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    腰果過(guò)敏蛋白Ana o 2與Ana o 3結(jié)構(gòu)分析及致敏性預(yù)測(cè)

    2022-03-09 08:40:48張愛(ài)琳趙慧娟梁筱妍李曉丹
    食品工業(yè)科技 2022年5期
    關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)分析

    張愛(ài)琳,趙慧娟,遲 越,梁筱妍,李曉丹,郭 梅

    (天津農(nóng)學(xué)院食品科學(xué)與生物工程學(xué)院,天津 300384)

    腰果(Anacardium occidentaleLinnaeus)也稱為長(zhǎng)壽果與樹花生,是漆樹科、腰果屬的一種常綠喬木[1]。腰果豐富的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值與醫(yī)藥價(jià)值使得其備受大眾喜愛(ài)[2?3]。但腰果蛋白是八大食物過(guò)敏原之一[4?6]。據(jù)研究報(bào)道,在我國(guó)一些地區(qū),腰果可占食入性過(guò)敏原的8.50%,是引起支氣管哮喘最重要的食入性過(guò)敏原[7?8]。Sicherer等[9]研究發(fā)現(xiàn)118名過(guò)敏患者中有6%的人對(duì)腰果過(guò)敏,在后續(xù)跟蹤調(diào)查中發(fā)現(xiàn)145名對(duì)堅(jiān)果過(guò)敏的人群中有25%對(duì)腰果過(guò)敏[10?13]。國(guó)內(nèi)有研究學(xué)者應(yīng)用回顧性方法對(duì)213名對(duì)花生和堅(jiān)果過(guò)敏兒童進(jìn)行為期42個(gè)月的調(diào)查,花生過(guò)敏率為30.5%,腰果過(guò)敏率為74.1%[14]。目前由于缺乏對(duì)食物過(guò)敏的具體治療方法,避免食用過(guò)敏食物仍然是最好的選擇[15?18]。通過(guò)對(duì)照腰果過(guò)敏原的研究報(bào)道發(fā)現(xiàn):腰果主要的過(guò)敏原為:Ana o 1、Ana o 2、Ana o 3,它們分別是7S豌豆蛋白、11S球蛋白和2S白蛋白,均為種子儲(chǔ)存蛋白,但是Ana o 2分子量理論值有差異,有報(bào)道53 kD,也有33 kD[19?20],分析原因有可能腰果過(guò)敏蛋白在加工過(guò)程中極易分解、聚集,有可能被水解成n端小亞基和c端大亞基或者是由二硫鍵連接變性還原,包含6、8和10 kDa的三種亞型[21],所以有必要進(jìn)一步研究腰果主要過(guò)敏蛋白,更好地探究腰果過(guò)敏蛋白的表位結(jié)構(gòu)和開發(fā)低敏性產(chǎn)品做準(zhǔn)備[22]。隨著高精度質(zhì)譜技術(shù)飛速發(fā)展,通過(guò)生物質(zhì)譜技術(shù)分析蛋白質(zhì)、鑒定肽段已經(jīng)逐漸成為蛋白質(zhì)組學(xué)的核心技術(shù)[23?26],結(jié)合生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索預(yù)測(cè)過(guò)敏蛋白的過(guò)敏位點(diǎn)是生命科學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)重要研究方向,閆娟娟等[20]成功地克隆了Ana o 3的基因,朱倩倩等[27]通過(guò)生物信息軟件預(yù)測(cè)了重組腰果過(guò)敏蛋白Ana o 2的結(jié)構(gòu),但從腰果中分離純化天然Ana o 2與Ana o 3及對(duì)其二級(jí)結(jié)構(gòu)的分析還有待完善。Ana o 1在腰果中含量低,過(guò)敏性弱,不易分離獲得[28]。本研究采用生物信息軟件與傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)方法相結(jié)合對(duì)致敏性強(qiáng)的腰果主要過(guò)敏原Ana o 2與Ana o 3結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,以便于為后期深入研究腰果過(guò)敏機(jī)理及過(guò)敏蛋白Ana o 1提供技術(shù)支撐。

    1 材料與方法

    1.1 材料與儀器

    生腰果仁 產(chǎn)于越南,購(gòu)于淘寶,品牌悠米;石油醚 分析純,天津津東天正精細(xì)化學(xué)試劑廠;丙酮

    分析純,天津市風(fēng)船化學(xué)試劑科技有限公司;碳酸氫鈉 分析純,天津市江天化工技術(shù)有限公司;考馬斯亮藍(lán)G-250 上海藍(lán)季科技發(fā)展有限公司;雙色預(yù)染蛋白Marker 10~250 kD、5×上樣緩沖液 上海雅酶生物科技有限公司;葡聚糖凝膠G-150、羊抗人IgG-HRP、BCA蛋白定量檢測(cè)試劑盒 索萊寶有限公司;硝酸纖維素膜(CN140)、樣品墊、結(jié)合墊、吸水墊 上海捷寧生物科技有限公司。

    H2050R多功能臺(tái)式冷凍離心機(jī) 上海埃德思生物科技有限公司;YA1073透析袋(8000~14000 D)索萊寶有限公司;BT-100純化儀、CBS-B程控多功能全自動(dòng)部分收集器 上海滬西分析儀器廠有限公司;752N紫外分光光度計(jì) 上海精科儀器廠;PowerPac Basic電泳儀、GelDocXR+凝膠成像儀美國(guó)Bio-Rad公司。

    1.2 實(shí)驗(yàn)方法

    1.2.1 腰果過(guò)敏蛋白分離純化

    1.2.1.1 樣品破碎與脫脂處理 取適量腰果去皮后于液氮中研碎成粉末,稱取適量于燒杯中,分別加入5倍體積的石油醚或丙酮于4 ℃下交替脫脂,直到上清液澄清為止。棄去有機(jī)相層,將沉淀置于通風(fēng)櫥中,使有機(jī)溶劑揮發(fā)干凈,稱重計(jì)算脫脂率。

    1.2.1.2 腰果蛋白粗提取液的制備 參考文獻(xiàn)資料[29],將脫脂后的腰果粉以1:10 (w/v)的比例加入pH7.0磷酸鹽緩沖液(1 mol/L),在4 ℃下磁力攪拌2 h,隨后4 ℃下10000 r/min離心10 min,過(guò)濾取上清液,將樣品冷凍備用。

    1.2.1.3 透析 將粗蛋白提取液灌裝在透析袋中置于pH7.0的PBS緩沖液內(nèi)4 ℃下透析,期間2~4、6~8、10~14 h更換PBS緩沖液,直至緩沖液中不出現(xiàn)絮狀沉淀,收集透析液于?80 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.1.4 蛋白的純化 將葡聚糖凝膠 Sephadex G-150干粉浸泡于蒸餾水中24 h后,煮沸12 h直到完全溶脹,在濕態(tài)下一次性灌裝到普通親和層析柱內(nèi)(操作方法參考說(shuō)明書)。上樣前用pH7.0 PBS緩沖溶液平衡層析柱5個(gè)柱體積。樣品上樣,設(shè)置壓力為0.4 ba,過(guò)0.45 μm水膜,洗脫液為pH7.0、0.01 mol/L的PBS(含0.15 NaCl)在0.2 mL/min流速進(jìn)行洗脫,等體積收集,每管1 mL。將收集的蛋白含量高的溶液合并備用。

    1.2.2 腰果過(guò)敏蛋白鑒定及過(guò)敏原性驗(yàn)證

    1.2.2.1 BCA測(cè)定 蛋白濃度采用BCA蛋白定量試劑盒中微孔酶標(biāo)法測(cè)定蛋白濃度,具體操作方法參考說(shuō)明書。

    1.2.2.2 聚丙烯酰胺SDS-PAGE電泳 參照文獻(xiàn)[30],選用Omni_PAGETM預(yù)制膠4%~15%。將蛋白樣品與5×上樣緩沖液進(jìn)行4:1混合均勻,加熱處理5 min,室溫冷卻。每孔加10 μL樣品,最大上樣量為60 μL,設(shè)置電壓150 V,電泳時(shí)間40~50 min,當(dāng)溴酚藍(lán)指示帶至膠板底部時(shí)結(jié)束電泳,取出凝膠,在搖床上染色30 min,倒掉染色液,后進(jìn)行脫色。待完全褪色后用凝膠成像儀拍照保存。

    1.2.2.3 免疫印跡(Western-Blotting) 腰果過(guò)敏患者及陰性血清由山西省某人民醫(yī)院提供。納入標(biāo)準(zhǔn):具有蕁麻疹、皮炎、哮喘或胃腸道不適等典型的臨床過(guò)敏癥的18~59歲的人群(不分性別),具體操作方法參考文獻(xiàn)[31]。一抗:過(guò)敏陽(yáng)性血清,稀釋倍數(shù)1:100;二抗:羊抗人IgG-HRP,稀釋倍數(shù)1:5000;SDS-PAGE電泳膠:濃度15%。

    1.2.3 腰果過(guò)敏蛋白結(jié)構(gòu)測(cè)定

    1.2.3.1 腰果過(guò)敏蛋白質(zhì)譜測(cè)序分析 用甲醇潤(rùn)濕2張聚偏二氟乙烯(PVDF)膜,然后在小型轉(zhuǎn)移裝置中組裝轉(zhuǎn)印夾層,夾層順序?yàn)椋核芰峡颉⒑>d、濾紙、凝膠、2張PVDF膜、濾紙、海綿、塑料框,夾好放到PBS緩沖溶液中,將電壓設(shè)置為6 V/cm,轉(zhuǎn)移時(shí)間因目標(biāo)蛋白和凝膠的濃度而異;0.1%考馬斯亮藍(lán)的50%甲醇染色5 min后用含10%乙酸的50%甲醇脫色,參考1.2.2.2的實(shí)驗(yàn)結(jié)果對(duì)目的蛋白進(jìn)行切膠(每次切膠都使用新的刀片);全酶解:加入2 mol/L尿素(Urea) 20 μL酶解30 min;10 mmol/L 二硫蘇糖醇(DTT)(25 mmol/L NH4HCO3溶解)20 μL,37 ℃水浴1 h;加55 mmol/L吲哚乙酸(IAA)(25 mmol/L NH4HCO3溶解)20 μL,置于暗室30 min;加入0.2 μg胰蛋白酶(200 U/mgP),混勻,37 ℃過(guò)夜;離心真空凍干,C18ziptip除鹽柱除鹽,離心真空凍干,?20 ℃保存。將凍干肽段用20 μL 2%甲醇、0.1%甲酸復(fù)溶。1200 r/min離心10 min,吸取上清上樣。上樣體積10 μL,采取夾心法上樣。Loading Pump流速350 nL/min,15 min。將數(shù)據(jù)與Uniprot-Anacardium occidentale(2019.4.20Download)和NCBI-Anacardium occidentale數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)[32]。

    1.2.3.2 圓二色譜(CD)測(cè)定腰果過(guò)敏蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)

    首先樣品池中不放任何物體,采集背景;后取腰果目的蛋白,分別注入比色皿,置樣品池中,按照帶寬0.5 nm、步進(jìn)1.0 nm、波長(zhǎng)范圍180~260 nm、Timeper-Point 0.5 s、采集三次數(shù)據(jù)。

    1.2.3.3 生物信息軟件分析預(yù)測(cè) 通過(guò)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)查詢過(guò)敏原序列與質(zhì)譜測(cè)序進(jìn)行比較(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AAN76862.1?report=genpe pt)。通過(guò)DNAstar中的Protean程序預(yù)測(cè)的二級(jí)結(jié)構(gòu)與圓二色譜測(cè)定的蛋白結(jié)構(gòu)比對(duì)分析。

    1.3 數(shù)據(jù)處理

    應(yīng)用Excel 2007統(tǒng)計(jì)分析所有數(shù)據(jù),計(jì)算誤差并制圖。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 腰果蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制

    采用BCA試劑盒微孔酶標(biāo)法測(cè)定蛋白濃度,如圖1所示,標(biāo)準(zhǔn)曲線方程為y=0.7343x?0.1009,R2=0.999,方程線性良好。

    圖1 BCA蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.1 BCA protein standard curve

    2.2 Sephadex G-150葡聚糖凝膠純化蛋白

    腰果蛋白溶液經(jīng)脫脂、鹽析透析處理后采用Sephadex G-150 葡聚糖凝膠柱進(jìn)行純化,用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)蛋白含量,根據(jù)吸收光譜最大吸收峰波長(zhǎng)的位置或吸收峰形狀和數(shù)量,判斷該物質(zhì)的純度。將過(guò)柱純化后的蛋白液體每30 s收集一管,依次編號(hào),在 280 nm 波長(zhǎng)下檢測(cè)紫外吸收峰,結(jié)果如圖2所示。

    圖2 腰果純化蛋白溶液紫外圖Fig.2 UV image of cashew purified protein solution

    如圖2所示,葡聚糖凝膠柱層析純化。根據(jù)郎伯-比爾定律,蛋白溶液在最大吸收波長(zhǎng)處的吸光度與濃度成正比。蛋白通過(guò)凝膠柱層析純化后收集合并3~5管蛋白液,備用。

    2.3 腰果過(guò)敏蛋白電泳及免疫印跡鑒定

    將葡聚糖凝膠純化后的腰果蛋白收集后采用SDS-PAGE電泳分析蛋白分子量,采用Western-Blotting評(píng)價(jià)腰果蛋白過(guò)敏性。

    結(jié)果如圖3~圖4所示,目標(biāo)蛋白在SDS-PAGE電泳圖中呈現(xiàn)四條蛋白聚集條帶和一些彌散性的蛋白條帶,通過(guò)Western-Blotting免疫印跡圖譜顯示在33和17 kD出現(xiàn)印跡條帶,分析目標(biāo)蛋白的過(guò)敏原組分,可知在33與17 kD與陽(yáng)性血清有免疫學(xué)反應(yīng)和特異性結(jié)合反應(yīng),與相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道[20]的腰果的過(guò)敏蛋白Ana o 2與Ana o 3分子條帶接近,可以初步判斷該蛋白為目標(biāo)天然腰果過(guò)敏蛋白Ana o 2與Ana o 3。

    圖3 腰果過(guò)敏蛋白SDS-PAGE分析圖Fig.3 SDS-PAGE analysis of allergic protein

    圖4 腰果過(guò)敏蛋白免疫印跡鑒定圖Fig.4 Western-Blotting identification of allergic protein

    2.4 腰果過(guò)敏蛋白質(zhì)譜序列分析

    如圖5、表1和表2可知,將質(zhì)譜圖所得數(shù)據(jù)與

    表1 腰果過(guò)敏蛋白Ana o 2匹配肽段Table 1 Sequence analysis of cashew allergy protein Ana o 2

    表2 腰果過(guò)敏蛋白Ana o 3匹配肽段Table 2 Sequence analysis of cashew allergy protein Ana o 3

    圖5 腰果過(guò)敏蛋白質(zhì)譜測(cè)序分析圖譜Fig.5 Protein profile sequencing analysis of cashew allergy (ESI)

    Uniprot-Anacardium occidentale (2019.4.20 Download)和生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)NCBI-Anacardium occidentale進(jìn)行比對(duì)可知,圖譜總數(shù)為60842,與鑒定肽段所對(duì)應(yīng)的蛋白個(gè)數(shù)為5,鑒定譜圖所對(duì)應(yīng)的肽段去重復(fù)之后的個(gè)數(shù)Uniprot-Anacardium occidentale為147,NCBI-Anacardium occidentale為148,其中測(cè)得的片段序列與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行對(duì)比發(fā)現(xiàn)其中兩個(gè)與數(shù)據(jù)庫(kù)中Ana o 2與Ana o 3過(guò)敏原序列相匹配。通過(guò)腰果過(guò)敏蛋白質(zhì)譜測(cè)序分析再次驗(yàn)證了腰果主要過(guò)敏原為Ana o 2與Ana o 3,氨基酸序列共有16條易形成過(guò)敏表位。

    2.5 腰果過(guò)敏原二級(jí)結(jié)構(gòu)分析

    蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)是按多肽鏈本身通過(guò)氫鍵沿一定方向盤繞、折疊而形成的構(gòu)象。故二級(jí)結(jié)構(gòu)不同,則圓二色譜的色譜帶不同,通過(guò)圓二色譜區(qū)了解蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)。運(yùn)用CD光譜對(duì)腰果過(guò)敏蛋白進(jìn)行結(jié)構(gòu)測(cè)定,如圖6為過(guò)敏蛋白在180~260 nm范圍的CD圖譜。二級(jí)結(jié)構(gòu)特征對(duì)抗原表位有很大的影響,通過(guò)圓二色譜及DNAstar中的Protean預(yù)測(cè)將傳統(tǒng)分析方法與生物信息方法相結(jié)合使得其相互驗(yàn)證,從而提高腰果天然過(guò)敏蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性[32]。

    圖6 腰果過(guò)敏蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)分析Fig.6 Secondary structure analysis of cashew allergy protein

    如圖6所示,運(yùn)用CD光譜對(duì)純化后的蛋白溶液進(jìn)行結(jié)構(gòu)測(cè)定,在180~260 nm范圍的CD圖譜,從195~260 nm開始ɑ-螺旋從微分區(qū)域0.307降到0.122,β-轉(zhuǎn)角從0.177上升到0.224,無(wú)規(guī)則卷曲從0.328上升到0.540,整體趨勢(shì)為ɑ-螺旋下降時(shí)β-轉(zhuǎn)角與無(wú)規(guī)則卷曲同時(shí)呈上升趨勢(shì),且β-轉(zhuǎn)角與無(wú)規(guī)則卷曲多位于蛋白質(zhì)表面,鍵能較低,容易與抗體結(jié)合,成為抗原表位的可能性大。其中蛋白表面可及性、柔韌性越多的區(qū)域,則表示其越易折疊,且暴露在表面;而抗原性指數(shù)則代表了其形成表位能力的強(qiáng)弱,抗原指數(shù)高的區(qū)域更可能形成表位。

    通過(guò)DNAstar中的Protean程序預(yù)測(cè)的Ana o 2與Ana o 3過(guò)敏原二級(jí)結(jié)構(gòu)圖7~圖10可知,利用DNAstar Protean軟件分析腰果主要過(guò)敏蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和抗原性:用Garnier-Robson、Chou-Fasman 方法對(duì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的α-螺旋、β-折疊、β-轉(zhuǎn)角和無(wú)規(guī)則卷曲等進(jìn)行預(yù)測(cè);用 Kyte-Doolittle、Eisenberg方法對(duì)蛋白的親水性進(jìn)行了預(yù)測(cè);用 Karplus-Schulz方法分析蛋白質(zhì)骨架區(qū)柔韌性,預(yù)測(cè)形成表位與抗體結(jié)合的可能性;用Jameson-Wolf方法預(yù)測(cè)了腰果過(guò)敏蛋白的B細(xì)胞抗原表位;用Emini方法預(yù)測(cè)了腰果過(guò)敏蛋白的表面可及性。

    圖10 Ana o 3親水性、柔韌性、抗原性指數(shù)和表面可及性Fig.10 Ana o 3 hydrophilicity, flexibility, antigenicity index and surface accessibility

    一般暴露在過(guò)敏原分子外部易成為抗原的構(gòu)象表位,位于疏水性區(qū)域內(nèi)的易形成抗原的線性表位,且蛋白質(zhì)的親水性、表面可及性、柔韌性等在形成抗原方面起著重要作用,當(dāng)親水性>0,抗原指數(shù)>0,表面可及性>1時(shí)形成表位的可能性大[31]。從圖7~圖8可以看出,Ana o 2中有10個(gè)主要的區(qū)域親水性較好,6個(gè)主要的區(qū)域表面可及性好,有 16個(gè)區(qū)域的抗原指數(shù)較高,柔韌性區(qū)域分布相對(duì)平均。

    從圖9~圖10 可以看出,Ana o 3中有3個(gè)主要的區(qū)域親水性較好,5個(gè)主要的區(qū)域表面可及性好,絕大多數(shù)區(qū)域的抗原指數(shù)較高,柔韌性區(qū)域分布在中間波長(zhǎng)50~120 nm部位。

    圖9 Ana o 3二級(jí)結(jié)構(gòu)分析Fig.9 Ana o 3 secondary structure analysis

    綜合分析Ana o 2與 Anao3過(guò)敏原蛋白骨架區(qū)含有較多的柔韌性區(qū)域,該蛋白肽段的柔韌性較大,發(fā)生扭曲、折疊的概率升高,容易與抗體在空間上產(chǎn)生結(jié)合,形成抗原表位的可能性較大。Ana o 2 N-C 端α-螺旋結(jié)構(gòu)、β-折疊區(qū)段和轉(zhuǎn)角區(qū)域均存在,所以Ana o 2是致敏性較強(qiáng)的一種親水性蛋白。Ana o 3的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要為α-螺旋結(jié)構(gòu)和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu),N端有僅有少量的β-折疊區(qū)段和轉(zhuǎn)角區(qū)域,為過(guò)敏性較弱的親水性蛋白。

    3 結(jié)論

    本實(shí)驗(yàn)分離純化腰果過(guò)敏蛋白并對(duì)其結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,通過(guò)SDS-PAGE電泳結(jié)合Western-Blotting免疫印跡獲得腰果主要過(guò)敏蛋白Ana o 2與Ana o 3,其分子量為33與17 kD左右。應(yīng)用Uniprot-Anacardium occidentale質(zhì)譜分析所得數(shù)據(jù)與和NCBIAnacardium occidentale數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),可知圖譜總數(shù)為60842,與鑒定肽段所對(duì)應(yīng)的蛋白個(gè)數(shù)為5,鑒定譜圖所對(duì)應(yīng)的肽段數(shù)Uniprot-Anacardium occidentale為147,NCBI-Anacardium occidentale為148。圓二色譜結(jié)果與DNAstar中的Protean程序預(yù)測(cè)可知,Ana o 2α-螺旋結(jié)構(gòu)、β-折疊區(qū)段和轉(zhuǎn)角區(qū)域均存在,是致敏性較強(qiáng)的一種親水性蛋白,β-轉(zhuǎn)角和無(wú)規(guī)則卷曲在Ana o 2氨基酸序列中出現(xiàn)率總和54%,所在區(qū)域?yàn)閮?yōu)勢(shì)抗原表位區(qū)。Ana o 3 N 端有僅有少量的β-折疊區(qū)段和轉(zhuǎn)角區(qū)域,出現(xiàn)率總和12%,Ana o 3的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要為α-螺旋結(jié)構(gòu)和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu),也為親水性過(guò)敏蛋白,但形成過(guò)敏性表位相對(duì)弱。本研究為探究腰果主要過(guò)敏原的分子結(jié)構(gòu)和表位預(yù)測(cè)提供研究基礎(chǔ),也為進(jìn)一步明確天然腰果主要過(guò)敏原結(jié)構(gòu)并對(duì)探索腰果致敏機(jī)理提供參考。

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