑(2,3,5-triphenyltetrazolium chloride, TTC)染色,觀察心肌梗死情況,其中灰白色為梗死區(qū),深紅色為非梗死區(qū),最后用Image J圖像分析系統(tǒng)處理并計算心肌梗死面積比[10]。
利用以群體協(xié)同為核心的模塊劃分方法,在加權(quán)網(wǎng)絡(luò)中共得到13個群體協(xié)同模塊[11],排除模塊度在0.3以下和模塊中節(jié)點(diǎn)數(shù)目過少(<3)的模塊,共納入10個模塊進(jìn)行分析。圖1、2示,統(tǒng)計所有模塊中每個中藥的DC和CC值,發(fā)現(xiàn)DC值和CC值基本上分布比較平均,僅藥物9在模塊9里出現(xiàn)1個較大的DC值,提示藥物9或許在特定領(lǐng)域中對MI/RI起作用。
圖1 群體協(xié)同模塊中的DC值
圖2 群體協(xié)同模塊中的CC值
在加權(quán)網(wǎng)絡(luò)中,由于權(quán)重系數(shù)及拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的原因,單純用經(jīng)過邊的數(shù)量難以反映2個點(diǎn)之間聯(lián)系的密切程度,于是提出用WCC從加權(quán)網(wǎng)絡(luò)的角度來判斷藥物的中心度,具體算法見前文[11],WCC值越大說明節(jié)點(diǎn)在模塊中的重要性越高。圖3示,統(tǒng)計每個中藥在所有模塊中的WCC值,發(fā)現(xiàn)藥物1、藥物2、藥物3的值較大。然后在模塊度排名前5的5個模塊中,取WCC排名前3位的藥物得到核心藥物組合(藥物1~6)。同時也發(fā)現(xiàn),這幾種藥物的DC值和CC值在模塊中排名靠前,說明這幾味藥物在網(wǎng)絡(luò)中處于核心地位。
圖3 群體協(xié)同模塊中的WCC值
另一方面,對每個模塊進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn),藥物6幾乎在所有的模塊都有出現(xiàn),回溯發(fā)現(xiàn)或許是因?yàn)樗幬?的成分個數(shù)過多,約占總成分個數(shù)的20%(103/504),考慮是否排除藥物6進(jìn)行驗(yàn)證。同時,觀察到特殊的模塊7,其成分個數(shù)大于等于3的藥物僅有藥物6、藥物9、藥物11,且藥物9在模塊9里出現(xiàn)1個非常大的DC值,提示藥物9和藥物11或許在特定領(lǐng)域中對MI/RI起作用。
因此,綜合考慮并擬定出優(yōu)化方1(藥物1~6)和優(yōu)化方2(藥物1~5,9,11)進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
2.2.1 各組大鼠血清LDH、CK、CK-MB和cTnI表達(dá) 表1示,與假手術(shù)組比較,MI/RI模型組大鼠血清LDH、CK、CK-MB和cTnI的含量顯著升高(P<0.01);與MI/RI模型組比較,基礎(chǔ)方組和優(yōu)化方1組血清LDH、CK、CK-MB和cTnI含量顯著下降(P<0.05,P<0.01),組間比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);優(yōu)化方2組血清LDH、CK、CK-MB和cTnI含量比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
表1 各組大鼠血清LDH、CK、CK-MB與cTnI含量比較
2.2.2 各組大鼠血清AST和ALT表達(dá) 表2示,與假手術(shù)組比較,MI/RI模型組大鼠血清AST、ALT及其比值顯著升高(P<0.01);與MI/RI模型組比較,基礎(chǔ)方組和優(yōu)化方1組血清AST、ALT及其比值顯著下降(P<0.05,P<0.01),組間比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),優(yōu)化方2組則僅有AST/ALT顯著下降(P<0.01)。
表2 各組大鼠血清AST、ALT和AST/ALT比較
2.2.3 各組大鼠心肌組織MDA表達(dá) 表3示,與假手術(shù)組比較,MI/RI模型組大鼠心肌MDA含量顯著升高(P<0.05);與MI/RI模型組比較,基礎(chǔ)方組和優(yōu)化方1組心肌MDA含量顯著下降(P<0.05),2組間比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),優(yōu)化方2組變化比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
表3 各組大鼠心肌MDA含量比較
2.2.4 各組大鼠血清IL-6、IL-1β和TNF-α表達(dá)比較 表4示,與假手術(shù)組比較,MI/RI模型組大鼠血清IL-1β、IL-6和TNF-α含量顯著升高(P<0.01);與MI/RI模型組比較,基礎(chǔ)方組血清IL-1β和TNF-α含量顯著降低(P<0.05),優(yōu)化方1組IL-1β、IL-6和TNF-α指標(biāo)含量均顯著降低(P<0.05,P<0.01),優(yōu)化方2組的IL-6和TNF-α含量顯著降低(P<0.05,P<0.01)。
表4 各組大鼠血IL-1β、IL-6與TNF-α含量比較
2.2.5 各組大鼠心肌梗死面積 表5圖4示,與假手術(shù)組比較,MI/RI模型組大鼠心肌梗死面積顯著增加(P<0.01);與MI/RI模型組比較,基礎(chǔ)方組、優(yōu)化方1組和優(yōu)化方2組心肌梗死面積均顯著減小(P<0.01)。
表5 各組大鼠心肌梗死面積比較
圖4 各組大鼠心肌梗死面積比較
中藥處方優(yōu)化的目標(biāo)是形成藥味更簡但療效更優(yōu)或基本不變的新處方。目前最常用的處方優(yōu)化方法為撤藥分析法和拆方分析法。撤藥分析法即將復(fù)方中各個藥物輪流剔除并分組實(shí)驗(yàn),用以判斷剔除的藥物對原本復(fù)方藥效和不良反應(yīng)的影響[11]。這種方法比較適合藥味較少的復(fù)方,如果藥味過大則需要進(jìn)行多次實(shí)驗(yàn),消耗大量的人力、物力,且容易產(chǎn)生較多的誤差。拆方分析則以傳統(tǒng)中醫(yī)藥理論為指導(dǎo),按不同治法或君臣佐使的配伍關(guān)系,或藥物性味的不同,或“藥對”關(guān)系進(jìn)行拆方,分解為不同部分進(jìn)行研究[12]。這是最具中醫(yī)特色的一種研究方法,然而同撤藥分析法一樣,缺點(diǎn)為實(shí)驗(yàn)次數(shù)過多,實(shí)驗(yàn)消耗大及所需時間較長。
隨著生物技術(shù)和信息科學(xué)的發(fā)展及不斷融合,基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)等方面積累了大量的組學(xué)數(shù)據(jù)[13]。整合這些組學(xué)數(shù)據(jù),可以構(gòu)建關(guān)于藥物、基因、疾病、靶點(diǎn)之間復(fù)雜的藥理網(wǎng)絡(luò)。借助藥理網(wǎng)絡(luò)分析,可以篩選中藥活性成分,闡述中藥或者方劑的作用機(jī)理、探討疾病的發(fā)病機(jī)制[14-16]。同時網(wǎng)絡(luò)具有雙向性,這給中藥處方優(yōu)化研究提供了新思路,通過構(gòu)建藥理網(wǎng)絡(luò)、篩選核心節(jié)點(diǎn),可以反向篩選出核心藥物組合,從而大大減少實(shí)驗(yàn)次數(shù),縮短實(shí)驗(yàn)時間,減少人力和物力支出。因此,本研究在前期研究基礎(chǔ)上[2-7]提出了一種新的處方優(yōu)化方法,借助藥理網(wǎng)絡(luò)分析篩選“成分-靶點(diǎn)-疾病”中的核心節(jié)點(diǎn),得出核心成分群,從而擬定出優(yōu)化方。該方法首先聚焦在藥物間的協(xié)同作用上,以群體協(xié)同算法為核心,尋找網(wǎng)絡(luò)中群體與群體之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系,而非個體與個體之間的關(guān)系。其次,當(dāng)前大多數(shù)學(xué)者在構(gòu)建藥理網(wǎng)絡(luò)時,將所有中藥在方劑中的藥效都做了均一性處理,故在網(wǎng)絡(luò)中不會體現(xiàn)出差別,將中醫(yī)君臣佐使方劑配伍理論引入到網(wǎng)絡(luò)模型的構(gòu)建中,能夠提高模塊劃分的質(zhì)量,從而也從側(cè)面證實(shí)了中醫(yī)“君臣佐使”思想對方劑藥理作用的影響。從整體上看,該方法與傳統(tǒng)方法相比能更清晰地發(fā)現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)和關(guān)系,從而能提取出更為準(zhǔn)確的藥物核心成分群,反推出核心藥物組合,實(shí)現(xiàn)中藥方劑的處方優(yōu)化。
基于以上方法,本研究在構(gòu)建痰瘀同治方抗心肌缺血再灌注的藥理網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上,按照君臣佐使理論對網(wǎng)絡(luò)中的邊進(jìn)行加權(quán),使用以群體協(xié)同計算為核心的方法進(jìn)行模塊劃分,得到13個群體協(xié)同模塊。結(jié)合模塊分析和加權(quán)中心性,分析模塊中的核心節(jié)點(diǎn),得到核心成分群,最終反推出優(yōu)化方1和優(yōu)化方2。
現(xiàn)代醫(yī)學(xué)中,MI/RI的發(fā)病機(jī)制較為復(fù)雜,目前認(rèn)為其主要與氧化應(yīng)激、炎癥反應(yīng)等多種病理生理變化有關(guān)[17]。
生理狀態(tài)下,絕大多數(shù)心肌酶和cTnI在細(xì)胞內(nèi)部維持正常的生理作用,但當(dāng)細(xì)胞受損后,心肌細(xì)胞膜通透性改變,心肌酶即釋放到血液中,血中的CK、LDH、AST等心肌酶就會升高,胞漿酶釋放量增加可反映細(xì)胞損傷嚴(yán)重。MDA為氧自由基與細(xì)胞膜上不飽和脂肪酸發(fā)生脂質(zhì)過氧化反應(yīng)的代謝產(chǎn)物,常被作為氧自由基生成和造成膜損害的指標(biāo)[18]。cTnI是心肌組織的一種特有的調(diào)節(jié)蛋白,可作為敏感和特殊的心肌損傷標(biāo)志物[19]。本研究顯示,MI/RI模型組的CK、CK-MB、LDH、ALT、AST、MDA和cTnI均顯著升高,同時心肌梗死面積顯著增加,提示此時心肌細(xì)胞嚴(yán)重受損。與MI/RI模型組比較,基礎(chǔ)方組及優(yōu)化方1組CK、CK-MB、LDH、ALT、AST、MDA和cTnI均顯著降低,心梗面積顯著減??;優(yōu)化方2除心肌梗死面積顯著降低外,其他指標(biāo)均變化不明顯。結(jié)果提示,痰瘀同治方及優(yōu)化方1在抑制心肌酶釋放、抗氧化應(yīng)激及降低心肌梗死程度等方面對MI/RI具有較好的保護(hù)作用。
MI/RI引起心肌細(xì)胞內(nèi)源性的炎癥反應(yīng),并誘導(dǎo)釋放大量炎性因子,從而進(jìn)一步引起心肌受損[20]。TNF-α是啟動炎癥級聯(lián)反應(yīng)的關(guān)鍵因素,可誘導(dǎo)多種炎癥因子和黏附分子的產(chǎn)生;IL-6、IL-1β是關(guān)鍵的促炎細(xì)胞因子, 廣泛參與機(jī)體缺血缺氧、炎癥、應(yīng)激的調(diào)控,在急性心肌梗死過程中扮演著非常重要的角色[21]。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,再灌注后MI/RI模型組TNF-α、IL-6及IL-1β均顯著升高。與MI/RI模型組比較,優(yōu)化方1組TNF-α、IL-6及IL-1β顯著降低,基礎(chǔ)方組TNF-α及IL-1β顯著降低,優(yōu)化方2組TNF-α、IL-6顯著降低,說明在MI/RI過程中3組均可減少炎癥因子的釋放,優(yōu)化方1可能效果更佳。動物實(shí)驗(yàn)各項(xiàng)結(jié)果顯示,優(yōu)化方1組在抑制血清心肌酶釋放、抗氧化應(yīng)激、減輕炎癥因子方面顯示出較好的抗MI/RI作用,且效果與痰瘀同治方相當(dāng)。
綜上所述,本研究將基于中醫(yī)“君臣佐使”理論的加權(quán)網(wǎng)絡(luò)模塊劃分優(yōu)化方法應(yīng)用于痰瘀同治方的處方優(yōu)化研究中,篩選出優(yōu)化方1和優(yōu)化方2,并通過動物實(shí)驗(yàn)證實(shí)優(yōu)化方1和原方療效相當(dāng),證實(shí)該處方優(yōu)化方法的有效性和可能性,為中藥復(fù)方優(yōu)化提供了一種新思路和新方法。