任超
(1.天津醫(yī)科大學(xué)人民醫(yī)院臨床學(xué)院,天津 300121;2.天津市濱海新區(qū)大港醫(yī)院檢驗科,天津 300270)
前列腺癌是男性第二常見的惡性腫瘤,也是第五大致死癌癥。目前,血清前列腺特異性抗原(PSA)水平升高(≥10 ng/mL)和(或)可疑直腸指檢(DRE)進(jìn)行前列腺活檢和組織病理學(xué)評估,可對前列腺癌做出診斷[2]。但PSA 對前列腺癌的特異性較低,導(dǎo)致許多不必要的前列腺活檢和前列腺癌的過度治療[3]。因此,迫切需要一種新的無創(chuàng)性分子生物標(biāo)志物來準(zhǔn)確診斷前列腺癌并預(yù)測其預(yù)后,以提高臨床診斷水平及做出治療決定。MicroRNAs(miRNAs)是一類小的非編碼RNA[4],已發(fā)現(xiàn)超過2 500 個成熟的miRNA[5],每個miRNA 都有可能調(diào)控數(shù)百個基因[6],miRNAs 因其檢測的穩(wěn)定性好,被認(rèn)為是很好的生物標(biāo)志物。研究表明,前列腺癌患者組織和血液(血清/血漿)樣本中的miRNAs 表達(dá)發(fā)生改變,可作為前列腺癌分期或診斷、預(yù)后的標(biāo)志分子[7-10]。miRNA-24 與miRNA-223、-375 表達(dá)差異的變化聯(lián)合可作為前列腺癌患者的診斷分子標(biāo)志物[11]。此外,miRNA-222-3p 可能通過負(fù)調(diào)控SNAP91 的表達(dá)在轉(zhuǎn)移性前列腺癌中發(fā)揮重要作用[12],但其是否可作為前列腺癌診斷或預(yù)后的標(biāo)志分子尚無報道。本研究聯(lián)合檢測miRNAs 在不同前列腺癌分期患者尿液中的表達(dá)。通過進(jìn)一步分析差異表達(dá)的miRNAs,尋找穩(wěn)定、可靠的前列腺癌診斷標(biāo)志分子,同時通過比較不同Gleason 分級組間的表達(dá)差異,以期改善前列腺癌的危險分層,指導(dǎo)個性化的治療決策。
1.1 研究對象及分組 收集2016 年1 月—2021 年12 月在天津市濱海新區(qū)大港醫(yī)院檢驗科因排尿困難、尿失禁等臨床癥狀接受檢查且PSA(4~25 ng/mL)中度升高患者的尿液和血清,初步進(jìn)行miRNAs 芯片篩選組的樣本分為兩組:對照1 組(6 例良性前列腺增生患者)及PC1組(18 例,根據(jù)Gleason 評分進(jìn)一步分為3 組,即GS16 組、GS17 組、GS18 組,各6 例)。另外,miRNAs 表達(dá)驗證時樣本組分為4 組:對照2組(20 例良性前列腺增生患者),PC2組59 例,PC2組根據(jù)Gleason 評分進(jìn)一步分為3 組:GS26 組22例,GS27 組19 例及GS28 組18 例。PC 組患者納入標(biāo)準(zhǔn):經(jīng)病理切片證實;首次診斷。排除標(biāo)準(zhǔn):他處具有原發(fā)性腫瘤;術(shù)前具有放化療治療;不配合試驗者。所有受試者在參加本研究之前均知情同意。
1.2 miRNA 提取及逆轉(zhuǎn)錄 收集的血清和首次排尿樣本最初儲存在4℃,在6 h 內(nèi)將其等分并轉(zhuǎn)移至-80℃冰箱儲存。所有患者均行經(jīng)直腸超聲引導(dǎo)活檢。用差速離心法從38.5 mL 的尿液獲得無細(xì)胞尿液,在4℃,13 000 ×g 離心10 min,去上清以去除碎屑和鹽。進(jìn)一步將上清液超速離心13 000×g,10 min,最終獲得的顆粒再用250 μL PBS 懸浮,然后儲存在-80℃供以后使用?;颊哐逶?0℃靜置10 min,去除剩余細(xì)胞和細(xì)胞碎片。在13 000×g,10 min 進(jìn)一步超速離心上清液后并用PBS 洗滌,重復(fù)兩次,最終獲得的顆粒100 μL PBS 再懸浮,然后儲存在-80℃供以后使用。用miRNeasy 小試劑盒(Qiagen,Venlo,Netherlands)和凈化試劑盒(Qiagen)分離miRNA 和mRNA,Nanodrop 紫外吸收測定法測定RNA 在波長260 nm 和280 nm 的吸收值,獲得RNA 的濃度并通過A260/280 及A260/230 的吸收比值判斷RNA 的純度。
1.3 人類miRNA 芯片檢測miRNA 表達(dá)水平 利用人類miRNA Microarray,Release 21.0(G4872A,Agilent)芯片檢測技術(shù),制備熒光標(biāo)記探針,miRNA 3′端進(jìn)行Cy 熒光標(biāo)記,采用SurePrint 原位噴墨合成技術(shù)合成60-mer 用于與芯片雜交的熒光探針。芯片雜交,取約100 ng 量的質(zhì)檢達(dá)標(biāo)樣本,與miRNA 芯片進(jìn)行雜交,檢測miRNA 的表達(dá)。
1.4 qRT-PCR 驗證候選miRNA 標(biāo)志分子的表達(dá)水平 利用Arraystar SYBR? Green qPCR Master Mix(ROX-)(AS-MR-005-5,康成生物)進(jìn)一步驗證miRNA 的表達(dá)水平,反應(yīng)體系為:樣本200 ng(2 μL),上下游引物(10 μmol/L,1.5 μL),SYBR? Green(10 μL),DERC 水(6.5 μL)。反應(yīng)程序為:95℃20 s,隨之進(jìn)行40 個循環(huán):95℃10 s,60℃20 s,70℃10 s,并在7900 real-time PCR 儀上進(jìn)行檢測。以穩(wěn)定表達(dá)的miRNA-200b-3p,miRNA-27b-3p 做內(nèi)參[13]。引物序列如下:miRNA-200b-3p:上游:5′-GCTGCTGAATTCCATCTAATTTCCAAAAG-′;下游:5′-TATTATGGATCCGCCCCCAGGGCAATGGG-3′;miRNA-27b-3p:上游:5′-AGCGTTCACAGTGGCTAAG-3′,下游:5′-TCCTCCTCTCCTCTCCTCTC-3′;miRNA-24-3p:上游:5′-ACAGCAGGCACAGAGAGGGG-3′,下 游:5′-CTGGCTCAGTTCAGCAGG AACAG-3′;miRNA-222-3p;上游:5′-GGGGAGCTACAT CTGGCT-3′,下游:5′-TGCGTGTCGTGGAGTC-3′。miRNAs 表達(dá)量計算公式為:差異倍數(shù)=2-(△△Ct),其中△Ct=Ct(miRNA)-Ct(miR-200b-3p,miR-27b-3p),△△Ct=△Ct(病例組)-△Ct(對照組)
1.5 統(tǒng)計學(xué)處理 利用SPSS 16.0 軟件進(jìn)行Student t 檢驗用以組間差異統(tǒng)計學(xué)分析,正態(tài)分布的計量資料用±s 表示。計量資料采用n(%)表示,頻數(shù)小于5 的數(shù)據(jù)采用Fisher 精確概率法。繪制受試者工作特征曲線(ROC 曲線),計算曲線下面積(AUC)。P<0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 尿液中miRNAs 差異表達(dá) 針對miRNAs 篩選組樣本進(jìn)行miRNA 芯片檢測(表1),結(jié)果發(fā)現(xiàn),與對照1 組相比,PC1組(包括GS16、GS17、GS18組)年齡差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);GS18 組PSA≥10 ng/mL 者的例數(shù)更多(P=0.03)。與對照1 組相比,各miRNAs 均一化表達(dá)量(1±0.07),共有20 個miRNAs表達(dá)發(fā)生顯著差異性改變,其中11 種miRNAs 顯著性下調(diào),9 種miRNAs 顯著性上調(diào)(表2),其中,表達(dá)差異最為顯著的兩個miRNAs:miRNA-24-3p(-2.58±0.022)及miRNA-222-3p(-2.89±0.029)表達(dá)比對照1 組顯著下調(diào)。
表1 臨床樣本信息表[±s,n(%)]Tab 1 Clinical sample information form[±s,n(%)]
表1 臨床樣本信息表[±s,n(%)]Tab 1 Clinical sample information form[±s,n(%)]
注:GS:Gleason 評分;PC:前列腺癌;PSA:血清前列腺特異性抗原
組別 年齡(歲) PSA(<10 ng/mL)PSA(≥10 ng/mL) GS對照1 組(n=6) 65.5±1.5 6(100) 0(0)PC1 組GS16(n=6) 66.4±1.2 5(83) 1(17) 3+3 GS17(n=6) 74.0±2.3 3(50) 3(50) 3+4 GS18(n=6) 78.2±2.5 1(17) 5(83)a 4+4 χ2/F 10.61 10.27 21.56 P 0.09 0.07 0.03
2.2 RT-PCR 驗證差異miRNA 的表達(dá)水平 利用RT-PCR 在驗證樣本組(表3)中進(jìn)一步驗證這些差異miRNAs 基因的表達(dá)水平,結(jié)果提示,與對照2 組相比,GS27 組miRNA-24-3p 顯著下調(diào),與GS27 組相比,GS28 組miRNA-24-3p 顯著下調(diào)。與對照2組相比,PC2 組中miR-222-3p 都顯著下調(diào)。與GS26 組、GS27 組相比組,GS28 組顯著下調(diào)(圖1)。
圖1 RT-PCR 驗證各組尿液樣本中miRNAs 表達(dá)水平Fig 1 Validation of miRNAs expression levels in urine samples by RT-PCR
表3 驗證miRNAs 表達(dá)的樣本信息[±s,n(%)]Tab 3 Samples clinical characteristics for miRNAs expression validation[±s,n(%)]
表3 驗證miRNAs 表達(dá)的樣本信息[±s,n(%)]Tab 3 Samples clinical characteristics for miRNAs expression validation[±s,n(%)]
注:GS:Gleason 評分;PC:前列腺癌;PSA:血清前列腺特異性抗原
組別 年齡(歲)PSA(<10 ng/mL)PSA(≥10 ng/mL) GS對照2 組(n=20) 62.5±0.5 20(100) 0(0)PC2 組GS26(n=22) 65.5±1.5 18(82) 4(18) 3+3 GS27(n=19) 68.6±2.2 6(33) 13(67) 3+4 GS28(n=18) 80.5±3.4 1(5) 17(95) 4+4 χ2/F 6.43 11.45 19.01 P 0.04 0.07 0.04
在血清樣本中,利用RT-PCR 進(jìn)一步檢測差異miRNAs 基因的表達(dá)水平,結(jié)果表明,與對照2 組相比,GS28 組miRNA-24-3p 及miR-222-3p 顯著下調(diào)(圖2)。根據(jù)miRNA-24-3p 及miRNA-222-3p 作為聯(lián)合診斷指標(biāo)繪制ROC 曲線。如圖3 所示,AUC值為0.93(OR=1.37,95% CI:0.92~1.76,P=0.02),提示miRNA-24-3p 及miRNA-222-3p 表達(dá)量改變聯(lián)合診斷前列腺癌的應(yīng)用價值較高。
圖2 RT-PCR 驗證各組血清樣本中miRNAs 表達(dá)水平Fig 2 Validation of miRNAs expression levels in serum samples by RT-PCR
圖3 miRNA-24-3p 及miRNA-222-3p 聯(lián)合診斷前列腺癌的受試者工作特征曲線Fig 3 Receiver operating characteristic curve of the combination of miRNA-24-3p and miRNA-222-3p model as diagnostic subjects for prostate cancer
本研究在篩選階段,篩選到20 個差異表達(dá)的miRNAs 后,進(jìn)行了第二階段的驗證,最終鑒定出2種穩(wěn)定下調(diào)的尿液、血清miRNAs(miR-24a-3p、miR-222-3p),同時比較不同GS 其表達(dá)差異,證明其在前列腺癌診斷及GS 危險分層中具有較高的準(zhǔn)確性,可能成為未來前列腺癌診斷的分子特征。
迄今為止,越來越多miRNAs 被認(rèn)為可作為前列腺癌診斷、分級、預(yù)后的標(biāo)志分子。2017 年,丹麥奧胡斯大學(xué)醫(yī)院研究團(tuán)隊針對第一組樣本:20 例良性前列腺增生(BPH)及188 例前列腺癌患者的無細(xì)胞尿液,應(yīng)用qRT-PCR 檢測92 種miRNAs 的表達(dá)水平,結(jié)果顯示,相比BPH 組,前列腺癌組14 種miRNAs 表達(dá)水平顯著升高,30 種miRNAs 表達(dá)水平顯著下降。進(jìn)一步在第二組樣本:20 例BPH 及197 例前列腺癌患者中,檢測該92 種miRNAs 的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)在前列腺癌組中,有6 種miRNAs 表達(dá)水平顯著升高,22 種miRNAs 表達(dá)水平顯著下降。合并分析兩組樣本中存在表達(dá)差異的miRNAs,篩選到miRNA-222-3p、miRNA-24-3p 及miRNA-30c-5p 這一差異表達(dá)的miRNAs 組合,在第一組中鑒別診斷前列腺癌的準(zhǔn)確率達(dá)95%,在第二組中診斷前列腺癌準(zhǔn)確率為89%。且在PSA<15 ng/mL 的患者中,對第一組及第二組樣本隊列中前列腺癌組的確診率也可高達(dá)97%與89%,提示該miRNAs 組合可作為前列腺癌患者早期診斷的標(biāo)志物[10]。在該組合中,miRNA-222-3p、miRNA-24-3p 在前列腺癌組中顯著下調(diào),而miRNA-30c-5p 則顯著上調(diào)。該研究團(tuán)隊于2019 年,利用類似的方法分析得到包含miRNA-151a-5p、miRNA-204-5p、miRNA-222-3p、miRNA-23b-3p 和miRNA-331-3p 的組合多標(biāo)志物模型,該模型與前列腺癌根治性手術(shù)后是否生化復(fù)發(fā),及前列腺癌患者的危險分級顯著相關(guān)[14]。日本大阪大學(xué)醫(yī)學(xué)研究院研究團(tuán)隊于2021 年針對PSA 水平升高的直腸指檢陽性患者及陰性患者尿液細(xì)胞外小泡,進(jìn)行芯片檢測分析miRNAs 表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)miRNA-30b-3p 和miRNA-126-3p 在前列腺癌患者中顯著高表達(dá),其預(yù)測前列腺癌發(fā)生的敏感性和特異性分別為46.4%和88.0%、60.7%和80.0%,優(yōu)于血清PSA(分別為53.5%和64.0%),可作為預(yù)測前列腺癌的分子標(biāo)志物[7]。同年,韓國一項研究對149例前列腺癌患者尿液外體miRNA 表達(dá)譜進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)miRNA-21、miRNA-16、miRNA-142-3p、miRNA-451 在前列腺癌中表達(dá)顯著上調(diào),而miRNA-636 顯著下調(diào)。當(dāng)綜合評估臨床因素時,miRNA-21、miRNA-451、miRNA-636,及術(shù)前PSA 水平在多因素分析中仍有顯著性差異。在此基礎(chǔ)上,該研究團(tuán)隊建立了前列腺癌轉(zhuǎn)移風(fēng)險評分(PCa-MRS)模型。PCa-MRS 顯示出優(yōu)于術(shù)前PSA 或臨床GS 的分層能力(AUC=0.925)。得分高的患者生化無復(fù)發(fā)生存率明顯低于得分低的患者[8]。此外,揚(yáng)州大學(xué)研究團(tuán)隊檢測前列腺癌患者及正常對照組外周血血清中168 種miRNAs,發(fā)現(xiàn)miRNA-146a-5p、miRNA-24-3p 及miRNA-93-5p 水平顯著升高,可作為前列腺癌患者無創(chuàng)性診斷標(biāo)志物[15]。
本研究提出miRNA-24-3p 可作為前列腺癌患者鑒定標(biāo)志分子,其機(jī)制被認(rèn)為是通過調(diào)節(jié)細(xì)胞因子通路,進(jìn)而影響前列腺癌細(xì)胞的遷移、侵襲、增殖[16]。另有研究發(fā)現(xiàn),miRNA-24-3p 可通過調(diào)控fascin1(FSCN1),影響前列腺癌的耐藥性[17]。在高危的前列腺癌患者中,miRNA-222-3p 可靶向調(diào)控血管內(nèi)皮生長因子受體2/KDR 蛋白[18]。但這兩種miRNAs具體的機(jī)制及是否存在協(xié)同靶向作用需進(jìn)一步明確。
綜上所述,本課題組確定了一個用于前列腺癌診斷、分層的miRNA 組,今后將進(jìn)一步在更大的樣本中驗證及統(tǒng)計,以期在未來的臨床中準(zhǔn)確應(yīng)用。