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    陸地棉基因GhMIPS1A 的克隆及功能分析

    2022-07-07 10:36:28徐婷婷張弛馮震劉其寶李黎貝俞嘯天張雅楠喻樹迅
    棉花學(xué)報(bào) 2022年2期
    關(guān)鍵詞:衣分肌醇擬南芥

    徐婷婷,張弛,馮震,劉其寶,李黎貝,俞嘯天,張雅楠,喻樹迅,2*

    (1.浙江農(nóng)林大學(xué)/ 省部共建亞熱帶森林培育國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,杭州 311300;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所/棉花生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南安陽 455000)

    肌醇(myo-inositol),又稱環(huán)己六醇,分子式是C6H12O6,結(jié)構(gòu)類似于葡萄糖。 大量研究表明,肌醇是植物生長發(fā)育所必需的[1],可以作為重要的前體和原料,廣泛參與植物細(xì)胞壁和細(xì)胞膜的生物合成、生長發(fā)育、細(xì)胞膜信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、逆境調(diào)節(jié)等多種生命活動[2-4]。肌醇的合成主要分為3 個步驟: 首先D- 葡萄糖在己糖激酶的作用下磷酸化生成D- 葡萄糖-6- 磷酸, 然后D- 葡萄糖-6- 磷酸在肌醇-1- 磷酸合酶(myo-inositol-1-phosphate synthase,MIPS)[5]的作用下環(huán)化生成肌醇-1- 磷酸, 最后肌醇-1- 磷酸在肌醇單磷酸酶的作用下脫磷酸化生成游離的肌醇,其中MIPS 是限速酶,在維持肌醇穩(wěn)態(tài)中起關(guān)鍵作用[6]。 研究表明,MIPS 不僅可以作為限速酶參與肌醇的合成,還可以作為轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子參與植物的生長發(fā)育[7]。

    MIPS 廣泛存在于原核生物和真核生物中,目前已經(jīng)在高等植物、動物、真菌、細(xì)菌等多種生物中被分離并檢測出活性[8]。 已有多項(xiàng)研究表明MIPS 在植物的耐鹽性、耐旱性、生長發(fā)育中發(fā)揮重要作用[9-10]。在擬南芥(Arabidopsis thaliana)中已鑒定出3 個MIPS基因,分別為AtMIPS1、AtMIPS2、AtMIPS3[11]。 其中,AtMIPS1在種子發(fā)育中起關(guān)鍵作用,缺失AtMIPS1會導(dǎo)致抗壞血酸(ascorbic acid,AsA) 和磷脂酰肌醇含量減少,從而導(dǎo)致子葉出現(xiàn)病斑、葉片卷曲、植株矮化[12]。 通過RNA 干擾技術(shù) (RNA interference, RNAi)抑制馬鈴薯(Solanum tuberosum)中MIPS基因的表達(dá),會導(dǎo)致葉片形態(tài)變化和塊莖產(chǎn)量降低[13]。利用RNAi 降低蘋果(Malus pumila)中MdMIPS基因的表達(dá),導(dǎo)致肌醇含量降低,進(jìn)而導(dǎo)致細(xì)胞程序性死亡,葉和根壞死,最終造成植株死亡,表明MIPS在蘋果中發(fā)揮重要的生理作用[14]。 從1 種鹽生稻(Porteresia coarctata)中分離出MIPS耐鹽基因PINO1, 將該基因轉(zhuǎn)入煙草(Nicotiana tabacum)植株后檢測肌醇含量,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因煙草在高鹽環(huán)境中能夠積累更多的肌醇,表明PINO1基因在植物的抗逆中起著關(guān)鍵作用[15]。 轉(zhuǎn)PdMIPS山新楊(Populus davidiana)比野生型山新楊具有更好的鹽脅迫耐受性, 說明PdMIPS基因參與植物抗逆脅迫過程[16]。 在玉米中克隆獲得2 個ZmMIPS基因, 發(fā)現(xiàn)這2 個MIPS基因都能響應(yīng)鹽、干旱等多種非生物脅迫[17]。

    棉花(Gossypiumspp.)是世界上重要的經(jīng)濟(jì)作物之一[18],其中陸地棉(G.hirsutum)因產(chǎn)量高、纖維較長、品質(zhì)較好是重要的栽培種[19]。 目前,高產(chǎn)仍然是棉花育種的主要目標(biāo)[20]。 棉纖維是由胚珠外突起的表皮細(xì)胞分化發(fā)育而來的,纖維突起的密度和衣分呈顯著正相關(guān)。 大量研究表明,棉花產(chǎn)量與衣分有著十分密切的關(guān)系[21]。GhMIPS1D基因在陸地棉纖維細(xì)胞起始期和伸長期早期高水平表達(dá),且可以有效地彌補(bǔ)擬南芥mips1突變體的生長發(fā)育缺陷[22]。近年來,土壤鹽漬化和干旱等非生物脅迫因素同樣嚴(yán)重制約著棉花產(chǎn)量的提高[23]。因此,利用各種分子育種手段挖掘潛在的有價值的基因并進(jìn)行功能分析,從而提高棉花在逆境中的生存能力和產(chǎn)量顯得尤為重要[24-25]。 研究表明,肌醇的氧化產(chǎn)物D- 葡萄糖醛酸(Dglucuronic acid,GlcA) 可用于細(xì)胞壁果膠類非纖維素化合物和抗壞血酸的合成。 果膠前體、抗壞血酸以及由抗壞血酸過氧化物酶催化的代謝產(chǎn)物在棉纖維伸長發(fā)育中起關(guān)鍵作用[26]。

    宿俊吉[27]利用簡化測序的關(guān)聯(lián)分析結(jié)合連鎖分析定位到與陸地棉衣分相關(guān)的候選基因GhMIPS1A(Gh_A02G1268),屬于MIPS基因家族成員, 比對后發(fā)現(xiàn)該基因與擬南芥調(diào)節(jié)胚胎、種子發(fā)育的基因AtMIPS2(AT2G22240)同源。 目前對于MIPS 參與棉纖維發(fā)育過程的調(diào)控機(jī)制研究較少。 因此,本研究從陸地棉標(biāo)準(zhǔn)系材料TM-1中克隆得到GhMIPS1A基因,通過生物信息學(xué)分析、亞細(xì)胞定位、擬南芥過表達(dá)試驗(yàn)、病毒誘導(dǎo)的基因沉默 (virus-induced gene silencing,VIGS)技術(shù)和逆境脅迫響應(yīng)分析,對該基因的功能進(jìn)行初步研究,為培育抗逆高產(chǎn)的棉花新品種提供優(yōu)質(zhì)的基因資源。

    1 材料與方法

    1.1 植物材料與處理

    將陸地棉材料TM-1、新陸早18 號、德字棉531 種植于浙江農(nóng)林大學(xué)平山溫室試驗(yàn)基地。 選取新陸早18 號和德字棉531 的根、莖、葉、萼片、花瓣、雄蕊,以及開花前3 d(-3 days post anthesis,-3 DPA)、開花當(dāng)天、開花后3 d 和5 d 的胚珠(5 DPA 及之前纖維與胚珠無法準(zhǔn)確區(qū)分),開花后10 d、15 d 和20 d 的胚珠和纖維用于實(shí)時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(quantitative realtime polymerase chain reaction, qRT-PCR)分析,每個樣品取3 個生物學(xué)重復(fù)。

    使用本生煙(N.benthamiana)進(jìn)行瞬時轉(zhuǎn)化,材料種植于浙江農(nóng)林大學(xué)人工氣候室,溫室的培養(yǎng)條件為:溫度22 ℃,光照16 h/ 黑暗8 h,相對濕度75%。

    使用擬南芥哥倫比亞型(Col-0)進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化,材料種植于浙江農(nóng)林大學(xué)人工氣候室,培養(yǎng)條件為:溫度25 ℃,光照16 h/ 黑暗8 h,相對濕度50%。

    1.2 載體和試劑

    所用的載體pBI121、pCAMBIA3301、pCLCr-VA、pCLCrVB 保存于本課題組。大腸桿菌DH5α感受態(tài)、農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)菌株GV3101、LBA4404 感受態(tài)購于上海唯地生物公司。 限制性內(nèi)切酶購于NEB 公司。 DNA 提取試劑盒購于天根生化科技(北京)有限公司。 多糖多酚植物的RNA 提取試劑盒、 質(zhì)粒小提試劑盒購于天根生化科技有限公司。GXL DNA Polymerase高保真酶、 反轉(zhuǎn)錄試劑盒、 熒光試劑TB GreenPremix Ex Taq TMⅡ(Tli RnaseH Plus)購于寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司。 乙酰丁香酮、2-嗎啉乙磺酸、1/2 MS 固體培養(yǎng)基購于源葉生物。 肌醇提取試劑盒、D- 葡萄糖提取試劑盒購于北京智微科技有限公司。 引物合成和測序由杭州有康生物有限公司完成。 本研究所用引物序列見表1。

    表1 本研究中使用的引物Table 1 Primers used in this study

    1.3 棉花DNA、RNA 的提取與基因表達(dá)分析

    棉花DNA 的提取參考說明書。 參考多糖多酚植物總RNA 提取試劑盒說明書,提取1.1 中各材料的RNA。 使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,合成第一條鏈互補(bǔ)DNA(complementary DNA,cDNA)。 將得到的cDNA 加水稀釋50 倍后作為qRT-PCR 模板。 反應(yīng)體系參考試劑盒說明書,使用Stepone Plus Real-time PCR System 儀器檢測分析,每個材料進(jìn)行3 次技術(shù)重復(fù)。以GhHistone 3為棉花的內(nèi)參基因, 以AtUBQ5為擬南芥的內(nèi)參基因。

    1.4 陸地棉GhMIPS1A 基因的克隆及生物信息學(xué)分析

    從CottonFGD 網(wǎng)站 (http://cottonfgd.org/)獲得Gohir.A02G132300基因的全長序列, 該基因位于A02 染色體上,根據(jù)Ma 等[22]的命名規(guī)則,將其命名為GhMIPS1A。 從陸地棉TM-1 中克隆GhMIPS1A基因, 通過雙酶切構(gòu)建過表達(dá)載體PBI121-GhMIPS1A。 通過熱激法轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌GV3101。通過CottonFGD 網(wǎng)站獲得陸地棉、雷蒙德氏棉(G.raimondii)、亞洲棉(G.arboreum)和海島棉 (G.barbadense) 中MIPS 蛋白序列。 通過NCBI 在線網(wǎng)站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)查找獲得榴蓮(Durio zibethinus)、可可(Theobroma cacao)、大 豆(Glycine max)、擬 南 芥、玉 米(Zea mays)和水稻(Oryza sativa)6 個物 種 的MIPS 蛋白序列。 使用ClustalX(http://www.clustal.org/)進(jìn)行氨基酸序列比對, 利用MEGA 7.0 軟件(http://www.mega-software.net/) 采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,自展值設(shè)為1 000,其余參數(shù)設(shè)置為默認(rèn)值。 使用DNAMAN 軟件對GhMIPS1A氨基酸序列進(jìn)行保守性分析。 使用GSDS(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php)進(jìn)行外顯子- 內(nèi)含子結(jié)構(gòu)分析。

    1.5 亞細(xì)胞定位分析

    采用凍融法,將構(gòu)建的35S∷GhMIPS1AGFP 融合表達(dá)載體、35S∷GFP 空載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌菌株GV3101。 利用煙草瞬時轉(zhuǎn)化進(jìn)行亞細(xì)胞定位,選取生長4 周左右的煙草的第三或第四片平滑且完整的葉片進(jìn)行注射。 注射后避光培養(yǎng)24 h, 恢復(fù)光照繼續(xù)培養(yǎng)48 h, 然后在蔡司LSM510 激光共聚焦顯微鏡下進(jìn)行觀察并拍照。

    1.6 病毒誘導(dǎo)的基因沉默試驗(yàn)及擬南芥轉(zhuǎn)化

    參考Gu 等[28]的具體試驗(yàn)步驟構(gòu)建VIGS 載體并進(jìn)行棉花侵染。 VIGS 所用載體系統(tǒng)為:pCLCrVA (空 載 體)、pCLCrVB (輔 助 載 體)、pCLCrVA-PDS(陽性對照)。 以TM-1 葉片cDNA為模板進(jìn)行基因片段的克隆,構(gòu)建pCLCrVAGhMIPS1A 載體并轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌LBA4404。陽性菌液可添加終濃度為20%(體積分?jǐn)?shù))甘油,長期保存于-80 ℃冰箱。 將TM-1 種子播種于育苗盤,放于長日照條件(16 h 光照/8 h 黑暗)下的光照培養(yǎng)箱培養(yǎng),待生長至子葉完全展平后使用注射法侵染棉花幼苗子葉, 以pCLCrVA-PDS 作為陽性對照, 侵染后的棉花幼苗在黑暗中放置24 h后, 重新放置于培養(yǎng)箱(25 ℃,16 h 光照/8 h 黑暗)培養(yǎng),后續(xù)持續(xù)觀察表型。

    采用花序侵染法,將構(gòu)建好的GhMIPS1A過表達(dá)載體轉(zhuǎn)化擬南芥, 使用含有卡那霉素的1/2 MS 固體培養(yǎng)基篩選轉(zhuǎn)基因株系, 對篩選的陽性植株移栽并進(jìn)行檢測。 至T3進(jìn)行陽性鑒定、表型觀察、肌醇含量測定。

    1.7 代謝物肌醇和D-葡萄糖含量的測定

    待測樣品制備方法:精確稱取并記錄植物樣品組織質(zhì)量,加入適量蒸餾水,使用研磨機(jī)粉碎制成勻漿, 將勻漿完全轉(zhuǎn)移至干凈的100 mL 容量瓶中備用,按照肌醇提取試劑盒說明書測定肌醇含量和D-葡萄糖含量。

    1.8 干旱、鹽脅迫處理及脯氨酸、丙二醛含量的測定

    將TM-1 棉花種子播種于育苗盤, 放于長日照條件(16 h 光照/8 h 黑暗)下的光照培養(yǎng)箱培養(yǎng)生長,待棉花生長至幼苗4 葉期,選取展平的真葉在水中培養(yǎng)1 d 后, 將離體葉片分別轉(zhuǎn)移至含有200 mmol·L-1NaCl 及20%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))聚乙二醇6000(PEG 6000)溶液中進(jìn)行脅迫處理,以水處理的葉片作為對照[29-30]。 分別在處理0 h、2 h、4 h、6 h、8 h、12 h、24 h 后進(jìn)行取樣,樣品立即用蒸餾水洗凈后擦干水分, 用剪刀去掉葉脈,剩余部分剪成0.5 cm×0.5 cm 小塊,在液氮中速凍后,于-80 ℃冰箱儲存或直接用于RNA 提取、生理指標(biāo)的測定。 以上樣品均取3 個生物學(xué)重復(fù)。脯氨酸(proline,Pro)含量測定方法為酸性茚三酮法[31],丙二醛(malondialdehyde, MDA)含量測定方法為硫代巴比妥酸法[32]。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 MIPS 基因家族成員鑒定及保守序列分析

    MIPS基因家族是一個非常小的家族, 在大多數(shù)植物中通常包含1~2 個成員。 但是在陸地棉和海島棉中分別發(fā)現(xiàn)4 個MIPS基因。 為研究MIPS基因家族在植物中的進(jìn)化特征,將陸地棉、海島棉、雷蒙德氏棉、亞洲棉、榴蓮、可可、大豆、擬南芥、玉米、水稻10 個物種中的29 個MIPS 蛋白序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,結(jié)果顯示單子葉植物的MIPS 蛋白聚在一起, 雙子葉植物的MIPS 蛋白聚在一起(圖1)。 將GhMIPS1A 和其他6 個物種的MIPS 蛋白進(jìn)行多序列比對發(fā)現(xiàn),MIPS 蛋白在植物中的保守性很高,氨基酸序列相似性高達(dá)93%,并且存在4 段高度保守的序列(圖2):GWGGNNG、LWTANTERY、NGSPQNTFVPGL、SYNHLGNNDG, 推測這4 個保守基序?qū)τ贛IPS 發(fā)揮功能至關(guān)重要。

    圖1 10 種植物的29 個MIPS 同源蛋白序列的進(jìn)化分析Fig. 1 Phylogenetic analysis of 29 MIPS proteins of ten species

    圖2 7 個代表性植物MIPS 蛋白的多重序列比對Fig. 2 Multiple sequence alignment of MIPS proteins in seven representative plants

    2.2 MIPS 基因的結(jié)構(gòu)分析

    為了進(jìn)一步研究MIPS基因家族成員的進(jìn)化關(guān)系, 對4 個陸地棉MIPS基因序列和其他9 個植物25 個MIPS基因進(jìn)行外顯子- 內(nèi)含子結(jié)構(gòu)分析。在絕大多數(shù)高等植物中,MIPS基因都有10個外顯子, 說明MIPS基因在進(jìn)化過程中高度保守。 然而擬南芥中AtMIPS1和AtMIPS12基因分別含有9 個和7 個外顯子, 這表明擬南芥在進(jìn)化過程中可能經(jīng)歷了特殊的進(jìn)化事件(圖3)。

    圖3 10 種代表性植物MIPS 基因的外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)Fig. 3 Exon-intron structure of MIPS genes in ten species

    2.3 GhMIPS1A 的時空表達(dá)模式分析

    為了探究GhMIPS1A的組織表達(dá)特性和空間表達(dá)特性, 分別使用高衣分材料新陸早18 號和低衣分材料德字棉531 進(jìn)行基因表達(dá)分析,結(jié)果顯示:GhMIPS1A在0 DPA、3 DPA、5 DPA 的胚珠中較高水平表達(dá)(圖4A),在根、莖、葉、纖維中表達(dá)量較高(圖4B),而且GhMIPS1A基因在高衣分材料新陸早18 號上述器官中的表達(dá)量均高于其在低衣分材料德字棉531 中的表達(dá)量(圖4)。由此推測,該基因在陸地棉纖維發(fā)育早期發(fā)揮重要作用,可能影響陸地棉的產(chǎn)量。

    圖4 GhMIPS1A 的時空表達(dá)分析Fig. 4 Temporal and spatial expression patterns of GhMIPS1A

    2.4 GhMIPS1A 的亞細(xì)胞定位

    亞細(xì)胞定位試驗(yàn)觀察發(fā)現(xiàn),GhMIPS1A-GFP融合蛋白的綠色熒光僅分布于細(xì)胞膜 (圖5A~C),而對照的熒光分布于整個細(xì)胞中(圖5D~F)。

    圖5 GhMIPS1A 蛋白的亞細(xì)胞定位Fig. 5 Subcellular localization of GhMIPS1A protein

    2.5 病毒誘導(dǎo)的GhMIPS1A 基因沉默

    轉(zhuǎn)化pCLCrVA-PDS 的陽性對照植株整株葉片出現(xiàn)不同程度的白化現(xiàn)象,表明該沉默系統(tǒng)成功且有效。 轉(zhuǎn)化空載體的對照植株及GhMIPS1A沉默植株在表型上并沒有明顯差異 (圖6A)。qRT-PCR 結(jié)果表明, 在GhMIPS1A沉默株系VL1、VL2、VL3 中,GhMIPS1A的表達(dá)量不同程度地降低,說明該基因被成功沉默(圖6B)。 測定代謝物肌醇和D- 葡萄糖的含量(圖6C)發(fā)現(xiàn),隨著GhMIPS1A基因的沉默, 肌醇含量也隨之顯著降低,3 個沉默株系的肌醇含量分別降低31.83%、32.90%、29.46%,但葡萄糖含量無顯著變化。 測定成熟棉鈴衣分發(fā)現(xiàn),與空載體對照植株相比,GhMIPS1A沉默植株的纖維密度降低(圖6D),3 個GhMIPS1A沉默株系VL1、VL2、VL3 的衣分分別降低4.48、4.93、3.95 百分點(diǎn)(圖6E)。

    圖6 GhMIPS1A 沉默植株的表型Fig. 6 Phenotypes of GhMIPS1A-silenced plants

    2.6 GhMIPS1A 在擬南芥中的功能研究

    為了探究GhMIPS1A基因在植物生長發(fā)育過程中所發(fā)揮的功能,構(gòu)建過表達(dá)載體轉(zhuǎn)化擬南芥,得到3 個過表達(dá)株系,分別為L1、L2、L3(圖7A~B)。將T3種子播種于1/2 MS 固體培養(yǎng)基上垂直培養(yǎng)1 周,觀察測定擬南芥根長,結(jié)果發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因擬南芥的根長顯著長于野生型 (圖7A、7C)。 同時測定肌醇含量和D- 葡糖糖的含量發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)基因擬南芥中肌醇含量比野生型擬南芥高1 倍以上,但是D- 葡萄糖含量無顯著差異,其原因可能是D- 葡萄糖的含量由多條不同的代謝途徑共同決定(圖7D)。

    圖7 GhMIPS1A 基因在擬南芥中的功能研究Fig. 7 Functional analysis of GhMIPS1A in A. thaliana

    2.7 干旱脅迫下和鹽脅迫下GhMIPS1A 的表達(dá)變化及相關(guān)代謝物含量的變化

    為了分析GhMIPS1A在多種脅迫下的表達(dá)模式, 本研究使用4 葉期的陸地棉幼苗作為材料,分別進(jìn)行干旱、高鹽脅迫處理,檢測處理后葉片脯氨酸和丙二醛含量。 結(jié)果顯示:隨著干旱或鹽脅迫處理時間的延長,脯氨酸的含量也隨之增加(圖8B),同時丙二醛的含量整體呈現(xiàn)增加的趨勢(圖8A),表明棉花葉片對脅迫做出了響應(yīng)。qRT-PCR 結(jié)果表明, 無論是鹽脅迫還是干旱脅迫,GhMIPS1A的表達(dá)量都呈現(xiàn)先增后減的趨勢(圖8C~D),肌醇含量隨著GhMIPS1A基因的表達(dá)呈現(xiàn)相同的變化趨勢(圖8E~F),這些結(jié)果均表明GhMIPS1A基因積極響應(yīng)鹽脅迫和干旱脅迫,可能在抗逆脅迫過程中發(fā)揮重要作用。

    圖8 非生物脅迫下GhMIPS1A 的表達(dá)模式及相關(guān)代謝物含量Fig. 8 Expression patterns of GhMIPS1A and relative metabolite contents under different abiotic stresses

    3 討論

    MIPS基因家族成員非常少,除了擬南芥有3個MIPS家族成員,陸地棉、海島棉、大豆和玉米各有4 個MIPS家族成員外, 絕大多數(shù)植物中僅有1~2 個成員[33]。所有高等植物MIPS基因大多編碼約510 個氨基酸, 氨基酸序列相似性高達(dá)93%,且存在4 個高度保守的基序,這與前人的研究結(jié)果[34-35]一致。而內(nèi)含子-外顯子結(jié)構(gòu)分析顯示擬南芥可能經(jīng)歷了復(fù)雜的進(jìn)化事件。

    MIPS 是肌醇及其衍生物合成中的關(guān)鍵酶,在植物的生長發(fā)育、 細(xì)胞壁和細(xì)胞膜的生成、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、抗逆調(diào)節(jié)等過程中起關(guān)鍵調(diào)控作用。 已有的研究表明,MIPS基因在陸地棉纖維發(fā)育的起始期和伸長期早期發(fā)揮重要的作用[22],棉花的產(chǎn)量通常由棉纖維起始期的突起細(xì)胞數(shù)目決定,分析高低衣分材料間基因表達(dá)量的差異, 推測GhMIPS1A可能是控制陸地棉產(chǎn)量的正向調(diào)控因子。

    在擬南芥中發(fā)現(xiàn)3 個MIPS基因AtMIPS1、AtMIPS2、AtMIPS3。 其中,AtMIPS1對于種子的發(fā)育至關(guān)重要,缺少AtMIPS1可使脫落酸和肌醇衍生物含量減少,從而產(chǎn)生葉片卷曲、植株矮小、子葉病變等異常表型。 MIPS 能夠改變植物細(xì)胞壁和細(xì)胞膜的通透性,促進(jìn)植物細(xì)胞對營養(yǎng)成分的吸收轉(zhuǎn)運(yùn),在植物對逆境脅迫的耐受中起非常重要的作用。 在擬南芥中過表達(dá)GhMIPS1A基因,轉(zhuǎn)基因擬南芥的根長顯著增加,肌醇含量也隨著提高。 亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示MIPS 蛋白定位于細(xì)胞膜中, 由此推測GhMIPS1A基因是參與細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、影響植物生長的重要信號分子。

    已有報(bào)道表明,果膠前體物質(zhì)和抗壞血酸對于棉纖維的生長發(fā)育是必不可少的[36-37],MIPS 影響果膠前體UDP-D- 葡萄糖醛酸和抗壞血酸的合成[38]。 UDP-D-葡萄糖醛酸、磷脂酰肌醇和磷脂酰肌醇激酶是重要的肌醇衍生物,已被證明是細(xì)胞壁、細(xì)胞膜的重要組成部分,參與棉花纖維的伸長生長[39]。 為了進(jìn)一步探究GhMIPS1A在陸地棉中發(fā)揮的作用, 本研究通過VIGS 試驗(yàn)沉默GhMIPS1A基因在棉花TM-1 中的表達(dá), 導(dǎo)致肌醇含量降低, 發(fā)現(xiàn)隨著該基因表達(dá)量的降低,棉花的纖維密度和衣分均降低, 初步表明GhMIPS1A基因?qū)τ陉懙孛廾蘩w維的生長發(fā)育起正向調(diào)控的作用。 若要進(jìn)一步明確GhMIPS1A基因在纖維發(fā)育過程中所發(fā)揮的作用,則需要進(jìn)行更深入的研究。 如針對該基因構(gòu)建CRISPRCas9 載體,獲得突變株系進(jìn)一步探究其在陸地棉中的調(diào)控機(jī)制。

    肌醇是植物的第二信使分子1,4,5- 三磷酸肌醇(IP3) 的前體物質(zhì),IP3通過液泡膜和粗糙內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的鈣離子通道結(jié)合,激活鈣調(diào)蛋白,形成Ca2+/CaM 復(fù)合物,并激活一系列下游蛋白,從而調(diào)控與抗逆脅迫相關(guān)的一系列級聯(lián)反應(yīng)[40]。 肌醇的生物合成是不同生化途徑高度調(diào)控的過程,因此GhMIPS1A基因是如何與其他相關(guān)酶基因相互協(xié)作參與肌醇代謝通路調(diào)控,以及如何和生長素、赤霉素等植物激素相互作用影響植物的生長發(fā)育需深入挖掘。

    干旱、鹽堿等非生物脅迫是限制植物生長發(fā)育和作物產(chǎn)量的主要因素,因此挖掘優(yōu)異的耐鹽耐旱基因資源具有重要的現(xiàn)實(shí)意義[41]。 本研究利用200 mmol·L-1NaCl 和20%PEG 6000 處理模擬鹽脅迫和干旱脅迫環(huán)境,發(fā)現(xiàn)GhMIPS1A基因可以快速響應(yīng)逆境脅迫,且肌醇含量在鹽脅迫和干旱脅迫下顯著增加。 然而,該基因在逆境脅迫響應(yīng)信號中的位置以及如何作用尚不清楚,需進(jìn)行更深入的研究驗(yàn)證其耐鹽、耐旱性。

    4 結(jié)論

    本研究從陸地棉TM-1 中克隆出1 個MIPS基因,將其命名為GhMIPS1A。 通過氨基酸序列保守性分析、系統(tǒng)發(fā)育樹分析、外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)分析表明MIPS 在進(jìn)化過程十分保守。 亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示GhMIPS1A蛋白定位于細(xì)胞膜。GhMIPS1A基因在根、莖、葉、纖維組織中具有較高的表達(dá)量,在纖維發(fā)育的起始期和伸長期早期優(yōu)勢表達(dá),且在高低衣分材料中的表達(dá)量有顯著差異。過表達(dá)GhMIPS1A基因的擬南芥植株根長增加,肌醇含量隨之增加。VIGS 技術(shù)沉默GhMIPS1A基因后的棉花植株出現(xiàn)纖維密度降低的現(xiàn)象, 且衣分也隨之減少。GhMIPS1A基因在鹽脅迫、干旱脅迫響應(yīng)途徑中具有積極作用。

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